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Modelagem de processos estocásticos espaço-temporais e de percolação no estudo de risco sobre sistemas : uma aplicação ao estudo da transmissão à febre aftosaSANTOS, Mariese Conceição Alves dos 03 June 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011-06-03 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The foot and mouth disease (FMD) is a disease that attacks all cloven-hoofed animals, especially cattle, pigs, sheep and goats. It is characterized by blistering and considered the most serious of all infections. It is generated by at least seven serotypes of viruses that cause infections indistinguishable. The spread is associated with the movement of infected animals and their contact with susceptible animals. In this thesis a model was proposed which aimed to find an index of risk of transmission of foot and mouth disease virus between cattle farms across a network. It comprises two levels, the first will be analyzed the point process F generated from the xi ∈ A ⊂ R2 randomly selected points and the stochastic process Yxi,tj , the level of infection wich through it is done the location of the occurrence of infection by the FMD virus, called a focus of infection. The second level is a percolation model G(G, P), in wich G = G(F,E) is a graph, F a set of farms and E represents the edges that connect the farms. And P is the probability that transmission occurring. By uniting the two levels arises G′(G′, P′), in that G′ consists of F′ the union of all the farms to the set F focus F, and E′ the union of E edges with new edges connecting F and F. And P′ is formed by the set of values of P and Pi,l, the probability of farm Fi be infected by a foco fl. Points were simulated representing the cartesian coordinates of the farms and herd size, the points were distributed randomly and regularly on the network. Were also simulated the relative initials positions of the focus in a random form on the network, in the center, edges and vertices, considering three areas of study region A. The results showed that there are no difference for the two types network and they confirm the impact of the relative initial position of the focus on the network to a spread of infection in a number of farms, these results were shown when compared to three areas of A. / A Febre aftosa (FA) é uma enfermidade que ataca a todos os animais de casco fendido, principalmente bovinos, suínos, ovinos e caprinos. Ela é caracterizada pela formação de vesículas e considerada a mais grave de todas infecções. É gerada por pelo menos sete sorotipos de vírus que causam infecções indistinguíveis. A propagação está associada com o movimento de animais infectados e o seu contato com animais suscetíveis. Nesta dissertação foi proposto um modelo que teve como objetivo encontrar um índice de risco de transmissão pelo vírus da febre aftosa (VFA) entre fazendas de rebanho bovino através de uma rede. Ele é formado por dois níveis, no primeiro será analisado o processo pontual F, gerado a partir de pontos xi ∈ A ⊂ R2 sorteados aleatoriamente e do processo estocástico Yxi,tj , o nível de infecção, que através dele é feita a localização da ocorrência da infecção pelo vírus da febre aftosa, chamado de focus de infecção. O segundo nível é um modelo de percolação G(G, P), em que G = G(F,E) é um grafo, F um conjunto de fazendas e E representando as arestas que ligam as fazendas. E P é a probabilidade dessa transmissão ocorrer. Com a união dos dois níveis surge G′(G′, P′), em que G′ ´e formado por F′, a união do conjunto de fazendas F ao conjunto de focus F, e E a união das arestas E com as novas arestas ligando F a F. E P′ é formado pelo conjunto de valores de P e por Pi,l, a probabilidade da fazenda Fi ser infectada por um foco fl. Foram simulados pontos representando as coordenadas cartesianas das fazendas e o tamanho do rebanho, os pontos foram distribuídos de forma aleatória e regular na rede. Também foram simuladas as posições relativas iniciais dos focus de forma aleatória na rede, no centro, nas bordas e nos vértices, considerando 3 áreas da região de estudo A. Os resultados mostraram que não há diferença para os dois tipos de rede e confirmam o impacto da posição relativa inicial dos focus na rede para uma propagação da infecção em um conjunto de fazendas, esses resultados também foram mostrados quando comparados para 3 áreas de A.
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Développement d’un biomarqueur salivaire mesurant l’exposition de l’Homme aux piqûres des moustiques Aedes : applications aux risques de transmission et à l’évaluation de l’efficacité des stratégies de lutte contre les arboviroses / Development of a salivary biomarker for measuring the human exposure to Aedes mosquitoes bites : applications to evaluate the risk of arboviruses transmission and the efficacy of vector controlElanga N'Dille, Clément Emmanuel 20 May 2014 (has links)
Les infections virales transmises à l'homme par les moustiques Aedes, sont en pleine émergence ou ré-émergence dans le monde entier. Le contrôle des populations de vecteurs reste la seule méthode de lutte. Pour un contrôle plus efficace, de nombreux efforts sont déployés pour développer de nouveaux indicateurs évaluant l'exposition de l'Homme aux piqûres des Aedes. Dans ce contexte, l'objectif de la thèse était de développer un biomarqueur, basé sur l'évaluation quantitative de la réponse anticorps (Ac) spécifique au peptide salivaire Nterm-34kDa d'Ae. aegypti chez les populations exposées. Pour cela, nous avons évalué le potentiel de cette réponse Ac spécifique à i) mesurer l'intensité d'exposition aux piqûres, ii) évaluer le risque de transmission des arboviroses et iii) évaluer l'efficacité des stratégies de lutte anti-vectorielle (LAV). Nos résultats ont montré qu'une réponse IgG anti-peptide Nterm-34kDa pouvait être détectée chez les individus exposés à Ae. aegypti et Ae. albopictus. Le niveau de cette réponse IgG spécifique augmentait entre les saisons de faibles densités de moustiques et celles de fortes densités, indiquant que ce candidat biomarqueur permettrait d'évaluer l'exposition aux piqûres des Aedes. La distribution spatiale similaire de la prévalence de nouvelles infections au virus de la dengue et la prévalence de la réponse IgG spécifique montrait également que ce candidat biomarqueur permettrait d'identifier des zones à risque de transmission. La comparaison des réponses IgG anti-peptide Nterm-34kDa avant et après les interventions de LAV, a montré qu'une baisse post-LAV de cette réponse Ac spécifique permettrait d'évaluer l'efficacité de la LAV contre les Aede. Ce biomarqueur salivaire pourrait donc représenter un indicateur de la réduction du contact homme-vecteur. L'ensemble de ces travaux montre que la réponse Ac spécifique au peptide salivaire Nterm-34kDa constitue un pertinent biomarqueur pour évaluer l'exposition de l'Homme aux vecteurs des arboviroses. La validation supplémentaire de ce biomarqueur et son développement sous forme de test rapide permettraient aux structures en charge de la surveillance des arboviroses et de la lutte anti-vectorielle, de disposer d'un outil complémentaire des indicateurs entomologiques et épidémiologiques de référence. / Human viral infections transmitted by Aedes mosquitoes are rapidly emerging or re-emerging worldwide. Vector control strategies remain currently the unique method to control these infections. To improve the effectiveness of this control, much effort is being devoted to develop new indicators for measuring the human exposure to Aedes bites. In this way, this project aimed to develop a biomarker based on the quantitative assessment of antibody response (Ab) to Ae. aegypti Nterm - 34kDa salivary peptide, in human exposed populations. We evaluated thus the potential of this specific Ab response to: i) measure the intensity of human exposure to Aedes bites, ii) assess the risk of transmission of arboviruses and iii) evaluate the efficacy of vector control strategies. Our results showed that a specific IgG response to Nterm-34kDa peptide could be detected in individuals exposed to Ae. aegypti or Ae. albopictus. The level of specific IgG response increased from the season of low mosquito densities to high densities one, indicating that this biomarker candidate could evaluate the intensity of exposure to the Aedes bites. The observed similar spatial distribution of the prevalence of new infections with dengue virus and specific IgG response showed that this biomarker candidate could identify areas at risk of transmission. The comparison of the specific IgG responses to Nterm-34kDa peptide before and after the vector control intervention showed a decline of the specific Ab response after implementation of control. It indicated that such salivary biomarker could assess the effectiveness of vector control against Aedes, and that this salivary biomarker could be an indicator of the reduction of man-vector contact. Altogether, the results of this work show that the specific IgG response to the Nterm-34kDa salivary peptide could be a relevant biomarker for assessing human exposure to arboviruses vectors. This promising indicator, developed as a rapid test, could represent a complementary tool for entomological and epidemiological surveillance of arboviruses diseases.
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Associação entre variáveis geográficas e climáticas e a ocorrência de Lutzomyia longipalpis (Lutz & Neiva, 1912) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) no estado do Espírito Santo, BrasilPinto, Israel de Souza 11 February 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-02-11 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Lutzomyia longipalpis (Lutz & Neiva, 1912) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) é o principal vetor da leishmaniose visceral americana (LVA) no Brasil. No estado do
Espírito Santo, a LVA parece estar associada às regiões de clima seco e de altitudes inferiores a 500 metros em relação ao nível do mar. Para inferir a distribuição potencial
de L. longipalpis e a influência das variáveis geográficas e climáticas na sua distribuição potencial no Espírito Santo (ES), foram realizadas coletas de flebotomíneos em localidades em que ocorreram casos de LVA e em áreas adjacentes na região norte do estado. Ao todo, foram pesquisadas 133 localidades pertencentes a 15 municípios,
sendo que L. longipalpis foi encontrado em 84 dessas. Para delimitar a distribuição potencial, foi utilizada a modelagem de nicho ecológico usando o programa DesktopGarp e dados de 73 pontos de ocorrência de L. longipalpis, considerados
espacialmente únicos e distintos. Além dos 15 municípios com registros de L. longipalpis, foi prevista pela modelagem a distribuição para pelo menos outros nove que não apresentam registros. A modelagem também evidenciou a associação de L.
longipalpis com características geoclimáticas propícias à sua ocorrência como: clima seco representado pela pluviosidade menor que 1000 milímetros anuais e altitudes inferiores a 500 metros em relação ao nível do mar. A ocorrência de casos humanos autóctones de LVA em duas localidades dos municípios de Vargem Alta e Rio Novo do Sul, localizados na porção sul do ES e sem as características geográficas e climáticas propícias à ocorrência de L. longipalpis, justificaram estudo sistematizado de coleta de flebotomíneos nessas localidades. No período de agosto de 2006 a julho de 2007 foram realizadas coletas sistematizadas mensais nesses dois municípios e L. longipalpis não foi encontrado em qualquer das localidades. Assim, foi possível dissociar a ocorrência de LVA da presença de L. longipalpis na porção sul do estado do ES. Além disso, devido ao pequeno número de flebotomíneos capturados em Rio Novo do Sul, foi sugerida a existência de um mecanismo de transmissão da LVA não associado aos
flebotomíneos nessa localidade. Concluindo, a presença de L. longipalpis no estado do Espírito Santo está associada às características geoclimáticas bem definidas e a ocorrência de LVA em áreas sem essas características provav elmente está vinculada a outro mecanismo de transmissão. / Lutzomyia longipalpis (Lutz & Neiva, 1912) (Diptera, Psychodidae, Phlebotominae) is the main vector of American visceral leishmaniasis (AVL) in Brazil. In the Espírito
Santo state, the AVL has always been associated to dry regions and elevations lower than 500 meters at sea level. To infer the potential distribution of L. longipalpis and the
influence of biogeographic variables on its potential distribution in Espírito Santo, sand flies were captured on localities with autochthonous cases of AVL and adjacent areas
from north region of the state. L. longipalpis was found in 84 localities, for a total of 133 localities belonging to 15 municipalities surveyed. To delimit the potential distribution, it was made ecological niche modeling using the DesktopGarp program and data of 73 occurrence points of L. longipalpis. Besides of the 15 municipalities with records of L. longipalpis, the distribution was provided by ecological niche modeling
for, at least, other nine municipalities without records. Yet, the ecological niche modeling showed the association of L. longipalpis with geoclimatic features favorable to its occurrence like as dry climate represented by rainfall lower than 1000 millimeters and elevations lower than 500 meters at sea level. The occurrence of human autochthonous cases of AVL in two localities of Vargem Alta and Rio Novo do Sul
municipalities, located on the south portion of ES and without geographic and climatic features favorable to occurrence of L. longipalpis, justified a systematic study for sand flies captured in these localities. From August 2006 to July 2007, mensal systematic entomological surveys were performed in Vargem Alta and Rio Novo do Sul municipalities, but no L. longipalpis was found. Therefore, it is possible that the ocurrence of AVL is disassociated with the presence of L. longipalpis in the south portion of ES. Furthermore, due to the low number of sand flies captured in Rio Novo do Sul, the presence of another mechanism of transmission of AVL is also possible. In
conclusion, the presence of L. longipalpis in the Espírito Santo state was associated with geoclimatic well defined features and the occurrence of AVL in areas without these features possibly was related to other mechanism of transmission.
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