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ANÁLISES COMPARATIVAS DAS PROBABILIDADES DE PATERNIDADE OBTIDAS A PARTIR DE DIFERENTES BANCOS DE DADOS POPULACIONAIS DO BRASIL.Almeida, Jonas Garcia de 26 March 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-03-26 / For human identification purposes in Forence area, the United States created the database
(DB) of DNA Index System Combined (CODIS), containing 13 loci: CSF1PO, FGA, TH01,
TPOX, VWA, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51 and D21S11.
Then the DBs of the markers of the Y-STR X-STRs haplotypes were created. Comparison of the
obtained data was conducted from allele frequencies (AF), paternity index (PI) by marker and
paternity probabilities (PPs) obtained from nine BD population, one of those national (BR), using
241 cases containing the PP 99.99 using 13 loci STRs (CODIS) and 2 more STRs markers of
Penta D- and E, granted by the BDs of Núcleo de Pesquisas Replicon, of the Pontifícia
Universidade Católica de Goiás (PUC - GO) and LaGene, Laboratório Central de Saúde Pública
(SES - GO). 241 cases were analyzed in Trio (alleged father, son and progenitor) and Duo
(alleged father and son) situations, using 13 STRs markers (CODIS) by Bayes theorem and the
Likelihood Ratio (LR). The results were submitted to the Kruskal-Wallis, chi-square, Spearman
correlation and Fishers exact tests and SPSS software (2010). Static analysis of RV cases
containing the Trio resulted in 1,148 results PPs 99.99% and 21 results PPs <99.99%, and in a
position to Duo 1686 results with PPs 99.99% and 483 results PPs <99.99%. The analysis of
the IP average of each marker showed the D21S11 of STRs markers and FGA with the highest
power of inclusion and TH01 and D3S1358 with the lowest power of inclusion. The PPs did not
show significantly different, containing mostly positive correlation, of moderate to strong,
between 8 BDs compared to the BR population databases. This study demonstrated the statistics
interference that each allele frequencies DB can have in PP calculations using only 13 loci of
genetic, thus making it more significant in cases Duo situation. According to the information
available in databases of gene frequencies of the different geographical regions of Brazil, it
became possible to conclude that the allele frequencies obtained and the IPs per marker and PPs
obtained, suggest strong similarities to those found in the national database. / Para fins de identificação humana na área forense os Estados Unidos criou o Banco de
Dados (BD) do Sistema de Índice de DNA Combinado (CODIS), contendo 13 loci: CSF1PO,
FGA, TH01, TPOX, VWA, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51
e D21S11. Foi realizado no presente estudo, a comparação dos dados obtidos das frequências
alélicas (FA), índices de paternidade (IP) por marcador e probabilidades de paternidade (PPs)
obtidas a partir de 9 BD populacionais, sendo 1 nacional (BR), utilizando 241 casos contendo a
PP 99,99 com o uso de 13 loci STRs (CODIS) e mais 2 marcadores STRs do Penta-D e E,
cedidos pelos BDs do Núcleo de Pesquisa Replicon, da Pontifícia Universidade Católica de Goiás
(PUC-GO) e do LaGene, Laboratório Central de Saúde Pública (SES-GO). Os 241 casos foram
analisados nas situações de Trio (suposto pai, filho e genitora) e Duo (suposto pai e filho) usando
13 marcadores STRs (CODIS) através do teorema de Bayes e pela Razão de Verossimilhança
(RV). Os resultados foram submetidos aos testes de Kruskal-Wallis, Qui-quadrado, Correlação de
Spearman e Exato de Fisher usando o software SPSS (2010). As análises estáticas da RV dos
casos contendo o Trio resultaram em 1.148 resultados com PPs 99,99% e 21 resultados com PPs
< 99,99%, e em situação de Duo 1.686 resultados com PPs 99,99% e 483 resultados com PPs <
99,99%. As análises das médias dos IPs de cada marcador demonstraram os marcadores STRs do
D21S11 e FGA com os maiores poder de inclusão e TH01 juntamente com o D3S1358 os
menores poderes de inclusão. As PPs não apresentaram diferenças estatísticas significativas
contendo em sua maioria correlações positivas de moderadas a fortes entre os 8 BDs comparados
ao BDs populacional do BR. Este estudo demonstrou as interferências estatísticas que cada BDs
de frequências alélicas pode exercer nos cálculos de PP quando se utiliza apenas 13 loci para
confirmação de vínculo genético, tornando-se assim mais significativas nos casos em situação de
Duo. De acordo as informações disponíveis nos BDs de frequências alélicas das diferentes regiões
geográficas do Brasil, tornou-se possível concluir, que as frequências alélicas obtidas, bem como
os IPs por marcador e as PPs obtidas, sugerem fortes similaridades às encontradas no banco de
dados nacional.
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Modelagem de um ambiente para análise de DNA em genética forenseSarmento, Felipe José de Queiroz 12 May 2006 (has links)
The advances in molecular biology have increased the production of enormous
amount of genetic information in a small period of time. This capacity of data production
motivated the researchers to increase the rhythm of their researches. This
necessity demands the use of efficient softwares in order to manage these data. Besides
this, it also demands the development of good softwares in order to assist the
researchers in the task of analyzing the data and giving them a biological meaning
in a brief space of time. This work proposes a software model that will support the
study of Forensic DNA, whose main repository is the autossomic DNA. This software
intends to support the researchers in the identification of condemned persons or persons
that are suspected of a crime. It also intends to assist the researchers in the
study of paternity and the search for disappeared persons. The results of this work
will be applied in the Forensic DNA Laboratory of UFAL. The software modeled here
has four modules study of paternity , criminal , disappeared people and the bank
of populational frequencies . The modules were modeled independently from each
other, considering the specifications related to the analysis of genetic links. The software
was developed using the JAVA programming language together with PostgreSQL
database. Both are free software and have an excellent relationship between cost and
benefit usage / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Alagoas / Os avanços da biologia molecular vêm favorecendo a geração de uma enorme
quantidade de informações genéticas em um tempo cada vez menor. Essa capacidade
de geração de dados permite que os pesquisadores acelerem o ritmo de suas
pesquisas, exigindo a utilização de ferramentas eficientes para o gerenciamento desses
dados. Outra necessidade está relacionada com o desenvolvimento de ferramentas
computacionais com capacidade de auxiliar na tarefa de análisar e dar um significado
biológico a estes dados em um breve espaço de tempo para os pesquisadores. Este
trabalho propõe a modelagem de um ambiente de apoio à análise e ao estudo do DNA
Forense, cujo principal repositório seja o DNA autossômico. Este ambiente visa dar
suporte a identificação de pessoas condenadas ou suspeitas de ter realizado algum
tipo de crime contra a sociedade, bem como auxiliar no estudo de paternidade e na
busca de pessoas desaparecidas. Este ambiente irá atender ao Laboratório de DNA
Forense, da UFAL, que vêm realizando estas atividades. O modelo do ambiente aqui
proposto, possui quatro módulos, estudo de paternidade , criminal , desaparecido
e o banco de freqüência das populações . Os módulos foram modelados de forma que
funcionem independentemente, atendendo as especificações inerentes à análise sobre
vínculo genético. O sistema foi desenvolvido na linguagem de programação JAVA com
banco de dados PostgreSQL. Ambas as ferramentas possuem característica de software
aberto e uma relação custo/benefício excelentes
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