Orientador: Carlos Ducatti / Coorientador: Giuseppina Pace Pereira Lima / Banca: Maria Márcia Pereira Sartori / Banca: Sérgio Marques Costa / Resumo: A demanda por alimentos orgânicos tem crescido nitidamente nos últimos anos, sobretudo pelos produtos lácteos. Logo, técnicas que permitam a autenticação dos mesmos são de grande importância para o consumidor assegurar-se de que está ingerindo um alimento genuinamente orgânico. Desta forma, o objetivo deste estudo foi diferenciar amostras de leites bovinos produzidos em sistemas convencional e orgânico, por meio das razões isotópicas de carbono e nitrogênio, do teor de polifenóis totais e da capacidade antioxidante, além de investigar o efeito da pasteurização sobre esses compostos antioxidantes. Oito amostras de leite cru foram colhidas de quatro fazendas (duas convencionais - Conv 1 e 2 - e duas orgânicas - Org 1 e 2) e uma porção de cada uma foi submetida à pasteurização lenta. Amostras cruas e pasteurizadas foram congeladas, liofilizadas e moídas para a condução das análises. Houve diferença (p<0,05) entre todas as fazendas para ambos os isótopos, exceto entre Org 1 e Conv 2 para δ13C, e entre Org 1 e Conv 1 para δ15N. Para polifenóis, houve diferença (p<0,05) entre as fazendas convencionais, mas não entre as orgânicas, sendo que, entre sistemas distintos, houve diferença entre Conv 1 e Org 2 e entre Conv 2 e Org 1. A pasteurização não afetou (p>0,05) o teor de polifenóis dos leites. A análise de componentes principais permitiu uma distinção mais clara entre todas as fazendas, sendo a razão isotópica ... / Abstract: The demand for organic food has increased sharply in recent years, especially for dairy products. Therefore, procedures for their authentication have a great importance for consumers to assure that food they are purchasing is genuinely organic. Thus, the aim of this study was to differentiate bovine milk samples produced in organic and conventional systems, by stables isotopes ratios of carbon and nitrogen, total polyphenols content and antioxidant capacity, in addition to investigate the effect of pasteurization on these antioxidant compounds. Eight samples of raw milk were collected from four farms (two conventional - Conv 1 and 2 - and two organic - Org 1 and 2) and a portion of each one was subjected to slow pasteurization. Raw and pasteurized samples were frozen, freeze-dried and ground for the conduct of analyzes. There were differences (p<0.05) between all farms for both isotopes, except between Org 1 and Conv 2 for δ13C, and between Org 1 and Conv 1 for δ15N. For polyphenols, there were differences (p<0.05) between conventional farms, but not between organic farms, and about distinct systems, there were differences between Conv 1 and Org 2 and between Conv 2 and Org 1. The pasteurization did not affect (p>0.05) the polyphenol content in milk. Principal component analysis allowed a clearer distinction between all farms, and stable nitrogen isotope ratio was the variable that most contributed to the distinction / Mestre

Orientador: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Ricardo Antonio Polanczyk / Banca: Sabrina Moutinho Chabregas / Banca: Janete Apparecida Desidério Sena / Banca: Antonio Sérgio Ferraudo / Resumo: A bactéria B. thuringiensis caracteriza-se pela produção de proteínas tóxicas a representantes de diversas ordens de insetos, as quais são codificadas por genes cry. Este trabalho foi realizado com objetivo de selecionar isolados de B. thuringiensis por meio da caracterização morfológica e molecular identificando as diferentes subclasses dos genes cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 e determinar a patogenicidade contra Sphenophorus levis, que é uma das mais importantes pragas da cultura da cana-de-açúcar. Foram utilizados 1128 isolados de B. thuringiensis e com a observação em microscópio com contraste de fases foram confirmadas como pertencentes à espécie de B. thuringiensis e três linhagens padrões. O material genético foi extraído pela matriz de troca iônica "Instagene Matrix" e submetido a PCR com iniciadores gerais cry3, cry7, cry8, cry9 e cry35 identificando-se 45 isolados com produto de amplificação para coleópteros, os quais juntamente com as linhagens padrões de B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone e var. tolworthi e testemunhas foram utilizados para a realização do bioensaio. A análise discriminante alocou os isolados em três grupos quanto à toxicidade de B. thuringiensis e os grupos ficaram assim definidos: um grupo de BAIXA efetividade, com 19,60% do total dos isolados, nesse grupo ficaram as testemunhas e uma linhagem padrão B. thuringiensis var. morrissone e isolados do LGBBA; um grupo de MÉDIA efetividade, com 66,67% do total dos isolados, nesse grupo ficaram duas linhagens padrões B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone e isolados do LGBBA e um grupo com ALTA efetividade com 13,72% do total dos isolados do LGBBA, os quais podem ser considerados promissores no controle biológico de S. levis. / Abstract: Molecular characterization and selection of B. thuringiensis isolates exhibiting potential control on Sphenophorus levis larvae. Bacillus thuringiensis is characterized by the production of toxic proteins to insects from a number of different orders which are coded by the cry genes. This work was developed aiming to select B. thuringiensis isolates using morphological and molecular analysis so as to identify different cry genes subclass for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 and also to determine the pathogenicity levels against Sphenophorus levis larvae, that is one of the most important sugar-cane pests. As much as 1128 bacterial isolates together with three control strains were used and for the phase contrast microscopy and molecular analysis. The genetic materials were obtained using the Instagene Matrix that is an ionic matrix and the PCR primers used were developed for cry3, cry7, cry8, cry9 and cry35 genes. A total of 45 isolates were selected showing possible amplicons for coleopterans. These isolates together with the standard strains B. thuringiensis var. tenebrionis, var. morrissone a var. tolworthi were used for bioassays. A discriminating analysis has allocated the bacterial isolates within three groups of B. thuringiensis toxicity and these groups were defined as one with LOW effectivity, comprising 19,6% of the isolates and the control strains together with one of the control strains B. thuringiensis var. morrissone. Another group has revealed a MEDIAN effectivity with a total of 66.7% of the isolates including two other control strains B. thuringiensis var. tolworthi e var. morrissone and a third group with HIGH effectivity with 13.7% of the isolates which were considered as promising B. thuringiensis isolates for the control of S. levis larvae. / Doutor

Orientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos / Banca: Maria José Valarini / Banca: Haroldo Alves Pereira Junior / Banca: Lúcia Maria Carareto Alves / Banca: Maria Inês Tiraboschi Ferro / Resumo: Bactérias simbiontes conhecidos como rizóbios interagem com raízes de leguminosas e induzem a formação de nódulos fixadores de nitrogênio. Em rizóbios, genes essenciais para simbiose são compartimentalizados em ilhas simbióticas ou em ilhas no cromossoma. Para o entendimento da estrutura e evolução dessas ilhas simbióticas, é necessário analisar seu contexto genético e sua organização. O genoma parcial de B. elkanii SEMIA 587 apresenta hoje um total de 5.821.111 pb seqüenciados contendo 62,6 % de GC em 3941 Contigs, onde foram identificados 5381 ORFs. Uma suposta ilha simbiótica foi localizada através da identificação de genes relacionados à fixação e nodulação em comparação à ilha simbiótica de B. japonicum, encontrando 267 ORFs em B. elkanii, onde 17 ORFs foram identificadas como transposases. Assim, através destes resultados parciais pode ser possível averiguar que B. elkanii provavelmente sofreu um rearranjo genético no cromossoma, já que ele apresenta um tamanho menor que B. japonicum em relação ao tamanho do genoma. / Abstract: Symbiont bacteria, commonly known as rhizobia interact with root legume and induce the formation of Nitrogen-fixing nodules. Among rhizobia, essential genes for symbioses are compartmentalized either in symbiotic islands or in chromosomal islands. For better understanding of the structure and evolution of these symbiotic islands, it is necessary to analyze their genetic context and organization. The work had as objective to analyze genes related to the symbiotic island in the partial genoma of the B. elkanii strain 587 has 5.821.111 bp sequenced, containing 62,6 % of GC in 3941 Contigs, been identified 5381 ORFs. A purported symbiotic island was localized through of the identification of related genes of fixing nitrogen and nodulation in comparison with the symbiotic island of B. japonicum, founding 267 ORFs in B. elkanii, where 17 ORFs were identified as transposases. So through these partial results could be possible to infer that B. elkanii probably shows a symbiotic island with genetic rearrange into chromosome, because it showed lower genome size than B. japonicum. / Doutor

Orientador: Carlos Ducatti / Co-orientador: Paulo Roberto de Lima Meirelles / Banca: Ciniro Costa / Banca: Robertyo Lyra Vilas Bôas / Resumo: Pesquisas direcionadas a nutrição e produção de ruminantes são importantes linhas de pesquisa, afim de melhor compreender o sistema. O presente estudo teve como objetivo avaliar o valor isotópico, composição química e produtividade da pastagem de Urochloa brizantha cv. Marandu em diferentes épocas de corte (13 cortes) sob fontes de adubação utilizadas (uréia e cama de frango). A área experimental foi subdividida em 3 tratamentos com 4 repetições, sendo: T1, tratamento testemunho sem adubação; T2, adubação orgânica sintética com uréia; T3, adubação orgânica com cama de frango. Para o corte da forragem e coleta das amostras foi utilizado quadrado de 0,5m x 0,5m. Nas amostras foram analisados os teores de proteína bruta (PB), fibra em detergente neutro (FDN), fibra em detergente ácido (FDA), lignina e determinação do valor isotópico (15N). Para determinação do valor isotópico foram coletados perfilhos sendo estes subdivididos em lâminas foliares e colmo mais bainha e, ainda, alguns analisados inteiramente. A decomposição e a liberação de nutrientes da cama de frango foram determinadas pelo método dos "litter bags". O delineamento experimental adotado foi o inteiramente casualizado com medidas repetidas no tempo. Pode-se inferir que para todos os tratamentos a produtividade foi maior nos meses de maior temperatura, luminosidade e precipitação. Para a PB, no tratamento sem adubação, os níveis foram maiores nos primeiros cortes (próximo à adubação) diminuindo nos cortes subsequentes. Os tratamentos com uréia e cama de frango foram responsivos no corte posterior a segunda adubação diminuindo nos próximos cortes, com comportamento inverso para FDN, FDA e lignina. Os valores de 15N para o tratamento sem adubação obtiveram diferenças ao longo dos cortes prevalecendo semelhanças dentro da época do ano. Para a uréia, a adubação influencia diretamente ... / Abstract: Researches directed nutrition and ruminant production are important lines of research in order to better understand the system. This study aimed to evaluate the isotopic value, chemical composition and productivity of Urochloa brizantha cv. Marandu pasture in different times of cut (13 cuts) under fertiization sources used (without fertilizer, urea and poultry litter). The experimental area was divided into 3 treatments with 4 repetitions: T1, witness treatment without fertilization; T2, sentetica organic fertilization with urea; T3, organic fertilizer with poultry litter. For cutting forage sample collection was used 0,5 m x 0,5 m square. Samples in the crude protein (CP), neutral detergent fiber (NDF), acid detergent fiber (ADF), lignin and determination of the isotopic value of 15N were analyzed. To determine the isotopic were collected tillers they are subdivided into leaf blade and sheath more stem and also some fully analyzed. Decomposition and nutrient release from poultry litter were determined by the method of "litter bags". The experimental design was completely randomized design with repeated measures. Can be infer that for all treatments productivity was higher in the months of highest temperature, light intensity and precipitation. For CP, the treatment without fertilization, levels were higher in the first cuts (near to fertilization) decreasing in subsequent cuts. Treatments with urea and poultry litter were responsive in subsequent cutting the second fertilization decreasing in the coming cuts, with inverse behavior for NDF, ADF and lignin. 15N values for treatment without fertilization had differences over the cuts prevailing similarities in the season. For urea, fertilizer directly influences enriching the isotopic value in some cuts, similar to the poultry litter, with higher isotopic values compared to the other treatments behavior. It is concluded that the isotope values ... / Mestre

Resumo: O nitrogênio é o nutriente que proporciona as maiores respostas em produtividade na cultura do milho, entretanto, devido sua complexa dinâmica no solo e a falta de um índice do N no solo o seu manejo adequado é difícil. Com um medidor (portátil) da intensidade da coloração verde da folhas (Clorofilômetro SPAD-502, da MINOLTA) é possível estimar o teor de N nas folhas no campo baseado na correlação entre o teor de clorofila e N nas folhas de milho. O objetivo específico do experimento foi avaliar o manejo da adubação nitrogenada em cobertura baseado na utilização do clorofilômetro e do índice de suficiência. O experimento foi conduzido na Fazenda Experimental São Manuel - UNESP, São Manuel, SP, em um Latossolo Vermelho Distrófico, em preparo convencional, utilizando irrigação suplementar por aspersão. Foi utilizado o híbrido simples de milho DAS 8410, realizando a semeadura em novembro de 2000 com 330 kg ha-1 de 08-28-16+0,4Zn. O experimento foi delineado em blocos casualizados adotando duas doses de N um dia antes da semeadura: 0 e 60 kg ha-1. Nas parcelas que não receberam N antes da semeadura foram estabelecidos os seguintes tratamentos: (1) 0 kg ha-1 de N, (2) 60 e 40 kg ha-1 de N respectivamente nos estádios V5 e V7, (3) 42 e 28 kg ha-1 de N respectivamente nos estádios V5 e V7, (4) 20 kg ha-1 de N quando necessário e (5) 35 kg ha-1 de N quando necessário. Nas parcelas que receberam 60 kg ha-1 de N antes da semeadura foram estabelecidos os seguintes tratamentos: (6) 24 e 16 kg ha-1 de N respectivamente nos estádios V5 e V7, (7) 20 kg ha-1 de N quando necessário; (8) 35 kg ha-1 de N quando necessário; (9) 80 e 60 kg ha-1 de N respectivamente nos estádios V5 e V7 (área de referência)...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Nitrogen is the nutrient that provides the largest response in corn grain yield, however, because of its dynamic in soil and the lack of an N soil index, the N management is difficult. With the invention of the handheld chlorophyll meter (SPAD-502, MINOLTA) it is possible to estimate N concentration in leaf corn in the field based on the correlation between chlorophyll and N concentration in corn leaf. The objective of this research was to determine the sidedress N management based on the use of chlorophyll meter and sufficiency index. The experiment was conducted in the experimental field of State University of São Paulo (SP, Brazil) in a Latosol Red (Oxisoil), in tillage system, using supplementary sprinkler irrigation. The hybrid utilized was DAS 8410 planted in November 2000 and fertilized with 330 kg ha-1 of 08-28-16+0,4Zn. A complete randomized block design with four replications was used. Two N rates one day before planting were used: 0 and 60 kg ha-1 and nine sidedress N management. In the plots that didn't receive N before planting the sidedress N management used was: (1) 0 kg ha-1 N; (2) 60 and 40 kg ha-1 N applied at the V5 and V7 stage; (3) 42 and 28 kg ha-1 N applied at the V5 and V7 stage; (4) 20 kg ha-1 N as needed; and (5) 35 kg ha-1 as needed. In the plots that received N before planting the N management used was: (6) 24 and 16 kg ha-1 N applied at the V5 and V7 stage; (7) 20 kg ha-1 N as needed; and (8) 35 kg ha-1 N as needed; and (9 80 and 60 kg ha-1 N applied at the V5 and V7 stage (reference plot). …(Complete abstract, click electronic access below) / Orientador: Roberto Lyra Villas Bôas / Coorientador: Sílvio José Bicudo / Mestre

Orientador: Otto Mack Junqueira / Banca: Ricardo de Albuquerque / Banca: Rosemeire da Silva Filardi / Banca: Euclides Braga Malheiros / Banca: Silvana martinez baraldi Artoni / Resumo: Cinco experimentos foram desenvolvidos com os objetivos de se obter os coeficientes de digestibilidade dos aminoácidos das farinhas de carne e ossos, farinha de penas, farinha de peixes e farinha de vísceras pelo método da colheita total de excretas de poedeiras comerciais Isa Brown e comparar a inclusão dos mesmos em rações formuladas com aminoácidos totais e digestíveis com base nos coeficientes da literatura e obtidos. No experimento 1 as aves foram distribuídas em um delineamento inteiramente casualizado com 6 tratamentos e 3 repetições de 4 aves cada. Os alimentos testados substituíram em 20% uma ração referência formulada com milho e farelo de soja, e manteve-se um tratamento jejum. Utilizou-se a cinza ácida insolúvel como marcador indigestível. Os demais experimentos foram arranjados individualmente em um delineamento inteiramente casualizado com 5 tratamentos e 5 repetições de 6 aves cada, sendo que cada ingrediente de origem animal caracterizou um experimento. Os tratamentos avaliados foram: rações com milho e farelo de soja formuladas com aminoácidos totais e digestíveis e 6% de inclusão dos ingredientes de origem animal em rações formuladas com aminoácidos totais e aminoácidos digestíveis com os coeficientes obtidos no experimento 1 e provenientes da literatura. De forma geral, não foram verificados benefícios das formulações com base em aminoácidos digestíveis e ingredientes de origem animal em poedeiras comerciais, entretanto, os ingredientes de origem animal determinaram redução nos custos de formulação. / Abstract: Five experiments were conducted with the objectives of measure the digestible coefficients of amino acids from meat and bone meal, feather meal, broiler offal meal and fish meal from total excreta analysis of Isa Brown hens and to compare their inclusion on diets formulated with total and digestible amino acids based on coefficients obtained and from Brazilian Standards. Birds from experiment 1 were distributed in a completely at random design with 6 treatments and 3 replications of 4 birds each. Tested feed replaced separately 20% of a standard diet formulated with corn and soybean meal and fasted birds were also kept. Acid insoluble ash was used as indigestible marked. Remains experiments were set independently in a completely at random design with 5 treatments and 5 replications of 6 birds and each animal by product individually performed an experiment. Evaluated treatments were diets formulated with corn and soybean meal and total and digestible amino acids basis and inclusion of 6% of animal by product in diets formulated on total amino acid basis and digestible amino acid basis from experiment 1 coefficients and Brazilian Standard coefficients. Overall results showed no benefits from digestible amino acid formulation and animal by product addition in hen's diets, however, animal by product promoted less cost formulation. / Doutor

Orientador: Edivaldo Antônio Garcia / Banca: Ricardo de Albuquerque / Banca: Carla Cachoni Pizzolante / Banca: Carlos Ducatti / Banca: Ariel Antonio Mendes / Resumo: Estudos para detecção de subprodutos de origem animal em carne de aves são escassos e, em se tratando de codornas são inexistentes. O trabalho teve por objetivo a detecção de farinha de vísceras de aves (FVA) em dietas de codornas de corte no músculo peitoral quilha e tíbia pela técnica dos isótopos estáveis de carbono (13C/12C) e nitrogênio (15N/14N). Foram utilizadas 64 codornas de corte macho de um dia de idade advindas de granja comercial. As aves foram divididas em sete grupos distintos distribuídos aleatoriamente em relação às dietas experimentais que continham diferentes percentagens de FVA: 0; 1,5; 3,0; 4,5; 6,0; 7,5 e 15. As dietas foram formuladas de forma a serem isoenergéticas, isoprotéicas e isoaminoacídicas. Quatro aves de cada tratamento foram abatidas aos 42 dias de idade para colheita do músculo peitoral (Pectoralis major), quilha e tíbia para posteriormente serem analisadas. Observou-se enriquecimento isotópico de d13C e d15N nos três tecidos analisados. Em codornas de corte com 42 dias de idade, o nível de inclusão de farinha de vísceras de aves detectado compreende o intervalo de 3,0 a 4,5%. / Abstract: Detection of animal origin by-products studies in poultry meat are rare and inexistent when related to quail meat. This paper aims the detection of increasing levels of poultry visceral meal (FVA) in quail meat, using carbon (13C/12C) and nitrogen (15N/14N) stable isotopes technique. Sixty four male quails aging one day originally from a commercial producer were divided in seven different groups in a random distribution. Those groups received different experimental diets containing 0; 1,5; 3,0; 4,5; 6,0; 7,5 e 15% of FVA. Those diets were formulated to be isoenergetic, isoproteic and to have the same level of amino-acids. Four individuals per treatment were sacrificed at the 42nd day for breast muscle (Pectoralis major), keel and tibia collection to later analysis. Isotopic enrichment of d13C and d15N were observed in all analyzed tissues. In 42 day old quail were detect a 3,0 and 4,5% poultry visceral meal inclusion in its diet. / Doutor

Orientador: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Coorientador: Tereza Cristina Luque Castellane / Banca: Janete Apparecida Desidério / Banca: Danielle Gregório Gomes Caldas / Resumo: O feijoeiro desenvolve associação simbiótica nas raízes com a bactéria Rhizobium tropici, naturalmente ou via inoculação, propiciando a infecção das raízes da planta hospedeira e provocando a formação de nódulo onde ocorre a fixação do N2. Os genes bacterianos envolvidos na formação dos nódulos estão divididos em: 1) genes que especificam a composição bioquímica da superfície celular bacteriana e 2) genes relacionados à produção de polissacarídeos. Estirpes de rizóbio são eficientes produtores de EPS, tais moléculas estão envolvidos nos processos de infecção e fixação biológica do nitrogênio (FBN). Estirpes mutantes dessa bactéria têm um papel importante não só na fixação biológica do nitrogênio, como também, biotecnologicamente. Neste trabalho foi realizada a caracterização do potencial biotecnológico de microrganismos mutantes em relação a sua estirpe selvagem SEMIA 4080, por meio da análise de expressão gênica, por PCR em tempo real, dos genes fixN, nifH, exoZ, exoR e phbC, relacionados ao processo de FBN. Foram selecionados quatro mutantes construídos por inserção de transposons Tn5. Para a avaliação da expressão gênica, o RNA foi extraído nas fases lag, log e estacionária de crescimento bacteriano e também na fase de bacterióides, isolados de nódulo de feijoeiro inoculados com as estirpes mutantes e selvagem. Os dados de seqüenciamento revelam que a mutação não ocorreu no gene exoZ, gene para o qual a mutação foi direcionada. A mutação aparentemente não alterou a expressão dos genes relacionados à FBN, no entanto, os mutantes apresentaram menor eficiência na simbiose. Sendo assim, tais mutantes são recomendados na utilização biotecnológica, uma vez que apresentam maior produção de exopolissacarídeos em relação a sua estirpe selvagem / Abstract: Plant bean develops symbiotic association with Rhizobium tropici bacteria both naturally or through inoculation, enabling the infection of roots of the host plant and triggering nodule formation where N2 fixation takes place. The bacterial genes involved in the formation of the nodules are divided into two classes: 1) genes that specify the biochemical composition of the bacterial cell surface and 2) genes related to the production of capsular polysaccharides. Rhizobia strains are efficient producers of exopolysaccharides and such exudates present complex structure involved in processes of infection and biological nitrogen fixation (BNF). This work focused on the characterization of the biotechnological potential of mutants in relation to their wild type SEMIA 4080, through gene expression analysis by real time PCR, gene fixN, nifH, exoZ, exoR and phbC, related to the process of BNF. Four mutants selected were constructed by insertion of transposons Tn5. For the evaluation of gene expression, RNA was extracted phases lag, log and stationary, bacterial growth phase and also in bacteroids isolated from nodules of bean plants inoculated with the mutant strains and wild type. The sequencing data revealed that the mutation not occur in exoZ gene, the gene to which mutation was directed. The mutation apparently did not alter the expression of genes related to BNF, however, the mutants were less efficient in symbiosis. Thus, these mutantes are recommended in the biotechnological utilization since a higher production of exopolysaccharides in relation to their wild type strain / Mestre

Orientador: Jackson Antônio Marcondes de Souza / Banca: Janete Aparecida Desidério / Banca: Rodrigo Matheus Pereira / Resumo: O Brasil é considerado mundialmente o segundo maior produtor de soja, com perspectiva para a safra de 2011 /2012 entre 72,18 e 73,29 milhões de hectares. Bactérias do tipo B.elkanii, fixadoras de nitrogênio, estabelecem uma relação simbiótica com a soja convertendo o nitrogênio atmosférico em amônia, que é o composto assimilável pela planta. Essas bactérias diazotróficas, do tipo Bradyrrizobium elkanii, têm a capacidade de sintetizar e acumular polihidroxibutirato (PHB), homopolímero de origem afilática com propriedades semelhantes aos dos polipropilenos utilizado para a produção de plástico biodegradável. Linhagens mutantes para o aumento na síntese e acúmulo de polímero foram desenvolvidas e testadas visando interesse biotecnológico da aplicação comercial das mesmas. O objetivo foi analisar a fixação biológica do nitrogênio (nifH e fixN ), conversão de amônia em aminoácidos (glnA e glnB) e acúmulo de polímero ( phbA, phbB e phbC) através da analise por PCR em tempo real. .As linhagens mutantes apresentaram expressão positiva e significativa para os genes de acúmulo e síntese de PHB in vitro; já em simbiose, apresentaram expressão negativa para os mesmos considerando a competição das vias de acúmulo de polímero e fixação biológica do nitrogênio. Frente ao potencial biotecnológico da aplicação industrial de polímeros de origem bacteriana, a análise por meio desta abordagem foi de fundamental importância para utilização futura e aprimoramento das linhagens mutantes de B. elkanii, bem como a análise expressão permitiu o conhecimento de interações metabólicas no processo de simbiose / Abstract: Brazil is considered the world's second largest soybean producer, with prospects for the harvest of 2011/2012 between 72.18 and 73.29 million hectares. B.elkanii type bacteria, nitrogen fixing, establishing a symbiotic relationship with soybean converting atmospheric nitrogen into ammonia, which is the compound assimilated by the plant. These diazotroph, Bradyrrizobium elkanii type, have the ability to synthesize and accumulate polyhydroxybutyrate (PHB), homopolymer afilática source with similar properties to the polypropylenes used for the production of biodegradable plastics. Mutant strains for the increase in polymer synthesis and accumulation have been developed and tested in order biotechnological interest of commercial application of the same. The aim was to analyze the biological nitrogen fixation (nifH and fixN), conversion of ammonia into amino acids (glnA and glnB) and accumulation of polymer (phbA, phbB and phbC) by PCR analysis in real time. . The mutant strains exhibited significant and positive expression of genes for the synthesis of PHB accumulation and in vitro, whereas in symbiosis showed negative expression for them considering the competition of the process of accumulation of polymer and biological nitrogen fixation. Front of the biotechnological potential of the industrial application of polymers of bacterial origin, the analysis by this approach was crucial for future use and improvement of mutant strains of B. elkanii and expression analysis allowed the understanding of metabolic interactions in the process of symbiosis / Mestre

Orientador: Renato de Mello Prado / Banca: João Chrisóstomo Pedroso Neto / Banca: Miguel Angelo Mutton / Resumo: O sistema de colheita da cana-de-açúcar sem despalha a fogo acumula palha na superfície do solo e pode alterar o manejo do nitrogênio na cultura, especialmente com uso do silício. Objetivou-se avaliar os efeitos da aplicação de nitrogênio em cobertura associado ao silicato e calcário nas propriedades químicas do solo, no estado nutricional e na produção da soqueira de cana-de-açúcar. O experimento foi desenvolvido na segunda soqueira de cana-de-açúcar com colheita sem despalha a fogo, cultivada em Latossolo Vermelho distrófico. Os tratamentos foram constituídos de doses de nitrogênio 0; 40; 80; 120 e 160 kg ha-1 na forma de ureia, e duas fontes de materiais corretivos, silicato de cálcio e magnésio (presença de Si) e calcário (ausência de Si). Foram avaliados os efeitos dos tratamentos nos atributos químicos do solo, no desenvolvimento, produção de massa seca, nutrição, produtividade e na qualidade tecnológica da segunda soqueira. O uso do nitrogênio associado aos corretivos não afetou a fertilidade do solo, entretanto, o uso do silicato aumentou o teor de Si do solo aos 12 meses após a brotação da cana-de-açúcar. As variáveis de desenvolvimento não foram afetadas pela aplicação dos tratamentos, exceto número de colmos na época da colheita, apresentando aumento na presença do silício. As doses de N e os corretivos não afetaram o estado nutricional da cultura, porém influenciaram o acúmulo de N e Si na planta. As doses de N, independentemente do uso do silicato, aumentaram a produtividade da soqueira da cana-de-açúcar, todavia, não afetaram a qualidade tecnológica / Abstract: The sugarcane harvest system without burning accumulates trash at the soil surface and can modify the culture nitrogen management especially with silicon application. The objective was to evaluate the effects of the nitrogen application associated to the silicate and to lime at the nutritional status, yield and the soil chemical properties at the second sugarcane ratoon. The experiment was carried out at the second sugarcane ratoon harvested without burning the trash, cultivated in an Oxisol. The treatments were constitute of nitrogen rates 0; 40; 80; 120 and 160 kg ha-1, urea, and two sources of corrective materials, calcium and magnesium silicate (presence of Si) and lime (absence of Si). Were evaluated the treatment effects at the soil chemistry attributes, sugarcane development, dry matter plant nutrition, productivity and yield, and the technological quality of the second sugarcane ratoon. The use of nitrogen associated to the use of silicate and lime did not affect the soil fertility, however, the use of silicate increased the soil silicon content 12 months after sugarcane sprouting. The development variables were not affect by the application of the treatments, except for number of culms at the harvesting period, showing increase at silicon presence. The N rates and the correctives did not affect the culture nutritional status, yet they affected the N and Si accumulation in the plant. The N rates independently of the use of silicate increased the sugarcane ratoon yield, though, did not affect the technological quality / Mestre