Ph.d.-afhandling. Danmarks Tekniske Universitet, 2006. / Haves også i trykt udg. Thesis (Ph.D.). 11 ill., 6 tables; approx. 260 ref. Summaries (Da, En).

Le p300/CBP acétyltransférase est un co-activateur transcriptionnel très important qui est impliqué dans la régulation d'un grand nombre de processus biologiques, comme la transcription d'ADN, le développement et l'immunité innée. Jusqu'à présent, le rôle de p300/CBP dans la régulation de l'expression des gènes a été largement étudiée, mais les mécanismes qui régulent son activité enzymatique sont encore peu connus. Des études ont montré que le dysfonctionnement de p300/CBP est associé à plusieurs formes de cancer et de maladies neurodégénératives. Dés lors, chaque progrès concernant les mécanismes de régulation de p300/CBP est devenu primordial pour le développement de nouvelles thérapies. Le 'noyau' de p300/CBP contient deux domaines pour la reconnaissance des modifications post-traductionnelles (MPTs), un bromodomaine et un PHD finger (le module BP), adjacent à un domaine HAT (ou domaine histone acétyltransférase). Plusieurs enzymes, modifiant la chromatine, contiennent des domaines de reconnaissance des MPTs. Fréquemment des groupements particuliers de ces domaines sont très conservés et liés, au sein de la même protéine ou du même complexe protéique, suggérant qu'ils réalisent des fonctions coordonnées. Ces domaines adjacents peuvent agir en concertation dans la reconnaissance simultanée de différents MPTs ou peuvent exercer des fonctions différentes de celles qui sont effectuées par ces deux domaines particuliers, tels que les fonctions de régulation enzymatique. Plusieurs études suggèrent que les cycles acétylation/désacétylation dans la boucle d'auto-inhibition, à l'intérieur du domaine HAT, jouent un rôle important dans la régulation de l'activité enzymatique de p300/CBP. La proximité du module BP et du domaine HAT suggère que la spécificité de liaison, appartenant au module BP, peut être intrinsèquement liée à la régulation de l'activité du domaine HAT. L'objectif de ma thèse est de déterminer le rôle du module BP dans la régulation de l'activité du domaine HAT. Je propose que le module BP soit impliqué dans la régulation de p300/CBP de deux façons. La première consiste à établir un lien avec le domaine HAT qui stabilise la conformation auto-inhibée de l'enzyme. La deuxième exige que le module BP joue un rôle dans le choix des substrats de p300/CBP. J'ai été en mesure de montrer que BP peut se lier au domaine HAT et à la chromatine modifiée et qu'il peut reconnaître les modifications effectuées par p300/CBP lui-même. Les données obtenues indiquent que le module BP peut être impliqué dans la régulation de l'activité de p300/CBP et dans son ciblage à la chromatine.

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Ce travail de thèse est une exploration ethnologique des propriétés générales et des vérités fondamentales que les Indiens Wayana de Guyane française (Amazonie), de langue karib, reconnaissent aux animaux, entre autres non-humains, ainsi qu’une étude des différentes formes de relations entre les humains et ces non-humains, en particulier la relation de prédation, lorsque les uns tuent et mangent les autres. Ce travail expose tout d’abord les différents non-humains qui peuplent le monde wayana, dont l’animal est une des formes. Puis, à partir d’outils théoriques et par une étude lexicale, la thèse étudie la nomenclature et la classification des entités non-humaines du point de vue wayana. Face aux impasses révélées par cette approche, la thèse expose les propriétés ontologiques des entités non-humaines, pour reconnaître une conception animiste des non-humains. Ce modèle, anthropocentré, au perspectivisme absent, s’avère mettre l’accent sur une équivalence réelle des rapports au sein des différentes bulles d’existants. Par l’étude des différentes positions de consanguinité et d’affinité dans leurs interactions avec les non-humains, ce travail révèle que, dans la relation de prédation avec l’animal, cet autre est avant tout un affin potentiel. On noue avec lui une relation d'ennemi à ennemi qui fonctionne par soustraction et sans institution d’arbitrage. Par l’étude des techniques de prédation, la thèse démontre que les Wayana mettent en œuvre des moyens de prédation les plus efficaces possibles. Si les Wayana cherchent un rendement optimal, il ne s’agit pas de maximiser les gains, mais de minimiser les risques dans une relation de prédation avec un ennemi. / This thesis is an ethnographic exploration of the general properties and fundamental truths that Indians Wayanas of French Guiana (Amazon), karib, recognize to animals, among other non-human beings, and a study of different forms of relationships between humans and non-humans, in particular the relationship of predation, when the ones kill and eat the others. First of all, this work presents the various non-human inhabitants of the Wayana world, of which the animal is one of the forms. Then, from theoretical tools and a lexical study, the thesis examines the nomenclature and classification of non-human entities from Wayana perspective. With the impasse revealed by this approach, the thesis presents the ontological properties of non-human entities to recognize an animistic conception of non-humans. This model, anthropocentric, without perspectivism, appears to focus on a real equivalence on relationships inside each boxes of beings. By studying the different positions of consanguinity and affinity in their interactions with non-humans, this work shows that in the relationship of predation with the animal, the other is primarily a potential affine. Is tied with him, an enemy to enemy relationship, working by subtraction without arbitration institution. By studying the techniques of predation, the thesis demonstrates that Wayanas implement means of predation the most effective. If Wayana are seeking for optimum performance, it is not so much to maximize the gains, but is to minimize the risks in a relationship of predation with an enemy.

The diverse outcomes of ubiquitination primarily relate to the flexibility of ubiquitin in forming homo- or heterotypic chains on each of its seven lysine residues which in turn stimulate distinct downstream signaling pathways. These ubiquitin signals must be selectively initiated on the substrate protein and subsequently decoded to facilitate the desired cellular function. These initiation and decoding steps often involve additional post-translational modifications and ubiquitin receptor proteins, but the enzymes and ubiquitin chains involved for many ubiquitinated substrates are not clear. Here, I have explored the initiation and decoding of ubiquitin signals, focusing on lysine-11 (K11) linked polyubiquitin chains and their role in protein degradation. I established in vitro assays to understand how K11-chains are decoded and whether these chains act as a signal for proteasome-mediated degradation. Pure homotypic K11-chains did not bind the proteasome or its associated ubiquitin binding proteins, but did bind to the mitophagy ubiquitin receptors, MyosinVI and TAX1BP1. Heterotypic K11/K48 linkages not only bound the proteasome but also stimulated degradation of the cell cycle substrate, cyclin B1. To further explore the functions of K11-chains I focused on the hypoxia inducible transcription factor (HIF) pathway, as K11-ubiquitination had been implicated in proteasome-independent degradation of the transcription factor. I established an in vitro assay to initiate HIF ubiquitination, via prolyl hydroxylation, and determine the type of ubiquitin chains involved. Recombinant HIF isoforms were rapidly hydroxylated when incubated with cell extracts. Moreover, the levels of iron and small molecule metabolites within the lysates regulated HIF hydroxylation. However, this hydroxylation was insufficient to reproducibly promote HIF ubiquitination or determine the ubiquitin chains involved. While the nature of the polyubiquitin chains formed in the HIF pathway remain elusive, my studies identify distinct roles for homotypic and heterotypic K11-polyubiquitination in proteasome-mediated degradation.

L’étude des usages et pratiques informationnels des usagers en démarche de recherche d’information est un axe majeur de la recherche en sciences de l’information et de la communication, à en juger par les travaux consacrés à cette problématique et disponibles sur Internet. Si les pays du Nord ont une tradition bien ancrée en la matière, au Sud, par contre, et plus précisément dans les pays francophones d’Afrique au sud du Sahara, peu d’études ont été consacrées à cette thématique. Au Mali, les références de travaux de thèses sur ce sujet sont quasi-inexistantes.La présente étude se place dans ce contexte thématique et géographique, et vise comme public cible les doctorants de l’Université de Bamako. Il s’agira d’abord de définir une typologie de cette communauté d’utilisateurs de l’information (spécialisation, écoles doctorales et laboratoires d’attache, thématique de recherche, etc.), puis d’évaluer ses besoins et pratiques informationnels et enfin d’identifier l’existence de difficultés éventuelles d’accès à l’information et de proposer des pistes de solutions. Pour la collecte de données une enquête réalisée auprès de doctorants et l’observation de leurs comportements en situation de recherche d’information seront privilégiées. Les résultats de l’étude permettront une meilleure connaissance des besoins et pratiques informationnels de la communauté des doctorants de l’université de Bamako et pourraient être utilisés par les unités d’information en vue d’améliorer l’offre de services d’information à leur intention. / The study uses and informational practices of users in information retrieval process is a major focus of research in Information and Communication Sciences, judging by the work on this issue and on the Internet. If the North has a strong tradition in this area, to the south by cons, specifically in Francophone countries of Africa in south of the Sahara, few studies have been devoted to this theme.In Mali, the thesis work of reference on this subject is almost non-existent.This study falls within this thematic and geographical context and aims as public target doctoral students from the University of Bamako. This will be first to define a typology of this information users community (specialization, doctoral schools and laboratories attachment, thematic research, etc.) and then evaluate its information needs and practices finally, to identify the existence of possible access to information problems and propose possible solutions. For data collection a survey of doctoral students and observing their behavior information search situation will be favored. The results of the study will enable a better understanding of community needs and the informational practices of doctoral students from the University of Bamako and could be used by the units of information to improve the supply of information services them.

De 1536 à 1551, on assiste à Lyon à un vaste mouvement de promotion du livre de poésie, que soutient la construction d’un groupe uni et dynamique. Cette entreprise se déploie, dans les officines des imprimeurs-libraires et dans l’espace du livre, sur fond d’élaboration d’une langue française de qualité, propre aux bonnes lettres. Étienne Dolet, François Juste, puis Jean de Tournes et Guillaume Rouillé mènent ainsi une politique éditoriale concertée qui confère à la langue française et au livre de poésie ses lettres de noblesse. Lyon acquiert dans ces années une identité éditoriale spécifique, qui se détache sur le paysage poétique du Royaume. L’étude des concurrences et des pillages réciproques entre Lyon et Paris met en évidence l’existence de deux identités poétiques distinctes : Lyon marque une modernité dans l’édition et la diffusion de nouveaux genres que ne comprend pas encore Paris. Quand les imprimeurs lyonnais puisent dans les productions parisiennes, c’est en se les appropriant pour les intégrer dans un catalogue et réaffirmer l’existence d’un groupe lyonnais porteur d’une identité culturelle et poétique. Cette identité, doublée d’une qualité éditoriale remarquable, fonde la prééminence de l’imprimerie lyonnaise dans le Sud de la France, comme le montre l’exemple toulousain. Tout cela contribue à l’élaboration d’un champ poétique fondé sur une cohérence affichée mais menacée par des forces centripètes qui remettent en question l’unité de la poésie lyonnaise. S’il y a « poésie lyonnaise », c’est en ce que le livre de poésie soutient les ambitions politiques de la cité, dans une période de conflit avec Charles Quint puis de changement de règne. / From the late 1530s to the early 1550s, the city of Lyons sees a considerable enterprise of promotion of poetry books, supported by a group of printers and booksellers. From the printer’s and bookseller’s workshops to the space of the book, this undertaking is built upon the reinvention of French as a refined language fit for conveying literature and poetry. Étienne Dolet, François Juste, Jean de Tournes and Guillaume Rouillé pursue a concerted editorial policy to obtain recognition for poetry books and the French language. During this period, Lyons builds a unique editorial identity, which sets the city apart from the rest of the kingdom. Even when the printers of Lyons help themselves to books edited in Paris, they do so by integrating the publications to consistent catalogues and using these to support their claim of a cultural and poetic identity specific to Lyons. This identity, along with a high editorial quality, sets up the pre- eminence of Lyons in Southern France, as can be witnessed for instance in Toulouse. All of these factors contribute to the setting up of a poetic field, but this pretense of consistency and unity is frail. If such a thing as “Lyons poetry” truly exists, this is only true insofar as poetry book holds the city’s political ambitions, in the context first of the war against Charles the Fifth and later of the change of reign.

This diploma thesis deals with the satisfaction of PhD students with facilities for the study by means of data gained from DOKTORANDI 2014 survey. The aim of the thesis is to identify factors that influence the satisfaction with facilities for PhD studies and finding similarities among different fields of studies according to satisfaction with facilities. The first part of this thesis contains a description of higher education with a focus on PhD programs and a description of statistical methods that are subsequently used in analytical part and a description of DOKTORANDI 2014 survey. The analytical part aims to answer the questions which factors affect the PhD students´ satisfaction with facilities for study using logistic regression and decision trees. Further it tries to determine the satisfaction similarities of PhD study fields with facilities for studying using cluster analysis.