Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-25Bitstream added on 2014-06-13T18:58:31Z : No. of bitstreams: 1 gabriel_js_me_sjrp_parcial.pdf: 216992 bytes, checksum: bbc625daf5b4deae2f711159759b17f1 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-02-04T11:39:22Z: gabriel_js_me_sjrp_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-02-04T11:40:09Z : No. of bitstreams: 1 000713818.pdf: 6444616 bytes, checksum: d678f998fb14745c7aacc63852bd136f (MD5) / No presente trabalho foi realizada a síntese e caracterização de derivados de quitosana que tiveram suas atividades antifúngicas testadas contra os fungos Aspergillus flavus e A. parasiticus. As quitosanas utilizadas nas sínteses foram obtidas da desacetilação heterogênea de quitosana comercial e da quitosana comercial de média massa molecular. Os graus médios de desacetilação ( ) da quitosana desacetilada (CH) e da quitosana de média massa molecular desacetilada (CHm) foram determinados pelas técnicas de Potenciometria e Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear de Hidrogênio (RMN-H). Parte da quitosana desacetilada CH foi degradada para obtenção de polímeros de baixa massa molecular (CHD). As massas moleculares médias das quitosanas CHm, CH e CHD foram determinadas por viscosimetria e os valores obtidos foram 42,93 kDa, 15,22 kDa e 610,79 Da, respectivamente. Os derivados hidrofílicos foram obtidos pela reação das quitosanas CHm, CH e CHD com cloreto de 2-cloro-N,N-dietilaminoetila (DEAE). Os graus de substituição (GS) de grupos DEAE de CHm, CH e CHD foram determinados utilizando-se RMN-H e os valores obtidos foram 14, 30 e 43%, respectivamente. Na sequência, as quitosanas CHm14DEAE, CH30DEAE e CHD43DEAE foram alquiladas com dodecil aldeído seguido pela redução com cianoboroidreto de sódio, obtendo-se derivados com diferentes graus de substituição. Os graus de substituição por grupos dodecila (GDD) para a quitosana contendo 14% de grupos DEAE foram 2,5, 10 e 14%. Para a quitosana com 30% de DEAE os graus de substituição por dodecila foram 2,7, 10 e 19%. Para o derivado contendo 43% de DEAE os graus de substituição por dodecila foram 5, 28 e 39%. Além da Espectroscopia de RMN-H o sucesso da obtenção dos derivados anfifílicos também foi indicado por meio da... / In this study, it was done the synthesis and characterization of chitosan derivatives, that had their antifungal activity tested against Aspergillus flavus and A. parasiticus. The chitosan used for the syntheses was obtained from heterogeneous deacetylation of the commercial chitosan and commercial chitosan of average molecular mass. The average degrees of deacetylation ( ) of chitosan (CH) and deacetylated chitosan of medium molecular weight (CHm) were determined by Potentiometry and techniques Spectroscopy Hydrogen Nuclear Magnetic Resonance (H-NMR). Part of deacetylated chitosan CH was degraded to obtain low molecular weight polymers (CHD). The average molecular weights of chitosans CHm, CH and CHD were determined by viscometry, and the values obtained were 42.93 kDa, 15.22 kDa and 610.79 Da, respectively. Hydrophilic derivatives were obtained by reaction of chitosan CHm, CH, CHD with chloride 2-chloro-N,N-diethylaminoethyl (DEAE). The degrees of substitution (DS) by DEAE groups of CHm, CH and CHD were determined by H-NMR and the values obtained were 14, 30 and 43%, respectively. After that the chitosans CHm14DEAE, CH30DEAE and CHD43DEAE were alkylated with dodecyl aldehyde followed by reduction with sodium cyanoborohydride to yield derivatives with different degrees of substitution. The degrees of substitution by dodecyl groups (GDD) for the chitosan containing 14% of DEAE groups were 2.5, 10 and 14%. For chitosan with 30% of DEAE the degrees of substitution by dodecyl groups were 2.7, 10... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:06Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-01-18Bitstream added on 2014-06-13T19:17:16Z : No. of bitstreams: 1 pedro_ro_me_sjrp_parcial.pdf: 308733 bytes, checksum: 9891c3253677398a2eaeee4aa835dae4 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-02-09T14:35:39Z: pedro_ro_me_sjrp_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-02-09T14:36:20Z : No. of bitstreams: 1 000713827.pdf: 1107831 bytes, checksum: 7123832b50b5229b5f6397201b89b8a2 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-02-09T17:15:02Z: 000713827.pdf,Bitstream added on 2015-02-09T17:15:39Z : No. of bitstreams: 1 000713827.pdf: 1107831 bytes, checksum: 7123832b50b5229b5f6397201b89b8a2 (MD5) / Os fungos do gênero Aspergillus, presentes em amendoins, milho, arroz, nozes e outros grãos, são uma constante preocupação nos dias atuais devido a sua capacidade de produzir toxinas cancerígenas. Dentre as várias técnicas de controle desse microrganismo, tem se destacado o uso de produtos naturais, não agressivos ao meio ambiente e de baixo custo, como por exemplo, a quitosana. O presente trabalho apresenta a síntese e caracterização de duas séries de novos derivados de quitosana para utilização como biofungicida contra os fungos Aspergillus flavus e Aspergillus parasiticus. A primeira série descreve a síntese de derivados de quitosana pela reação de quitosana desacetilada (QD) com brometo de propil (Q-Propil) pentil (Q-Pentil) trimetilamônio para obter derivados com proporções crescentes do grau de substituição (GS). A segunda série foi obtida a partir da síntese de sais bi-quaternários de amônio, com a posterior reação com quitosana desacetilada obtendo-se derivados bi-quaternários de quitosana. Todos os derivados foram caracterizados por técnicas de RMN 1 H, infra-vermelho (IR) e titulação potenciométrica e as suas atividades fungicidas testadas contra o crescimento micelial dos fungos A. flavus e A. parasiticus in vitro. Os estudos foram conduzidos variando-se a acidez e a força iônica do meio. Os resultados dos ensaios microbiológicos mostram que as atividades antifúngicas aumentam com o grau de substituição e os derivados mais substituídos de ambas as series, propil e pentil, exibiram respectivamente atividades três e seis vezes maiores que as quitosanas comercial e desacetilada. As concentrações inibitórias mínimas foram avaliadas após 24, 48 e 72 horas, variando-se a concentração dos polímeros de 0,5 a 16 g L -1 e os resultados mostraram que os derivados quaternários inibem o crescimento... / The fungi of the genus Aspergillus, present in peanuts, corn, rice, nuts and other grains, are a constant concern nowadays due to its ability to produce carcinogenic toxins. Among the various techniques for controlling this microorganism it has been emphasized the use of natural products not harmful to the environment and at a low cost, for example, chitosan. This paper presents the synthesis and the characterization of two series of novel derivatives of chitosan for use as biofungicide against the Aspergillus flavus and Aspergillus parasiticus fungi. The first series of derivatives was synthesized by the reaction of deacetylated chitosan (QD) propyl bromide (Q-Propil) and pentyl trimethylammonium (Q-Pentil) for obtaining derivatives with increasing degrees of substitution (GS). The second series was obtained from the synthesis of bi-quaternary salts, with subsequent reaction with deacetylated chitosan to yield bi-quaternary derivatives of chitosan (Q-BPHD). All derivatives were characterized using NMR techniques, infra-red (IR) and potentiometric titration and fungicides activities were tested against A. flavus and A. parasiticus by evaluating the mycelial growth of fungi in vitro. The studies were conducted by varying the acidity and ionic strength of the medium. The antifungal activities increase with the degree of substitution and the most substituted derivatives from both series, propyl and pentyl, respectively exhibited activities three to six times lighter than the commercial and deacetylated chitosans. The minimum inhibitory concentrations were recorded after 24, 48 and 72 hours varying the concentration of polymer from 0.5 to 16 g L -1 and the results showed that the quaternary derivatives inhibit the growth of fungi in concentrations four times lower than deacetylated chitosan . The bi-quaternary derivative (Q-BPHD) showed the... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Francisco Maugeri Filho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-18T19:03:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 VilocheBazan_JuanHeraldo_M.pdf: 4323076 bytes, checksum: c173b7a1393c3663a354336fee533b4c (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: Este trabalho consiste na obtenção "in vitro" de dextrana clínica a partir da sacarose utilizando a enzima dextrana-sacarase obtida pela fermentação do Leuconostoc mesenteroides linhagem NRRL B512-F. A dextrana clínica, de peso molecular médio 40.000 daltons, tem sua aplicação consagrada como expansor volumétrico de sangue humano. A enzima foi produzida por fermentação e purificada usando ultrafiltração, separada com o uso de polietilenoglicol de peso molecular 1500 daltons e estocada a -10°C. O estudo da produção de dextrana clínica foi feito obedecendo 2 etapas de síntese, sendo que para cada uma delas foi realizado um delineamento experimental. No primeiro usou-se maltose como aceptor e no segundo dextrana de peso molecular 4676 daltons. O objetivo dó primeiro delineamento foi otimizar as condições para obtenção de dextrana de peso molecular próximo a 5000 daltons e no segundo para obtenção da dextrana clínica propriamente dita. Determinou-se o rendimento e a distribuição de pesos moleculares da dextrana produzida por um sistema de cromatografia de permeação em gel (HPLC). Os resultados do processo de síntese enzimática de dextrana, foram utilizados' ,para obtenção dos modelos de rendimento e distribuição de pesos moleculares em função da concentração de sacarose, relação R ([aceptor]/[sacarose]) e temperatura. Através da metodologia de superfície de resposta conclui-se que a concentração de sacarose é a variável que mais influencia no processo de síntese enzimática de dextrana. Os parâmetros, para produzir dextrana em torno de 40.000 daltons com maior rendimento, foram altas concentrações de sacarose (133,6 g/l), altos valores da relação R (0.0384)e baixas temperaturas (18.3°C). / Abstract: This study consists of the "in vitro" production of clinical dextran from sucrose using the enzyme dextransucrase obtained from Leuconostoc mesenteroides NRRl B512-F. Clinical dextran, whose average molecular weight is 40,000 daltons, is extensively used as a volume expander of human blood. The enzyme was produced by fermentation; purified by ultracentrifugation, separated using polyethylene glycol (mol. weight 1500 daltons) and stored at -10°C. The study of the production of clinical dextran was carried out according to the two steps of synthesis, an experimental design being produced for each step. In the first step maltose was used as an acceptor and in the second, dextran with a molecular weight of 4676 daltons. The objective of the first design was to optimize the conditions to obtain dextran with a molecular weight of about 5000 daltons, and the second design ained at obtaining the actual clinical dextran. The yield and the molecular weight distribution of the dextran produced was determined by a high performance gel permeation chromatography system (HPLC). The results of the process for the enzymatic synthesis of dextran were used to obtain models for the yield and the molecular weight distribution as conditions of sucrose concentrations, the ratio R and temperature. Using surface response methodology, it was conclucted that the sucrose concentration was the variable that most affected . the enzymatic synthesis of dextran. The parameters required to produced greater yields of dextran with a molecular weight of about 40,000 daltons were: high concentrations of sucrose (133,7 g/l), low temperatures (18,3°C) and high values to the relationship R (acceptor]/[sucrose]) of 0,0384. / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos

Orientador: Antônio Carlos Guastaldi / Banca: Sandra Helena Pulcinelli / Banca: Luis Geraldo Vaz / Banca: Jorge Enrique Rodriguez Chanfrau / Banca: Gildásio de Cerqueira Daltro / Resumo: A engenharia de tecidos é um campo que aplica os princípios de engenharia e ciências biológicas para desenvolver substitutos biológicos que restauram, mantém ou melhoram o tecido ou a função do órgão por inteiro. A presente tese estudou arcabouços (scaffolds) produzidos com celulose bacteriana/fosfato de cálcio voltados para a regeneração óssea. Foram analisados a modificação do processo de fermentação da celulose bacteriana com moléculas naturais (sulfato de condroitina e ácido hilaurônico), modificações físicas superficiais empregando-se irradiação gamma na celulose bacteriana e método biomimético para formação de fosfato de cálcio na superfície da membrana, posteriormente foram testados os biomateriais com células do ovário de hamster chineses (CHO-K1 cells). A modificação com moléculas naturais alterou a carga superficial e a cristalinidade das membranas, a modificação física alterou também propriedades físico-químicas de superfície, interferindo no processo de deposição de fosfato de cálcio. Os fosfatos de cálcio testados pelo método biomimético (SBFs 1 e 3), tiveram resultados melhores quanto a sua incorporação na superfíce das membranas não irradiadas de celulose bacteriana e seus nanocompósitos. / Doutor

Orientador: José Luiz Laus / Coorientador: Alvio Isao Shiguematsu / Banca: Andreia Vitor Couto do Amaral / Banca: Antonio Carlos Alessi / Banca: Jayter Silva de Paula / Banca: Noeme Sousa Rocha / Resumo: A córnea atua como principal elemento refrativo do olho, para tal tem que manter-se transparente. O endotélio corneal é um peça chave para essa manutenção, possuindo mecanismos como a bomba de Na+ e K+ que ajudam a garantir a desturgescência corneal. Descompensações endoteliais constituem uma importante indicação de transplante da córnea, uma vez que as células endoteliais corneais apresentam limitada capacidade proliferativa. Entretanto, transplantes são procedimentos cirúrgicos complicados e de elevado custo. Alternativas e coadjuvantes medicamentosos vêm sendo estudadas. O fucoidam é uma substância que, dentre outras propriedades, promove migração e proliferação celular, portanto objetivou-se, com a presente pesquisa, avaliar seus efeitos sobre a morfologia, a ploidia e o metabolismo de células endoteliais da córnea de coelhos, após criolesão experimental. Para tal, foram realizadas avaliações quanto à morfologia e viabilidade celular empregando-se dupla marcação com corantes vitais (alizarina vermelha e azul de tripan) e ultraestrutural pela microscopia eletrônica de transmissão e de varredura. Outrossim, avaliou-se a morfometria in vivo e in vitro de seguintes parâmetros: número de células, densidade, hexagonalidade e coeficiente de variação celulares. Estudou-se o metabolismo dessas células empregando-se a imunofluorescência com observação em confocal dos anticorpos Ki-67, Na+K+/ATPase, n-Caderina e Zo-1, conjugados com Alexafluor-488. Visando-se a conseguirem conhecime... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cornea as the main refractive element of the eye, which has to remain transparent. The corneal endothelium is a key piece for this maintenance, having mechanisms such as the Na + and K + pump that help to ensure corneal dysurgescence. Endothelial decompensations are an important indication for corneal transplantation, since the corneal endothelial cells have limited proliferative capacity. However, transplants are complicated and expensive surgical procedures. Alternatives and drug coadjuvants have been studied. Fucoidam is a substance that, among other properties, promotes cell migration and proliferation, therefore, the objective of this research was to evaluate its effects on the morphology, ploidy and metabolism of rabbit cornea endothelial cells after experimental cryoinjury. For this, evaluations were made for morphology and cell viability using double labeling with vital dye (alizarin red and tripan blue) and ultrastructural analysis by transmission and scanning electron microscopy. Morphometry (in vivo and in vitro) of the following parameters were also evaluated: cell number, cell density, hexagonality and coefficient of variation. The metabolism of these cells was studied using immunofluorescence with confocal observation of the Ki-67, Na + K + / ATPase, n-Caderin and Zo-1 antibodies, conjugated to Alexafluor-488. In order to obtain additional knowledge regarding the nuclear activity during the healing process of the corneal endothelium in the presence of fucoidam were analyzed, from the feulgen reaction, nuclear perimeter and area, in addition to the chromatin supraorganization. Cryoinjury resulted in worsening of all morphometric parameters, with cell decrease, cell density, the percentage of standard cells with 6 sides and increase in coefficient of variation, the recovery to normal values with time was better in eyes tre... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Maria de Lourdes Corradi Custodio da Silva / Banca: Beatriz Eleutério Goi / Banca: Cesar Augusto Tischer / Resumo: O fungo Rhizoctonia solani, é um fitopatógeno que ataca diversas culturas, provocando o tombamento de plântulas. Há vários estudos visando o combate deste micro-organismo, no entanto, não há relatos da composição química de sua biomassa. De acordo com a literatura a biomassa fúngica pode ser uma fonte promissora de moléculas para aplicação em ensaios biológicos. A partir disso, um estudo inédito da composição química da biomassa do R. solani, principalmente em relação aos polissacarídeos, foi realizado. O micro-organismo foi cultivado em meio mínimo de Vogel com glucose como fonte de carbono. A biomassa resultante de vários cultivos foi tratada consecutivamente com etanol (1:20 m/v, 78 °C, 12h, 1x), e água destilada a quente (1:20 m/v, 100 °C, 4h, 4x). O extrato aquoso foi submetido a ciclos de congelamento e descongelamento de maneira a separar o material insolúvel da fração solúvel que foi precipitada em etanol e denominada PEH2O (precipitado etanólico do extrato aquoso). A fração solúvel foi analisada por GPC, cujos resultados indicaram a necessidade de purificação adicional. A cromatografia de filtração em gel Sepharose CL-6B, a pressão normal, separou o PEH2O em cinco frações distintas, denominadas de PI a PV, eluídas em ordem decrescente de suas massas moleculares. A análise cromatográfica para verificar o grau de homogeneidade de cada pico (GPC) indicou que tanto PIII quanto PV estavam puros e aptos a serem quimicamente caracterizados. A hidrólise ácida e os resultados das análises de metilação e ressonância magnética nuclear uni e bidimensional mostraram que PIII é uma β-D-glucana com cadeia principal formada por ligações (1→3), (1→6) e parcialmente substituída em O-6 por cadeias laterais β-D-glucopiranosídicas e PV uma fucomanogalactana com a cadeia principal formada por resíduos α-D-galactopiranosídicos (1→6) ligados, parcialmente substituídos em O-2 por unidades... / Abstract: The Rhizoctonia solani is a phytopathogenic fungus that attacks various crops, causing the tipping of seedlings. There are several studies related to the combat this microorganism, however, no reports of its biomass chemical composition. According to the literature the fungal biomass can be a promising source of molecules for the use in biological studies. Then a novel study of the chemical composition from R. solani biomass, mainly in relation to the polysaccharides, was conducted. The microorganism was grown in Vogel minimal salts medium with glucose as carbon source. Biomass resulting from various cultivations was treated consecutively with ethanol (1:20 w/v), 78 °C, 12h, 1x) and hot distilled water (1:20 w/v, 100 °C, 4h, 4x). The aqueous extract was subjected to freezing and thawing cycles in order to separate the insoluble material. The soluble fraction was precipitated in ethanol and named PEH2O (ethanolic precipitated from aqueous extract). That fraction was analyzed by GPC and the results indicated that an additional purification procedure would be necessary. Gel filtration chromatography on Sepharose CL-6B at normal pressure, separated the PEH2O in five distinct fractions named PI to PV, which eluted in decreasing order of their molecular weight. The chromatographic analysis to verify the homogeneity degree of each peak (GPC) indicated that both PIII as PV were pure and able to be chemically characterized. The results from acid hydrolysis, methylation analysis and uni- and bidimensional nuclear magnetic resonance experiments showed that PIII is a glucan with β-D-Glcp(1→3), (1→6)-linked main chain, partially substituted at O-6 by β-D-Glcp side chains and PV a fucomannogalactan with a main chain composed by (1→6)-linked -D-Galp partially substituted in O-2 by non-reducing end-units of α- L-Fucp and α-D-Manp. Some Galp units from main chain were partially methylated at OH-3. Both... / Mestre

Orientador: Maria Célia Bertolini / Banca: Cleslei Fernando Zanelli / Banca: Ana Paula Ulian de Araújo / Banca: Maria Teresa Marques Novo Mansur / Banca: Marcos Roberto de Mattos Fontes / Resumo: O fungo Neurospora crassa tem sido amplamente usado como um organismo modelo para os aspectos fundamentais da biologia dos eucariotos. Neste trabalho, foi investigado o papel funcional de uma ciclina de N. crassa (PCL-1), codificada pela ORF NCU08772 e ortóloga a Pcl10 de Saccharomyces cerevisiae. Na levedura, a proteína Pcl10, em conjunto com a proteína quinase dependente de ciclina Pho85, fosforila a enzima glicogênio sintase, a enzima regulatória da síntese de glicogênio. A fosforilação resulta na inativação da enzima e, portanto, em diminuição do acúmulo de glicogênio. A linhagem pcl-1 de N. crassa apresentou um atraso na germinação dos conídios e um retardo na progressão do ciclo celular quando comparado com a linhagem selvagem, sugerindo que esta ciclina pode regular o desenvolvimento e a divisão celular. Além disto, a linhagem nocauteada acumulou níveis mais elevados de glicogênio que a linhagem selvagem indicando o papel na regulação do metabolismo deste carboidrato. A fosforilação da enzima glicogênio sintase de N. crassa (GSN) foi analisada na linhagem nocaute através de análises de atividade enzimática, e os resultados mostraram que a GSN apresentou baixo índice de fosforilação, portanto alta atividade durante o crescimento, um resultado que pode explicar o alto acúmulo de glicogênio observado. Este resultado foi confirmado por análise de 2D-PAGE seguida por western blot, utilizando anticorpos anti-GSN. GSN apresentou na linhagem mutante isoformas m... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Maria de Lourdes Corradi Custodio da Silva / Coorientador: Ana Flora Dalberto Vasconcelos / Banca: Maria Antonia Pedrini Colabone Celligoi / Banca: Valdemiro Pereira Carvalho Junior / Resumo: Polissacarídeos e oligossacarídeos de plantas, algas, bactérias e fungos representam um grupo de moléculas com potencial para aplicação em terapia medicamentosa e em biotecnologia. Os oligossacarídeos podem ser obtidos, a partir dos respectivos polissacarídeos, por degradação química, física ou bioquímica. β-glucanas secretadas pelo fungo ascomiceto Lasiodiplodia theobromae (EPSgraviola, EPSlaranja e EPSmanga), cujas soluções apresentam elevado grau de viscosidade, dificultando os testes de atividade biológica, foram hidrolisadas parcialmente com TFA 0,2 M, 100 °C, em tempos variáveis, para a obtenção dos respectivos oligossacarídeos, que foram analisados por cromatografia líquida de íons. O EPSmanga mostrou-se, nas condições estudadas, o substrato ideal para a produção de oligossacarídeos, especialmente aos 45 minutos de hidrólise. As frações solúveis, contendo o material hidrolisado, foram submetidas, inicialmente, à cromatografia de filtração em gel Sephadex G-15, que forneceu dois picos, um composto predominantemente por mono e dissacarídeos e outro contendo oligossacarídeos maiores, de onde foi separada a Fração I, a qual foi submetida à cromatografia de adsorção em carvão-Celite, utilizando um gradiente descontínuo de etanol-água 0 a 60% (v/v). A fração etanol-água a 50%, denominada Fração II, contendo a maior proporção de oligossacarídeos com maior DP foi submetida a uma segunda condição de eluição, utilizando um gradiente contínuo de etanol-água 42-49%, gerando frações... / Abstract: Polysaccharides and oligosaccharides of plants, algae, bacteria and fungi represent a group of molecules that have potential to application in drug therapy and in biotechnology. The oligosaccharides can be obtained, from their respective polysaccharides, by chemical, physical or biochemical degradation. β-glucans secreted by the fungus Lasiodiplodia theobromae (EPSgraviola, EPSorange e EPSmango), whose solutions have high viscosity, what makes the tests of biological activity difficult, were partially hydrolyzed with TFA 0,2 M, 100 °C, in variable times, in order to obtain their respective oligosaccharides, that were analyzed by liquid chromatography of ions. The EPSmango was, in the studied conditions, the ideal substrate to the production of oligosaccharides, especially at 45 minutes of hydrolysis. The soluble fractions, that contain the hydrolyzed material, were initially submitted to gel filtration chromatography on Sephadex G-15, that provided two peaks, one peak with mono and disaccharides and the other one containing bigger oligosaccharides, named Fraction I. That fraction I was submitted to charcoal-Celite adsorption chromatography using a discontinuous gradient ethanol-water 0 to 60% (v/v). The fraction containing oligosaccharides with higher DP (ethanol-water 50%) was named Fraction II, that was submitted to charcoal-Celite adsorption chromatography using a continuous gradient ethanol-water 42-49%, generating fractions still composed of a mixture of oligosaccharides ... / Mestre

Orientador: Lucia Maria Carareto Alves / Coorientador: Alessandro de Mello Varani / Banca: Hugo Miguel Preto de Morais Sarmento / Banca: Rodrigo Matheus Pereira / Banca: Everlon Cid Rigobelo / Banca: Silvana Pompéia do Val de Moraes / Resumo: O composto orgânico produzido a partir de carcaças, resíduos animais e vegetais é uma alternativa viável para a substituição total ou parcial dos fertilizantes minerais utilizados na atualidade. No processo de compostagem participam diferentes populações microbianas, e com isso o composto torna-se um sistema rico para utilização como fertilizante no solo, complementando assim as necessidades nutricionais e microbianas do meio ambiente. Entretanto, há poucos trabalhos envolvendo análise da diversidade bacteriana em solos sob uso de composto orgânico feito a partir de carcaças, e também pouco se conhece sobre o impacto ambiental do uso agrícola de composto orgânico na qualidade da água. Existe também a questão se há influência da água utilizada para irrigação na qualidade do solo. O objetivo central desse trabalho foi analisar a diversidade bacteriana e perfil funcional de um solo de horta e da água de um córrego utilizada para irrigação. E como objetivo secundário, através do isolamento de bactérias da água verificar o potencial biotecnológico de produção e uso de exopolissacarídeo como bioemulsificante de óleo e hidrocarbonetos. As amostras de solo e água utilizadas nesse trabalho foram coletadas na área do departamento rural da Fundação Parque Zoológico de São Paulo, em setembro de 2014. Todo material coletado foi transportado até o Laboratório de Bioquímica de Micro-organismos e de Plantas, onde realizou-se a extração de DNA total e sequenciamento através de tecnologia Ion ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The organic compost produced from carcasses, animal and vegetable waste is a viable alternative to full or partial replacement of mineral fertilizers used nowadays. In the composting process there are involved different microbial populations, and the compost becomes a rich system for use as a fertilizer in the soil, thereby supplementing the nutritional and microbial requirements of the medium. However, there are few studies involving the analysis of bacterial diversity in soil under use of organic compost made from carcasses, and also little is known about the environmental impact of agricultural use of organic compost in water quality. Furthermore, there is also the question of whether there is influence of the water used for irrigation on soil quality. Because of these questions, the central objective of this study was to analyze the bacterial diversity and functional profile of a soil from vegetable garden and freshwater used for irrigation from a local stream. As a secondary objective, we aimed to verify the production and biotechnology potential of a bacterial exopolysaccharide as oil and hydrocarbons bioemulsifier. Soil and freshwater samples used in this study were collected at rural department of the Zoo Foundation Park of São Paulo, in September 2014. All material collected was transported to the Laboratório de Bioquímica de Micro-organismos e de Plantas where we proceeded with the total DNA extraction experiments, sequencing through Ion Proton technology (Life Technologies), bacterial isolation, production and application of exopolysaccharide as bioemulsifier. By analyzing the metagenomic DNA it was observed that both freshwater and soil were plenty of bacterial communities normally found in agricultural areas under influence of organic amendments. Through the analysis of genes related to biogeochemical cycles, it was found abundance ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Fernando Carlos Pagnocca / Coorientador: André Rodrigues / Banca: Lara Durães Sette / Banca: Vanderlei Gerlado Martins / Banca: Paula Benevides de Morais / Banca: Aline Silva / Resumo: Atualmente, existe um crescente interesse em explorar diversos habitats, a fim de revelar a biodiversidade microbiana, incluindo as leveduras. Tal diversidade ainda não acessada guarda a descoberta de novas espécies para ciência, provavelmente muitas das quais com potencial para aproveitamento em processos biotecnológicos. Com o objetivo de explorar e conservar a diversidade de fungos, o Central de Recursos Microbianos da UNESP (CRM - UNESP) mantém em seu acervo várias estirpes de leveduras isoladas de ecossistemas diversos, sendo alguns deles pouco explorados. No início deste trabalho sabíamos que muitas das leveduras depositadas no acervo do CRM - UNESP não estavam totalmente caracterizadas tanto em nível taxonômico, quanto em relação ao potencial biotecnológico que poderiam apresentar. Portanto, o presente estudo foi desenhado para caracterizar e identificar taxonomicamente leveduras depositadas no CRM - UNESP, bem como selecionar estirpes que produzem enzimas extracelulares degradadoras de polissacarídeos como amilase, celulase, xilanase, pectinase e ligninase. Usando uma abordagem polifásica, um total de 340 isolados de leveduras foi identificado, sendo que 71,2% compreendem 43 taxa de ascomicetos e os restantes 28,8% foram classificados em 27 taxa de basidiomicetos. O estudo também levou à descoberta de 8 prováveis novas espécies. Baseado nesta constatação, a classificação taxonômica e análise filogenética foi realizada para duas espécies anamórficas de ascomicetos e uma espécie teleomórfica de basidiomiceto. A descrição destas três espécies é apresentada neste estudo. Os resultados demonstraram que Wickerhamiella kiyanii FB1-1DASPT e W. pindamonhangabaensis H10YT pertencem à clade Wickerhamiella da ordem Saccharomycetales... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In recent time, there has been an increasing interest in exploring diverse ecological habitats in order to reveal the yeast biodiversity. The increased awareness in the biotechnological potentials of yeasts has also spurred attempts to search for new species with novel biotechnological capabilities. Aiming to explore and conserve the fungal diversity from various ecosystems, the UNESP - Central for Microbial Resources (UNESP - CMR) harbors various strains of ecologically diverse yeasts isolates, some of which were yet to be identified. Therefore, this study was designed to identify and characterize some yeasts from the UNESP - MRC and to select strains possessing extracellular plant polysaccharide degrading enzymes namely amylase, cellulase, xylanase, pectinase and ligninase. Using a polyphasic approach, a total of 340 strains were identified. Taxonomic classification grouped 71.2% of these isolates into 43 ascomycetous taxa while the remaining 28.8% were classified in 27 basidiomycetous taxa. The study also led to the discovery of 8 putative new species. As a result, we classified two anamorphic species in the Ascomycota and one teleomorphic species in the Basidiomycota. In this study we provide the description of both species. Our results demonstrated that the two ascomycetous species proposed as Wickerhamiella kiyanii FB1-1DASPT and W. pindamonhangabaensis H10YT belong to the Wickerhamiella clade of the Saccharomycetales (Saccharomycetes) while the basidiomycetous species proposed as Bulleromyces texanaensis ATT064T belong to the Bulleromyces / Papiliotrema / Auriculibuller clade of the Tremellales (Agaricomycotina). In order to show the significance of intraspecific diversity in yeasts, in one of our studies, we subjected 11 strains, (including the type strain CBS 8960T) of Hannaella kunmingensis... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre