Mémoire numérisé par la Direction des bibliothèques de l'Université de Montréal.

En dépit de nombreux essais thérapeutiques, les syndromes septiques sont la première cause de mortalité en service de soins intensifs. La population septique étant très hétérogène, une meilleure caractérisation des patients serait essentielle afin de mieux individualiser et cibler les thérapeutiques potentiellement bénéfiques. Une approche multiparamétrique de l'utilisation des biomarqueurs est une alternative qui viserait à appréhender la situation de manière plus globale. Notre travail s'inscrit dans ce contexte au travers de l'étude plus spécifique de la défaillance des systèmes cardio-vasculaire et immunitaire. Au-delà de la confirmation de l'intérêt des biomarqueurs présentement étudiés (prohormones cardio-vasculaires et PD-1) dans la prédiction de la mortalité et du risque d'infections nosocomiales, nos résultats apportent des éléments nouveaux. Nous avons montré que (1) la sur-expression des molécules PD-1 est associée à l'énergie leucocytaire, (2) un même biomarqueur peut apporter une information différente au cours du temps, (3) l'information apportée par l'analyse simultanée de deux biomarqueurs est supérieure à celle de la somme de leurs valeurs individuelles, et (4) l'expression dynamique d'un biomarqueur est meilleure que son expression à un temps donné. Au total, notre travail illustre l'intérêt potentiel d'un panel de biomarqueurs pour mieux appréhender la complexité des états septiques et leur rapide évolution. Il reste néanmoins à développer des outils biostatistiques capables de donner au clinicien une vision globale en temps réel des processus en cours. Cela constituera une étape clé pour mieux stratifier et cibler les prochains essais cliniques dans le domaine.

En dépit de nombreux essais thérapeutiques, les syndromes septiques sont la première cause de mortalité en service de soins intensifs. La population septique étant très hétérogène, une meilleure caractérisation des patients serait essentielle afin de mieux individualiser et cibler les thérapeutiques potentiellement bénéfiques. Une approche multiparamétrique de l’utilisation des biomarqueurs est une alternative qui viserait à appréhender la situation de manière plus globale. Notre travail s’inscrit dans ce contexte au travers de l’étude plus spécifique de la défaillance des systèmes cardio-vasculaire et immunitaire. Au-delà de la confirmation de l’intérêt des biomarqueurs présentement étudiés (prohormones cardio-vasculaires et PD-1) dans la prédiction de la mortalité et du risque d’infections nosocomiales, nos résultats apportent des éléments nouveaux. Nous avons montré que (1) la sur-expression des molécules PD-1 est associée à l’énergie leucocytaire, (2) un même biomarqueur peut apporter une information différente au cours du temps, (3) l’information apportée par l’analyse simultanée de deux biomarqueurs est supérieure à celle de la somme de leurs valeurs individuelles, et (4) l’expression dynamique d’un biomarqueur est meilleure que son expression à un temps donné. Au total, notre travail illustre l’intérêt potentiel d’un panel de biomarqueurs pour mieux appréhender la complexité des états septiques et leur rapide évolution. Il reste néanmoins à développer des outils biostatistiques capables de donner au clinicien une vision globale en temps réel des processus en cours. Cela constituera une étape clé pour mieux stratifier et cibler les prochains essais cliniques dans le domaine. / Septic syndromes remain the leading cause of death in the intensive care units despite numerous clinical trials. Septic patients constitute a very heterogeneous population. Therefore improved characterisation of patients in order to better target and personalize potential new therapeutics is highly desirable. A multiparametric biomarker-based approach could be an attractive alternative to obtain a global view of the pathophysiologic situation. In this context, we worked specifically on cardio-vascular and immune dysfunctions. We first confirmed the predictive value of biomarkers for mortality or nosocomial infections, and showed new elements. We observed that (1) PD-1 overexpression is associated with leukocyte anergy, (2) one biomarker could give different information over time, (3) information provided by the association of two biomarkers is more interesting than the addition of their individual values, and (4) dynamic expression of one biomarker is more informative than its expression at a given time point. Finally, our results illustrate the potential interest of biomarker panels to improve our understanding of the septic syndrome complexity and to reflect their rapid evolution. Consequently, next step will depend on our capacity to develop biostatistic tools that enable clinicians to get, in real time, a global view of the process over time. This key step is likely necessary to decrease the heterogeneity of septic patient population in order to better stratify and target next clinical trials in the field.

La découverte du système des peptides natriurétiques (NP), au début des années 80, fut une découverte majeure qui révéla le rôle endocrinien du cœur. Les connaissances sur la relaxation vasculaire, la diurèse et la natriurèse provoquées par ce système ont évolué vers un niveau de complexité insoupçonné à cette époque. Nous savons à présent que les NP sont impliqués dans plusieurs autres mécanismes dont la prolifération cellulaire, l’apoptose, l’inhibition du système rénine-angiotensine-aldostérone (RAAS) et le métabolisme des adipocytes. Le métabolisme des lipides est maintenant devenu une cible de choix dans la lutte contre l’obésité. Cette condition aux proportions pandémiques est un facteur de risque majeur dans l’apparition de l’hypertension et du syndrome métabolique (MetS). La compréhension des mécanismes et des défauts de la voie des NP pourrait avoir un impact positif sur le contrôle du MetS et de l’hypertension. L’expression du récepteur des peptides natriuretiques de type 1 (NPR1/GCA) est contrôlée par plusieurs agents incluant son propre ligand, le peptide natriurétique de l’oreillette (ANP). La découverte d’une boucle de retro-inhibition, dans les années 90, a été un événement majeur dans le domaine des NP. En effet, suite à une stimulation à l’ANP, le NPR1/GCA peut inhiber l’activité transcriptionnelle de son propre gène par un mécanisme dépendant du cGMP. Notre groupe a identifié un élément cis-régulateur responsable de cette sensibilité au cGMP et mon projet consistait à identifier la ou les protéine(s) liant cet élément de réponse au cGMP (cGMP-RE). Nous avons identifié un clone liant le cGMP-RE en utilisant la technique du simple hybride chez la levure et une banque d’ADN complémentaire (ADNc) de rein humain. Ce clone provient d’un ADNc de 1083-bp dont le gène est localisé sur le chromosome 1 humain (1p33.36) et codant pour une protéine dont la fonction était inconnue jusqu’ici. Nous avons nommé cette nouvelle protéine GREBP en raison de sa fonction de cGMP Response Element Binding Protein. Des essais de liaison à l’ADN ont montré que cette protéine possède une affinité 18 fois plus élevée pour le cGMP-RE que le contrôle, tandis que des expériences de retard sur gel (EMSA) ont confirmé la spécificité des interactions protéine-ADN. De plus, l’immuno-précipitation de la chromatine (ChIP) a prouvé que GREBP lie le cGMP-RE dans des conditions physiologiques. La liaison de GREBP au cGMP-RE inhibe l’expression du gène rapporteur luciférase sous contrôle du promoteur de npr1/gca. L’inhibition de GREBP à l’aide d’ARN interférant active le promoteur de npr1/gca. Dans les cellules NCI-H295R, l’ANP stimule l’expression de grebp de 60% après seulement 3 heures et inhibe l’expression de npr1/gca de 30%. GREBP est une protéine nucléaire surtout exprimée dans le cœur et ayant le facteur eIF3F comme partenaire. Les variations nucléotidiques du gène sont plus fréquentes chez les patients hypertendus que chez des patients normotendus ou hypertendus souffrant de MetS. Nous rapportons ici l’existence d’un gène spécifique à l’humain qui agit comme répresseur transcriptionnel de npr1/gca et potentiellement impliqué dans le développement de l’hypertension. / The natriuretic peptide (NP) system was a milestone discovery that revealed the endocrine role of the heart for the first time in the early 1980s. From its vasodilatory, natriuretic and diuretic actions, knowledge about this system has evolved to a degree of complexity unsuspected at that time. Now, through cGMP generation, NPs are involved in several other mechanisms, such as cell proliferation, apoptosis, renin-angiotensine-aldosterone system (RAAS) inhibition, and fat cell function. The latter point is of growing interest in lipid metabolism and has become an important issue in the fight against obesity. This pandemic condition is one of the main risk factors leading to hypertension development and metabolic syndrome (MetS) progression. Thus, understanding, at least in part, the lipid mobilization pathways controlled by NPs could have a positive impact in MetS management. As with hypertension, identifying defects in signaling pathways will certainly help to identify mechanisms implicated in lost sensitivity of the NP system. Natriuretic peptide receptor 1 (npr1/gca) expression is controlled by several agents including its own ligand, the atrial natriuretic peptide (ANP). A major finding in NPs field occured in the mid-90s when a mechanism involving a retro-inhibition loop was described. Indeed, after ANP stimulation, NPR1/GCA down-regulates the transcriptional activity of its gene via a cGMP-dependent mechanism. Since our group previously identified a cis-acting element responsible for this cGMP sensitivity, I proceeded to explore novel putative protein binding to the cGMP-response element (cGMP-RE). Using the yeast-one-hybrid technique with a human kidney cDNA library, we identified a strongly positive clone able to bind cGMP-RE. The clone was derived from a 1083-bp long cDNA of a gene of yet unknown function localized on human chromosome 1 (1p33.36). We named this new protein GREBP for cGMP-Response Element-Binding Protein. DNA-binding assays showed 18-fold higher cGMP-RE-binding capacity than the controls while electromobility shift assay (EMSA) indicated a specific binding for the cGMP-RE and chromatin immuno-precipitation (ChIP) confirmed the binding of GREBP to the element under physiological conditions. By acting on cGMP-RE, GREBP inhibited the activity of a luciferase-coupled NPR1 promoter construct. In H295R cells, ANP heightened GREBP expression by 60% after just 3 hours of treatment while inhibiting npr1/gca expression by 30%. Silencing GREBP with specific small interfering RNA increased the activity of the luciferase-coupled NPR1/GCA promoter and NPR1/GCA mRNA levels. GREBP is a nuclear protein mainly expressed in the heart and has the eIF3F factor as partner. Its nucleotide variations are more frequent in non-obese hypertensive patients than normotensive subjects or hypertensive patients suffering from MetS. We report here the existence of a human specific gene acting as a transcriptional repressor of npr1/gca gene that could be implicated in hypertension development.

La découverte du système des peptides natriurétiques (NP), au début des années 80, fut une découverte majeure qui révéla le rôle endocrinien du cœur. Les connaissances sur la relaxation vasculaire, la diurèse et la natriurèse provoquées par ce système ont évolué vers un niveau de complexité insoupçonné à cette époque. Nous savons à présent que les NP sont impliqués dans plusieurs autres mécanismes dont la prolifération cellulaire, l’apoptose, l’inhibition du système rénine-angiotensine-aldostérone (RAAS) et le métabolisme des adipocytes. Le métabolisme des lipides est maintenant devenu une cible de choix dans la lutte contre l’obésité. Cette condition aux proportions pandémiques est un facteur de risque majeur dans l’apparition de l’hypertension et du syndrome métabolique (MetS). La compréhension des mécanismes et des défauts de la voie des NP pourrait avoir un impact positif sur le contrôle du MetS et de l’hypertension. L’expression du récepteur des peptides natriuretiques de type 1 (NPR1/GCA) est contrôlée par plusieurs agents incluant son propre ligand, le peptide natriurétique de l’oreillette (ANP). La découverte d’une boucle de retro-inhibition, dans les années 90, a été un événement majeur dans le domaine des NP. En effet, suite à une stimulation à l’ANP, le NPR1/GCA peut inhiber l’activité transcriptionnelle de son propre gène par un mécanisme dépendant du cGMP. Notre groupe a identifié un élément cis-régulateur responsable de cette sensibilité au cGMP et mon projet consistait à identifier la ou les protéine(s) liant cet élément de réponse au cGMP (cGMP-RE). Nous avons identifié un clone liant le cGMP-RE en utilisant la technique du simple hybride chez la levure et une banque d’ADN complémentaire (ADNc) de rein humain. Ce clone provient d’un ADNc de 1083-bp dont le gène est localisé sur le chromosome 1 humain (1p33.36) et codant pour une protéine dont la fonction était inconnue jusqu’ici. Nous avons nommé cette nouvelle protéine GREBP en raison de sa fonction de cGMP Response Element Binding Protein. Des essais de liaison à l’ADN ont montré que cette protéine possède une affinité 18 fois plus élevée pour le cGMP-RE que le contrôle, tandis que des expériences de retard sur gel (EMSA) ont confirmé la spécificité des interactions protéine-ADN. De plus, l’immuno-précipitation de la chromatine (ChIP) a prouvé que GREBP lie le cGMP-RE dans des conditions physiologiques. La liaison de GREBP au cGMP-RE inhibe l’expression du gène rapporteur luciférase sous contrôle du promoteur de npr1/gca. L’inhibition de GREBP à l’aide d’ARN interférant active le promoteur de npr1/gca. Dans les cellules NCI-H295R, l’ANP stimule l’expression de grebp de 60% après seulement 3 heures et inhibe l’expression de npr1/gca de 30%. GREBP est une protéine nucléaire surtout exprimée dans le cœur et ayant le facteur eIF3F comme partenaire. Les variations nucléotidiques du gène sont plus fréquentes chez les patients hypertendus que chez des patients normotendus ou hypertendus souffrant de MetS. Nous rapportons ici l’existence d’un gène spécifique à l’humain qui agit comme répresseur transcriptionnel de npr1/gca et potentiellement impliqué dans le développement de l’hypertension. / The natriuretic peptide (NP) system was a milestone discovery that revealed the endocrine role of the heart for the first time in the early 1980s. From its vasodilatory, natriuretic and diuretic actions, knowledge about this system has evolved to a degree of complexity unsuspected at that time. Now, through cGMP generation, NPs are involved in several other mechanisms, such as cell proliferation, apoptosis, renin-angiotensine-aldosterone system (RAAS) inhibition, and fat cell function. The latter point is of growing interest in lipid metabolism and has become an important issue in the fight against obesity. This pandemic condition is one of the main risk factors leading to hypertension development and metabolic syndrome (MetS) progression. Thus, understanding, at least in part, the lipid mobilization pathways controlled by NPs could have a positive impact in MetS management. As with hypertension, identifying defects in signaling pathways will certainly help to identify mechanisms implicated in lost sensitivity of the NP system. Natriuretic peptide receptor 1 (npr1/gca) expression is controlled by several agents including its own ligand, the atrial natriuretic peptide (ANP). A major finding in NPs field occured in the mid-90s when a mechanism involving a retro-inhibition loop was described. Indeed, after ANP stimulation, NPR1/GCA down-regulates the transcriptional activity of its gene via a cGMP-dependent mechanism. Since our group previously identified a cis-acting element responsible for this cGMP sensitivity, I proceeded to explore novel putative protein binding to the cGMP-response element (cGMP-RE). Using the yeast-one-hybrid technique with a human kidney cDNA library, we identified a strongly positive clone able to bind cGMP-RE. The clone was derived from a 1083-bp long cDNA of a gene of yet unknown function localized on human chromosome 1 (1p33.36). We named this new protein GREBP for cGMP-Response Element-Binding Protein. DNA-binding assays showed 18-fold higher cGMP-RE-binding capacity than the controls while electromobility shift assay (EMSA) indicated a specific binding for the cGMP-RE and chromatin immuno-precipitation (ChIP) confirmed the binding of GREBP to the element under physiological conditions. By acting on cGMP-RE, GREBP inhibited the activity of a luciferase-coupled NPR1 promoter construct. In H295R cells, ANP heightened GREBP expression by 60% after just 3 hours of treatment while inhibiting npr1/gca expression by 30%. Silencing GREBP with specific small interfering RNA increased the activity of the luciferase-coupled NPR1/GCA promoter and NPR1/GCA mRNA levels. GREBP is a nuclear protein mainly expressed in the heart and has the eIF3F factor as partner. Its nucleotide variations are more frequent in non-obese hypertensive patients than normotensive subjects or hypertensive patients suffering from MetS. We report here the existence of a human specific gene acting as a transcriptional repressor of npr1/gca gene that could be implicated in hypertension development.