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Uso de ferramentas de análise de 'big data' na identificação de ameaças e fatores de risco fitossanitário / Use of analysis tools 'big data' in identifying threats and phytosanitary risk factors

Alves, Giliardi Anício 31 March 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-14T16:40:14Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 497659 bytes, checksum: 2c99a8ab10eb6c5a75f20d8df5487dd7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-14T16:40:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 497659 bytes, checksum: 2c99a8ab10eb6c5a75f20d8df5487dd7 (MD5) Previous issue date: 2016-03-31 / Entender o movimento das pragas entre fronteiras, identificar os padrões de dispersão e tendências neste movimento são desafios em serviços de inteligência quarentenária. As espécies que foram introduzidas na América do Sul e Trindade e Tobago, em muitos casos, causam grande dano à agricultura e à economia local. O Brasil, por sua vez, sendo o país com maior produção agrícola nesta região, enfrenta grandes desafios para impedir a entrada de novas pragas e controlar aquelas já introduzidas em seu território. Com o intuito de identificar o padrão atual de distribuição geográfica e incentivar o uso de novas tecnologias na área de pesquisa em defesa vegetal, o presente trabalho trata da identificação de ameaças fitossanitárias utilizando ferramentas computacionais de mineração de dados. Essas ferramentas permitiram identificar dezessete espécies de pragas quarentenárias ausentes para o Brasil com presença confirmada para os países da América do Sul e Trindade e Tobago, as quais foram submetidas a uma avaliação de risco de pragas. Os hemípteros Perkinsiella saccharicida e Pseudococcus calceolariae, os fungos Boeremia foveata, Botrytis fabae, Phoma andigena, Tilletia laevis, Urocystis agropyri, Phytophthora erythroseptica e o coleóptero Prostephanus truncatus são espécies de pragas quarentenárias ausentes para o Brasil com alta probabilidade de entrada a partir da América do Sul e com alto potencial de risco para o país. / Understanding pest movement across international borders, identifying standards of their dispersal and trends are challenges to quarantine intelligence services. Often, exotic species that have become introduced in South America and Trinidad and Tobago cause severe damages to local agriculture and economy. In turn, Brazil, given its regional prominence in agriculture faces challenges to prevent the entry of new pests as well as to control the ones that have already become introduced. Aiming to identify patterns of geographic distribution and to encourage the use of new technological tools in quarantine intelligence, this work deals with the use of data mining and big data analysis tools. 17 pest species of quarantine species have been identified as highly likely to be introduced through the terrestrial borders of Brazil and were submitted to a pest assessment analysis. The hemipterans Perkinsiella saccharicida and Pseudococcus calceolariae, fungi Boeremia foveata, Botrytis fabae, Phoma andigena, Tilletia laevis, Urocystis agropyri, Phytophthora erythrosepticaand the beetle Prostephanus truncatus were qualified as the most risky species to Brazil.
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Inseticidas eficientes no controle de Bemisia tabaci / Efficient insecticides in the control of Bemisa tabaci

Kon, Leonardo Ikari 28 March 2016 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-17T16:48:12Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 402690 bytes, checksum: fc02e830bf569c6d8fc27807afce9259 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-17T16:48:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 402690 bytes, checksum: fc02e830bf569c6d8fc27807afce9259 (MD5) Previous issue date: 2016-03-28 / Helm do Brasil Mercantil Ltda / A mosca branca Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) é uma importante praga que ataca mais de 500 espécies de plantas. As principais culturas atacadas pertencem as famílias Malvaceae (algodão), Fabaceae (soja e feijão), Solanaceae (batata e tomate), Brassicaceae (brócolis, canola, couve-flor e couve), Cucurbitaceae (abóbora, melancia e melão) e Asteraceae (alface e crisântemo). O controle químico é o principal método usado no controle de B. tabaci. Apesar da grande quantidade de inseticidas registrados para o controle e do intensivo uso destes produtos tem-se verificado grandes surtos populacionais nos cultivos. Este fato indica que possivelmente os inseticidas usados no controle de mosca branca não têm sido eficientes. Assim este trabalho teve como objetivo, selecionar inseticidas eficientes no controle de adultos de B. tabaci. Para tanto foram estudados 17 inseticidas: acefato, acetamiprido, alfa-cipermetrina, beta-ciflutrina, beta-cipermetrina, bifentrina, cipermetrina, clorfenapir, cartape, clorpirifós, deltametrina, esfenvalerato, fenpropatrina, gama-cialotrina, imidacloprido, lambda-cialotrina e tiametoxam. Destes produtos apenas o cartape, clorpirifós, bifentrina e clorfenapir foram eficientes no controle da mosca branca. Estes inseticidas tiveram ação rápida de controle sobre a mosca branca (<24h) e eles causaram 91,74; 85,27; 81,45 e 76,79% de mortalidade à praga, respectivamente. O cartape, clorpirifós, bifentrina e clorfenapir possuem baixo efeito residual de controle sobre a mosca branca (< 1 semana) e não são seletivos ao predador Orius tristicolor (Hemiptera: Anthocoridae). / The whitefly Bemisia tabaci (Hemiptera: Aleyrodidae) is an important pest that attacks more than 500 species of plants. The main crops attacked belong to the Malvaceae family (cotton), Fabaceae (soybean and beans), Solanaceae (potatoes and tomatoes), Brassicaceae (broccoli, canola, cauliflower and cabbage), Cucurbitaceae (pumpkin, watermelon and melon) and Asteraceae (lettuce and chrysanthemum). Chemical control is the main method used to control B. tabaci. Despite the large amount of insecticides registered for the control and the intensive use of these products there have been large population outbreaks in crops. This indicates that possibly the insecticides used in whitefly control have not been effective. So this study aimed to select efficient insecticides to control adults of B. tabaci. Therefore, we studied 17 insecticides: acephate, acetamiprid, alpha-cypermethrin, beta-cyfluthrin, beta-cypermethrin, bifenthrin, cypermethrin, esfenvalerate, chlorfenapyr, cartap, fenpropathrin, chlorpyrifos, deltamethrin, gamma-cyhalothrin, imidacloprid, lambda- cyhalothrin and thiamethoxam. These products only cartap, chlorpyrifos, bifenthrin and chlorfenapyr were efficient in controlling whitefly. These insecticides have fast acting control of whiteflies (<24 hours) and they caused 91.74; 85.27; 81.45 and 76.79% mortality to the pest, respectively. The cartap, chlorpyrifos, bifenthrin and chlorfenapyr have low residual control of whiteflies (<1 week) and they are not selective to Orius tristicolor (Hemiptera: Anthocoridae).
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Fatores reguladores do ataque do tripes Frankliniella schultzei à cultura da melancia / Factors that regulates the intensity of attack of the thrips Frankliniella schultzei in watermelon crops

Barbosa, Breno Gomes 29 March 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-21T18:28:16Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 323391 bytes, checksum: 78f3e886ce03578e612db333d275ad80 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T18:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 323391 bytes, checksum: 78f3e886ce03578e612db333d275ad80 (MD5) Previous issue date: 2016-03-29 / O cultivo de melancia (Citrullus lanatus) tem grande relevância econômica e social devido a renda e os empregos gerados. Nos cultivos de melancia uma das pragas mais importantes é o tripes Frankliniella schultzei (Trybom) (Thysanoptera: Thripidae). Os estudos dos fatores reguladores da intensidade do ataque das pragas às culturas possibilitam o entendimento da bioecologia destes organismos e servem de base para o planejamento do uso de métodos de controle em programas de manejo integrado de pragas. Apesar da importância de F. schultzei como praga da cultura de melancia até o momento não se conhece os fatores que regulam sua intensidade de ataque a esta cultura. Assim este trabalho teve como objetivo determinar os fatores que regulam a intensidade de ataque de F. schultzei à cultura da melancia. Para tanto durante duas safras em oito cultivos se monitorou o ataque do tripes F. schultzei à cultura (intensidade e local de ataque), densidades dos inimigos naturais e os elementos climáticos. Os cultivos foram conduzidos nas épocas chuvosa e seca. O ataque de F. schultzei foi maior nas partes mais apicais dos ramos, em plantas no estádio vegetativo e na época seca. Quanto maior o ataque de F. schultzei às plantas maiores foram as populações do predador Chrysoperla sp. (Neuroptera: Chrysopidae). As chuvas influenciaram negativamente o ataque de F. schultzei enquanto que os ventos influenciaram positivamente as populações do tripes. Portanto a intensidade de ataque de F. schultzei foi regulada pelas chuvas de forma negativa e pelos ventos de forma positiva e o ataque desta praga foi maior em folhas mais novas e no início do cultivo. / The watermelon crop (Citrullus lanatus) has great economic and social importance, mainly due to high financial return and the creation of jobs. In watermelon crops, one of the most important pest is the thrips Frankliniella schultzei (Trybom) (Thysanoptera: Thripidae). Studies of the factors regulating the intensity of pest attack on crops enable the understanding of the bioecology of these organisms and provide the basis for planning the use of control methods in integrated pest management programs. Despite the importance of F. schultzei as watermelon crop pest, the factors that regulate its intensity of attack to this crop still unknown. So, this study aimed to determine the factors that regulate intensity of attack of F. schultzei in the watermelon crop. Therefore, during two growing seasons of watermelon in Brazil, we monitored the attack of the thrips F. schultzei in eight watermelon crops (intensity and attack site), densities of natural enemies and weather elements. The cultivations were conducted in the rainy and dry seasons. The attack of F. schultzei was higher in apical parts of the branches of the plants in the vegetative stage and during the dry season. The density of F. schultzei was higher in plants with higher populations of the predator Chrysoperla sp. (Neuroptera: Chrysopidae). Rains influenced negatively the attack of F. schultzei, while the winds influenced positively. Therefore, the attack of F. schultzei was regulated by the rains negatively and winds positively and the attack of this pest was higher in young leaves and of young plants.
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Síntese de derivados de isobenzofuran-1(3H)-onas: obtenção de compostos tipo gaiola e atividade inseticida / Synthesis of isobenzofuran-1(3H)-ones derivatives: preparation of cage compounds and insecticidal activity

Resende, Gabriela da Costa 18 March 2016 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-03-02T18:32:45Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 12971371 bytes, checksum: 4c397df1a034ed8b3f0c89553f5e886a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-02T18:32:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 12971371 bytes, checksum: 4c397df1a034ed8b3f0c89553f5e886a (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As isobenzofuran-1(3H)-onas (ou ftalidas) e seus derivados tetra- e hexaidroisobenzofuran-1(3H)-onas compõe um grupo de metabólitos secundários produzidos, principalmente, por plantas da família Apiaceae que tem se destacado devido a sua gama de atividades biológicas. O objetivo do presente trabalho foi sintetizar novas ftalidas e avaliá-las quanto à toxicidade frente a insetos-praga. Para a obtenção das tetraidroisobenzofuran-1(3H)-onas, a reação de Diels-Alder entre o ciclopentadieno e γ-lactonas α,β-insaturadas (2, 3 e 4) foi escolhida como etapa-chave, levando à formação dos adutos 5a-b, 6a-b e 7a-c com rendimentos globais acima de 90%. Os adutos anti-endo majoritários 5a, 6a e 7a foram submetidos a reações de hidrogenação, epoxidação, bromação e cloração para a obtenção de onze derivados com rendimentos que variaram entre 32 e 98%. Os compostos sintetizados foram completamente caracterizados por espectrometria de massas, espectroscopia no IV e espectroscopia de RMN de H e de 13 C (uni e bidimensionais). Adicionalmente, cálculos computacionais DFT-GIAO foram utilizados para a elucidação estrutural dos adutos 7a-c e dos compostos gaiola 11, 14 e 16. Por meio de bioensaios, avaliou-se a atividade inseticida dos compostos sintetizados sobre Ascia monuste e Diaphania hyalinata. Os compostos mais ativos para A. monuste (2, 3, 10 e 7a) e D. hyalinata (2 e 7a) tiveram as curvas dose-mortalidade determinadas e as doses letais responsáveis pela morte de 50 e 90% da população (DL 50 e DL 90 ) estimadas. Os valores de mortalidade observados para a ftalida 10 (A. monuste) e para os compostos 2 e 7a (D. hyalinata) foram estatisticamente iguais ao do inseticida padrão utilizado (Malation). Para as duas espécies de lagartas, as lactonas de partida 2 e 3 apresentaram valores de DL 50 menores que as ftalidas 7a e 10. A DL 90 foi empregada na construção das curvas de sobrevivência das pragas e na avaliação da seletividade dos compostos sintetizados frente ao predador Solenopsis saevissima e ao polinizador Tetragonisca angustula. Foi possível observar que o tempo médio de sobrevivência (TL 50 ) da população de D. hyalinata foi menor para o composto 2 do que para o composto 7a. Para A. monuste, as substâncias 2, 3, 7a e 10 agiram em tempos estatisticamente iguais. Os compostos 2, 3, 7a e 10 foram seletivas ao predador S. saevissima e apenas a substância 3 foi seletiva ao polinizador T. angustula. Os resultados encontrados indicam que os butenolídeos e as isobenzofuran-1(3H)-onas são unidades estruturais promissoras para a descoberta de novos compostos com atividade inseticida. / The isobenzofuran-1(3H)-ones (or phthalides) and their derivatives tetra- e hexahydroisobenzofuran-1(3H)-ones comprise a group of secondary metabolites mainly produced by Apiaceae plants that features a wide range of bioactivities. The aim of this work was to synthesize new phthalides and evaluate their toxicity against insect pests. The Diels-Alder reaction between cyclopentadiene and α,β-unsaturated γ-lactones (2, 3 and 4) was chosen as a key step for tetrahydroisobenzofuran-1(3H)-ones achievement, leading to formation of the adducts 5a-b, 6a-b and 7a-c with global yields above 90%. The major adducts anti-endo 5a, 6a and 7a were subjected to hydrogenation, epoxidation, bromination and chlorination reactions to get eleven derivatives with yields ranging from 32% to 98%. The synthesized compounds were fully characterized by mass spectrometry, IR spectroscopy, H and 13 C NMR spectroscopy (uni and bidimensional). Additionally, DFT-GIAO theoretical calculations were used for the structural elucidation of the adducts 7a-c and the cage compounds 11, 14 and 16. Through bioassays, the insecticidal activity of the synthesized compounds on Ascia monuste and Diaphania hyalinata was evaluated. The most active compounds for A. monuste (2, 3, 10 and 7a) and D. hyalinata (2 and 7a) had their dose-mortality curves determined and the lethal dose responsible for the death of 50% and 90% of the population (LD 50 and LD 90 ) estimated. The mortality levels observed for phthalide 10 (A. monuste) and compounds 2 and 7a (D. hyalinata) were statistically similar to the commercial insecticide used (Malathion). For both caterpillar species, the starting lactones 2 and 3 presented smaller values of LD 50 than the phthalides 7a and 10. The LD 90 was used for construction of the pests survival curves and for evaluation of the selectivity of the synthesized compounds against the predator Solenopsis saevissima and the pollinator Tetragonisca angustula. It was observed that the median survival time (LT 50 ) was lower when the population of D. hyalinata was exposed to compound 2 than to compound 7a. For A. monuste, the substances 2, 3, 7a e 10 acted in statistically equal times. Compounds 2, 3, 7a and 10 were selective for the predator S. saevissima and just the compound 3 was selective to the pollinator T. angustula. These results indicate that butenolides and isobenzofuran-1(3H)-ones are promising structural units for discovering of new compounds with insecticidal activity.
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Feeding ecology of green lacewings / Ecologia alimentar de crisopídeos

Batista, Michela Costa 23 March 2016 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-03T14:58:49Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1535650 bytes, checksum: 3f7a877b6b568460f4e6f26fa968315f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T14:58:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1535650 bytes, checksum: 3f7a877b6b568460f4e6f26fa968315f (MD5) Previous issue date: 2016-03-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Para que os inimigos naturais encontrem as plantas e se estabeleçam em uma área de cultivo para fornecer o serviço de controle biológico, eles precisam ser atraídos para o local, sobreviver, reproduzirem-se e serem capazes de predar as pragas presentes nesse cultivo. Geralmente, a atração de inimigos naturais está direta ou indiretamente ligada às necessidades alimentares. Uma vez atraídos para a área, as fontes de alimento no cultivo e arredores devem ser apropriadas para promover o crescimento e estabelecimento das populações desses inimigos naturais. Nosso objetivo foi entender aspectos chave da ecologia alimentar de crisopídeos, predadores generalistas encontrados naturalmente em agroecossistemas e comumente comercializados como agentes de controle biológico. No Capítulo I, avaliamos a atratividade de espécies de plantas aromáticas a Ceraeochrysa cubana Hagen, uma espécie de crisopídeo com ampla distribuição geográfica e que pode ser encontrada em diversos sistemas de cultivo. Adicionalmente, foram testados os efeitos dessas plantas aromáticas na sobrevivência e performance de larvas e adultos de C. cubana, a fim de elucidar a importância dessas plantas para o estabelecimento de populações de crisopídeos. Constatamos que plantas de Ocimum basilicum (manjericão) sem flores e não infestadas foram atrativas para C. cubana, e que as larvas podem sobreviver em O. basilicum por um período de tempo maior em comparação com as outras espécies de plantas aromáticas avaliadas. Adicionalmente, as flores de O. basilicum proporcionaram uma sobrevivência longa para larvas e adultos de C. cubana, em comparação com o controle negativo (água). Os resultados indicam que a utilização de O. basilicum como um componente de diversificação em áreas agrícolas pode ser benéfico para a atração e manutenção de populações de C. cubana para favorecer o controle biológico. No Capítulo II, foi estudada a amplitude de dieta de Chrysoperla rufilabris Burmeister, uma espécie de crisopídeo comumente usada e comercializada como agente de controle biológico, com 16 espécies de afideos, avaliando-se a qualidade dessas espécies para a sobrevivência e o fitness desse predador generalista. Os resultados mostraram que C rufilabris se alimentou de todas as espécies de afideo oferecidas. No entanto, esse crisopídeo se desenvolveu e produziu ovos apenas quando alimentado por sete das 16 espécies avaliadas, estando a maioria destas espécies agrupadas em um mesmo ramo filogenético. Também foi encontrado um forte sinal filogenético para a sobrevivência, consumo de afídeos e produção de ovos de C. ruleabris, indicando que a maioria das espécies apropriadas a C. ruleabris são filogeneticamente próximas, o que demonstra que essa espécie de crisopídeo é menos generalista do que se havia suposto. Assim, C. ruleabris pode não se beneficiar de uma grande amplitude de presas e isso deve ser levado em consideração no planejamento de estratégias de controle biológico que visem utilizar esse crisopídeo. Conclui-se que o conhecimento sobre a ecologia alimentar de agentes de controle biológico é essencial antes da escolha das espécies a serem liberadas ou atraídas e mantidas em uma área cultivada. Nesse sentido, O. basilicum é uma espécie de planta aromática promissora para atrair e manter populações de crisopídeos no campo. Além da atratividade, é importante considerar a filogenia das presas em estudos de amplitude de dieta de predadores generalistas a fim de se obter melhores resultados em programas de controle biológico. / Biological control is a pest management strategy that relies on the action of natural enemies to control the populations of herbivores, minimizing their damage on cultivated areas. For natural enemies to find and establish in a cropping area to provide biological control services they need to be attracted to the area, survive, reproduce, and be capable of preying on the pests present in the crop. Usually, natural enemy attraction is direct or indirectly linked with feeding needs. Once attracted to the area, the food resources in the crop and surroundings must be suitable to promote population growth and establishment of natural enemies populations. Therefore, the aim of this thesis was to understand key aspects of the feeding ecology of green lacewings, generalist predators naturally found in agroecosystems and commonly commercialized as biological control agents. On Chapter I, we assessed the attractiveness of aromatic plant species to Ceraeochrysa cabana Hagen, a lacewing species with a broad geographical range that can be found in several cropping systems. Additionally, we tested the effects of those aromatic plants on survival and performance of larvae and adults of C. cabana, in order to elucidate the importance of such plant species to the establishment of green lacewing populations. We found that non-flowering and uninfested Ocimam basilicam (basil) plants were attractive to C. cabana, and that larvae could survive for a longer period of time in O. basilicam leaves compared to the other aromatic plant species tested. Additionally, O. basilicam flowers promoted a long survival for larvae and adults of C. cabana, compared to the negative control (water). Results indicate that using O. basilicam as a diversification component in cultivated areas may be beneficial to attract and maintain C. cabana populations to support biological control. On chapter II, we studied the diet breadth of Chrysoperla rafilabris Burmeister, a green lacewing commonly used and commercialized as a biological control agent, over 16 aphid species, assessing the quality of those species on survival and fitness of this generalist predator. Results demonstrated that C. rafilabris preyed over all the aphid species, but could develop and produce eggs only in seven species, most of them from the same cluster in a phylogenetic tree. We also found a strong phylogenetic signal for survival, aphid consumption and egg load of C. rafilabris, indicating that most of the species more suitable to C. rufilabris were closely related, which demonstrate that this green lacewing species is less generalist than it was supposed. Thus, C. rufilabris may not benefit from a broad prey range and that has to be taken into consideration when planning biological control strategies using this green lacewing species. In conclusion, knowledge on the feeding ecology of biological control agents is essential before choosing the species to be released or that to be attracted to and to maintain in the cropping system. In this sense, O. basilicum is a promising aromatic plant species to attract and maintain lacewing populations in the field. Additionally to attractiveness, it is important to consider prey phylogeny in the study of generalist predators diet breadth in order to have better results in biological control programs.
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Modelagem molecular, análises de docking de serino-proteases intestinais de Anticarsia gemmatalis e uso de peptídeos sintéticos na caracterização do modelo de inibição enzimática / Molecular modeling, docking analysis of intestinal serino-proteases from Anticarsia gemmatalis and use of synthetic peptides in the characterization enzimatic of inhibition model

Vargas, Adriana Maria Patarroyo 27 February 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-06T15:07:07Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3732467 bytes, checksum: 247973bf48da051a9a1fe62db84cfc55 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-06T15:07:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 3732467 bytes, checksum: 247973bf48da051a9a1fe62db84cfc55 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A lagarta da soja, Anticarsia gemmatalis (Lepidoptera), é considerada uma das principais pragas da sojicultura, causando enormes prejuízos devido ao seu ataque. As proteases digestivas desempenham papel importante na fisiologia das larvas e o estudo de inibidores de proteases como agentes de controle de pragas tem recebido atenção contínua. Para a utilização dessa estratégia de controle é necessário conhecer a estrutura dessas enzimas, além de entender as interações químicas com esses inibidores. O uso de programas computacionais são ferramentas úteis para contornarem os problemas relacionados às técnicas de elucidação estrutural e avaliam in silico as principais interações entre as enzimas e os ligantes. Após esse processo a caracterização cinética do complexo enzimático contribuem para a melhor compreensão dos centros ativos e dos mecanismos de ação da enzima. Neste contexto, este trabalho teve como objetivo realizar a modelagem molecular por homologia das serino-proteases intestinais de A. gemmatalis, avaliar as possíveis interações com peptídeos sintéticos utilizando estudos de docking e propôr um modelo de inibição enzimática das serino-proteases utilizando os peptídeos. As sequências obtidas foram utilizadas na modelagem molecular com o programa I-TASSER. Os três melhores modelos estruturais foram validados através dos parâmetros de C-score e B-factor profile. A análise do C-scoreEC classificou as enzimas como serino-proteases. No estudo de docking, dos sete ligantes testados, somente Gor K, Gor R e Gor 5 apresentaram valores de energia livre de ligação para a formação de complexos estáveis. As principais interações observadas foram em regiões do centro ativo e sítio secundário das enzimas. Para a caracterização cinética utilizando diferentes substratos peptídicos as enzimas foram purificadas por cromotagrafia de afinidade utilizando coluna de p-aminobenzamidina agarose em sistema FPLC. Pelas análises dos parâmetros cinéticos foi possível constatar que as serino-proteases intestinais tripsina- like de Anticarsia gemmatalis têm preferência na hidrólise de substratos contendo arginina na posição P1. Nos estudos de cinética de inibição utilizando os peptídeos sintéticos Gor 3, Gor 4 e Gor 5 em presença do substrato cromogênico L-BApNA observou-se que a inibição é do tipo competitiva linear nas concentrações utilizadas. A melhor Ki foi observada para o peptídeo Gor 5 que apresentou uma inibição mais eficiente em comparação aos peptídeos Gor 3 e Gor 4. No geral, a eficiência na inibição da atividade enzimática está relacionada à capacidade de ligação ao centro ativo da enzima. / The velvetbean caterpillar, Anticarsia gemmatalis (Lepidoptera), is considered the main pest of soybean culture, causing huge losses due to its attack. Digestive proteases play an important role in the physiology of the larvae and the study of protease inhibitors as pest control agents has received continuous attention. The use of this control strategy requires knowledge of the structure of these enzymes, besides understanding the chemical interactions with those inhibitors. Computer programs are useful tools to overcome problems related to structural elucidation techniques and also evaluate in silico the main interactions between enzymes and ligands. After this process the kinetic characterization of the enzyme complex contribute to a better understanding of the active centers of the enzyme and mechanisms of action. In this context, this study aimed to perform homology modeling of intestinal serine proteases A. gemmatalis, to evaluate possible interactions with synthetic peptides utilizing docking studies and to propose one enzyme inhibition model of serine proteases using peptides. The sequences obtained were used in molecular modeling with I-TASSER program. The top three structural models were validated through the C-score parameters and B-factor profile. Analysis of C-scoreEC ranked enzymes like serine proteases. In the docking study of the seven tested ligands, only Gor K, Gor R and Gor 5 showed binding free energy values for the formation of stable complexes. The main interactions were observed in regions of the active site and secondary site of the enzyme. For kinetic characterization using different peptides substrates the crude extract were purified by affinity cromotagraphy using p-aminobenzamidine agarose column FPLC system. From the analysis of the kinetic parameters was noted that the trypsin-like serine proteases from Anticarsia gemmatalis prefer hydrolyse substrates containing arginine at position P1. In inhibition kinetic studies using synthetic peptides Gor 3, Gor 4 and Gor 5 in the presence of chromogenic substrate L-BApNA was observed that the inhibition is linear competitive in the concentration range used. The best Ki was observed for Gor 5 peptide that showed more efficient inhibition compared to peptides Gor 3 and Gor 4. Overall, the efficient inhibition of enzyme activity is related to the binding capacity to the active center of the enzyme.
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Toxicidade de novos piretróides a lepidópteros-praga de hortaliças e hymenópteros predadores e polinizador / Toxicity of new pyrethroids to lepidopterous pests of vegetable and hymenopterous predators and polinizattor

Moreno, Shaiene Costa 15 February 2007 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-06-08T16:30:17Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 321585 bytes, checksum: 64dcbf3e3f563f338757569a51121e39 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-08T16:30:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 321585 bytes, checksum: 64dcbf3e3f563f338757569a51121e39 (MD5) Previous issue date: 2007-02-15 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / A demanda por novos produtos para o manejo de pragas em hortaliças é crescente. Dentre essas pragas, a traça-do-tomateiro Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae), a broca-das-cucurbitáceas Diaphania hyalinata (L.) (Lepidoptera: Pyralidae) e o curuquerê-da-couve Ascia monuste orseis (Latreille) (Lepidoptera: Pieridae) são pragas-chave do tomateiro, cucurbitáceas e brássicas, respectivamente. Além da eficiência contra insetos-praga, novos inseticidas devem apresentar seletividade a inimigos naturais e polinizadores. Nos agroecossistemas formados por hortaliças freqüentemente se observa a ação benéfica dos predadores Solenopsis saevissima (F. Smith) (Hymenoptera: Formicidae) e Protonectarina sylveirae (Saussure) (Hymenoptera: Vespidae); e do polinizador Tetragonisca angustula (Latreille) (Hymenoptera: Apidae: Meliponinae). Assim, neste trabalho objetivou-se avaliar a toxicidade de novos piretróides contendo modificações na parte de origem ácida, a fim de elucidar a atividade inseticida desses compostos aos lepidópteros-praga de hortaliças T. absoluta, D. hyalinata e A. monuste orseis e a seletividade aos predadores S. saevissima e P. sylveirae e ao polinizador T. angustula. Determinou-se, por análise de próbite, curvas dose-mortalidade dos piretróides para os insetos. Por meio dessas curvas, foram estimadas as doses letais para 50 e 90% das populações (DL50 e DL90). Foram calculados os índices de toxicidade relativa, de seletividade diferencial e de tolerância relativa. Os novos piretróides estudados apresentaram ação inseticida sobre os lepidópteros-praga T. absoluta, D. hyalinata e A. monuste orseis. As misturas dos isômeros cis e trans dos novos piretróides causaram altas mortalidades aos insetos- praga em doses ligeiramente maiores que as da permetrina. Os isômeros cis das misturas [10+11] e [16+17], e os isômeros trans da mistura [12+13] apresentaram maior eficiência. Os novos piretróides estudados causaram alta mortalidade a T. absoluta, D. hyalinata e A. monuste orseis em tempo menor que 12 horas. As misturas dos isômeros [14+15] e [18+19] apresentaram seletividade em favor do predador S. saevissima. A determinação da dose correta dos piretróides estudados foi, de forma geral, mais importante no impacto destes sobre os predadores e polinizador do que nos lepidópteros-praga. / The demand of new products for handling of pests on vegetables is growing. Among those pests, the tomato leafminer Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae), the melonworm Diaphania hyalinata (L.) (Lepidoptera: Pyralidae) and the kale leafworm Ascia monuste orseis (Latreille) (Lepidoptera: Pieridae) are key pests of tomato, curcubitaceas and brassicas crops, respectively. Besides the efficiency against insect, new insecticides should present selectivity to natural enemies and pollinator. In the ecosystems formed by vegetables frequently the beneficial action of the predators Solenopsis saevissima (F. Smith) (Hymenoptera: Formicidae); Protonectarina sylveirae (Saussure) (Hymenoptera: Vespidae); and the pollinator Tetragonisca angustula (Latreille) (Hymenoptera: Apidae: Meliponinae) is observed. So, in this work, it was to evaluate the toxicity of new pyrethroids containing modifications in the acid origin, in order to elucidate the insecticide activity of those compositions to the lepidopterous pests of vegetables T. absoluta, D. hyalinata and A. monuste orseis and the selectivity to the predators S. saevissima and P. sylveirae and to the polinizattor T. angustula. It was determined, for probit analysis, dose-mortality curves of the pyrethroids for the insects. Through those curves were dear the lethal doses for 50 and 90% of the populations (DL50 e DL90). Based on lethal doses the relative toxicity index, the differential selectivity index and relative tolerance index were calculated. The new studied pyrethroids presented insecticide action on the lepidopterous pets T. absoluta, D. hyalinata and A. monuste orseis. The mix of cis and trans isomers of the new pyrethroids caused high mortalities to the insect pests in doses lightly larger than the one of the permetrina. The cis isomer from mix [10+11] and [16+17], and the trans isomer from mix [12+13] were more presented larger efficiency. The new pyrethroids caused high mortality to T. absoluta, D. hyalinata and A. monuste orseis in smaller time than 12 hours. The mix of the isomers [14+15] and [18+19] presented selectivity in favor of the predator S. saevissima. The determination of correct dose of the studied pyrethroids was, in a general way, more important in the impact of these on the predators and polinizattor than in the lepidopterous pests.
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Infestação de Spodoptera frugiperda e Helicoverpa zea (Lepidoptera: Noctuidae) em híbridos comerciais de milho (Zea mays L.)

Nais, Juliana [UNESP] 28 February 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:46Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:22:55Z : No. of bitstreams: 1 nais_j_dr_jabo.pdf: 297704 bytes, checksum: 58a7b62580296b98718799a8194e3ca1 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O milho é uma das plantas domesticadas pelo homem mais antigas do mundo e sua produção se torna ameaçada diante do ataque de pragas. Dentre elas destacam-se a lagarta-do-cartucho Spodoptera frugiperda e a lagarta-da-espiga Helicoverpa zea. A S. frugiperda ataca preferencialmente o cartucho das plantas consumindo grande parte da área foliar antes de as folhas se desenvolverem. A H. zea é referida prejudicando a cultura atacando os estilo-estigmas e alimentando-se dos grãos leitosos. Para promover o manejo dessas pragas com a mínima utilização de agrotóxicos, a tecnologia das plantas geneticamente modificadas tem sido objeto de estudos. Neste trabalho, os objetivos foram avaliar a infestação de lagartas e injúrias de S. frugiperda e determinar o comportamento de oviposição, intensidade de infestação, danos nos estilo-estigmas e espigas provocados por H. zea em condições de campo, em híbridos convencionais e transgênicos. Os híbridos foram semeados na safrinha de 2010 e na safra de 2010/2011, em delineamento de blocos ao acaso, com sete tratamentos (híbridos) e quatro repetições. Diferentes níveis de infestação ocorreram durante os experimentos nos híbridos Bt e não Bt. O híbrido 2B710HX foi o menos infestado com lagartas de S. frugiperda e o menos danificado, o que se conclui que a expressão da toxina Cry1F foi a mais efetiva na proteção da planta, independente da época de semeadura. Os híbridos que expressam a toxina Cry1Ab e Cry1F foram os mais efetivos no controle da H. zea em Jaboticabal, independente da época de semeadura. Em Pindorama, SP, a toxina Cry1F apresentaram bons resultados contra a infestação de lagartas / The maize is a plant domesticated by humans world’s oldest and your production becomes threatened before the attack of pests. Among the pest that attack maize stand out the fall armyworn Spodoptera frugiperda and the bollworm Helicoverpa zea. S. frugiperda attacks preferably the maize plants consuming much of the leaf area before the leaves develop. H. zea hurting the culture attacking style-stigma and destroying the mand. In order to promote the management of these pests with minimal use of pesticides, the technology of genetically modified plants has been the subject of many studies. In this paper, the objective was to evaluate the infestation and injuries of S. frugiperda and determine the oviposition behavior, intensity of infestation, damage to the style-stigma and in ear caused by H. zea in field conditions in conventional and transgenic maize hybrids. The hybrids were planted in the harvest in the summer of 2010 and in harvest 2010/2011, in a randomized blocks with seven treatments (hybrids) and four replications. Different levels of infestation of larvae occurred throughout the development of conventional and transgenic hybrids. The hybrid 2B710HX was the least infested with larvae of S. frugiperda and the least damaged, which concludes that the Cry1F toxin was the most effective in protecting the plant, regardless of time of sowing. The hybrids expressing the Cry11Ab and Cry1F toxin were most effective in controlling H. zea in Jaboticabal, SP, regardless of sowing time. In Pindorama, SP, toxin Cry1F showed good results against the infestation of caterpillars
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Uso de ferramentas biotecnológicas para o controle de pragas agrícolas

Coelho, Roberta Ramos 28 August 2013 (has links)
Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, Pós-Graduação em Biologia Molecular, 2013. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-06-03T14:46:13Z No. of bitstreams: 1 2013_RobertaRamosCoelho_Parcial.pdf: 1375046 bytes, checksum: c126bf586c468cd419bdfca6216af06b (MD5) / Rejected by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br), reason: Retirar o restante do capítulo 3. on 2015-06-03T18:28:49Z (GMT) / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-06-03T18:35:35Z No. of bitstreams: 1 2013_RobertaRamosCoelho_Parcial.pdf: 749097 bytes, checksum: f12f9942225d4a2704b22859efa25ac3 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2015-06-03T19:22:20Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_RobertaRamosCoelho_Parcial.pdf: 749097 bytes, checksum: f12f9942225d4a2704b22859efa25ac3 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-06-03T19:22:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_RobertaRamosCoelho_Parcial.pdf: 749097 bytes, checksum: f12f9942225d4a2704b22859efa25ac3 (MD5) / O Brasil é o quinto maior produtor de algodão do mundo, e também um dos maiores produtores mundiais de fibra, contribuindo positivamente para a balança comercial. O algodão é atacado por uma série de pragas, sendo o bicudo-doalgodoeiro, Anthonomus grandis, um dos insetos-pragas mais destrutivos. Além do bicudo-do-algodoeiro, o nematoide das galhas Meloidogyne incognita é uma praga importante desta e de outras culturas. O presente trabalho foi realizado visando o desenvolvimento de ferramentas biotecnológicas para o controle destas duas pragas agrícolas. No caso de A. grandis, a técnica do silenciamento gênico por RNAi foi utilizada para estudar a importância da Vitelogenina (proteína envolvida na reprodução dos insetos) para este inseto-praga. A técnica de RNAi é utilizada como ferramenta de validação funcional de genes e para o controle de pragas, e vem sendo utilizada na nova geração de plantas transgênicas. Isto em vista, no presente trabalho foram avaliados os efeitos do silenciamento gênico da vitelogenina de A. grandis (Agvtg) na biologia e no desenvolvimento do inseto adulto e da progênie. Inicialmente, foi realizado um estudo para identificar os melhores genes referência a serem utilizados em estudos gerais de qRT-PCR com este inseto. Após esta identificação, foi determinado o padrão de expressão do gene Agvtg e verificou-se a presença de transcritos em diferentes fases do desenvolvimento do inseto através de qRT-PCR. A proteína (AgVtg) foi localizada, por imunocitoquímica, em oócitos em desenvolvimento. Após microinjeção de dsRNA para Agvtg (dsVtg) em fêmeas de A. grandis, foi verificada uma significativa diminuição no acúmulo de transcritos deste gene. Além disto, verificou-se que as fêmeas tratadas com o dsVtg são capazes de produzir ovos na mesma quantidade dos tratamentos controle, porém, a maior parte dos ovos era inviável. Estudos realizados por meio de microscopia dos ovos oriundos de fêmeas tratadas com dsVtg revelaram, ainda, diferentes fenótipos, correspondentes a paralização do desenvolvimento do embrião em diferentes estágios de desenvolvimento, indicando, provavelmente, diferentes níveis desilenciamento gênico. Os estudos realizados com M. incognita, por sua vez, foram feitos utilizando uma estratégia distinta da anterior. Sabe-se que o nematoide das galhas estimula o ciclo celular das células hospedeiras das plantas, assim, foram utilizadas linhagens de plantas de Arabidopsis thaliana superexpressando proteínas inibidoras do ciclo celular de plantas (KRPs) e mutantes que não expressam estas proteínas para avaliar o efeito no ciclo de vida do patógeno. Esse trabalho nos permitiu demonstrar a possível função de KRP3, KRP5 e KRP7 em galhas induzidas por nematoides. Nossos resultados demonstram que todos os membros desta família afetam a progressão do ciclo celular durante a formação de galhas de forma diferente, afetando o ciclo de vida do nematoide. Assim, os dados gerados neste trabalho certamente contribuirão consideravelmente para o desenvolvimento de novas técnicas e ferramentas para o controle da principal praga do algodão no país, o bicudo-do-algodoeiro, e do nematoide de galhas, Meloidogyne incognita. ____________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is ranked as the fifth world cotton producer, being also one of the largest fiber producers in the world, leading in high contribution to the commercial trade. Cotton is produced in monoculture system, and it is attacked by a large number of pests. The cotton boll weevil, Anthonomus grandis, is one of the most destructive pests of cotton. Also, the root-knot nematode Meloidogyne incognita is an important pest that infect many plants species including cotton. The present work was conducted to develop biotechnological tools for the control of these two agricultural pests. In the case of A. grandis, the technique of gene silencing by RNAi was used to study the importance of vitellogenin (protein involved in reproduction) for this insect pest. The RNAi technique is used as a tool for validation of gene function and pest control, and is used in the new generation of transgenic plants. The present study evaluated the effects of gene silencing of vitellogenin in A. grandis (Agvtg) in biology,development of the adult insect and its progeny. Initially, a study was conducted to identify the best reference genes to be used in general studies qRT-PCR with this insect. After, it was determined the expression pattern of Agvtg gene and the presence of transcripts at different stages of insect development was verified by qRT-PCR. The protein (AgVtg) was located by immunocytochemistry in developing oocytes. After microinjection of dsRNA for Agvtg (dsVtg) in A. grandis females, there was a significant decrease in transcripts accumulation of this gene. Furthermore, it was found that females treated with dsVtg are able to produce eggs in the same amount of control treatments, however, most of the eggs was not viable. Studies performed by microscopy of the eggs that came from females treated with dsVtg also revealed different phenotypes, corresponding to paralysis of embryo development in different stages of development, probably indicating different levels of gene silencing. Studies realized with M. incognita, were made using a different strategy from above. It is known that the root-knot nematode stimulates the cell cycle of the host cells in plants. So Arabidopsis thaliana lines overexpressing cell cycle inhibitory proteins from plants (KRPs) and also mutants which do not express these proteins were used to evaluate the effect the pathogen life cycle. This work allowed us to demonstrate the possible role of KRP3, KRP5 and KRP7 in galls induced by nematodes. Our results demonstrate that all members of this family affect cell cycle progression during gall formation differently, thus affecting the nematode life cycle. Thus, the data generated in this study will certainly contribute significantly to the development of new techniques and tools for the control of major cotton pest in the country, cotton boll weevil, and the root-knot nematode, Meloidogyne incognita.
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Infestação de Spodoptera frugiperda e Helicoverpa zea (Lepidoptera: Noctuidae) em híbridos comerciais de milho (Zea mays L.) /

Nais, Juliana. January 2012 (has links)
Orientador: Antonio Carlos Busoli / Coorientador: Marcos Doniseti Michelotto / Banca: Aildson Pereira Duarte / Banca: Julio César Guerreiro / Banca: Arlindo Leal Boiça Júnior / Banca: Ricardo Antonio Polanczyk / Resumo: O milho é uma das plantas domesticadas pelo homem mais antigas do mundo e sua produção se torna ameaçada diante do ataque de pragas. Dentre elas destacam-se a lagarta-do-cartucho Spodoptera frugiperda e a lagarta-da-espiga Helicoverpa zea. A S. frugiperda ataca preferencialmente o cartucho das plantas consumindo grande parte da área foliar antes de as folhas se desenvolverem. A H. zea é referida prejudicando a cultura atacando os estilo-estigmas e alimentando-se dos grãos leitosos. Para promover o manejo dessas pragas com a mínima utilização de agrotóxicos, a tecnologia das plantas geneticamente modificadas tem sido objeto de estudos. Neste trabalho, os objetivos foram avaliar a infestação de lagartas e injúrias de S. frugiperda e determinar o comportamento de oviposição, intensidade de infestação, danos nos estilo-estigmas e espigas provocados por H. zea em condições de campo, em híbridos convencionais e transgênicos. Os híbridos foram semeados na safrinha de 2010 e na safra de 2010/2011, em delineamento de blocos ao acaso, com sete tratamentos (híbridos) e quatro repetições. Diferentes níveis de infestação ocorreram durante os experimentos nos híbridos Bt e não Bt. O híbrido 2B710HX foi o menos infestado com lagartas de S. frugiperda e o menos danificado, o que se conclui que a expressão da toxina Cry1F foi a mais efetiva na proteção da planta, independente da época de semeadura. Os híbridos que expressam a toxina Cry1Ab e Cry1F foram os mais efetivos no controle da H. zea em Jaboticabal, independente da época de semeadura. Em Pindorama, SP, a toxina Cry1F apresentaram bons resultados contra a infestação de lagartas / Abstract: The maize is a plant domesticated by humans world's oldest and your production becomes threatened before the attack of pests. Among the pest that attack maize stand out the fall armyworn Spodoptera frugiperda and the bollworm Helicoverpa zea. S. frugiperda attacks preferably the maize plants consuming much of the leaf area before the leaves develop. H. zea hurting the culture attacking style-stigma and destroying the mand. In order to promote the management of these pests with minimal use of pesticides, the technology of genetically modified plants has been the subject of many studies. In this paper, the objective was to evaluate the infestation and injuries of S. frugiperda and determine the oviposition behavior, intensity of infestation, damage to the style-stigma and in ear caused by H. zea in field conditions in conventional and transgenic maize hybrids. The hybrids were planted in the harvest in the summer of 2010 and in harvest 2010/2011, in a randomized blocks with seven treatments (hybrids) and four replications. Different levels of infestation of larvae occurred throughout the development of conventional and transgenic hybrids. The hybrid 2B710HX was the least infested with larvae of S. frugiperda and the least damaged, which concludes that the Cry1F toxin was the most effective in protecting the plant, regardless of time of sowing. The hybrids expressing the Cry11Ab and Cry1F toxin were most effective in controlling H. zea in Jaboticabal, SP, regardless of sowing time. In Pindorama, SP, toxin Cry1F showed good results against the infestation of caterpillars / Doutor

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