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Caracterização do proteoma de entrenós maduros e imaturos de cana-de-açúcar durante o estádio de maturação / Characterization of the proteome of mature and immature internodes from sugarcane during maturation phase of development

Cruz, Larissa Prado da 08 October 2012 (has links)
Grandes esforços dos programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar são dedicados ao desenvolvimento de novas variedades com maior rendimento e conteúdo de sacarose. As etapas do metabolismo da sacarose têm sido foco de pesquisas há muito tempo, porém apenas recentemente têm-se buscado compreender os processos de transporte e acúmulo da sacarose no colmo da cana-de-açúcar. O objetivo deste trabalho é a caracterização do proteoma de entrenós maduros (entrenó 9) e imaturos (entrenó 5) de dois genótipos de cana-de-açúcar (Co 740 e SP 80-3280), ambos com 12 meses de idade, visando à identificação de proteínas relacionadas aos processos de transporte e acúmulo de sacarose. A altura, diâmetro do colmo, área foliar, umidade dos entrenós, trocas gasosas, potencial hídrico da planta e índice de maturação foram obtidos no momento da coleta do material vegetal. A quantificação dos açúcares glicose, frutose e sacarose foi realizada por cromatografia líquida e não mostrou a existência de diferenças no acúmulo desses carboidratos entre as duas variedades. Porém observamos diferenças entre os entrenós maduros e imaturos, indicando que o entrenó considerado imaturo encontra-se em estádio de pleno acúmulo de sacarose. O perfil de expressão proteica, gerado por 2D-PAGE, mostrou 87 e 85 proteínas diferencialmente expressas nos entrenós 5 e 9, respectivamente. Nos entrenós imaturos 12 proteínas foram identificadas como preferencialmente expressas em cada variedade e nos entrenós maduros 11 e 16 proteínas foram identificadas como preferencialmente expressas em Co 740 e SP 80-3280, respectivamente. As proteínas totais dos dois entrenós das duas variedades foram separadas e identificadas via UPLC acoplado a espectrômetro de massas LC-MS/MS com auxílio da base de dados do SUCEST. A caracterização do proteoma dos entrenós foi complementada pela avaliação da localização celular, função molecular e processo biológico a que pertencem todas as proteínas identificadas. Ao todo, foram identificadas 1.493 proteínas localizadas em 19 componentes celulares, com 20 funções metabólicas diferentes, atuantes em 24 processos biológicos e integrantes de 84 vias metabólicas. Deste total, 71 foram classificadas como participantes do metabolismo de carboidratos e encontram-se distribuídas em 21 vias metabólicas, segundo a base de dados KEGG. / Great efforts have been put into sugarcane breeding programs in order to develop new varieties with increased sucrose yield and content. The steps of sucrose metabolism have been focus of research for a long time, but only recently have researchers sought to understand the processes of transport and accumulation of sucrose in sugarcane stem. The objective of this study is characterize the proteome of mature (internode 9) and immature (internode 5) internodes in two genotypes of sugarcane (Co 740 and SP 80-3280), both 12 months old, focusing on the identification of proteins related to the processes of transport and accumulation of sucrose. The height, stem diameter, leaf area, internode moisture, gas exchange, plant water potential and maturation index were all recorded at the time the plant material was collected. The quantification of sugars glucose, fructose and sucrose was performed by liquid chromatography and showed no difference in carbohydrates accumulation between the two varieties. Nevertheless, we observed differences between the mature and immature internodes, indicating that the internode considered immature was actively accumulating sucrose. The protein profile, produced by 2D-PAGE, showed 87 and 85 differentially expressed proteins in internodes 5 and 9, respectively. In immature internodes 12 proteins were identified as being preferentially expressed in each of the varieties and in the mature internodes 11 and 16 proteins were identified as preferentially expressed in Co 740 and SP 80- 3280, respectively. Total proteins of the two internodes of two varieties were separated and identified by UPLC coupled to a mass spectrometer LC-MS/MS using the SUCEST database. The characterization of the internodes proteome was further complemented by evaluating cellular localization, function and molecular biological processes to which all identified proteins belong. Altogether, 1,493 proteins were identified, located in 19 cellular components, with 20 different metabolic functions, operating in 24 biological processes and involving 84 metabolic pathways. Of this total, 71 have been classified as being involved in carbohydrate metabolism and are distributed in 21 metabolic pathways, according to the KEGG database.
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Caracterização do proteoma de entrenós maduros e imaturos de cana-de-açúcar durante o estádio de maturação / Characterization of the proteome of mature and immature internodes from sugarcane during maturation phase of development

Larissa Prado da Cruz 08 October 2012 (has links)
Grandes esforços dos programas de melhoramento genético da cana-de-açúcar são dedicados ao desenvolvimento de novas variedades com maior rendimento e conteúdo de sacarose. As etapas do metabolismo da sacarose têm sido foco de pesquisas há muito tempo, porém apenas recentemente têm-se buscado compreender os processos de transporte e acúmulo da sacarose no colmo da cana-de-açúcar. O objetivo deste trabalho é a caracterização do proteoma de entrenós maduros (entrenó 9) e imaturos (entrenó 5) de dois genótipos de cana-de-açúcar (Co 740 e SP 80-3280), ambos com 12 meses de idade, visando à identificação de proteínas relacionadas aos processos de transporte e acúmulo de sacarose. A altura, diâmetro do colmo, área foliar, umidade dos entrenós, trocas gasosas, potencial hídrico da planta e índice de maturação foram obtidos no momento da coleta do material vegetal. A quantificação dos açúcares glicose, frutose e sacarose foi realizada por cromatografia líquida e não mostrou a existência de diferenças no acúmulo desses carboidratos entre as duas variedades. Porém observamos diferenças entre os entrenós maduros e imaturos, indicando que o entrenó considerado imaturo encontra-se em estádio de pleno acúmulo de sacarose. O perfil de expressão proteica, gerado por 2D-PAGE, mostrou 87 e 85 proteínas diferencialmente expressas nos entrenós 5 e 9, respectivamente. Nos entrenós imaturos 12 proteínas foram identificadas como preferencialmente expressas em cada variedade e nos entrenós maduros 11 e 16 proteínas foram identificadas como preferencialmente expressas em Co 740 e SP 80-3280, respectivamente. As proteínas totais dos dois entrenós das duas variedades foram separadas e identificadas via UPLC acoplado a espectrômetro de massas LC-MS/MS com auxílio da base de dados do SUCEST. A caracterização do proteoma dos entrenós foi complementada pela avaliação da localização celular, função molecular e processo biológico a que pertencem todas as proteínas identificadas. Ao todo, foram identificadas 1.493 proteínas localizadas em 19 componentes celulares, com 20 funções metabólicas diferentes, atuantes em 24 processos biológicos e integrantes de 84 vias metabólicas. Deste total, 71 foram classificadas como participantes do metabolismo de carboidratos e encontram-se distribuídas em 21 vias metabólicas, segundo a base de dados KEGG. / Great efforts have been put into sugarcane breeding programs in order to develop new varieties with increased sucrose yield and content. The steps of sucrose metabolism have been focus of research for a long time, but only recently have researchers sought to understand the processes of transport and accumulation of sucrose in sugarcane stem. The objective of this study is characterize the proteome of mature (internode 9) and immature (internode 5) internodes in two genotypes of sugarcane (Co 740 and SP 80-3280), both 12 months old, focusing on the identification of proteins related to the processes of transport and accumulation of sucrose. The height, stem diameter, leaf area, internode moisture, gas exchange, plant water potential and maturation index were all recorded at the time the plant material was collected. The quantification of sugars glucose, fructose and sucrose was performed by liquid chromatography and showed no difference in carbohydrates accumulation between the two varieties. Nevertheless, we observed differences between the mature and immature internodes, indicating that the internode considered immature was actively accumulating sucrose. The protein profile, produced by 2D-PAGE, showed 87 and 85 differentially expressed proteins in internodes 5 and 9, respectively. In immature internodes 12 proteins were identified as being preferentially expressed in each of the varieties and in the mature internodes 11 and 16 proteins were identified as preferentially expressed in Co 740 and SP 80- 3280, respectively. Total proteins of the two internodes of two varieties were separated and identified by UPLC coupled to a mass spectrometer LC-MS/MS using the SUCEST database. The characterization of the internodes proteome was further complemented by evaluating cellular localization, function and molecular biological processes to which all identified proteins belong. Altogether, 1,493 proteins were identified, located in 19 cellular components, with 20 different metabolic functions, operating in 24 biological processes and involving 84 metabolic pathways. Of this total, 71 have been classified as being involved in carbohydrate metabolism and are distributed in 21 metabolic pathways, according to the KEGG database.
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Curva de maturação de frutos e potencial germinativo de sementes de jabuticaba 'Sabará' (Myrciaria Jaboticaba Berg) / Jabuticaba\'s Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg.) fruits maturation curve and seeds germination power

Coletti, Luana Yoneda 07 February 2013 (has links)
As jabuticabeiras são árvores tipicamente brasileiras, de origem subtropical e tem como principal distribuição o centro sul do país. Dentre elas está a Sabará, a qual é a mais cultivada em todo o país. Sua propagação é realizada basicamente através de sementes, pois métodos de propagação vegetativa ainda são pouco utilizados. Contudo, a enxertia tem se mostrado promissora e a necessidade de porta enxertos bem formados torna-se essencial para o sucesso desta técnica. As sementes de jabuticaba são classificadas com recalcitrantes por serem sensíveis à dessecação o que dificulta seu armazenamento. As jabuticabeiras Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg) são frutas nativas do Brasil, cuja distribuição concentra-se no centro sul do país. Trata-se de uma espécie subtropical com frutos pequenos, de coloração escura e muito doces, sendo utilizados principalmente para a confecção de geleias, licores e vinhos, pois o fruto in natura possui vida de prateleira muito curta, de até dois dias. Fatores externos e de cultivo limitam a produção de frutos e um deles poderia ser a presença de luz solar na maturação do fruto. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influencia da luz solar na maturação do fruto de jabuticaba, através da divisão da planta em quadrantes e se a germinação da semente diminui durante o armazenamento em dois ambientes, geladeira e temperatura ambiente. Para a primeira etapa dividiu-se cinco plantas em quadrantes Norte, Sul, Leste e Oeste, onde foram coletados frutos para a análise físico-química e os parâmetros avaliados foram: o diâmetro, peso do fruto, Brix, acidez titulável, o índice de maturação e pH. Foi observado que apenas para o parâmetro Brix e, consequentemente para o índice de maturação, houve diferença estatística entre o quadrante Sul dos demais. A partir disso pode-se concluir que há influência da luz solar sobre alguns parâmetros de qualidade do fruto de jabuticabeira. Para o armazenamento sementes de jabuticaba Sabará foram coletadas e armazenadas em geladeira (5°C) e temperatura ambiente (~25°C) durante 105 dias em saquinhos de polietileno. Foram postas para germinar aos 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 dias e foram feitas avaliações semanais. Foi possível perceber que não houve diferença estatística entre os dois ambientes, mostrando que se trata de uma semente tolerante a temperaturas baixas para o armazenamento. A partir do teste de secagem foi possível observar o comportamento recalcitrante da semente, pois esta perdeu o poder germinativo com a perda gradual de umidade. Conclui-se, então, que a semente de jabuticaba é recalcitrante, porém classificada como minimamente recalcitrante já que tolerou armazenamento em temperaturas baixas. / Jabuticaba trees are typical Brazilian trees and are mainly distributed in the country\'s center- south. Among them there is Sabará, which is the most spread specie through Brazil. Its propagation is basically made with seeds since the vegetative propagation is still less used. However, grafting seems to be efficient and the necessity of good rootstocks becomes essential to the technique\'s success. Jabuticaba seeds are classified as recalcitrant because they are drying sensible turning the storage difficult. Jabuticaba Sabará trees (Myrciaria jaboticaba Berg) are brazilian native fruits, which are mainly distributed in the country\'s center-south. It is subtropical specie with small fruits, dark colored and very sweet, being used to make jellies, liquors and wines, since in natura fruits are very perishable not lasting two days. This work aimed to evaluate the influence of the sun light in jabuticaba\'s maturation and if the germination decrease during the storage in two different environments. It was possible to notice that during jabuticaba\'s development it was possible to notice that TSS, and consequently the TSS/TTA ratio, was influenced by the position of the fruit on the tree. The south side had lower results compared to the other quadrants, showing that there should be a sunlight influence in some quality parameters in jabuticaba\'s fruits. For storage test jabuticaba\'s seeds were collected and stored in fridge (5°C) and in environmental temperature (~25°C) during 105 days in polyethylene bags. Germination tests were taken at 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 days and weekly evaluations were made. It was possible to notice that there were no differences between both environments, showing that this seed tolerates low storage temperatures. From the drying test it was possible to observe the recalcitrant behavior of the seed, since it lost its germination power with the humidity loss. Therefore, it is possible to conclude that jabuticaba\'s seeds are recalcitrant, however it could be classified as minimally recalcitrant due the fact that it could be stored in low temperatures.
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Curva de maturação de frutos e potencial germinativo de sementes de jabuticaba 'Sabará' (Myrciaria Jaboticaba Berg) / Jabuticaba\'s Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg.) fruits maturation curve and seeds germination power

Luana Yoneda Coletti 07 February 2013 (has links)
As jabuticabeiras são árvores tipicamente brasileiras, de origem subtropical e tem como principal distribuição o centro sul do país. Dentre elas está a Sabará, a qual é a mais cultivada em todo o país. Sua propagação é realizada basicamente através de sementes, pois métodos de propagação vegetativa ainda são pouco utilizados. Contudo, a enxertia tem se mostrado promissora e a necessidade de porta enxertos bem formados torna-se essencial para o sucesso desta técnica. As sementes de jabuticaba são classificadas com recalcitrantes por serem sensíveis à dessecação o que dificulta seu armazenamento. As jabuticabeiras Sabará (Myrciaria jaboticaba Berg) são frutas nativas do Brasil, cuja distribuição concentra-se no centro sul do país. Trata-se de uma espécie subtropical com frutos pequenos, de coloração escura e muito doces, sendo utilizados principalmente para a confecção de geleias, licores e vinhos, pois o fruto in natura possui vida de prateleira muito curta, de até dois dias. Fatores externos e de cultivo limitam a produção de frutos e um deles poderia ser a presença de luz solar na maturação do fruto. O objetivo deste trabalho foi avaliar a influencia da luz solar na maturação do fruto de jabuticaba, através da divisão da planta em quadrantes e se a germinação da semente diminui durante o armazenamento em dois ambientes, geladeira e temperatura ambiente. Para a primeira etapa dividiu-se cinco plantas em quadrantes Norte, Sul, Leste e Oeste, onde foram coletados frutos para a análise físico-química e os parâmetros avaliados foram: o diâmetro, peso do fruto, Brix, acidez titulável, o índice de maturação e pH. Foi observado que apenas para o parâmetro Brix e, consequentemente para o índice de maturação, houve diferença estatística entre o quadrante Sul dos demais. A partir disso pode-se concluir que há influência da luz solar sobre alguns parâmetros de qualidade do fruto de jabuticabeira. Para o armazenamento sementes de jabuticaba Sabará foram coletadas e armazenadas em geladeira (5°C) e temperatura ambiente (~25°C) durante 105 dias em saquinhos de polietileno. Foram postas para germinar aos 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 dias e foram feitas avaliações semanais. Foi possível perceber que não houve diferença estatística entre os dois ambientes, mostrando que se trata de uma semente tolerante a temperaturas baixas para o armazenamento. A partir do teste de secagem foi possível observar o comportamento recalcitrante da semente, pois esta perdeu o poder germinativo com a perda gradual de umidade. Conclui-se, então, que a semente de jabuticaba é recalcitrante, porém classificada como minimamente recalcitrante já que tolerou armazenamento em temperaturas baixas. / Jabuticaba trees are typical Brazilian trees and are mainly distributed in the country\'s center- south. Among them there is Sabará, which is the most spread specie through Brazil. Its propagation is basically made with seeds since the vegetative propagation is still less used. However, grafting seems to be efficient and the necessity of good rootstocks becomes essential to the technique\'s success. Jabuticaba seeds are classified as recalcitrant because they are drying sensible turning the storage difficult. Jabuticaba Sabará trees (Myrciaria jaboticaba Berg) are brazilian native fruits, which are mainly distributed in the country\'s center-south. It is subtropical specie with small fruits, dark colored and very sweet, being used to make jellies, liquors and wines, since in natura fruits are very perishable not lasting two days. This work aimed to evaluate the influence of the sun light in jabuticaba\'s maturation and if the germination decrease during the storage in two different environments. It was possible to notice that during jabuticaba\'s development it was possible to notice that TSS, and consequently the TSS/TTA ratio, was influenced by the position of the fruit on the tree. The south side had lower results compared to the other quadrants, showing that there should be a sunlight influence in some quality parameters in jabuticaba\'s fruits. For storage test jabuticaba\'s seeds were collected and stored in fridge (5°C) and in environmental temperature (~25°C) during 105 days in polyethylene bags. Germination tests were taken at 7, 14, 21, 28, 42, 56, 70 e 105 days and weekly evaluations were made. It was possible to notice that there were no differences between both environments, showing that this seed tolerates low storage temperatures. From the drying test it was possible to observe the recalcitrant behavior of the seed, since it lost its germination power with the humidity loss. Therefore, it is possible to conclude that jabuticaba\'s seeds are recalcitrant, however it could be classified as minimally recalcitrant due the fact that it could be stored in low temperatures.

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