Prior research has shown pathogen prevalence on-farms is not uniformly distributed, instead pathogen prevalence is highly dependent on environmental factors and management practices. A study was performed to determine environmental factors (e.g., landscape features, meteorological events) and management practices (e.g., date of last irrigation, pesticide application) that may impact the prevalence of Salmonella spp. and Listeria spp. at the sub-field level (0.2 ha grids) on an Eastern Shore of Virginia farm. Virginia Tech's Eastern Shore Agricultural Research and Extension Center (ESAREC) farm was used due to the liability of testing for pathogens in commercial produce fields; however, production practices used at the ESAREC farm are similar, if not the same, to production practices used on commercial farms. Fifteen drag swab, one water, and up to five fecal samples were collected every two weeks per sampling occurrence from August to December 2016 (thus up to 21 samples may be collected during one sampling occurrence. Samples were collected from randomized field plots that were picked during each sampling occurrence. Salmonella spp. and Listeria spp. were isolated and confirmed using modified versions of the Food and Drug Administration's Bacteriological Analytical Manual. Environmental factors were retrieved by remotely-sensed data for the sample location or date. Management practices were recorded by an observational survey for each sample occurrence. Two hundred and seventy-four samples (210 drag swab, 50 fecal, and 14 water samples) were collected during the late summer, fall, and winter. Listeria spp. and Salmonella spp. was detected in 8.3% (23/274) and 1.8% (5/274) of samples, respectively. Neither pathogen was detected in any of the fourteen water samples tested. Findings from this study will support the development of mitigation strategies to reduce pathogen contamination on-farm, with emphasis at the sub-field level. For instance, mitigation strategies include growers electing to not harvest near edges of fields or directly after precipitation events to minimize contamination events. Additionally, management practices were found to be associated with pathogen prevalence; therefore, management practices should be carefully tailored for each unique farm landscape. / Master of Science in Life Sciences

O Brasil consolidou-se como o principal produtor e exportador mundial de carne bovina. Estudos microbiológicos, geralmente realizados com amostras de carne coletadas no comércio e não na cadeia produtiva de carne, resultam numa insuficiência de dados a respeito das características fenotípicas e genotípicas das bactérias patogênicas de relevância nos produtos destinados à exportação. Objetivando determinar a prevalência e características de Salmonella spp em carne bovina para exportação, realizou-se a coleta de amostras de superfícies de 200 bovinos adultos, provenientes de 12 fazendas, abatidos em Frigorífico Exportador em São Paulo, Brasil, no ano de 2008. Foram coletadas amostras do couro do animal, logo após a realização da sangria (Co), da carcaça do mesmo animal, após a esfola (Ca I) e da carcaça do mesmo animal, após o toalete e antes da refrigeração (Ca II). O isolamento e a identificação de Salmonella spp foram realizados de acordo com o método - ISO 6579:2002, com algumas modificações. O patógeno foi detectado em 14 amostras de couro (7,0%), 5 de carcaça I (2,5%) e 4 de carcaça II (2,0%). Verificou-se a prevalência do sorovar S. Give (52,0%), seguido de S. Abaetetuba (16,0%), S. Typhimurium (8,0%), S. Agona (4,0%) e S. Dublin (4,0%), e quatro cepas (16,0%) não tipáveis. A tipagem molecular, feita por PFGE, mostrou que as salmonelas expressaram 12 perfis genéticos distintos, sendo 10 formados por apenas uma cepa, cada. As demais cepas (15) pertenceram a dois perfis genéticos apenas, que apresentaram 91,7% de similaridade. De acordo com o teste de infecção de células Caco-2, a maioria das cepas (92,0%) apresentou Eficiência de Invasão inferior a 1,0%, indicando baixo potencial de virulência. Quanto ao perfil de resistência a antibióticos, 68,0% das cepas analisadas foram multiresistentes, apresentando 12 perfis diferentes. Animais diferentes, provenientes de uma mesma fazenda, apresentaram salmonelas de um mesmo sorovar e com o mesmo perfil genético e de resistência a drogas, comprovando a ocorrência de contaminação cruzada durante o processamento da carne bovina. A multiresistência das salmonelas isoladas e a possibilidade de disseminação desses patógenos denotam a necessidade de se adotar medidas de higiene adequadas e maior prudência no emprego de antimicrobianos, na dieta alimentar e na terapêutica veterinária. / Brazil is an important bovine meat producer and exporter. Microbiological surveys are generally run with meat samples collected at retail level and not with meat for export, explaining the lack of data on the phenotypic and genotypic characteristics of pathogens of relevance in exported food products. This study aimed to evaluate the prevalence and characteristics of Salmonella spp in bovine meat destined for export, through surface sampling of hides and carcasses of 200 animals, from 12 farms, slaughtered in 2008 in an export slaughterhouse located in São Paulo, Brazil. Sampling was done from the hides right after bleeding (Co) and from carcasses of the same animal after removal of the hide (Ca I) and after cleaning but before chilling (Ca II). Isolation and identification of Salmonella spp were done according to ISO 6579:2002, with some modifications. The pathogen was detected in 14 samples of hides (7,0%), 5 of carcasses Ca I (2,5%) and 4 of carcasses Ca II (2,0%). The most prevalent serovars were S. Give (52,0%), followed by S. Abaetetuba (16,0%), S. Typhimurium (8,0%), S. Agona (4,0%) and S. Dublin (4,0%). Four isolates (16,0%) were not typable. Molecular typing using PFGE indicated that the isolates presented 12 molecular profiles, ten of them containing one single isolate. Fifteen isolates belonged to only two distinct profiles, with 91.7% similarity. Invasion Efficiency tests, run with Caco-2 cells, indicated that most isolates (92,0%) presented low virulence potential. 68,0% of the isolates were multiresistant to antimicrobial drugs, presenting 12 different resistance profiles. Different animals, coming from the same rearing farm, harbored salmonellae belonging to same serovar and presenting the same genetic and antimicrobial resistance profiles, indicating cross contamination in the slaughterhouse during production of meat. The occurrence of salmonellae that can disseminate in the slaughterhouse and the multiresistance presented by the strains strengthen the need for adoption of proper hygiene control measures and care in the use of antibiotics in human and veterinary therapeutics.

Made available in DSpace on 2017-07-10T14:38:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jessica Pandini.pdf: 653531 bytes, checksum: 10e2067d39b473edba9024e91143df5b (MD5) Previous issue date: 2014-06-06 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present study aimed to determine the chemical composition of the essential oil of Guarea kunthiana A Juss by the method of gas chromatography coupled to mass spectrometry (GC-MS), evaluate the antimicrobial activity of this oil against different Gram positive and Gram negative bacteria, and yeast: Escherichia coli, Salmonella entérica subsp. entérica, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Staphylococcus epidermidis, Bacillus subtillis e Candida albicans. Evaluate the antimicrobial activity of essential oil and aqueous extracts, ethyl acetate and alcohol against different serotypes of Salmonella in poultry origin: Enteritidis, Infantis, Typhimurium, Heildelberg, Mbandaka, Give, Saintpaul, Orion, Gallinarum e Agona. Determine the insecticidal activity of the oil and extracts against larvae and adults of Alphitobius diaperinus (Panzer 1797) (Coleoptera: Tenebrionidae), and finally evaluate the antioxidant activity of essential oil and extracts by the capture of the hydrazyl free radical 2,2-diphenyl-1-picryl (DPPH). The analyses of GC-MS resulted in the identification of 13 constituents, representing 96.52% of the total area on the essential oil. The main compounds identified were α-Zingiberene (34.48%), β-Sesquifelandreno (22.90%) and α-Curcumene (16.17%). Regarding antimicrobial activity of the essential oil was effective against all micro-organisms tested except for the bacteria E.coli e K. pneumoniae, which presented themselves resistant to the action of the oil. For Salmonella serotypes evaluated, the essential oil had greater activity against serotypes Infantis, Typhimurium e Give, with values of MIC and MBC of 54,6 μg/mL for both, for the other serotypes tested the action of the oil was classified as moderate, weak and inactive. Regarding extracts all serotypes tested were susceptible to the extract of ethyl acetate, followed by alcoholic extract, the aqueous extract showed no antimicrobial activity. The results concerning the insecticidal activity of the essential oil revealed that it provided better activity against larvae at a concentration of 200 mg / mL (28%) compared to adults the mortality rate was low (12%) at this concentration. With the extracts, the best results were found for the alcoholic extract at a concentration of 10%, with values of 34 and 44% respectively, adults and larvae. The values of antioxidant activity showed no significant differences between the synthetic antioxidant butylated hydroxytoluene (BHT), essential oil and alcoholic extract, revealing that both the essential oil as alcoholic extract of G. kunthiana demonstrated high antioxidant capacity / O presente estudo teve por objetivo determinar a composição química do óleo essencial de Guarea kunthiana A Juss pelo método de cromatografia gasosa acoplada à espectrometria de massas (CG-EM), avaliar a atividade antimicrobiana deste óleo frente a diferentes bactérias Gram-positivas e Gram- negativas e uma levedura: Escherichia coli, Salmonella entérica subsp. entérica, Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Enterococcus faecalis, Staphylococcus epidermidis, Bacillus subtillis e Candida albicans. Avaliar a atividade antimicrobiana do óleo essencial e dos extratos aquoso, acetato de etila e alcoólico frente a diferentes sorotipos de Salmonella de origem avícola: Enteritidis, Infantis, Typhimurium, Heildelberg, Mbandaka, Give, Saintpaul, Orion, Gallinarum e Agona. Determinar a atividade inseticida do óleo e dos extratos frente a larvas e adultos de Alphitobius diaperinus (Panzer 1797) (Coleoptera: Tenebrionidae), e por último avaliar a atividade antioxidante do óleo essencial e dos extratos pelo método de captura do radical livre 2,2-difenil-1-picril hidrazil (DPPH). As análises de CG-EM resultaram na identificação de 13 constituintes, representando 96,52% da área relativa total do óleo essencial. Os principais compostos identificados foram α-Zingibereno (34,48%), β-Sesquifelandreno (22,90%) e α-Curcumeno (16,17%). Em relação à atividade antimicrobiana o óleo essencial foi efetivo frente a todos os micro-organismos testados exceto para as bactérias E.coli e K. pneumoniae, as quais se apresentaram resistentes à ação do óleo. Para os sorotipos de Salmonella avaliados, o óleo essencial exerceu maior atividade frente aos sorotipos Infantis, Typhimurium e Give, com valores de CIM e CBM de 54,6 μg/mL para ambos, para os demais sorotipos testados a ação do óleo foi classificada como moderada, fraca e inativa. Em relação aos extratos todos os sorotipos testados foram suscetíveis ao extrato de acetato de etila, seguido do extrato alcoólico, o extrato aquoso não apresentou atividade antimicrobiana. Os resultados referentes à atividade inseticida do óleo essencial revelaram que este exerceu melhor atividade frente às larvas na concentração de 200 mg/mL (28%), em relação aos adultos a porcentagem de mortalidade foi baixa (12%) nesta concentração. Com os extratos, os melhores resultados foram encontrados para o extrato alcoólico na concentração de 10%, com valores de 34 e 44% para larvas e adultos respectivamente. Os valores de atividade antioxidante revelaram que não houve diferenças significativas entre o antioxidante sintético butil-hidroxi-tolueno (BHT), o óleo essencial e o extrato alcoólico, revelando que tanto o óleo essencial quanto extrato alcoólico de G. kunthiana demonstraram elevada capacidade antioxidante

Die im Biogasprozess anfallenden Gärreste werden oftmals als Wirtschaftsdünger verwendet. Krankheitserreger, die sich in den Gärresten befinden können über die Düngung in die Lebensmittelkette gelangen. Die Möglichkeit einer Vermehrung von Bakterien in den Biogasanlagen sowie deren Ausbreitung schürt die Bedenken der Öffentlichkeit. Das Ziel dieser Arbeit war es, Nachweismethoden für die Untersuchung von Proben aus Biogasanlagen zu etablieren, die Praxistauglichkeit dieser anhand von Proben aus Biogasanlagen zu überprüfen und die mikrobielle Belastung dieser Proben hinsichtlich ausgewählter Indikatorkeime zu erfassen. Bei den Indikatorkeimen handelte es sich um Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Enterokokken, Escherichia coli, ESBL-bildende Enterobaceriaceae und Salmonellen. Für die Etablierung der bakteriologischen Nachweismethoden wurde autoklavierter Gärrest mit einer definierten Keimmenge beimpft und auf verschiedene Nährmedien aufgebracht. Diese wurden bebrütet, ausgezählt und die KbE/ml berechnet. Mittels Probitanalyse wurde für jedes Medium die untere Grenze für den Nachweis aus beimpftem Gärrest bestimmt. Bei den Nährmedien handelte es sich um Brilliance™ Salmonella Agar, XLT4 Agar und XLD Agar für den Nachweis von Salmonella spp. Für E. coli wurden Tergitol 7 Lactose TCC Agar und Brilliance™ E. coli/Coliform Selektiv Agar verwendet. Der Nachweis von Enterokokken erfolgte mittels Slanetz Bartley Agar und Enterococcus Selektivagar. Für die ESBL-bildenden Enterobacteriaceae wurde der Brilliance™ ESBL Agar eingesetzt. Die getesteten Nährmedien zum Nachweis von C. perfringens waren Membran Clostridium Perfringens (mCP) Selektivnährboden sowie Tryptose Sulphite Cycloserine (TSC) Agar überschichtet mit TSC Agarbasis. Für C. botulinum erfolgte der Nachweis auf Eigelb Laktose Agar. Darüber hinaus wurde eine PCR zur C. perfringens Toxintyp-Bestimmung nach dem Protokoll von VAN ASTEN et al. (2009) etabliert. Zum Nachweis von C. botulinum wurde die PCR nach dem Protokoll von HILL et al. (2010) eingesetzt. Bei der Untersuchung der Praxistauglichkeit wurden Proben aus zehn Biogasanlagen des Freistaates Sachsen entnommen und untersucht. Hierbei handelte es sich um Proben aus Abschnitten vor, während und nach der Fermentation. Anhand der ermittelten Nachweisgrenze sowie der Handhabung wurden die folgenden Nährmedien für die Untersuchung der Biogasanlagen-Proben ausgewählt: Brilliance™ Salmonella Agar, XLT4 Agar, Brilliance™ E. coli/Coliform Selektiv Agar, Slanetz Bartley Agar, Brilliance™ ESBL Agar, TSC Agar überschichtet mit TSC Agarbasis und Eigelb Laktose Agar. Für die Anzucht anaerober Bakterien wurden die Proben vor der Beimpfung der Agarplatten erhitzt. Zudem erfolgte eine Anreicherung des zuvor erhitzten Probenmaterials in TPYG Bouillon. Diese wurde genutzt, um daraus aufgereinigte DNA mittels PCR auf C. botulinum und C. perfringens zu untersuchen. Die verwendeten Nährmedien wurden im Praxistest positiv evaluiert. Die Ergebnisse für die Proben aus den Biogasanlagen zeigten, dass, mit Ausnahme von C. perfringens, alle Indikatororganismen während des Biogasprozesses einer Reduktion unterlagen. Die durchschnittliche anaerobe Lebendkeimzahl belief sich auf 107 bis 108 KbE/g Probe. E. coli erfuhr eine Reduktion um bis zu vier Zehnerpotenzen. Enterokokken wurden um 1 bis 2 log10 Stufen reduziert. ESBL-bildende Enterobacteriaceae konnten in sechs der zehn Biogasanlagen nachgewiesen werden. Hierbei handelte es sich überwiegend um E. coli und Klebsiella spp. In keiner der Proben konnten Salmonellen oder C. botulinum nachgewiesen werden. Typ A war der am häufigsten nachgewiesene C. perfringens-Toxintyp. Das β2-Toxin-Gen wurde in 20 Fällen nachgewiesen. Einmal konnte C. perfringens Typ C, β2-Toxin-Gen-positiv detektiert werden. Der hygienische Status der Gärreste entsprach in etwa dem hygienischen Status von Gülle. In Abhängigkeit vom Indikatorkeim war eine Verbesserung des Status durch eine Reduktion der Keimzahl festzustellen.

Programa de Apoio aos Planos de Reestruturação e Expansão das Universidades Federais / The microbiota intestinal of Psittaciformes is mainly composed of Gram positive bacteria, is considered a sign of illness the presence of Gram negative bacteria. Wild birds are important to public health by harboring pathogens able of zoonotic transmission. The displacement of these birds, such as occurs in the trafficking of wild animals, is a propagation mechanism of new endemic foci of infections agents to long distances from where they were acquired. In this study we examined the presence of enterobacteria in psittacines using samples of organs of birds received for necropsy at the Laboratório Central de Diagnóstico de Patologias Aviárias (LCDPA) situate in the Departamento de Medicina Veterinária Preventiva (DMVP) at Centro de Ciências Rurais (CCR) of the Universidade Federal de Santa Maria (UFSM). We also collected samples using swabs of cloaca and crop, in live birds, kept in captivity in order to monitor the possible presence of pathogenic bacteria. Escherichia coli was considered the predominant bacteria in most samples, then after microbiological analysis and confirmation of E. coli isolates, we selected 28 colonies, which were tested for virulence factors iss, this gen is associated with the strain s ability to resist the lytic effects of serum, and iutA an outer membrane receptor of involved in the high affinity binding of iron-aerobactin. It is hoped that the data obtained in this research will help in establishing the health status of psittacines helping maintain the species and preventing risks to public health. / A microbiota intestinal de Psitaciformes é composta principalmente por bactérias Gram positivas, não se considerando saudável a presença de bactérias Gram negativas. As aves silvestres possuem importância para a saúde pública por albergarem patógenos passíveis de transmissão zoonótica. O deslocamento territorial dessas aves, como o que ocorre no tráfico de animais selvagens, constitui um mecanismo de propagação de novos focos endêmicos de agentes infecciosos a grandes distâncias dos locais onde foram adquiridos. Neste trabalho analisamos a presença de enterobactérias em psitacídeos utilizando amostras de órgãos de aves recebidas para necropsia na rotina do Laboratório Central de Diagnóstico de Patologias Aviárias (LCDPA) situado no Departamento de Medicina Veterinária Preventiva (DMVP) do Centro de Ciências Rurais (CCR) da Universidade Federal de Santa Maria (UFSM). Também foi realizada coleta de suabes cloacais e de inglúvio em aves vivas mantidas em cativeiro visando monitorar a presença de possíveis bactérias patogênicas. Escherichia coli foi considerada a bactéria predominante na maioria das amostras, então após análise microbiológica e confirmação dos isolados de E. coli, selecionamos 28 colônias, as quais foram testadas para os fatores de virulência iss, relacionado com a capacidade da cepa em resistir aos efeitos líticos do soro, e iutA, sendo este gene um receptor de membrana externa dos compostos sideróforos da aerobactina (genes iuc) que é um sistema de captação de ferro pelo qual E. coli expressa afinidade. Espera-se que os dados obtidos nessa pesquisa contribuam no estabelecimento do estado sanitário de psitaciformes auxiliando na manutenção da espécie e prevenindo riscos à saúde pública.

O Brasil consolidou-se como o principal produtor e exportador mundial de carne bovina. Estudos microbiológicos, geralmente realizados com amostras de carne coletadas no comércio e não na cadeia produtiva de carne, resultam numa insuficiência de dados a respeito das características fenotípicas e genotípicas das bactérias patogênicas de relevância nos produtos destinados à exportação. Objetivando determinar a prevalência e características de Salmonella spp em carne bovina para exportação, realizou-se a coleta de amostras de superfícies de 200 bovinos adultos, provenientes de 12 fazendas, abatidos em Frigorífico Exportador em São Paulo, Brasil, no ano de 2008. Foram coletadas amostras do couro do animal, logo após a realização da sangria (Co), da carcaça do mesmo animal, após a esfola (Ca I) e da carcaça do mesmo animal, após o toalete e antes da refrigeração (Ca II). O isolamento e a identificação de Salmonella spp foram realizados de acordo com o método - ISO 6579:2002, com algumas modificações. O patógeno foi detectado em 14 amostras de couro (7,0%), 5 de carcaça I (2,5%) e 4 de carcaça II (2,0%). Verificou-se a prevalência do sorovar S. Give (52,0%), seguido de S. Abaetetuba (16,0%), S. Typhimurium (8,0%), S. Agona (4,0%) e S. Dublin (4,0%), e quatro cepas (16,0%) não tipáveis. A tipagem molecular, feita por PFGE, mostrou que as salmonelas expressaram 12 perfis genéticos distintos, sendo 10 formados por apenas uma cepa, cada. As demais cepas (15) pertenceram a dois perfis genéticos apenas, que apresentaram 91,7% de similaridade. De acordo com o teste de infecção de células Caco-2, a maioria das cepas (92,0%) apresentou Eficiência de Invasão inferior a 1,0%, indicando baixo potencial de virulência. Quanto ao perfil de resistência a antibióticos, 68,0% das cepas analisadas foram multiresistentes, apresentando 12 perfis diferentes. Animais diferentes, provenientes de uma mesma fazenda, apresentaram salmonelas de um mesmo sorovar e com o mesmo perfil genético e de resistência a drogas, comprovando a ocorrência de contaminação cruzada durante o processamento da carne bovina. A multiresistência das salmonelas isoladas e a possibilidade de disseminação desses patógenos denotam a necessidade de se adotar medidas de higiene adequadas e maior prudência no emprego de antimicrobianos, na dieta alimentar e na terapêutica veterinária. / Brazil is an important bovine meat producer and exporter. Microbiological surveys are generally run with meat samples collected at retail level and not with meat for export, explaining the lack of data on the phenotypic and genotypic characteristics of pathogens of relevance in exported food products. This study aimed to evaluate the prevalence and characteristics of Salmonella spp in bovine meat destined for export, through surface sampling of hides and carcasses of 200 animals, from 12 farms, slaughtered in 2008 in an export slaughterhouse located in São Paulo, Brazil. Sampling was done from the hides right after bleeding (Co) and from carcasses of the same animal after removal of the hide (Ca I) and after cleaning but before chilling (Ca II). Isolation and identification of Salmonella spp were done according to ISO 6579:2002, with some modifications. The pathogen was detected in 14 samples of hides (7,0%), 5 of carcasses Ca I (2,5%) and 4 of carcasses Ca II (2,0%). The most prevalent serovars were S. Give (52,0%), followed by S. Abaetetuba (16,0%), S. Typhimurium (8,0%), S. Agona (4,0%) and S. Dublin (4,0%). Four isolates (16,0%) were not typable. Molecular typing using PFGE indicated that the isolates presented 12 molecular profiles, ten of them containing one single isolate. Fifteen isolates belonged to only two distinct profiles, with 91.7% similarity. Invasion Efficiency tests, run with Caco-2 cells, indicated that most isolates (92,0%) presented low virulence potential. 68,0% of the isolates were multiresistant to antimicrobial drugs, presenting 12 different resistance profiles. Different animals, coming from the same rearing farm, harbored salmonellae belonging to same serovar and presenting the same genetic and antimicrobial resistance profiles, indicating cross contamination in the slaughterhouse during production of meat. The occurrence of salmonellae that can disseminate in the slaughterhouse and the multiresistance presented by the strains strengthen the need for adoption of proper hygiene control measures and care in the use of antibiotics in human and veterinary therapeutics.

Die im Biogasprozess anfallenden Gärreste werden oftmals als Wirtschaftsdünger verwendet. Krankheitserreger, die sich in den Gärresten befinden können über die Düngung in die Lebensmittelkette gelangen. Die Möglichkeit einer Vermehrung von Bakterien in den Biogasanlagen sowie deren Ausbreitung schürt die Bedenken der Öffentlichkeit. Das Ziel dieser Arbeit war es, Nachweismethoden für die Untersuchung von Proben aus Biogasanlagen zu etablieren, die Praxistauglichkeit dieser anhand von Proben aus Biogasanlagen zu überprüfen und die mikrobielle Belastung dieser Proben hinsichtlich ausgewählter Indikatorkeime zu erfassen. Bei den Indikatorkeimen handelte es sich um Clostridium perfringens, Clostridium botulinum, Enterokokken, Escherichia coli, ESBL-bildende Enterobaceriaceae und Salmonellen. Für die Etablierung der bakteriologischen Nachweismethoden wurde autoklavierter Gärrest mit einer definierten Keimmenge beimpft und auf verschiedene Nährmedien aufgebracht. Diese wurden bebrütet, ausgezählt und die KbE/ml berechnet. Mittels Probitanalyse wurde für jedes Medium die untere Grenze für den Nachweis aus beimpftem Gärrest bestimmt. Bei den Nährmedien handelte es sich um Brilliance™ Salmonella Agar, XLT4 Agar und XLD Agar für den Nachweis von Salmonella spp. Für E. coli wurden Tergitol 7 Lactose TCC Agar und Brilliance™ E. coli/Coliform Selektiv Agar verwendet. Der Nachweis von Enterokokken erfolgte mittels Slanetz Bartley Agar und Enterococcus Selektivagar. Für die ESBL-bildenden Enterobacteriaceae wurde der Brilliance™ ESBL Agar eingesetzt. Die getesteten Nährmedien zum Nachweis von C. perfringens waren Membran Clostridium Perfringens (mCP) Selektivnährboden sowie Tryptose Sulphite Cycloserine (TSC) Agar überschichtet mit TSC Agarbasis. Für C. botulinum erfolgte der Nachweis auf Eigelb Laktose Agar. Darüber hinaus wurde eine PCR zur C. perfringens Toxintyp-Bestimmung nach dem Protokoll von VAN ASTEN et al. (2009) etabliert. Zum Nachweis von C. botulinum wurde die PCR nach dem Protokoll von HILL et al. (2010) eingesetzt. Bei der Untersuchung der Praxistauglichkeit wurden Proben aus zehn Biogasanlagen des Freistaates Sachsen entnommen und untersucht. Hierbei handelte es sich um Proben aus Abschnitten vor, während und nach der Fermentation. Anhand der ermittelten Nachweisgrenze sowie der Handhabung wurden die folgenden Nährmedien für die Untersuchung der Biogasanlagen-Proben ausgewählt: Brilliance™ Salmonella Agar, XLT4 Agar, Brilliance™ E. coli/Coliform Selektiv Agar, Slanetz Bartley Agar, Brilliance™ ESBL Agar, TSC Agar überschichtet mit TSC Agarbasis und Eigelb Laktose Agar. Für die Anzucht anaerober Bakterien wurden die Proben vor der Beimpfung der Agarplatten erhitzt. Zudem erfolgte eine Anreicherung des zuvor erhitzten Probenmaterials in TPYG Bouillon. Diese wurde genutzt, um daraus aufgereinigte DNA mittels PCR auf C. botulinum und C. perfringens zu untersuchen. Die verwendeten Nährmedien wurden im Praxistest positiv evaluiert. Die Ergebnisse für die Proben aus den Biogasanlagen zeigten, dass, mit Ausnahme von C. perfringens, alle Indikatororganismen während des Biogasprozesses einer Reduktion unterlagen. Die durchschnittliche anaerobe Lebendkeimzahl belief sich auf 107 bis 108 KbE/g Probe. E. coli erfuhr eine Reduktion um bis zu vier Zehnerpotenzen. Enterokokken wurden um 1 bis 2 log10 Stufen reduziert. ESBL-bildende Enterobacteriaceae konnten in sechs der zehn Biogasanlagen nachgewiesen werden. Hierbei handelte es sich überwiegend um E. coli und Klebsiella spp. In keiner der Proben konnten Salmonellen oder C. botulinum nachgewiesen werden. Typ A war der am häufigsten nachgewiesene C. perfringens-Toxintyp. Das β2-Toxin-Gen wurde in 20 Fällen nachgewiesen. Einmal konnte C. perfringens Typ C, β2-Toxin-Gen-positiv detektiert werden. Der hygienische Status der Gärreste entsprach in etwa dem hygienischen Status von Gülle. In Abhängigkeit vom Indikatorkeim war eine Verbesserung des Status durch eine Reduktion der Keimzahl festzustellen.

Orientador: Karin Werther / Coorientador: Angelo Berchieri Júnior / Banca: Anna Monteiro Correia Lima Ribeiro / Banca: Ivens Gomes Guimarães / Banca: Marcelo Vasconcelos Meireles / Banca: Raphael Lucio Andreatti Filho / Resumo: Para a manutenção da avicultura brasileira e conservação dos seus altos índices de produção e exportação de produtos avícolas, são exigidas medidas de prevenção e controle de alguns agentes etiológicos nas granjas, como por exemplo, a Salmonella spp. O objetivo deste trabalho foi isolar e classificar Salmonella spp., em materiais colhidos de instalações avícolas, sunícolas e avifauna selvagem local, inocular posteriormente os sorotipos isolados em pintos de frangos de corte verificando sua patogenicidade.. Foram capturadas 36 aves selvagens de diferentes espécies nas instalações avícolas de uma granja integrada de frango de corte. Foi isolado Salmonella Heidelberg dos órgãos e conteúdo intestinal de um pica-pau-do-campo (Colaptes campestris),. As amostras positivas provenientes das aves de produção foram: cama aviária (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), fezes de frangos de corte (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee); água (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) e cascudinhos (Alphitobius diaperinus) encontrados na cama aviária (Salmonella Tennessee). Em fezes de suínos criados em galpões na mesma propriedade, foram isolados Salmonella Panama e Salmonella Typhimurium. Quanto à infecção experimental, em todos os nove grupos de aves foi observado entre o 3° dpi (dia pós-infecção) e o 12° dpi, fezes amolecidas no chão das gaiolas, ao redor da cloaca e na penugem das aves. Aos 15 e 21 dpi, os diferentes sorotipos de Salmonella foram isolados do conteúdo cecal, do baço e do fígado. Nas necropsias não foram encontradas alterações macro nem microscópicas relevantes / Abstract: For maintenance of the high levels of production in Brazil and the export of poultry products, preventive measures and control of some etiologic agents on farms, such as Salmonella spp., are required. The purpose of the present study was to initially investigate the presence of Salmonella spp.through bacterial culture in poultry houses materials collected from local poultry and wild birds and subsequently inoculate the isolated serotypes in broiler chicks and verify the effect on these. From the 36 wild birds captured in the poultry houses, Salmonella Heidelberg were isolated from the organs and intestinal contents from one woodpecker (Colaptes campestris) From the poultry houses the positive samples were: litter (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), feces of broiler (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee), water (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) and lesser mealworm (Alphitobius diaperinus) found in litter (Salmonella Tennessee). From the feces of swine also produced in sheds on the same farm were isolated Salmonella Typhimurium and Salmonella Panama. In the experimental infection done in nine avian groups (n=15) was observed between the 3rd dpi (days post-infection) and 12th dpi the presence of soft feces on the floor of the cages, around the cloaca and on feathers of the birds. On 15 and 21 dpi the different serotypes of Salmonella were isolated from the cecal contents, spleen and liver. At the necropsies weren't observed relevant macro or microscopic alterations / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-12-02Bitstream added on 2014-06-13T19:09:24Z : No. of bitstreams: 1 andrade_phm_me_arafcf.pdf: 233794 bytes, checksum: 4fb09f68aeeb569be13ec267ab33fc6f (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O objetivo do trabalho foi a análise bacteriológica e físico-química de amostras da água do Sistema de Pré-resfriamento de um abatedouro de aves e na análise bacteriológica de carcaças de frango antes, no interior e após o Sistema de Pré-resfriamento. As variáveis físico-químicas da água foram relacionadas com presença ou ausência de Salmonella spp. nas carcaças após sistema de pré-resfriamento. Em relação à contagem bacteriana, observamos que a saída do pré-chiller é o ponto de coleta onde há maior contaminação da água. No entanto, há uma queda significativa na contaminação da água na saída do chiller. Na análise por agrupamento hierárquico adotando a variável Salmonella spp. como classe, não foi possível verificar tendência de separação entre as amostras contaminadas e as não contaminadas, porém, pode-se perceber que com o aumento da velocidade de abate a separação entre as amostras passa a existir. Ao analisar as componentes principais, considerando todas as variáveis, observamos que existe uma relação entre a contaminação por Salmonella spp. e a vazão da renovação da água do pré-chiller. Assim, foi possível verificar que o controle dos parâmetros físico-químicos e microbiológicos da água do sistema de pré-resfriamento, bem como as diversas variáveis das condições de abate, são fundamentais para garantirem carcaças pré-resfriadas livres de Salmonella spp. Torna-se necessário propor estudos específicos de cada variável a fim de que as condições ideais de abate sejam estabelecidas e o processo seja autocontrolado / This study was based on microbiological and physicochemical analysis of water samples from the pre-cooling system of a poultry slaughterhouse and the bacteriological analysis of chicken carcasses before, during and after the pre-cooling system. The physicochemical variables of the water were related to the presence or absence of Salmonella spp. in the carcasses after the pre-cooling system. Regarding the amount of bacteria, it was observed that the output of the pre-chiller is the collecting point where the water is most contaminated. However, there is a significant decrease of contamination in the water leaving the chiller. In the hierarchical cluster analysis taking the variable Salmonella spp. as a class it was not possible to verify the trend of separation between the contaminated samples and the non-contaminated ones, although it was realized that with the increase in speed of slaughter the separation between samples exists. By analyzing the main components, considering all variables, it was observed that there is a relation between the contamination by Salmonella spp. and the flow rate of the water renewal in the pre-chiller. Therefore, it was verified that the control of physicochemical and microbiological parameters of the water in the pre-cooling system and the variables of slaughtering conditions are essential to guarantee pre-cooled carcasses free from Salmonella spp. This it becomes necessary to propose specific studies of each variable so that the ideal conditions for slaughter are established and the process can become self-controlled

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:33:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-01Bitstream added on 2014-06-13T18:45:07Z : No. of bitstreams: 1 sousa_e_dr_jabo.pdf: 731084 bytes, checksum: 8b5b74e4f498844e65d919aeece86e5e (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Para a manutenção da avicultura brasileira e conservação dos seus altos índices de produção e exportação de produtos avícolas, são exigidas medidas de prevenção e controle de alguns agentes etiológicos nas granjas, como por exemplo, a Salmonella spp. O objetivo deste trabalho foi isolar e classificar Salmonella spp., em materiais colhidos de instalações avícolas, sunícolas e avifauna selvagem local, inocular posteriormente os sorotipos isolados em pintos de frangos de corte verificando sua patogenicidade.. Foram capturadas 36 aves selvagens de diferentes espécies nas instalações avícolas de uma granja integrada de frango de corte. Foi isolado Salmonella Heidelberg dos órgãos e conteúdo intestinal de um pica-pau-do-campo (Colaptes campestris),. As amostras positivas provenientes das aves de produção foram: cama aviária (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), fezes de frangos de corte (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee); água (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) e cascudinhos (Alphitobius diaperinus) encontrados na cama aviária (Salmonella Tennessee). Em fezes de suínos criados em galpões na mesma propriedade, foram isolados Salmonella Panama e Salmonella Typhimurium. Quanto à infecção experimental, em todos os nove grupos de aves foi observado entre o 3° dpi (dia pós-infecção) e o 12° dpi, fezes amolecidas no chão das gaiolas, ao redor da cloaca e na penugem das aves. Aos 15 e 21 dpi, os diferentes sorotipos de Salmonella foram isolados do conteúdo cecal, do baço e do fígado. Nas necropsias não foram encontradas alterações macro nem microscópicas relevantes / For maintenance of the high levels of production in Brazil and the export of poultry products, preventive measures and control of some etiologic agents on farms, such as Salmonella spp., are required. The purpose of the present study was to initially investigate the presence of Salmonella spp.through bacterial culture in poultry houses materials collected from local poultry and wild birds and subsequently inoculate the isolated serotypes in broiler chicks and verify the effect on these. From the 36 wild birds captured in the poultry houses, Salmonella Heidelberg were isolated from the organs and intestinal contents from one woodpecker (Colaptes campestris) From the poultry houses the positive samples were: litter (Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Heidelberg; Salmonella Infantis), feces of broiler (Salmonella Heidelberg; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,7:R:-; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 4,5,12:R:-; Salmonella Tennessee), water (Salmonella Glostrup; Salmonella enterica subsp. enterica sorotipo 6,8:d:-;) and lesser mealworm (Alphitobius diaperinus) found in litter (Salmonella Tennessee). From the feces of swine also produced in sheds on the same farm were isolated Salmonella Typhimurium and Salmonella Panama. In the experimental infection done in nine avian groups (n=15) was observed between the 3rd dpi (days post-infection) and 12th dpi the presence of soft feces on the floor of the cages, around the cloaca and on feathers of the birds. On 15 and 21 dpi the different serotypes of Salmonella were isolated from the cecal contents, spleen and liver. At the necropsies weren’t observed relevant macro or microscopic alterations