Thesis (Ph. D.)--Oregon State University, 2007. / Printout. Includes bibliographical references (leaves 101-116). Also available on the World Wide Web.

Thesis (M.S.)--Rochester Institute of Technology, 2007. / Typescript. Includes bibliographical references (leaves 66-68).

Cet ouvrage présente la synthèse d'analogues du L-fucose comme inhibiteur de l'adhésion de la bactérie Pseudomonas aeruginosa (PA), dont la colonisation des poumons est mortelle chez les patients atteints de fibrose kystique. Ces dérivés fucosides devaient être reconnus de la PA-IlL, une lectine produite par la bactérie, ce qui leur permettra d'empêcher l'adhésion de P. aeruginosa aux poumons des patients atteints de la maladie. La préparation de O-, C-, N- et S-α-L-fucosides a été effectuée principalement à partir des réactions de O-glycosylation, de 'Click Chemistry' et de cycloadditions 1,3-dipolaires. La synthèse des dérivés α-L-fucosides a été réalisée en peu d'étapes, avec de bons rendements et avec un contrôle sur la configuration anomérique, ce qui a permis le développement de nouvelles méthodologies de synthèse sur des glycomimétiques. Le design rationnel de nos analogues fucosides se base sur des images cristallographiques présentant les interactions entre la PA-IlL et son ligand naturel le L-fucose. Une image cristallographique du complexe formé par un fucoside synthétique (composé 57) et la PA-IlL, a même pu être obtenue nous fournissant ainsi des informations supplémentaires. C'est à partir de ces nouvelles données qu'une exploration du pharmacophore de ce fucoside a été effectuée. L'insertion de pharmacophores en position C-6 du L-fucose a également été effectuée. La synthèse du 6,7,8-trideoxy-L-galacto-oct-7-enose a été réalisée avec un bon rendement global par le Dr. Karine Marotte. La fonction allyle en position C-6 a ainsi pu être fonctionnalisée par les réactions de métathèse croisée et de dihydroxylation asymétrique. Un homologue du L-galactose a également été préparé en deux étapes. Des résultats préliminaires en inhibition compétitive (tests ELLA) ont démontré que la lectine PA-IlL pouvait avoir une affinité 14 fois plus élevée pour certains de nos analogues, qu'elle en avait pour le fucose présent chez le trisaccharide Lewis a, le ligand naturel présumé de la bactérie. Les trois composés ayant démontré le meilleur potentiel d'inhibition sont des fucosides possédant des pharmacophores de type triazole et isoxazole. De tels agents anti-adhésion pourraient représenter une thérapie alternative ou un complémentaire aux antibiotiques dans le traitement d'infections mortelles.

Thèse doctorat : Sciences et Techniques du Déchet : Villeurbanne, INSA : 2004. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 213-226.

Thesis (M.S.)--University of North Texas, May, 2009. / Title from title page display. Includes bibliographical references.

Thesis (Ph. D.)--University of Queensland, 2002. / Includes bibliographical references.

Not available / text

The aim of this study was to increase understanding of amino acid utilisation and amino acid permease (aa_permease) genes in the plant pathogen Pseudomonas syringae, which inhabits the nutrient-limited environment of the plant surface and intracellular apoplast. aa_permease genes are significantly reduced in P. syringae genomes compared to non plant-pathogenic Pseudomonas. Accordingly, this work demonstrates that P. syringae can utilise a restricted number of amino acids for growth compared to non plant-pathogenic Pseudomonas. The remaining aa_permease genes in Pseudomonas syringae pv. tomato are annotated as transporting GABA, ethanolamine, proline and aromatic amino acids. Sequence analyses, phylogenetic analyses, chemotaxis assays and gene expression analyses supported the functional annotations of the GABA, ethanolamine and aromatic aa_permeases, but showed that expression of the proline permease was specifically induced by histidine, which suggests that this encodes a histidine transporter. Expression of the GABA and histidine permeases was also induced in the presence of tomato apoplast, indicating that these amino acids may be assimilated during apoplast colonisation. P. syringae pv. tomato exhibited chemotaxis towards tomato apoplast and several constituent amino acids, which may be important for invasion of the apoplast from the plant surface. Uptake of several amino acids including GABA and histidine appeared to be negatively affected in alkaline media. The aa_permeases use electrochemical potential energy to transport substrates and this mechanism may be affected by pH. The plant apoplast becomes increasingly alkaline during infection and this may select against the retention of particular transporters in P. syringae. As GABA is an abundant amino acid in the apoplast and can be used by P. syringae strains for growth, the growth of P. syringae pv. tabaci was monitored in transgenic tobacco plants with increased GABA. Although growth was similar in all plants, significantly fewer symptoms and more callose deposition was observed upon infection.

No description available.

No description available.