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Analysis of Breast Lesions using a Simplified Rubber Band Straightening Transform and the Onion Transform

Lee, Matthew Allen 05 May 2007 (has links)
This thesis compares different methods that could be used to construct a computer aided diagnosis (CAD) system that analyzes mammograms. Such systems have many steps, but this thesis focuses on feature extraction, feature selection, and classification. The main comparison is between the simplified Rubber Band Straightening Transform (SRBST) and the Onion Transform, which are used to extract texture features. Another comparison is between 2D and 3D co-occurrence matrices. Next, features are selected using a greedy algorithm. This section mainly compares the effectiveness of Receiver Operating Characteristic (ROC) and Class Overlap Rating (COR). Also evaluated are the effectiveness of Linear Discriminate Analysis (LDA) and the sort order of features. Then the selected features are used to classify the lesions. In this part, Nearest Mean, Nearest Neighbor, and Maximum Likelihood are compared. The results are then used to determine the best combination of methods to use in a CAD system.
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Influência da somatotropina recombinante bovina (rBST) sobre parâmetros metabólicos, hormonais e de qualidade de sêmen em touros / Influence of bovine recombinant somatotropin (rBST) on metabolic parameters, hormones and semen quality of bulls

VIEIRA, Marcelo Brandi 07 May 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:37:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_marcelo_vieira.pdf: 644753 bytes, checksum: e45dacce2e978ab7c293923a447f7290 (MD5) Previous issue date: 2007-05-07 / The growth hormone (GH) have as main function improve proliferation and cellular development, but also participates of processes related to the immune system and reproductive function. The effect of GH is exerted by the IGF-I (insulin-like growth factor I), that is a hormone polypeptidic mitotic secreted by all cells that carry through mitosis. Since the development of the recombinant form of the bovine recombinant somatotropin (rBST) various studies have been developed on milk and meat production in farm animals. The objective of this study was to evaluate the effect of rBST on metabolic markers of energetic, protein, mineral and hepatic metabolism, as well as, to evaluate its effect on concentrations of IGF-I, insulin and quality parameters semen in bulls. This study was carried in central of artificial insemination ABS/PECPLAN using 20 bulls of european breeds. These animals were divided in two groups, a group that received a placebo application (NaCl, 0.9%) and another that received rBST (Lactotropin®/Elanco Animal Health). Five blood collections for evaluation of metabolic and hormonal markers and 6 semen collections with posterior freezing for the accomplishment of the corresponding semen evaluations. There was no effect of rBST (P > 0,05) in metabolic markers, except in the concentration of gamma- glutamyltransferase (GGT), that increased in the group that received rBST (P < 0,05), but inside the physiological range, in the hormones evaluations, IGF-I increased in the group treated with rBST (P < 0,05), but there wasn t difference in the insulin concentrations (P > 0,05). In relation to the semen evaluations, there were no differences observed (P > 0,05) in motility and morphology evaluated in the period before freezing. In after freezing evaluations, being that motility, morphology, integrity of plasmatic membrane by fluorescent sounding leads and the hiposmotic test, differences have been observed (P < 0,05) between groups, showing beneficial effect of rBST in these characteristics. In this way can be observed that rBST, beyond raising the IGF-I levels positively influenced the seminal after freezing characteristics evaluated without causing disequilibrium in the metabolism of treated animals since the concentrations of the evaluated metabolic markers were in accordance with the physiological standards for the bovine species. / O hormônio do crescimento (GH) possui como principal função realizar a proliferação e desenvolvimento celular, participando também de processos relacionados ao sistema imune e a reprodução. O efeito do GH é exercido pelo IGF-I (fator de crescimento semelhante à insulina I), que é um hormônio polipeptídico mitótico secretado por todas as células que realizam mitose. A partir do desenvolvimento da forma recombinante da somatotropina recombinante bovina (rBST) foram desenvolvidos inúmeros estudos relacionados a produção de leite e carne em animais de produção. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito do rBST sobre marcadores metabólicos relacionados ao metabolismo energético, protéico, mineral e hepático, bem como avaliar o seu efeito nas concentrações de IGF-I, insulina e nos parâmetros de qualidade de sêmen em touros. Este estudo foi realizado na central de inseminação artificial ABS/PECPLAN, com 20 touros de raças predominantemente européias. Estes animais foram divididos em dois grupos, sendo que um grupo recebeu a aplicação do placebo (solução fisiológica, NaCl 0,9%) e outro rBST (Lactotropin®/Elanco Saúde Animal). Foram realizados 5 coletas de sangue para avaliação dos marcadores metabólicos e hormonais e 6 coletas de sêmen com posterior congelamento para a realização das correspondentes avaliações de sêmen. De acordo com os resultados não foi observado (P > 0,05) efeito do rBST nas avaliações dos marcadores metabólicos, exceto nas concentrações da enzima hepática gama - glutamiltransferase (GGT), que foi mais elevada no grupo que recebeu o rBST (P < 0,05), mas de acordo com os padrões fisiológicos. Nas avaliações hormonais os níveis de IGF-I foram mais elevados no grupo tratado com rBST (P < 0,05), não sendo, porém, observadas diferenças para os níveis de insulina (P > 0,05). Em relação às avaliações de sêmen, não foram observadas diferenças entre os dois grupos (P > 0,05) na motilidade e morfologia espermática avaliadas no período pré-congelamento. Nas avaliações pós-congelamento que incluíam a motilidade, morfologia, integridade de membrana plasmática por sondas fluorescentes e pelo teste hiposmótico foram observadas diferenças (P < 0,05) entre os grupos, sendo demonstrado melhores índices no grupo que recebeu o tratamento com rBST. Desta forma pode-se observar que o rBST, além de elevar o níveis de IGF-I, influenciou positivamente as características seminais avaliadas no pós-congelamento sem que tivesse ocasionado desequilíbrio no metabolismo dos animais tratados, já que as concentrações dos marcadores metabólicos avaliados estavam de acordo com os padrões fisiológicos para a espécie bovina.
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Efeito da administração de somatotropina pré-parto em novilhas da raça Holandês com elevada condição corporal sobre parâmetros metabólicos, reprodutivos e produção leiteira / Effect of prepartum somatotropin injection in late pregnant Holstein heifers with high body condition score on metabolic, reproductive parameters and milk production

Acosta, Diego Andres Velasco 28 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:38:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_diego_andres_velasco_acosta.pdf: 554045 bytes, checksum: 4c51ec170f50997dc62e7caef5c6f9d2 (MD5) Previous issue date: 2012-02-28 / Negative energy balance (NEB) has been associated with changes in hormones that support follicular development in early lactation. Prepartum recombinant bovine somatotropin (rbST) injection led to reduced non-esterified fatty acids (NEFA) and β-hydroxybutyrate (BHBA) in the early postpartum period. Therefore, prepartum administration of somatotropin may result in metabolic changes that benefit the energetic balance of the postpartum dairy cows. The aim of this study was to determine the effect of prepartum injections of somatotropin in dairy heifers with high BCS on the markers of NEB, resumption of ovarian activity and milk production. Holstein heifers (n=20) with high body condition score (scale 1-5; BCS>3.5) were randomly divided into two groups: somatotropin group (n=10) that received two doses of 500 mg of rbST at -28 and -14 days from calving; and control group (n=10) that received applications of placebo in a similar manner to somatotropin group. Blood samples were collected weekly from 28 to 42 d after calving to evaluate BHBA and NEFA concentrations. Follicular development was also monitored via ultrasound examinations starting at days 10 postpartum and every 3 days until ovulation. Prepartum somatotropin administration did not affect (P =0.28) the moment of the first postpartum ovulation. The proportion of cows ovulating the first follicular wave postpartum was not different between groups (P=0.49). There was no effect (P>0.05) of prepartum treatment on the diameter of the first postpartum dominant follicle. There was a interaction days by group for plasma NEFA concentrations during the prepartum period (P= 0.03) and a tendency for the day (P=0.07) but no effect on the group (P=0.35). There was only an effect of the week (P<0.001) for postpartum NEFA concentrations. Postpartum NEFA concentration was higher at days 0, 7 and 14 than at 21, 28, 35 and 42 (P<0.05). For pre and postpartum BHBA there was not effect of days (P>0.05), group (P>0.05) or days by group (P=0.05). In conclusion, prepartum somatotropin treatment in dairy heifers with high body condition did not improve parameters that indicate that these heifers had a less severe NEB during the early postpartum period,had not affect development of the first follicular wave in the postpartum period and milk production. / O balanço energético negativo (BEN) tem sido associado com alterações nos hormônios que auxiliam o desenvolvimento folicular no início da lactação. A aplicação pré-parto de somatotropina recombinante bovina (rbST) pode levar a uma redução sérica dos ácidos graxos não esterificados (AGNE) e β-hidroxibutirato (BHBA) no período pós-parto. Portanto, a administração pré-parto de somatotropina pode resultar em alterações metabólicas que beneficiam o equilíbrio energético da vaca leiteira após o parto. O objetivo deste estudo foi determinar o efeito da administração pré-parto de somatotropina em novilhas leiteiras com elevado escore de condição corporal (ECC) sobre marcadores BEN, a retomada da atividade ovariana e produção de leite. Foram utilizadas novilhas da raça Holandês (n = 20) com ECC elevada (Escala 1-5; ECC > 3,5), foram divididos aleatoriamente em dois grupos: grupo somatotropina (n = 10) que recebeu duas aplicações de 500 mg de rbST nos dias -28 e -14 referente ao parto e grupo controle (n = 10) que recebeu aplicações de placebo no mesmo local e forma do grupo somatotropina. Amostras de sangue foram coletadas entre os dias -28 a 42 relativos ao parto para a avaliação das concentrações de BHBA e AGNE. O desenvolvimento folicular também foi monitorado através de exames de ultrassom a partir do dia 10 pós-parto, e cada 3 dias até o momento da primeira ovulação. A administração pré-parto de somatotropina não afetou (P = 0,28) o momento da primeira ovulação pós-parto. A proporção de vacas que ovularam na primeira onda folicular pós-parto não foi diferente entre os grupos (P = 0,49). Não houve efeito (P> 0,05) do tratamento pré-parto de somatotropina sobre o diâmetro do folículo dominante da primeira onda folicular pós-parto. Houve interação entre o dia e grupo para as concentrações plasmáticas de AGNE durante o período pré-parto (P = 0,03) e uma tendência para o dia (P = 0,07), mas nenhum efeito sobre o grupo (P = 0,35). Houve apenas um efeito da semana (P <0,001) para as concentrações de AGNE no pós-parto. As concentrações de AGNE pós-parto foram maiores nos dias 0, 7 e 14 do que em 21, 28, 35 e 42 (P <0,05). Para BHBA pré e pós-parto não houve efeito de dias (P> 0,05), grupo (P > 0,05) ou dias por grupo (P>0,05). Em conclusão, o tratamento pré-parto de somatotropina em novilhas leiteiras com condição corporal elevada não melhorou os parâmetros que indicam que estas novilhas tiveram um BEN menos grave durante o período pós-parto, não teve efeito sobre o desenvolvimento da primeira onda folicular pós-parto e produção leiteira.

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