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Refaktoring portálu Curriculum Generator na single-page aplikaciStratil, Jakub January 2017 (has links)
Stratil J. Refactoring of web portal Curriculum Generator to single-page application. Diploma thesis. Brno: Mendel University, 2017. This thesis is documenting the refactoring process of web application located at web portal Curriculum Generator. The thesis contains analysis of the application status, which is the basis for a draft. The draft includes changes to be made during the refactoring process, a process of choosing JavaScript framework for the refactoring process and a draft of new API. The thesis continues with an implementation of the proposed changes and draft, using chosen technologies. The thesis ends with a description of the refactored application deployment process.
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Attacking Disk Storage Using Hypervisor-Based MalwareMartin, Jaron W 11 May 2013 (has links)
Malware detection is typically performed using either software scanners running inside the operating system or external devices designed to validate the integrity of the kernel. This thesis proposes a hypervisor-based malware that compromises the system by targeting the hard disk drive and leaving the kernel unmodified. The hypervisor is able to issue read and write commands to the disk while actively hiding these actions from the operating system and any detection software therein. Additionally, the hypervisor’s presence has minimal impact on the performance of the system. The ability to perform these commands compromises the confidentiality, integrity, and availability of the stored data. As a result, this thesis has widespread implications affecting personal, corporate, and government users alike.
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Análise comparativa dos proteomas das raízes tuberosas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) de variedades de mesa e indústria / Comparative proteome analysis of the tuberous roots of sweet and bitter cassava (Manihot esculenta Crantz) varieties.Schmitz, Gabriela Justamante Handel 20 December 2013 (has links)
A mandioca (Manihot esculenta Crantz) é uma das principais culturas do mundo, havendo grande variabilidade genética. As variedades são classificadas com base na palatabilidade e toxicidade das raízes, em mansas ou doces e bravas ou amargas. Apesar da importância, o potencial da mandioca é pouco explorado, não sendo conhecidos, em nível molecular, os elementos determinantes para as suas características. Assim, pretendeu-se identificar, empregando a 2D-PAGE, proteínas que possam estar associadas com as diferenças físico-químicas das raízes tuberosas de variedades de mesa (IAC 576-70 e IAC 06-01), indústria (Cigana Preta, IAC 12 e IAC 90) e de uso misto (Vassourinha Paulista). Após extração de proteínas e separação por 2D-PAGE, as imagens dos géis foram analisadas no programa Delta2D (DECODON), sendo realizada análise estatística utilizando-se ANOVA (p<0,01), Heat Map e Análises de Componentes Principais (ACP) e de Agrupamentos. Os 146 spots de interesse foram removidos dos géis e suas proteínas digeridas e sequenciadas por espectrometria de massas. Algumas proteínas refletiram as características fenotípicas das variedades em estudo, especialmente entre as de mesa e indústria. Pela ACP, foram explicados 54,54% da variabilidade entre as amostras. A primeira componente separou as variedades exclusivamente de mesa de todas as demais, enquanto a segunda separou a IAC 90 de todas as outras, sendo esta caracterizada por um perfil proteico diferente das demais amostras de uso industrial. A IAC 576-70 e a IAC 12 apresentaram alta correlação positiva, assim como, a Vassourinha e a Cigana. A Análise de Agrupamentos corroborou as informações da ACP, revelando que o proteoma das raízes tuberosas refletiu diferenças fenotípicas entre as variedades. / Cassava (Manihot esculenta Crantz) is a main crop with large genetic variability. The varieties are classified according palatability and toxicity of the roots as sweet or bitter cassavas. Despite its importance, little is known about the molecular basis of phenotypic characteristics. Therefore, this study aimed to identify proteins associated to the differences between the sweet (\'IAC 576-70\' e \'IAC 06-01\'), bitter (\'Cigana Preta\', \'IAC 12\' e \'IAC 90\') and the mixed-use (\'Vassourinha Paulista\') varieties by 2D-PAGE. After the protein extraction and separation by 2D-PAGE, the gel images were analyzed through the software Delta 2D (DECODON), and the statistical analysis were performed with ANOVA (p<0,01), Heat Map, Principal Component Analysis (PCA) and Cluster Analysis. The 146 significant spots were removed from the gels, digested and sequenced by mass spectrometry. Some proteins were related to the physico-chemical characteristics of the varieties, especially between the sweet and the bitter. Variability of the samples was explained at the level of 54,54% by the PCA. The first component separated the sweet varieties from all others while the second one separated the \'IAC 90\' from all others. This variety was characterized by a different protein profile among the bitter cassavas. The \'IAC 576-70\' and the \'IAC 12\' were positively correlated, as well as, \'Vassourinha\' and the \'Cigana\'. Cluster Analysis agreed the PCA information, revealing that the proteomes of the tuberous roots reflected phenotypic differences among the varieties.
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Arquitetura forense do Estado de São Paulo: produção moderna, antecedentes e significados / Forensic architecture of the State of São Paulo: modern production, antecedents and meaningsCordido, Maria Tereza Regina Leme de Barros 10 October 2007 (has links)
Com a introdução de um plano de governo com ideais modernizadores: o plano de ação - PAGE- de Carvalho Pinto, (1959/1963), jovens arquitetos encontram solo para cultivar seus ideais de uma nova arquitetura, através da geração de novos espaços que possibilitariam novas práticas sociais. Ações administrativas, organizacionais e financeiras se estruturaram em torno de um projeto central, o de alavancar a modernidade do Estado, em particular no seu interior, estruturada através da modernização material e do modernismo sócio-cultural. Este objetivo era coordenado por um grupo de planejamento responsável pelo entrosamento dessas ações. Agregando o modernismo tanto cultural, através das formas arquitetônicas modernas, que deveriam representar a modernidade, como social, através de novos arranjos espaciais, que deveriam tornar a justiça mais acessível, os edifícios forenses projetados pelos arquitetos modernos são peças paradigmáticas desse processo. Suas novas práticas questionavam o agenciamento espacial tradicional, introduziram novas características construtivas e tipológicas e repensaram a relação com o entorno. Vale registrar que ao longo da primeira metade do século XX os edifícios forenses, implantados pelo DOP (a partir de 1920), ainda traziam no seu agenciamento espacial interno formas de uso similares as extintas casas de câmara e cadeia, modelo colonial, onde os serviços tidos como mais nobres ocupavam o andar superior que tinha acabamento mais requintado. A simbologia recursiva destes edifícios, os usos de ornamentos e elementos greco-romanos buscavam conferir monumentalidade. Mesmo onde se indica uma pré-padronização destes edifícios a partir dos anos cinqüenta, essa condição está presente. A nova fase de produção através dos edifícios modernos possui um propósito mais complexo, envolvendo uma nova forma do saber e fazer arquitetura, percebida na introdução de novas tecnologias, conceitos e relações que se interagem compondo um macrocosmo de questões. Bratke em Amparo utiliza um grande átrio de distribuição aberto e fluído; em Araras Fábio Penteado concebe o fórum a partir de um pátio coberto para circulação retirando o tribunal do júri do corpo do edifício para múltiplo uso da população local; concepção também adotada em Avaré com Paulo Mendes da Rocha; em Amparo, Libeskind e em Piracicaba com Reydi os edifícios enfatizam a independência da estrutura em favor da maior expressividade plástica da obra; em Orlândia, Wilhein aproxima os ambientes de maior uso público com seu entorno, fruição também evidente em Itapira com Joaquim Guedes; em Promissão, Artigas e Cascaldi utilizam essa fluência de forma crítica, articulada por rampas diluindo o campo de observação unidirecional dos recorrentes passos perdidos; em Porto Feliz, Botti e Rubin enfrentam a modulação e elementos pré-fabricados, prezando pela funcionalidade para os serviços da justiça. Embora propusessem um rompimento aos paradigmas adotados na produção forense, essa produção se contrapõe ao utilizar uma nova simbologia, que de certa forma, expressasse a modernização do Estado, percebidos no conjunto de seus aspectos formais e sentidos sociais de seus projetos. Entretanto a adequação para os serviços da justiça foi problemática. As diversidades desta produção, aliados as inadequações encontradas em suas formulações tiveram como resposta a produção estandardizada. Este novo rumo, ainda que base para os novos fóruns até a atualidade, não eliminaram todas as dificuldades apontadas na produção anterior. A produção viabilizada pelo PAGE nos revela que a representação dada a modernização do país, no caso em São Paulo, está associada a proposta de novas práticas de relações sociais, através de espaços mais democráticos. Além de se obter um novo campo de compreensão, ao conhecer como o interior do Estado participava no quadro de desenvolvimento do país projetando a representação de uma nação que bania seu atraso, contribuindo na difusão da arquitetura moderna. / With the introduction of a government plan with ideas of modernization: the action plan - Page, by Carvalho Pinto (1959-1963), young architects found soil to cultivate their ideas of a new architecture, through the generation of new spaces which would allow new social behaviors. Administrative, organizational and financial activities were structured around a main project, to improve state modernization, particularly in the rural part, structured through the material modernization and social and cultural modernism. This aim was coordinated by a planning group responsible for the mixing of these actions. Associating both cultural modernism, through modern architectonic forms, which should represent modernity, and social modernism, through new space arrangements, which should make justice more accessible, the forensic buildings projected by modern architects are paradigmatic parts of this process. Their new actions questioned the traditional space negotiations, introduced new constructive and typological characteristics and rethought the relation with the surroundings. It is worth mentioning that throughout the first half of twentieth century forensic buildings, implemented by DOP (from 1920), still had in its negotiation of space forms of use similar to those of the extinct house of commons and prison, colonial models, where services known as noblest occupied the superior floor, which had fancier finishing. The recursive symbology of these building, the use of greco-roman ornaments and elements aimed to confer monumentality. Even when a fore-standardization of these buildings is indicated from the\' 50s, this condition is present. The new production phase through modern buildings has a more complex objective, involving a new form of knowing and doing architecture, noted in introduction of new technologies, concepts and relations which interact, making out a macrocosmos of questions. Bratke in Amparo uses a huge atrium of distribution open and fluid; in Araras, Fábio Pented conceives a forum from a covered court-yard for circulation, extracting the court of jury from the building body for multiple use of local population; conception also adopted in Avaré by Paulo Mendes da Rocha; in Amparo, Libesking, and in Piracicaba, with Reydi, the buildings emphasize the independence of structure in favor or a bigger plastic expressivity of the piece; in Orlândia, Wilhein bring near environments of a higher public use in its surroundings, fruition also evident in Itapira with Joaquim Guedes; in Promissão, Artigas and Cascaldi use this influence critically, articulated with ramps diluting one-direction observation fields with recurring lost steps; in Porto Feliz, Botti and Rubin face modulation and fore-produced elements, respecting functionality for justice services. Although they proposed a breaking of paradigms adopted in forensic production, this production opposes itself by using a new symbology, which, in a certain way, expressed state modernization, noted in its formal aspects and social meaning of its projects. However, the adjustment for justice services was troubled. The diversities of this production, allied with inappropriations found in its formulas, had as an answer a standard production. This new course, even though it serves as a basis for new forums until now, did not eliminate all difficulties pointed in previous productions. The production made possible by the PAGE reveals that the representation of the modernization of Brazil, in this case São Paulo, is associated to the proposal of new activities of social relations, through more democratic spaces. Besides obtaining a new comprehension field, when discovering how the interior of the state participated in the development chart of the country, projecting the representation of a nation which banned its delay, contributing in the diffusion of the modern architecture.
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ABORDAGEM METALOPROTEÔMICA DO MERCÚRIO EM LEITE MATERNO DE COMUNIDADES DA BACIA AMAZÔNICA - BRASILCerbino, Maria Rosa 12 April 2016 (has links)
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Previous issue date: 2016-04-12 / Mercury is a potentially toxic element with a wide distribution on the Amazonian
environment. This metal is dangerous and responsible for environmental
contaminations and human intoxications as it is capable to biomagnifications
and bioaccumulate throughout the food chains becoming the main way of
exposing the riverine Amazonian communities to methylmercury to whom the
main diet is fish. Therefore, studies related to mercury toxicity are of
fundamental importance to health and life quality of the Amazonian
communities. This study aimed to detect and evaluate possible proteic
biomarkers of mercury toxicity in samples of human milk collected in riverine
populations of Madeira and Negro rivers in the Brazilian Amazon. Initially total
mercury was determined in the hair of breast feeding women to identify who
were contaminated with mercury followed by the obtaining of the proteome of
milk samples by two-dimensional electrophoresis (2D PAGE) after precipitation
of proteins in half acetone. On the proteic spots obtained in the process of
protein fractionation of milk samples, detection of mercury was carried out by
atomic absorption spectrometry in graphite furnace(GFAAS), where the results
showed that mercury was bonded in proteins of molecular weight around 14-26
kDa. The concentration determination of total mercury by GFAAS was also
carried out with milk in natura, lyophilized milk and the proteic pellets aiming a
mass balance of mercury related to the concentration of this element on milk
and pellets. The measurements of mass balance permitted to observe that, in
relation to the milk samples from Madeira River, about 85 to 95%of the mercury
present in the lyophilized milk is on the proteic fraction. In relation to the
breastfeeding women of the Negro River, about 50% of the total mercury is
bound in the proteic fraction and the difference of 51% might be bound to the
lipidic fraction. However, more studies in this line of research need to be
pursued to achieve more robust conclusions. / O mercúrio é um elemento potencialmente tóxico com ampla distribuição no
ambiente amazônico. Este metal é perigoso e responsável por contaminações
ambientais e intoxicações humanas, já que é capaz de biomagnificar e
bioacumular através das cadeias alimentares, tornando-se assim a principal via
de exposição às comunidades amazônicas ribeirinhas do metilmercúrio, cuja
dieta é baseada em peixes. Sendo assim estudos relacionados à toxicidade do
mercúrio são de fundamental importância para a saúde e a qualidade de vida
das comunidades amazônicas. Este estudo buscou detectar e avaliar possíveis
biomarcadores proteicos da toxicidade do mercúrio em amostras de leite
materno coletadas de populações ribeirinhas do rio Madeira e do rio Negro, na
Amazônia brasileira. Inicialmente, determinou-se mercúrio total no cabelo das
lactantes para identificar quais estavam contaminadas com mercúrio, em
seguida obteve-se o proteoma das amostras de leite por eletroforese
bidimensional (2D-PAGE) após precipitação das proteínas em meio acetônico.
Nos spotsproteicos obtidos no processo de fracionamento das proteínas, nas
amostras leite, foram feitas determinações de mercúrio por espectrometria de
absorção atômica em forno de grafite (GFAAS), onde os resultados mostraram
que o mercúrio se encontra ligado em proteínas de massa molecular na faixa
de 14-26 kDa. A determinação da concentração de mercúrio total por GFAAS
foi feita também no leite in natura, leite liofilizado e nos pelletsproteicos, com o
objetivo de se fazer um balanço de massa de mercúrio em relação à
concentração deste elemento no leite e pellets. As medidas de balanço de
massa permitiram observar que, em relação às amostras de leite do rio
Madeira, cerca de 85 a 95% do mercúrio presente no leite liofilizado encontrase
na fração proteica. Em relação às lactantes do rio Negro, cerca de 50% do
mercúrio total está ligado na fração proteica e a diferença de 51% pode estar
ligado na fração lipídica. Contudo, mais estudos nesta linha de pesquisa devem
ser desenvolvidos, para que se possam ter conclusões mais robustas.
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Ordenação das páginas do Google - \"Page Rank\" / Google\'s page sorting - \"Page Rank\"Melo, Mariana Pereira de 09 April 2009 (has links)
Grande parte do sucesso do Google provêm do algoritmo Page Rank, que avalia quantitativamente a importância de cada página na web. Esta ordenação é obtida através do vetor estacionário de uma matriz estocástica específica, utilizando o Método das Potências. A velocidade de convergência deste método será avaliada em detalhe, já que se trata de uma resposta imediata da pesquisa do usuário. Afim de entender as diferentes situações que o modelo pode enfrentar, diversas simulações são apresentadas neste trabalho. Em particular, estamos interessados nos fatores que influenciam a velocidade de convergência. Para tanto, o número de páginas total e de cada conjunto fechado, bem como o número de conjuntos fechados e de nós pendentes foram estudados. / Great part of Google\'s success comes from the Page Rank algorithm, wich quantitatively evaluates the importance of each page on the web. This sort is achieved through a specific stochastic matrix stationary vector, using the Power Method. The convergency speed of this method will be evaluated in details, since this is a imediate response for the user search. In order to understand the diferent situations the model can confront, several simulations are shown in this work. In particular, we are interested in the factors which influences the convergency speed. For that, the total and inside each closed set number of pages and also the closed sets and dangling nodes numbers were studied.
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Extração de proteínas a partir de tecido fixado em formaldeído e embebido em parafina para análise proteômica / Protein extraction from formalin-fixed and paraffin-embedded tissues for proteomic analysisMiziara, Guilherme Muniz 31 October 2014 (has links)
O câncer colorretal (CCR) é a segunda de causa morte relacionada ao câncer, com aproximadamente 500.000 mortes por ano em países desenvolvidos. Os pacientes com doença localmente avançada ou metastática possuem um prognóstico ruim e, desta forma, a detecção precoce é necessária para reduzir a alta mortalidade associada à essa doença. Ainda, os métodos de rastreamento utilizados no momento apresentam boa exatidão, porém são de alto custo, consomem muito tempo e são incômodos para os pacientes. A colonoscopia é o método mais comumente utilizado para a detecção de CCR. Entretanto, apresentam duas limitações importantes: i) necessidade da luz intestinal estar limpa, sem resíduos fecais, o que só é conseguido após um preparo rigoroso, com dieta e laxativos, nos dias que antecedem a realização do exame, e, ii) é examinador-dependente, ou seja, dependem da experiência do profissional em localizar as alterações anatômicas, e ainda da habilidade em selecionar o melhor local para a realização da biópsia. Portanto, o desenvolvimento de um método rápido e sensível para o diagnóstico do câncer colorretal é extremamente importante.<br /> A proposta desta dissertação foi desenvolver um método eficaz para o preparo dos tecidos parafinizados e extração de proteínas para experimentos em eletroforese bidimensional (2DE). Tecidos fixados em formaldeído e embebidos em parafina apresentam como vantagens a preservação da qualidade morfológica, abundância e facilidade de armazenamento, o que permite estudos futuros. Entretanto, para análises proteômicas, a recuperação do material biológico é ineficiente. A partir deste estudo, 156 proteínas foram obtidas de tecidos parafinizados, sendo possível identificar por espectrometria de massas, levando a estudos posteriores para identificação de possíveis biomarcadores relacionados ao CCR. / Colorectal cancer (CRC) is the second cause of cancer-related death, with approximately 500,000 deaths per year in developed countries. Patients with locally advanced or metastatic disease have a poor prognosis and, thus, early detection is needed to reduce the high mortality associated with this disease. Yet, the screening methods used at the time have good accuracy, but are expensive, time consuming and are uncomfortable for patients. Colonoscopy is the most commonly used method for the detection of CRC. However, present two major limitations: i) the need to be clean intestinal lumen without fecal waste, which is achieved only after rigorous preparation with laxatives and diet, in the days before the exam, and ii) it is examiner-dependent, i.e., depends on the professional\'s experience in locating anatomical changes, and even the ability to select the best site for biopsy. Therefore, the development of a rapid and sensitive method for the diagnosis of colorectal cancer is extremely important. The purpose of this dissertation was to develop an effective method for the preparation of tissues and protein extraction experiments for two-dimensional electrophoresis (2DE). Tissues fixed in formaldehyde and embedded in paraffin have the advantage of preserving the morphological quality, abundance and storage facility, which allows for further studies. However, for proteomic analysis, the recovery of biological material is inefficient. From this study, 156 proteins were obtained from paraffinized tissues, and can be identified by mass spectrometry, leading to further studies to identify potential biomarkers related to CCR.
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Evolução sem evolução: assimetria e a emergência do tempo na teoria quântica / Evolution without evolution: asymmetry and the emergence of time in quantum theoryMartinelli, Tiago 16 February 2017 (has links)
Na teoria quântica é usual se referir a probabilidade de encontrar uma partícula entre as posições x e x + dx no instante t, embora a teoria não forneça quando ocorre a detecção. Nos primórdios da teoria, Pauli apresentou um argumento refutando a ideia de introduzir um operador que descreva a probabilidade do instante em que ocorre a detecção. Mais tarde, Page e Wootters, motivados pelo fato de não se observar autoestados de superposição de energia, apresentaram um formalismo quântico não-relativista num espaço estendido em que espaço e tempo desempenham papéis equivalentes, sendo consistente com as indagações feitas por Pauli. Isso leva a uma descrição dada pela probabilidade condicional de encontrar uma partícula entre x e x + dx em relação ao tempo [t, t + dt] dado por outra partícula, chamada de partícula relógio. Essa dissertação consiste de uma revisão da proposta de Page e Wootters para abordar o problema do tempo na mecânica quântica bem como de uma análise detalhada desta utilizando de ferramentas recentes introduzidas na área de informação quântica para o tratamento de simetrias em física. / In quantum theory it is usual one refers to the probability of finding a particle between the positions x and x + dx at time t, although the theory does not provide when detection occurs. In the primordies of the theory, Pauli presented an argument refuting the idea of introducing an operator describing the probability of the instant in which the detection occurs. Later, Page and Wootters, motivated by the fact that one is not able to observe energy eigenstates superposition, presented a non-relativistic quantum formalism in an extended space in which space and time play equivalent roles, being consistent with Pauli´s inquiries. This leads to a description given by the conditional probability of finding a particle between x and x + dx in respect to the time [t, t + dt] given by another particle, called the clock particle. This dissertation consists in a review of the Page and Wootters proposal to address the time problem in quantum mechanics as well as a detailed analysis of this using recent tools introduced in the area of quantum information for the treatment of symmetries in physics.
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Perfil eletroforético de rotavírus em amostras fecais diarréicas e após isolamento em cultura de células da linhagem MA104 / Rotaviruses electropherotyes in diarrhoeal faeces and after isolation in MA104 cell culturesFerreira, Thais Lourenço 20 December 2006 (has links)
No presente estudo foi analisado o perfil eletroforético de 15 amostras de rotavírus, sendo 11 de bezerros, 02 de leitões e 02 de criança, que foram cultivadas até a sexta passagem em células da linhagem MA104, com o monitoramento realizado pela técnica de eletroforese em gel de poliacrilamida (PAGE). O objetivo foi comparar o perfil eletroforético de amostras fecais e após o isolamento As amostras leitões não revelaram mudanças de migração aparente, mas uma amostra apresentou um segmento adicional entre os segmentos 5 e 6, tanto no material anterior ao cultivo, quanto na amostra isolada. Em relação as amostras de crianças, uma apresentou diferença na velocidade de migração eletroforética. Além disso, uma amostra de bezerro apresentou um segmento adicional entre os segmentos 5 e 6. Estes dados ressaltam a importância da PAGE como uma técnica de triagem de amostras, que podem, posteriormente serem analisadas por técnicas moleculares mais especificas. As mudanças de comportamento na migração eletroforética dos segmentos genômicos do RNA viral podem ser sugestivas de alteração nas propriedades antigênicas, além do fato de que mudanças que ocorreram in vitro poderão, também, ocorrer in vivo. / In the present work, we have analyzed the electrophoretic profile of 15 samples of rotavírus, 11 of calves, 02 of pigs and 02 of children, that have been cultivated on MA,104 cell up to the sixth passage. The polyacrilamide gel electrophoresis(PAGE) was used to confirm the viral isolation. The aim of the work was to compare the electropherotic profile of fecal samples before and after isolation in MA104 cells. The samples from pigs did not reveal apparent changes in bands migration. However, an additional segment, betweem segments 5 and 6 was detected, in one fecal sample and after isolation. Furthermore, one child sample showed differences in the electrophoretic mobility and also an additional segment was detected between segments 5 - 6 in one sample from a calf. The results emphasize the importance of PAGE as a technique to screen samples that could be analyzed posteriorly by more specific molecular techniques. The changes in the electrophoretic profiles of genomic segments of viral RNA might be suggestive of changes in the antigenic properties, besides the fact that changes that occurred in vitro may also happen in vivo.
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Análise interactômica da VDAC em mitocôndrias neuronais bovina e murina / Interactomic analysis of VDAC in rat and bovine mitochondria in neuronal cellsCrepaldi, Carla Rossini 10 April 2012 (has links)
A VDAC é a proteína mais abundante da membrana mitocondrial externa. Possui diversas funções, tais como o controle da troca de metabólitos, através da membrana, e a participação no maquinário apoptótico. Estudamos o interactoma da VDAC com as proteínas mitocondriais neuronais do cérebro bovino e murino, a fim de compreender se a expressão diferenciada da VDAC1 e VDAC2 verificada entre essas células estão associadas às diferenças nas interações da VDAC. Os complexos proteicos foram analisados por 2D Blue Native SDS-PAGE e identificados via MALDI-TOF TOF usando o software Mascot e o banco de dados NCBInr. Foram identificados 27 e 46 spots em murino e bovino, respectivamente. Nós identificamos proteínas solúveis e incorporadas na membrana que não são participantes da fosforilação oxidativa, dentre elas a aldeido deidrogenase e muitas outras constituintes de complexos mitocondriais já conhecidos tão bem como novos, tais como a putative stomatin-like protein 2 complex e a switch-associated protein 70. Nossos resultados mostraram que os neurônios bovinos possuem mais complexos (5) contendo a VDAC do que em ratos (1), os quais indicam uma cinética diferencial de acoplamento e desacoplamento. Interessantemente, a lista contendo as proteínas identificadas inclui algumas proteínas conhecidas ou supostamente localizadas em compartimentos não-mitocondriais, por exemplo, a myc-induced nuclear antigen. O interactoma diferencial da VDAC entre as espécies bovina e murina, evidencia a presença de uma base comum, porém com diferentes ambientes estruturais, as quais podem ser a base da diferença entre os sítios de ligação A e B observados nas diferentes espécies. / The voltage dependent anion channel (VDAC) is the most abundant protein of outer mitochondrial membrane. VDAC controls metabolite exchange through this membrane and the apoptosis machinery. We studied the interactome of VDAC with mitochondrial proteins of neuronal cells from rat and bovine brain. We wished to understand if the differential expression of VDAC1 and VDAC2 verified between these cells was linked to differences in the VDAC interactions. Protein complexes were analyzed by 2D Blue Native SDS-PAGE and were identified by MALDI-TOF TOF using Mascot software against the NCBInr database. Number of 27 e 46 spots were identified from rat and bovine brain, respectively. We identified soluble and membrane-embedded non-OXPHOS proteins, among them aldehyde dehydrogenase, and many as constituents of known mitochondrial complexes as well as novel ones such as putative stomatin-like protein 2 complex and switchassociated protein 70. Our results showed that bovine neurons had more protein complexes (5) containing VDAC than rat cells (1), which indicates a differential kinetics of assembly or disassembly. Interestingly, the identification list included some proteins known or presumed to be localized to nonmitochondrial compartments, for example, myc-induced nuclear antigen. Our results support evidences of differential apoptotic and energetic mechanisms verified in these brains. The differential VDAC interactome between bovine and murine, support evidences of a common base, but whith different structural environment, which may be the basis of the difference between the binding sites A and B observed in these brains.
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