Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Adriane Pinto Wasko / Banca: Daniela Calcagnotto / Banca: Flávio César Thadeo de Lima / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Resumo: A família Characidae é o grupo mais especioso entre os Characiformes, abrangendo cerca de 1100 espécies válidas, divididas em 14 subfamílias e com diversos gêneros considerados incertae sedis. A subfamília Bryconinae incluí 43 espécies válidas sendo que 41 pertencem ao gênero Brycon, uma ao gênero Henochilus e uma ao gênero Chilobrycon. Os peixes do gênero Brycon estão entre os mais importantes na pesca amadora e profissional de água doce da América do Sul. Apesar da importância econômica e ecológica das espécies dessa subfamília, ainda há resultados controversos presentes na literatura quanto à sua composição, conhecimento da relação entre seus componentes e de seu relacionamento com outros Characiformes. Para tentar resolver essas questões, o presente trabalho tem como objetivo elaborar e testar hipóteses de relacionamento das espécies dos diferentes gêneros dessa subfamília e desta com outros grupos de Characidae e Characiformes. Sequências parciais de dois genes mitocondriais (16S RNA e Citocromo b) e três genes nucleares (Myh6, Rag1 e Rag2) foram obtidas de 231 espécies, incluindo 230 Characiformes e 1 Cypriniformes, totalizando uma matriz total de 4684pb. As análises filogenéticas foram conduzidas pelo método de Máxima Parcimônia, Máxima Verossimilhança e Análise Bayesiana. Todos os métodos filogenéticos apontaram para o mesmo resultado: Bryconinae mais os representantes do gênero Salminus formaram o grupo irmão de Gasteropelecidae, diretamente relacionados às subfamílias de Characidae: Agoniatinae, Clupeacharacinae e Triportheinae e também aos gêneros Engraulisoma e Lignobrycon. A subfamília Bryconinae e o gênero Brycon não são monofiléticos, assim como os grupos cis e transandinos de Brycon. Salminus apareceu entre as amostras de Brycon. Chilobrycon pertence a um clado formado por espécies de Brycon trans-andinas... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Characidae is the richest group among Characiformes, comprising about 1100 valid species, divided in 14 subfamilies and several genera considered incertae sedis. Among Characidae, the subfamily Bryconinae includes 43 valid species; among which 41 belong to the genus Brycon, one to the genus Henochilus and one to the genus Chilobrycon. In spite of the economic and ecological importance of the species of the subfamily Bryconinae, its phylogeny, classification and composition are not yet well solved. The main objective of this study was to test the hypothesis of relationship of the Bryconinae with other group of Characidae and Characiformes. Partial sequences of two mitochondrial genes (cytochrome b and 16S RNA) and three nuclear genes (Myh6, RAG1 and RAG2) were obtained from 231 species, including 230 Characiformes and one Cypriniformes, resulting in a matrix of 4684 pb. Phylogenetic analysis were conducted by the methods of Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian analysis. In all phylogenetic analysis we achieved the same result: Bryconinae and the genus Salminus formed the sister group of Gasteropelecidae directly related to the Characidae subfamilies Agoniatinae, Clupeacharacinae, and Triportheinae and also to the genera Engraulisoma and Lignobrycon. The subfamily Bryconinae and Brycon are not monophyletic, as well as the cis- and trans-Andean groups. Salminus appeared between samples of Brycon. Chilobrycon is related to some trans-Andean species of Brycon. B. moorei (trans-Andean) is related of the species found in the Amazonas, São Francisco and Paraná Basis. Henochilus wheatlandii is sister-group of species of the coastal rivers of eastern Brazil. Some aspects related to the composition of Bryconinae as well as the groups distribution are discussed in the text / Doutor

Orientador: Francisco Langeani Neto / Banca: Osvaldo Takeshi Oyakawa / Banca: Lilian Casatti / Resumo: São apresentadas a análise filogenética e a revisão taxonômica de Hasemania Ellis, 1911. Hasemania, Ellis, 1911, compreende doze espécies; sete anteriormente descritas: H. nana (Lütken, 1875) descrita para a bacia do rio São Francisco; H. melanura Ellis, 1911 (espécie-tipo por designação original), bacia do rio Iguaçu; H. maxillaris Ellis, 1911, mesma localidade de H. melanura; H. hanseni (Fowler, 1949), Estado de Goiás; H. crenuchoides Zarske & Géry, 1999, bacia do alto rio Paraná; H. bilineata Ellis, 1911, bacia do rio Tietê, descrita originalmente em Hasemania mas transferida por Géry (1966) para Coptobrycon; H. negodagua Lima & Gerhard, 2001, bacia do alto rio Paraguaçu, descrita originalmente em Hyphessobrycon; e cinco espécies novas: H. sp.n.1, bacia do rio Tocantins-Araguaia, H. sp.n.2, bacia do rio Jequitinhonha, H. sp.n.3, bacia do alto rio Paraná, H. sp.n.4, bacia do rio Doce e H. sp.n.5, bacia do rio Tocantins-Araguaia. A análise filogenética envolvendo as espécies de Hasemania e outros Tetragonopterinae e Characidade resultou em uma única árvore filogenética (Passos: 602; IR: 0,5368; ICR: 0,1213). O gênero é hipotetizado como monofilético com base em uma apomorfia exclusiva (com reversão em H. hanseni): mesetmóide bastante delgado, com um estreitamento mediano muito acentuado, deixando boa parte do vômer visível em vista dorsal. Além das relações de Hasemania, são também discutidas algumas relações filogenéticas em Tetragonopterinae. INTRODUÇÃO GERAL Hasemania Ellis, 1911, originalmente abrigava três espécies: H. melanura (espécie tipo por designação original) descrita para Porto União, rio Iguaçu, bacia do rio Paraná, Estado do Paraná; H. maxillaris, Ellis, 1911, descrita para a mesma localidade, e H. bilineata, Ellis, 1911, descrita para Paranapiacaba (Alto da Serra), São Paulo, bacia do rio Tietê, Estado de São Paulo...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-22Bitstream added on 2014-06-13T21:07:57Z : No. of bitstreams: 1 abe_kt_dr_botib.pdf: 4152827 bytes, checksum: 7b9ae47b515068c8a1fd1fa83a78bd1c (MD5) / A família Characidae é o grupo mais especioso entre os Characiformes, abrangendo cerca de 1100 espécies válidas, divididas em 14 subfamílias e com diversos gêneros considerados incertae sedis. A subfamília Bryconinae incluí 43 espécies válidas sendo que 41 pertencem ao gênero Brycon, uma ao gênero Henochilus e uma ao gênero Chilobrycon. Os peixes do gênero Brycon estão entre os mais importantes na pesca amadora e profissional de água doce da América do Sul. Apesar da importância econômica e ecológica das espécies dessa subfamília, ainda há resultados controversos presentes na literatura quanto à sua composição, conhecimento da relação entre seus componentes e de seu relacionamento com outros Characiformes. Para tentar resolver essas questões, o presente trabalho tem como objetivo elaborar e testar hipóteses de relacionamento das espécies dos diferentes gêneros dessa subfamília e desta com outros grupos de Characidae e Characiformes. Sequências parciais de dois genes mitocondriais (16S RNA e Citocromo b) e três genes nucleares (Myh6, Rag1 e Rag2) foram obtidas de 231 espécies, incluindo 230 Characiformes e 1 Cypriniformes, totalizando uma matriz total de 4684pb. As análises filogenéticas foram conduzidas pelo método de Máxima Parcimônia, Máxima Verossimilhança e Análise Bayesiana. Todos os métodos filogenéticos apontaram para o mesmo resultado: Bryconinae mais os representantes do gênero Salminus formaram o grupo irmão de Gasteropelecidae, diretamente relacionados às subfamílias de Characidae: Agoniatinae, Clupeacharacinae e Triportheinae e também aos gêneros Engraulisoma e Lignobrycon. A subfamília Bryconinae e o gênero Brycon não são monofiléticos, assim como os grupos cis e transandinos de Brycon. Salminus apareceu entre as amostras de Brycon. Chilobrycon pertence a um clado formado por espécies de Brycon trans-andinas... / The family Characidae is the richest group among Characiformes, comprising about 1100 valid species, divided in 14 subfamilies and several genera considered incertae sedis. Among Characidae, the subfamily Bryconinae includes 43 valid species; among which 41 belong to the genus Brycon, one to the genus Henochilus and one to the genus Chilobrycon. In spite of the economic and ecological importance of the species of the subfamily Bryconinae, its phylogeny, classification and composition are not yet well solved. The main objective of this study was to test the hypothesis of relationship of the Bryconinae with other group of Characidae and Characiformes. Partial sequences of two mitochondrial genes (cytochrome b and 16S RNA) and three nuclear genes (Myh6, RAG1 and RAG2) were obtained from 231 species, including 230 Characiformes and one Cypriniformes, resulting in a matrix of 4684 pb. Phylogenetic analysis were conducted by the methods of Maximum Parsimony, Maximum Likelihood and Bayesian analysis. In all phylogenetic analysis we achieved the same result: Bryconinae and the genus Salminus formed the sister group of Gasteropelecidae directly related to the Characidae subfamilies Agoniatinae, Clupeacharacinae, and Triportheinae and also to the genera Engraulisoma and Lignobrycon. The subfamily Bryconinae and Brycon are not monophyletic, as well as the cis- and trans-Andean groups. Salminus appeared between samples of Brycon. Chilobrycon is related to some trans-Andean species of Brycon. B. moorei (trans-Andean) is related of the species found in the Amazonas, São Francisco and Paraná Basis. Henochilus wheatlandii is sister-group of species of the coastal rivers of eastern Brazil. Some aspects related to the composition of Bryconinae as well as the groups distribution are discussed in the text

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-27Bitstream added on 2014-06-13T19:25:12Z : No. of bitstreams: 1 silva_gjc_me_botib.pdf: 2625570 bytes, checksum: ff79004155d6f80851bd931782561e7f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A família Loricariidae, uma das mais especiosas famílias de peixes do mundo, com cerca de 700 espécies, tem sido objeto de vários estudos taxonômicos e sistemáticos, o que tem auxiliado na compreensão da diversidade e dos padrões gerais de relacionamento entre seus gêneros e espécies. Todavia, dada a ampla diversidade do grupo, muitos dos problemas da família ainda estão por serem resolvidos. Dentro de Loricariidae, a subfamília Loricariinae tem sido reconhecida como um grupo monofilético, porém o conhecimento da relação entre seus gêneros é ainda incipiente. Atualmente essa subfamília compreende cerca de 210 espécies distribuídas em 31 gêneros encontrados na América Central e do Sul. O presente trabalho teve como objetivo principal procurar ampliar o conhecimento sobre a diversidade e os padrões de relacionamento dos gêneros da subfamília Loricariinae e em especial estudar as relações entre espécies do gênero Harttia. Para isso foram analisadas quatro matrizes de dados, construídas a partir de seqüências parciais do gene nuclear F-Reticulon 4 e dos genes mitocondriais COI, 16S e 12S mais o RNA transportador da Valina que existe entre eles. Cada matriz foi construída com um conjunto de genes e de amostras particulares, para testar diferentes hipóteses. Graficamente, pela análise de transversão e transição, observou-se que os conjuntos de dados não se encontram saturados, possibilitando seu emprego para análise filogenética. Amostras das subfamílias Hypoptopomatinae, Neoplecostominae, Delturinae e Hypostominae foram utilizadas como grupo externo nas diferentes análises. As hipóteses de relacionamento filogenético obtidas por Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança apresentaram topologias idênticas em todas as análises, tendo sido testadas estatisticamente pela técnica de bootstrap. Os resultados corroboram as hipóteses de relacionamento... / Not available

Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Osvaldo Oiakawa / Banca: Anderson Luiz Alves / Resumo: A família Loricariidae, uma das mais especiosas famílias de peixes do mundo, com cerca de 700 espécies, tem sido objeto de vários estudos taxonômicos e sistemáticos, o que tem auxiliado na compreensão da diversidade e dos padrões gerais de relacionamento entre seus gêneros e espécies. Todavia, dada a ampla diversidade do grupo, muitos dos problemas da família ainda estão por serem resolvidos. Dentro de Loricariidae, a subfamília Loricariinae tem sido reconhecida como um grupo monofilético, porém o conhecimento da relação entre seus gêneros é ainda incipiente. Atualmente essa subfamília compreende cerca de 210 espécies distribuídas em 31 gêneros encontrados na América Central e do Sul. O presente trabalho teve como objetivo principal procurar ampliar o conhecimento sobre a diversidade e os padrões de relacionamento dos gêneros da subfamília Loricariinae e em especial estudar as relações entre espécies do gênero Harttia. Para isso foram analisadas quatro matrizes de dados, construídas a partir de seqüências parciais do gene nuclear F-Reticulon 4 e dos genes mitocondriais COI, 16S e 12S mais o RNA transportador da Valina que existe entre eles. Cada matriz foi construída com um conjunto de genes e de amostras particulares, para testar diferentes hipóteses. Graficamente, pela análise de transversão e transição, observou-se que os conjuntos de dados não se encontram saturados, possibilitando seu emprego para análise filogenética. Amostras das subfamílias Hypoptopomatinae, Neoplecostominae, Delturinae e Hypostominae foram utilizadas como grupo externo nas diferentes análises. As hipóteses de relacionamento filogenético obtidas por Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança apresentaram topologias idênticas em todas as análises, tendo sido testadas estatisticamente pela técnica de bootstrap. Os resultados corroboram as hipóteses de relacionamento... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Not available / Doutor

Orientador: Francisco Langeani Neto / Coorientador: Heraldo A. Britski / Coorientador: Márcio C. Chiachio / Banca: Roberto Esser dos Reis / Banca: Marcelo Ribeiro de Britto / Resumo: Pseudotothyris Britski & Garavello, 1984 é um gênero de cascudinhos pequenos da subfamília Hypoptopomatinae que conta com duas espécies válidas, P. obtusa e P. janeirensis. O gênero tem distribuição somente por bacias litorâneas do sul e sudeste do Brasil entre os estados do Rio de Janeiro e Santa Catarina. Schaefer (1991), em uma análise filogenética da subfamília Hypoptopomatinae, afirma não haver nenhum caráter diagnóstico unicamente derivado para Pseudotothyris, questionando sua validade taxonômica e sugerindo uma análise comparativa mais detalhada com os demais hipoptopomatíneos a fim de se determinar, se existirem, caracteres diagnósticos exclusivos para o gênero. Apesar dos inúmeros trabalhos posteriormente realizados sobre as relações filogenéticas da subfamília, nenhum deles incluiu as duas espécies válidas para o gênero. Com base no exposto, o presente trabalho realizou a análise filogenética e a revisão taxonômica do gênero a fim de avaliar sua composição específica, seu monofiletismo e o relacionamento filogenético entre suas espécies e delas com os demais Hypoptopomatinae. Para a análise filogenética foi realizado um estudo a partir de 108 caracteres observados para 49 táxons terminais, incluindo membros de Loricariinae, Hypostominae, Neoplecostominae e Hypoptopomatinae. Os resultados corroboram o monofiletismo do gênero, que é suportado por duas sinapomorfias não ambíguas: espinho neural central da vértebra 8 bem desenvolvido, alcançando pelo menos metade do tamanho do espinho neural central da vértebra 7; e odontódeos da margem anterior do focinho muito desenvolvidos apenas na região dorsal. Este último estado de caráter constituindo uma sinapomorfia exclusiva para o gênero dentro de Hypoptopomatinae. Assim como esperado e já sugerido... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Pseudotothyris Britski & Garavello, 1984 is a genus of small catfishes of Hypoptopomatinae with two species, P. obtusa and P. janeirensis. The genus occurs only in coastal basins in southern and southeastern Brazil, between Rio de Janeiro and Santa Catarina States. Schaefer (1991), in a phylogenetic analysis of the subfamily Hypoptopomatinae, did not found any uniquely derived unreversed character which diagnoses Pseudotothyris, and questioned the taxonomic validity of the genus, suggesting that a more detail comparative analysis is need to find exclusive diagnostic characters to the genus. Despite numerous studies about Hypoptopomatinae relationships performed later, no one of them included the two valid species of the genus. Based on this, the present study aims to perform the phylogenetic analysis and taxonomic revision of the genus, evaluating its specific composition, its monophyly, and the phylogenetic relationship within the genus and among the genus and other Hypoptopomatinae genera. Phylogenetic analysis was performed with 108 characters observed to 49 terminal taxa, including members of the Loricariinae, Hypostominae, Neoplecostominae, and Hypoptopomatinae. The results corroborated the monophyly of the genus that is supported by two unambiguous synapomorphies: central neural spine of eighth vertebra well developed, reaching at least half of the size of the central spine of the seventh vertebra; and anterior snout odontodes well developed only on dorsal region. Among the Hypoptopomatinae, this last character state is an exclusive synapomorphy for the genus. As expected and already suggested by other authors, Pseudotothyris is recovered as sister group of Otothyris, another genus that occurs in coastal drainages. As result of the taxonomic revision, we present... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Resumo: A família Rivulidae inclui atualmente 240 espécies válidas, sendo distribuídas desde o sul da Flórida (EUA) até o sul da Patagônia (Argentina). Dentro da família Rivulidae, o gênero de peixes anuais mais especioso é Simpsonichthys, compreendendo 56 espécies válidas. Devido sua ampla distribuição e a ocorrência de variação morfológica entre as espécies do gênero, foi sugerido a divisão deste grupo em cinco subgêneros: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias e Hypsolebias. Buscando levantar as primeiras informações genéticas para o gênero, o objetivo do trabalho foi inferir as relações filogenéticas do grupo na tentativa de testar a hipótese de divisão de Simpsonichthys em cinco subgêneros. Para tanto, indivíduos pertencentes ao gênero Simpsonichthys foram coletados ao longo de riachos costeiros da bacia do Leste do Brasil e tiveram seu DNA genômico extraído para a realização da reação de PCR, com o intuito de amplificar os genes de interesse (ATPase 8/6 e RAG-2). Os produtos de PCR obtidos com o gene mitocondrial (ATPase 8/6) foram sequênciados e as análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos Neighbour-Joining e Máxima Parcimônia, com 1000 réplicas de bootstrap, utilizando o modelo evolutivo Kimura-2- Parâmetros. Os resultados obtidos permitem inferir que a hipótese de divisão de Simpsonichthys é válida, e que o gênero é subdividido em sete subgêneros distintos. A topologia obtida apresentou dois clados, sendo o clado I composto pelo subgênero Hypsolebias, grupo S. magnificus, e o II contendo os subgêneros Hypsolebias, grupos S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) e S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) e Ophtalmolebias (IIF). As relações filogenéticas observadas foram: o clado I como grupo irmão de todo o clado II, e dentro do segundo clado... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The family Rivulidae currently comprises 240 valid species, being distributed from southern Florida (USA) to the southern Patagonia (Argentina). Within the family Rivulidae, the genus of annual fish that is more specious is Simpsonichthys, comprising 56 valid species. Due to the wide distribution and occurrence of morphological variation among species of the genus, it was suggested to divide this group into five subgenus: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias and Hypsolebias. Seeking to raise the first genetic information for the genus, the aim of this study was to infer the phylogenetic relationships of the group in order to test the hypothesis of the division of Simpsonichthys into five subgenus. So, individuals belonging to the genus Simpsonichthys were collected along coastal streams of the East Brazilian basin and had their genomic DNA extracted to perform the PCR reaction to amplify the genes of interest (ATPase 8/6 and RAG-2). The PCR products (ATPase 8/6) were subjected to sequencing and phylogenetic analysis were performed by methods Neighbour-Joining and Máximum Parcimony, with 1000 bootstrap replicates, using the evolutionary model Kimura-2-Parameters. The results obtained allow us to infer that the hypothesis of division of Simpsonichthys is valid, and that the genus is divided into seven distinct subgenus. The topology obtained showed two clades, the clade I is composed of the subgenus Hypsolebias, group S. magnificus, and the II containing the subgenus Hypsolebias groups S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) and S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) and Ophtalmolebias (IIF). Phylogenetic relationships observed were: the clade I, composed by subgenus Hypsolebias (S. magnificus), appears as sister group of clade II, and within the... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Anderson Luis Alves / Coorientador: Patrícia P. Parise-Maltempi / Banca: Maria Rita de Cascia Barreto Netto / Banca: Marcio Cesar Chiachio / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-03-01Bitstream added on 2014-06-13T19:08:39Z : No. of bitstreams: 1 ponzetto_jm_me_rcla_parcial.pdf: 242120 bytes, checksum: 9ee242141ffd7b601c1d33861b554267 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-25T13:01:09Z: ponzetto_jm_me_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-25T13:03:26Z : No. of bitstreams: 1 000696856_20151201.pdf: 232016 bytes, checksum: 5f65468f370a6873831529b66b3a00d9 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-12-01T09:08:36Z: 000696856_20151201.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-01T09:09:26Z : No. of bitstreams: 1 000696856.pdf: 1828460 bytes, checksum: dd52594af21a629a302fead3bdf5696b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A família Rivulidae inclui atualmente 240 espécies válidas, sendo distribuídas desde o sul da Flórida (EUA) até o sul da Patagônia (Argentina). Dentro da família Rivulidae, o gênero de peixes anuais mais especioso é Simpsonichthys, compreendendo 56 espécies válidas. Devido sua ampla distribuição e a ocorrência de variação morfológica entre as espécies do gênero, foi sugerido a divisão deste grupo em cinco subgêneros: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias e Hypsolebias. Buscando levantar as primeiras informações genéticas para o gênero, o objetivo do trabalho foi inferir as relações filogenéticas do grupo na tentativa de testar a hipótese de divisão de Simpsonichthys em cinco subgêneros. Para tanto, indivíduos pertencentes ao gênero Simpsonichthys foram coletados ao longo de riachos costeiros da bacia do Leste do Brasil e tiveram seu DNA genômico extraído para a realização da reação de PCR, com o intuito de amplificar os genes de interesse (ATPase 8/6 e RAG-2). Os produtos de PCR obtidos com o gene mitocondrial (ATPase 8/6) foram sequênciados e as análises filogenéticas foram realizadas pelos métodos Neighbour-Joining e Máxima Parcimônia, com 1000 réplicas de bootstrap, utilizando o modelo evolutivo Kimura-2- Parâmetros. Os resultados obtidos permitem inferir que a hipótese de divisão de Simpsonichthys é válida, e que o gênero é subdividido em sete subgêneros distintos. A topologia obtida apresentou dois clados, sendo o clado I composto pelo subgênero Hypsolebias, grupo S. magnificus, e o II contendo os subgêneros Hypsolebias, grupos S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) e S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) e Ophtalmolebias (IIF). As relações filogenéticas observadas foram: o clado I como grupo irmão de todo o clado II, e dentro do segundo clado... / The family Rivulidae currently comprises 240 valid species, being distributed from southern Florida (USA) to the southern Patagonia (Argentina). Within the family Rivulidae, the genus of annual fish that is more specious is Simpsonichthys, comprising 56 valid species. Due to the wide distribution and occurrence of morphological variation among species of the genus, it was suggested to divide this group into five subgenus: Xenurolebias, Ophthalmolebias, Simpsonichthys, Spectrolebias and Hypsolebias. Seeking to raise the first genetic information for the genus, the aim of this study was to infer the phylogenetic relationships of the group in order to test the hypothesis of the division of Simpsonichthys into five subgenus. So, individuals belonging to the genus Simpsonichthys were collected along coastal streams of the East Brazilian basin and had their genomic DNA extracted to perform the PCR reaction to amplify the genes of interest (ATPase 8/6 and RAG-2). The PCR products (ATPase 8/6) were subjected to sequencing and phylogenetic analysis were performed by methods Neighbour-Joining and Máximum Parcimony, with 1000 bootstrap replicates, using the evolutionary model Kimura-2-Parameters. The results obtained allow us to infer that the hypothesis of division of Simpsonichthys is valid, and that the genus is divided into seven distinct subgenus. The topology obtained showed two clades, the clade I is composed of the subgenus Hypsolebias, group S. magnificus, and the II containing the subgenus Hypsolebias groups S. flammeus (IIA), S. notatus (IIB) and S. antenori (IID), Simpsonichthys (IIC), Spectrolebias (IIE) and Ophtalmolebias (IIF). Phylogenetic relationships observed were: the clade I, composed by subgenus Hypsolebias (S. magnificus), appears as sister group of clade II, and within the... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-21Bitstream added on 2014-06-13T19:39:32Z : No. of bitstreams: 1 tagliacollo_va_me_botib.pdf: 696657 bytes, checksum: 38fcfa7941eec57c79cee0e5fc106dc8 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The subfamily Aphyocharacinae comprises the genera Aphyocharax, Prionobrama, Paragoniates, Phenagoniates, Leptagoniates, Xenagoniates, Rachoviscus, and Inpaichthys. This current arrangement based on a morphological analysis is congruent with most proposed morphological phylogenetic analyses, except for the inclusion of Rachoviscus and Inpaichthys which is tenuous and not always supported by data. In this current work the goal was to investigate the monophyly of the subfamily Aphyocharacinae and to recover relationships within it using molecular and morphological analyses. Using separate parsimony and Bayesian analyses of morphological, nuclear and mitochondrial genes, I recover new relationships within Aphyocharacinae. Independent analyses recovered similar topologies for molecular and morphologic datasets. Molecular based topologies showed common generic relationships: Aphyocharacinae, excluding the genus Rachoviscus and Inpaichthys, constitutes a monophyletic group. Moreover, Aphyocharacinae has two well–marked major branches. One composed by (Paragoniates (Phenagoniates (Leptagoniates+Xenagoniates))), while the other includes Aphyocharax and Prionobrama. Also, relationships among the genera were completely resolved and supported by strong statistical indexes. Based on molecular hypotheses, I had a specific monophyletic framework to conduct morphological analysis. This approach suggests that Aphyocharacidium sp. and Microschemobrycon cf. casiquiare are most probably the sister group of Aphyocharacinae. The morphological analysis conducted with 25 unweighted and unordered characters recovers one tree, resolved at generic–species level. A similar hypothesis found using molecular data is recovered with three well–marked... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Ricardo Cardoso Benine / Coorientador: Claudio de Oliveira / Banca: Flávio César Thadeo de Lima / Banca: Cristiano Rangel Moreira / Resumo: Não disponível / Abstract: The subfamily Aphyocharacinae comprises the genera Aphyocharax, Prionobrama, Paragoniates, Phenagoniates, Leptagoniates, Xenagoniates, Rachoviscus, and Inpaichthys. This current arrangement based on a morphological analysis is congruent with most proposed morphological phylogenetic analyses, except for the inclusion of Rachoviscus and Inpaichthys which is tenuous and not always supported by data. In this current work the goal was to investigate the monophyly of the subfamily Aphyocharacinae and to recover relationships within it using molecular and morphological analyses. Using separate parsimony and Bayesian analyses of morphological, nuclear and mitochondrial genes, I recover new relationships within Aphyocharacinae. Independent analyses recovered similar topologies for molecular and morphologic datasets. Molecular based topologies showed common generic relationships: Aphyocharacinae, excluding the genus Rachoviscus and Inpaichthys, constitutes a monophyletic group. Moreover, Aphyocharacinae has two well-marked major branches. One composed by (Paragoniates (Phenagoniates (Leptagoniates+Xenagoniates))), while the other includes Aphyocharax and Prionobrama. Also, relationships among the genera were completely resolved and supported by strong statistical indexes. Based on molecular hypotheses, I had a specific monophyletic framework to conduct morphological analysis. This approach suggests that Aphyocharacidium sp. and Microschemobrycon cf. casiquiare are most probably the sister group of Aphyocharacinae. The morphological analysis conducted with 25 unweighted and unordered characters recovers one tree, resolved at generic-species level. A similar hypothesis found using molecular data is recovered with three well-marked... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre