Submitted by Rosana Amâncio (rosana.amancio@ufcg.edu.br) on 2018-07-11T20:50:26Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Thamara - Capa Dura.pdf: 2260125 bytes, checksum: 530ae87f1e4a9200aafe1cb3102cff39 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-11T20:50:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação Thamara - Capa Dura.pdf: 2260125 bytes, checksum: 530ae87f1e4a9200aafe1cb3102cff39 (MD5) Previous issue date: 2016-08-19 / CNPq / A gomose, provocada principalmente pelo oomiceto Phytophthora parasitica, é uma das mais graves doenças que acometem culturas de citros no âmbito mundial. Durante a interação, plantas induzem cascatas de sinalização a fim de induzir respostas de defesa. Contudo, P. parasitica secreta proteínas efetoras capazes de modular estas respostas por parte do hospedeiro, a fim de promover a infecção. No gênero Citrus, espécies comercialmente importantes são suscetíveis a infecção por este patógeno e a resistência a gomose é encontrada na espécie de citros Poncirus trifoliata. Considerando a escassez de informações acerca do patossistema citros-P. parasitica, o presente trabalho objetivou analisar, por meio de RT-qPCR, a expressão quantitativa de genes efetores apoplásticos e citoplasmáticos de P. parasitica e da cascata de defesa em citros, durante interações com espécies suscetíveis e resistentes, Citrus sunki e P. trifoliata, respectivamente. Dos 17 genes efetores estudados, 10 apresentaram expressão quantitativa relativa diferencial ao nível de significância induzida em P. parasitica após inoculação em raízes de P. trifoliata, sendo 06 apoplásticos e 04 citosólicos. Os perfis de expressão dos 17 genes efetores de P. parasitica apresentaram dois picos máximos de expressão, indicativos da síntese de novo desses genes ao longo dos pontos temporais de interação, sendo o acúmulo dos transcritos mais precoce sobre P. trifoliata (as 6 h.a.i.) e mais tardio sobre C. sunki (as 96 h.a.i.). Os elevados níveis de expressão de genes efetores em P. parasitica induzidos por C. sunki as 96 h.a.i. devem corresponder a fase necrotrófica de vida do oomiceto, consequentemente devido ao sucesso na penetração das células vegetais suscetíveis e acúmulo de biomassa do patógeno. A presença de hifas intracelulares no córtex de raízes de C. sunki foi abundantemente visualizada em micrografias as 96 h.a.i., a qual deve ocorrer como consequência da suscetibilidade da planta ao patógeno. Seis grupos hierárquicos de genes co-regulados foram formados a partir dos perfis de expressão dos 17 genes efetores em P. parasitica, os quais são reagrupados de modo diferente de acordo com a interação com C. sunki ou com P. trifoliata, indicando que o patógeno foi capaz de reconhecer entre hospedeiros suscetível ou resistente e sintetizar seletivamente quais efetores e em que intensidade devem ser segregados. As raízes de C. sunki expressaram 10 componentes de cascatas de resistência mediada pelo SA em resposta não bem-sucedida a infecção por P. parasitica. A supressão por P. parasitica da expressão de 05 genes de cascatas de resistência mediada pelo SA foi observada em raízes de P. trifoliata e deve indicar tentativas do patógeno de burlar com a imunidade da planta. Entretanto, a resistência de P. trifoliata a P. parasitica não deve utilizar genes envolvidos na cascata de resistência mediada pelo SA, mas sim genes PR-5 e calose sintase, envolvendo barreiras bioquímicas e estruturais. Portanto, o presente trabalho fornece uma nova visão para o entendimento acerca do processo de modulação de efetores de P. parasitica em interações suscetíveis e resistentes e, a maneira como estes hospedeiros respondem mediante interação / The gummosis, mainly caused by the oomycete Phytophthora parasitica, is one of the most serious diseases affecting citrus crops worldwide. During the interaction, plants induce signaling cascades in order to induce defense responses. However, P. parasitica secrets effector proteins capable of modulating these host responses in order to promote the infection. In Citrus genus, commercially important species are susceptible to infection by this pathogen and the gummosis resistance is achieved in Poncirus trifoliata citrus species. Considering the lack of information on citrus-P. parasitica pathosystem, this study aimed to analyze, through RT-qPCR, the quantitative expression of P. parasitica effector and citrus defense genes during citrus-P. parasitica susceptible and resistant interactions, with Citrus sunki and P. trifoliata, respectively. As results, P. parasitica was able to recognize among susceptible or resistant host and selectively synthesize which effectors and in that intensity should be expressed. Of the 17 studied effector genes, 10 showed quantitative relative differential expression at significance level induced in P. parasitica after inoculation in trifoliate orange roots, being 06 apoplastics and 04 cytosolics. The expression profiles for the 17 effector genes in P. parasitica had two maximum peaks of expression, that are indicative of de novo synthesis of these genes along the time points of interaction, showing transcript accumulation earlier on P. trifoliata (at 6 h.a.i.) and later on C. sunki (at 96 h.a.i.). High levels of the effector gene expression in P. parasitica induced by C. sunki at 96 h.a.i. must match the necrotrophic phase of life of this oomycete, consequently due to their successful penetration into the susceptible plant cells and pathogen biomass accumulation. The presence of intracellular hyphae in cortex of C. sunki roots was abundantly visualized in the micrographs at 96 h.a.i., which may occur as a result of the plant susceptibility to the pathogen. Six hierarchical groups of co-regulated genes were formed from the expression profiles of the 17 effector genes in P. parasitica, which are grouped differently according to interact with C. sunki or P. trifoliata, indicating that the pathogen was able to recognize between susceptible or resistant host and selectively synthesize which effectors and in that intensity should be segregated. The roots of C. sunki expressed 10 components of the cascade resistance mediated by SA in response not successful to P. parasitica infection. The suppression by P. parasitica of the expression of 05 genes of the cascade resistance mediated by SA was found in P. trifoliata roots, and must indicate pathogen attempts to circumvent with the immunity of the plant. However, P. trifoliata resistance to P. parasitica should not use genes involved in the resistance cascade mediated by SA, but instead PR-5 and callose synthase genes, involving biochemical and estructural barriers. In conclusion, this study provides a new insight into the understanding of the effectors of modulation process of P. parasitica in susceptible and resistant interactions and how these hosts respond through interaction.

The papaya culture is extensively cultivated in the world, where Brazil meets as worldwide the producing greater. Amongst the problems main inherent to the culture, the root and fruit rots are distinguished, caused by Phytophthora palmivora. The present work had for objective to control P. palmivora in seedling of papaya cv. Sunrise solo, through methods of biological, physical and chemical control. They had been tested four Trichoderma isolated (T. koningii - T3; T. harzianum - T13; Trichoderma sp. - T152D and T. polysporum - TP) and five fungicides "in vitro" (copper oxychloride - 2; 3 e 4g/L; mancozeb - 2; 3 e 4g/L; metalaxyl + mancozeb - 2,5; 3,5 e 4g/L; thiophanate-methyl - 6; 7 e 8g/L and carbendazim - 0,5; 1,0 e 1,5mL/L) and "in vivo", as well as the solarization of the substratum in solar collectors. They had been made still, test of volatile, not volatile metabolites and hyperparasitism for the Trichoderma isolated. In the biological control "in vitro", used the plate technique, while in the in vivo control, the substratum was dealt with Trichoderma of isolated and integrated form, before the infestation of the ground. In the chemical control, the fungicides had been tested "in vitro" adding them in BDA medium, while "in vivo" the seedlings roots had been immersed during 10 minutes in the fungicides solution. The solarization of the substratum was carried during 24, 48 and 72 hours, in solar collectors of 10 and 15 cm of diameter, becoming infested itself, previously the substratum with the pathogen (40 mL of inocule with approximately 20 sporangia for mL/ vase). The Trichoderma isolated T3, T13 and TP had been most efficient in the inhibition of the growth of P. palmivora "in vitro", however, only the isolated TP produced volatile and not volatile metabolites. On the other hand, all the isolated ones had presented capacity to hyperparasite the pathogen. In the biological control "in vivo" no isolated one was capable to reduce the severity of the disease. The solarization of the substratum increased significantly the seedlings survival, when compared to the witness. It didn t have significant differences between the periods of solar exposition, however, the diameter of 15 cm presented one better efficiency, with 87% of seedlings survival. The products most efficient in the pathogen inhibition "in vitro" had been oxicloreto de cobre, mancozeb and metalaxyl + mancozeb, while "in vivo" the five fungicides had presented similar efficiency, not having significant difference between the dosages tested. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A cultura do mamoeiro é extensamente cultivada no mundo tendo o Brasil como o maior produtor. Dentre os principais problemas inerentes à cultura, destacam-se as podridões do pé e do fruto, causadas por Phytophthora palmivora. O presente trabalho teve por objetivo avaliar o controle de P. palmivora em plântulas de mamoeiro cv. Sunrise solo, utilizando métodos de controle biológico, físico e químico. Foram testados quatro isolados de Trichoderma (T. koningii - T3; T. harzianum - T13; Trichoderma sp. - T152D e T. polysporum - TP) e cinco fungicidas in vitro (oxicloreto de cobre - 2; 3 e 4g/L; mancozeb 2; 3 e 4g/L; metalaxyl + mancozeb 2,5; 3,5 e 4g/L; tiofanato metílico 6; 7 e 8g/L; e carbendazim 0,5; 1,0 e 1,5mL/L) e in vivo na dosagem recomendada pelo fabricante, bem como a solarização do substrato em coletores solares. Foram feitos ainda, testes de metabólitos voláteis, não voláteis e hiperparasitismo para os isolados de Trichoderma. No controle biológico in vitro , utilizou-se a técnica de confrontamento em cultivo pareado, enquanto no controle in vivo , o substrato foi tratado com os isolados de Trichoderma de forma isolada e integrada, antes da infestação do solo com o patógeno. No controle químico, os fungicidas foram testados in vitro adicionando-os ao meio BDA, enquanto in vivo as raízes das plântulas foram imersas durante 10 minutos na solução dos fungicidas. A solarização do substrato foi realizada durante 24, 48 e 72 horas, em coletores solares de 10 e 15 cm de diâmetro, infestando-se, previamente o substrato com o patógeno (40 mL do inoculo com aproximadamente 20 esporângios por mL / vaso). Os isolados de Trichoderma T3, T13 e TP foram os mais eficientes na inibição do crescimento de P. palmivora in vitro , no entanto, apenas o isolado TP produziu metabólitos voláteis e não voláteis. Por outro lado, todos os isolados apresentaram capacidade de hiperparasitar o patógeno. Já no controle biológico in vivo nenhum isolado foi capaz de reduzir a severidade da doença. A solarização do substrato aumentou significativamente a sobrevivência das plântulas quando comparada à testemunha. Não houve diferenças significativas entre os períodos de exposição solar, entretanto, o diâmetro de 15 cm apresentou uma melhor eficiência, com 87% de sobrevivência das plântulas. Os produtos mais eficientes na inibição do patógeno in vitro foram oxicloreto de cobre, mancozeb e metalaxyl + mancozeb, enquanto in vivo os cinco fungicidas apresentaram eficiência semelhante, não havendo diferença significativa entre as dosagens testadas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-17T12:56:22Z No. of bitstreams: 1 Giltemberg Macedo Tavares.pdf: 1201827 bytes, checksum: f3dc6ee4db4cb245f2d3cd6c71898ad7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T12:56:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Giltemberg Macedo Tavares.pdf: 1201827 bytes, checksum: f3dc6ee4db4cb245f2d3cd6c71898ad7 (MD5) Previous issue date: 2009-03-10 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Brazil is the main papaya’s producer in the world (Carica papaya L.) and it occupies the first position producing 1,65 million tones, thus, it is an important production with economic and social value, and, in this meaning, Bahia stands out as the largest producing state with a Brazilian production of 724 tons. Many diseases cause damage to the crop by increasing the cost of production, in some cases limiting the exploitation of that production, among those we can highlight diseases like papaya root damage caused by Phytophthora palmivora. This present study aimed: 1) to achieve the level of infestation of P. palmivora in soils of plantations of papaya commercial in the Extreme South of Bahia, to better support the measures of control; 2) ) to evaluate the action of biotic and abiotic inducers in order to increase the root rot in seedlings of papaya inoculated with P. palmivora, in the activity of enzymes of defense, 1,3-glucanase, peroxidase and chitinase, as well as the lignin content of roots; and 3) to analyze the effect of species of Trichoderma spp. on control of P. palmivora etiologic agent of root rot of papaya. In evaluating of the results of infestation of the soil of papaya orchards, it was showed that in those 33 areas assessed, only two of them, the presence of P. palmivora was not found. There was also no significant differences (p <0.05) for incidence of that pathogen, as those varieties of papaya grown in samples soil evaluated. In all eight municipalities that had sampled orchards the presence of the pathogen was detected, and it showed its wide distribution in the Extreme South of Bahia. To evaluate the control of foot rot in papaya seedlings, it was noted that the treatments using ASM, except the dosage 0.15 g / L 6 days before inoculation, showed levels of larger control to the other inductors. Plants sprayed with ASM showed increased activity of peroxidase and -1,3-glucanase and a highest concentration of lignin in relation to the witness. However,these treatments have no effect on the activity of chitinase. The ASM is a potential inducer of resistance to P. palmivora for using it in the management of root rot of papaya. As the assessment of agents of biocontrol happened it was noted that as using 33 isolated of Trichoderma only 2 isolated (T70 - T. harzianum, T68 - T. virens) did not differ statistically from that treatment with the standard fungicide and showed the percentage of survival of 58.3 and 52.4 respectively. The effect of these two isolated of Trichoderma on increase of dry mass and fresh in seedlings of papaya was also evaluated and it was noted that those two isolates showed higher increases in these parameters when compared with witness. The isolated T70 and T68 showed an increase of fresh and dry mass total of 110, 73% and 59; 59% respectively, compared with those witnesses only planted in the soil. The isolates of T. harzianum and T. virens presented potential with biocontrol agent of P. palmivora for being used in the management of root rot of papaya. / O Brasil é o principal produtor de mamão (Carica papaya L.) do mundo ocupando a primeira posição com uma produção de 1,65 milhão de toneladas, sendo assim, uma importante cultura tanto de valor econômico como social, e a Bahia se destaca como o maior Estado produtor brasileiro com uma produção de 724 mil toneladas. Várias doenças causam danos à cultura aumentando o custo de produção, sendo em alguns casos limitantes a exploração da cultura, dentre essas doenças podemos destacar a podridão do pé do mamoeiro causada por Phytophthora palmivora. Os objetivos do presente estudo foram: 1) realizar o nível de infestação de P. palmivora em solos de plantações de mamoeiros comerciais na região Extremo Sul da Bahia, para melhor subsidiar as medidas de controle; 2) avaliar a ação de indutores biótico e abióticos na redução da podridão de raízes em mudas de mamoeiro inoculadas com P. palmivora, na atividade das enzimas de defesa, 1,3-glucanase, peroxidase e quitinase, assim como no teor de lignina dasraízes; e 3) avaliar o efeito de espécies de Trichoderma spp. sobre controle de P. palmivora agente etiológico da podridão radicular do mamoeiro. Para a avaliaçãos dos resultados de infestação do solo de pamares de mamoeiro observou-se que das 33 áreas avaliadas apenas em duas não se constatou a presença de P. palmivora. Também não houve diferenças significativas (p<0,05) para incidência do patógeno, quanto às variedades de mamoeiro plantadas nas amostras de solos avaliados. Em todos os oito municípios que tiveram pomares amostrados foi detectada a presença do patógeno, atestando sua ampla distribuição no Extremo Sul da Bahia. Para avaliação do controle da podridão do pé em mudas de mamoeiro constou-se que os tratamentos com ASM, com exceção da dosagem 0,15 g/L 6 dias antes da inoculação, apresentaram níveis de controle supeiores aos demais indutores. Plantas pulverizadas com ASM apresentaram aumento deatividade da peroxidase e 1,3-glucanase e maior concentração de lignina em relação à testemunha. No entanto, estes tratamentos não tiverem efeito sobre a atividade da quitinase. O ASM é um potencial indutor de resistência a P. palmivora para ser usado no manejo da podridão de raízes do mamoeiro. Quanto a avaliação dos agentes de biocontrole observdos ou-se que 33 isolados de Trichoderma utilizados apenas 2 isolados (T70 - T. Harzianum, T68 - T. virens) não diferiram estatisticamente do tratamento com o fungicida padrão, apresentaram o percentual de sobrevivência de 58,3 e 52,4 respectivamente. Foi avaliado também o efeito destes dois isolados de Trichoderma sobre incremento de massa seca e fresco em mudas de mamoeiro e contatou-se que dois isolados apresentaram maiores aumentos nestes dois parâmetros quando comparados com testemunha. O isolado T70 e T68 de apresentaram um incremento de massa fresca e seca total de 110; 73% e 59; 59% respectivamente, comparados com a testemunha apenas plantadas no solo. Os isolados de T. harzianum e T. virens apresentaram potencial com agente biocontroladorde P. palmivora para ser usado no manejo da podridão de raízes do mamoeiro.