A linguagem síncrona RS é destinada ao desenvolvimento de sistemas reativos. O presente trabalho tem como objetivo criar meios que facilitem o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas, permitindo que, à partir da especificação de um sistema reativo, seja realizada a sua implementação de forma automática. Deste modo, a linguagem RS é utilizada para a descrição do comportamento de um sistema em um alto nível de abstração, antes de serfeitas a decomposição do sistema em componentes de software ou hardware. A implmentação do protótipo do sistema computacional dedicado é obtida através de uma síntese automática desse modelo de alto nível. Foram implementados geradores de código que utilizam o código objeto fornecido pelo compilador da linguagem RS. Os geradores fazem a tradução para a linguagem C, para a linguagem JAVA, ou para a linguagem de descrição de hardware VHDL. A partir da síntese desses códigos poderá ser obtida a implementação do sistema em um micrcoomputador comercial, em um microcomputador Java de dedicado (ASIP Java), ou em um hardware de aplicação específica (ASIC). Foram realizados estudos de caso representativos dos sistemas reativos embaraçados e de tempo rel. Estes estudos de caso serviram para validar os geradores de código bem como para analisar o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas.

Rizobactérias promotoras de crescimento vegetal (PGPR) podem estimular o crescimento da planta hospedeira através da produção de determinadas substâncias, supressão de organismos deletérios, disponibilidade e captura de nutrientes minerais, entre outras atividades. Essas bactérias têm sido objeto de estudos devido aos efeitos produzidos em importantes culturas comerciais. A canola é uma opção de planta para cobertura de solo, para rotação de culturas e para produção de óleo, tanto comestível quanto biodiesel. No entanto, estudos sobre a diversidade de micro-organismos associados com culturas de canola e seu potencial para promover o crescimento das plantas são escassos. Dois estudos foram conduzidos nesse trabalho com os seguintes objetivos: i) isolar e identificar bactérias cultiváveis associadas ao solo rizosférico e raízes de canola (Brassica napus) para verificar se possíveis mudanças nas comunidades microbianas estão associadas com os diferentes estágios de rotação de culturas e com as diferentes fases do crescimento da planta; ii) avaliar as habilidades de promoção de crescimento vegetal dos isolados bacterianos; iii) utilizar isolados selecionados em experimentos in vivo em casa de vegetação; iv) desenvolver um microarranjo para identificação de bactérias diazotróficas cultiváveis e conhecidas de diferentes ambientes. Os resultados obtidos pelo isolamento tradicional indicaram a presença de diferentes populações de PGPRs no solo rizosférico e no interior das raízes de canola nos diferentes estágios de rotação de cultura. Além disso, a estrutura da comunidade microbiana foi influenciada pela variação sazonal, como indicado pelos diferentes gêneros identificados nos diferentes estágios de desenvolvimento da planta, havendo, também, uma correlação positiva entre a diversidade bacteriana e a quantidade de precipitação mensal. Agrobacterium, Burkholderia, Enterobacter e Pseudomonas foram os gêneros bacterianos predominantes entre todos os identificados. Muitas das bactérias isoladas foram capazes de produzir compostos indólicos e sideróforos, solubilizar fosfato e algumas também foram capazes de fixar nitrogênio. Alguns dos isolados promoveram o crescimento da planta em casa de vegetação. Com relação ao microarranjo para identificação de bactérias diazotróficas cultiváveis e conhecidas de diferentes ambientes, apesar de terem sido realizados apenas testes preliminares, acredita-se que o microarranjo apresente um bom potencial para atingir o seu objetivo. Esse facilitará a busca por bactérias com propriedades de promoção de crescimento vegetal para a produção de um inoculante para as culturas de canola do sul do Brasil. / Plant growth promoting rhizobacteria (PGPR) can stimulate host plant growth through the production of plant-growth substances, suppression of deleterious organisms, availability and uptake of mineral nutrients and other activities. These bacteria have been the object of studies due to the effects produced in commercially important crops. Canola is an option for ground cover plant for crop rotation and the production of oil both as food and biodiesel. However, studies on the diversity of such microorganisms associated with canola crops and their potential to promote plant growth are scarce. Two studies were conducted in this work with the following objectives: i) isolate and identify culturable bacteria associated with rhizospheric soil and roots of canola (Brassica napus) to verify if possible changes in microbial communities were associated with different stages of crop rotation and the different stages of canola growth; ii) evaluate the PGP abilities of bacterial isolates iii) test some of the isolates for in vivo experiments in a greenhouse, iv) develop a microarray for identification of culturable diazotrophs in different environments. The results obtained by traditional isolation indicated the presence of a diverse population of PGPR in the rhizospheric soil and inside the roots of canola at different stages of crop rotation. Moreover, the microbial community structure was influenced by seasonal variation, as indicated by the different genera identified at different stages of canola development. There was also a relationship between bacterial diversity and monthly rainfall. Agrobacterium, Burkholderia, Enterobacter, and Pseudomonas were the prominent bacterial genera among all identified. Several of the isolated bacteria could produce indolic compounds and siderophores, to solubilize phosphate and some could also fix nitrogen. Some of the isolates were able to promote plant growth. Regarding the microarray, although only preliminary tests were performed, it was possible to show that the microarray has a good potential to achieve its goal. It will make easy the search for bacteria with properties of plant growth promotion for the production of an inoculant for canola cultivated in southern Brazil.

Resumo não disponível.

A linguagem síncrona RS é destinada ao desenvolvimento de sistemas reativos. O presente trabalho tem como objetivo criar meios que facilitem o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas, permitindo que, à partir da especificação de um sistema reativo, seja realizada a sua implementação de forma automática. Deste modo, a linguagem RS é utilizada para a descrição do comportamento de um sistema em um alto nível de abstração, antes de serfeitas a decomposição do sistema em componentes de software ou hardware. A implmentação do protótipo do sistema computacional dedicado é obtida através de uma síntese automática desse modelo de alto nível. Foram implementados geradores de código que utilizam o código objeto fornecido pelo compilador da linguagem RS. Os geradores fazem a tradução para a linguagem C, para a linguagem JAVA, ou para a linguagem de descrição de hardware VHDL. A partir da síntese desses códigos poderá ser obtida a implementação do sistema em um micrcoomputador comercial, em um microcomputador Java de dedicado (ASIP Java), ou em um hardware de aplicação específica (ASIC). Foram realizados estudos de caso representativos dos sistemas reativos embaraçados e de tempo rel. Estes estudos de caso serviram para validar os geradores de código bem como para analisar o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas.

A Praça da Matriz e a Praça da Alfândega são as principais praças de Porto Alegre por suas características históricas, arquitetônicas, culturais e institucionais. Este trabalho procura mostrar estas duas praças sob a ótica da disposição das edificações como os elementos de delimitação de espaços e, portanto, como definidores do projeto do espaço aberto, determinando assim suas formas de experimentação espacial. A preocupação dos arquitetos com a disposição de elementos e sua experimentação pelas pessoas não é um fenômeno recente. Embora Vitrúvio já mencionasse a necessidade de considerar as peculiaridades da visualização humana no projeto de templos, não tratou desse fenômeno em relação ao movimento das pessoas diante e dentro deles. Contudo, Bacon mostra que os principais edifícios dos centros de cidades gregas e romanas eram dispostos levando em consideração a percepção sequencial do espaço pelas pessoas. Na época em que a tradição Beaux-Arts se desenvolveu na França (séculos XVII-XIX) foram introduzidas diretrizes de projeto arquitetônico que consideravam o percurso das pessoas pelos diferentes espaços do edifício. O projeto foi então entendido como composição, envolvendo um arranjo sequencial de partes (enfilade) que oferecem diferentes quadros (tableaux) ao visitante, num percurso coordenado (marche). Esse conceito foi retomado mais tarde por Le Corbusier, que o denominou promenade architecturale (passeio arquitetônico). O propósito desta dissertação é examinar as duas principais praças de Porto Alegre sob a perspectiva da composição arquitetônica, como acima definida. Portanto, estas duas praças serão analisadas com vistas a comprovar que são um conjunto de cheios e vazios que, em um determinado momento, foram intencionalmente compostos por arquitetos e/ou outras pessoas envolvidas no processo. Ao longo da história destes espaços, buscar-se-á identificar momentos em que um determinado arranjo compositivo se configurou. Ao mesmo tempo, será analisado o quanto um determinado arranjo foi efetivado e como pode ter sido alterado posteriormente. Para compreender melhor estes projetos, serão demostrados quais foram as transformações experimentadas ao longo da história da cidade por estas praças e por seus limites formais, analisando-se as modificações que estas transformações criam na percepção do espaço do ponto de vista arquitetônico. / Praça da Matriz and Praça da Alfândega are the main squares of Porto Alegre, due to their historical, architectural, cultural and institutional characteristics. This dissertation will show these two squares from the point of view of the disposition of the buildings as the elements of space delimitation and, therefore, as defining elements of the design of the open space, thus establishing its forms of spatial experimentation.The concern of architects with the arrangement of forms and people’s experience of them is not a recent phenomenon. Although Vitruvius already mentioned the need to consider the particularities of human visualization in the design of temples, he did not mention this phenomenon in relation to the movement of people in front of or inside of the buildings. However, Bacon shows that the main buildings of the centers of Greek and Roman cities were arranged considering the sequential perception of space by people. At the time when the Beaux-Arts tradition developed in France (17th-19th centuries), architectural design guidelines were introduced considering the movement of people through the different spaces of a building. The project was then understood as composition, involving a sequential arrangement of parts (enfilade) that offer different pictures (tableuax) to the visitor, in a coordinated course (marche). This concept was later taken up by Le Corbusier, which he called the promenade architectural. The purpose of this dissertation is to examine the two main squares of Porto Alegre from the perspective of architectural composition, as defined above. Therefore, these two squares will be analyzed to prove that they are a set of solids and voids that, in a given moment, were intentionally composed by architects and / or others involved in the process. Throughout the history of these spaces, moments in which features of a compositional arrangement have been configured shall be identified. At the same time, we shall analyze how much a certain intention of arrangement has been introduced in a given moment and how it could have been changed later. In order to better understand these projects, it will be demonstrated throughout the history of the city which were the transformations experienced by these squares and their formal limits, analyzing the transformations created in the perception of space from the architectural point of view.

Malaysia’s rainforests have a great biodiversity, a lot of which has yet to be studied. This presents researchers with the opportunity for the discovery of new chemical structures which may be new leads in drug discovery. With problems such as antibiotic resistance and the need for improved drugs for the treatment of diseases such as cancer and neurodegenerative diseases, there is need for more research into drug discovery. The focus of the research covered in this document is on Pericampylus glaucus, a common climbing plant for which there is limited literature available. The aim of this study is to determine its pharmacological activities, based on what is known of its traditional use, in the hope that it can be used in the development of pharmaceutical drugs in the future. The literature review of the traditional uses of P. glaucus suggests that the plant may be used in ethnomedicine for its anti-inflammatory and/or antibacterial activity as it is used to treat many conditions in which inflammation and infection is indicated. Components of P. glaucus extracts were investigated through a variety of phytochemical screening methods and were found to include polyphenols such as tannins and flavonoids, terpenes, sterols, alkaloids and saponins and similarities between the different extracts were observed. P. glaucus was found to possess antioxidant activity, with the stem chloroform extract possessing the greatest radical scavenging activity. The antibacterial assays revealed only mild antibacterial activity by P. glaucus extracts, making the use of the plant for treating infections seem unlikely, although this may be due to activity against specific strains of bacteria. The anti-inflammatory assays suggested a number of different mechanisms by which P. glaucus could exert anti-inflammatory activity, with many of the extracts and known compounds inhibiting COX-1 and COX-2 enzymes, and only the fruit hexane extract providing less than 50% inhibition of COX-1 and COX-2 at 500 μg/mL. The hexane extracts generally prevented protein denaturation to a greater extent compared to other extracts, as well as palmitic and stearic acid. The extracts showed a varying ability to prevent lysis of red blood cells, which were used as a model for lysosomes, depending on whether lysis was induced by hypotonicity or by heat. Some anticancer activity, cytotoxicity and growth promoting activity was recorded when cells were cultured with P. glaucus extracts. The ethanol extracts were found to exert the greatest cytotoxic activity, with the exception of the fruit ethanol extract. The root ethanol extract was the most toxic towards HK1 and MRC-5, while the stem hexane extract increased HK1 proliferation by over 200% and the root hexane extract increased MRC-5 proliferation by over 600%. Because of the growth promoting activity that was observed and the traditional use of P. glaucus for the treatment of wounds, the wound healing activity of the extracts was tested and found to be much less effective than the control of 10% FBS, although the greatest wound healing activity of around 20% wound coverage after 24 h was seen by the fruit extracts. Since P. glaucus is traditionally used for the treatment of venomous snake bites, its antivenom activity was assessed and found to have some antivenom activity, with the fruit hexane extract increasing cell proliferation by over 50% at 200 μg/mL and the alkaloid, periglaucine A, increasing proliferation by over 70% demonstrating significant antivenom activity. The antioxidant activity is most likely attributable to the polyphenols as the total polyphenol content correlated with the results of the DPPH radical scavenging activity of the extracts. The mild antibacterial activity suggested that P. glaucus may be used more for its anti-inflammatory activity in traditional medicine rather than antibacterial activity. The findings of toxicity towards cancer cells supports the traditional use of P. glaucus for the treatment of cancer. The results of the wound healing activity would indicate that P. glaucus would have a mild effect in the treatment of wounds due to its ability to promote cell proliferation and migration, however, its anti-inflammatory activity and mild antibacterial activity may be beneficial in treating wounds. It did possess antivenom activity, which supports its use for the treatment of envenomation by snakes, although the fruit extracts had stronger antivenom activity compared to the root, which is the plant part traditionally used. The mild antibacterial activity of P. glaucus may partly contribute to its medicinal effects, however, this study reported stronger evidence of anti-inflammatory, cytotoxic and antivenom activity which may be the properties that practitioners of traditional medicine have found valuable when selecting this plant for treatment. The pharmacological activities reported support a number of the traditional uses for the plant, P. glaucus, suggesting that the traditional use may have a scientific ground and could be investigated further, possibly leading to the discovery or development of new anti-inflammatory, chemotherapeutic or antivenom drugs.

Cancer is one of the leading causes of death worldwide with approximately 14 million new cases reported in 2012. Systemic chemotherapy is widely used to treat cancer and can often result in toxicity and adverse side effects. To reduce these adverse side effects and potentially increase efficacy, the focus of this thesis is to create a new intratumoural drug delivery platform for patients who are too ill to receive systemic chemotherapy or with inoperable tumours. Herein, an injectable formulation composed of a hydrogel and drug-loaded polymeric nanocapsules (NCs) was developed, to deliver the chemotherapeutic locally within the tumour and hence reduce the adverse side effects. The hydrogel is used to control the release of the NCs within the tumour, while small NCs (< 100 nm) aim to promote NC penetration throughout the tumour mass. Self-emulsification, a low energy and solvent-free method, was used to produce the polymeric NCs. The lipid core of the NCs was suitable for encapsulation of anticancer drugs: docetaxel (DCX) and 4N-myristoyl-gemcitabine (GEM C14). NCs with diameters of 40 and 80 nm and with zeta potential values of ~ -4 ± 1 to –19 ±1 mV were produced. Both anticancer drugs, DCX and GEM C14 were encapsulated with efficiencies of greater than 90%. GEM C14 was released from the NCs by diffusion with 63 ± 8 and 66 ± 10 % released in 30 days from 40 and 80 nm NCs respectively. Additionally, GEM C14-loaded NCs showed activity against various cancer cell lines in vitro where the following GI50 values were obtained: 15 ± 6, 10 ± 9, 13 ± 3 nM in HCT 116, MIA PaCa-2 and Panc-1 cell lines respectively. Although not as potent in a GEM-resistant pancreatic cancer cell line (Panc-1 GEM resistant), GEM C14 NCs (GI50= 410 ± 463 nM) were significantly more active than GEM C14 alone (GI50=8300 ± 5523 nM). Hydrogels were prepared using a low molecular weight (LMW) gelator - N4-octanoyl-2’-deoxycytidine. This amphiphilic molecule self-assembles in water forming a 3D nanofibre network with the ability to reform after the application of stress, making it suitable for injection through a syringe/needle. N4-octanoyl-2’-deoxycytidine was used to gel the NC suspension via a heat-cooling cycle. The strength of gel-NC composite was determined by oscillatory rheology and its 3D nanofibre structure containing spherical NCs was confirmed by TEM. The gel-NCs formulation reformed instantly into a gel after injection through the needle and formed a depot when injected in an in vitro simulation of intratumoural delivery i.e. chicken tissue. In summary, a novel NCs-gel composite has been designed demonstrating appropriate characteristics for intratumoural drug delivery.

VanS is an integral membrane protein, and a receptor histidine kinase representing on half of the VanSR two component system. In the presence of vancomycin, as well as certain other antibiotics, VanS undergoes autophosphorylation at a conserved histidine residue and then transfers this phosphoryl group to a conserved aspartate on VanR. The phosphorylated form of VanR binds to the promoter region of the vanHAX operon, inducing expression of these genes, which confer glycopeptide antibiotic resistance to the cell. Although the vancomycin resistance mechanism is mostly well-characterised, questions surrounding the structure and mode of activation of VanS remain unanswered. This thesis describes work towards the structural and ligand-binding characterisation of the extracellular \sensor" domain of VanS. Little is known of the structure of this domain, and while there exists evidence in the literature to support numerous theories surrounding the identity of the VanS ligand, no report has yet been made of a direct observation of a binding event involving any VanS protein and its ligand To identify the ligand to VanS, the catalytically active, full-length VanS proteins of Enterococcus faecium (VanSA) and Streptomyces coelicolor (VanSSC) were heterologously expressed, solubilised and purified and binding studies were carried out by solution-state NMR. We present evidence of interactions between vancomycin and both VanS proteins, indicating that direct binding of vancomycin may be the mechanism by which both proteins are activated. The VanSSC extracellular domain was isolated as a synthetic peptide, its structure characterised, and the binding interface between this domain and vancomycin was investigated. Evidence of binding at the N-terminal end of the extracellular domain, in agreement with the findings of Koteva et al. (2010), is presented here. An interaction between vancomycin and DPC detergent micelles was also observed and characterised, and the biological significance of such an interaction is discussed.

A linguagem síncrona RS é destinada ao desenvolvimento de sistemas reativos. O presente trabalho tem como objetivo criar meios que facilitem o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas, permitindo que, à partir da especificação de um sistema reativo, seja realizada a sua implementação de forma automática. Deste modo, a linguagem RS é utilizada para a descrição do comportamento de um sistema em um alto nível de abstração, antes de serfeitas a decomposição do sistema em componentes de software ou hardware. A implmentação do protótipo do sistema computacional dedicado é obtida através de uma síntese automática desse modelo de alto nível. Foram implementados geradores de código que utilizam o código objeto fornecido pelo compilador da linguagem RS. Os geradores fazem a tradução para a linguagem C, para a linguagem JAVA, ou para a linguagem de descrição de hardware VHDL. A partir da síntese desses códigos poderá ser obtida a implementação do sistema em um micrcoomputador comercial, em um microcomputador Java de dedicado (ASIP Java), ou em um hardware de aplicação específica (ASIC). Foram realizados estudos de caso representativos dos sistemas reativos embaraçados e de tempo rel. Estes estudos de caso serviram para validar os geradores de código bem como para analisar o uso da linguagem RS no projeto e implementação desses sistemas.

Baseado em análise texturais e mineralógicas de amostras do leito do Estuário do Guaíba o autor define as seguintes fácies sedimentares: Arenosa, sub-devidida em Sub-Fácies Areia Grossa, Média e Final; Areno-Síltica; Silto-Arenosa e Areno-Silto-Argilosa. Cada uma destas fácies é o resultado da mistura e deposição de detritos sólidos provenientes de quatro áreas fontes distintas: o Escudo Cristalino; as Formações Quaternárias; a suspensão na corrente dos Rios Jacuí, Gravataí, Sinos e Caí que cortam rochas de idade Pré-Cambriana, Paleozóica, Mesozóica e Quaternária, originando, assim, uma complexa mistura que flui para o estuário e o material recente que ocorre nas margens do mesmo. A mineralogia das Argilas mostra um significativo vínvulo com as rochas-fonte, salientando-se a Montmorilonita proveniente da Formação Graxaim, Caolinita e Clorita carregadas do Escudo Pré- Cambriano e Caolinita resultante da erosão da Laterita Serra de Tapes. Relações com os resultados obtidos por diversos autores em outros estuários são discutidos paralelamente, ficando bem caracterizada a grande influência das áreas adjacentes e emersas, na distribuição dos sedimentos de fundo.