Typescript. / Thesis (Ph. D.)--University of Hawaii, 1970. / Bibliography: leaves [190]-196. / x, 196 l illus

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Typescript. / Thesis (Ph. D.)--University of Hawaii at Manoa, 1990. / Includes bibliographical references (leaves 110-115) / Microfiche. / xiv, 115 leaves, bound ill. (some col.) 29 cm

Orientador: Edson Luiz Furtado / Banca: Nilton Luiz de Souza / Banca: Marcos Antonio Machado / Resumo: Phytophthora parasitica, principal causador da gomose dos citros, é um importante patógeno dos citros provocando danos em viveiros e no campo. Programas de melhoramento visando obtenção de plantas resistentes a P. parasitica exigem informações detalhadas sobre o tipo de herança e a localização de genes de resistência no genoma. Fontes de resistência às doenças podem ser encontradas em gêneros correlatos a citros como Poncirus sp. O presente estudo teve como objetivos detectar e verificar a estabilidade de marcadores moleculares e locos controladores de características quantitativas (QTLs) ligados à resistência a gomose em uma progênie F1 obtida do cruzamento entre Citrus sunki vs. Poncirus trifoliata 'Rubidoux'. As avaliações fenotípicas de três conjuntos de dados de 3 épocas de avaliação distintas foram incorporadas às informações dos mapas de ligação estabelecidos através de marcadores moleculares do tipo RAPD. Plantas jovens foram inoculadas com o patógeno, usando o método do disco e avaliadas medindo-se o comprimento da lesão. A estratégia do 'pseudo-testcross' foi adotada como delineamento genético. Os QTLs foram mapeados utilizando o método do mapeamento por intervalo composto (CIM) com o programa QTLCartographer v.1.25. A partir das média de todos os experimentos, foram identificadas 5 posições nos grupos de ligação II, III e V de P. trifoliata associadas à gomose de Phytophthora. Em 2 posições observou-se uma correlação na detecção de QTLs para as avaliações realizadas em duas das três épocas. Demonstrado desta forma a ocorrência da interação genótipo ambiente. / Abstract: P. parasitica, is the most important main causal agent of Citrus Phytophthora gummosis in Brazil and hve caused damage in nurseries and orchards. Improving resistence programs to get resistant to P. parasitica have been detailed information about the inheritance and gene localization resistance. Source of disease resistance can be found in correlated genera like Poncirus trifoliata. The present study had the objective of detecting molecular markers associated to quantitative trait loci (QTL) for resistance to Citrus Phytophthora gummosis using F1 lineage obtained between Citrus sunki vs. Poncirus trifoliata 'Rubidoux' cross. Phenotypical evaluations will be incorporated in linkage maps established through RAPD molecular markers. Young plants were inoculated with P. parasitica, using the disc method and evaluated after one month measuring lesions length. Pseudo-testcross strategy was be used for genetic outlining. All this information were evaluated in specific genetic-statistical programs. QTLs were mapped using the method of the maps for composed interval (CIM) with the program QTLCartographer v.1.25. CIM. Starting from the average of all of the experiments, they were identified 2 positions in the group of connection II of P. trifoliata associated with gomose of Phytophthora. In each area a correlation was observed in the detection of QTLs for the evaluations accomplished in two of the three times... (Complete abstract, click electronic address below). / Mestre

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:37Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2004-06-25Bitstream added on 2014-06-13T20:58:39Z : No. of bitstreams: 1 boava_lp_me_botfca.pdf: 497651 bytes, checksum: 37f114f566262afe532ca550bf9ecb9f (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / Phytophthora parasitica, principal causador da gomose dos citros, é um importante patógeno dos citros provocando danos em viveiros e no campo. Programas de melhoramento visando obtenção de plantas resistentes a P. parasitica exigem informações detalhadas sobre o tipo de herança e a localização de genes de resistência no genoma. Fontes de resistência às doenças podem ser encontradas em gêneros correlatos a citros como Poncirus sp. O presente estudo teve como objetivos detectar e verificar a estabilidade de marcadores moleculares e locos controladores de características quantitativas (QTLs) ligados à resistência a gomose em uma progênie F1 obtida do cruzamento entre Citrus sunki vs. Poncirus trifoliata 'Rubidoux'. As avaliações fenotípicas de três conjuntos de dados de 3 épocas de avaliação distintas foram incorporadas às informações dos mapas de ligação estabelecidos através de marcadores moleculares do tipo RAPD. Plantas jovens foram inoculadas com o patógeno, usando o método do disco e avaliadas medindo-se o comprimento da lesão. A estratégia do 'pseudo-testcross' foi adotada como delineamento genético. Os QTLs foram mapeados utilizando o método do mapeamento por intervalo composto (CIM) com o programa QTLCartographer v.1.25. A partir das média de todos os experimentos, foram identificadas 5 posições nos grupos de ligação II, III e V de P. trifoliata associadas à gomose de Phytophthora. Em 2 posições observou-se uma correlação na detecção de QTLs para as avaliações realizadas em duas das três épocas. Demonstrado desta forma a ocorrência da interação genótipo ambiente. / P. parasitica, is the most important main causal agent of Citrus Phytophthora gummosis in Brazil and hve caused damage in nurseries and orchards. Improving resistence programs to get resistant to P. parasitica have been detailed information about the inheritance and gene localization resistance. Source of disease resistance can be found in correlated genera like Poncirus trifoliata. The present study had the objective of detecting molecular markers associated to quantitative trait loci (QTL) for resistance to Citrus Phytophthora gummosis using F1 lineage obtained between Citrus sunki vs. Poncirus trifoliata 'Rubidoux' cross. Phenotypical evaluations will be incorporated in linkage maps established through RAPD molecular markers. Young plants were inoculated with P. parasitica, using the disc method and evaluated after one month measuring lesions length. Pseudo-testcross strategy was be used for genetic outlining. All this information were evaluated in specific genetic-statistical programs. QTLs were mapped using the method of the maps for composed interval (CIM) with the program QTLCartographer v.1.25. CIM. Starting from the average of all of the experiments, they were identified 2 positions in the group of connection II of P. trifoliata associated with gomose of Phytophthora. In each area a correlation was observed in the detection of QTLs for the evaluations accomplished in two of the three times... (Complete abstract, click electronic address below).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:01Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2001-07Bitstream added on 2014-06-13T19:24:12Z : No. of bitstreams: 1 siviero_a_dr_botfca.pdf: 1011233 bytes, checksum: b962f917617fbd995aa744e10e7a84f4 (MD5) / O presente estudo teve como objetivos selecionar isolados de Phytophthora parasitica com alta agressividade em citros, avaliar métodos de inoculação em genótipos quanto à resistência a gomose de Phytophthora e detectar marcadores moleculares ligados a locos controladores de características quantitativas (QTLs) de resistência a gomose. Foram testados 15 isolados de P. parasitica procedentes do Estado de São Paulo. As plantas foram inoculadas por meio de contato, método do disco, inserção sob casca, agulha e palitode- dente infestado com o patógeno. Para o trabalho de detecção de marcadores e QTLs foram inoculados 98 indivíduos de uma progênie F1, obtida do cruzamento entre Citrus sunki, parental suscetível, e Poncirus trifoliata ‘Rubidoux’, parental altamente resistente ao patógeno. As avaliações fenotípicas da resistência a gomose da progênie foram incorporadas aos mapas de ligação de P. trifoliata ‘Rubidoux’ e C. sunki, estabelecidos através de 170 marcadores moleculares do tipo RAPD, usando a estratégia de ‘pseudo testcross’. Os isolados apresentaram variação na agressividade quando inoculados em C. limon Burmann. e C. limonia Osbeck. com destaque para o isolado, LRS23/97. A avaliação de resistência de genótipos de citros a gomose pode ser realizada em plântulas e ‘in vitro’, através de inserção de agulha infestada com o patógeno e através do método do disco e da inserção sob casca em plantas com diâmetro acima de 4,0 mm. Os indivíduos da população F1, inoculados artificialmente através do método do disco, apresentaram lesões intermediárias em relação aos parentais. A herdabilidade do caráter foi de 18,7%. Foram detectados 36 marcadores moleculares associados à resistência a gomose, dos quais, 19 mapeados em P. trifoliata ‘Rubidoux’ e 10 em C. sunki... . / The objectives of the study were to select Phytophthora parasitica isolates with high agressivity on citrus, to evaluate inoculation methods and to detect molecular markers linked to resistance QTLs to Phytophthora gummosis. Fifth teen isolates of P. parasitica from the State of São Paulo were tested. Young plants were inoculated and by contact, through the insertion of a disc and tricking infested, needle and toothpick infested with pathogen. For the markers and QTLs detection, 98 individuals of the F1 progeny obtained from Citrus sunki, (susceptible parent) and Poncirus trifoliata ‘Rubidoux’, (resistant) cross were inoculated. The phenotypic evaluations for Phytophthora gummosis resistance were incorporated on genetic linkage maps built with 170 RAPD markers using the pseudotestcross strategy. The isolates showed variation in agressivity when inoculated on Citrus limon Burmann. and Citrus limonia Osbeck. The LRS23/97 isolate showed more agressivity. The citrus genotypes evaluation to resistance to Phytophphtora gummosis were made in seedlings and ‘in vitro’ by needle insertion with pathogen, disc insertion method under bark and disc method in plants with diameter larger than 4,0 mm. The F1 hybrids, which were artificially inoculated by disc method, showed intermediates symptoms compared to the parents. The heretability of Phytophthora gummosis resistance was 18,7%. 36 molecular markers were associated to Phytophthora gummosis resistance and 19 were associated with P. trifoliata ‘Rubidoux’ map and 10 with C. sunki map. It was also detected 3 QTLs linked to Phytophthora gummosis resistance on I, II and V linkage groups of P. trifoliata ‘Rubidoux’ map and 1 QTL on II linkage group of C. sunki map. The phenotypic variation ratio explained by association markers-QTLs, was in a range of 14 to 60% for P. trifoliata ‘Rubidoux’ and... (Complete abstract, click electronic address below).

Orientador: Edson Luiz Furtado / Resumo: O presente estudo teve como objetivos selecionar isolados de Phytophthora parasitica com alta agressividade em citros, avaliar métodos de inoculação em genótipos quanto à resistência a gomose de Phytophthora e detectar marcadores moleculares ligados a locos controladores de características quantitativas (QTLs) de resistência a gomose. Foram testados 15 isolados de P. parasitica procedentes do Estado de São Paulo. As plantas foram inoculadas por meio de contato, método do disco, inserção sob casca, agulha e palitode- dente infestado com o patógeno. Para o trabalho de detecção de marcadores e QTLs foram inoculados 98 indivíduos de uma progênie F1, obtida do cruzamento entre Citrus sunki, parental suscetível, e Poncirus trifoliata 'Rubidoux', parental altamente resistente ao patógeno. As avaliações fenotípicas da resistência a gomose da progênie foram incorporadas aos mapas de ligação de P. trifoliata 'Rubidoux' e C. sunki, estabelecidos através de 170 marcadores moleculares do tipo RAPD, usando a estratégia de 'pseudo testcross'. Os isolados apresentaram variação na agressividade quando inoculados em C. limon Burmann. e C. limonia Osbeck. com destaque para o isolado, LRS23/97. A avaliação de resistência de genótipos de citros a gomose pode ser realizada em plântulas e 'in vitro', através de inserção de agulha infestada com o patógeno e através do método do disco e da inserção sob casca em plantas com diâmetro acima de 4,0 mm. Os indivíduos da população F1, inoculados artificialmente através do método do disco, apresentaram lesões intermediárias em relação aos parentais. A herdabilidade do caráter foi de 18,7%. Foram detectados 36 marcadores moleculares associados à resistência a gomose, dos quais, 19 mapeados em P. trifoliata 'Rubidoux' e 10 em C. sunki... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo). / Abstract: The objectives of the study were to select Phytophthora parasitica isolates with high agressivity on citrus, to evaluate inoculation methods and to detect molecular markers linked to resistance QTLs to Phytophthora gummosis. Fifth teen isolates of P. parasitica from the State of São Paulo were tested. Young plants were inoculated and by contact, through the insertion of a disc and tricking infested, needle and toothpick infested with pathogen. For the markers and QTLs detection, 98 individuals of the F1 progeny obtained from Citrus sunki, (susceptible parent) and Poncirus trifoliata 'Rubidoux', (resistant) cross were inoculated. The phenotypic evaluations for Phytophthora gummosis resistance were incorporated on genetic linkage maps built with 170 RAPD markers using the pseudotestcross strategy. The isolates showed variation in agressivity when inoculated on Citrus limon Burmann. and Citrus limonia Osbeck. The LRS23/97 isolate showed more agressivity. The citrus genotypes evaluation to resistance to Phytophphtora gummosis were made in seedlings and 'in vitro' by needle insertion with pathogen, disc insertion method under bark and disc method in plants with diameter larger than 4,0 mm. The F1 hybrids, which were artificially inoculated by disc method, showed intermediates symptoms compared to the parents. The heretability of Phytophthora gummosis resistance was 18,7%. 36 molecular markers were associated to Phytophthora gummosis resistance and 19 were associated with P. trifoliata 'Rubidoux' map and 10 with C. sunki map. It was also detected 3 QTLs linked to Phytophthora gummosis resistance on I, II and V linkage groups of P. trifoliata 'Rubidoux' map and 1 QTL on II linkage group of C. sunki map. The phenotypic variation ratio explained by association markers-QTLs, was in a range of 14 to 60% for P. trifoliata 'Rubidoux' and... (Complete abstract, click electronic address below). / Doutor

Orientador: Herculano Penna Medina Filho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-27T12:36:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carvalho_MarliRezendeTessarinide_D.pdf: 5553083 bytes, checksum: ff21d935db0e813566223a662e7f232d (MD5) Previous issue date: 2000 / Doutorado

M. Tech.

L'agriculture mondiale a connu de profonds changements qui lui ont permis de faire face à l'augmentation constante de la demande alimentaire. Cependant, les conséquences de ces nouvelles pratiques agricoles sur l'environnement et la santé humaine font l'objet de préoccupations croissantes. Notamment, les politiques sanitaires actuelles visent à réduire l'utilisation des produits phytosanitaires. Aussi de nouvelles stratégies de protection des cultures doivent-elles être développées. Une meilleure compréhension des échanges moléculaires qui contribuent au succès des bioagresseurs est nécessaire. Ces échanges impliquent notamment la sécrétion de protéines qui interfèrent avec le métabolisme de l'hôte : les effecteurs. Certains d'entre elles sont accumulés au cours de la pénétration des premières cellules végétales, une étape décisive pour le succès de la tentative d'infection. Les travaux menés au cours de cette thèse se sont concentrés sur 3 de ces effecteurs, sécrétés par l'oomycète Phytophthora parasitica. L'analyse des lignées de surexpression chez Arabidopsis thaliana a permis de mettre en évidence des perturbations du développement et de la physiologie de certaines hormones végétales en réponse à l'accumulation de ces effecteurs. Ces données confirment l'importance de la manipulation des voies hormonales dans le cadre des interactions plantes-pathogènes et soutiennent l'hypothèse récente selon laquelle des effecteurs sécrétés par les agents pathogènes interfèrent avec un petit nombre de cibles clefs du métabolisme de l'hôte. Ces cibles constituent des candidats de choix pour développer des variétés plus résistantes. / Agriculture has undergone deep changes that have allowed to cope with the ever-increasing demand for food. However, the consequences of the new agricultural practices on the environment and human health are the subject of increasing concern. Notably, current health policies aimed at reducing the use of pesticides in agriculture. Thus, new strategies need to be developed for efficient crop protection. In particular, a better understanding of molecular exchanges that contribute to the success of pathogens is required. These exchanges include the secretion of proteins that interfere with host metabolism : the effectors. Some of them are accumulated during the penetration of the first plant cells, a crucial step for the success of the infection attempt. This thesis work focused on three of these effectors, secreted by the oomycete Phytophthora parasitica. The analysis of transgenic Arabidopsis thaliana lines highlighted perturbations of plant development and hormone physiology in response to the accumulation of these effectors. These data confirm the pivotal role of hormonal balance during plant-pathogen interactions and support the recent hypothesis that effectors secreted by evolutionarily distant plant pathogens interfere with a small number of key target host metabolism. These targets are good candidates to develop varieties that are more resistant to infection.