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Seleção de Bacillus spp. da Amazônia Brasileira portadores de genes Cry e/ou PhaC via síntese Polihidroxiacalnoatos (PHAs) para o controle de Aedes aegypti Linnaeus 1762

Katak, Ricardo de Melo 27 November 2015 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:13:49Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ricardo M. Katak.pdf: 1544893 bytes, checksum: b7b82696df95a9ce886dc0401cb6f29c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:14:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ricardo M. Katak.pdf: 1544893 bytes, checksum: b7b82696df95a9ce886dc0401cb6f29c (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-04-24T13:14:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ricardo M. Katak.pdf: 1544893 bytes, checksum: b7b82696df95a9ce886dc0401cb6f29c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T13:14:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Ricardo M. Katak.pdf: 1544893 bytes, checksum: b7b82696df95a9ce886dc0401cb6f29c (MD5) Previous issue date: 2015-11-27 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Insect vectors of tropical diseases such as Ae. Aegypti, the main vector of dengue virus, chikungunya, zika and West Nile virus, are a major problem for public health. One of the major control measures is to control the vector. In this regard, we sought to investigate the biological control of Ae. aegypti; with the use of Bacillus spp .; Amazon isolated from different environments. From the different samples, there was obtained a total of 118 bacterial strains, and 41 strains identified by phenotypic characteristics such as bacilli. Of these, 38 were positive and gram 2 gram negative bacilli. The molecular identification of these strains allowed the identification of 29 strains were characterized in three different genres. The molecular characterization of patients bacilli of Cry4 genes, cry11 and PHAC. Cry4 genes were observed in BtAM41, 2R6.2.1LB lines with no toxicity. The Bio19LB lines, BSBioLB, Bio01LB and Bio011LB presented the cry11 genes, as the larvicidal activity were efficient in both phases of bioassays except Bio011 lineage that any result below 50% in the second stage of bioassays. The 2WISP2, K5NA lines, R8ISP2, R15ISP2, Bio16LB, BtAM125LB, BtAM49LB just presented the PhaC gene. Just BtAM49LB strain was effective in larvicidal activity. Considering the results of the first and second stage, the best results when there were interaction sterile lysed cell supernatant (SN), showing 100% in 72 h. In this sense, it is recommended to study the characterization of metabolites of these strains. The K4NA lines; 103PHAISP2, BtAM220NA; ALP2ISP2, BtAM74LB and PHA50ISP2 bear the cry11 and PHAC genes showed no larvicidal activity above 50% considering it was not observed correlation of genes associated with larvicidal activity. Only Bio19LB strain showed the cry11 gene and Cry4, with larvicidal activity above 50% in the supernatant of lysed cells with interaction with 70% mortality within 72 h. There was no correlation of the phaC gene and Cry isolated, but the best results were in the supernatant of lysed cells with consortium, possibitando the possibility of interaction of molecules with insecticidal activity. So before these results are needed more detailed studies to understand and elucidate the interaction of strains that showed higher larvicidal activity, it is concluded that the strains that showed larvicidal activity above 50% and the same carriers of cry11 genes, Cry4 and PHAC can be associated with other virulence and pathogenicity factors, becoming future potential lines for the control of Ae. Aegypti. / Insetos vetores de patógenos tropicais como Ae. Aegypti, principal vetor do vírus dengue, chikungunya, zika e vírus do Nilo Ocidental, são um grande problema para saúde pública. Uma das principais medidas de combate é o controle do vetor. Neste sentido, buscou-se investigar o controle biológico de Ae. aegypti; com uso de Bacillus spp.; isolados de diferentes ambientes Amazônicos. A partir de diferentes amostras, obteve-se o total de 118 linhagens bacterianas, sendo 41 linhagens identificadas por características fenotípicas como bacilos. Destes, 39 foram bacilos gram positivos e 2 gram negativos. A identificação molecular destas linhagens permitiu identificar 29 linhagens, sendo caracterizadas em três gêneros distintos. Quanto a caracterização molecular dos bacilos portadores dos genes Cry4, Cry11 e PhaC. Foram observados genes Cry4 nas linhagens BtAM41, 2R6.2.1LB, com ausência de toxicidade. As linhagens Bio19LB, BSBioLB, Bio01LB e Bio011LB apresentaram os genes Cry11, quanto a atividade larvicida foram eficientes nas duas etapas dos bioensaios exceto a linhagem Bio011 que apresentou resultados abaixo de 50 % na segunda etapa dos bioensaios. As linhagens 2WISP2, K5NA, R8ISP2, R15ISP2, Bio16LB, BtAM125LB, BtAM49LB apresentaram apenas o gene PhaC. Apenas a linhagem BtAM49LB foi eficiente na atividade larvicida. Considerando os resultados dos bioensaios seletivos de extratos brutos de Bacillus spp., os melhores resultados foram quando houve a interação do sobrenadante estéril com células lisadas (SN), apresentando 100 % em 72 h. Neste sentido, recomenda-se estudos da caracterização dos metabolitos destas linhagens. As linhagens K4NA; 103PHAISP2, BtAM220NA; ALP2ISP2, BtAM74LB e PHA50ISP2 portadoras dos genes Cry11 e PhaC, não apresentaram atividade larvicida acima de 50 %, considerando que não foi observado correlação dos genes associados com atividade larvicida. Somente a linhagem Bio19LB apresentou os genes Cry11 e Cry4, apresentando atividade larvicida acima de 50 % na interação de sobrenadante com células lisadas com 70 % de mortalidade em 72 h. Não foi observado correlação dos genes PhaC e Cry nos isolados, mas os melhores resultados foram no consórcio do sobrenadante + células lisadas, possibilitando a hipótese de interação de moléculas com atividade inseticida. Portanto, diante destes resultados são necessários mais estudos detalhados para compreender e elucidar a interação das linhagens que apresentaram maior atividade larvicida, conclui-se que as linhagens que apresentaram atividade larvicida acima de 50 % e as mesmas portadoras dos genes Cry11, Cry4 e PhaC podem estar associados a outros fatores de virulência e patogenicidade, tornando-se futuramente linhagens potenciais para o controle de Ae. Aegypti no Estado do Amazonas.
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Seleção e caracterização de novos genes vip3A: genes inseticidas de segunda geração de Bacillus thuringiensis

Marucci, Suzana Cristina [UNESP] 03 December 2010 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-12-03Bitstream added on 2014-06-13T20:14:46Z : No. of bitstreams: 1 marucci_sc_me_jabo_parcial.pdf: 42548 bytes, checksum: 705ccf6a74fac7e11f4cb25dc8fb9403 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-01-16T10:37:51Z: marucci_sc_me_jabo_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-01-16T10:38:35Z : No. of bitstreams: 1 000638549.pdf: 1096070 bytes, checksum: 93634385c53868612602ba315f79ea43 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Como uma alternativa para diminuir as agressões constantes que o ecossistema vem sofrendo, devido à grande quantidade de produtos químicos utilizados no controle de pragas, pesquisas envolvendo microrganismos capazes de promover o controle biológico tem se intensificado. Dentre estes microrganismos a bactéria Bacillus thuringiensis tem se destacado. Essa bactéria caracteriza-se pela produção de proteínas tóxicas a representantes de diversas ordens de insetos. Em particular, as proteínas Vip3A, estão em amplo estudo devido a sua especificidade, alto potencial ativo e como alternativa para o controle da resistência de insetos às proteínas Cry. Diante disto, o objetivo deste trabalho foi selecionar, a partir de 1080 isolados de diferentes regiões brasileiras, aqueles portadores de genes vip3A e obter a sequência de nucleotídeos completa dos mesmos. As linhagens padrão B. thuringiensis var. kurstaki HD1, B. thuringiensis var. tolworthi HD125 e o isolado I187 tiveram seus DNAs amplificados com oligonucleotídeos baseados na sequência de genes vip3A, descritos no banco de dados de B. thuringiensis e, a partir dos amplicons obtidos, a sequência completa de nucleotídeos dos mesmos foi determinada, utilizando-se da estratégia de “primer walking”. A proteína Vip3Aa43 (GenBank: [HQ594534]) da linhagem HD1 demonstrou ser 100% idêntica às proteínas Vip3Aa já descritas. Já as proteínas Vip3Aa42 (GenBank: [HQ587048]) da linhagem HD125 e Vip3Ag5 (GenBank: [HQ542193]) do isolado I187 demonstraram similaridade de 99% com as proteínas descritas Vip3Aa35 e Vip3Ag2, respectivamente, demonstrando serem duas novas proteínas Vip3A, devido às substituições de aminoácidos ocorridas. Os três genes vip3A obtidos poderão ser utilizados na produção de plantas Bt, piramidadas ou não, visando ao manejo da resistência dos insetos praga / As an alternative to decrease the constant aggressions that the ecosystem has suffered due to the large amount of chemical products used in pest control, researches involving microorganisms able to promoting biological control have been intensified. Among these microorganisms the bacterium Bacillus thuringiensis has been stood out. This bacterium is characterized by the production of toxic proteins to representatives of several insect orders. In particular, the Vip3A proteins are in large study due to its specificity, and high active potential as an alternative to control of insect's resistance to Cry proteins. According to this, the aim of this work was to select from 1080 isolates in different Brazilian regions, those carrying vip3A genes and obtain the complete nucleotide sequence of the same. The standard strains B. thuringiensis var. kurstaki HD1, B. thuringiensis var. tolworthi HD125 and the isolate I187 had their DNA amplified with primers based on vip3A gene sequence described in database of B. thuringiensis, and from the amplicons obtained, the full sequence of nucleotides was determined, by the use of the strategy of primer walking. The protein Vip3Aa43 (GenBank: [HQ594534]) of HD1 strain showed to be 100% identical to Vip3Aa proteins already described. However, the proteins Vip3Aa42 (GenBank: [HQ587048]) of HD125 strain and Vip3Ag5 (GenBank: [HQ542193]) of the isolate I187 showed 99% similarity with the Vip3Aa35 and Vip3Ag2 proteins described, respectively, showing been two new Vip3A proteins due to amino acid substitutions occurred. The three vip3A genes obtained can be used in the production of Bt crops, pyramidal or not, aiming to resistance management of pest insects

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