Thesis (M.S.)--University of Wisconsin--Madison, 1980. / Typescript. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves 70-71).

Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin, 1967. / Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliography.

Thesis--University of Wisconsin--Madison. / Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references (leaves 167-179).

Thesis (Ph. D.)--University of Wisconsin--Madison, 1966. / Abstracted in Dissertations abstracts, v.27 (1966) no. 6, p. 2189-B. Typescript. Vita. eContent provider-neutral record in process. Description based on print version record. Includes bibliographical references.

Thesis (Ph. D.) -- Lincoln University, 2007. / Also available via the World Wide Web.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2011. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2012-05-24T13:00:43Z No. of bitstreams: 1 2011_MarcileneFernandesAlmeidadosSantos.pdf: 1313434 bytes, checksum: e32db128bd70fade50c2c2690b4d0c61 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-05-24T13:32:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_MarcileneFernandesAlmeidadosSantos.pdf: 1313434 bytes, checksum: e32db128bd70fade50c2c2690b4d0c61 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-24T13:32:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_MarcileneFernandesAlmeidadosSantos.pdf: 1313434 bytes, checksum: e32db128bd70fade50c2c2690b4d0c61 (MD5) / Meloidogyne incognita é uma das espécies de nematoide das galhas mais polífagas que ocorrem no Brasil e no mundo. Oito representantes de M. incognita incluindo os dois fenótipos enzimáticos (esterase e malato desidrogenase: I1N1, I2N1) e quatro isolados de espécie cripta (Meloidogyne sp.1 - S2N1), representando um tipo citológico (3n = 40-46) e quatro raças fisiológicas foram estudados. Meloidogyne hispanica (H3N1, 2n = 32-36) e dois isolados atípicos de Meloidogyne sp. 2 (S2N3, 3n = 40-44) foram incluídas neste estudo. Todos os isolados foram testados com três marcadores moleculares espécie-específico do tipo SCAR, desenvolvidos para M. incognita. Os pares de primers B06F/R, miF/R e incK14F/R amplificaram três fragmentos espécie-específico de 1,200 bp, 955 bp e 399 bp, respectivamente, para os oito isolados de M. incognita e quatro de Meloidogyne sp. 1, não ocorrendo para os isolados pertencentes a M. hispanica e Meloidogyne sp. 2. A variabilidade genética de todos os isolados de Meloidogyne spp. usados neste estudo foi avaliada por meio dos marcadores RAPD e ISSR. Análises filogenéticas das matrizes resultantes usando (UPGMA, Maximum Parsimony e Bayesian inference) produziram árvores com a mesma topologia geral na relação entre as espécies. Dois grupos monofiléticos foram observados: grupo I, consistindo de isolados de M. hispanica e Meloidogyne sp.2 atípicos e grupo II agrupando-se todos os isolados de M. incognita e Meloidogyne sp.1 (S2N1). Considerando abordagens morfométricas, morfológicas e moleculares, foi possível concluir que os três fenótipos enzimáticos (I1N1, I2N2 e S2N1) caracterizam a espécie M. incognita. Nenhuma correlação foi detectada entre os fenótipos isoenzimáticos, as raças dos isolados e a topologia da árvore. Morfologicamente, os isolados de (S2aN3) diferem de M. incognita e M. hispanica pelas características do estilete das fêmeas. Os resultados deste estudo sugerem que os dois isolados com fenótipo S2aN3 pertencem à espécie ainda não identificada, mas geneticamente relacionada à M. hispanica. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Meloidogyne incognita is one of the most polyphagous species of root-knot nematode occurring in Brazil and worldwide. Eight M. incognita representing two enzymatic phenotypes (esterase and malate desydrogenase: I1N1, I2N1) and four cryptic isolates of Meloidogyne sp.1 (S2N1), representing one cytological type (3n=40-46), and four host races were studied. Meloidogyne hispanica (H3N1, 2n=32-36) and two isolates of an atypical Meloidogyne sp.2 (S2N3, 3n= 40-44) were included in this study. All isolates were tested with three species-specific molecular markers, i.e., SCARs, developed for M. incognita. The pairs of primers B06F/R, miF/R and incK14F/R amplified three species-specific fragments of 1,200 bp, 955 bp and 399 bp, respectively, and were observed for the eight isolates of M. incognita and four of Meloidogyne sp.1, and not for those belonging to either M. hispanica or Meloidogyne sp.2. Overall genetic variability of Meloidogyne isolates in this study was evaluated using RAPD and ISSR markers. Phylogenetic analyses of the resulting matrices using UPGMA, Maximum Parsimony and Bayesian inference produced trees with the same general topology with respect the relationships among species. Two strongly supported monophyletic clades were observed: clade I, consisting of M. hispanica isolates and the atypical Meloidogyne sp.2, and clade II, clustering together all M. incognita isolates and Meloidogyne sp.1 (S2N1). Considering morphometrical, morphological and molecular approaches, it was possible to conclude that the three enzymatic phenotypes (I1N1, I2N2 and S2N1) characterized M. incognita. No strict correlation could be detected between either, the isoenzymatic phenotypes or the races of the isolates, and the tree topology. Morphologically, the S2N3 isolates differ from M. incognita and M. hispanica by female stylet features. The results of this study suggested that the two isolates with phenotypes S2aN3 belong to unidentified species closely related to M. hispanica.

Dissertação (mestrado)Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2012. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2012-05-28T16:40:48Z No. of bitstreams: 1 2012_JoelmaGardeniaPereiraSilva_Parcial.pdf: 1472235 bytes, checksum: 04e8168c1f054c41fa3734b39c235b29 (MD5) / Approved for entry into archive by Marília Freitas(marilia@bce.unb.br) on 2012-05-30T13:36:03Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_JoelmaGardeniaPereiraSilva_Parcial.pdf: 1472235 bytes, checksum: 04e8168c1f054c41fa3734b39c235b29 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-05-30T13:36:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_JoelmaGardeniaPereiraSilva_Parcial.pdf: 1472235 bytes, checksum: 04e8168c1f054c41fa3734b39c235b29 (MD5) / O Cerrado (Savana brasileira) é formado por um mosaico heterogêneo de tipos de vegetação, solo e clima, com grande diversidade biológica. Apesar desta biodiversidade, a fauna nematológica nesse bioma é pouco estudada, principalmente no que se refere aos nematoides do gênero Meloidogyne. O objetivo deste trabalho foi identificar espécies de Meloidogyne presentes em diferentes fitofisionomias de Cerrado do Parque Nacional de Brasília (PNB) e da Fazenda Água Limpa (FAL) no Distrito Federal. Objetivou-se também validar os marcadores SCAR para as diferentes espécies de Meloidogyne associadas à vegetação nativa do Cerrado e verificar a hospedabilidade de plantas nativas do Cerrado a Meloidogyne javanica. Foram realizadas coletas de solo em cinco fitofisionomias de Cerrado,totalizando 125 amostras em cada um dos locais de estudo (PNB e FAL). Tomateiros suscetíveis a várias espécies de Meloidogyne foram cultivados em vasos contendo solo de vegetação nativa do Cerrado e avaliados aos 90 dias após o plantio. A identificação das espécies encontradas foi realizada com base em fenótipos da isoenzima esterase e por marcadores moleculares. Das 125 amostras de solo coletadas no PNB, 9 (7,2 %) estavam infestadas e na FAL das 125 amostras coletadas, 48 (38,4 %) apresentaram os nematoides de galhas. De modo geral, foram detectadas 66 populações de Meloidogyne pertencentes a cinco espécies: M. javanica (75,76 %), M. incognita (10,60 %), M. hapla (9,1 %), M. morocciensis (3,03 %) e M. arenaria (1,51 %). Os pares de primers SCAR incK14F/R, F/Rar, F/Rjav e F/Rh amplificaram os fragmentos específicos de M. incognita (399 pb), M. morocciensis (420 pb), M. javanica (670 pb) e M. hapla (610 pb), evidenciando sua especificidade e maior eficiência em detectar misturas de espécies em comparação com a técnica de eletroforese de isoenzimas. Das 17 espécies de plantas nativas testadas quanto à hospedabilidade a M. javanica, apenas Mimosa caesalpiniifolia mostrou ser boa hospedeira com fator de reprodução de 22,73. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Occurrence of Meloidogyne spp. in different physiognomic vegetation of Cerrado, and host suitability of native plants to Meloidogyne javanica Cerrado (Brazilian savannah) is a highly diverse ecosystem composed of a heterogeneous mosaic of vegetation, climates and soils. Despite its biodiversity, there are few studies with nematodes, especially those of the genus Meloidogyne. The objectives of this work were (i) to characterize and identify Meloidogyne species in different physiognomic vegetation of Cerrado located at the National Park (PNB) and Águas Limpas farm (FAL), (ii) to validate SCAR markers for different Meloidogyne spp., found in these sites and (iii) to assess the host Meloidogyne javanica. A total of 125 soil samples in the rhizosphere per area of study (PNB and FAL) were collected in five types of physiognomic vegetation, Soil samples were planted with a susceptible tomato plantlet and evaluated for the presence of root-knot nematodes at 90 days after. Meloidogyne spp. were identified using esterase phenotypes and species-specific SCAR-PCR markers. Nine out of 125 samples from PNB (7.2 %) and 48 (38.4 %) from FAL were infested with Meloidogyne spp. Overall, there were five species of Meloidogyne, including M. javanica (75.76 %), M. incognita (10.60 %), M. hapla (9.1 %), M. morocciensis (3.03 %) and M. arenaria (1.51 %). The SCAR primer pairs incK14F/R, F/Rar, F/Rjav and F/Rh amplified fragments species-specific for M.incognita (399 bp), M. morocciensis (420 bp), M. javanica (670 bp) and M. hapla (610 bp) respectively, and was consistent with the enzymatic phenotypes and more efficient to detected mixed species. Most of the 17 native plant species tested had a reproduction factor (RF) < 1 and only the species Mimosa caesalpiniifolia was considered a good host for M. javanica, with a RF of 22.73.

Resumo: Este trabalho teve como primeiro objetivo categorizar grupos funcionais de dispersao de nematoides marinhos de vida livre, com base na combinacao das suas estrategias de locomocao e modos de deslocamentos e de suas caracteristicas morfologicas e estrategias de vida. Em uma primeira etapa, as estrategias de locomocao e os modos de deslocamentos de nematoides marinhos foram categorizados experimentalmente em laboratorio, usando como modelos especies de uma planicie entremares nao vegetada na Baia de Paranagua, um grande sistema estuarino na costa sul do Brasil. Em uma segunda etapa, para a definicao formal dos grupos funcionais de dispersao, estas categorias foram combinadas com as caracteristicas morfologicas e estrategias de vida, a partir de dados secundarios obtidos da literatura especifica. Como segundo objetivo do trabalho, foi avaliada a presenca de nematoides marinhos na da coluna d.agua relacionada com o potencial de dispersao por meio de um experimento de campo em um baixio subtropical nao vegetado, tambem na Baia de Paranagua. O experimento foi replicado durante eventos unicos de mare enchente em julho de 2008 e janeiro de 2009. De modo geral o grupo funcional de dispersao vagil nadador apresentou comportamento ativo, com capacidade de natacao por deslocamentos senoidal mola e senoidal omega, possibilitados pelo corpo esbelto e cauda conica/cilindrica. Ao considerar as especies de nematoides marinhos associadas a macroalgas, especies vageis nadadoras foram relacionadas, principalmente, aos processos de dispersao por ¡°rafting¡±. Especies desse grupo funcional de dispersao mostram uma grande agilidade para se locomoverem tanto no sedimento quanto nadar na coluna d.agua. Ao contrario das especies vageis nadadoras, as especies vageis rastejadoras apresentam modo de deslocamento senoidal circular e pertencem ao grupo trofico comedor de deposito seletivo e apresentaram a estrategia de evitar a suspensao, atraves da locomocao ativa no ambiente intersticial, migrando para as camadas mais profundas do sedimento. Eventualmente especies vageis rastejadoras podem ser encontradas na coluna d.agua decorrente dos processos de erosao e transporte passivo. Por fim, o grupo funcional de dispersao sedentario e formado por especies com corpo relativamente pequeno e robusto, o que restringe o deslocamento a movimentos senoidais ou similares, mostrando-se completamente estaticos ou parados. A presenca das especies sedentarias na coluna d.agua e uma funcao dos processos de erosao dos fundos por correntes e subsequente transporte passivo, facilitado pelo seu habito de vida restrito as camadas superficiais do sedimento e por seu comportamento letargico. As populacoes da especie sedentaria Metachromadora chandleri, apresentaram amplo fluxo genico, nao sendo possivel reconhecer populacoes locais e regionais geneticamente estruturadas. A distribuicao dessa especie nao representa uma metapopulacao classica, mas pode ser considerada uma metapopulacao Fonte-dreno. Por outro lado, Viscosia cobbi por ser uma especie vagil nadadora e capaz de resistir ao carreamento apos suspensao, atraves do comportamento ativo de natacao. Especies vageis nadadoras se ajustam assim ao conceito classico de metapopulacoes, com populacoes regionais apresentando fluxo genico restrito. Em ultima analise, para determinar a importancia dos grupos funcionais de dispersao na estrutura genetica das populacoes e aplicacao do conceito de metapopulacoes para nematoides marinhos, a comparacao com especies vageis rastejadoras, assim como para outras especies sedentarias e vageis nadadoras, e extremamente relevante e necessaria.

Submitted by Milena Dias (milena.dias@ufpe.br) on 2015-03-10T18:58:27Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Tatiana Alves.pdf: 1748447 bytes, checksum: c8e3f056f6b74473117874223beafe65 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-10T18:58:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Tatiana Alves.pdf: 1748447 bytes, checksum: c8e3f056f6b74473117874223beafe65 (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2009 / Os Nematoda são os organismos mais abundantes da meiofauna, principalmente em estuários, apresentando uma organização variada e complexa. Esse grupo constitui o mais importante a níveis de densidade, diversidade e consumidor secundário. O trabalho teve como objetivos determinar a dominância de Nematoda em relação a dos demais grupos da meiofauna; os parâmetros da estrutura da comunidade de Nematoda: diversidade, densidade e abundância; correlacionar a distribuição espaço-temporal dos gêneros de Nematoda com os parâmetros bióticos/abióticos e dos gêneros mais abundantes identificar ao nível específico. As coletas foram realizadas no estuário do rio Carrapicho-PE em 4 estações, do infralitoral, em janeiro, fevereiro, junho e agosto/2004. Para a coleta da meiofauna utilizou-se seringa plástica de 2,0 cm de diâmetro interno e 5,0 cm de altura. Através da garrafa oceanográfica de Niskin foram coletadas amostras de água na superfície para análise da biomassa primária, temperatura, salinidade, oxigênio, pH. Amostras superficiais de sedimento foram coletadas para a análise granulométrica. Para a análise dos dados foi calculada a freqüência de ocorrência e abundância relativa dos grupos de meiofauna e gêneros de Nematoda; classificação trófica;índices de diversidade Shannon-Weaner, equitabilidade de Pielou e o de riqueza de Margalef; análise de ordenação não-métrica multidimensional (MDS); o ANOSIM bi-fatorial para as significâncias das similaridades relacionadas aos grupos de amostras dos fatores espacial e temporal; análise SIMPER para determinar quais os gêneros que mais contribuíram para as dissimilaridades entre as amostras e ánalise BIOENV para a relação entre as variáveis ambientais e a distribuição espaço-temporal de Nematoda. Os Nematoda dominaram a meiofauna em todos os meses, com até 99,6% dos organismos e classificados como grupo constante. A abundância dos Nematoda variou entre 97,5% em agosto a 99% em janeiro. Um total de 51 gêneros e 17 famílias foram listadas. Terschellingia e Spirinia ocorreram em maior abundância, sendo identificadas as espécies T. longicaudata, T. mora e S. parasitifera. Houve uma dominância dos grupos tróficos de hábito raspador, no período seco, e uma alternância, no chuvoso, entre raspadores e detritívoros não-seletivos. Tanto o período seco quanto o chuvoso apresentam oscilações quanto a diversidade. A maior riqueza de indivíduos ocorre em agosto. A equitabilidade entre as estações dos meses secos foram mais diversos, e no chuvoso houve uma maior uniformidade da distribuição dos indivíduos. O MDS apresentou uma maior similaridade entre amostras de janeiro, fevereiro e agosto. Na variação espacial o MDS indicou que as amostras da estação II estão próximas entre si, formando um grupo maior. A maioria das amostras da estação I, algumas da IV e da III estão se agrupando com as da estação II. O ANOSIM indicou haver diferenças espaço-temporal entre as amostras. Segundo o SIMPER Terschellingia e Spirinia foram os maiores responsáveis pelas dissimilaridades entre os meses e estações. O Bio-Env indicou a temperatura, oxigênio dissolvido, pluviometria, percentual de silte/argila como os fatores ambientais responsáveis que melhor explicaram a associação dos Nematoda na distribuição espacial e temporal com os fatores biológicos. Conclui-se que os Nematoda apresentaram uma variabilidade espaçotemporal aos níveis de densidade, diversidade e riqueza; os comedores de depósito não seletivos e os raspadores dominaram a comunidade e a comunidade de Nematoda do estuário do rio Carrapicho é semelhante a de outras comunidades de estuários brasileiros e mundiais.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:07:16Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3018_1.pdf: 1893063 bytes, checksum: 85f3900d7bc96891b2e542ad501df2ff (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi conhecer a estrutura de comunidade da meiofauna de substrato inconsolidado em ambiente recifal, suas interações com fatores ambientais e relacionála com a proteção ambiental e a influência do recife sobre a mesma. Foram feitas coletas nos meses de abril e setembro de 2008, dentro e fora de uma área de proteção ambiental. As duas áreas são compostas por areia grossa, com baixo teor de matéria orgânica. Foram encontrados 15 táxons da meiofauna, 56 gêneros de Nematoda e 18 gêneros de Polychaeta. A meiofauna apresentou diversidade foi maior na área protegida e na área mais afastada do recife, sendo estes resultados significativos. Os Nematoda não apresentaram diferença significativa de diversidade entre as áreas, tanto em relação a proteção quanto em relação ao afastatamento do recife. Os Polychaeta também não apresentou diferença significativa na diversidade entre as áreas comparadas, apesar da riqueza ser significativamente maior na área mais afastada do recife. As diferenças encontradas em relação aos parâmetros sedimentológicos e em relação aos parâmetros de estrutura biológica foram pequenas, indicando que algum fator foi subestimado teria influencia maior que os parâmetros aferidos. Ainda assim a influencia do recife sobre a comunidade foi claramente constatada, existindo ainda a necessidade de mais estudos, tanto em termos de variabilidade espacial, como em relação aos estudos de comunidade e os efeitos de cadeia sobre elas