L’objectif de cette thèse était de développer un cadre conceptuel et méthodologique permettant d’évaluer l’impact global de l’alimentation sur la santé des consommateurs, en prenant en compte les dimensions microbiologiques, chimiques et nutritionnelles. Cette méthodologie a été développée à l’aide d’un cas d’étude portant sur l’alimentation des nourrissons (lait maternel et formules infantiles), incluant les facteurs suivants : C. sakazakii, Cryptosporidium, arsenic, polychlorobiphényles de type dioxine et acide docosahexaénoïque. Cinq modèles mathématiques probabilistes ont été développés pour quantifier les risques / bénéfices associés à chaque facteur. Ils ont été ensuite harmonisés, quand cela a été possible, à l’aide d’un indicateur commun de santé publique, le DALY. Les résultats ont été obtenus par simulation de Monte Carlo de second ordre afin de quantifier séparément l’incertitude et la variabilité. Les techniques probabilistes ont permis de prendre en compte d’une part la variabilité inhérente à la biologie (hétérogénéité entre individus d’une même population) et d’autre part l’incertitude liée au manque de connaissances et de données. De plus, la séparation de la variabilité et de l’incertitude a consolidé l’évaluation, permettant une interprétation plus cohérente des résultats et donc fournissant des informations plus complètes aux décisionnaires. La méthode mise en oeuvre dans ce travail de thèse pourra servir de base pour d’autres cas d’études et pourra aussi être utilisée pour continuer le développement méthodologique de l’évaluation risque-bénéfice. Cette démarche s’inscrit dans une approche plus générale d’analyse multi-critères des systèmes agronomiques et alimentaires / The objective of the present PhD project was to develop a conceptual and methodological framework to assess the overall impact of food consumed on human health, including microbiological, chemical and nutritional dimensions. This methodology was developed using a case study on infant milk-based diet (breast milk and infant formulas) taking into account the following selected factors: C. sakazakii, Cryptosporidium, arsenic, dioxin like polychlorinated biphenyls and docosahexaenoic acid. Five probabilistics mathematicals models were developed to quantify risks / benefits associated with these factors. When possible, they were harmonized using a common public health indicator, the DALY. Results were obtained by second-order Monte Carlo simulations in order to quantify separately the uncertainty and the variability. Probabilistic techniques enabled to take into account on the one hand the biology related to variability (heterogeneity between individuals of the same population) and on the other hand the uncertainty linked to the lack of knowledge and data. In addition, separation of variability and uncertainty strengthened the evaluation by enabling a more accurated interpretation of results and by providing more comprehensive information for policy makers. The method used in this PhD thesis can be considered as a robust basis for other case studies and can be also used to continue methodological development in risk-benefit assessment. This approach is also part of a broader area: the multi-criteria decision analysis of agronomic and food systems

De nouveaux composés anabolisants sont devenus accessibles via Internet : les modulateurs spécifiques des récepteurs androgènes (SARMs) actuellement développés pour le traitement des pertes musculaires. L’Ostarine® (MK-2866, GTX-024, enobosarm) en particulier, exerce ses effets sur les muscles squelettiques et ne présente pas d'activité androgénique. Sur la base de son mécanisme d’action et des résultats cliniques préliminaires, ce produit pourrait être utilisé comme promoteur de croissance en élevage bovin. Dans ce contexte, les objectifs de la thèse sont de valider des outils permettant de décrire les effets zootechniques pouvant être induits par l’administration orale d'enobosarm à des bovins et de développer des stratégies analytiques dédiées à la mise en évidence de son utilisation frauduleuse. En comparant animaux contrôles et animaux traités avec l'enobosarm, aucun effet morphologique n'a été mis en évidence en termes de croissance ou de conformation. Il a été ensuite démontré que l'enobosarm et ses principaux métabolites de phase II sont éliminés dans les urines et les fèces à des concentrations permettant leur détection par des techniques analytiques impliquant le couplage chromatographie en phase liquide et spectrométrie de masse. Enfin, une stratégie de type métabolomique conduite sur matrices urinaire et fécale a conduit à la description d’empreintes spécifiques et discriminantes pouvant signer l’administration d'enobosarm. Ce travail de recherche pluridisciplinaire contribue à générer des connaissances sur une nouvelle classe d'anabolisants, permettant par extension de contribuer à garantir au consommateur une sécurité chimique accrue des denrées d’origine animale. / New compounds with anabolic properties have recently become accessible via Internet-based suppliers: selective androgens receptor modulators (SARMs) currently developed for the treatment of chronic diseases with wasting muscle. Ostarine® (MK-2866, GTX-024, enobosarm), in particular, exerts its anabolic effects exclusively on the skeletal muscles and has no androgenic activity. Based on its mechanism of action and clinical preliminary results, this product could potentially be used as a growth promoter in cattle. In this context, the aims of this thesis are to validate tools allowing to describe the zootechnical effects that may be induced by an oral administration of enobosarm in calves and to develop analytical strategies dedicated to highlight its fraudulent use. Following a comparison between control animals and enobosarm treated animals, no morphological effect was visible and measurable in terms of growth and conformation. It was then demonstrated that enobosarm and its main phase II metabolites are eliminated in urine and feces at concentrations allowing their detection with analytical techniques using a liquid chromatography-mass spectrometry coupling. Finally, a metabolomics approach on urine and fecal matrices led to the description of specific and discriminant fingerprints signaling the administration of enobosarm. This multidisciplinary research work helps to generate knowledge on a new class of anabolic substance and therefore contributes to guarantee a more chemically-safe food of animal origin to the consumer.

La thèse porte sur l'Agence française de sécurité sanitaire des aliments, établissement public créé en 1998 suite à la crise de la vache folle. Elle cherche à comprendre d'où vient cette agence, pourquoi et comment elle a été créée, comment elle est organisée et comment elle fonctionne ainsi que l'impact de son action sur la régulation des risques alimentaires, entre 1998 et 2005. La question sociologique centrale est celle de l'institutionnalisation de cette nouvelle agence sanitaire, sous la forme d'une organisation-frontière, située à l'interface de la science et de l'action publique, redevable tant auprès de la communauté scientifique que de la communauté politique et devant gérer la frontière socialement construite entre ces deux mondes. En utilisant la démarche de la sociologie de l'action organisée, nous montrons comment l'Afssa s'est institutionnalisée à la fois comme une organisation scientifique, par un processus de bureaucratisation de l'expertise, et comme un acteur politique pleinement engagé dans la défense des valeurs et des intérêts de la sécurité sanitaire. La thèse analyse les mécanismes, les effets et les contradictions de ce processus d'institutionnalisation pour comprendre la nature et l'ampleur du changement qu'a entraîné l'Afssa en matière de régulation des risques alimentaires.