Orientador: Amauri Gouveia Júnior / Banca: Sílvio Morato de Carvalho / Banca: Kester Carrara / Resumo: O objetivo do presente estudo foi avaliar o comportamento de preferência por escuridão em peixes da espécie C. auratus. No primeiro experimento avaliamos os efeitos das condições de alojamento sobre o comportamento de preferência, comparando posteriormente a situações onde foi inserido um substrato de cor intermediária (cinza). No segundo experimento avaliamos se a preferência por escuridão alterava-se após expor os sujeitos a variados regimes de luz. No primeiro experimento utilizamos 48 peixes (c. auratus), medindo entre cinco e sete centímetros, alojados em grupo (n = 24) em aquários de vidro (30 x 45 x 35 cm), com água filtrada e tamponada ph = 7,5 ± 5, sob temperatura de 27 ± 2ºc, ciclo de luz alternados em 12:12 h, controle de luz externa e alimentados uma vez ao dia. O aparato utilizado constituiu-se por seis aquários (15 x 10 x 45 cm) nas cores: preto, branco, cinza, branco-preto, cinza-branco e cinza-preto, com coluna d'água de 10 cm. No segundo experimento utilizamos 32 peixes da mesma espécie e com as mesmas características, mantidos em grupo (n = 11) em condições similares (4h, 8h, 12h, 16h ou 20h de luz). Foi utilizado aparato com medida similar ao experimento anterior e nas cores preto-branco. Após 5 minutos de habituação no centro do aquário as comportas eram removidas. As sessões tiveram duração de quinze 15 min. O procedimento foi o mesmo nos 2 experimentos. Os resultados indicaram maior preferência dos animais pelo substrato preto quando em contraste com o substrato branco, e do cinza, em relação ao preto e ao branco. O segundo experimento indicou que a exposição a regimes de luz diferenciados altera a preferência dos animais fazendo com que no regime de 20 h a preferência por substrato escuro desapareça, desta forma, alguns regimes luminosos, em específico os mais longos,...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of the present study was to evaluate the darkeness preference behavior in fish . The first experiment evaluated the preference among three substratum (dark, white and ash) . The second experiment evaluated the preference by darkness after exposition to differentes light regimes. In the first experiment 48 fish (c. auratus), five to seven centimeters of body size, were housed in group (n = 24) with light cycle alternated in 12:12 h, light control expresses and they were fedded once a day. The apparatus was constituted by six aquariums (15 x 10 x 45 cm) in colors (black, white, ash, white-black, ash-white and ash-black) and column of water of 10 cm. In the second experiment 32 fish of the same species and with the same characteristics, under similar conditions, were exposed to inverted and alternated light cycles (4 h, 8 h, 12 h, 16 h or 20h). The apparatus had similar measures and black-white colors to the previous experiment. After 5 minutes of habituation in the center of the aquarium the floodgates were removed. The sessions finished at 15 minutes. The procedure was the same in two experiments. The data of teh first experiment shows that the subjects prefer black substract than white and they o prefer ash than blak or white. The second experiment suggested that the kind of exposure of light regime effects the preferency in fishes. Twenty hours lighting regime faded out the darkeness preferency. Some luminous regimes, in specific the longest, altered the preference for darkness in the fish. There is preference for the intermediate substratum (ash) when available. / Mestre

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Ecologia, 2016. / Submitted by Camila Duarte (camiladias@bce.unb.br) on 2016-09-20T15:58:52Z No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-12-02T14:54:05Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-02T14:54:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_LucianaAlvesPereira.pdf: 4357025 bytes, checksum: 32348bc07ee8be67758bdde45c9c206f (MD5) / O desenvolvimento de ferramentas analíticas para determinar a origem de peixes é útil para o entendimento de padrões de uso do habitat e podem auxiliar no monitoramento, manejo e no controle de recursos naturais, bem como na certificação da origem de alimentos. A aplicação da metodologia de análise isotópica em estruturas calcificadas fornece informações integradas sobre a origem geográfica dos peixes provenientes de diferentes ambientes. O objetivo deste trabalho foi desenvolver marcadores isotópicos de estrôncio (Sr), carbono (C) e oxigênio (O) para traçar a origem geográfica do pirarucu (Arapaima sp.) comercializado na bacia Amazônica, por meio da análise cronológica de Sr nos otólitos em alta resolução com LAMC- ICPMS, visando distinguir indivíduos criados em cativeiro e capturados em ambiente natural. Foram coletados espécimes de diferentes ambientes, bem como a água e as rações utilizadas na alimentação do pirarucu em cativeiro. Os principais resultados encontrados foram: a discriminação total da pesca do pirarucu quanto a origem geográfica e ao método de produção com 70,5% e 94,16% de classificação correta, respectivamente; a integração cronológica entre as variações das razões 87Sr/86Sr dos peixes em relação as sub-bacias amazônicas, bem como a confirmação do padrão de sedentarismo e migração lateral do pirarucu. A ferramenta isotópica desenvolvida apresenta diversas aplicações no rastreamento da pesca do pirarucu na bacia Amazônia, sendo assim importante para o desenvolvimento tecnológico e ecológico desta espécie no ecossistema Amazônico. _________________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The development of an analytical tool to determine the origin of fish is useful for the understanding of habitat use patterns and can assist in monitoring, management and control of natural resources, as well as the certification of food origin. The application of isotopic analyses methodology in calcificated structures provides integrate information about a fish´s geographic origin from different environments. The objective of this study was to develop a method using Sr, C and O isotopic markers to trace the geographical origin of pirarucu (Arapaima sp) sold in Amazonian basin, through the chronological otolith analyses in high resolution with LA-MCICPMS, in order to distinguish captive fishes from those caught in their natural environment. Individuals were collected from different environments, as well as water and food used for feeding pirarucu in captivity. The main findings were total discrimination of Arapaima fishing for the geographic origin and production method with 70,5% e 94,16% of correct classification, respectively; chronological integration between the variation of fish 87Sr/86Sr ratio in relation to the Amazon sub basins, as well as confirmation of pirarucu sedentary pattern and lateral migration. The isotopic tool developed has several applications in tracking the Arapaima sp. fishing in Amazon basin, therefore important for technological and ecological development about these species in Amazon ecosystem.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-10-30T15:31:28Z No. of bitstreams: 1 2014_AngeloAugustoProcopioCosta.pdf: 619708 bytes, checksum: 7fecad68ddf2929d5ae4ab349d2b9608 (MD5) / Approved for entry into archive by Tania Milca Carvalho Malheiros(tania@bce.unb.br) on 2014-10-30T17:13:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_AngeloAugustoProcopioCosta.pdf: 619708 bytes, checksum: 7fecad68ddf2929d5ae4ab349d2b9608 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-30T17:13:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_AngeloAugustoProcopioCosta.pdf: 619708 bytes, checksum: 7fecad68ddf2929d5ae4ab349d2b9608 (MD5) / A produção de tilápias em tanques-rede tem como característica principal a possibilidade de submeter os peixes a altas densidades de estocagem devido a uma grande e intermitente troca de água proporcionada pelos lagos e represas em que são instalados. A determinação de uma densidade de estocagem ideal é essencial para proporcionar ao empreendimento maior lucratividade, sem ocorrer perdas por baixa biomassa nem por baixo desempenho individual decorrente de estresse e população excessiva. O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho e o estresse de juvenis de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) com peso médio inicial de 30g submetidos a três diferentes densidades de estocagem (250, 350 e 450 peixes/m³) em tanques-rede de uma piscicultura comercial no reservatório de Chavantes na bacia do rio Paranapanema. Ao final de 74 dias de cultivo, verificou-se que o aumento da densidade de estocagem gerou uma diminuição no peso final dos peixes, ganho de peso, ganho de peso diário, comprimento padrão e sobrevivência, aumentando a conversão alimentar aparente, mas não influenciando na biomassa final. As concentrações séricas de cortisol (123,65 a 246,65 ng/mL) e sanguíneos de glicose (71,87 a 105,75 mg/100mL) apontaram para um estresse fisiológico dos peixes em todos os tratamentos, porém sem sofrerem influência das diferentes densidades de estocagem estudadas, não sendo possível estabelecer uma conexão entre o baixo rendimento dos peixes submetidos às altas densidades e o bem-estar animal. ________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The culture of tilapia in cages have as main characteristic the possibility to submit the fish at high stocking densities due to a large and intermittent change of water provided by dams and lakes in which they are installed. The determination of an optimal stocking density is essential to provide the most financial profit without losses due to low biomass or low individual performance caused by stress and excessive population density. The objective of this study was evaluate the performance and the stress of juvenile Nile tilapia (Oreochromis niloticus) with an average initial weight of 30g subjected to three different stocking densities (250, 350 and 450 fish/m³) in cages in a commercial fish farm located at reservoir Chavantes of the Paranapanema river basin, Brazil. At the end of 74 days of cultivation, it was found that the increase of storage density caused a decrease in final weight of fish, weight gain, daily gain of weight, standard length and survival, and increased feed conversion but did not affect the final biomass. Serum cortisol (123.65 to 246.65 ng/mL) and blood glucose (71.87 to 105.75 mg/100mL) pointed to a physiological stress of the fish in all treatments but without suffering the influence of different stocking densities studied. It was not possible to establish a connection between low income of the fish subjected to high densities and animal welfare.

Orientador: Edmir Daniel Carvalho / Banca: Lúcia Helena Sipaúba-Tavares / Banca: Katharina Eichbaum Esteves / Resumo: Caracterizados como sistemas complexos, os reservatórios são considerados ambientes intermediários entre rios e lagos, de múltiplos usos, podendo comprometer a qualidade dos seus recursos hídricos e pesqueiros. O aporte contínuo de nutrientes, contribui de forma significativa para a eutrofização artificial, promovendo alterações na estrutura das comunidades do biota aquático. Nos reservatórios do Brasil vem sendo observado um impacto adicional, que é a tilapicultura em sistemas de tanques-rede sendo escassas as investigações sobre este assunto, principalmente no tocante aos aspectos da eutrofização. O presente projeto teve como objetivo avaliar quali-quantitativamente as condições limnológicas numa área de influência da criação de tilápias-do-Nilo (Oreochormis niloticus) em tanques-rede no reservatório de Jurumirim (rio Paranapanema), conhecido por suas características limnológicas como um ambiente oligotrófico, e ainda a comunidade de peixes que podem associar-se a esses tanques. Para avaliar as condições limnológicas foram realizadas coletas trimestrais em pontos próximos ao sistema dos tanques-rede e trechos controle, concomitantemente foram realizadas coletas de peixes com o intuito de diagnosticar e comparar a ictiofauna entre os trechos estudados. Apesar do significativo aporte de matéria orgânica provinda deste modelo de piscicultura, tanto os dados limnológicos quanto os dados ictiofaunísticos, seja em escala temporal ou espacial, não demonstraram diferenças significativas entre os trechos estudados. Mas empiricamente constatou-se a invasão dos tanques por juvenis de três espécies nativas (Serrassalmus maculatus, Astyanax altiparanae e Pimelodus sp.). Salientamos ainda, a importância do ordenamento e monitoramento científico deste modelo zootécnico em águas públicas evitando novos impactos antrópicos nestes ecossistemas aquáticos com excelente qualidade ambiental. / Abstract: Não disponível. / Mestre

Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-26. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:42Z : No. of bitstreams: 1 000864243_20170305.pdf: 7143919 bytes, checksum: caed29775e1aef81d31c7ee53b951b52 (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-10T13:07:29Z: 000864243_20170305.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-10T13:08:14Z : No. of bitstreams: 1 000864243.pdf: 17228237 bytes, checksum: e60fc4adb3f71274c66a6fc0677f3dea (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Introduction: Prematurity is the leading cause of neonatal mortality and serious neonatal morbidity worldwide and the risk is inversely proportional to gestational age at birth. Several studies demonstrate the role of innate immune response and Toll-like receptors (TLRs) in normal and complicated pregnancies, however most studies have focused on the tissues of the maternal-fetal interface. Research of the expression of TLRs in gestational tissues is of great importance for understanding the involvement of innate immunity in normal pregnancies and adverse pregnancy outcomes, but the analysis of these tissues allows for results only after the complete resolution of gestation. In this scenario, a potential biological sample of interest for analysis of TLRs in the ongoing gestation are maternal peripheral blood cells, since they play a crucial role in the immune system and express high levels of many of the TLRs. Main: Evaluate the profile of gene expression of TLR-1, -2, -4 and -6 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and polymorphonuclear cells (PMNs) and compare these expressions between preterm and term pregnancies. Materials and methods: 119 normal pregnant women were included in the study, subdivided into three groups according to the gestational trimester. In addition, 20 pregnant women in preterm labor and 18 pregnant women at term were evaluated. Gene expression analysis was performed by real-time PCR and protein expression evaluation by flow cytometry. Statistical analyses were performed using the nonparametric Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests by SigmaStat 3.1 software. Results: Regarding PBMCs, there were no significant differences in gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 among the trimesters. The same was observed when comparing PBMCs of preterm and term pregnancies. In relation to neutrophils, gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 remained unchanged throughout normal... / Introduction: Prematurity is the leading cause of neonatal mortality and serious neonatal morbidity worldwide and the risk is inversely proportional to gestational age at birth. Several studies demonstrate the role of innate immune response and Toll-like receptors (TLRs) in normal and complicated pregnancies, however most studies have focused on the tissues of the maternal-fetal interface. Research of the expression of TLRs in gestational tissues is of great importance for understanding the involvement of innate immunity in normal pregnancies and adverse pregnancy outcomes, but the analysis of these tissues allows for results only after the complete resolution of gestation. In this scenario, a potential biological sample of interest for analysis of TLRs in the ongoing gestation are maternal peripheral blood cells, since they play a crucial role in the immune system and express high levels of many of the TLRs. Main: Evaluate the profile of gene expression of TLR-1, -2, -4 and -6 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and polymorphonuclear cells (PMNs) and compare these expressions between preterm and term pregnancies. Materials and methods: 119 normal pregnant women were included in the study, subdivided into three groups according to the gestational trimester. In addition, 20 pregnant women in preterm labor and 18 pregnant women at term were evaluated. Gene expression analysis was performed by real-time PCR and protein expression evaluation by flow cytometry. Statistical analyses were performed using the nonparametric Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests by SigmaStat 3.1 software. Results: Regarding PBMCs, there were no significant differences in gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 among the trimesters. The same was observed when comparing PBMCs of preterm and term pregnancies. In relation to neutrophils, gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 remained unchanged throughout normal ... / FAPESP: 11/00269-4

Orientador: Fábio Porto-Foresti / Banca: Fernanda Simões de Almeida / Banca: Daniel Cardoso de Carvalho / Resumo: O rio Sapucaí-Mirim, tributário da bacia do Alto Paraná apresenta grande diversidade de peixes neotropicais, em termo de riqueza de espécies. Paradoxalmente, a região que compreende a bacia do rio Paraná e alto Paraná apresenta uma grande interferência antrópica devido principalmente a construção de centrais hidrelétricas. Centrais hidrelétricas podem ser classificadas em Usinas Hidrelétricas (UHE) e Pequenas Centrais Hidrelétricas (PCH), de acordo com a capacidade de gerar energia. As PCHs são colocadas por vários autores como uma das alternativas de menor interferência, por apresentarem um tamanho reduzido, sendo construídas para suprir a demanda energética de pequenos centros urbanos e rurais. No entanto, a construção de diversas PCHs somada a construções de UHE causam uma fragmentação ainda maior nos ambientes aquáticos, ocasionando a interrupção do fluxo dos rios, este evento tem se mostrado prejudicial para várias espécies de peixes, principalmente as espécies migradoras. Estas espécies têm a necessidade de movimentar-se rio acima para fins tróficos e reprodutivos uma vez ao ano, com a construção de barramentos estas encontram dificuldades para completar seu ciclo de vida. Diversos estudos apontam esse bloqueio como principal fator na redução populacional destas espécies, alertando para necessidade de ações conservacionistas, a fim de manter os estoques pesqueiros que além de apresentarem importância ecológica nos ambientes aquáticos são de grande importância na pesca comercial e de subsistência. Há diversas ações tomadas para mitigar a redução populacional destas espécies, no entanto, no Brasil, estas ações são realizadas sem informações científicas, ocorrendo de forma equivocada, especialmente em práticas de repovoamento, onde alevinos são liberados na natureza sem nenhum conhecimento prévio biológico e genético. Práticas mitigadoras realizadas sem respaldo .... / Abstract: The Sapucaí-Mirim River, tributary of Alto Paraná basin presents great diversity of Neotropical fishes in terms of richness of species. Nevertheless, the region which encompasses the Paraná and Alto Paraná basins presents a great anthropic interference especially due to the construction of hydroelectric plants, these constructions can be classified as to its capacity to generate energy, in Hydroelectric plants and Small Hydroelectric Plants (SHP). The SHP are considered by several authors as one of the alternatives with less interference, due to its small size, this kind of hydroelectric are constructed to feed the energetic demand of small urban and rural centers. However, the constructions of SHPs together with hydroelectric plants constructions causes an even bigger fragmentation in the aquatic environments , which results in the interruption of rivers flow, this event has been shown as very harmful to fishes species specially the migratory species. Once a year these species move upstream to feed and reproduce, due to dams constructions migratory fishes species have difficulties to complete their life cycle. Several studies indicates the dams as a principal factor in the reduction of migratory species population , warning to necessity of conservationist actions, aiming to maintain the fisheries stocks that represent a fisheries and ecological importance in the aquatic environments. Many actions are employed aiming to minimize the reduction of migratory species population, however, in Brazil these actions are performed without scientific support, occurring in a wrongful manner, specially the restocking, where the fishes are released into the wild without any prior biological and genetic knowledge. Mitigation practices performed without scientific support may endanger the wild stocking. The development of genetics technologies has been proven of extremely importance to assist in the ecology and conservationist biology, through ... / Mestre

Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Jonathan Stuart Ready / Banca: Anderson Luis Alves / Banca: Luiz Henrique Garcia Pereira / Banca: Guilherme José da Costa / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Resumo: Introduction: Prematurity is the leading cause of neonatal mortality and serious neonatal morbidity worldwide and the risk is inversely proportional to gestational age at birth. Several studies demonstrate the role of innate immune response and Toll-like receptors (TLRs) in normal and complicated pregnancies, however most studies have focused on the tissues of the maternal-fetal interface. Research of the expression of TLRs in gestational tissues is of great importance for understanding the involvement of innate immunity in normal pregnancies and adverse pregnancy outcomes, but the analysis of these tissues allows for results only after the complete resolution of gestation. In this scenario, a potential biological sample of interest for analysis of TLRs in the ongoing gestation are maternal peripheral blood cells, since they play a crucial role in the immune system and express high levels of many of the TLRs. Main: Evaluate the profile of gene expression of TLR-1, -2, -4 and -6 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and polymorphonuclear cells (PMNs) and compare these expressions between preterm and term pregnancies. Materials and methods: 119 normal pregnant women were included in the study, subdivided into three groups according to the gestational trimester. In addition, 20 pregnant women in preterm labor and 18 pregnant women at term were evaluated. Gene expression analysis was performed by real-time PCR and protein expression evaluation by flow cytometry. Statistical analyses were performed using the nonparametric Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests by SigmaStat 3.1 software. Results: Regarding PBMCs, there were no significant differences in gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 among the trimesters. The same was observed when comparing PBMCs of preterm and term pregnancies. In relation to neutrophils, gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 remained unchanged throughout normal... / Abstract: Introduction: Prematurity is the leading cause of neonatal mortality and serious neonatal morbidity worldwide and the risk is inversely proportional to gestational age at birth. Several studies demonstrate the role of innate immune response and Toll-like receptors (TLRs) in normal and complicated pregnancies, however most studies have focused on the tissues of the maternal-fetal interface. Research of the expression of TLRs in gestational tissues is of great importance for understanding the involvement of innate immunity in normal pregnancies and adverse pregnancy outcomes, but the analysis of these tissues allows for results only after the complete resolution of gestation. In this scenario, a potential biological sample of interest for analysis of TLRs in the ongoing gestation are maternal peripheral blood cells, since they play a crucial role in the immune system and express high levels of many of the TLRs. Main: Evaluate the profile of gene expression of TLR-1, -2, -4 and -6 in peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and polymorphonuclear cells (PMNs) and compare these expressions between preterm and term pregnancies. Materials and methods: 119 normal pregnant women were included in the study, subdivided into three groups according to the gestational trimester. In addition, 20 pregnant women in preterm labor and 18 pregnant women at term were evaluated. Gene expression analysis was performed by real-time PCR and protein expression evaluation by flow cytometry. Statistical analyses were performed using the nonparametric Kruskal-Wallis and Mann-Whitney tests by SigmaStat 3.1 software. Results: Regarding PBMCs, there were no significant differences in gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 among the trimesters. The same was observed when comparing PBMCs of preterm and term pregnancies. In relation to neutrophils, gene and protein expressions of TLR-1, TLR-2, TLR-4 and TLR-6 remained unchanged throughout normal ... / Doutor

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2012. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2012-10-10T13:35:15Z No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2012-10-15T14:06:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-10-15T14:06:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_IassudaraGarciaAlmeida.pdf: 2157003 bytes, checksum: 1ff1c34bf2a468eec5d25a95671992a2 (MD5) / O pirarucu (Arapaima gigas) é considerado um dos maiores peixes de água doce, podendo atingir três metros e peso aproximado de 200 quilos. Este peixe possui grande importância econômica para populações ribeirinhas da Bacia Amazônica, por esse motivo vem sofrendo uma grande exploração comercial resultando na drástica redução de espécimes e consequentemente na variabilidade genética desta espécie. O presente trabalho visa associar duas metodologias, com o objetivo de gerar mais conhecimentos sobre a biologia da espécie que sejam úteis para o desenvolvimento de tecnologias para a criação do pirarucu em cativeiro e sua conservação nas bacias fluviais onde pode ser encontrado. O pirarucu possui o comportamento de formar casais para acasalamento, o que proporciona uma barreira para sua criação em cativeiro, pois a identificação do sexo só é possível no período de maturidade sexual e por meio de métodos inviáveis economicamente e ao bem estar do peixe. Na tentativa de solucionar esse problema foi realizada uma varredura do genoma desta espécie utilizando a metodologia BSA (“Bulk Segregant Analysis”) associada a marcadores RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) a fim de prospectar sequências sexo-específicas para o desenvolvimento de um marcador molecular para sexagem de peixes pré-púberes. Foram combinadas amostras de machos e fêmeas para formar bulks sexo-específicos e estes foram avaliados com 566 primers RAPD (Operon®). Foram amplificados 2.609 fragmentos com uma cobertura estimada de um marcador a cada 714Kb. Os resultados sugerem que o pirarucu possui um sistema de determinação sexual não cromossômico ou, alternativamente, que a espécie sofreu perda recente do cromossomo sexual. O pirarucu tem passado por uma drástica redução populacional e conseqüente diminuição da variabilidade genética em algumas regiões da Bacia Amazônica. A fim de determinar o estado dessas populações e sua variabilidade, estudos de dinâmica populacional e estrutura genética têm sido realizados. Nesses estudos, normalmente se trabalha com um N amostral reduzido e uma maior abrangência geográfica. No entanto, com base nos dados obtidos neste trabalho, foi possível observar que uma amostragem maior de apenas uma região pode fornecer resultados semelhantes. A metodologia utilizada fundamentou-se no sequenciamento e análise de duas regiões do mtDNA, ATPase (n=95) e citocromo oxidase (n=97) em indivíduos de quatro populações, geograficamente próximas, na região Santarém – PA. Também foi possível concluir que em se tratando dessa espécie a variabilidade genética encontrada é baixa, no entanto, entre as populações estudadas é possível encontrar certa diferenciação. Além disso, de acordo com a distribuição das redes de haplótipos observada, é possível sugerir uma recente expansão populacional de peixes oriundos da região Santa Maria. Esses resultados são compatíveis com os poucos trabalhos reportados na literatura sobre essa espécie, comprovando que é possível aumentar o N amostral e reduzir a representatividade geográfica, e assim melhorar a realização de estratégias de manejo locais a partir dos resultados de estudos filogenéticos para análise da estrutura populacional da espécie. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The arapaima (Arapaima gigas) is considered one of the largest freshwater fish and can reach three meters and weighing approximately 200 pounds. This fish has great economic importance to coastal communities in the Amazon Basin, for this reason has been undergoing a major commercial operation resulting in drastic reduction of specimens and thus genetic variability in this species. The present work aims to link two methodologies, in order to generate more knowledge about the biology of the species that are useful for the development of technologies for the creation of arapaima in captivity and conservation in river basins where it can be found. The arapaima has behavior to form mating pairs, which provides a barrier to their breeding in captivity, because the sex identification is possible only in the period of sexual maturity and by methods uneconomical and welfare of the fish. In an attempt to solve this problem, we scanned the genome of this species using the methodology BSA ("Bulk Segregant Analysis") associated with RAPD ("Random Amplified Polymorphic DNA") to sex-specific sequences prospect for the development of a molecular marker for sexing fish prepubescent. Samples were combined to form male and female sex-specific bulks and these were evaluated with 566 RAPD primers (Operon ®). 2609 fragments were amplified with an estimated coverage of one marker every 714Kb. The results suggest that pirarucu has a system for determining sex chromosome not or, alternatively, that it has suffered sudden loss of the sex chromosome. The arapaima has undergone a drastic population reduction and consequent reduction of genetic variability in some regions of the Amazon Basin. In order to determine the status of these populations and their variability, studies of population dynamics and genetic structure have been performed. In these studies, usually working with a small sample N and greater geographic coverage. However, based on data obtained in this study we observed that a larger sample of one region can provide similar results. The methodology is based on the sequencing and analysis of two regions of mtDNA, ATPase (n = 95) and cytochrome oxidase (n = 97) in individuals from four populations, geographically close, in the Santarém - PA. It was also concluded that when it comes to this kind of genetic variability found is low, however, among the studied populations is possible to find some differentiation. Moreover, according to the distribution networks of haplotypes observed, it is possible to suggest a recent population expansion of fish from the Santa Maria region. These results are consistent with the few studies reported in the literature on this species, showing that it is possible to increase the sample size N and reduce geographic representation, and thereby improve the performance of local management strategies from the results of phylogenetic studies for analysis of the structure population of the species.

Orientador: Fausto Foresti / Banca: Henrique Garcia Pereira / Banca: Vanessa Paes da Cruz / Resumo: A fauna de peixes de água doce no Brasil é particularmente diversa e muitas das espécies que a compõem não são encontradas naturalmente em outros locais. Tal diversidade contém um número elevado de estoques naturais nos cursos d'água, os quais vêm sofrendo sensível redução como resultado da exploração desordenada dos recursos, devido a captura de indivíduos jovens, pesca predatória, falta de fiscalização e medidas protecionista, poluição das águas, introdução de espécies exóticas e, principalmente, pela crescente fragmentação dos rios devido à construção de empreendimentos hidroelétricos, que modificam as áreas de desova coletiva e interrompem o trajeto migratório de algumas espécies. Atualmente constam na lista oficial de espécies ameaçadas de extinção (IN no 4/2005) 196 espécies de peixes, sendo que 141 são de água doce, entre as quais sete são consideradas sobreexplotadas. Dentre as espécies de peixes migradoras classificadas em perigo pela IUCN, o gênero Brycon é o mais representado no Livro Vermelho da Fauna Ameaçada de Extinção (MMA, 2008), com seis espécies ameaçadas, sendo que a piracanjuba Brycon orbignyanus consta entre elas. Brycon orbignyanus é um peixe reofílico, pois migra por longas distâncias para se reproduzir e, sendo assim, não se reproduz naturalmente em ambiente de cativeiro. Entre as ações de manejo que visam reduzir os impactos das ações antrópicas sobre os estoques de peixes, pode-se destacar a proibição da pesca durante o período de reprodução, controle da pesca, proibição do uso de determinados equipamentos de pesca, programas de repovoamento e a construção de mecanismos de transposição de peixes. Porém, muitas destas estratégias e ações para melhoria ou manutenção dos recursos naturais têm sido realizadas sem respaldo cientifico, com base simplesmente no senso comum. Este estudo tem como objetivo principal realizar a reprodução em ... / Abstract: The freshwater fauna of fish in Brazil is particularly diverse and a lot of these species that compose it are not naturally found elsewhere. Such diversity has a high number of stocks in natural watercourses, which have suffered significant reduction as a result of uncontrolled exploitation of resources, because the capture of juveniles, overfishing, lack of supervision and protectionist measures, water pollution, introduction of exotic species, and especially by the increasing fragmentation of rivers by the construction of hydroelectric projects, which modify the collective spawning areas and disrupt the migratory path of some species. Currently listed on the official list of endangered species (IN on 4/2005) 196 fish species, of which 141 from freshwater, among which seven are considered overfished. Among the migratory fish species classified as endangered by IUCN, the Brycon is the most represented in the Red Book of Endangered Fauna (MMA, 2008), with six endangered species, and piracanjuba Brycon orbignyanus is among them. Brycon orbignyanus is a reofílico fish because migrate long distances to breed and, therefore, does not reproduce naturally in captivity environment. Between management actions to reduce the impacts of human activities on fish stocks, can highlight a ban on fishing during the breeding period , control of fishing , prohibiting the use of certain fishing equipment , programs and build fishways fish . However, many of these strategies and actions for improvement or maintenance of natural resources has been made without scientific backing, simply based on common sense. This study aims to conduct captive breeding of B. orbignyanus different source locations, assisted by genetic analysis of mitochondrial DNA and also molecular microsatellite markers in order to produce genetically juvenile suitable for use in management programs . For genetic analysis, total DNA was obtained from samples of animal tissue collected from ... / Mestre

A maioria das espécies marinhas possui um ciclo de vida complexo em que a fase adulta é precedida por uma fase larval pelágica. Os adultos produzem larvas que são soltas na coluna d'água onde elas são influenciadas por processos hidrodinâmicos como advecção e difusão turbulenta. Para os organismos que na maturidade são fixos a um substrato, como as cracas em particular, estudos mostram que estes processos podem afetar diretamente o assentamento das larvas e a dinâmica das populações de adultos. Neste trabalho apresentamos um modelo em Elementos Finitos que permite estudar as interações entre os processos biológicos e oceanográficos na dinâmica de um organismo marinho (craca Balanus glandula) com uma fase adulta séssil restrita à linha costeira e uma fase larval planctônica. Alguns cenários são investigados no estudo da variação, ao longo do tempo e do espaço, do número de indivíduos e da distribuição desta população, com o objetivo de entender, explicar e predizer como os fatores abióticos e bióticos afetam tais variações. O modelo considerou a dinâmica da população estágio-estruturada tanto de uma única espécie quanto de duas espécies, diferentes padrões idealizados de correntes marinhas, qualidade do habitat, influência da temperatura e reconstrução do campo de velocidades a partir de dados locais. / Most marine benthic invertebrates have a complex life cycle in which the adult phase is preceded by a planktonic larval phase. The passive nature of larval dispersal of these species results in a larval transport governed by hydrodynamic processes like advection and eddy diffusion. The recruitment depends on a variety of physical and biological factors, which include spawning, larval dispersal and survival, larval settlement, metamorphosis, post-settlement events, inter-specific and intra-specific competitions. In order to assess interactions between oceanographic and biological processes that determine the population dynamics of marine organisms with a sessile adult phase restricted to the coastline and a planktonic larval phase, we develop a stage-structured finite element model for the barnacle Balanus glandula that inhabits the rocky intertidal zone of central California, USA. As the larval dispersal depends on knowing the flow pattern, we also develop a numerical procedure to couple physical and biological models in a very simple way when the velocity flow field is known of some discrete points of the domain of interest and at a given time. We investigate the effects of different flow patterns and velocity speeds on the abundance and the distribution of this organism as well as the influence of other abiotic interactions such as temperature and habitat quality. The interplay of different intra- and inter-specific competitions is also addressed.