Nous présentons dans ce mémoire des outils permettant de généraliser une méthode de cartographie génétique fine. Nous y résumons les concepts de base de la statistique génétique et y décrivons aussi la méthode de cartographie génétique fine que nous cherchons à généraliser en permettant l'utilisation de génotypes plutôt que d'haplotypes. Pour ce faire, nous comparons diverses méthodes reconnues d'estimation d'haplotypes. Le développement nouveau de ce travail consiste en un algorithme EM conditionnel aux phénotypes permettant d'estimer les haplotypes associés à un échantillon de génotype, ainsi que le statut au gène causal du caractère étudié. Nous généralisons la méthode de cartographie par l'ajout d'étapes au modèle d'échantillonnage pondéré. Nous effectuons finalement quelques tests par simulation. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Algorithme EM, Cartographie génétique, Coalescence, Diplotype, Échantillonnage pondéré, Estimation, Génotype, Gène causal, Haplotype, Modèle de pénétrance, Phénotype, Vraisemblance composite.

Dans ce mémoire, nous présentons une nouvelle méthode de cartographie génétique fine ayant comme particularité de pouvoir être utilisée dans le cadre de modèles génétiques complexes. Nous présentons tout d'abord quelques concepts de génétique et de statistique génétique, avec une emphase particulière sur le processus de coalescence qui est à la base de notre travail. Par la suite, trois méthodes de cartographie génétique déjà existantes sont présentées ; notre nouvelle méthode contient des éléments de chacune d'entre elles. Nous décrivons ensuite la nouvelle méthode proposée dans ce mémoire. Finalement, nous testons notre nouvelle approche à l'aide de simulations; nous comparons par la suite les résultats obtenus avec notre méthode à ceux obtenus par des tests d'association classiques, et par deux des trois méthodes présentées au début du mémoire. Les résultats nous laissent croire que notre méthode est performante autant dans des cas de modèles génétiques simples que complexes, contrairement à la plupart des méthodes existantes. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : cartographie génétique, processus de coalescence, arbre de recombinaison ancestral, arbre partiel, distribution proposée, fonction de pénétrance.

Thèse de doctorat--Signal et images--Paris--ENST, 2007. / Bibliogr. p. 115-122. Résumé.

Thèse de doctorat--Signal et images--Paris--ENST, 2007. / Textes en français et en anglais. Bibliogr. p. 303-311. Résumé en anglais et en français.

Reproduction de : Thèse doctorat : Acoustique : Le Mans : 2004. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 101.

Thèse de doctorat : Physique : Lyon, École normale supérieure (sciences) : 2005. / Bibliogr. p. 201-214.

Reproduction de : Thèse doctorat : Sciences et techniques des activités physiques et sportives : Reims : 2008. / Titre provenant de l'écran titre. Bibliogr. p.212-245.

Reproduction de : Thèse doctorat : Physique statistique et chimie physique industrielle : Reims : 2007. / Thèse en co-tutelle. Titre provenant de l'écran titre. Bibliogr. p. 158-166.

Reproduction de : Thèse d'Etat : mathématiques : Grenoble 1 : 1988. / Titre provenant de l'écran-titre. Bibliogr. p. 201-204.

Thèse de doctorat : Bioinformatique : Evry-Val d'Essonne : 2008. / Titre provenant de l'écran-titre.