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The genetic analysis of the vulval cell lineages of Caenorhabditis elegans /

Ferguson, Edwin L. January 1900 (has links)
Thesis (Ph. D.)--Massachusetts Institute of Technology and Woods Hole Oceanographic Institution. 1985. / Bibliography: p. 325-332.
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Variabilidade genética e fisiológica de populações de Meloidogyne incognita e identificação de QTLs de uma nova fonte de resistência do algodoeiro (Gossypium spp.) a esse nematoide / Genetic and physiological variability of Meloidogyne incognita populations to resistant cotton genotypes (Gossypium spp.) and identification of QTLs associated with resistance to this nematode

Silva, Esdras Henrique 24 July 2014 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-29T12:24:37Z No. of bitstreams: 1 2014_EsdrasHenriqueSilva_Parcial.pdf: 1455835 bytes, checksum: f13ea5b9310477f8d5f474487a41a55c (MD5) / Approved for entry into archive by Patrícia Nunes da Silva(patricia@bce.unb.br) on 2015-01-29T12:53:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_EsdrasHenriqueSilva_Parcial.pdf: 1455835 bytes, checksum: f13ea5b9310477f8d5f474487a41a55c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-29T12:53:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_EsdrasHenriqueSilva_Parcial.pdf: 1455835 bytes, checksum: f13ea5b9310477f8d5f474487a41a55c (MD5) / CAPÍTULO 2 - O nematoide das galhas Meloidogyne incognita (Kofoid & White) Chitwood, 1949 é um dos mais importantes patógenos na cultura do algodão (Gossypium spp.), além de ser amplamente distribuído. Os objetivos deste estudo foram avaliar a variabilidade genética entre populações brasileiras de M. incognita e agressividade/virulência dessas populações em diferentes cultivares de algodoeiro. Cinco isolados de M. incognita e um isolado de M. enterolobii (outgroup) foram utilizados nas análises moleculares. Os resultados mostraram que apenas 2,7% dos fragmentos de DNA foram polimórficos. Apesar da existência de duas raças (raças 3 e 4) e dois fenótipos de esterase (I1 e I2), foi observada uma baixa variabilidade genética entre os isolados, o que pode ser devido ao modo de reprodução partenogenético mitótico do patógeno. A agressividade/virulência entre os isolados em relação a diferentes genótipos de algodoeiros também foi estudada. Nenhuma das populações foi virulenta aos genótipos de algodoeiros resistentes M-315 RNR, TX-25, CIR1343, Wild mexicano Jack Jones e CIR1348, que apresentaram FR <1.0. Duas populações de M. incognita dos estados de Mato Grosso do Sul e Paraná (Umuarama) (raças 4 e 3, respectivamente) foram altamente agressivas em relação ao controle suscetível FM966 e virulentas para os acessos LA-887 e Clevewilt-6 que mostraram resistência moderada a outras populações testadas. / The root-knot nematode Meloidogyne incognita (Kofoid & White) Chitwood, 1949 is widely distributed and a major pathogen of cotton (Gossypium spp.) worldwide. The objectives of this study were to assess the genetic variability and aggressiveness/virulence among Brazilian populations of M. incognita in cotton. Five isolates of M. incognita and one isolate of M. enterolobii (outgroup) were used in the molecular analyses. Our results showed that only 2.7% of the fragments of DNAwere polymorphic. Despite the existence of two races (races 3 and 4) and two esterase phenotypes (I1 and I2), a low genetic variability among isolates was observed, which might be due to the mitotic parthenogenetic mode of reproduction of this pathogen. The aggressiveness/virulence among isolates towards different cotton genotypes was also studied. None of the populations was virulent to the resistant cotton genotypes M-315 RNR, TX-25, CIR1343, Wild Mexican Jack Jones and CIR1348, that presented RF<1.0. Two populations of M. incognita from the states of Mato Grosso do Sul and Paraná (Umuarama) (races 4 and 3, respectively) were highly aggressive to the susceptible control FM966 and virulent to the accessions LA-887 and Clevewilt-6 that showed moderate resistance to the other populations tested.
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Multiplicação do nematoide meloidogyne javanica em plantas invasoras e seu efeito sobre o desenvolvimento do manjericão

Guimarães, Thássya Menezes 06 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-04-03T13:06:23Z No. of bitstreams: 1 2012_ThassyaMenezesGuimaraes.pdf: 1338802 bytes, checksum: 247b1b23ce05f0682464fdb01a0b9448 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-04-17T14:08:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_ThassyaMenezesGuimaraes.pdf: 1338802 bytes, checksum: 247b1b23ce05f0682464fdb01a0b9448 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-04-17T14:08:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_ThassyaMenezesGuimaraes.pdf: 1338802 bytes, checksum: 247b1b23ce05f0682464fdb01a0b9448 (MD5) / Foram realizados dois ensaios para estudar a multiplicação do nematoide Meloidogyne javanica em plantas invasoras e seu efeito sobre o desenvolvimento do manjericão (Ocimum basilicum L.). O primeiro ensaio objetivou acessar o efeito da multiplicação do nematoide sobre o manjericão mediante inoculação controlada das ervas em pré-cultivo. Os tratamentos com cinco repetições constaram de sete espécies de plantas invasoras postas a crescer por sessenta dias em vasos de 2,5 L contendo mistura de latossolo vermelho de cerrado mais areia, vermiculita e composto orgânico mais a formulação 4-14-8, na dose de 100g para 40 L da mistura. A testemunha foi o pousio. O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado. Todos os vasos com solo previamente esterilizado foram inoculados com 10.000 ovos de uma população de M. javanica encontrada no cerrado de Brasília. As espécies invasoras foram: Hyptis pectinata, Cyperus rotundus, Paspalum notatum, Talinum triangulare, Hydrocotile umbellata, Sphagneticola trilobata (L.) Pruski e Artemisia verlotorum. Após 60 dias de cultivo as ervas tiveram a parte aérea cortada e no vaso, sobre seu resto cultural foi plantado o manjericão (O. basilicum cv Folha Miúda) comumente encontrado no comércio de Brasília. Decorridos mais sessenta dias o manjericão foi desenvasado e seu sistema radicular observado para atribuição do índice de galhas (IG) pela escala de Taylor & Sasser (1978). Os resultados mostraram que o manjericão cultivado nos restos culturais de H. pectinata, T. triangulare e C. rotundus apresentou altos índices de galhas, variando de 4,2 a 5,0 (índice mais alto da escala), enquanto que sobre P. notatum, H. umbellata, S. trilobata, A. verlotorum, e a testemunha (pousio), a ausência de galhas foi notável, não passando a média dos IGs de 1,2. O objetivo do segundo ensaio foi estudar a multiplicação de uma população de M. javanica descrito acima em dez espécies de plantas invasoras. Em ensaio de vasos em casa de vegetação do tipo glasshouse, dez espécies de plantas invasoras foram inoculadas com 4.000 ovos de M. javanica e deixadas a crescer por 60 dias, quando então foram extraídos e contados os ovos do sistema radicular para se determinar o FR. Os resultados obtidos mostram que o uso do FR para revelar a capacidade de dez espécies invasoras em multiplicar a população de M. javanica, definiu como hospedeiras A. verlotorum, H. pectinata e T. paniculatum. T. paniculatum foi a espécie que melhor multiplicou o nematoide. As espécies S. trilobata, B. pilosus, H. bonariensis, P. notatum, C. rotundus A. conyzoides e T. triangulare não se revelaram boas hospedeiras. _____________________________________________________________________________________________________________________________ ABSTRAC / Two experiments were carried out to study the reproduction of Meloidogyne javanica in selected weed species and its effect on growth of brasil Ocimum basilicum L. The first experiment aimed to access the effect of M. javanica reproduction on weeds prior to cultivation of basil. The treatments consisted of seven weed species grown in pots of 2.5 L filled with sterilized mixture of savannah red latosol, sandy plus vermiculite, plus organic compound and the formulation 4-14-8, at a dose of 100 g to 40 L of the mixture, plus the nematodes. Soil without weeds and nematodes served as a control. The experiment was carried out under greenhouse conditions in a completely randomized design with five replicates. The pots were inoculated with a suspension of 10,000 eggs of M. javanica (a pure culture originally found in the cerrado near Brasília-Brazil). Sixty days pots inoculation, weeds aerial parts (leaves and stems) were removed and basil seedlings (cv Folhas Miúda) were transplanted in the pots. Two months later, the reproduction of M. javanica on basil plants was evaluated using the gall index (GI). Our results showed tht basil grown in pots previously cultivated with Hyptis pectinata, Talinum tiangulare and Cyperus rotundus had high GI, ranging from 4.2 to 5.0 (highest index), while Paspalum notatum, Hydrocotile umbellate, Sphagneticola trilobata, Artemisia verlotorum and the control had overall a low GI of less than 1.2. The goal of the second experiment was to study the reproduction of M .javanica (population described above) in tem species of weeds. Weeds grown under glasshouse as described above were inoculated with a suspension of 4.000 eggs/plant of M. javanica. Two months later, the reproduction factor (FR = final population/initial population) was determined. Our results showed that the weeds species A. verlotorum, T. oaniculatum and H. pectinata were good hosts for M. javanica. Besides, T. paniculatum was the species that best multiplied the nematode (FR˃28). The weed species S. trilobata, B. pilosa, H. bonariensis, P. notatum, C. rotundus, A. conyzoides and T. triangulare were not good host for M. javanica
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Contagem de ovos de nematódeos gastrintestinais em ovelhas Santa Inês no período periparto, no Distrito Federal

Rufino, Luis Alberto Linhares 04 1900 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2007. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2009-12-09T14:53:43Z No. of bitstreams: 1 2007_LuisAlbertoLinharesRufino.PDF: 171784 bytes, checksum: 4e333f8cd032238638441f66d900d643 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2010-01-07T00:45:49Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_LuisAlbertoLinharesRufino.PDF: 171784 bytes, checksum: 4e333f8cd032238638441f66d900d643 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-07T00:45:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_LuisAlbertoLinharesRufino.PDF: 171784 bytes, checksum: 4e333f8cd032238638441f66d900d643 (MD5) Previous issue date: 2007-04 / A presente pesquisa teve por objetivo avaliar a variação na quantidade de ovos de nematódeos gastrintestinais eliminados nas fezes de ovinos da raça Santa Inês no período do peri-parto numa propriedade próxima a cidade de Samambaia, no Distrito Federal. O grupo experimental foi composto por dezenove matrizes em período peri-parto, com idade entre 2 e 3,5 anos, mantidas em regime semi-intensivo, sendo sete nativas e doze adicionadas ao rebanho um ano antes do início do experimento. Foram realizadas colheitas quinzenais individuais, totalizando quatrocentas amostras. As fezes foram obtidas diretamente da ampola retal em sacos plásticos individuais e mantidas a 4ºC até o processamento. O número de ovos foi determinado utilizando-se a técnica de GORDON e WHITLOCK (1939) modificada. Os animais não foram desverminadas durante o experimento. Foram observadas diferenças nas quantidades de ovos eliminados nas fezes desses animais tanto nas três fases do peri-parto (pré-parto, lactação e desmame), quanto em relação à origem dos animais e ao tipo de parto. _________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The present research was carried out to evaluate the variation on eggs output ing by gastrintestinal nematodes in Santa Inês sheep during the periparturient period. The experimental group were composed by nineteen ewes, aged between 2 to 3.5 years old, maintained in semi-intensive system in a farm near Samambaia district, in the Distrito Federal. The ewes were from different origins: seven were natives and twelve were introduced to the flock one year before the beginning of the experiment. Individual samples were collected each fifteen days, totalizing four hundred samples. Rectal faecal samples were collected in plastic bags and stored at 4ºC for later analysis. The number of eggs was determined for each sample using the modified GORDON & WHITLOCK technique. There were differences in amount of eliminated eggs quantities related to the three stages of the periparturient period (pré-parturient, lactation and weaning), as well as considering the origin of the animals and related to the number of borned lambs per ewe.
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Caracterização genética e molecular de acessos de bananeira a Radopholus similis e Meloidogyne incognita

Santos, Jansen Rodrigo Pereira 05 April 2011 (has links)
Tese (doutorado)-Univesidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2011. / Submitted by Jadiana Paiva Dantas (jadi@bce.unb.br) on 2011-06-27T14:44:11Z No. of bitstreams: 1 2011_JansenRodrigoPereiraSantos.pdf: 2733197 bytes, checksum: 7bf99f2770c187b6ba5bc58259257e51 (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-06-28T17:59:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_JansenRodrigoPereiraSantos.pdf: 2733197 bytes, checksum: 7bf99f2770c187b6ba5bc58259257e51 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-06-28T17:59:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_JansenRodrigoPereiraSantos.pdf: 2733197 bytes, checksum: 7bf99f2770c187b6ba5bc58259257e51 (MD5) / A cultura da bananeira tem grande importância econômica e social em todo o mundo. O Brasil é o quarto produtor mundial de banana, sendo esta cultivada de Norte a Sul do País e, praticamente toda produção é comercializada no mercado interno. Problemas fitossanitários de variadas etiologias reduzem a vida útil dos plantios e levam a perdas na produção e na qualidade dos frutos. Dentre os fitonematoides, Radopholus similis, Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria, Helicotylenchus multicinctus, Rotylenchulus reniformis e Pratylenchus coffeae são considerados os de maior importância para a bananicultura. O parasitismo dos nematoides além de levar a perdas diretas, pode acarretar perdas indiretas, como gastos com fertilizantes, outros insumos e mão de obra para evitar maiores perdas de produção. Também o uso de nematicidas pode acarretar em risco de intoxicação durante a aplicação e de contaminação do meio ambiente. Tendo em vista que o princípio da resistência de plantas a doenças constitui uma das medidas de controle mais compatíveis com a sustentabilidade agrícola, estabelecemos como objetivo deste projeto buscar uma forma de viabilizar o controle de nematoides por meio de resistência e tolerância varietal na cultura da banana, estudando a variabilidade do patógeno e do hospedeiro, além de iniciar o estudo da interação nematoide vs. Musa utilizando técnicas moleculares. O uso de métodos de multiplicação em massa de fitonematoides in vitro em condições axênicas permite intensificar os estudos de taxonomia, biologia, epidemiologia e controle desses patógenos. Portanto, devido a necessidade de multiplicação massal de R. similis para a produção de inóculo com a finalidade de atender aos experimentos, tentou-se otimizar o método de multiplicação do inóculo para o nematoide, já que há variação da eficiência entre diferentes métodos de multiplicação. Foram avaliadas duas metodologias de multiplicação in vitro para R. similis e Pratylenchus brachyurus em três períodos de avaliação (20, 40 e 60 dias). Ambas as metodologias utilizam cilindros de cenoura em frascos com tampas, sendo que em uma delas foi adicionado meio agar-água no interior dos frascos. O método com agar-água mostrou-se mais efetivo que o método sem agar-água, para ambas as espécies, com um aumento populacional em torno de 280 vezes para R. similis e 226 vezes para P. brachyurus, enquanto o outro método aumentou 5 e 2 vezes, respectivamente, após 60 dias. O grau de resistência de oito acessos de bananeiras a diferentes populações de R. similis foi verificado e a diferença de agressividade entre as populações do nematoide também foram avaliadas. Plantas dos acessos 4249-05, 4279-06, Yangambi Km5, 0323-03, 0337-02, 1304-06, Borneo e Grande Naine foram inoculadas com 400 nematoides por planta e mantidas em casa de vegetação por 60 dias. Cada acesso foi inoculado com três populações de R. similis provenientes de Pernambuco, Distrito Federal e Santa Catarina, separadamente, com 5 repetições. Os acessos 4249-05, Yangambi Km5, 0323-03 e 4279-06 apresentaram níveis diferentes de resistência ao nematoide cavernícola com base na percentagem de redução do fator de reprodução. A população de PE foi considerada a mais agressiva em relação às demais, enquanto que a do DF foi mais agressiva que a de SC. Foi avaliada também a reação de clones diploides e triploides de bananeira em relação aos nematoides R. similis (nematoide cavernícola) e M. incognita (nematoide das galhas), em condições de campo com base nas taxas de multiplicação de cada nematoide e no desenvolvimento das plantas. As plantas foram previamente inoculadas com 200 juvenis, machos e fêmeas de R. similis, ou 2500 ovos e juvenis de M. incognita em vasos distintos. Os acessos foram avaliados após 13 meses da inoculação, em condições de campo. Os acessos 1304-04, 4223-06, 1318-01, 1319-01, Tjau Lagada e N118 se mostraram tolerantes ao nematoide cavernícola e os acessos N118, Pipit e Birmanie tolerantes ao nematoide das galhas, sendo que estes acessos permitiram a multiplicação do nematoide e não tiveram o desenvolvimento afetado. Para o entendimento de componentes da resistência horizontal-vertical e da agressividade-virulência do patossistema Musa spp. vs. R. similis, foram utilizadas as populações de Santa Catarina (SC), Distrito Federal (DF) e Pernambuco (PE) do nematoide, além dos acessos 4249-05, Yangambi Km5, 0323-03, 4279-06, Grande Naine, 0337-02, Borneo e 1310-06. De cada população de R. similis foram inoculados 400 nematoides por planta em casa de vegetaçao. Os nematoides foram extraídos das raízes e do solo 60 dias após a inoculação. O fator de reprodução (FR) para cada acesso em relação a cada população de nematoide foi determinado. Na análise dos dados utilizou-se o modelo IV de Griffing (1956), no esquema de dialelo parcial, com quatro repetições. Os acessos com maior resistência horizontal foram 4249-05 e Yangambi Km5 e a população mais agressiva do patógeno foi a de Pernambuco. Marcadores moleculares SSR e RAPD foram utilizados para a análise molecular de 11 acessos de Musa contrastantes para os fenótipos de resistência aos nematoides R.similis, M. incognita, M. javanica e M. arenaria, visando identificar primers e selecionar marcadores moleculares promissores para futuros trabalhos de mapeamento genético da resistência, além de estudar a diversidade genética dos acessos. Os acessos Birmanie, Pisang Nangka, Borneo, Grande Naine, Yangambi Km5, 1304-06, 4279-06, 4223-06, 8694-15, 1304-04 e 4249-05 foram selecionados conforme a percentagem de redução do fator de reprodução de cada espécie de nematoide de acordo com Santos (2007) e Teixeira (2007). O DNA genômico dos onze acessos foi extraído, sendo utilizados 13 primers RAPD e 14 pares de primers microssatélites. Um total de 195 marcadores RAPD e 59 alelos microssatélites foram gerados. Do total de marcadores, 183 RAPD e 56 SSR foram polimórficos e, 44 e 17, respectivamente, mostraram-se promissores para trabalhos futuros de mapeamento genético para resistência a M. incognita, M. javanica, M. arenaria e R. similis. Entre todos os primers utilizados, 92 % para RAPD e 78 % para SSR geraram ao menos uma banda ou alelo promissor para estudos de mapeamento genético. Os primers decâmeros para RAPD OPE-09, OPG-12 e OPG-05 e, os pares de primers SSR AGMI25/AGMI26 e AGMI101/AGMI102 apresentaram o maior número de alelos promissores e se destacaram para futuros trabalhos de mapeamento genético. As distâncias genéticas entre os diferentes acessos baseadas nos marcadores RAPD variaram de 0,29 a 0,62 e, com base nos microssatélites variaram de 0,33 a 0,78. Os acessos Pisang Nangka e Grande Naine apresentaram a menor distância genética com base nos marcadores RAPD e os acessos Yangambi Km5 e 4223-06 com base nos marcadores SSR. Os acessos contrastantes para a resistência, 4279-06 e Borneo apresentaram, respectivamente distância genética de 0,48 e 0,60 e um total de 37 marcadores RAPD e 10 alelos SSR polimórficos e promissores para o mapeamento genético. Para os acessos contrastantes 4279-06 e 1304-04, as distâncias genéticas foram, respectivamente, de 0,47 e 0,46 e o total de bandas polimórficas promissoras para o mapeamento foi de 36 e 9 para os marcadores RAPD e microssatélites. Para analisar a expressão de genes análogos de resistência (RGAs) em acessos resistente (Yangambi Km5) e suscetível (Grande Naine) ao nematoide R. similis, na presença e ausência do patógeno em momentos diferentes após a inoculação, um bioensaio foi realizado com duração de 7 dias em casa de vegetação. As raízes foram coletadas em quatro períodos distintos, 0, 3, 5 e 7 dias após inoculação. Doze pares de primers desenhados a partir de sequências de RGAs da família NBS-LRR (sítio de ligação a nucleotídeos e região de repetição rica em leucina) foram utilizados para a análise de expressão diferencial via RT-PCR a partir do RNA extraído das raízes. Seis protocolos de extração de RNA foram testados. O protocolo do Concert Plant RNA Reagent foi selecionado, pois possibilitou a extração de RNA em quantidade e qualidade ideais. Os genes RGC5 e RGA14 não foram expressos em nenhum dos dois acessos. Os genes RGA10, Franc_MbPKW_RGA08L, Franc_MbPKW_RGA08O, se revelaram como constitutivos e expressos em todos os tempos para ambos os acessos. Outros genes que apresentaram uma expressão basal foram os RGA37, RGA41, RGC3 e RGC1, sendo que o primeiro foi expresso de forma constitutiva apenas para Yangambi Km5, os dois seguintes apenas para Grande Naine, e o últimos para ambos os acessos. O gene Franc_MbPKW_RGA08E teve um aumento na concentração a partir do tempo 3 para o acesso resistente, sendo que para a planta suscetível este gene só foi começar a ser expresso no tempo 7. O gene RGC2 foi expresso apenas no acesso resistente no tempo 5. O gene Franc_MbPKW_RGA08K foi expresso tardiamente em Grande Naine e para Yangambi Km5 foi constitutivo, mas deixou de ser expresso a partir do período de tempo 3. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Banana plantations have great economic and social importance worldwide. Brazil is the fourth largest producer of bananas, which is planted from North to South, and almost total fruit produced is sold domestically. Phytosanitary problems of varied etiologies reduce crop life span and lead to yield losses and poor fruit quality. Among the plant-parasitic nematodes, Radopholus similis, Meloidogyne incognita, M. javanica, M. arenaria, Helicotylenchus multicinctus, Pratylenchus coffeae and Rotylenchulus reniformis are considered the most important for banana production. Parasitism by nematodes also lead todirect and indirect losses, such as spending on fertilizers, and other inputs and labors to mitigate crop losses. Furthermore, the use of nematicides can carry risks of intoxication during application, and environmental contamination. Considering that the principle of plant resistance to diseases is one of the most consistent strategy with sustainable farming, the goal for this project is to achieve control of nematodes in banana through varietal resistance or tolerance. For that, we analyzed the variability of the pathogen and host, and studied the interaction Musa vs. nematode at molecular level. The use of mass multiplication methods of plant-parasitic nematodes in vitro allows to intensify studies on taxonomy, biology, epidemiology and control of these pathogens. Due to the need of mass production of nematodes for supplying inoculum for the experiments in this project, we optimized the method of multiplication of R. similis, since the efficiency of the methods of multiplication varies widely. Therefore, two methods for in vitro multiplication of R. similis and Pratylenchus brachyurus were evaluated in three time periods (20, 40 and 60 days). Both methods used carrot cylinders in closed lid jars. In one of them, it water-agar was added covering the bottom of the jars, whilst in the second method no water-agar was added. For both species the method with water-agar proved to be more the most efficient, with a population increase of 280 times for R. similis and 226 times for P. brachyurus, whilst by the other method, the nematode populations increased 5 and 2 times, respectively, after 60 days. ix The degree of resistance of eight accessions of banana to three different populations of R.similis has been verified, and the difference in aggressiveness between populations of the nematode has also been evaluated. Plants of accessions 4249-05, 4279-06, Yangambi Km5, 0323-03, 0337-02, 1304-06, Borneo and Grande Naine were inoculated with 400 nematodes per plant and maintained under greenhouse for 60 days. Each access was inoculated with three populations of R.similis from Pernambuco (PE), Federal District (DF) and Santa Catarina (SC), separately, with five replicates. Accessions 4249-05, Yangambi Km5, 0323-03 and 4279-06 expressed different levels of resistance to the burrowing nematode. The population from PE was considered the most aggressive. The population from DF was more aggressive whe compared to the one from SC. The reaction of clones of diploid and triploid bananas was evaluated to the burrowing nematode (R. similis), and to the root-knot nematode (Meloidogyne incognita), under field conditions, based on the multiplication rates of each nematode and plant development. Plants were inoculated with 200 juveniles, males and females of R.similis, or 2500 eggs and juveniles of M. incognita in pots, separately. The accessions were evaluated 13 months after inoculation under field conditions. Accessions 1304-04,4223-06, 1318-01, 1319-01, Tjau Lagada and N118 reacted as tolerant to the burrowing nematode, while N118, Birmanie, Pipit as tolerant to the root-knot nematode. To understand the components of horizontal-vertical resistance and of virulence-aggressiveness in the pathosystem Musa spp. vs. R. similis were used, three populations of R. similis, from Santa Catarina (SC), Federal Distrito (DF), Pernambuco (PE), and eight accessions of banana (4249-05, Yangambi KM5, 0323-03, 4279-06, Grande Naine, 0337-02, Borneo, and 1310-06). Each accession was inoculated with 400 nematodes per plant under greenhouse. The nematodes were extracted from roots and soil 60 days after inoculation. The reproduction factor (RF) for each accession and each nematode population was determined. The model IV of Griffing (1956) was adopted for analyzing the data, in partial diallel scheme with four replications. The accessions with higher horizontal resistance were 4249-05 and Yangambi Km5, and PE was the most aggressive population of the pathogen. Evidence of vertical and horizontal resistance were observed. RAPD and SSR markers were used for molecular characterization of 11 genotypes of Musa with contrasting phenotypes of resistance to the nematodes R. similis, M. incognita, M. javanica and M. arenaria, aiming to select primers and molecular markers for future work on genetic mapping of the resistance. In addition the genetic diversity of the banana genotypes was studied. These accessions were selected from a working x collection of 26 accessions of banana, based on the evaluation of the reproduction factor for each nematode species. Genomic DNA was extracted from the selected acessions, and used 13 RAPD primers and 14 pairs of microsatellite primers for obtaining molecular markers. A total of 195 RAPD markers and 59 microsatellite alleles were generated. Of the total markers, 183 RAPD and 56 SSR were polymorphic, and 44 and 17, respectively, have shown to be promising for future studies of genetic mapping for resistance to M. incognita, M. javanica, M. arenaria and R. similis. Among all primers used, 92% RAPD, and 78% SSR primers generated at least one band or allele promising for genetic mapping. Decamer primers for RAPD, OPE-09, OPG-12 and OPG-05 and the pairs of SSR primers AGMI25/AGMI26 and AGMI101/AGMI102 showed the highest number of alleles promising for future works of genetic mapping. The genetic distances between the different accessions based on RAPD markers ranged from 0.29 to 0.62 and, based on microsatellites ranged from 0.33 to 0.78. Accessions Grande Naine and Pisang Nangka showed the smallest genetic distance based on RAPD markers, and accessions Yangambi Km5 and 4223-06 the smallest distance based on SSR markers. For the contrasting accessions for resistance, Borneo and 4279-06 the genetic distances were respectively 0.48 and 60 and, with a total of 37 RAPD and 10 SSR polymorphic alleles promising for genetic mapping. For the contrasting accessions 4279-06 and 1304-04, genetic distances were, respectively, 0.47 and 0.46, and the total number of polymorphic bands promising for genetic mapping was 36 and 9 for the RAPD and microsatellites. To analyze the expression of RGAs in banana accenssions, resistant (Yangambi Km5) and susceptible (Grande Naine) to the nematode R. similis in the presence and absence of the pathogen, were used at different time periods after inoculation. A bioassay was conducted for 7 days in a greenhouse. Roots were collected in four distinct periods, 0, 3, 5 and 7 days after inoculation. Twelve pairs of primers designed from sequences of RGAs from the NBS-LRR family were used for analysis of differential expression by RT-PCR from RNA extracted from roots. Six RNA extraction protocols were tested. The protocol Concert™ Plant RNA Reagent was selected since it allowed the extraction of RNA in ideal quantity and quality. The genes RGC5 and RGA14 were not expressed in any of the two accessions. The genes RGA10, Franc_MbPKW_RGA08L, Franc_MbPKW_RGA08O, were revealed as constitutive and expressed in all times for both accessions. Other genes that showed a basal expression were RGA37, RGA41, RGC3 and RGC1. The first one was expressed constitutively only in Yangambi Km5, the next two only in Grande Naine, and the last one was expressed in both accessions. The gene xi Franc_MbPKW_RGA08E had an increased concentration starting from time 3 in the resistant accession, while in the susceptible one, this gene was only beginning to be expressed at time 7. The gene RGC2 was expressed only in the resistant accession, beginning at time 5. The gene Franc_MbPKW_RGA08K was expressed late in Grande Naine, and it proved to be constitutive in Yangambi Km5, but it stopped to be expressed at time 3.
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Comunidades de nematóides associadas às principais fitofisionomias do cerrado do parque nacional de Brasília

Rodrigues, Cecília da Silva 29 July 2011 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Fitopatologia, 2011. / Submitted by Shayane Marques Zica (marquacizh@uol.com.br) on 2011-11-10T14:49:16Z No. of bitstreams: 1 2011_CecíliadaSilvaRodrigues.pdf: 1084317 bytes, checksum: 547b843001bb5f80e6cde7cfadf47d73 (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2011-12-20T11:29:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_CecíliadaSilvaRodrigues.pdf: 1084317 bytes, checksum: 547b843001bb5f80e6cde7cfadf47d73 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-12-20T11:29:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_CecíliadaSilvaRodrigues.pdf: 1084317 bytes, checksum: 547b843001bb5f80e6cde7cfadf47d73 (MD5) / As comunidades de nematoides de solo foram estudadas em cinco diferentes fitofisionomias (Cerrado sensu stricto, Campo cerrado, Campo limpo, Campo sujo e Mata de galeria) do bioma Cerrado presentes no Parque Nacional de Brasília, DF. A amostragem de solo foi realizada em parcelas (quadrantes de 50 x 50 m), com profundidade de 0 a 20 cm, no período de julho a setembro de 2010. Foi feita contagem do número total de nematoides de cada amostra e para confecção das lâminas permanentes foram usados 100 nematoides de cada amostra separados ao acaso e identificados a nível de gênero. Posteriormente foram feitos cálculos das medidas ecológicas e de distúrbios (Abundância total, relativa e absoluta; Riqueza de gêneros, Índice de Shannon-Weaver e Equitatividade de Shannon, Índice de Simpson e Equitatividade de Simpson; Estrutura trófica, Diversidade trófica, Padrão de decomposição, MI, mMi, MI 2-5 e PPI) e análises estatísticas pelo teste de Scott-Knott e analise multivariada de agrupamento com os dados de abundância da comunidade de nematoides. Foram identificados 55 gêneros de nematoides pertencentes a 29 famílias. A Mata de galeria foi a fitofisionomia que apresentou a maior abundância total, enquanto que o Campo sujo foi a que apresentou a menor abundância, entretanto, este apresentou o maior número de gêneros. Os nematoides que apresentaram maiores abundâncias foram Rotylenchus spp., Xiphinema spp., e Discocriconemella spp. Em todos os sistemas, os gêneros da superfamília Criconematoidea foram encontrados de forma bastante representativa. A riqueza de gêneros foi maior no Campo sujo e menor na Mata de galeria. Os sistemas Campo sujo e Cerrado sensu stricto foram os sistemas que obtiveram as maiores médias no cálculo de Índice de Shannon-Weaver. Essas tendências se repetiram nos cálculos da Equitatividade de Shannon, Índice e Equitatividade de Simpson. Os índices de distúrbios indicaram que os ambientes estudados apresentaram-se pouco perturbados. O grupo trófico mais representativo foi o dos nematoides parasitas de plantas, seguidos pelos bacteriófagos. O Cerrado sensu stricto foi o sistema que apresentou a maior abundância de nematoides parasitas plantas. Os nematoides bacteriófagos foram mais abundantes nos sistemas Campo cerrado, Campo sujo e Campo limpo. Os micófagos se apresentaram em maiores números no Campo sujo acompanhados dos predadores. A Mata de galeria também apresentou grande abundância de micófagos. Já os onívoros foram mais abundantes no Campo limpo. O maior valor do índice FF/BB foi observado na Mata de galeria, mas não houve diferença estatística significativa com relação aos demais sistemas. Já com relação ao índice (FF+BF)/PP, os maiores valores foram observados nos sistemas Campo sujo e Campo limpo, porém também não houve diferença estatística significativa. Na análise multivariada para o agrupamento dos dados de abundância, observou-se a formação de dois grupos, o primeiro composto dos seguintes sistemas Campo cerrado, Cerrado sensu stricto, Mata de galeria e Campo sujo, os quais mostraram grande similaridade entre si. Já o segundo grupo incluiu apenas o sistema Campo limpo, mostrando divergência deste com relação aos outros sistemas. Resultados obtidos neste estudo confirmam resultados de trabalhos anteriores. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Assemblages of soil nematodes were studied in five different physiognomies of biome Cerrado (Cerrado sensu stricto, Campo cerrado, Campo limpo, Campo sujo, and Gallery forest) in the National Park of Brasília. Soil sampling was conducted in plots (quadrates of 50 x 50 m) with soil cores in the depth of 0 to 20 cm, from July to September, 2010. Total numbers of nematodes were counted in each sample, and permanent slides were mounted with 100 nematodes randomly selected for from each sample identification to the genus level. Later, ecological measures and disturbance indices were calculated (Total, Absolute and Relative abundances, Genus richness, Shannon-Weaver and Simpson’s indices, and their respective evenness, Trophic structure, Trophic diversity and the Trophic pattern of decomposition, MI, mMi, MI 2-5 and PPI). Statistical analysis by the test Scott-Knott, and multivariate clustering analysis were performed with data of abundance of the nematode assemblages. Fifty-five genera of nematodes were identified, belonging to 29 families. Gallery forest was the system with the highest total abundance, while Campo sujo showed the lowest number of nematodes, however, with the greatest number of genera. The nematodes present in higher abundances were Rotylenchus spp., Xiphinema spp., and Discocriconemella spp. Genera of superfamily Criconematoidea were highly represented in all systems evaluated. Genus richness was highest in Campo sujo and lowest in Gallery forest. Campo sujo and Cerrado sensu stricto were the systems with higher averages for Shannon-Weaver index. This tendency was consistent with calculation of Sampson’s index, evenness of Shannon, and evenness of Simpson. According to the disturbance indices the areas sampled were under low levels of disturbance. Plant-parasitic nematodes was the most representative trophic group in all systems evaluated, followed by the bacterial feeders. Cerrado sensu stricto was the system with the greatest abundance of plant parasitic-nematodes. The bacterial feeder nematodes were more abundant in Campo cerrado, Campo sujo and Campo limpo. The fungal feeders, and predators were present in higher numbers in Campo sujo. Gallery forest also showed large abundance of fungal feeders. Finally, omnivores were more abundant in Campo limpo. The highest value for the ratio FF/BB was observed in the Gallery forest, although, no statistically significant difference was observed in relation to the other systems. The ratio (FF+BF)/PP was higher in Campo cerrado and Campo limpo, but there was no statistically significant difference. Multivariate analysis for clustering data on abundance, divided the phytophysiognomies in two groups, the first one grouping the systems Campo cerrado, Cerrado sensu stricto, Gallery forest and Campo sujo, which shared great similarity between each other. The second group included only Campo limpo, showing no similarity with respect the other systems. Results of this study confirm data obtained in previous works.
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Variabilidade genética e agressividade a soja [Glycine max (L.) Merrill] de populações de Meloidogyne spp. do Cerrado e de áreas de cultivo / Genetic variability and aggressiveness to soybean [Glycine max (L.) Merrill] of Meloidogyne spp. populations from cerrado and cultivated areas

Mattos, Vanessa da Silva 24 April 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2013. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2013-08-20T15:21:18Z No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-27T13:11:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-27T13:11:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / A conversão para a agricultura intensiva, a fim de atender à crescente demanda por soja, cana-de-açúcar e criação de gado, está ocorrendo rapidamente sobre as vastas áreas dos 1,8milhões de km² do cerrado brasileiro, uma região que é naturalmente um mosaico de vegetação, clima e solos. Apesar de sua biodiversidade, há poucos estudos com nematoides, especialmente os do gênero Meloidogyne. O objetivo deste trabalho foi estudar e comparar a variabilidade genética e a variação em agressividade em cultivares de soja de populações de três espécies de Meloidogyne (M. javanica, M. incognita e M. morocciensis) provenientes de diferentes fitofisionomias do Cerrado e comparar com populações de áreas de cultivo agrícola. O estudo da variabilidade genética foi realizado através da utilização de 30 primers RAPD e 7 de AFLP. Bandas foram separadas num gel de agarose a 1,5% e contadas como presentes ou ausentes nas fotografias digitalizadas dos géis. Para cada um dos dois marcadores moleculares, esses dados referentes aos fragmentos foram convertidos em uma matriz binária. Análises de clusters mostraram a separação entre as populações do Cerrado e as populações de áreas de cultivo. A variabilidade intra-específica em M. javanica, M. morocciensis e M. incognita representou 26,7; 16,6 e 15,3% dos fragmentos polimórficos, respectivamente. A agressividade dessas populações em cinco diferentes cultivares de soja foi também estudada. O experimento foi conduzido em casa de vegetação em que cinco cultivares de soja foram inoculadas com 5.000 ovos por planta com cada população selecionada. Sessenta dias após a inoculação (DAI), foi determinado o fator de reprodução (FR). As populações de Meloidogyne spp. provenientes da soja e as populações coletadas no Cerrado apresentaramreações de agressividade semelhantes, com exceção de M. morocciensis, cuja população da soja foi bem mais agressiva que a do cerrado. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Conversion to intensive agriculture to meet rising demand for soybeans, sugarcane, and livestock products is rapidly occurring over vast areas of the 1.8 million km Brazilian Cerrado; a region that is naturally a mosaic of vegetation, climates and soils. Despite a vast biodiversity in the Cerrado, there are few studies with nematodes, especially those of the genus Meloidogyne. The aim of this work was to study and compare the genetic variability and variation in aggressiveness in soybean cultivars among populations of three Meloidogyne species (M. javanica, M. incognita and M. morocciensis) from different physiognomic vegetation of Cerrado and from crop areas. DNA amplifications were done using 7 AFLP and 30 RAPD primers. Amplified fragments were separated on a 1.5% agarose gel and scored as present or absent from the digitized photographs of the gels. For each of the two markers, DNA fingerprints of the populations were converted into a binary matrix. Cluster analyses separated Cerrado populations and the populations from cropping areas. The intraspecific variability in M. javanica, M. morocciensis and M. incognita represented 26,7%; 16,6% and 15,3% of the polymorphic fragments, respectively. The aggressiveness of the nematode populations on five soybean cultivars was also studied. The experiment was conducted under greenhouse conditions in which soybeans cultivars were inoculated with 5.000 eggs per plant of each population. Sixty days after inoculation, nematode reproduction factor (RF) was determined. Populations of Meloidogyne spp. from Cerrado and cultivated areas showedsimilar aggressiveness, except for M. morocciensis, whose population from soybean field was more aggressive than the one from Cerrado.
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Validação funcional de genes envolvidos com estresse de Meloidogyne incognita via RNA interferente in planta

Lourenço, Isabela Tristan 28 February 2014 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2014. / Submitted by Ruthléa Nascimento (ruthleanascimento@bce.unb.br) on 2014-05-20T15:47:56Z No. of bitstreams: 1 2014_IsabelaTristanLourenco.pdf: 2883653 bytes, checksum: 35a2b51e36c41ba42ef4670be0ea96c3 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2014-05-22T15:24:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_IsabelaTristanLourenco.pdf: 2883653 bytes, checksum: 35a2b51e36c41ba42ef4670be0ea96c3 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-05-22T15:24:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_IsabelaTristanLourenco.pdf: 2883653 bytes, checksum: 35a2b51e36c41ba42ef4670be0ea96c3 (MD5) / O fitonematoide Meloidogyne incognita é considerado um dos patógenos de plantas mais relevantes devido a sua distribuição mundial e os danos severos causados a várias culturas importantes agronomicamente. Práticas agronômicas têm tido geralmente pouco sucesso e alto custo, sendo o cultivo de variedades resistentes, quando existentes, a forma mais eficiente de controle. Uma estratégia alternativa promissora é a transformação genética de plantas para expressão de moléculas que afetem o metabolismo e desenvolvimento do nematoide. No presente trabalho foram selecionados dois genes-alvo homólogos a genes essenciais do nematoide modelo Caenorhabditis elegans para silenciamento gênico de M. incognita in planta: Isocitrato liase e hsp90. Visando a validação desses genes, para o controle deste fitonematoide, os fragmentos gênicos foram isolados e clonados em um vetor binário para expressão de dsRNA in planta. Plantas transgênicas de Nicotiana tabacum contendo as construções de RNAi foram obtidas através de transformação via Agrobacterium tumefaciens. As plantas expressando dsRNA de hsp90 apresentaram uma atraso na formação de galhas e menor número de células gigantes, observado aos 14 DAI. Os bioensaios com as plantas de tabaco GM nas gerações T1 e T2 mostraram os efeitos do silenciamento dos genes-alvo na reprodução do nematoide. Os testes de resistência mostraram, 45 DAI, uma redução média de 65% nos ovos por grama de raiz nas plantas expressando dsRNA de Isocitrato liase e redução média de 30% nas plantas expressando dsRNA de hsp90. A análise do silenciamento de hsp90 em ovos coletados das plantas expressando dsRNA foi confirmada por qRT-PCR. Em conclusão, genes-alvo com efeitos essenciais foram encontrados, exercendo papel importante no desenvolvimento e reprodução do nematoide. Portanto, essa metodologia pode ser utilizada como uma ferramenta biotecnológica para indução de resistência ao fitonematoide M. incognita em grandes culturas de interesse comercial. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The phytonematode Meloidogyne incognita is considered the most important plant pathogen, because its worldwide distribution and the severe damage caused to a large variety of agronomically important crops. The phytopathogen has a life cycle that is divided in six developmental stages (Egg, Juvenile 1-4, Female) that can persist for 6 to 8 weeks. The Juvenile 2 enters the root using mechanical force and enzymatic degradation to establish the plant-pathogen interaction that finally differentiates in female that deposit 2,000 eggs. Current agronomic practices have usually been unsuccessful and expensive, so the cultivation of resistant varieties is actually the most efficient way to control nematodes. In this work, we selected target genes for silencing homologues lethal genes of the model nematode Caenorhabditis elegans. Aiming validation of these target genes, the fragments were isolated, cloned in RNAi binary vector for tobacco transformation via Agrobacterium tumefaciens. After this, tobacco seeds were collected and genotyped to select the transformed ones. Bioassays on GM tobacco showed the effects of silencing in the nematode reproduction. The resistance tests conducted with GM tobacco at 45 DAI showed a reduction of 65% in eggs per root gram in transgenic lines of Isocitrate lyase and 30% in transgenic lines of hsp90. In conclusion, we found new target genes that showed deleterious phenotype in nematodes. Therefore, this methodology can be used as a promising biotechnological tool to induce nematode resistance in GM crops.
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Efeitos estruturadores de recifes arenosos do Polychaeta Sabellaria wilsoni na comunidade de meiofauna e na associação de Nematoda.

ATAIDE, Manuelle Belmiro 31 January 2012 (has links)
Submitted by Danielle Karla Martins Silva (danielle.martins@ufpe.br) on 2015-03-12T16:59:05Z No. of bitstreams: 2 Dissertação_Manuelle_Ataide_catalogada.pdf: 2223519 bytes, checksum: 1f7fdcc7b46e96ff802ff2b700eae8ac (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-12T16:59:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Manuelle_Ataide_catalogada.pdf: 2223519 bytes, checksum: 1f7fdcc7b46e96ff802ff2b700eae8ac (MD5) license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) Previous issue date: 2012 / O objetivo do estudo é avaliar o efeito da engenharia de ecossistema causada pelos recifes de Sabellaria wilsoni (Polychaeta: Sabellariidae) na comunidade da meiofauna e na associação de Nematoda na Ilha de Algodoal, Amazônia, Brasil. Dois tipos de recifes arenosos (Cogumelo e Plataforma) bem como o sedimento arenoso circunvizinho de duas praias distintas (terraço de maré baixa e dissipativa) foram estudados. As coletas foram realizadas em junho (estação chuvosa) e dezembro (estação seca) de 2008 em dois perfis perpendiculares à linha de costa em cada local. As amostras obtidas utilizando-se um corer de 3,0cm de diâmetro enterrado até à profundidade de 10cm foram fixadas com formol a 4%, coradas com Rosa de Bengala e triadas em laboratório ao nível de grandes grupos e para o estudo taxonômico foram retirados os 30 primeiros indivíduos de cada réplica. A meiofauna esteve representada por 22 taxa: Acari, Amphipoda, Bivalvia, Cladocera, Copepoda, Cumacea, Gastropoda, Gastrotricha, Hydrozoa, Insecta, Isopoda, Kinorhyncha, Nematoda, Nemertea, Oligochaeta, Ostracoda, Polychaeta, Rotifera, Tanaidacea, Tardigrada, Tunicata e Turbellaria. A densidade média da meiofauna foi de 1774 ind/10cm², sendo Nematoda o táxon dominante em todas as estações e locais. A ANOVA mostrou que dos parâmetros univariados somente a riqueza apresentou diferença significativa entre os ambientes. A PERMANOVA indicou diferenças significativas para as interações entre os ambientes, bem como entre os tipos de recife e praia considerando os ambientes, e interações entre as estações considerando os diferentes tipos de recife e de praia. A associação de Nematoda esteve representada por 2 classes, 9 ordens, 30 famílias, 91 gêneros e 59 espécies. A densidade média da nematofauna foi de 1424 ind/10cm², sendo Daptonema o gênero dominante seguido por Viscosia e Sabatieria. A ANOVA mostrou que dos parâmetros univariados nenhum apresentou diferença significativa entre os ambientes. A PERMANOVA para a nematofauna também indicou diferenças significativas para as interações entre os ambientes, bem como entre os tipos de recife e praia considerando os ambientes, e interações entre as estações considerando os diferentes tipos de recife e de praia. O IndVal, indicou que os gêneros Bathylaimus, Halichoanolaimus, Linhomoeus, Sabatieria e Viscosia são indicadores do ambiente recifal enquanto que Daptonema, Odontophora, Omicronema, Prorhynchonema e Trichotheristus são gêneros indicadores do ambiente praial. Um conjunto de mudanças nos fatores estruturais e abióticos leva à alta diversidade dentro dos recifes indicando a importância de S. wilsoni enquanto engenheiro de ecossistema em ambiente de praia arenosa estuarina no litoral amazônico.
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Distribuição espacial dos Nematoda livres em um gradiente hipersalino do Nordeste Brasileiro

Renato Rodrigues da Silva, Neyvan January 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:06:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1998_1.pdf: 1240195 bytes, checksum: 44a248711b89228b0ad13934a631b381 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Os Nematoda de vida livre constituem o grupo mais abundante da meiofauna, dominando de 50% a 90% do total em amostras biosedimentológicas. Vários fatores abióticos são estruturadores da comunidade nematofaunística em ambientes costeiros e, dentre eles, a salinidade influencia a distribuição e composição da fauna. Este estudo teve como objetivo identificar a nematofauna presente ao longo de um gradiente artificialmente hipersalino da Salina Diamante Branco no Município de Galinhos RN. Amostras biosedimentológicas foram coletadas espacialmente, tomadas em triplicata, para identificação da nematofauna em evaporadores de 40 a 120 . Os Nematoda foram identificados ao nível de gênero e quando possível em espécie. Alguns parâmetros da população foram analisados como: tipologia bucal, maturidade sexual, abundância e densidade. Foram empregadas as análises estatísticas: BIOENV, SIMPER, ANOSIM e MDS, utilizando o PRIMER versão 5.0. A comunidade foi composta por 77 espécies de Nematoda distribuídas em 19 famílias, das quais Ethmolaimidae e Linhomoeidae foram as mais abundantes. Terschellingia longicaudata, Oncholaimus oxyuris, Thalassomonystera sp.1, Neotonchus sp.1 e Syringolaimus sp.1 foram as mais frequentes no gradiente determinando em 50% a dominância dos tipos tróficos 1A + 1B nas salinidades iniciais. A diversidade medida através do índice de Shannon-Wiener apresentou o menor valor na salinidade de 92 e os índices de Hill mostraram um padrão de decréscimo ao longo do gradiente salino. A densidade variou de 49 a 3.929 ind.cm2, sendo que não houve uma relação entre o aumento da salinidade e a densidade da nematofauna. O MDS dividiu a comunidade nematofaunística em 4 grupos de acordo com as similaridades. O ANOSIM detectou que existe diferença significativa entre algumas salinidades (40 x 48 ; 48 x 55 ; 55 x 66 ). O BIOENV apontou a salinidade como o fator abiótico estruturador da comunidade nematofaunística. O SIMPER mostrou uma composição de 4 a 6 gêneros que contribuíram com 50% das dissimilaridades, dentre eles: Oncholaimus oxyuris, Terschellingia longicaudata, Ethmoilaimus sp.1 e Thalassomonystera sp.1. Para a composição da nematofauna, a salinidade mostrou-se como fator limitante, sendo a tolerância ao estresse salino espécie-específica, determinando que a capacidade de osmorregulação é fundamental na colonização do sedimento. A tolerância dos Nematoda a diversos distúrbios ambientais promove uma ampla adaptação a uma série de condições ambientais desfavoráveis à vida. Os resultados obtidos evidenciam a necessidade do estudo da nematofauna associada em trabalhos futuros de biomonitoramento ambiental, especialmente em ambientes hipersalinos

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