Este trabalho visa apresentar métodos de categorização de variáveis explicativas contínuas em Análise de Sobrevivência. Do ponto de vista clínico, agrupar pacientes em grupos de risco distintos é importante para agilizar tomadas de decisões; entretanto, perda de informação e outros problemas estatísticos podem ocorrer. Portanto, métodos para seleção de pontos de corte e correção dos possíveis problemas gerados pela categorização são criticamente avaliados. Para a aplicação e comparação dos métodos são utilizados dados do Instituto do Coração do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (InCor - FMUSP), em que a variável fração de ejeção é dicotomizada e tricotomizada. / This dissertation aims to present methods of categorization for continuous variables in Survival Analysis. From a clinical point of view, grouping patients into distinct risk groups is important for accelerating decision-making; however, loss of information and other statistical problems may occur. Therefore, methods for selecting cutpoints and correcting problems generated by categorization are critically evaluated. For the application and comparison of the methods, the dataset from Heart Institute - University of Sao Paulo Medical School (InCor FMUSP) is used, in which the variable ejection fraction is dichotomized and trichotomized.

Objetivo. Uma coorte de crianças foi observada sob duas abordagens: coorte prospectiva e coorte retrospectiva (histórica) e o objetivo foi comparar as estimativas da função de riscos do modelo de Cox entre as duas abordagens e a mesma comparação com o modelo complemento log-log. Além disso, comparar as estimativas da função de riscos pelos modelos de Cox e complemento log-log para cada uma das abordagens, separadamente. Métodos. Quando se estuda o tempo de sobrevida da amamentação sem as covariáveis, foram obtidas as estimativas pela técnica atuarial e modelo complemento log-log da informação retrospectiva e a técnica de Kaplan-Meier para a informação prospectiva. Os modelos de Cox e complemento log-log foram utilizados para estimar a razão de riscos (HR) com covariáveis para as duas abordagens. Resultados. Sem as covariáveis, a comparação entre as duas abordagens mostrou que as estimativas de S(t) pela informação retrospectiva estão um pouco defasadas em relação à medida prospectiva. Com as covariáveis, os resultados dos modelos de Cox e complemento log-log são semelhantes tanto para os dados prospectivos quanto para os retrospectivos. Foram semelhantes, também, os resultados de um mesmo modelo para cada uma das fontes de informação. Conclusões. Em geral, as estimativas foram bastante próximas em quaisquer das comparações. Somente a variável hábito de fumar da mãe durante a gravidez permaneceu nos modelos finais para todas as técnicas utilizadas, com estimativas próximas, reforçando semelhança entre as várias abordagens. / Objective. A cohort of children was observed under two approaches: prospective cohort and retrospective (historical) cohort and the objective was to compare the estimates of the hazard ratio from Cox model between the two approaches and do the same comparison using the complementary log-log model. Moreover, to compare the estimates of the hazard ratio from the two models to each one of the approaches, separately. Methods. When the survival time for breastfeeding is studied without the covariates, the comparison between the results of actuarial technique and the complementary log-log model has been made for the recorded information. The Kaplan-Meier technique has been used with the daily notebook measures. The Cox and complementary log-log models can estimate the risk rate of covariates categories to both approaches. Results. Without the covariates, the comparison between the two information resources showed that retrospective measures give lower estimates than that from the prospective measures. With covariates, the estimates are not so different and led to the same results. Conclusions. The estimates of each one of the comparisons were too close. Just the variable mothers smoking during the pregnancy stayed in the final models for every techniques used, with close estimates, reinforcing likeness between the several approaches.

O presente estudo compreende 96 transplantes de medula óssea (TMO) de doadores HLA-idênticos em pacientes portadores de Leucemia Mielóide Crônica, no período de Junho de 1986 a Junho de 1998. A autora selecionou diversas covariáveis para serem estudadas como fatores prognósticos de cinco desfechos principais: ocorrência de doença enxerto contra hospedeiro (DECH) aguda e crônica, incidência de recaída, sobrevida livre de doença (SLD) e sobrevida global (SG). As covariáveis estudadas foram: idade, sexo, escolaridade, tempo entre o diagnóstico e o transplante, fase da doença ao transplante, regime de condicionamente, profilaxia de DECH, compatibilidade de sexo entre doador e receptor, sexo do doador, tamanho do baço e do fígado, percentagem de blastos e número de plaquetas no sangue periférico na primeira consulta ao CEMO, ocorrência e grau de DECH aguda, ocorrência de DECH crônica e tempo para recuperação de plaquetas após o TMO. Não foi encontrada associação estatisticamente significativa num nível de 95% de confiança entre qualquer das covariáveis e a ocorrência de DECH crônica ou de recaída. A ocorrência de DECH aguda mostrou-se associada apenas com a fase da doença ao transplante. As covariáveis que se mostraram associadas com a sobrevida global e a sobrevida livre de doença foram: a percentagem de blastos no sangue periférico e tamanho do baço na primeira consulta ao CEMO, a fase da doença ao transplante, o tipo de profilaxia de DECH, a ocorrência e o grau de DECH aguda e o tempo para recuperação de plaquetas num nível acima de 20 x 103/mm3. / This study comprises 96 bone marrow transplantations (BMT) from HLA-identical siblings in patients with Chronic Myeloid Leukaemia (CML), from June 1986 to June 1998. The author selected several covariates to be studied as prognostic factors for five main endpoints: acute and chronic graft versus host disease (GVHD) occurrence, relapse incidence (RI), disease free survival (DFS) and overall survival (OS). The covariates studied were: age, sex, years of schooling, time from diagnosis to transplantation, disease phase at BMT, conditioning regimen, GVHD prophylaxis, sexmatch between donor-receptor, donor sex, spleen and liver size, blasts percentage and platelet counts in peripheral blood at first consultation at CEMO, acute GVHD occurrence and grade, chronic GVHD occurrence and time to platelet recovery after BMT. No statistically significant association was found between the covariates studied and the occurrence of acute or chronic GVHD or of relapse. The covariates found to have an association with overall survival (OS) and disease free survival (DFS) were the percentage of blasts in peripheral blood and the spleen size at first consultation, the disease phase at transplant, type of GVHD prophylaxis, the occurrence and grade of acute GVHD and the time to platelet recovery above 20 x 103/mm3.

O presente estudo compreende 96 transplantes de medula óssea (TMO) de doadores HLA-idênticos em pacientes portadores de Leucemia Mielóide Crônica, no período de Junho de 1986 a Junho de 1998. A autora selecionou diversas covariáveis para serem estudadas como fatores prognósticos de cinco desfechos principais: ocorrência de doença enxerto contra hospedeiro (DECH) aguda e crônica, incidência de recaída, sobrevida livre de doença (SLD) e sobrevida global (SG). As covariáveis estudadas foram: idade, sexo, escolaridade, tempo entre o diagnóstico e o transplante, fase da doença ao transplante, regime de condicionamente, profilaxia de DECH, compatibilidade de sexo entre doador e receptor, sexo do doador, tamanho do baço e do fígado, percentagem de blastos e número de plaquetas no sangue periférico na primeira consulta ao CEMO, ocorrência e grau de DECH aguda, ocorrência de DECH crônica e tempo para recuperação de plaquetas após o TMO. Não foi encontrada associação estatisticamente significativa num nível de 95% de confiança entre qualquer das covariáveis e a ocorrência de DECH crônica ou de recaída. A ocorrência de DECH aguda mostrou-se associada apenas com a fase da doença ao transplante. As covariáveis que se mostraram associadas com a sobrevida global e a sobrevida livre de doença foram: a percentagem de blastos no sangue periférico e tamanho do baço na primeira consulta ao CEMO, a fase da doença ao transplante, o tipo de profilaxia de DECH, a ocorrência e o grau de DECH aguda e o tempo para recuperação de plaquetas num nível acima de 20 x 103/mm3. / This study comprises 96 bone marrow transplantations (BMT) from HLA-identical siblings in patients with Chronic Myeloid Leukaemia (CML), from June 1986 to June 1998. The author selected several covariates to be studied as prognostic factors for five main endpoints: acute and chronic graft versus host disease (GVHD) occurrence, relapse incidence (RI), disease free survival (DFS) and overall survival (OS). The covariates studied were: age, sex, years of schooling, time from diagnosis to transplantation, disease phase at BMT, conditioning regimen, GVHD prophylaxis, sexmatch between donor-receptor, donor sex, spleen and liver size, blasts percentage and platelet counts in peripheral blood at first consultation at CEMO, acute GVHD occurrence and grade, chronic GVHD occurrence and time to platelet recovery after BMT. No statistically significant association was found between the covariates studied and the occurrence of acute or chronic GVHD or of relapse. The covariates found to have an association with overall survival (OS) and disease free survival (DFS) were the percentage of blasts in peripheral blood and the spleen size at first consultation, the disease phase at transplant, type of GVHD prophylaxis, the occurrence and grade of acute GVHD and the time to platelet recovery above 20 x 103/mm3.

Objetivo. Uma coorte de crianças foi observada sob duas abordagens: coorte prospectiva e coorte retrospectiva (histórica) e o objetivo foi comparar as estimativas da função de riscos do modelo de Cox entre as duas abordagens e a mesma comparação com o modelo complemento log-log. Além disso, comparar as estimativas da função de riscos pelos modelos de Cox e complemento log-log para cada uma das abordagens, separadamente. Métodos. Quando se estuda o tempo de sobrevida da amamentação sem as covariáveis, foram obtidas as estimativas pela técnica atuarial e modelo complemento log-log da informação retrospectiva e a técnica de Kaplan-Meier para a informação prospectiva. Os modelos de Cox e complemento log-log foram utilizados para estimar a razão de riscos (HR) com covariáveis para as duas abordagens. Resultados. Sem as covariáveis, a comparação entre as duas abordagens mostrou que as estimativas de S(t) pela informação retrospectiva estão um pouco defasadas em relação à medida prospectiva. Com as covariáveis, os resultados dos modelos de Cox e complemento log-log são semelhantes tanto para os dados prospectivos quanto para os retrospectivos. Foram semelhantes, também, os resultados de um mesmo modelo para cada uma das fontes de informação. Conclusões. Em geral, as estimativas foram bastante próximas em quaisquer das comparações. Somente a variável hábito de fumar da mãe durante a gravidez permaneceu nos modelos finais para todas as técnicas utilizadas, com estimativas próximas, reforçando semelhança entre as várias abordagens. / Objective. A cohort of children was observed under two approaches: prospective cohort and retrospective (historical) cohort and the objective was to compare the estimates of the hazard ratio from Cox model between the two approaches and do the same comparison using the complementary log-log model. Moreover, to compare the estimates of the hazard ratio from the two models to each one of the approaches, separately. Methods. When the survival time for breastfeeding is studied without the covariates, the comparison between the results of actuarial technique and the complementary log-log model has been made for the recorded information. The Kaplan-Meier technique has been used with the daily notebook measures. The Cox and complementary log-log models can estimate the risk rate of covariates categories to both approaches. Results. Without the covariates, the comparison between the two information resources showed that retrospective measures give lower estimates than that from the prospective measures. With covariates, the estimates are not so different and led to the same results. Conclusions. The estimates of each one of the comparisons were too close. Just the variable mothers smoking during the pregnancy stayed in the final models for every techniques used, with close estimates, reinforcing likeness between the several approaches.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:06:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 1662.pdf: 571364 bytes, checksum: 6091268473b4a7cb920748fd364c2a99 (MD5) Previous issue date: 2007-03-30 / Survival data analysis models is used to study experimental data where, normally, the variable "answer"is the time passed until an event of interest. Many authors do prefer modeling survival data, in the presence of co-variables, by using a hazard function - which is related with its interpretation. The Cox model (1972) - most commonly used by the authors - is applicable when the fail rates are proportional. This model is very flexible and used in the survival analysis. It can be easily extended to, for example, incorporate the time-dependent co-variables. In the present work we propose a proportional risk model which incorporates a time-dependent parameter named "time-dependent proportional risk model". / A análise de sobrevivência tem por objetivo estudar dados de experimento em que a variável resposta é o tempo até a ocorrência de um evento de interesse. Vários autores têm preferido modelar dados de sobrevivência na presença de covariáveis por meio da função de risco, fato este relacionado à sua interpretação. Ela descreve como a probabilidade instantânea de falha se modifca com o passar do tempo. Nesse contexto, um dos modelos mais utilizados é o modelo de Cox (Cox, 1972), onde a suposição básica para o seu uso é que as taxas de falhas sejam proporcionais. O modelo de riscos proporcionais de Cox é bastante flexível e extensivamente usado em análise de sobrevivência. Ele pode ser facilmente estendido para incorporar, por exemplo, o efeito de covariáveis dependentes do tempo. Neste estudo, propõe-se um modelo de risco proporcional, que incorpora um parâmetro dependente do tempo, denominado modelo de risco proporcional dependente do tempo. Uma análise clássica baseada nas propriedades assintóticas dos estimadores de máxima verossimilhança dos parâmetros envolvidos é desenvolvida, bem como um estudo de simulação via técnicas de reamostragem para estimação intervalar e testes de hipóteses dos parâmetros do modelo. É estudado o custo de estimar o efeito da covariável quando o parâmetro que mede o efeito do tempo é considerado na modelagem. E, finalizando, apresentamos uma abordagem do ponto de vista Bayesiano.

Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-06T18:14:46Z No. of bitstreams: 1 TeseEAMms.pdf: 1490434 bytes, checksum: e7a807666b453630ffb423774d2539b9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T13:51:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEAMms.pdf: 1490434 bytes, checksum: e7a807666b453630ffb423774d2539b9 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-20T13:51:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseEAMms.pdf: 1490434 bytes, checksum: e7a807666b453630ffb423774d2539b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-20T13:52:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseEAMms.pdf: 1490434 bytes, checksum: e7a807666b453630ffb423774d2539b9 (MD5) Previous issue date: 2016-03-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / From the generalized normal distribution and concepts of the generalized autoregressive moving averages models we introduce the generalized normal-ARMA model as an alternative way to model time series exhibiting symmetry and tails that may be lighter or heavier when compared the normal distribution. We present application for proposed model using three time series in the hydrology, economy and publics policy areas. The proposed model is presented as good alternative when compared to ARMA model with normal distribution. We extended this model the case of the asymmetric time series. In this case we used the Box-Cox transformation, denoted by Box-Cox generalized normal ARMA. The particular case, when we use the logarithmic transformation is called generalized log-normal ARMA. We adjusted the models with transformation to the series on monthly average affluent streamflow of the Furnas and Sobradinho hydroelectric plants. We obtain the prediction values for the model with transformation, that are better when compared with the model without transformation. To treat time series that exhibit periodic in the correlation function we defined three extensions for periodic autoregressive model, called generalized normal periodic autoregressive model, generalized log-normal periodic autoregressive model and Box-Cox generalized normal periodic autoregressive model. We can observed that the series on monthly average affluent streamflow of the Furnas and Sobradinho hydroelectric plants have periodic correlation. We present two applications of periodic models from these series. In the models, we note that is not necessary the use of generalized normal distribution in every months, just in some the generalized normal distribution presented better results than the normal distribution. Finally, we define the generalized normal zero inflated distribution and the generalized normal zero inflated ARMA model for time series. Adopting the model for series that have zero inflation and the maximum likelihood method for estimation of parameters, we analyze the serie of the amount of rainfall in the city of São Carlos. / A partir da distribuição normal generalizada e dos conceitos do modelo autorregressivo e de médias móveis generalizado, introduzimos o modelo normal generalizada- ARMA, como alternativa para modelar séries temporais, que exibem simetria e caudas mais leves ou mais pesadas quando comparadas com a distribuição normal. Apresentamos aplicações do modelo proposto, usando três séries temporais, das áreas de hidrologia, políticas públicas e economia. O modelo proposto se apresentou como uma boa alternativa ao modelo ARMA com distribuição normal. Estendemos o modelo para o caso de séries que apresentam assimetria. Neste caso, utilizamos a transformação de Box-Cox, denotado por Box-Cox normal generalizada-ARMA. O caso particular quando utilizamos a transformação logarítmica é chamado de log-normal generalizada-ARMA. Ajustamos os modelos com transformação à séries de vazões das usinas hidrelétricas de Furnas e Sobradinho. Calculamos predições, que para o modelo com transformação, foram melhores, quando comparado ao modelo sem transformação. Com o objetivo de tratar séries que apresentam periodicidade na função de correlação, definimos três extensões do modelo autorregressivo periódico, chamando-os de modelo normal generalizada autorregressivo periódico, modelo log-normal generalizada autorregressivo periódico e modelo Box-Cox normal generalizada autorregressivo periódico. Constatamos que as séries de vazões das usinas hidrelétricas de Furnas e Sobradinho apresentam correlação periódica. Apresentamos duas aplicações dos modelos periódicos propostos usando estas séries. Nos ajustes dos modelos, notamos que não há necessidade da utilização da distribuição normal generalizada em todos os meses, mas em alguns a distribuição normal generalizada se sobressaiu em relação a distribuição normal. Por último, definimos a distribuição normal generalizada zero inflacionada e o modelo para séries temporais normal generalizada zero inflacionada-ARMA. Adotando o método de máxima verossimilhança e o modelo para séries que apresentam inflação de zeros, analisamos a série da quantidade de precipitação pluviométrica da cidade de São Carlos.