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Efficient data integration is one of the most challenging problems in data management, interoperation and analysis. The Earth science data which are heterogeneous are collected at various geographical locations for scientific studies and operational uses. The intrinsic problem of archiving, distributing and searching such huge scientific datasets is compounded by the heterogeneity of data and queries, thus limiting scientific analysis, and generation/validation of hydrologic forecast models. The data models of hydrologic research communities such as National Weather Service (NWS), National Oceanic and Atmospheric Administration (NOAA), and US Geological Survey (USGS) are diverse and complex. A complete derivation of any useful hydrological models from data integrated from all these sources is often a time consuming process. One of the current trends of data harvesting in scientific community is towards a distributed digital library initiative. However, these approaches may not be adequate for data sources / entities who do not want to "upload" the data into a "data pool." In view of this, we present here an effective architecture to address the issues of data integration in such a diverse environment for hydrological studies. The heterogeneities in these datasets are addressed based on the autonomy of data source in terms of design, communication, association and execution using a hierarchical integration model. A metadata model is also developed for defining data as well as the data sources, thus providing a uniform view of the data for different kind of users. An implementation of the model using web based system that integrates widely varied hydrology datasets from various data sources is also being developed. / Master of Science

Estudo qualitativo de natureza descritiva, objetivando analisar a autoria científica a partir do compartilhamento de dados de pesquisa. Para esta finalidade, foi utilizada a Teoria Ator-Rede (ANT), a qual busca, a partir de uma ideia de simetria entre humanos e não humanos, não assumir uma divisão entre essas entidades, possibilitando visualizar o estabelecimento e a dissolução de uma rede a partir das relações que se criam em diversos níveis. Esses atores-rede, actantes, estão mobilizados para a estruturação de redes temporárias a partir de um programa de ações, através da transformação e da modificação do significado ou dos elementos que veiculam. Os dados levantados, os quais serviram de base para descrição e análise a partir da literatura que também emergiu do que foi coletado, foram recolhidos a partir de observação, de entrevistas e de materiais bibliográficos. A investigação ocorreu junto ao Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Conclui que os objetos conceituais e pragmáticos não podem ser vistos de maneira isolada, mas sim como atores-rede afetados diretamente pela tecnologia, devendo ser considerados atuantes importantes no processo de produção, compartilhamento e uso de dados digitais de pesquisa. A construção de um fato científico e social como a autoria, é coordenada por uma série de elementos que foram levantados com o auxílio da ANT, como a coleta de dados, a curadoria, os próprios dados científicos, seus metadados, as fontes de fomento, a política de dados, o repositório e seus softwares de gerenciamento e envio de dados e metadados, o licenciamento, a propriedade e a responsabilidade, agindo como um tipo de instrumentalização de um arranjo de fenômenos, isto é, uma ferramenta que, atuante como conceito e/ou como processo, permite que seja consolidado um conjunto de ações instituídas a partir de regras explícitas e implícitas. / Qualitative study of descriptive nature, aimed to analyze the scientific authorship from the data sharing. For this purpose, we used the Actor-Network Theory (ANT), which seeks, from an idea of symmetry between human and non-human, do not assume a division between those entities, allowing to view the establishment and dissolution of a network from the relationships that are created at different levels. These actors-network, actants, are mobilized for structuring temporary networks from an action program, through the transformation and modification of the meaning or the elements they provide. The data collected, which were the basis for description and analysis from the literature that also emerged from what ware collected by observation, interviews and bibliographic materials. The study was carried out by the Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Concludes that conceptual and pragmatic objects can not be seen in isolate way, but as actors directly affected by the technology, should be considered important actants in the process of production, sharing and use of digital research data. The construction of a scientific and social fact as authorship, is coordinated by a number of elements that were raised with the help of ANT, such as data collection, curation, scientific data and its metadata, funding sources, data policy, repository and its management software for data and metadata, licensing, ownership and responsibility, acting as a kind of exploitation of a phenomena arrangement, ie, a tool that can be seen as concept and/or as a process, allows it to be consolidated a set of actions established from explicit and implicit rules.

Estudo qualitativo de natureza descritiva, objetivando analisar a autoria científica a partir do compartilhamento de dados de pesquisa. Para esta finalidade, foi utilizada a Teoria Ator-Rede (ANT), a qual busca, a partir de uma ideia de simetria entre humanos e não humanos, não assumir uma divisão entre essas entidades, possibilitando visualizar o estabelecimento e a dissolução de uma rede a partir das relações que se criam em diversos níveis. Esses atores-rede, actantes, estão mobilizados para a estruturação de redes temporárias a partir de um programa de ações, através da transformação e da modificação do significado ou dos elementos que veiculam. Os dados levantados, os quais serviram de base para descrição e análise a partir da literatura que também emergiu do que foi coletado, foram recolhidos a partir de observação, de entrevistas e de materiais bibliográficos. A investigação ocorreu junto ao Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Conclui que os objetos conceituais e pragmáticos não podem ser vistos de maneira isolada, mas sim como atores-rede afetados diretamente pela tecnologia, devendo ser considerados atuantes importantes no processo de produção, compartilhamento e uso de dados digitais de pesquisa. A construção de um fato científico e social como a autoria, é coordenada por uma série de elementos que foram levantados com o auxílio da ANT, como a coleta de dados, a curadoria, os próprios dados científicos, seus metadados, as fontes de fomento, a política de dados, o repositório e seus softwares de gerenciamento e envio de dados e metadados, o licenciamento, a propriedade e a responsabilidade, agindo como um tipo de instrumentalização de um arranjo de fenômenos, isto é, uma ferramenta que, atuante como conceito e/ou como processo, permite que seja consolidado um conjunto de ações instituídas a partir de regras explícitas e implícitas. / Qualitative study of descriptive nature, aimed to analyze the scientific authorship from the data sharing. For this purpose, we used the Actor-Network Theory (ANT), which seeks, from an idea of symmetry between human and non-human, do not assume a division between those entities, allowing to view the establishment and dissolution of a network from the relationships that are created at different levels. These actors-network, actants, are mobilized for structuring temporary networks from an action program, through the transformation and modification of the meaning or the elements they provide. The data collected, which were the basis for description and analysis from the literature that also emerged from what ware collected by observation, interviews and bibliographic materials. The study was carried out by the Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Concludes that conceptual and pragmatic objects can not be seen in isolate way, but as actors directly affected by the technology, should be considered important actants in the process of production, sharing and use of digital research data. The construction of a scientific and social fact as authorship, is coordinated by a number of elements that were raised with the help of ANT, such as data collection, curation, scientific data and its metadata, funding sources, data policy, repository and its management software for data and metadata, licensing, ownership and responsibility, acting as a kind of exploitation of a phenomena arrangement, ie, a tool that can be seen as concept and/or as a process, allows it to be consolidated a set of actions established from explicit and implicit rules.

Estudo qualitativo de natureza descritiva, objetivando analisar a autoria científica a partir do compartilhamento de dados de pesquisa. Para esta finalidade, foi utilizada a Teoria Ator-Rede (ANT), a qual busca, a partir de uma ideia de simetria entre humanos e não humanos, não assumir uma divisão entre essas entidades, possibilitando visualizar o estabelecimento e a dissolução de uma rede a partir das relações que se criam em diversos níveis. Esses atores-rede, actantes, estão mobilizados para a estruturação de redes temporárias a partir de um programa de ações, através da transformação e da modificação do significado ou dos elementos que veiculam. Os dados levantados, os quais serviram de base para descrição e análise a partir da literatura que também emergiu do que foi coletado, foram recolhidos a partir de observação, de entrevistas e de materiais bibliográficos. A investigação ocorreu junto ao Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Conclui que os objetos conceituais e pragmáticos não podem ser vistos de maneira isolada, mas sim como atores-rede afetados diretamente pela tecnologia, devendo ser considerados atuantes importantes no processo de produção, compartilhamento e uso de dados digitais de pesquisa. A construção de um fato científico e social como a autoria, é coordenada por uma série de elementos que foram levantados com o auxílio da ANT, como a coleta de dados, a curadoria, os próprios dados científicos, seus metadados, as fontes de fomento, a política de dados, o repositório e seus softwares de gerenciamento e envio de dados e metadados, o licenciamento, a propriedade e a responsabilidade, agindo como um tipo de instrumentalização de um arranjo de fenômenos, isto é, uma ferramenta que, atuante como conceito e/ou como processo, permite que seja consolidado um conjunto de ações instituídas a partir de regras explícitas e implícitas. / Qualitative study of descriptive nature, aimed to analyze the scientific authorship from the data sharing. For this purpose, we used the Actor-Network Theory (ANT), which seeks, from an idea of symmetry between human and non-human, do not assume a division between those entities, allowing to view the establishment and dissolution of a network from the relationships that are created at different levels. These actors-network, actants, are mobilized for structuring temporary networks from an action program, through the transformation and modification of the meaning or the elements they provide. The data collected, which were the basis for description and analysis from the literature that also emerged from what ware collected by observation, interviews and bibliographic materials. The study was carried out by the Repositório de Dados de Estudos Ecológicos do Programa de Pesquisa em Biodiversidade (PPBio). Concludes that conceptual and pragmatic objects can not be seen in isolate way, but as actors directly affected by the technology, should be considered important actants in the process of production, sharing and use of digital research data. The construction of a scientific and social fact as authorship, is coordinated by a number of elements that were raised with the help of ANT, such as data collection, curation, scientific data and its metadata, funding sources, data policy, repository and its management software for data and metadata, licensing, ownership and responsibility, acting as a kind of exploitation of a phenomena arrangement, ie, a tool that can be seen as concept and/or as a process, allows it to be consolidated a set of actions established from explicit and implicit rules.

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Hexokinase 2 (Hxk2) of Saccharomyces cerevisiae is a dual function hexokinase, acting as a glycolytic enzyme and being involved in the transcriptional regulation of glucose-repressible genes. Relief from glucose repression is accompanied by phosphorylation of Hxk2 at serine 15, which has been attributed to the protein kinase Tda1. To explore the role of Tda1 beyond Hxk2 phosphorylation, the proteomic consequences of TDA1 deficiency were investigated by difference gel electrophoresis (2D-DIGE) comparing a wild type and a Δtda1 deletion mutant. To additionally address possible consequences of glucose repression/derepression, both were grown at 2% and 0.1% (w/v) glucose. A total of eight protein spots exhibiting a minimum twofold enhanced or reduced fluorescence upon TDA1 deficiency was detected and identified by mass spectrometry. Among the spot identities are—besides the expected Hxk2—two proteoforms of hexokinase 1 (Hxk1). Targeted proteomics analyses in conjunction with 2D-DIGE demonstrated that TDA1 is indispensable for Hxk2 and Hxk1 phosphorylation at serine 15. Thirty-six glucose-concentration-dependent protein spots were identified. A simple method to improve spot quantification, approximating spots as rotationally symmetric solids, is presented along with new data on the quantities of Hxk1 and Hxk2 and their serine 15 phosphorylated forms at high and low glucose growth conditions. The Δtda1 deletion mutant exhibited no altered growth under high or low glucose conditions or on alternative carbon sources. Also, invertase activity, serving as a reporter for glucose derepression, was not significantly altered. Instead, an involvement of Tda1 in oxidative stress response is suggested.