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Taxonomia, interação patógeno-hospedeiro, estudo fitossanitário e denematização de sementes de gramíneas forrageiras /

Favoreto, Luciany. January 2008 (has links)
Orientador: Jaime Maia dos Santos / Banca: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Vilmar Gonzaga / Banca: Rita de Cassia Panizzi / Banca: Clélia Aparecida Iunes Lapera / Resumo: Foi objetivo desta pesquisa: 1) Quantificar a população de nematóides e fungos em amostras de sementes procedentes dos principais Estados produtores do Brasil; 2) Estudar a taxonomia dos nematóides; 3) Estudar o processo de infecção de sementes de Brachiaria brizantha por nematóides; 4) Avaliar a eficácia da irradiação com 60Co e do tratamento químico para o controle dos nematóides. Amostras de 237 lotes de sementes de diferentes gramíneas forrageiras foram examinadas nos Laboratórios de Nematologia e de Fitossanidade da UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal, quanto à ocorrência de fungos e nematóides. No tratamento químico, usouse um lote de sementes infectadas por 1.350 Aphelenchoides sp. por 10 g. As sementes foram tratadas com doses de diferentes produtos, e como testemunha usaram-se sementes não-tratadas do mesmo lote. O experimento foi conduzido a campo em duas regiões distintas. Para irradiação, empregaram-se doses de 60Co, no Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA), Piracicaba - SP, sendo que 160 g de sementes de B. brizantha foram irradiadas com a taxa de dose de 186,8 Gy/h. Em outro experimento, 10 g de sementes de B. brizantha, isentas de nematóide, foram colocadas em gerbox, sobre areia autoclavada. Em seguida, foram inoculados 10 mL de uma suspensão contendo 3.000 indivíduos de Aphelenchoides sexlineatus (partenogenética). Os tratamentos tanto químico quanto com 60Co demonstraram não ter efeito sobre a população do nematóide. Confirmou-se, neste estudo, que os nematóides infectam as sementes após elas caírem no solo. Nematóides e fungos são encontrados infectando sementes de diferentes espécies forrageiras. / Abstract: It was the objective of this study: 1) To quantify the population of nematodes and fungi in samples of seeds from the main producer states of Brazil, 2) study the taxonomy of nematodes, 3) To study the process of infection of seeds of tropical grasses by nematodes, 4) Evaluate the effectiveness of irradiation with 60Co and chemical treatment to control nematodes. Samples of 237 seed lots of different grasses were examined in the Nematologia and Fitopatologia laboratory of UNESP / FCAV, from Jaboticabal Câmpus as the occurrence of fungi and nematodes. In the chemical treatment, used to a lot of seeds infected by 1350 Aphelenchoides sp. for 10 g. The seeds were treated with doses of different products and used it as a witness if untreated seeds from the same batch. The experiment was conducted under field conditions in two separate regions. For irradiation, using doses of 60Co, in the Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA) Piracicaba - SP, of which 160 g of seeds of B. brizantha were irradiated with a dose rate of 186.8 Gy / h. In another experiment, 10 g of seeds of B. brizantha, free of nematode, were placed in gerbox on autoclaved sand. It was then inoculated 10 mL of a suspension containing 3000 specimens of Aphelenchoides sexlineatus. The both treatments, chemist and with 60Co showed no effect on the nematode population. It was confirmed in this study that the nematodes infect the seeds after they fall on the ground. Nematodes and fungi are found infected seeds of different forage species. / Doutor
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Nematoides em feijoeiro-comum: ocorrência nos Estados do Paraná e São Paulo, e interação de cultivares com Pratylenchus brachyurus, Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica / Nematodes in common bean: occurence in Paraná and São Paulo state, and interaction of cultivars with Pratylenchus brachyurus, Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica

Bonfim Junior, Mauro Ferreira 30 September 2013 (has links)
O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é cultivado em vários países ao redor do mundo. O Brasil figura nesse cenário como o segundo maior produtor mundial de grãos secos da cultura, que é a principal fonte de proteína de origem vegetal para o consumo interno. Os nematoides-das-galhas, Meloidogyne incognita e M. javanica, são as principais espécies causadoras da redução de produtividade da cultura. Entretanto, o status hospedeiro das cultivares comerciais atuais ao nematoide das galhas é desconhecido. Da mesma maneira, a distribuição, a resistência de cultivares e os danos de Pratylenchus brachyurus à cultura não foram investigados até o momento. Tendo em vista tal situação, o presente trabalho teve como objetivo determinar quais espécies de nematoides ocorrem em áreas produtoras de feijoeirocomum; verificar a influência de P. brachyurus sobre o crescimento da cultivar Pérola; e o status hospedeiro de cultivares comerciais à P. brachyurus, M. incognita e M. javanica para o possível uso no manejo de áreas infestadas e como fonte de resistência em programas de melhoramento. No levantamento, coletaram-se 69 amostras compostas provenientes de dez cidades nos estados do Paraná e de São Paulo. Os efeitos de diferentes níveis populacionais de P. brachyurus sobre o crescimento de feijoeiro-comum cv. Pérola e sobre parâmetros de resistência [FR=população final (Pf)/população inicial (Pi) e nematoides/g de raiz (Nem./g)] foram avaliados. Trinta e cinco cultivares comerciais de feijoeiro-comum, adaptadas às regiões Centro-Oeste, Sudeste e Sul do Brasil foram avaliadas quanto à sua resistência às três principais espécies encontradas no levantamento, por meio do FR. Classificaram-se as cultivares com FR=1 como suscetíveis. As seguintes espécies foram encontradas nos levantamentos: P. brachyurus, P. crenatus, M. incognita, M. javanica, Rotylenchulus reniformis e Helicotylenchus dihystera. Observou-se redução na massa fresca de raízes (g) da cultivar Pérola, nos tratamentos inoculados com 6,66 e 20 nem./cm³ de solo. Os FR foram maiores nos tratamentos com baixa Pi (0,83 e 2,5 nem./cm³ de solo). Apesar das cultivares terem mostrado FR variado, nenhuma das cultivares apresentou resistência às três espécies estudadas. / Common bean is grown in several countries around the world. Brazil is the second main producing of dry grains, which is the main source of protein for national consumption. The root-knot nematodes, Meloidogyne incognita and M. javanica, are the major species causing yield reduction in that crop. However, the host status of actual cultivars to those rootknot nematodes is unknown. Likewise, the distribution, resistance and damage caused by Pratylenchus brachyurus to the crop were not investigated yet. In view of such situation, the present work aimed survey and identify phytonematodes in common bean fields; verify the effect of P. brachyurus on the growth of the cultivar Pérola; and the host status of actual cultivars to P. brachyurus, M. incognita and M. javanica, in order to enable the management in infested areas, as well as to use like source of resistance in breeding programs. A total of 69 samples from ten cities in Paraná and São Paulo State were surveyed. The effects of different population densities of P. brachyurus on the growth of cultivar Pérola and on parameters of resistance [FR=final population (Pf)/initial population (Pi) and nematodes/g of roots (Nem./g)] were evaluated. Thirty five common bean cultivars, adapted to center-west, southeast and south of Brazil were evaluated for resistance to the three main species found in the survey. The cultivars with FR=1 as susceptible. The following species were found in the surveys: P. brachyurus, P. crenatus, M. incognita, M. javanica, Rotylenchulus reniformis e Helicotylenchus dihystera. Reduction in root fresh weight (g) of cultivar Pérola, in the treatments inoculated with 6.66 and 20 nem./cm³ of soil were observed. The FR was higher in the treatments with low Pi (0.83 and 2.5 nem./cm³ of soil). Despite the cultivars have shown varied FR, resistance for the three nematode species studied was not found in any cultivar.
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Reação de linhagens de feijão guandu [Cajanus cajan (l.) millspaugh] frente a Meloidogyne javanica, Pratylenchus zeae E Rotylenchulus reniformis (Nematoda: Tylenchoidea) / Host status of Brazilian pigeonpea lines [Cajanus cajan (L.) Millspaugh] to Meloidogyne javanica, Rotylenchulus reniformis and Pratylenchus zeae (Nematoda: Tylenchoidea)

Araujo Filho, Jeronimo Vieira de 30 January 2009 (has links)
O feijão guandu (Cajanus cajan) é um adubo verde que tem sido utilizado, com freqüência, em esquemas de rotação e sucessão de culturas no Brasil. Entretanto, as reações (resistência/ suscetibilidade) dos genótipos nacionais frente aos principais fitonematóides foram pouco estudadas até o momento. Objetivou-se, assim, caracterizar as reações de linhagens nacionais em relação a Meloidogyne javanica, Pratylenchus zeae e Rotylenchulus reniformis, sob condições de casa de vegetação. A definição da reação baseou-se em dados de fator de reprodução dos nematóides e nos números de nematóides por grama de raízes. Desenvolveram-se cinco experimentos no total, sendo três iniciais para a avaliação de 40 linhagens em relação a M. javanica (Pi = 1000 exemplares/recipiente com três plantas), nos quais pode ser verificada ampla variedade de reações, desde alta resistência a alta suscetibilidade, mas com prevalência de linhagens suscetíveis. Num quarto experimento, as 10 linhagens avaliadas frente a R. reniformis (Pi = 1500) foram consideradas suscetíveis, inclusive com valores de FR bem superiores aos determinados para o padrão de suscetibilidade. No quinto experimento, as 11 linhagens avaliadas frente a P. zeae (Pi = 400) foram consideradas resistentes. As recomendações de cultivo do feijão guandu em áreas de reforma de cana-de-açúcar e de produção de algodão sob plantio direto são brevemente discutidas. / Pigeonpea (Cajanus cajan) is a green manure often used in crop rotation in Brazil. Despite this, the host status of pigeonpea lines to major phytonematodes remains unknown. Thereby, this work dealt with the assessment of the host status of Brazilian lines to Meloidogyne javanica, Rotylenchulus reniformis and Pratylenchus zeae under greenhouse conditions. The reaction (resistant/susceptible) for each tested interaction was defined with basis on the data of nematode reproduction factor and nematode number per gram of roots. Three out five experiments were related to M. javanica (Pi=1000 nematodes/plot with three plants), including evaluation of 40 lines; the host reaction showed large variation, ranging from high resistance to high susceptibility, but susceptible lines prevailed. In a fourth experiment, all lines that were assessed (n=10) in relation to R. reniformis (Pi=1500 nematodes/plot) were rated as susceptible, with mean RF values much higher than the one determined for the susceptible control. In the fifth experiment, all lines that were assessed (n=11) in relation to P. zeae (400 nematodes/plot) were rated as resistant. Practical implications of crop rotation of pigeonpea with sugarcane or cotton in nematode-infested fields are briefly discussed.
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Reação de hospedeiro de espécies de eucalipto a Pratylenchus brachyurus e Meloidogyne incognita / Host-status of eucalyptus species to Pratylenchus brachyurus and Meloidogyne incognita

Souza, Victor Hugo Moura de 16 January 2015 (has links)
O gênero Eucalyptus possui diversas espécies que apresentam grande valor comercial, sendo utilizado principalmente para produção de energia (carvão e lenha) e celulose-papel. Na literatura, entretanto, existem poucas informações acerca de nematoses nessa cultura. Além dessa carência e de sua importância econômica, o eucalipto é comumente cultivado em locais de alta incidência de Pratylenchus brachyurus e Meloidogyne incognita, além de ser consorciado com diversas outras culturas intolerantes, como por exemplo a soja. Dessa forma há uma necessidade de conhecer a reação das espécies de eucalipto a estes nematoides. Dito isso, o presente trabalho teve por objetivo testar a reação de algumas espécies de eucalipto a P. brachyurus e M.incognita. Foram realizados 6 experimentos, 5 envolvendo o nematoide das lesões e 1 com o nematoide de galhas. Os tratamentos foram inoculados com uma população inicial de nematoides e, após 90 dias, estimava-se o fator de reprodução (FR) e nematoides por grama de raiz (Nem/g). Adotou-se o critério baseado em Oostenbrink (1966), onde a espécie foi considerada suscetível quando apresenta FR >= 1 e resistente quando FR < 1. Dos eucaliptos testados, 6 apresentaram reação suscetível e 4 reação resistente para P. brachyurus. As espécies com maiores FR estão entre as mais utilizadas no Brasil, exceto E. saligna. Ressalta-se que estas não necessariamente são resistentes, necessitando apenas de um período maior para o estabelecimento do patógeno. Observou-se indícios de que E. saligna e E. camaldulensis sejam intolerantes a P.brachyurus. Para M. incognita raça 3 todas as espécies testadas foram resistentes. Aconselha-se a realização de experimentos com períodos superiores a 100 dias para uma correta classificação da reação de hospedeiro. O eucalipto é uma opção para aproveitamento de áreas infestadas com M. incognita raça 3, porém seu uso mostra-se um risco em áreas infestadas com P. brachyurus. / The Eucalyptus has several species with high commercial value and is used mainly for energy purpose (Charcoal and firewood) and paper. In the literature, however, there is little information about plant parasitic nematodes in this woody specie. In addition to this lack and its economic importance, eucalypts is also commonly cultivated in areas with high incidence of Pratylenchus brachyurus and Meloidogyne incognita, and consorted with several intolerant crops, such as soybean. Thus, there is a need to know the host status of the eucalypts species to these nematodes. With that, this work aimed to test the reaction of some Eucalyptus species to P.brachyurus and M. incognita. For this purpose six experiments were performed, five to test the lesion nematode and one to test the root-knot nematode. The treatments were inoculated and, after 90 days, it was estimated the reproduction factor (FR) and nematodes per gram of root (Nem/g). The present work adopted the criteria based on Oostenbrink (1966), where the species was considered susceptible when presenting FR >= 1 and resistant when FR < 1. Of species tested, six were susceptible hosts and four resistant host to P. brachyurus. The species with highest FR are among the most used eucalypts in Brazil, except E. saligna. It is emphasized that those species with FR < 1 are not necessarily resistant, requiring only a longer period for the pathogen establishment. There was some evidence that E. saligna and E. camaldulensis are intolerant hosts to P. brachyurus. To M. incognita Race 3 all tested species were resistant. It is advisable to perform experiments for periods longer than 100 days to a correct classification of host status. Eucalyptus is an option for utilization of areas infested with M. incognita race 3, but its use appears to be a risk in Pratylenchus brachyurus infested areas.
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Taxonomia, interação patógeno-hospedeiro, estudo fitossanitário e denematização de sementes de gramíneas forrageiras

Favoreto, Luciany [UNESP] 12 December 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:04Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-12-12Bitstream added on 2014-06-13T18:42:55Z : No. of bitstreams: 1 favoreto_l_dr_jabo.pdf: 3329621 bytes, checksum: 36f575037615585fab467fb72c68c365 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Foi objetivo desta pesquisa: 1) Quantificar a população de nematóides e fungos em amostras de sementes procedentes dos principais Estados produtores do Brasil; 2) Estudar a taxonomia dos nematóides; 3) Estudar o processo de infecção de sementes de Brachiaria brizantha por nematóides; 4) Avaliar a eficácia da irradiação com 60Co e do tratamento químico para o controle dos nematóides. Amostras de 237 lotes de sementes de diferentes gramíneas forrageiras foram examinadas nos Laboratórios de Nematologia e de Fitossanidade da UNESP/FCAV, Câmpus de Jaboticabal, quanto à ocorrência de fungos e nematóides. No tratamento químico, usouse um lote de sementes infectadas por 1.350 Aphelenchoides sp. por 10 g. As sementes foram tratadas com doses de diferentes produtos, e como testemunha usaram-se sementes não-tratadas do mesmo lote. O experimento foi conduzido a campo em duas regiões distintas. Para irradiação, empregaram-se doses de 60Co, no Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA), Piracicaba – SP, sendo que 160 g de sementes de B. brizantha foram irradiadas com a taxa de dose de 186,8 Gy/h. Em outro experimento, 10 g de sementes de B. brizantha, isentas de nematóide, foram colocadas em gerbox, sobre areia autoclavada. Em seguida, foram inoculados 10 mL de uma suspensão contendo 3.000 indivíduos de Aphelenchoides sexlineatus (partenogenética). Os tratamentos tanto químico quanto com 60Co demonstraram não ter efeito sobre a população do nematóide. Confirmou-se, neste estudo, que os nematóides infectam as sementes após elas caírem no solo. Nematóides e fungos são encontrados infectando sementes de diferentes espécies forrageiras. / It was the objective of this study: 1) To quantify the population of nematodes and fungi in samples of seeds from the main producer states of Brazil, 2) study the taxonomy of nematodes, 3) To study the process of infection of seeds of tropical grasses by nematodes, 4) Evaluate the effectiveness of irradiation with 60Co and chemical treatment to control nematodes. Samples of 237 seed lots of different grasses were examined in the Nematologia and Fitopatologia laboratory of UNESP / FCAV, from Jaboticabal Câmpus as the occurrence of fungi and nematodes. In the chemical treatment, used to a lot of seeds infected by 1350 Aphelenchoides sp. for 10 g. The seeds were treated with doses of different products and used it as a witness if untreated seeds from the same batch. The experiment was conducted under field conditions in two separate regions. For irradiation, using doses of 60Co, in the Centro de Energia Nuclear na Agricultura (CENA) Piracicaba - SP, of which 160 g of seeds of B. brizantha were irradiated with a dose rate of 186.8 Gy / h. In another experiment, 10 g of seeds of B. brizantha, free of nematode, were placed in gerbox on autoclaved sand. It was then inoculated 10 mL of a suspension containing 3000 specimens of Aphelenchoides sexlineatus. The both treatments, chemist and with 60Co showed no effect on the nematode population. It was confirmed in this study that the nematodes infect the seeds after they fall on the ground. Nematodes and fungi are found infected seeds of different forage species.
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Reação de hospedeiro de espécies de eucalipto a Pratylenchus brachyurus e Meloidogyne incognita / Host-status of eucalyptus species to Pratylenchus brachyurus and Meloidogyne incognita

Victor Hugo Moura de Souza 16 January 2015 (has links)
O gênero Eucalyptus possui diversas espécies que apresentam grande valor comercial, sendo utilizado principalmente para produção de energia (carvão e lenha) e celulose-papel. Na literatura, entretanto, existem poucas informações acerca de nematoses nessa cultura. Além dessa carência e de sua importância econômica, o eucalipto é comumente cultivado em locais de alta incidência de Pratylenchus brachyurus e Meloidogyne incognita, além de ser consorciado com diversas outras culturas intolerantes, como por exemplo a soja. Dessa forma há uma necessidade de conhecer a reação das espécies de eucalipto a estes nematoides. Dito isso, o presente trabalho teve por objetivo testar a reação de algumas espécies de eucalipto a P. brachyurus e M.incognita. Foram realizados 6 experimentos, 5 envolvendo o nematoide das lesões e 1 com o nematoide de galhas. Os tratamentos foram inoculados com uma população inicial de nematoides e, após 90 dias, estimava-se o fator de reprodução (FR) e nematoides por grama de raiz (Nem/g). Adotou-se o critério baseado em Oostenbrink (1966), onde a espécie foi considerada suscetível quando apresenta FR >= 1 e resistente quando FR < 1. Dos eucaliptos testados, 6 apresentaram reação suscetível e 4 reação resistente para P. brachyurus. As espécies com maiores FR estão entre as mais utilizadas no Brasil, exceto E. saligna. Ressalta-se que estas não necessariamente são resistentes, necessitando apenas de um período maior para o estabelecimento do patógeno. Observou-se indícios de que E. saligna e E. camaldulensis sejam intolerantes a P.brachyurus. Para M. incognita raça 3 todas as espécies testadas foram resistentes. Aconselha-se a realização de experimentos com períodos superiores a 100 dias para uma correta classificação da reação de hospedeiro. O eucalipto é uma opção para aproveitamento de áreas infestadas com M. incognita raça 3, porém seu uso mostra-se um risco em áreas infestadas com P. brachyurus. / The Eucalyptus has several species with high commercial value and is used mainly for energy purpose (Charcoal and firewood) and paper. In the literature, however, there is little information about plant parasitic nematodes in this woody specie. In addition to this lack and its economic importance, eucalypts is also commonly cultivated in areas with high incidence of Pratylenchus brachyurus and Meloidogyne incognita, and consorted with several intolerant crops, such as soybean. Thus, there is a need to know the host status of the eucalypts species to these nematodes. With that, this work aimed to test the reaction of some Eucalyptus species to P.brachyurus and M. incognita. For this purpose six experiments were performed, five to test the lesion nematode and one to test the root-knot nematode. The treatments were inoculated and, after 90 days, it was estimated the reproduction factor (FR) and nematodes per gram of root (Nem/g). The present work adopted the criteria based on Oostenbrink (1966), where the species was considered susceptible when presenting FR >= 1 and resistant when FR < 1. Of species tested, six were susceptible hosts and four resistant host to P. brachyurus. The species with highest FR are among the most used eucalypts in Brazil, except E. saligna. It is emphasized that those species with FR < 1 are not necessarily resistant, requiring only a longer period for the pathogen establishment. There was some evidence that E. saligna and E. camaldulensis are intolerant hosts to P. brachyurus. To M. incognita Race 3 all tested species were resistant. It is advisable to perform experiments for periods longer than 100 days to a correct classification of host status. Eucalyptus is an option for utilization of areas infested with M. incognita race 3, but its use appears to be a risk in Pratylenchus brachyurus infested areas.
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Reação de linhagens de feijão guandu [Cajanus cajan (l.) millspaugh] frente a Meloidogyne javanica, Pratylenchus zeae E Rotylenchulus reniformis (Nematoda: Tylenchoidea) / Host status of Brazilian pigeonpea lines [Cajanus cajan (L.) Millspaugh] to Meloidogyne javanica, Rotylenchulus reniformis and Pratylenchus zeae (Nematoda: Tylenchoidea)

Jeronimo Vieira de Araujo Filho 30 January 2009 (has links)
O feijão guandu (Cajanus cajan) é um adubo verde que tem sido utilizado, com freqüência, em esquemas de rotação e sucessão de culturas no Brasil. Entretanto, as reações (resistência/ suscetibilidade) dos genótipos nacionais frente aos principais fitonematóides foram pouco estudadas até o momento. Objetivou-se, assim, caracterizar as reações de linhagens nacionais em relação a Meloidogyne javanica, Pratylenchus zeae e Rotylenchulus reniformis, sob condições de casa de vegetação. A definição da reação baseou-se em dados de fator de reprodução dos nematóides e nos números de nematóides por grama de raízes. Desenvolveram-se cinco experimentos no total, sendo três iniciais para a avaliação de 40 linhagens em relação a M. javanica (Pi = 1000 exemplares/recipiente com três plantas), nos quais pode ser verificada ampla variedade de reações, desde alta resistência a alta suscetibilidade, mas com prevalência de linhagens suscetíveis. Num quarto experimento, as 10 linhagens avaliadas frente a R. reniformis (Pi = 1500) foram consideradas suscetíveis, inclusive com valores de FR bem superiores aos determinados para o padrão de suscetibilidade. No quinto experimento, as 11 linhagens avaliadas frente a P. zeae (Pi = 400) foram consideradas resistentes. As recomendações de cultivo do feijão guandu em áreas de reforma de cana-de-açúcar e de produção de algodão sob plantio direto são brevemente discutidas. / Pigeonpea (Cajanus cajan) is a green manure often used in crop rotation in Brazil. Despite this, the host status of pigeonpea lines to major phytonematodes remains unknown. Thereby, this work dealt with the assessment of the host status of Brazilian lines to Meloidogyne javanica, Rotylenchulus reniformis and Pratylenchus zeae under greenhouse conditions. The reaction (resistant/susceptible) for each tested interaction was defined with basis on the data of nematode reproduction factor and nematode number per gram of roots. Three out five experiments were related to M. javanica (Pi=1000 nematodes/plot with three plants), including evaluation of 40 lines; the host reaction showed large variation, ranging from high resistance to high susceptibility, but susceptible lines prevailed. In a fourth experiment, all lines that were assessed (n=10) in relation to R. reniformis (Pi=1500 nematodes/plot) were rated as susceptible, with mean RF values much higher than the one determined for the susceptible control. In the fifth experiment, all lines that were assessed (n=11) in relation to P. zeae (400 nematodes/plot) were rated as resistant. Practical implications of crop rotation of pigeonpea with sugarcane or cotton in nematode-infested fields are briefly discussed.
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Nematoides em feijoeiro-comum: ocorrência nos Estados do Paraná e São Paulo, e interação de cultivares com Pratylenchus brachyurus, Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica / Nematodes in common bean: occurence in Paraná and São Paulo state, and interaction of cultivars with Pratylenchus brachyurus, Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica

Mauro Ferreira Bonfim Junior 30 September 2013 (has links)
O feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) é cultivado em vários países ao redor do mundo. O Brasil figura nesse cenário como o segundo maior produtor mundial de grãos secos da cultura, que é a principal fonte de proteína de origem vegetal para o consumo interno. Os nematoides-das-galhas, Meloidogyne incognita e M. javanica, são as principais espécies causadoras da redução de produtividade da cultura. Entretanto, o status hospedeiro das cultivares comerciais atuais ao nematoide das galhas é desconhecido. Da mesma maneira, a distribuição, a resistência de cultivares e os danos de Pratylenchus brachyurus à cultura não foram investigados até o momento. Tendo em vista tal situação, o presente trabalho teve como objetivo determinar quais espécies de nematoides ocorrem em áreas produtoras de feijoeirocomum; verificar a influência de P. brachyurus sobre o crescimento da cultivar Pérola; e o status hospedeiro de cultivares comerciais à P. brachyurus, M. incognita e M. javanica para o possível uso no manejo de áreas infestadas e como fonte de resistência em programas de melhoramento. No levantamento, coletaram-se 69 amostras compostas provenientes de dez cidades nos estados do Paraná e de São Paulo. Os efeitos de diferentes níveis populacionais de P. brachyurus sobre o crescimento de feijoeiro-comum cv. Pérola e sobre parâmetros de resistência [FR=população final (Pf)/população inicial (Pi) e nematoides/g de raiz (Nem./g)] foram avaliados. Trinta e cinco cultivares comerciais de feijoeiro-comum, adaptadas às regiões Centro-Oeste, Sudeste e Sul do Brasil foram avaliadas quanto à sua resistência às três principais espécies encontradas no levantamento, por meio do FR. Classificaram-se as cultivares com FR=1 como suscetíveis. As seguintes espécies foram encontradas nos levantamentos: P. brachyurus, P. crenatus, M. incognita, M. javanica, Rotylenchulus reniformis e Helicotylenchus dihystera. Observou-se redução na massa fresca de raízes (g) da cultivar Pérola, nos tratamentos inoculados com 6,66 e 20 nem./cm³ de solo. Os FR foram maiores nos tratamentos com baixa Pi (0,83 e 2,5 nem./cm³ de solo). Apesar das cultivares terem mostrado FR variado, nenhuma das cultivares apresentou resistência às três espécies estudadas. / Common bean is grown in several countries around the world. Brazil is the second main producing of dry grains, which is the main source of protein for national consumption. The root-knot nematodes, Meloidogyne incognita and M. javanica, are the major species causing yield reduction in that crop. However, the host status of actual cultivars to those rootknot nematodes is unknown. Likewise, the distribution, resistance and damage caused by Pratylenchus brachyurus to the crop were not investigated yet. In view of such situation, the present work aimed survey and identify phytonematodes in common bean fields; verify the effect of P. brachyurus on the growth of the cultivar Pérola; and the host status of actual cultivars to P. brachyurus, M. incognita and M. javanica, in order to enable the management in infested areas, as well as to use like source of resistance in breeding programs. A total of 69 samples from ten cities in Paraná and São Paulo State were surveyed. The effects of different population densities of P. brachyurus on the growth of cultivar Pérola and on parameters of resistance [FR=final population (Pf)/initial population (Pi) and nematodes/g of roots (Nem./g)] were evaluated. Thirty five common bean cultivars, adapted to center-west, southeast and south of Brazil were evaluated for resistance to the three main species found in the survey. The cultivars with FR=1 as susceptible. The following species were found in the surveys: P. brachyurus, P. crenatus, M. incognita, M. javanica, Rotylenchulus reniformis e Helicotylenchus dihystera. Reduction in root fresh weight (g) of cultivar Pérola, in the treatments inoculated with 6.66 and 20 nem./cm³ of soil were observed. The FR was higher in the treatments with low Pi (0.83 and 2.5 nem./cm³ of soil). Despite the cultivars have shown varied FR, resistance for the three nematode species studied was not found in any cultivar.
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Identificação de QTLs em soja associados à resistência ao nematoide-das-lesões-radiculares / QTL identification in soybean related to root lesion nematode

Terasawa, José Maurício 26 February 2018 (has links)
Soja (Glycine max (L.) Merrill) é uma das mais importantes oleaginosas no mundo e sua relevância pode ser também mensurada pela extensão da sua produção no Brasil, onde representa quase a metade do total da área plantada com grãos. A importância da soja está também associada à multiplicidade de utilização do grão, como por exemplo, na alimentação humana e animal, na indústria química e na geração de energia como biodiesel. A produtividade da soja tem sido frequentemente impactada devido ao ataque de pragas e doenças. Dentre as espécies de fitonematoides, o nematoide-das-lesões-radiculares (Pratylenchus brachyurus Godfrey), tem gerado significativas perdas econômicas aos produtores, variando entre 30 a 50%, dependendo da infestação da cultura. Este trabalho teve como objetivo identificar QTLs (Quantitative Trait Loci), a partir de um conjunto de fenótipos associados à resistência ao nematoide-das-lesões-radiculares utilizando a abordagem de mapeamento multivariado. Uma população de 174 indivíduos F2, obtidos a partir do cruzamento entre duas linhagens de soja FTPG06A e FTPG12X (com baixo fator de reprodução do nematoide), foi utilizada para a obtenção dos valores genéticos preditos (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) de cinco características estudadas e também para a genotipagem com o SoySNP6k Bead Chip. As características avaliadas foram: fator de reprodução (FR), peso fresco (PA) e comprimento (CA) da parte aérea, peso fresco (PR) e comprimento (CR) da raiz. Um total de 1.240 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) foram mapeados nos 20 grupos de ligação (GLs) da soja. O comprimento total do mapa foi de 3.084,46 centiMorgans (cM), com intervalo médio de 2,54 cM entre marcadores adjacentes. A identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) para os caracteres fenotípicos foi realizada utilizando-se o mapeamento de intervalos múltiplos univariado (MIM) e multivariado (MT-MIM), com estimativa dos efeitos principais dos QTLs e análises de epistasia envolvendo pares de QTLs. Na abordagem MIM foram identificados três QTLs associados à variável CR, nos GLs (Grupos de Ligação) A2 e E (2 QTLs), explicando um total de 34,22% da variação fenotípica dessa variável para a população em estudo. Na abordagem MT-MIM, foram selecionados dois conjuntos de variáveis, de acordo com a correlação entre as mesmas. Três regiões genômicas foram reveladas, sendo estatisticamente significativas para as variáveis CR, FR e CA. A comparação dos seis QTLs identificados no presente estudo com o banco de dados de QTLs do Soybase forneceu evidências de que cinco QTLs, ainda não foram descritos na literatura. Uma busca por sequências candidatas em duas regiões de interesse, associadas à variável FR, foi realizada, com base na plataforma de dados genômicos PlantGDB. Várias sequências candidatas indicam relação com mecanismos importantes na resposta das plantas a estresses bióticos. Dessa forma, os resultados obtidos no presente estudo forneceram informações para auxiliar na melhor compreensão da arquitetura genética dos caracteres quantitativos analisados. / Soybean (Glycine max (L.) Merrill) is one of the most important oil crop worldwide and its relevance can also be measured by the extension of soybean grain production in Brazil, where it represents almost half of the total planting area with grains crops. Importance of soybean is also related to a multiplicity of usage of the grain, for example, in human consumption, animal feed, chemical industry and for energy generation as biofuel. Soybean yield has been frequently reduced by occurrence of pest and diseases. Among phytonematodes species, root lesion nematode (Pratylenchus brachyurus Godfrey) has caused significant economic losses to farmers, ranging from 30 to 50%, depending on crop infestation. This research aimed to identify QTLs (Quantitative Trait Loci), from a set of phenotypes associated with resistance to root lesion nematode, using the multivariate multiple interval mapping. A mapping population of 174 F2 plants derived from a by-parental cross between two soybean breeding lines FTPG06A and FTPG12X (with low nematode reproduction factor), was used for prediction of genetic values (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) for five traits studied and also for genotyping with SoySNP6k Bead Chip. Traits evaluated were reproduction factor (FR), shoot weight (PA), shoot length (CA), root weight (PR) and root length (CR). A total of 1,240 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers were mapped into 20 soybean linkage groups (LG). A total map length was 3,084.46 centiMorgans (cM) with an average of 2.54 cM between flanking markers. QTL mapping for those traits was performed using univariate (MIM) and multivariate (MT-MIM) multiple-interval mapping, with main QTL effects estimates and epistasis analysis between QTL pairs. MIM analysis identified three QTLs associated to CR trait at LG A2 and LG E (2 QTL), explaining 34,22% of phenotypic variation estimated for this mapping population. For MT-MIM analysis, two sets of traits were selected, according to the correlation among them. Three genomic regions statistically significant for CR, FR and CA traits were identified. Comparison between six identified QTL and QTL database at Soybase provided evidence that five QTL have not been published yet. Search for candidate sequences located in two regions associated with FR trait were further performed on the PlantGDB genomic data platform. Several candidate sequences indicate relationships with important plant response mechanisms to biotic stresses. Thus, results obtained in the present study provided information to improve knowledge of the genetic architecture of the analyzed quantitative traits.
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Identificação de QTLs em soja associados à resistência ao nematoide-das-lesões-radiculares / QTL identification in soybean related to root lesion nematode

José Maurício Terasawa 26 February 2018 (has links)
Soja (Glycine max (L.) Merrill) é uma das mais importantes oleaginosas no mundo e sua relevância pode ser também mensurada pela extensão da sua produção no Brasil, onde representa quase a metade do total da área plantada com grãos. A importância da soja está também associada à multiplicidade de utilização do grão, como por exemplo, na alimentação humana e animal, na indústria química e na geração de energia como biodiesel. A produtividade da soja tem sido frequentemente impactada devido ao ataque de pragas e doenças. Dentre as espécies de fitonematoides, o nematoide-das-lesões-radiculares (Pratylenchus brachyurus Godfrey), tem gerado significativas perdas econômicas aos produtores, variando entre 30 a 50%, dependendo da infestação da cultura. Este trabalho teve como objetivo identificar QTLs (Quantitative Trait Loci), a partir de um conjunto de fenótipos associados à resistência ao nematoide-das-lesões-radiculares utilizando a abordagem de mapeamento multivariado. Uma população de 174 indivíduos F2, obtidos a partir do cruzamento entre duas linhagens de soja FTPG06A e FTPG12X (com baixo fator de reprodução do nematoide), foi utilizada para a obtenção dos valores genéticos preditos (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) de cinco características estudadas e também para a genotipagem com o SoySNP6k Bead Chip. As características avaliadas foram: fator de reprodução (FR), peso fresco (PA) e comprimento (CA) da parte aérea, peso fresco (PR) e comprimento (CR) da raiz. Um total de 1.240 marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) foram mapeados nos 20 grupos de ligação (GLs) da soja. O comprimento total do mapa foi de 3.084,46 centiMorgans (cM), com intervalo médio de 2,54 cM entre marcadores adjacentes. A identificação de QTLs (Quantitative Trait Loci) para os caracteres fenotípicos foi realizada utilizando-se o mapeamento de intervalos múltiplos univariado (MIM) e multivariado (MT-MIM), com estimativa dos efeitos principais dos QTLs e análises de epistasia envolvendo pares de QTLs. Na abordagem MIM foram identificados três QTLs associados à variável CR, nos GLs (Grupos de Ligação) A2 e E (2 QTLs), explicando um total de 34,22% da variação fenotípica dessa variável para a população em estudo. Na abordagem MT-MIM, foram selecionados dois conjuntos de variáveis, de acordo com a correlação entre as mesmas. Três regiões genômicas foram reveladas, sendo estatisticamente significativas para as variáveis CR, FR e CA. A comparação dos seis QTLs identificados no presente estudo com o banco de dados de QTLs do Soybase forneceu evidências de que cinco QTLs, ainda não foram descritos na literatura. Uma busca por sequências candidatas em duas regiões de interesse, associadas à variável FR, foi realizada, com base na plataforma de dados genômicos PlantGDB. Várias sequências candidatas indicam relação com mecanismos importantes na resposta das plantas a estresses bióticos. Dessa forma, os resultados obtidos no presente estudo forneceram informações para auxiliar na melhor compreensão da arquitetura genética dos caracteres quantitativos analisados. / Soybean (Glycine max (L.) Merrill) is one of the most important oil crop worldwide and its relevance can also be measured by the extension of soybean grain production in Brazil, where it represents almost half of the total planting area with grains crops. Importance of soybean is also related to a multiplicity of usage of the grain, for example, in human consumption, animal feed, chemical industry and for energy generation as biofuel. Soybean yield has been frequently reduced by occurrence of pest and diseases. Among phytonematodes species, root lesion nematode (Pratylenchus brachyurus Godfrey) has caused significant economic losses to farmers, ranging from 30 to 50%, depending on crop infestation. This research aimed to identify QTLs (Quantitative Trait Loci), from a set of phenotypes associated with resistance to root lesion nematode, using the multivariate multiple interval mapping. A mapping population of 174 F2 plants derived from a by-parental cross between two soybean breeding lines FTPG06A and FTPG12X (with low nematode reproduction factor), was used for prediction of genetic values (BLUPs - Best Linear Unbiased Predictions) for five traits studied and also for genotyping with SoySNP6k Bead Chip. Traits evaluated were reproduction factor (FR), shoot weight (PA), shoot length (CA), root weight (PR) and root length (CR). A total of 1,240 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) markers were mapped into 20 soybean linkage groups (LG). A total map length was 3,084.46 centiMorgans (cM) with an average of 2.54 cM between flanking markers. QTL mapping for those traits was performed using univariate (MIM) and multivariate (MT-MIM) multiple-interval mapping, with main QTL effects estimates and epistasis analysis between QTL pairs. MIM analysis identified three QTLs associated to CR trait at LG A2 and LG E (2 QTL), explaining 34,22% of phenotypic variation estimated for this mapping population. For MT-MIM analysis, two sets of traits were selected, according to the correlation among them. Three genomic regions statistically significant for CR, FR and CA traits were identified. Comparison between six identified QTL and QTL database at Soybase provided evidence that five QTL have not been published yet. Search for candidate sequences located in two regions associated with FR trait were further performed on the PlantGDB genomic data platform. Several candidate sequences indicate relationships with important plant response mechanisms to biotic stresses. Thus, results obtained in the present study provided information to improve knowledge of the genetic architecture of the analyzed quantitative traits.

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