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Diversidade, taxonomia e filogenia de tripanossomatídeos da subfamilia Leishmaniinae. / Diversity, taxonomy and phylogeny of trypanosomatids of Leishmaniinae subfamily.

Dominguez, Omar Ariel Espinosa 25 September 2015 (has links)
A subfamília Leishmaniinae compreende espécies de tripanossomatídeos dos gêneros Crithidia, Leptomonas, Endotrypanum e Leishmania. O objetivo deste estudo foi caracterizar isolados da subfamília Leishmaniinae através de DNA Barcoding e inferir suas relações filogenéticas utilizando os genes SSUrDNA, gGAPDH, CATB, HSP70 e ITS1rDNA como marcadores genéticos. As espécies estudadas foram segregadas em dois clados principais, um formado por Endotrypanum-Leishmania e genótipos de L. costarricensis posicionados como clado basal. E outro clado que contém espécies monoxênicas as quais foram separados em diferentes subclados (Crithidia, Leptomonas, Lotmaria, Termófilo e três subclados homogêneos representados por C. inconstans, C. acanthocephali e isolados de Rondônia). No gênero Leishmania as análises posicionaram as espécies pouco estudadas do complexo L. enriettii como o grupo mais basal. Os isolados de lagartos Moçambique formaram um grupo monofilético com as espécies do subgênero L. (Sauroleishmania), corroborando, também, sua relação com o subgênero L. (Leishmania). / The Leishmaniinae subfamily comprises trypanosomatid species from genera Crithidia, Leptomonas, Endotrypanum and Leishmania. The aim of this study was to characterize Leishmaniinae isolates through DNA Barcoding and further infer their phylogenetic relationships using SSUrDNA, gGAPDH, CATB, HSP70 and ITS1rDNA genes as genetic markers. The Leishmaniinae species was segregated into two major clades, one formed by Endotrypanum-Leishmania with L. costarricensis genotypes resolving as a basal clade. The other clade contained the monoxenic species which were separated in different subclades (Crithidia, Leptomonas, Lotmaria, Termofilo, and three homogeneous subclades represented by C. inconstans, C. acanthocephali and Rondônia isolates). In Leishmania genus analyzes positioned the poorly investigated species of the complex L. enriettii as the most basal group. Isolates from Mozambique lizards formed a monophyletic group with the species of the subgenus L. (Sauroleishmania), was corroborated its relationship to the subgenus L. (Leishmania) too.
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Caracterização molecular e morfológica de isolados brasileiros do gênero Euglena. / Molecular and morphological characterization of Brazilian isolates of the genus Euglena.

Martins, Adriana Vieira de Castro 12 February 2009 (has links)
Neste estudo foram isolados e caracterizados flagelados de 20 amostras de solo e água do Brasil classificados no gênero Euglena por parâmetros taxonômicos tradicionais, e distribuídos em 5 grupos de acordo com características morfológicas. Análises filogenéticas do gene SSUrDNA das 20 amostras resultou em 25 seqüências posicionadas nos grupos A2 e A3 do gênero Euglena definidos em estudos anteriores, separando as seqüências obtidas em 7 clados distintos, revelando uma maior diversidade que a obtida por parâmetros taxonômicos tradicionais. A fim de resolver os relacionamentos intra-específicos do grupo A3, realizamos uma análise filogenética restrita deste grupo, que apresentou árvores congruentes e subclados bem suportados. Representantes de cada espécie foram analisados por microscopia eletrônica de varredura, revelando dois padrões principais de estrias e poros da película. Os isolados caracterizados neste estudo são os primeiros do Brasil estabelecidos em cultura, validados por análises filogenéticas e morfologicamente caracterizados. / In this study we isolated and characterized flagellates from 20 soil and water samples of Brazil, classified in the genus Euglena based on traditional taxonomic parameters and distributed in 5 groups according to morphological characteristics. Phylogenetic analyses of the SSUrDNA of the 20 samples resulted in 25 sequences that where positioned in previously defined groups A2 and A3 of the genus Euglena, separating the obtained sequences in 7 distinct clades, revealing a larger diversity than defined by traditional taxonomic parameters. To better resolve the intra-specific relationships of group A3, we conducted a phylogenetic analyses restricted to this group, generating congruent trees and well supported sub-clades. A representative of each species was selected and analyzed by scanning electron microscopy, revealing two major patterns of strip and pellicle pores. The isolates characterized in this study are the first in Brazil to be established in culture, validated by phylogenetic analyses and morphologically characterized.
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Caracterização molecular e morfológica de isolados brasileiros do gênero Euglena. / Molecular and morphological characterization of Brazilian isolates of the genus Euglena.

Adriana Vieira de Castro Martins 12 February 2009 (has links)
Neste estudo foram isolados e caracterizados flagelados de 20 amostras de solo e água do Brasil classificados no gênero Euglena por parâmetros taxonômicos tradicionais, e distribuídos em 5 grupos de acordo com características morfológicas. Análises filogenéticas do gene SSUrDNA das 20 amostras resultou em 25 seqüências posicionadas nos grupos A2 e A3 do gênero Euglena definidos em estudos anteriores, separando as seqüências obtidas em 7 clados distintos, revelando uma maior diversidade que a obtida por parâmetros taxonômicos tradicionais. A fim de resolver os relacionamentos intra-específicos do grupo A3, realizamos uma análise filogenética restrita deste grupo, que apresentou árvores congruentes e subclados bem suportados. Representantes de cada espécie foram analisados por microscopia eletrônica de varredura, revelando dois padrões principais de estrias e poros da película. Os isolados caracterizados neste estudo são os primeiros do Brasil estabelecidos em cultura, validados por análises filogenéticas e morfologicamente caracterizados. / In this study we isolated and characterized flagellates from 20 soil and water samples of Brazil, classified in the genus Euglena based on traditional taxonomic parameters and distributed in 5 groups according to morphological characteristics. Phylogenetic analyses of the SSUrDNA of the 20 samples resulted in 25 sequences that where positioned in previously defined groups A2 and A3 of the genus Euglena, separating the obtained sequences in 7 distinct clades, revealing a larger diversity than defined by traditional taxonomic parameters. To better resolve the intra-specific relationships of group A3, we conducted a phylogenetic analyses restricted to this group, generating congruent trees and well supported sub-clades. A representative of each species was selected and analyzed by scanning electron microscopy, revealing two major patterns of strip and pellicle pores. The isolates characterized in this study are the first in Brazil to be established in culture, validated by phylogenetic analyses and morphologically characterized.

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