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Seleção de linhagens de feijoeiro resistentes à mancha-angular assistida por marcadores moleculares e identificação de novas fontes de resistência / Selection of common bean lines resistant to angular leaf spot assisted by molecular markers and identification of new resistance sources

Oliveira, Eder Jorge 08 July 2002 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-10T11:24:39Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1458718 bytes, checksum: 848cff4ffab0a6124463173e706a2f70 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T11:24:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1458718 bytes, checksum: 848cff4ffab0a6124463173e706a2f70 (MD5) Previous issue date: 2002-07-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A mancha-angular, causada pelo fungo Phaeoisariopsis griseola, é uma das principais doenças do feijoeiro, provocando perdas que podem chegar a 70% da produção no Brasil. Para o controle da doença, o uso de cultivares resistentes é uma medida eficiente, prática e econômica, no entanto, a alta variabilidade patogênica de P. griseola dificulta o trabalho dos melhoristas. Neste caso, a estratégia de piramidação de genes de resistência, pode ser utilizada, buscando-se uma resistência mais duradoura. Este trabalho teve como principais objetivos, a obtenção de linhagens de feijoeiro com grãos tipo carioca e resistentes à mancha- angular, além da caracterização de 58 cultivares de feijoeiro quanto a esta doença. Na geração RC 2 F 2 do cruzamento Rudá x México 54, procedeu-se a seleção de plantas resistentes por meio de inoculação com a raça 63.19 de P. griseola, bem como pelo uso do marcador SCAR OPN02 890 . Estas, geraram 15 famílias RC 2 F 2:3 com grãos tipo carioca, as quais foram avaliadas em teste de progênie, identificando-se duas famílias como homozigotas para o gene de resistência. A partir da análise das distâncias genéticas por marcadores RAPD, foram selecionadas quatro linhagens RC 2 F 3 com distâncias genéticas relativas em relação ao genitor Rudá variando de 8,38 a 11,26%. Para o cruzamento Rudá x MAR-2, utilizou-se a raça 63.39 de P. griseola e o marcador RAPD OPE04 500 na geração RC 1 F 2 , para seleção de plantas resistentes. Foram selecionadas dezenove famílias RC 1 F 2:3 com grãos tipo carioca, para o teste de progênie. Destas, foram selecionadas duas como resistentes homozigotas. Quatro linhagens RC 1 F 3 foram selecionadas com auxílio de marcadores RAPD, com distâncias genéticas relativas variando de 11,73 a 14,17% em relação à cultivar Rudá. Na geração RC 1 F 2 do cruzamento entre Rudá x BAT 332, plantas resistentes foram selecionadas, por meio do marcador RAPD OPAO12 950 . Selecionaram-se dezessete famílias RC 1 F 2:3 que possuíam grãos do tipo carioca para o teste de progênie. Por este teste, foram selecionadas 5 famílias como homozigotas resistentes. Seis linhagens RC 1 F 3 foram selecionados pela análise por RAPD, com distâncias genéticas relativas variando de 13,94 a 14,14% em relação ao Rudá. Na caracterização de 58 cultivares de feijoeiro quanto à reação às raças 63.19, 31.15, 63.55 e 63.23 de P. griseola, as cultivares Antioquia 8 e CAL 143, ambas de origem andina e Equador 299 e México 235, de origem mesoamericana, apresentaram resistência às quatro raças testadas. O uso de cultivares andinas e mesoamericanas em programas de melhoramento visando resistência à mancha- angular é importante, devido às evidências de coevolução patógeno-hospedeiro. Desta forma, Antioquia 8, CAL 143, Equador 299 e México 235 podem ser úteis em tais programas. Todos as outras cultivares possuem algum nível de suscetibilidade às quatro raças de P. griseola estudadas. Os mais suscetíveis foram: AB 7419, AN 9022180, Aporé, Bambuí, Carioca 80, CNC, CNF 9287, Diamante Negro, Earlly Gallatin, Jamapa e KW 780. / Angular leaf spot caused by the fungus Phaeoisariopsis griseola is a major common bean disease, and may cause yield losses up to 70% in Brazil. An effective, practical and economic way to control the angular leaf spot is to use resistant cultivars, however, high P. griseola pathogenic variability makes the development of such resistant cultivars a difficult task. In this case, pyramiding of resistance genes may be used if a longer lasting resistance is to sought. This work aimed at obtaining common bean lines with “carioca” grain type and resistant to the angular leaf spot, as well as the characterization of 58 common bean cultivars to this disease. In generation BC 2 F 2 of Ruda x Mexico 54 cross the selection of resistant plants was proceeded by inoculation of race 63.19 of P. griseola, as well as by the use of the SCAR OPN02 890 marker. Those plants bred 15 BC 2 F 2:3 families with “carioca” grain type, which were used in the progeny test, and two families were identified as resistant and homozygous. From the analyses of genetic distances by RAPD markers, four BC 2 F 3 plants were selected with relative genetic distances to the recurrent parent Ruda ranging from 8.38 to 11.26%. In the Ruda x MAR-2 cross, race 63.39 of P. griseola and the RAPD OPE04 500 were used in generation BC 1 F 2 to select resistant plants. Nineteen BC 1 F 2 plants were selected for progeny test which bred BC 1 F 2:3 families with “carioca” grain type, From those 19 families, 2 were selected as homozygous resistant. Through the analysis of BC 1 F 3 plants by RAPD markers, four were selected with relative genetic distances to Ruda ranging from 11.73 to 14.17%. In generation BC 1 F 2 of Ruda x BAT 332 cross, resistant plants were selected using the RAPD OPAO12 950 marker. Those plants bred 17 BC 1 F 2:3 families with “carioca” grain type, which were used in the progeny test, and 5 families were identified as resistant homozygous. Six BC 1 F 3 individuals were selected through the RAPD analysis, with relative genetic distances, ranging from 13.94 to 14.14% to Ruda. In the characterization of 58 common bean cultivars, for their reaction to the races 63.19, 31.15, 63.55 and 63.23 of P. griseola, the cultivars Antioquia 8 and CAL143, both of Andean, and Equador 299 and México 235, of Mesoamerican common bean groups, showed resistance to the four tested races. The use of Andean and Mesoamerican common beans in breeding programs aiming angular leaf spot resistance is an important strategy due to the evidences of pathogen-host coevolution. Thus, Antioquia 8, CAL 143, Equador 299 and México 235 may be good choices in such programs. All the other cultivars were susceptible to at least one of the four races tested. Amongst the most susceptible ones were: AB 7419, AN 9022180, Aporé, Bambuí, Carioca 80, CNC, CNF 9287, Diamante Negro, Earlly Gallatin, Jamapa and KW 780. / Dissertação importada do Alexandria
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Controle da mancha angular e análise bioquímica de resistência em feijoeiro tratado com extratos de Pycnoporus sanguineus / Control of angular leaf spot and biochemical characterization of resistence in bean plant treated with Pycnoporus sanguineus extracts

Viecelli, Clair Aparecida 31 January 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2017-07-10T17:37:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Clair Aparecida Viecelli.pdf: 557659 bytes, checksum: 04dd69a9f737d5b596647fd8663a566f (MD5) Previous issue date: 2008-01-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The alternative control of plants disease aims to minimize ambient impacts by the use of natural products. With the possibility of using Pycnoporus sanguineus extracts for the control of pathogenic fungus, this work was conduced to verify the antimicrobial activity in vitro against Pseudocercospora griseola and the induction of enzyme defense in bean plant as peroxidase, polyphenol oxidase and β-1,3-glucanase and activation of physiological mechanisms related to the energy supply, as proteins and chlorophyll. The experiments in vitro and in greenhouse had been constituted by extracts from basidiocarps, mycelium and liquid medium culture filtrate of P. sanguineus. Water, acibenzolar-S-methyl (ASM: 75 mg i.a. L-1) and fungicide (azoxystrobin: 40 mg i.a. L-1) were the control treatments. In vitro, the extract of mycelium at 5%, sterilized by filtration, significantly inhibited the mycelial growth, sporulation and conidia germination of P. griseola, what did not occur in the extract sterilized in autoclave, indicating the presence of thermo-sensible compounds. In greenhouse, bean plants had been treated three days before the inoculation with the pathogen and were evaluated the severity and the activity of plant defense enzymes peroxidase, β-1,3-glucanase and polyphenol oxidase in 3rd leaves treated as well as in 4th leaves not treated, to verify the occurrence of local or systemic resistance induction, respectively. Severity was reduced in 82.4% and 77% in 3rd leaves and in 71.6% and 69.4% in 4th leaves to P. sanguineus extracts at concentrations of 10% and 20%, respectively. In the field, severity was reduced in 19.2% and 63.8% in 1st and 2nd application, respectively, in relation to the control water. The activities of peroxidase, polyphenol oxidase, proteins and chlorophylls had an increment in plants treated with extracts. These results indicate the potential of P. sanguineus for alternative control of the angular leaf spot in bean plants / O controle alternativo de doenças de plantas visa minimizar impactos ambientais por meio da utilização de produtos naturais. Com a possibilidade de utilizar extratos de Pycnoporus sanguineus no controle de fitopatógenos, realizou-se esse trabalho com o objetivo de verificar a atividade antimicrobiana in vitro contra Pseudocercospora griseola e a indução de enzimas de defesa em feijoeiro como peroxidase, polifenoloxidase e β-1,3-glucanase e ativação de mecanismos fisiológicos relacionados ao fornecimento de energia, como proteínas e clorofilas. Os experimentos in vitro e em casa de vegetação foram constituídos pelos extratos do basidiocarpo, micélio e filtrado de cultura de P. sanguineus, além dos controles água, acibenzolar-S-metil (ASM: 75 mg i.a. L-1) e fungicida (azoxystrobin: 40 mg i.a. L-1). In vitro o extrato de micélio esterilizado por filtração inibiu significativamente o crescimento micelial, a esporulação e a germinação de esporos de P. griseola a partir da concentração 5%, o que não ocorreu no extrato esterilizado em autoclave, indicando a presença de compostos termolabeis. Em casa de vegetação, plantas de feijão foram tratadas três dias antes da inoculação do patógeno, avaliando-se a severidade e a atividade de enzimas envolvidas no processo de defesa, na 3º folha tratada bem como na 4º folha não tratada, para verificar a ocorrência da resistência local e/ou sistêmica respectivamente. A severidade em casa de vegetação foi reduzida na 3ª folha em 82,4 e 77% e na 4ª folha em 71,6 e 69,4% com os extratos de P. sanguineus em concentrações de 10% e 20%, respectivamente. A campo, reduções de até 19,2% e 63,8% na 1ª e 2ª aplicação, respectivamente, foram observadas, em relação ao controle água. A atividade das enzimas peroxidase e polifenoloxidase, o teor de proteínas e clorofilas foram maiores nas plantas tratadas com os extratos de P. sanguineus. Estes resultados indicam a eficiência de P. sanguineus para o controle alternativo da mancha angular do feijoeiro
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Melhoramento genético do feijoeiro com ênfase na piramidação de genes de resistência à mancha-angular / Genetic breeding of the common bean with emphasis in the pyramiding of resistance genes to the angular leaf spot

Sanglard, Demerson Arruda 02 October 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 845160 bytes, checksum: ab158123059f0363225a41a6992848eb (MD5) Previous issue date: 2006-10-02 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / "Pyramiding is a strategy for the achievement of cultivars resistant to a larger number of pathotypes for a longer period of time and its objective is to incorporate in one single cultivar the largest possible number of resistance genes. In order to transfer rust resistance genes (Ur-ON), anthracnose (Co-10), and angular leaf spot (Phg-ON), from the cultivar Ouro Negro to the cultivar Pérola, and the angular leaf spot resistance gene (Phg-3) from the cultivar Cornell 49-242 to the cultivar Rudá, two backcrossing subprograms were conducted. To achieve this goal, inoculations with the pathogens which incite the diseases, analyses of molecular fingerprinting, molecular markers linked to the resistant genes and progeny tests were used. By means of the backcrossing method, four families were achieved BC3F5 (Pérola x Ouro Negro) homozygotes for the three diseases, which have simultaneously the bands with specific sizes linked to the resitance loci: OPX11550a, OPAJ18560a, SCAR F101050a and SCAR BA08560a (Ur-ON and Co-10); SCAR BA16669a and SCAR AA19650a (Phg-ON). It was also possible to achieve the plants BC2F1 (Rudá x Cornell 49-242) resistant to the angular leaf spot and bearing the molecular mark produced by the amplification of SCAR N02890a linked to the gene Phg-3. Those plants were crossed with a line called Rudá R , which already has five resistant genes pyramided, one for the rust (Ur-ON), other for the angular leaf spot (Phg-1) and three others for the anthracnose (Co-4, Co-10 e Co-6). According to studies on allelism previously carried out and the available lines, the possible and best combinations were stablished aiming the pyramiding of resistance genes to the angular leaf spot. In a first phase, the crossings were carried out in a directed form in two schemes separatedly conducted: lines MAR-138A-1-11-4 x BAT-67-15-8 and MEX-37-3-6-3 x Rudá R . Considering the first crossing scheme, it was used the pathotype 63.19 of Phaeoisariopsis griseola for verifying the hybrid nature of the plants F1. The resistant plants had their DNA extracted and amplified with the molecular markers OPE04500a and OPAO12950a. The resistant plants F1 which presented molecular marks were intercrossed with the line Rudá R . This way, plants F1 (triple hybrid) were achieved, which were inoculated with the pathotype 65 of Colletotrichum lindemuthianum and monitored with the molecular markers: SCAR F101050a (Ur-ON and Co-10), SCAR BA8560a (Ur-ON and Co-10), SCAR AZ20845a (Co-4), SCAR Y20830a (Co-6), SCAR H13520a (Phg-1), OPE04500a (Phg-4 e/ou Phg-52) and OPAO12950a (Phg-62). The generation F2 segregated for all these loci, but plants bearing all the marks were found. In the second crossing scheme, plants F1 MEX-37-3-6-3 x Rudá R were improved by means of autofecundation up to the generation F3. In this case, the resistant genes were also monitored through the inoculation with the pathotype 65 of C. lindemuthianum and the use of molecular markers: SCAR F101050a (Ur-ON and Co-10), SCAR BA8560a (Ur-ON and Co-10), SCAR AZ20845a (Co-4), SCAR Y20830a (Co-6), SCAR H13520a (Phg-1) and OPE04650a (Phg-2 e/ou Phg-5 e/ou Phg-6). The material to be achieved in the end of the improvement process initiated in this work, after being tested as to resistance and agronomic performance, will be able to be launched as a new cultivar and be used as a bank of resistance genes for more modern cultivars. / Uma estratégia para obtenção de cultivares com resistência a um maior número de patótipos e por um maior período de tempo é a piramidação , onde o objetivo é incorporar em um único cultivar o maior número possível de genes de resistência. Com o intuito de transferir genes de resistência à ferrugem (Ur-ON), antracnose (Co-10), e mancha-angular (Phg-ON), do cultivar Ouro Negro para o cultivar Pérola, e o gene de resistência à mancha-angular (Phg-3) do cultivar Cornell 49-242 para o cultivar Rudá, foram conduzidos dois subprogramas de retrocruzamentos. Para alcançar este objetivo, foram utilizadas inoculações com os patógenos incitadores das doenças, análises de fingerprinting molecular, marcadores moleculares ligados aos genes de resistência e testes de progênie. Por meio do método de retrocruzamentos, foram obtidas quatro famílias RC3F5 (Pérola x Ouro Negro) homozigotas para as três doenças e possuindo simultaneamente as bandas de tamanhos específicos ligadas aos locos de resistência: OPX11550a, OPAJ18560a, SCAR F101050a e SCAR BA08560a (Ur-ON e Co-10); SCAR BA16669a e SCAR AA19650a (Phg-ON). Também foram obtidas plantas RC2F1 (Rudá x Cornell 49-242) resistentes à mancha-angular e possuindo a marca molecular produzida pela amplificação de SCAR N02890a ligado ao gene Phg-3. Essas plantas foram cruzadas com uma isolinha denominada Rudá R , a qual já possui piramidados cinco genes de resistência, sendo um para a ferrugem (Ur-ON), um para a mancha-angular (Phg-1) e outros três para antracnose (Co-4, Co-10 e Co-6). De acordo com estudos de alelismo realizados anteriormente e as isolinhas disponíveis, foram estabelecidas as possíveis e melhores combinações visando a piramidação de genes de resistência à manchaangular. Em uma primeira etapa, os cruzamentos foram realizados de forma direcionada em dois esquemas conduzidos separadamente: isolinhas MAR- 138A-1-11-4 x BAT-67-15-8 e MEX-37-3-6-3 x Ruda R . Considerando o primeiro esquema de cruzamento, foi utilizado o patótipo 63.19 de Phaeoisariopsis griseola na verificação da natureza híbrida das plantas F1. As plantas resistentes tiveram seu DNA extraído e amplificado com os marcadores moleculares OPE04500a e OPAO12950a. Essas plantas F1 resistentes e que apresentaram marcas moleculares foram intercruzadas com a isolinha Rudá R . Deste modo, obtiveram-se plantas F1 (híbrido triplo), as quais foram inoculadas com o patótipo 65 de Colletotrichum lindemuthianum e monitoradas com os marcadores moleculares: SCAR F101050a (Ur-ON e Co-10), SCAR BA8560a (Ur-ON e Co-10), SCAR AZ20845a (Co-4), SCAR Y20830a (Co-6), SCAR H13520a (Phg-1), OPE04500a (Phg-4 e/ou Phg-52) e OPAO12950a (Phg-62). A geração F2 segregou para todos estes locos, porém, foram encontradas plantas contendo todas as marcas. No segundo esquema de cruzamento, plantas F1 MEX-37-3-6-3 x Ruda R foram avançadas por meio de autofecundações até a geração F3. Neste caso, também foram monitorados os genes de resistência por meio de inoculação com o patótipo 65 de C. lindemuthianum e uso dos marcadores moleculares: SCAR F101050a (Ur-ON e Co-10), SCAR BA8560a (Ur-ON e Co-10), SCAR AZ20845a (Co-4), SCAR Y20830a (Co-6), SCAR H13520a (Phg-1) e OPE04650a (Phg-2 e/ou Phg-5 e/ou Phg-6). O material a ser obtido ao final do processo de melhoramento iniciado neste trabalho, após ser testado quanto à resistência e ao desempenho agronômico, poderá também ser lançado como novo cultivar e servir como banco de genes de resistência para cultivares mais modernos.
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Incidência e transmissão de dsRNA em Pseudocercospora griseola, agente causal da mancha-angular do feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris) / Incidence and transmission of dsRNA in Phaeoisariopsis griseola, the agent causing the angular leaf spot in the common bean (Phaseolus vulgaris)

Lima, Swiany Silveira 29 July 2008 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:51:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 01 - capa_abstract.pdf: 74907 bytes, checksum: 25176f30d42e87ea51768c28726ca1bd (MD5) Previous issue date: 2008-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The common bean Phaseolus vulgaris shows great importance under feeding and economical aspects for the Brazilian people. However, its productivity has been low due to the occurrence of diseases and other factors. The angular leaf spot is distinguished among those diseases. Its causal agent is the Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun. Some mycovirus or virus-like particles were already described in several phytopathogenic fungus. Those viruses are unable to penetrating and lysing the host cells, and the intracytoplasmic transmission is accomplished by anastomosis among hyphae and the sporogenesis. Most mycovirus are found as multiple dsRNA fragments. In general, the mycovirus are cryptic (latent) concerning to the effects caused into phenotype of the host fungus, but they can affect the biology of their host by provoking morphological changes, hyper or hypovirulence. Because they are associated to the hypovirulence phenomenon, the mycoviruses show a potential use in the biocontroll of the phytopathogenic fungus. The general objective of this work was to characterize the mycovirus in the isolates of P. griseola, since they were recently detected in this fungus species for the first time. To reach this objective, the following were performed: the characterization of the dsRNA in different isolates; the vertical transmission analysis; and the obtainment of isogenic lines by the virus cure. The dsRNAs were detected in 31 from those 49 isolates of P. griseola under analysis. In the present study, most isolates showed multiple dsRNA fragments varying from zero to 10, as being the sizes estimated between 0.8 and 4.8 kb. The dsRNA fragment of 4.8 kb from the isolate was efficiently transmitted to the asexual spores. However, not all dsRNA fragments (between 1 and 6) found in the isolate Ig848 were transmitted to monosporic colonies. The cycloheximide was used at concentration of 20 µg/mL in order to obtain the mycovirus cure. This treatment was ineffective for the isolate 29-3, since those three colonies transplanted to cyclohexymide during four generations showed the same profile as the total nucleic acids found in the wild isolate. In the case of the isolate Ig848, this same chemical treatment eliminated the fragments 2.2; 2.0; 1.8; 1.2 and 1.0 kb of the colonies Ch2 and Ch4 after seven successive transplantings in medium containing cycloheximide. Several phytopathogenic fungus are attacked by viral infections, and this variation in the profile of the nucleic acid found in the P. griseola isolates is also observed in other plant pathogens. The presence of multiple fragments in only one isolate may be due to the infection by virus with segmented genome, RNA satellite, defective RNA or mixed infections. The efficiency of the transmission by conidia is variable, as depending on the fungus species under consideration, but it is usually near 100% as occurred for the isolate 29-3 of P. griseola. Either cure of some dsRNA fragments and the spontaneous loss during conidiogenesis observed for the isolate Ig848 rather indicate the infection by independent replicons. In those isogenic lines with and without some dsRNA fragments, the effect of the viral infection will be evaluated under some aspects such as the sporulation rate, growth and pathogenicity. The characterization of those viruses found in P. griseola will allow for further studies concerning to their use in the biological control of the angular leaf spot, which will turn possible to reduce the economical losses caused by this disease in agriculture. / O feijoeiro comum Phaseolus vulgaris apresenta grande importância alimentar e econômica para o brasileiro. No entanto, sua produtividade é baixa devido, em parte, à ocorrência de doenças. Entre essas doenças, destaca-se a mancha-angular, cujo agente causal é o fungo Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun. Micovírus ou partículas semelhantes a vírus já foram descritas em diversos fungos fitopatogênicos. Esses vírus são incapazes de penetrar e lisar as células hospedeiras, sendo a transmissão intracitoplasmática por meio da anastomose entre hifas e da esporogênese. A maior parte dos micovírus é encontrada como múltiplos fragmentos de dsRNA. Em geral, os micovírus são crípticos (latentes) em relação aos efeitos provocados no fenótipo do fungo hospedeiro, mas podem influenciar a biologia de seu hospedeiro, provocando alterações morfológicas, hiper ou hipovirulência. Por estarem associados ao fenômeno de hipovirulência, os micovírus apresentam uso potencial no biocontrole de fungos fitopatogênicos. O objetivo geral deste trabalho foi caracterizar micovírus presentes em isolados de P. griseola, uma vez que recentemente estes foram detectados, pela primeira vez, nesta espécie de fungo. Para atingir este objetivo, foi realizada a caracterização de dsRNAs presentes em diferentes isolados, a análise da transmissão vertical e a obtenção de linhagens isogênicas por meio da cura de vírus. dsRNAs foram detectados em 31 dos 49 isolados de P. griseola analisados. Neste trabalho, a maioria dos isolados apresentou múltiplos fragmentos de dsRNA, que variaram de zero a 10, com tamanhos estimados entre 0,8 e 4,8 kb. O fragmento de dsRNA de 4,8 kb do isolado 29-3 foi eficientemente transmitido para os esporos assexuais. Entretanto, nem todos os fragmentos de dsRNA, entre um e seis, presentes no isolado Ig848 foram transmitidos para colônias monospóricas. Cicloheximida foi utilizada em concentração de 20 μg/mL a fim de obter a cura de micovírus. Para o isolado 29-3, este tratamento foi ineficaz, pois as três colônias repicadas em cicloheximida durante quatro gerações apresentaram o mesmo perfil de ácidos nucléicos totais presente no isolado selvagem. No caso do isolado Ig848, este mesmo tratamento eliminou os fragmentos de 2,2; 2,0; 1,8; 1,2 e 1,0 kb das colônias Ch2 e Ch4, após sete repicagens sucessivas em meio contendo cicloheximida. Diversos fungos fitopatogênicos são acometidos por infecções virais, sendo que essa variação no perfil de ácidos nucléicos presente nos isolados de P. griseola também é observada em outros patógenos de plantas. A presença de múltiplos fragmentos, em um único isolado, pode ser devido à infecção por vírus com genoma segmentado, RNA satélite, RNA defectivo ou infecções mistas. A eficiência de transmissão por meio dos conídios é variável, dependendo da espécie de fungo considerada, mas geralmente é próxima a 100%, conforme ocorreu para o isolado 29-3 de P. griseola. Tanto a cura de alguns fragmentos de dsRNA quanto a perda espontânea durante a conidiogênese, observada para o isolado Ig848, indicam a infecção por replicons independentes. Estas linhagens isogênicas, com e sem alguns fragmentos de dsRNA, terão o efeito da infecção viral avaliados em aspectos como a taxa de esporulação, o crescimento e a patogenicidade. A caracterização destes vírus, presentes em P. griseola, permitirá estudos posteriores sobre o uso destes no controle biológico da mancha-angular, o que poderá reduzir as perdas econômicas causadas por essa doença na lavoura.
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Interação genótipos por épocas de semeadura de feijoeiro comum em relação a doenças foliares em cerrados de baixa altitude /

Rossetto, João Édino. January 2018 (has links)
Orientador: Bruno Ettore Pavan / Resumo: O Feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma das principais fontes alimentares no Brasil, agregado tanto por valores culturais como nutricionais. Seu cultivo pode ser encontrado pequenos e grandes produtores, e em diferentes níveis tecnológicos, e se estende por todo o território Nacional. O potencial produtivo do feijoeiro está em muito ligada a sanidade de plantas, tendo os patógenos como os principais responsáveis pelas quedas em produção. O trabalho objetivou verificar a interação genótipo x ambiente, procedendo com a estratificação ambiental de épocas de semeadura afim de recomendar a melhor época que possibilite a discriminação entre os genótipos e a seleção dos genótipos mais adaptados e estáveis em relação ao ataque de Mancha Angular e Crestamento Bacteriano Comum em cerrado de baixa altitude. Os experimentos foram conduzidos no período de: Junho, Agosto, Outubro e Dezembro de 2015 e Março e Abril de 2016, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (FEIS), situada no município de Selvíria-MS. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, onde foram usados 20 genótipos, sendo 5 deles comerciais, IAC – Una, IAC – Imperador, IAC – Formoso, IAC – Milênio, IAC – Alvorada; e 15 provenientes do programa de melhoramento da FEIS. Para a fonte de variação “ambiente” foram utilizadas as seis épocas de semeadura. Os caracteres avaliados foram: incidência de Crestamento Bacteriano Comum e Mancha Angular. Os parâmetros ge... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) is one of the main food sources in Brazil, aggregated both by cultural and nutritional values. Its cultivation can be found both small and large producers, and at different technological levels, and extends throughout the national territory. The productive potential of the bean plant is closely related to plant health, with pathogens being the main cause of falls in production. The objective of this work was to verify the genotype x environment interaction, proceeding with the environmental stratification of sowing times in order to recommend the best season that allows discrimination between the genotypes and the selection of the most adapted and stable genotypes in relation to the attack of angular spot and blight bacterial in cerrado of low altitude. The experiments were conducted in the period of: June, August, October and December of 2015 and March and April of 2016, in the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (FEIS), located in the municipality of Selvíria-MS . The experimental design was randomized blocks, where 20 genotypes were used, 5 of them commercial, IAC - Una, IAC - Imperador, IAC - Formoso, IAC - Milênio, IAC - Alvorada; and 15 from the FEIS breeding program. For the "environment" variation source, the six sowing times were used. The evaluated characters were: incidence of Bacterial and Angular Spotting. The genetic parameters and variance components were obtained by the REML / B... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Seleção, caracterização e comportamento de isolinhas de feijoeiro-comum resistentes à ferrugem, antracnose e mancha-angular / Selection, characterization and behavior of common bean isolines resistant to rust, anthracnose, and angular leaf spot

Ragagnin, Vilmar Antonio 25 January 2001 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-05T20:01:47Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T20:01:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 613081 bytes, checksum: 51a4d7528d9d2e7c73d3049bdf77a998 (MD5) Previous issue date: 2001-01-25 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Isolinhas de feijoeiro-comum obtidas por cruzamentos em que o cultivar Rudá foi o genitor recorrente foram inoculadas com diferentes patótipos de ferrugem, antracnose e mancha-angular, analisadas com marcadores moleculares de DNA e avaliadas por meio de características quantitativas. As inoculações feitas em isolinhas RC n F 2:3 indicaram que as proporções entre as famílias heterozigotas e homozigotas para a resistência foram 2:1 em todos os cruzamentos. Para resistência à ferrugem e antracnose simultaneamente, foram selecionadas 13 isolinhas do retrocruzamento Rudá x Ouro Negro. Para resistência à antracnose, foram selecionadas, ainda, outras 16 isolinhas, sendo 10 isolinhas provenientes do retrocruzamento Rudá x TO e seis do retrocruzamento Rudá x AB 136. Cinco isolinhas homozigotas do retrocruzamento Rudá x AND 277 foram selecionadas para resistência à mancha-angular. De todas as isolinhas homozigotas, foram selecionadas aquelas geneticamente mais próximas do genitor recorrente, pela utilização de marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Essas isolinhas foram utilizadas para avaliar a reação de resistência a ferrugem, antracnose e mancha-angular causadas pelos patótipos Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum e Phaeoisariopsis griseola , respectivamente. A s isolinhas ON-25-99 e ON-48-99 se comportavam como resistentes a todos os patótipos de ferrugem inoculados. As isolinhas TO-41-5-6-24 e AB-74-1-13 foram resistentes a todos os patótipos de antracnose testados. A isolinha AN-7-2-9-4-6 foi resistente aos seis isolados de mancha-angular testados. As isolinhas mais próximas geneticamente do recorrente foram caracterizadas com marcadores moleculares fortemente ligados aos genes de resistência dos genitores doadores. Treze marcadores foram testados, e oito deles (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 e Satt174) podem ser potencialmente utilizados para dar continuidade ao processo de piramidização dos genes de resistência no cultivar Rudá. Os outros cinco marcadores sofreram recombinação no processo de retrocruzamento. As isolinhas foram, ainda, testadas para características quantitativas, em que foram estimados diferentes parâmetros genéticos, correlações fenotípicas, genotípicas e ambientais e efeitos diretos e indiretos de cada característica sobre a produção, mediante o uso da análise de trilha conduzido em dois ambientes diferentes. Os caracteres “número de vagens por planta” e “número de sementes por vagem” apresentaram maiores correlações genotípicas com a produção por planta. A média das características e a precisão experimental foram semelhantes nos dois ensaios. Os resultados encontrados neste trabalho são importantes para dar continuidade ao processo de piramidização de genes visando à resistência a ferrugem, antracnose e mancha- angular no cultivar Rudá atualmente sendo conduzido pelo BIOAGRO/UFV. / Common bean isolines obtained from crosses in which cultivar Rudá was the recurrent parent were inoculated with different rust, anthracnose, and angular leaf spot pathotypes, and also characterized with DNA molecular markers and evaluated for quantitative traits. The inoculations done in BC n F 2:3 isolines showed that the proportion between heterozygous and homozygous resistant plants was 2:1 for all crosses. Thirteen homozygous isolines resistant to rust and anthracnose simultaneously were selected from the cross Rudá x Ouro Negro. Sixteen isolines resistant to anthracnose were selected, 10 from the cross Rudá x TO, and six isolines from the cross Rudá x AB 136. Six homozygous isolines resistant to angular leaf spot were selected from the cross Rudá x AND 277. The isolines genetically closer to the recurrent parent were identified with the use of the random amplified DNA (RAPD) technique. These lines were tested against different pathotypes of the causing agents of rust, anthracnose and angular leaf spot, Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum and Phaeoisariopsis griseola , respectively. Isolines ON-25-99 and ON-48-99 were resistant to all rust pathotypes tested. Isolines TO-41-5-6-24 and AB-74-1-13 were resistant to all anthracnose pathotypes tested. Isoline AN-7-2-9-4-6 was resistant to six angular spot pathotypes tested. The isolines which were genetically closer to the recurrent parent were characterized with molecular markers previously shown to be tightly linked to disease resistance genes in the donor parents. Thirteen markers were tested and eight of them (OPAZ20 940 , OPB03 1800 , OPH13 490 , ScarBA08 560 , ScarF10 1050 , OPX11 630 , OPY20 830 and Satt174) proved to be potentially useful in a breeding program to pyramid the resistance genes in the same cultivar. The other five markers separated from the resistance loci due to recombinations during the backcrossing process. The isolines were also tested for quantitative traits and different genetic parameters, phenotypic, genotypic and environmental correlations, and the direct effect of each characteristic on productivity by using path analysis in two different environments. The characters ‘number of pods per plant’ and ‘number of seeds per pod’ presented the highest correlations with productivity per plant. The mean values for the traits and the experimental precision were similar for both assays. Our results will be important to continue the pyramidation process of resistance genes for rust, anthracnose, and angular leaf spot in the cultivar Rudá presently being conducted at BIOAGRO/UFV.
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Interação genótipos por épocas de semeadura de feijoeiro comum em relação a doenças foliares em cerrados de baixa altitude / Interaction of genotypes by season times of common bean in relation to foliary diseases in closures of low altitude

Rossetto, João Édino 22 February 2018 (has links)
Submitted by João Édino Rossetto null (jerossetto@terra.com.br) on 2018-04-20T13:56:04Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_JoaoEdinoRossetto.pdf: 1124751 bytes, checksum: 62ba748ae485faac54f96efa6f360817 (MD5) / Approved for entry into archive by Cristina Alexandra de Godoy null (cristina@adm.feis.unesp.br) on 2018-04-20T14:15:24Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rossetto_je_me_ilha.pdf: 1124751 bytes, checksum: 62ba748ae485faac54f96efa6f360817 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-20T14:15:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rossetto_je_me_ilha.pdf: 1124751 bytes, checksum: 62ba748ae485faac54f96efa6f360817 (MD5) Previous issue date: 2018-02-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O Feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é uma das principais fontes alimentares no Brasil, agregado tanto por valores culturais como nutricionais. Seu cultivo pode ser encontrado pequenos e grandes produtores, e em diferentes níveis tecnológicos, e se estende por todo o território Nacional. O potencial produtivo do feijoeiro está em muito ligada a sanidade de plantas, tendo os patógenos como os principais responsáveis pelas quedas em produção. O trabalho objetivou verificar a interação genótipo x ambiente, procedendo com a estratificação ambiental de épocas de semeadura afim de recomendar a melhor época que possibilite a discriminação entre os genótipos e a seleção dos genótipos mais adaptados e estáveis em relação ao ataque de Mancha Angular e Crestamento Bacteriano Comum em cerrado de baixa altitude. Os experimentos foram conduzidos no período de: Junho, Agosto, Outubro e Dezembro de 2015 e Março e Abril de 2016, na Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (FEIS), situada no município de Selvíria-MS. O delineamento experimental adotado foi em blocos casualizados, onde foram usados 20 genótipos, sendo 5 deles comerciais, IAC – Una, IAC – Imperador, IAC – Formoso, IAC – Milênio, IAC – Alvorada; e 15 provenientes do programa de melhoramento da FEIS. Para a fonte de variação “ambiente” foram utilizadas as seis épocas de semeadura. Os caracteres avaliados foram: incidência de Crestamento Bacteriano Comum e Mancha Angular. Os parâmetros genéticos e componentes de variância foram obtidos pelo procedimento REML/BLUP. As metodologias MHPRVG (Média Harmônica da Performance Relativa dos Valores Genéticos), AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) e Dendograma baseado na distância de Mahalanobis foram utilizadas para estudo estratificação ambiental, estabilidade e adaptabilidade. Os resultados apontaram que houve interação entre genótipos e ambientes, gerando ambientes favoráveis e não favoráveis a incidência de Mancha Angular e Crestamento Bacteriano Comum. Foi possível detectar os ambientes (épocas) que proporcionaram boa discriminação dos genótipos (A1, junho de 2015 e A6, abril de 2016) e os melhores genótipos para estabilidade e tolerância simultânea (G11 e G5). / Common Bean (Phaseolus vulgaris L.) is one of the main food sources in Brazil, aggregated both by cultural and nutritional values. Its cultivation can be found both small and large producers, and at different technological levels, and extends throughout the national territory. The productive potential of the bean plant is closely related to plant health, with pathogens being the main cause of falls in production. The objective of this work was to verify the genotype x environment interaction, proceeding with the environmental stratification of sowing times in order to recommend the best season that allows discrimination between the genotypes and the selection of the most adapted and stable genotypes in relation to the attack of angular spot and blight bacterial in cerrado of low altitude. The experiments were conducted in the period of: June, August, October and December of 2015 and March and April of 2016, in the Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão da Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira (FEIS), located in the municipality of Selvíria-MS . The experimental design was randomized blocks, where 20 genotypes were used, 5 of them commercial, IAC - Una, IAC - Imperador, IAC - Formoso, IAC - Milênio, IAC - Alvorada; and 15 from the FEIS breeding program. For the "environment" variation source, the six sowing times were used. The evaluated characters were: incidence of Bacterial and Angular Spotting. The genetic parameters and variance components were obtained by the REML / BLUP procedure. The methodologies MHPRVG (Harmonic Mean of Relative Performance of Genetic Values), AMMI (Additive Main effects and Multiplicative Interaction) and Dendogram based on Mahalanobis distance were used to study environmental stratification, stability and adaptability. The results indicated that there was interaction between genotypes and environments, generating favorable environments and not favoring the incidence of Angular Spot and Bacterial Crust. It was possible to detect the environments (seasons) that provided good discrimination of the genotypes (A1, June 2015 and A6, April 2016) and the best genotypes for stability and simultaneous tolerance (G11 and G5).
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Piramidação de genes de resistência à ferrugem, antracnose e mancha- angular em feijão do tipo carioca / Pyramiding of resistance genes to rust, anthracnose and angular leaf spot in a "carioca-type" common bean

Ragagnin, Vilmar Antonio 03 August 2004 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T17:41:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 461198 bytes, checksum: 1983c9ff254d751fb9f67e35fbabb1fc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T17:41:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 461198 bytes, checksum: 1983c9ff254d751fb9f67e35fbabb1fc (MD5) Previous issue date: 2004-08-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Visando piramidar genes de resistência à ferrugem (Uromyces appendiculatus), antracnose (Colletotrichum lindemuthianum) e mancha-angular (Phaeoisariopsis griseola) em cultivar de feijão do tipo carioca, foram intercruzadas quatro isolinhas de feijoeiro-comum. As isolinhas foram obtidas por meio de retrocruzamento nos quais foi utilizado o cv. Rudá como genitor recorrente. As isolinhas continham os seguintes genes de resistência: linha ON-48-99 - genes Co-10 e Ur-ON provenientes do cultivar Ouro Negro, linha AB-74-1-18 - gene Co-6 proveniente do cultivar AB-136, linha TO- 41-5-6-24 - gene Co-4 proveniente do cultivar TO e linha AND-7-2-9-7-10 - gene Phg- 1 proveniente do cultivar AND 277. Após seleção para homozigose e avaliação das características altura de plantas, número de dias para floração, número de dias para maturação, produtividade de grãos, peso de 100 sementes, número de sementes por vagens, número de vagens por plantas, e da reação de resistência aos patótipos de Uromyces appendiculatus, Colletotrichum lindemuthianum e Phaeoisariopsis griseola, as isolinhas foram intercruzadas duas a duas. Em seguida, as plantas F 1 foram intercruzadas para obter os híbridos duplos. Os marcadores moleculares SCAR-F10 1150a , SCAR-BA8 560a , OPX11 550a , OPY20 830a , OPB03 1800r , OPAZ20 940a e OPH13 490a associados aos respectivos genes de resistência Ur-ON, Co-10, Co-6, Co-4 e Phg-1 proveniente foram utilizados para identificar as plantas contendo todos os genes de interesse as quais foram autofecundadas para obtenção de sementes F 2 . As sementes F 2 foram semeada em casa de vegetação, e as plantas F 2 foram genotipadas utilizando-se de marcadores moleculares ligados aos genes de resistência. A resistência das plantas foi também confirmada por inoculação dos patógenos. Na geração F 3 foi feita nova avaliação com os marcadores moleculares, selecionando-se apenas as plantas que apresentavam todas as marcas. Este procedimento foi também utilizado na geração F 4 . No final deste processo foi obtida uma população constituída de 40 famílias F 4 denominadas genericamente por ́Rudá R`. Paralelamente, foi feito o cruzamento de ́Rudá R` com o cv. Pérola, obtendo-se 30 famílias F 4 . Sementes das famílias F 4:5 foram multiplicadas para realização de experimento a campo. As famílias F 4:6 foram testadas quanto ao seu desempenho agronômico em ensaio em condição de campo e foram selecionadas 4 e 3 linhagens F 4:7 de cada população, respectivamente. Estas famílias foram avaliadas quanto à resistência a diferentes patótipos de U. appendiculatus, C. lindemuthianum e P. griseola. As inoculações feitas em famílias F 4:7 mostraram que as famílias R-127-10-14, R-97-13-5, R-97-13-6, R-127-4-13, P-33-5-1, P-49-8-2 e P-49-2- 2 se comportaram como resistentes a todos os patótipos de U. appendiculatus e C. lindemuthianum, e a cinco dos sete patótipos de P. griseola inoculados. As melhores familias serão avaliadas em uma rede de ensaio de Valor de Cultivo e Uso (VCU) para uma possível recomendação de um novo cultivar de feijão tipo carioca. A seleção de linhagens de feijão com grãos do tipo carioca, resistentes à ferrugem, antracnose e mancha-angular confirmam o grande potencial e a importância do uso da seleção assistida por marcadores moleculares em programas de piramidação de genes de resistência. / The objective of this work was to pyramid resistance genes to rust (Uromyces appendiculatus), anthracnose (Colletotrichum lindemuthianum) and angular leaf spot (Phaeoisariopsis griseola) in the "carioca-type" common bean cultivar Rudá. Four isolines were obtained in four backcross programs and intercrossed. The isolines contained the following resistance genes: isoline ON-48-99 - genes Co-10 and Ur-ON from cultivar Ouro Negro (ON), isoline AB-74-1-18 - gene Co-6 from cultivar AB 136, isoline TO-41-5-6-24 - gene Co-4 from cultivar TO and isoline AND-7-2-9-7-10 - gene Phg-1 from cultivar AND 277. After selection for homozygosis and evaluation of different quantitative, morphologic, and molecular characteristics, and for resistance to rust, anthracnose and angular leaf spot, the isolines were intercrossed. The F 1 plants were intercrossed to obtain the double hybrid. The molecular markers SCAR-F10 1150a , SCAR-BA8 560a , OPY20 830a , OPAZ20 940a , OPH13 490a , OPX11 550a and OPB03 1800r associated to the resistance genes were used to identify the plants containing all the genes of interest which were selfed to obtain the F 2 seeds. The F 2 seeds were sown, and the corresponding plants were selected with molecular markers linked to the resistance genes and resistance was confirmed by inoculation of the pathogens. The selection based on molecular markers was repeated in the F 3 and F 4 generations, only plants containing all the markers were selected. At the end of this process a population of 40 families was obtained and designated ́Rudá R`. In a parallel procedure, ́Rudá R` were crossed with cv. Pérola. Thirty F 4 families ( ́Rudá R` x Pérola) were obtained. Seeds of the F 4:5 families were multiplied and used for agronomic evaluation in preliminary field tests. Four and three lines were selected from populations ́Rudá R` and ́Rudá R` x Pérola, respectively. These lines were tested against different pathotypes of U. appendiculatus, C. lindemuthianum and P. griseola. The inoculations done in F 4:7 lines showed that the lines R-127-10-14, R-97-13-5, R-97-13-6, R-127-4-13, P-33-5-1, P-49- 8-2 and P-49-2-2 were resistant to all pathotypes of U. appendiculatus and C. lindemuthianum, and to five of the seven pathotypes of P. griseola tested. The lines are xstill being analyzed for quantitative characteristics in field trials. The best lines will be tested in an official trial to be released as new varieties of "carioca-type" bean. The selection of bean lines with "carioca-type" grains, resistant to rust, anthracnose and angular leaf spot confirm the power and importance of the use of marker assisted selection in breeding programs aiming to pyramid disease resistance genes.

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