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Estudo Morfométrico de Ovinos da Raça Crioula Lanada no Sul do Brasil: Um Subsídio para a Conservação In Situ / Morphometric Traits in Crioula Lanada Sheep in Southern Brazil: A Contribution for In Situ Conservation

SILVA, Marcelo Corrêa da 23 February 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-07-29T15:07:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Marcelo Correa da Silva.pdf: 2475185 bytes, checksum: 5145b979ea0db333c12b56b2ecd50859 (MD5) Previous issue date: 2011-02-23 / Intense selection pressure is associated with global economy and market conjectures, which has great influence and threatens the sustainability of genetic varieties used in traditional crop and livestock production. Abrupt change of such breeds for exotic ones is decreasing genetic diversity and has extinguished many domestic varieties worldwide. The Crioula Lanada sheep breed is a Brazilian cultural, ecological and genetic patrimony which was almost extinct in the mid twentieth century. Conservation activities were established in Southern Brazil with collaboration of a farmer´s association and the foundation of an institutional flock. Currently, breed population is still small and little information about these animals is available. It is necessary that characterization studies subsidize the conservation of this important genetic resource so that farmers can make the best of its use in different production systems. A phenotypical study was undertaken to help handling activities and in situ conservation. 15 morphometric variables (cm) and body weight (kg) were evaluated in 67 male and 812 female sheep, distributed in five age categories and raised in four municipalities of Rio Grande do Sul and two of Santa Catarina, Southern Brazil. The influence of age, sex, wool type and geographic location (fixed effects) on morphometric measures was tested, in addition to correlation, factor analysis and the discrimination of the Crioula Lanada sample in Serrana or Fronteira ecotype. Variance, means test, descriptive, correlation analysis and multivariate statistics were carried out using the Statistical Analysis System Program (SAS, 2002). Age, sex and geographic location revealed significant effect (p<0,001) on morphometric measures. Different averages between age categories depend on which variable is being analyzed, being all means equivalent when considering animals older than 3 years. Most correlations where significant (p<0,05), being thoracic perimeter with body weight the strongest (0,72). Correlation between head and body measures were medium or weak, being strong between body weight. Head and body variables are more related among themselves. Leg, arm and tail measurements revealed weak correlations with body weight, besides not being different (p>0,05) among age categories. Using multivariate statistics, it was possible to explain 81% of variance with only two factors, whereat three groups of variables were identified: one with body measures, the second with head measures and the third with thoracic measures and body weight. 95% of Fronteira sheep were correctly classified in its geographic location being possible to correctly classify animals of each herd of the Serrana ecotype and the ecotypes themselves. The results found in this study can be used as a dialectic instrument to study farmers perceptions and develop an in situ conservation program for the Crioula Lanada breed / A intensa pressão de seleção genética exercida nas espécies domésticas é resultado de conjunturas de mercado e economia global e tem representado ameaças às variedades tradicionalmente utilizadas na agricultura e pecuária. A substituição abrupta de grupos genéticos crioulos por raças exóticas tem diminuído a diversidade genética mundial e levado inúmeras raças à extinção. A ovelha Crioula Lanada é um patrimônio genético, cultural e ecológico brasileiro que quase foi extinto em meados do século XX. Ações para a conservação da raça foram estabelecidas no sul do Brasil, com ajuda de uma associação de produtores e a criação de um rebanho institucional. Atualmente a população efetiva ainda é pequena e com o pouco conhecimento acerca destes ovinos tornase fundamental que estudos de caracterização subsidiem a conservação deste importante recurso genético e que, assim, seja possível fazer um melhor uso nos diferentes sistemas de criação. O objetivo foi realizar um estudo fenotípico da raça para subsidiar as práticas de manejo e conservação in situ. Utilizaram-se 15 variáveis morfométricas (cm) e o peso corporal (kg) de 67 machos e 812 fêmeas, distribuídos em cinco categorias de idade e criados em quatro municípios do Rio Grande do Sul e dois de Santa Catarina. Foi testada a influência dos efeitos fixos (idade, sexo, tipo de lã e procedência geográfica) sobre as medidas morfométricas, analisada a estrutura de correlação e a possibilidade de discriminar os animais da raça Crioula Lanada em ecótipos Serrana ou Fronteira. Para isso, foram realizadas análises de variância, teste de médias, estatística descritiva, análise de correlação e estatística multivariada. A idade, o sexo e a procedência geográfica dos rebanhos apresentaram efeito significativo (p<0,001) sobre as medidas estudadas. Dependendo da variável morfométrica analisada pode, ou não, haver diferença (p<0,05) entre as cinco categorias de idade, sendo que nenhum valor médio difere entre as categorias com mais de três anos. A maioria das correlações foi significativa (p<0,05), sendo mais forte entre o perímetro torácico e o peso corporal (0,72). As correlações entre as medidas da cabeça e as do corpo foram médias ou fracas, sendo maiores entre si e com o peso corporal. Medidas de perna, braço e cauda tem correlação fraca com o peso corporal, além de não serem diferentes (p>0,05) entre as categorias de idade. Na análise multivariada dos dados, foi possível explicar 81% da variância com dois fatores, no qual três grupos de variáveis foram identificados: um com medidas do corpo, um com medidas da cabeça e o terceiro com medidas do tórax e o peso corporal. As ovelhas criadas na região atribuída ao ecótipo Fronteira foram corretamente classificadas (95%), sendo possível classificar cada rebanho do ecótipo Serrana e os ecótipos entre si. Os resultados encontrados poderão servir como um instrumento de diálogo junto aos criadores para desenvolver um programa de conservação in situ para a raça Crioula Lanada.
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Genômica de populações e genética geográfica de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro com uso de polimorfismos de base única (SNP) / First report of population genomics in pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro catle using single nucleotide polymorphisms (SNP) and a geographical genetics approach

Silva, Marcelo Corrêa da 21 September 2015 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-04-18T10:48:49Z No. of bitstreams: 2 Tese - Marcelo Corrêa da Silva - 2015.pdf: 7209207 bytes, checksum: c24f13fb20a00a3bc5b7d242ee956d69 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-04-18T10:51:37Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Marcelo Corrêa da Silva - 2015.pdf: 7209207 bytes, checksum: c24f13fb20a00a3bc5b7d242ee956d69 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-18T10:51:37Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Marcelo Corrêa da Silva - 2015.pdf: 7209207 bytes, checksum: c24f13fb20a00a3bc5b7d242ee956d69 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2015-09-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Livestock production has played a major role in social-economic aspects of rural development worldwide. In South America the introduction of domestic breeds such as cows, sheep and goats occurred during Spanish and Portuguese colonization expeditions over five hundred years ago. The Pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro cattle breeds originate from this exact context and resemble historic, cultural and ecological aspects of traditional cattle farming in Brazil. This is characterized by rough and extensive breeding systems placed in many ecosystems of this country. Small population sizes and severe loss of genetic diversity in livestock breeds are of great concern regarding the scenario of global warming, emphasis on the sustainability of farming activities, the need of alternatives to attend market trends and promote rural development in a local perspective. This study was undertaken to explore patterns of genetic diversity in Pantaneiro e Curraleiro Pé-Duro cattle, aiming to identify differences between groups reared in several regions of Central-West, Central, North and Northeast of Brazil. Animals were genotyped using a SNP (single nucleotide polymorphism) chip containing over fifty thousand markers. Different analytical procedures were carried out using differentiation index, estimates of common ancestry, simple and multivariate clustering, inbreeding coefficients, genetic and also geographical distances. Spatial analysis was developed to allow the identification of patterns of genetic variation, specific geographical regions and herds of greater genetic differentiation. The results furnish insights in order to develop strategies to preserve genetic variability in Pantaneiro and Curraleiro Pé-Duro cattle. / Os bovinos são tradicionalmente utilizados como fonte de proteína animal na alimentação humana em diversas regiões do mundo. Na América do Sul esta espécie foi introduzida por colonizadores espanhóis e portugueses e há mais de 500 anos tem sido disseminada no Brasil com importância alimentar e socioeconômica. Bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro são remanescentes de bovinos trazidos da região ibero-americana por meio de navios. Atualmente são considerados patrimônios históricos e culturais do país, com destaque à pecuária extensiva e tradicional que é praticada em diversos biomas do interior do Brasil, como o Pantanal, o Cerrado e a Caatinga. O baixo número de indivíduos existente, a demanda por uma produção animal mais competitiva e economicamente viável, com potencial de agregação de valor ou diferencial em termos de rusticidade, tem sido favoráveis para a discussão da conservação e maior utilização de raças localmente adaptadas. Isso tem tido maior destaque também em função do advento do aquecimento global e maior valorização de especificidades que caracterizam circunstâncias sociais, ecológicas e produtivas em escala local. Assim, este estudo foi desenvolvido a fim de explorar e compreender padrões de diversidade genética em populações de bovinos Pantaneiros e Curraleiro Pé-Duro, investigando-se diferenças e semelhanças genéticas entre indivíduos e rebanhos amostradas em diferentes biomas das regiões centro oeste, norte e nordeste do Brasil. Bovinos foram amostrados e genotipados com uso de um chip contendo mais de 50 mil marcadores polimórficos de base única (single nucleotide polymorphism, SNP). Diferentes técnicas de análise genética foram realizadas como o uso de distância genéticas, índices de diferenciação genética, estimativas de ancestralidade comum, endogamia e análises de dispersão e agrupamento uni e multivariados. Foram utilizados métodos de estatística espacial, que possibilitaram a identificação de padrões de variabilidade genética em função de distâncias geográficas e a identificação de descontinuidades genéticas, revelando uma compreensão inédita acerca da diferenciação entre grupos formados com base em um critério geopolítico ou com base em similaridade genética. Os resultados obtidos fornecem subsídios para a formação de grupos experimentais, a troca de material genético entre criadores, planejamentos participativos para a preservação e gestão sustentável desses bovinos junto às associações de criadores, entidades de pesquisa e demais atores envolvidos.

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