Submitted by Guilherme Giacomini (giacomini@ibb.unesp.br) on 2017-11-09T00:24:52Z No. of bitstreams: 1 DissertacaoGuilherme_acervo.pdf: 2216493 bytes, checksum: 5df4eb4d175e55f62c2facdc924fe753 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-11-21T14:00:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 giacomini_g_me_bot.pdf: 2216493 bytes, checksum: 5df4eb4d175e55f62c2facdc924fe753 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-21T14:00:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 giacomini_g_me_bot.pdf: 2216493 bytes, checksum: 5df4eb4d175e55f62c2facdc924fe753 (MD5) Previous issue date: 2017-02-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O volume é um dos fatores mais importantes na avaliação dos seios paranasais. A literatura mostra uma falta de consenso em estudos de volume dos seios maxilares (SMs). Isto pode ser atribuído às diferentes técnicas de aquisição dos exames de tomografia computadorizada, diferentes métodos de segmentação e diferentes objetos de estudo. Além disto, métodos de quantificação volumétrica são comumente manuais ou semiautomáticos, necessitando de alta experiência e tempo do usuário. A padronização das medidas de SMs é extremamente importante para determinação dos fatores que influenciam o tamanho desta região anatômica sob condições normais e patológicas, bem como para entendimento das funções dos SMs. Métodos de quantificação ainda podem auxiliar em estudos detalhados da estrutura anatômica dos SMs de modo a auxiliar no planejamento de cirurgias endoscópicas e de procedimentos odontológicos de levantamento do assoalho desta região. Também podem auxiliar na verificação de resposta à tratamentos em diferentes patologias, tais como a presença de rinossinusite, tumores, cistos, entre outras. O objetivo deste estudo foi o desenvolvimento de uma ferramenta automática para quantificar o volume total e de ar livre presente nos SMs, utilizando exames de tomografia computadorizada. A ferramenta desenvolvida exclui qualquer variabilidade resultante dos procedimentos de medição e separa as regiões de ar livre e de comprometimento dentro dos SMs sadios e patológicos. O volume dos SMs foi quantificado em 30 pacientes. Para avaliar a precisão do método automático, os resultados foram comparados com uma segmentação manual, realizada por um radiologista experiente. A diferença percentual média entre os métodos automático e manual foi 7,19% ± 5,83% e 6,93% ± 4,29% para o volume total e volume de ar livre, respectivamente. Estatísticas de regressão linear e Bland-Altman mostraram boa correlação e baixa dispersão entre os métodos. Esta pesquisa traz contribuições originais quanto a combinação de distintas técnicas de processamento de imagens (watershed, limiarização e operadores morfológicos) aplicados em um método híbrido. Outra contribuição desta pesquisa é a inovação no desenvolvimento de um método totalmente automático, rápido (aproximadamente 3 minutos por exame) e de fácil implementação na prática clínica para avaliação dos SMs. / Volume measurement is one of the most important factors in analyzing paranasal sinuses. The literature shows a lack of consensus in studies of maxillary sinus volume. This may be attributed to different computed tomography data acquisition techniques, segmentation methods, and focuses of investigation. Furthermore, methods for volumetrically quantifying the maxillary sinus are commonly manual or semiautomated, which require substantial user expertise and are time-consuming. The standardization of maxillary sinus measurements is extremely important for determining the factors that influence the size of this anatomical region under normal and pathological conditions, and to provide a better understanding of the functions of the maxillary sinus. Quantification methods may also allow the detailed study of the anatomical structure evaluated, helping the planning of endoscopic surgeries and dental procedures of sinus floor elevation. These methods may also help to check the response to treatments in different pathologies, such as rhinosinusitis, tumors, cysts, and others. The purpose of the present study was to develop an automated tool for quantifying the total and air-free volume of the maxillary sinus using computed tomography images. The developed tool excludes the variability that is inherent in different measurement procedures and separates the air-free and involvement regions in the maxillary sinus in normal and pathological condition. The maxillary sinus volume was quantified in 30 patients. To evaluate the accuracy of the automated tool, the results were compared with manual segmentation that was performed by an experienced radiologist. The mean percent differences between the automated and manual methods were 7.19% ± 5.83% and 6.93% ± 4.29% for total and air-free maxillary sinus volume, respectively. Linear regression and Bland-Altman statistics showed good agreement and low dispersion between both methods. The original contribution of this research was a combination of different image processing techniques (watershed, threshold, and morphological operators) applied in a hybrid method. Other contribution of this study was the development of a fully automated and rapid (about 3 minutes per exam) tool for maxillary sinus volume assessment, allowing to be used easily in clinical practice.

O planeta terra tem grande dimensão, e seus recursos naturais precisam ser mapeados e conhecidos para nortear políticas públicas. O solo é um destes importantes recursos. O seu conhecimento passa pela caracterização e mapeamento pedológico e/ou de seus atributos. Para o adequado monitoramento, é necessário o conhecimento em escala detalhadas. Isto demanda recursos humanos, altos custos financeiros e de logística. Fato este ainda difícil de se atingir. Logo, é preciso investir em tecnologias que auxiliem na rápida obtenção de informações de qualidade, à baixo custo. Tendo em vista as áreas agrícolas da região de estudo, os objetivos deste trabalho foram: (i) definir uma metodologia que identifique em imagens de satélite, locais de o solo exposto; (ii) Mapear os teores granulométricos através de imagens de satélite e atributos do relevo, utilizou-se das imagens compostas do tópico (i). A área de estudo localiza-se na região de Araraquara, São Paulo, Brasil, com dimensão de 14.614 km2. Dentro desta área foram demarcados 952 pontos para coleta de amostras de terra na camada superficial, as quais foram georreferenciadas e analisadas granulometricamente em laboratório. Sua demarcação seguiu os preceitos do método da topossequência com o intuito de representar a variabilidade da região. Foram obtidas imagens do satélite Landsat 5 (sensor TM) multitemporais as quais foram processadas e transformadas em reflectância. As amostras de terra coletadas em campo passaram por sensor em laboratório (400-2500 nm), os espectros laboratoriais foram utilizados para validar aqueles obtidos nas imagens de satélite. Para tanto, nos locais onde foram coletadas as amostras, foram extraídos os dados espectrais dos pixels perfazendo os gráficos das curvas espectrais. Estas foram comparadas com os dados de obtidos em laboratório simulados. Feita a correlação, as imagens passaram por processos de eliminação de objetos que não fossem solo. Todas as imagens multitemporais foram finalizadas contendo apenas solo exposto, as quais dentro do software R foram sobrepostas e gerou-se uma imagem composta, com apenas solo exposto. Os resultados mostraram que as curvas espectrais de laboratório foram extremamente semelhantes aos das imagens de satélite, seguindo a lógica das variações texturais. Além disso, as técnicas de componentes principais e relação entre bandas 3-4, 5-7, e correlação entre bandas (sendo a mais expressiva com r de 0,87 entre TM7), comprovaram que a imagem apresentou solo exposto. Se um usuário utilizar-se somente uma imagem para estudar solos, teria na faixa de 4% de solo exposto, porém utilizando a técnica de composição de imagens, atingiria 43%. Não obstante, se a área de estudo fosse 100 % com agricultura poderia atingir 95% de solo exposto. Num segundo momento, o trabalho comprova, com o modelo Cubist, que tanto por imagens de satélite quanto por relevo foi possível quantificar os teores de argila da área da camada superficial, atingindo R2 de ≈0,65. No entanto, a qualidade visual do mapa gerado por relevo é ruim. Porém, quando se integra dados de imagens, relevo e geomorfologia, este resultado é de 0,72 e apresenta o melhor resultado visual. / Planet Earth has great dimension, and its natural resources has to be mapped and monitored, looking towards correct decisions. Soil is one of these important resources. Know soils is related with its caracterization and mapping by pedological and attributes recognition. For soil monitoring, its necessary maps in large scale, which demand man power and high cost. Thus, its necessary to invest in geotechnologies, to reach the goal faster and low cost. The objective of this work was to determine a method to determine exposed soils in satellite images, even when have vegetation, taking in account a multitemporal dataset, in agricultural areas, where as in a given season will have exposed soils. b. quantify clay and sand contents by satellite images and relief attributes. The area is located in Araraquara, SP, Brazil, with a 14.614 km2 dimension. We collected soil samples all over the area with a total of 952 points and 0-20 cm depth, georeferenced, representative of the area. Samples were granulometric analysed and afterwards passed throgh a vis-nir-swir sensor (400-2500 nm). We collected multitemporal images from landsat satellite from september and october n the last 15 years. Images were atmospheric corrected and transformed into reflectance. Laboratory spectral data was used to validate pixels spectra information from satellite. We extracted all objects which were not soils from all images. Using R software, we merged the multitemporal images and performed a unique bare soil image. Also, we made processing on the DEM of the área reaching several soil attribute factors. Results indicated as follows: a. labortory spectral curves validated satellite data; b) principal componentes and relation between bands ¾ and 5/7 reached great R2 until 0,87 between laboratory and satellite data; d) a user could reach 1,21% of na image with bare soil, while with our method could reach 43% in the entire image. On the other hand, if the user have only agriculture area, could reach until 95% with bare soil. In a second step of this work, we prove that by regression tree statistics, clay and sand content can be quantified by satellite images with a 0,62 of R2, as also with terrain atributes. On the other hand, when we associate image spectral data with terrain atributes, we can reach 0,72 on clay quantification. Despite this, the visual aspecto of data, is better using image data than relief , which presented more noise. Another conclusion, is that images could substitute geology information in the models. This work can considerably assist pedologists, farmers and environment professionals on soil monitoring.

As imagens de Angiografia por Ressonância Magnética (angio-RM) e Tomografia Computadorizada (angio-TC) são ferramentas amplamente usadas em processos de quantificação vascular e no diagnóstico de doenças cardiovasculares, as quais são consideradas entre as principais causas de morte. Contudo, a análise dos vasos em larga escala a partir das imagens é dificultada, tanto pela variabilidade natural dos vasos no corpo humano, quanto pela grande quantidade de dados disponíveis. Além disso, os métodos de quantificação existentes, usualmente extraem as características a partir dos esqueletos, ou até mesmo das próprias imagens de angiografia, razão pela qual tais métodos podem fazer necessária a reanálise das imagens repetidas vezes. Com o intuito de facilitar a análise e de fornecer uma ferramenta de apoio ao diagnóstico, neste trabalho são apresentados um modelo de representação textual de redes vasculares e uma metodologia de quantificação vascular automática, que é feita a partir dessa representação. A representação é obtida a partir da segmentação de imagens volumétricas de angio-RM e angio-TC, seguida da extração de trajetórias e diâmetros de redes vasculares. Tal representação é híbrida, combinando grafos e uma sequência textual de instruções, e permite não apenas a extração de caraterísticas morfológicas da rede vascular, como também a compressão das imagens e, ainda, a reconstrução de imagens similares às imagens originais. A partir das características extraídas, foram realizados estudos comparativos entre arquiteturas vasculares, o que é feito tanto por meio do uso de imagens sintéticas, como por meio de imagens reais, imagens nas quais foi possível encontrar diferenças entre arquiteturas, além de viabilizar a caracterização de aneurismas em um indivíduo. Paralelamente, desenvolvemos um método que permite identificar similaridade entre segmentos vasculares, o que por sua vez possibilita o reconhecimento e rotulação de segmentos em um conjunto de redes vasculares. A metodologia por nós desenvolvida deve também auxiliar no desenvolvimento de processos de classificação de vasos sanguíneos, de ferramentas para o diagnóstico automático de doenças vasculares, e para a melhora de técnicas utilizadas na prática clínica. / Magnetic Resonance Angiography (angio-MR) and Computed Tomography Angiography (angio-TC) are widely used imaging techniques used for vascular quantification and the diagnosis of cardiovascular diseases, considered one of the main causes of death. Blood vessel analysis using angiographic images is intrisically difficult because of the natural human vessel variability and the large amount of information. Additionally, most quantification methods perform the analysis of entire datasets, which can be very time consuming when they need to be reanalyzed. With the aim of reducing these problems and to provide a tool to aid diagnosis, we propose a textual representation model for vascular networks and an automatic vascular quantification methodology. The representation is obtained from volumetric image segmentation of angio-MR and angio-TC, followed by the extraction of the trajectory and the blood vessel diameters. This representation is hybrid in nature, combining graphs and a sequence of textual instructions, allowing for the extraction of morphological features, image compression, and the synthesis of angiographic images. Using extracted features derived from the model, comparative studies of vascular architecture can be performed. Experiments were made using synthetic and real images, in which was possible to find structural differences that make feasible to characterize abnormalities such as aneurysms. Also, a vessel similarity identification method was developed, which makes it possible to recognize vessel segments and label them in a set of vessel networks. The proposed methodology should aid in blood vessel classification processes, automatic diagnosis of cardiovascular diseases, and allow development of methods and applications that could be used in the clinical practice.

Trabalho realizado na Empresa Gisgeo Informations Sysytems, orientado pela Cláudia Ribeiro da Silva / Tese de mestrado integrado. Engenharia do Ambiente (Projeto). Faculdade de Engenharia. Universidade do Porto. 2012

Orientador: Diana Rodrigues de Pina / Resumo: A tuberculose (TB) é uma das doenças infecciosas de grande preocupação mundial. Seu agente etiológico, a Mycobacterium tuberculosis, é a espécie de micobactéria mais importante do ponto de vista da saúde pública. Seu agente etiológico, tem aumentado sua resistência frente as drogas de tratamento, ocasionando mudança nos esquemas terapêuticos. Desde 2009, a TB passou a ser tradada com quatro drogas em um único comprimido com dose combinada de rifampicina, isoniazida, pirazinamida e etambutol (esquema II). Antes desse período, o tratamento era realizado através da combinação de três drogas: rifampicina, isoniazida e pirazinamida (esquema I). O exame de raios X é o método de diagnóstico por imagem mais realizado no acompanhamento de pacientes diagnosticados com TB. Esta pesquisa teve como objetivo a quantificação objetiva das áreas pulmonares acometidas pela tuberculose utilizando exames de raios X e associá-la aos exames séricos (índices de proteína C-reativa, velocidade de hemossedimentação e albumina) e esforço pulmonar, em estágios de pré e pós-tratamento de tuberculose. Este procedimento de associação entre os exames abordados foi realizado com dois esquemas anti-tuberculose (esquemas I e II). A quantificação objetiva do comprometimento pulmonar foi realizada utilizando um algoritmo computacional previamente desenvolvido. A correlação entre a quantificação objetiva do comprometimento pulmonar e os exames séricos comprovou que durante o processo inflamatório da doença a re... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Tuberculosis (TB) is an infectious disease of great concern worldwide. Its etiological agent, Mycobacterium tuberculosis, is the most important mycobacteria species concerning public health. Its etiological agent has increased its resistant to drug treatments, leading to a change in the therapeutic regimens. Since 2009, TB has been treated with four drugs: rifampicin, isoniazid, pyrazinamide and ethambutol (scheme II). Prior to this time, treatment was performed through combination of three drugs: rifampicin, isoniazid, and pyrazinamide (scheme I). X ray exam is the most used diagnostic imaging method to follow-up patients with TB. The objective of this research was the objective quantification of the pulmonary areas affected by tuberculosis using X ray exams and to associate it with serum exams (albumin, erythrocyte sedimentation rate and C-reactive protein) and pulmonary effort in the pre and post-treatment stages of tuberculosis. This procedure of association between the examinations was performed with two anti-tuberculosis regimens (scheme I and II). The objective quantification of pulmonary involvement was performed using a computational algorithm previously developed. The correlation between the objective quantification of pulmonary involvement and serum exams has shown that during the inflammatory process of the disease there is an increase in the pulmonary region affected and had a reduction in lung impairment of 73.23±11.57% and 69.52±17.06% for schemes I and II, r... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

UCHOA, Paula Karina Santos. Estudo do potencial químico-farmacológico de metabólitos secundários de fungos da Costa Cearense: Aspergillus niger. 2017. 2011 f. Tese (Doutorado em Química)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2017. / Submitted by Anderson Silva Pereira (anderson.pereiraaa@gmail.com) on 2017-02-08T20:45:42Z No. of bitstreams: 1 2017_tese_pksuchoa.pdf: 16649275 bytes, checksum: ef700c069cae733143409f052e0350e3 (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-02-10T21:07:38Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2017_tese_pksuchoa.pdf: 16649275 bytes, checksum: ef700c069cae733143409f052e0350e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T21:07:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2017_tese_pksuchoa.pdf: 16649275 bytes, checksum: ef700c069cae733143409f052e0350e3 (MD5) Previous issue date: 2017 / EtOAc extract from the BRF074 strain (Aspergillus niger), cultivated in BD medium and isolated from sediments collected on Pecém beach (CE), showed high cytotoxic activity (77%, IC50 0,95) against the cancer cell line HCT-116 (colon). Thus, a bioguided study aiming the optimization of the culturing conditions of A. niger was conducted in which four different culture media were evaluated: PD (potato, dextrose), PDY (potato, dextrose and yeast), MPD (malt, peptone and dextrose) and MntPY (mannitol, peptone and yeast), in four growth periods: 07, 14, 21 and 28 days. From the cultive of A. niger in BD culture medium during 28 days, seven secondary metabolites were isolated: cyclo(4-hydroxy-L-Pro-L-Leu), cyclo(4-hydroxy-L-Pro-L-Phe), cyclo(L-Pro-L-Leu), cyclo(L-Pro-L-Phe), pseurotin D, pseurotin A and chlovalicin. The BDL culture medium (14 days) led to the isolation of the diketopiperazine cyclo(L-Pro-L-Val) and cyclopeptides malformin A and malformin C, whereas the MPD medium for 7 days provided a new compound, an ester furanic first report in the literature. Malformins A and C and the new compound were active against the cancer cell line HCT-116. A quantitative method of high performance liquid chromatography (HPLC) was developed and validated for the quantification of these cytotoxic metabolites in different nutritional media and growth periods. This method reveal that in the BDL medium, within 21 and 28 days, greater amounts of malformin A and C were produced, whereas the furanic ester was produced in higher levels in the MPD medium with 28 days. In parallel, an epigenetic study was performed using SAHA as reagent and the fungus strain LG0949. This experiment led to the isolation of the compounds phomalactone, dihydrophomalactone and acetophomalactone, acetanilide and a dimer of the SAHA. Isolation of the secondary metabolites was conducted using C18 reverse phase chromatography using a solid phase extraction cartridge and high performance liquid chromatography (HPLC). The structural characterization was done using spectrometric techniques such as mass spectrometry, nuclear magnetic resonance (1H and 13C) and infrared, in addition to comparison with literature data. / O extrato AcOEt da cepa BRF074 (Aspergillus niger), cultivada em BD e isolada a partir de sedimentos coletados na praia do Pecém (Fortaleza-CE), apresentou alta atividade citotóxica (77%; IC50 0,95) frente à linhagem de células tumorais HCT-116 (cólon). Desta forma, um estudo bioguiado de cultivo foi conduzido para este micro-organismo utilizando quatro meios de culturas distintos: BD (batata, dextrose), BDL (batata, dextrose e levedura), MPD (malte, peptona e dextrose) e MntPL (manitol, peptona e levedura), em quatro períodos de crescimento: 07, 14, 21 e 28 dias. A partir do cultivo de A. niger em meio de cultura BD por 28 dias, foram isolados sete metabólitos secundários: ciclo(4-hidroxi-L-Pro-L-Leu), ciclo(4-hidroxi-L-Pro-L-Phe), ciclo(L-Pro-L-Leu), ciclo(L-Pro-L-Phe), pseurotin D, pseurotin A e clovalicina. O meio de cultivo BDL (14 dias) levou ao isolamento da dicetopiperazina ciclo(L-Pro-L-Val) e dos ciclopeptídeos malformina A e malformina C, enquanto que o meio MPD durante 7 dias forneceu um ester furânico, de caráter inédito na literatura. As malforminas A e C e o composto inédito apresentaram-se ativas frente a linhagem de células HCT-116. Um método quantitativo de cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE) foi desenvolvido e validado para a quantificação destes metabólitos citotóxicos em diferentes meios nutricionais e períodos de crescimento. A partir deste método, foi observado que no meio BDL, nos períodos de 21 e 28 dias as malforminas A e C foram produzidos em maior quantidade, enquanto que o ester furânico foi produzido em maiores teores no meio MPD em 28 dias. Em paralelo, foi realizado um estudo envolvendo epigenética utilizando o reagente SAHA e a cepa do fungo LG0949. A partir deste experimento foram isolados os compostos phomalactona, dihidrophomalactona e acetophomalactona, e os compostos acetanilida e dímero do reagente SAHA. O isolamento dos metabólitos secundários foi realizado através de cromatografia em fase reversa C18, utilizando cartucho para extração em fase sólida e cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE). A caracterização estrutural foi realizada através do uso de métodos espectrométricos, tais como espectrometria de massas, ressonância magnética nuclear (1H e 13C) e infravermelho, além de comparação de dados da literatura.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:11Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-01-19Bitstream added on 2014-06-13T20:08:51Z : No. of bitstreams: 1 rinaldo_d_me_araiq.pdf: 1938518 bytes, checksum: a509ac17408e64d3137339681fe5c3e1 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Este trabalho aborda a investigação de Neea theifera Oerst. (Nyctaginaceae), uma planta brasileira conhecida popularmente como o Capa-rosa-do-campo. Esta espécie é usada na medicina popular contra doenças gástricas e diarréias. As folhas foram coletadas e extraídas sequencialmente com clorofórmio e metanol. O extrato metanólico foi fracionado por cromatografia líquida de média pressão em fase reversa, seguido de cromatografia de permeação em gel (Sephadex LH-20), e foi possível isolar os flavonóides vitexina, isovitexina, orientina, isoorientina, vicenina-2, crisoeriol, apigenina, luteolina e luteolina-7-O-[2''-O-(5'''-O-feruloil)-D-apiofuranosil]- ß-D-glicopiranosídeo, identificados por técnicas espectrométricas (RMN, UV, IV, MS). Os flavonóides presentes no extrato metanólico foram quantificados por HPLC-DAD, apresentando um teor de 5,6% no extrato metanólico e 0,85% nas folhas. Os ensaios farmacológicos in-vivo mostraram que os extratos não foram capazes de inibir as úlceras induzidas por HCl/etanol. Por outro lado, eles não apresentaram efeitos mutagênicos. Ambos os extratos apresentaram atividade antimicrobiana. O extrato clorofórmico revelou promissora atividade contra Mycobacterium tuberculosis (62,5 æm mL-1) e o extrato metanólico contra Staphylococcus aureus (50 æm mL-1). O extrato metanólico também apresentou atividade imunomodulatória. Portanto, os resultados obtidos mostraram-se importantes, pois eles sugerem que o uso popular de N. theifera como agente anti-úlcera pode não estar correto. Por outro lado, esta espécie demosntrou ser uma fonte promissora de metabólitos secundários com atividade antimicrobiana e imunomodulatória. / This work deals with the investigation of Neea theifera Oerst. (Nyctaginaceae), a Brazilian plant popularly known as 'Capa-rosa-do-campo'. This species is used in folk medicine against gastric diseases and diarrhea. Leaves were collected and extracted sequentially with chloroform and methanol. The methanolic extract was fractionated by reverse phase medium pressure liquid chromatography followed by gel permeation chromatography (Sephadex LH-20), and afforded the flavonoids vitexin, isovitexin, orientin, isoorientin, vicenin-2, chrysoeriol, apigenin, luteolin and luteolin-7-O-[2''-O-(5'''-O-feruloyl)-D-apiofuranosyl]-ß-D-glucopyranoside, identified by spectrometric techniques (NMR, UV, IR, MS). The flavonoids content in the methanolic extract was determined by HPLC-DAD as 5.6 % correspondent to 0.85 % in the leaves. In-vivo pharmacological assays did not inhibit ulcers induced by HCl / ethanol.They did not exhibit mutagenic effects. Both extracts revealed to be active against several microorganisms. The chloroformic extract showed promising activity against Mycobacterium tuberculosis (62.5 æm mL-1) whereas the methanolic extract revealed strong activity against Staphylococcus aureus (50 æm mL-1). The methanolic extract also displayed immunomodulatory activity. Therefore, these results are important, and they suggest that the folk use of N. theifera as an anti-ulcer agent might not be correct. However, this species is a promising source of secondary metabolites with antimicrobial and immunomodulatory activies.

Resumo: Este trabalho aborda a investigação de Neea theifera Oerst. (Nyctaginaceae), uma planta brasileira conhecida popularmente como o "Capa-rosa-do-campo". Esta espécie é usada na medicina popular contra doenças gástricas e diarréias. As folhas foram coletadas e extraídas sequencialmente com clorofórmio e metanol. O extrato metanólico foi fracionado por cromatografia líquida de média pressão em fase reversa, seguido de cromatografia de permeação em gel (Sephadex LH-20), e foi possível isolar os flavonóides vitexina, isovitexina, orientina, isoorientina, vicenina-2, crisoeriol, apigenina, luteolina e luteolina-7-O-[2''-O-(5'''-O-feruloil)-D-apiofuranosil]- ß-D-glicopiranosídeo, identificados por técnicas espectrométricas (RMN, UV, IV, MS). Os flavonóides presentes no extrato metanólico foram quantificados por HPLC-DAD, apresentando um teor de 5,6% no extrato metanólico e 0,85% nas folhas. Os ensaios farmacológicos in-vivo mostraram que os extratos não foram capazes de inibir as úlceras induzidas por HCl/etanol. Por outro lado, eles não apresentaram efeitos mutagênicos. Ambos os extratos apresentaram atividade antimicrobiana. O extrato clorofórmico revelou promissora atividade contra Mycobacterium tuberculosis (62,5 æm mL-1) e o extrato metanólico contra Staphylococcus aureus (50 æm mL-1). O extrato metanólico também apresentou atividade imunomodulatória. Portanto, os resultados obtidos mostraram-se importantes, pois eles sugerem que o uso popular de N. theifera como agente anti-úlcera pode não estar correto. Por outro lado, esta espécie demosntrou ser uma fonte promissora de metabólitos secundários com atividade antimicrobiana e imunomodulatória. / Abstract: This work deals with the investigation of Neea theifera Oerst. (Nyctaginaceae), a Brazilian plant popularly known as 'Capa-rosa-do-campo'. This species is used in folk medicine against gastric diseases and diarrhea. Leaves were collected and extracted sequentially with chloroform and methanol. The methanolic extract was fractionated by reverse phase medium pressure liquid chromatography followed by gel permeation chromatography (Sephadex LH-20), and afforded the flavonoids vitexin, isovitexin, orientin, isoorientin, vicenin-2, chrysoeriol, apigenin, luteolin and luteolin-7-O-[2''-O-(5'''-O-feruloyl)-D-apiofuranosyl]-ß-D-glucopyranoside, identified by spectrometric techniques (NMR, UV, IR, MS). The flavonoids content in the methanolic extract was determined by HPLC-DAD as 5.6 % correspondent to 0.85 % in the leaves. In-vivo pharmacological assays did not inhibit ulcers induced by HCl / ethanol.They did not exhibit mutagenic effects. Both extracts revealed to be active against several microorganisms. The chloroformic extract showed promising activity against Mycobacterium tuberculosis (62.5 æm mL-1) whereas the methanolic extract revealed strong activity against Staphylococcus aureus (50 æm mL-1). The methanolic extract also displayed immunomodulatory activity. Therefore, these results are important, and they suggest that the folk use of N. theifera as an anti-ulcer agent might not be correct. However, this species is a promising source of secondary metabolites with antimicrobial and immunomodulatory activies. / Orientador: Wagner Vilegas / Coorientador: Lourdes Campaner dos Santos / Banca: Ian Castro-Gamboa / Banca: Sebastião Ferreira Fonseca / Mestre

As imagens de Angiografia por Ressonância Magnética (angio-RM) e Tomografia Computadorizada (angio-TC) são ferramentas amplamente usadas em processos de quantificação vascular e no diagnóstico de doenças cardiovasculares, as quais são consideradas entre as principais causas de morte. Contudo, a análise dos vasos em larga escala a partir das imagens é dificultada, tanto pela variabilidade natural dos vasos no corpo humano, quanto pela grande quantidade de dados disponíveis. Além disso, os métodos de quantificação existentes, usualmente extraem as características a partir dos esqueletos, ou até mesmo das próprias imagens de angiografia, razão pela qual tais métodos podem fazer necessária a reanálise das imagens repetidas vezes. Com o intuito de facilitar a análise e de fornecer uma ferramenta de apoio ao diagnóstico, neste trabalho são apresentados um modelo de representação textual de redes vasculares e uma metodologia de quantificação vascular automática, que é feita a partir dessa representação. A representação é obtida a partir da segmentação de imagens volumétricas de angio-RM e angio-TC, seguida da extração de trajetórias e diâmetros de redes vasculares. Tal representação é híbrida, combinando grafos e uma sequência textual de instruções, e permite não apenas a extração de caraterísticas morfológicas da rede vascular, como também a compressão das imagens e, ainda, a reconstrução de imagens similares às imagens originais. A partir das características extraídas, foram realizados estudos comparativos entre arquiteturas vasculares, o que é feito tanto por meio do uso de imagens sintéticas, como por meio de imagens reais, imagens nas quais foi possível encontrar diferenças entre arquiteturas, além de viabilizar a caracterização de aneurismas em um indivíduo. Paralelamente, desenvolvemos um método que permite identificar similaridade entre segmentos vasculares, o que por sua vez possibilita o reconhecimento e rotulação de segmentos em um conjunto de redes vasculares. A metodologia por nós desenvolvida deve também auxiliar no desenvolvimento de processos de classificação de vasos sanguíneos, de ferramentas para o diagnóstico automático de doenças vasculares, e para a melhora de técnicas utilizadas na prática clínica. / Magnetic Resonance Angiography (angio-MR) and Computed Tomography Angiography (angio-TC) are widely used imaging techniques used for vascular quantification and the diagnosis of cardiovascular diseases, considered one of the main causes of death. Blood vessel analysis using angiographic images is intrisically difficult because of the natural human vessel variability and the large amount of information. Additionally, most quantification methods perform the analysis of entire datasets, which can be very time consuming when they need to be reanalyzed. With the aim of reducing these problems and to provide a tool to aid diagnosis, we propose a textual representation model for vascular networks and an automatic vascular quantification methodology. The representation is obtained from volumetric image segmentation of angio-MR and angio-TC, followed by the extraction of the trajectory and the blood vessel diameters. This representation is hybrid in nature, combining graphs and a sequence of textual instructions, allowing for the extraction of morphological features, image compression, and the synthesis of angiographic images. Using extracted features derived from the model, comparative studies of vascular architecture can be performed. Experiments were made using synthetic and real images, in which was possible to find structural differences that make feasible to characterize abnormalities such as aneurysms. Also, a vessel similarity identification method was developed, which makes it possible to recognize vessel segments and label them in a set of vessel networks. The proposed methodology should aid in blood vessel classification processes, automatic diagnosis of cardiovascular diseases, and allow development of methods and applications that could be used in the clinical practice.

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-01-19T18:57:09Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE_LUCIANA_FRANÇA_2015.pdf: 24518868 bytes, checksum: 4269eb570ad8b8aee5ee4554090855b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-19T18:57:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE_LUCIANA_FRANÇA_2015.pdf: 24518868 bytes, checksum: 4269eb570ad8b8aee5ee4554090855b3 (MD5) Previous issue date: 2015-06-05 / CAPES / O município de Lagoa dos Gatos, pertencente ao Estado de Pernambuco, localiza-se na mesorregião do Agreste e se insere na microrregião do Brejo Pernambucano, a 180 km da cidade do Recife. Este município é contemplado com um rico cenário, tanto da geodiversidade quanto da biodiversidade, constituído principalmente por cachoeiras, geoformas graníticas, serras, extensos lajedos e reserva de mata atlântica. Geologicamente o município está inserido na Província Borborema, sendo constituído pelos litotipos dos complexos Cabrobó e Belém do São Francisco e da Suíte Calcialcalina de Médio a Alto Potássio Itaporanga. Foi realizado um inventário dos geossítios considerando o inventário temático e sistemático proposto por Sharples a partir da abordagem de classificação baseado no contexto geológico-geomorfológico da região. A quantificação dos geossítios foi feita utilizando-se o método de Brilha, determinando-se os valores: (A) intrínseco, (B) de uso potencial e (C) de necessidade de proteção. Após a quantificação, os geossítios foram divididos em grupos, de acordo com a sua semelhança, a partir da aplicação da técnica de Análise de Agrupamentos. Os resultados obtidos não invalidam a quantificação tradicional, onde é determinado um índice de quantificação denominado Q, que corresponde à média aritmética dos valores dos geossítios de caráter regional ou local, aplicando-se aos valores dos geossítios. Os valores A, B e C são avaliados distintamente, e as relações desses três elementos criam uma resposta em forma de grupos que representam as diversas modalidades da geodiversidade de uma determinada área. A aplicação da técnica de Análise de Agrupamentos permitiu a formação de 5 grupos a partir dos catorzes geossítios inventariados. De acordo com as características dos grupos, foi possível definir prioridades, através de um plano de ação, no qual foram pontuadas estratégias de divulgação, de uso e de preservação, visto que geralmente há limitação de recursos a serem investidos. / The municipality of Lagoa dos Gatos, in the State of Pernambuco, located in the middle region of Agreste and inserts on the microregion Pernambucano Brejo. This municipality is covered with a rich scenario, both geodiversity as biodiversity, mainly of waterfalls, granite landforms, mountain ranges, large flagstones and Mata Atlântica reserve. Geologically the municipality is inserted in the Borborema Province, being composed of rock types of Cabrobó complex and Belém de São Francisco and suite Calcialcalina Medium to High Potassium Itaporanga. An inventory was conducted of geosites considering the thematic and systematic inventory proposed by Sharples from the classification approach based on the geological and geomorphological context of the region. The quantification of geosite was made using the method Brilha, determining the values: (A) intrinsic (B) potential use and (C) need protection. After quantification, the geosites were divided into groups according to their similarity, from the application of the cluster analysis technique. After quantification, the geosites were divided into groups according to their similarity, from the application of the Cluster Analysis technique. The results do not invalidate the traditional quantification, which is given a quantification index known as Q, which is the arithmetic average of the national or local character geosites, applying the values of geosites. The values A, B and C are assessed distinctly, and the relationships of these three elements create a response in the form of groups representing the different types of geodiversity of a given area. The application of the cluster analysis technique allowed the formation of 5 groups from catorzes potential geosites inventoried. According to the characteristics of the groups, it was possible to set priorities, through a plan of action, which were scored dissemination strategies, usage and preservation, since there is usually limited resources to be invested.