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Análises genéticas de carcaças de atobá marrom, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), da região centro-norte do Estado do Rio de Janeiro / Genetic analysis of carcasses of brown booby, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), from the North-Central region of Rio de Janeiro State

Rafaela Magalhães Aires 28 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A região da Bacia de Campos está exposta a diversas atividades antrópicas, que interferem diretamente no funcionamento do ecossistêmico marinho. O estudo da fauna marinha na costa centro-norte fluminense mostra grande relevância, diversas aves marinhas residem ou passam grande parte de seu período migratório ao longo da Bacia de Campos, entre elas está Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Embora essas aves sejam altamente móveis, suas populações apresentam uma estrutura populacional genética robusta. Com o intuito de verificar a estruturação e as relações evolutivas da população de Sula leucogaster na Bacia de Campos foram recolhidas 91 amostras de encalhe e os dados gerados para esta região foram comparados com dados já publicados de outras bacias oceânicas. A partir da região controle do DNA mitocondrial foram gerados 26 haplótipos, todos exclusivos da Bacia de Campos, muitos raros e apenas oito possuíram frequência comum. As análises mostraram que a população da Bacia de Campos é um estoque genético de Sula leucogaster. Tal fato pode ser atribuído ao comportamento filopátrico e ao hábito costeiro dessa espécie que impede o fluxo gênico entre populações. Além disso, a população da Bacia de Campos detém baixa variabilidade genética e possivelmente está sofrendo efeito gargalo ou seleção purificadora, corroborados por valores do teste Fu, o que é comum para espécies que se dividem em subpopulações. Os dados filogenéticos demonstram um contato recente entre as populações da Bacia de Campos e da ilha de Ascensão. As condições oceanográficas também têm influência na estruturação de populações de Sula leucogaster, visto que a ausência de barreiras e a proximidade geográfica poderiam favorecer contato secundário com o Mar do Caribe, fato não evidenciado nas análises. Sendo assim, a divergência de populações nessa espécie e a baixa variabilidade genética são fatores preocupantes para a manutenção da população de atobás marrons em uma área de grande impacto ambiental / The region of Campos Basin is exposed to various anthropogenic activities that affect directly the behavior of marine ecosystem. The study of marine fauna in North-Central coast of Rio de Janeiro is of great importance, several marine and coastal birds live or spend most of their migratory period along the Campos Basin, between them is Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Although these birds are highly mobile, their populations have a robust genetic population structure. In order to check the structure and evolutionary relationships of the population of Sula leucogaster in the Campos Basin, 91 stranding samples were collected, and the data of this region were compared with the published data. From the control region of mitochondrial DNA, 26 haplotypes were identified, all of them being unique to the Campos Basin. Most of these haplotypes were rare, only eight have common frequencies. The analyses show that the population of the Campos Basin is a genetic stock of Sula leucogaster. This fact can be attributed to the filopatric behavior and coastal habit of this species that prevents the gene flow between populations. Moreover, the population of the Campos Basin has low genetic variability and is possibly suffering a bottleneck effect or purifying selection, supported by Fu test values, which is common for species divided into subpopulations. The phylogenetic data demonstrates a recent contact between the populations of the Campos Basin and Ascensão island. The oceanographic conditions also influence the structuring of populations of Sula leucogaster populations, as the absence of barriers and geographical proximity could favor secondary contact with the Caribbean Sea, which was not evident in the analyzes. Thus, the low amount of gene flow and the low genetic variability are worrying factors for the maintenance of the population of brown boobies in this area of high environmental impact
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Análises genéticas de carcaças de atobá marrom, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), da região centro-norte do Estado do Rio de Janeiro / Genetic analysis of carcasses of brown booby, Sula leucogaster (Boddaert, 1783), from the North-Central region of Rio de Janeiro State

Rafaela Magalhães Aires 28 February 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A região da Bacia de Campos está exposta a diversas atividades antrópicas, que interferem diretamente no funcionamento do ecossistêmico marinho. O estudo da fauna marinha na costa centro-norte fluminense mostra grande relevância, diversas aves marinhas residem ou passam grande parte de seu período migratório ao longo da Bacia de Campos, entre elas está Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Embora essas aves sejam altamente móveis, suas populações apresentam uma estrutura populacional genética robusta. Com o intuito de verificar a estruturação e as relações evolutivas da população de Sula leucogaster na Bacia de Campos foram recolhidas 91 amostras de encalhe e os dados gerados para esta região foram comparados com dados já publicados de outras bacias oceânicas. A partir da região controle do DNA mitocondrial foram gerados 26 haplótipos, todos exclusivos da Bacia de Campos, muitos raros e apenas oito possuíram frequência comum. As análises mostraram que a população da Bacia de Campos é um estoque genético de Sula leucogaster. Tal fato pode ser atribuído ao comportamento filopátrico e ao hábito costeiro dessa espécie que impede o fluxo gênico entre populações. Além disso, a população da Bacia de Campos detém baixa variabilidade genética e possivelmente está sofrendo efeito gargalo ou seleção purificadora, corroborados por valores do teste Fu, o que é comum para espécies que se dividem em subpopulações. Os dados filogenéticos demonstram um contato recente entre as populações da Bacia de Campos e da ilha de Ascensão. As condições oceanográficas também têm influência na estruturação de populações de Sula leucogaster, visto que a ausência de barreiras e a proximidade geográfica poderiam favorecer contato secundário com o Mar do Caribe, fato não evidenciado nas análises. Sendo assim, a divergência de populações nessa espécie e a baixa variabilidade genética são fatores preocupantes para a manutenção da população de atobás marrons em uma área de grande impacto ambiental / The region of Campos Basin is exposed to various anthropogenic activities that affect directly the behavior of marine ecosystem. The study of marine fauna in North-Central coast of Rio de Janeiro is of great importance, several marine and coastal birds live or spend most of their migratory period along the Campos Basin, between them is Sula leucogaster (Boddaert, 1783). Although these birds are highly mobile, their populations have a robust genetic population structure. In order to check the structure and evolutionary relationships of the population of Sula leucogaster in the Campos Basin, 91 stranding samples were collected, and the data of this region were compared with the published data. From the control region of mitochondrial DNA, 26 haplotypes were identified, all of them being unique to the Campos Basin. Most of these haplotypes were rare, only eight have common frequencies. The analyses show that the population of the Campos Basin is a genetic stock of Sula leucogaster. This fact can be attributed to the filopatric behavior and coastal habit of this species that prevents the gene flow between populations. Moreover, the population of the Campos Basin has low genetic variability and is possibly suffering a bottleneck effect or purifying selection, supported by Fu test values, which is common for species divided into subpopulations. The phylogenetic data demonstrates a recent contact between the populations of the Campos Basin and Ascensão island. The oceanographic conditions also influence the structuring of populations of Sula leucogaster populations, as the absence of barriers and geographical proximity could favor secondary contact with the Caribbean Sea, which was not evident in the analyzes. Thus, the low amount of gene flow and the low genetic variability are worrying factors for the maintenance of the population of brown boobies in this area of high environmental impact
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Concentração de metais no sangue e em penas de petréis do gênero Porcellanaria

Carvalho, Paloma Calábria January 2012 (has links)
Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós-Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2012. / Submitted by Cristiane Gomides (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-10-16T12:22:26Z No. of bitstreams: 1 Paloma.pdf: 489250 bytes, checksum: 19c1a510804e4f596b4c389dc55d9d48 (MD5) / Approved for entry into archive by Sabrina Andrade (sabrinabeatriz@ibest.com.br) on 2013-10-17T17:52:48Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Paloma.pdf: 489250 bytes, checksum: 19c1a510804e4f596b4c389dc55d9d48 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-17T17:52:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paloma.pdf: 489250 bytes, checksum: 19c1a510804e4f596b4c389dc55d9d48 (MD5) Previous issue date: 2012 / No presente estudo, indivíduos de duas espécies irmãs de petréis do gênero (P.conspicillata e P.aequinoctialis) foram avaliados para verificar possíveis diferenças nas concentrações de metais essenciais (Cu e Zn) e não: essenciais (Cd, Pb e Hg) em espécies filogeneticamente próximas, porém com nichos ecológicos distintos. Na invernagem, estas espécies são simpátricas em algumas áreas, com valores semelhantes de isótopos estáveis de nitrogênio (δ15N) e carbono (δ13C) no sangue, indicando que estas se encontram em um mesmo nível trófico e que possuem alimentação semelhante durante este período. No entanto, P.aequinoctialis apresentou maior variação individual, com valores isotópicos menores em indivíduos oriundos da região Antártica. Não houve correlações entre os valores de isótopos estáveis e a concentração de metais no sangue das duas espécies analisadas, porém, foi detectada diferença na concentração de Hg no sangue e nas penas, bem como de Cu e Zn nas penas, entre as duas espécies. Para ambas as espécies, todos os metais apresentaram menores concentrações no sangue que nas penas, exceto o Hg em P.aequinoctialis. Nas penas, a concentração de Hg foi dez vezes maior em P.conspicillata do que em P.aequinoctialis. E, além de distinguir as duas espécies, a concentração de Hg também foi diferente entre indivíduos juvenis e adultos de P.aequinoctialis. Todos esses resultados indicam que o alimento utilizado no Oceano Atlântico Sul Ocidental, onde P.conspisillata se distribui durante todo o ano e P.aequinoctialis forrageia durante o inverno, apresenta elevadas concentrações de Hg. / In the present study, specimens of two sister species from the genus (spectacled petrel P.conspicillata and white:chinned petrel P.aequinoctialis ) were evaluated to verify potential differences in the concentrations of essential (Cu and Zn) and non:essential (Cd, Pb and Hg) metals in phylogenetically closely: related species, but with distinct ecological niches. In wintering period, these species are sympatric in some areas, showing similar blood values of nitrogen (δ15N) and carbon (δ13C stable isotopes. This finding indicates that they are in the same trophic level and are feeding on similar food resources during this period. However, white: chinned petrel showed higher individual variation, with lower isotopic values in individuals from the Antarctic region. For both species, there were no correlations between blood values of stable isotopes and metal concentrations. However, there was a significant difference between species in Hg concentration in blood and feathers, as well as in Cu and Zn concentrations in feathers. For both species, all metals analyzed showed lower concentrations in blood than in feathers, except for Hg in white:chinned petrel.In feathers, Hg concentration was 10: fold higher in spectacled petrel than in white: chinned petrel. Besides to distinguish the two species, Hg was also different between juveniles and adults white: chinned petrels Taken altogether, these findings indicate that food consumed in the South Atlantic Ocean, where spectacled petrels occurs throughout the year and where white: chinned petrel forages in wintering period, has elevated concentrations of Hg.
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At-sea behaviour in marine birds : a life-history perspective

Shoji, Akiko January 2014 (has links)
Recent bio-logging technology and associated techniques have uncovered the distribution, behaviour, and phenology of marine predators at remote locations, providing us with insights of not only scientific merit, but also in terms of conservation and management. This thesis explores the at-sea behaviour of marine birds using field studies and ethoinformatic approaches by using multiple data loggers, focusing on four species of free-ranging seabirds breeding in the UK. Key findings and conclusions are: Extending travel distance in central place foragers in the wild is associated with higher prey quality as estimated by an indirect method based on dive profiles. This result is consistent with a prediction of optimal foraging theory, but my results show empirically that seabirds are able to increase reward with distance at the extended scale of the marine environment. Razorbills Alca torda are capable of adjusting their foraging behaviour in response to proximate environmental conditions. The potential mechanisms underlying this adaptive behaviour are independent of breeding stage, but the magnitude of flight orientation is scale-dependent. These results suggest that Razorbills are capable of optimising their foraging adaptively, possibly reading cues from the environment or conspecifics. Diving behaviour in sympatric Atlantic Puffins Fratercula arctica and Razorbills is very similar, in contrast to the predictions of the competitive exclusion principle. They are likely to be near carrying capacity for the location and this may explain why Skomer’s Razorbill population is declining while its puffin population is stable. Differences in foraging trip duration of chick-rearing Manx Shearwaters Puffinus puffinus reflect differences in resource allocation between provisioning offspring and self-feeding. I developed a model based on patch quality and travel time to show that birds should use bimodal foraging trip durations to optimise feeding rates for their offspring. Individual reproductive performance in Manx Shearwaters can be predicted from previous breeding phenology and is linked to differences in overwintering behaviour patterns. This carry-over effect reveals the existence of a trade-off between current parental investment and future reproductive performance.
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Investigação de enfermidades virais selecionadas em aves marinhas na costa Atlântica da América do Sul / Selected viral diseases survey in seabirds along the South American Atlantic Coast

Niemeyer, Claudia 18 December 2014 (has links)
Doenças infecciosas emergentes se caracterizam como enfermidades cujos patógenos evoluíram para uma nova cepa ou genótipo capaz de infectar tanto o mesmo hospedeiro quanto uma nova espécie. A ocorrência de doenças emergentes tem sido correlacionada à destruição de habitats e à perda de biodiversidade. As aves marinhas têm sido consideradas bons indicadores e sentinelas do ecossistema aquático, e uma ampla variedade de enfermidades virais têm sido investigadas e descritas em aves no mundo todo. A caracterização e o entendimento das enfermidades virais que acometem as aves marinhas que habitam a costa brasileira são de fundamental importância para a compreensão de possíveis surtos de mortalidade dentre outros fatores que interferem na conservação das aves em geral. O objetivo desta pesquisa foi investigar a ocorrência de herpesvírus, avipoxvírus e coronavírus nas espécies de aves marinhas que foram reabilitadas em três centros localizados ao longo da costa brasileira e nas colônias reprodutivas de Sula sp. e Phaeton sp. localizadas no arquipélago de Abrolhos, Bahia, Brasil, e em quatro colônias de Spheniscus magellanicus localizadas na Patagônia argentina. As análises virais foram realizadas pela técnica de PCR e RT-PCR e confirmadas pela reação de sequenciamento do amplicon identificado. Nos casos de óbito, as alterações histopatológicas foram identificadas por meio de análise microscópica. O estudo revelou a ocorrência dos três agentes virais identificados em centros de reabilitação no Brasil, além da ocorrência de herpesvírus nas populações de vida livre e ativas em seus sítios reprodutivos. Foram identificados quatro novos herpesvírus denominados: Magellanic penguin herpesvirus 1 (MagHV -1) causador de um surto de mortalidade associado a traqueíte necrótico-hemorrágica em pinguins de Magalhães em reabilitação; Magellanic penguin herpesvirus 2 (MagHV-2), identificado em pinguins de Magalhães aparentemente saudáveis nas colônias reprodutivas da Patagônia argentina; Sulid herpesvirus 1 (SuHV -1), identificado em atobás (Sula sp.) e grazinas (Phaeton sp.) nas colônias reprodutivas de Abrolhos e Thalassarchid herpesvirus 1 (ThHV -1), identificados em um albatroz de nariz amarelo (Thalassarche chlororhynchos) nas praias de Rio Grande, RS, Brasil. Também foram identificados: um novo avipox, denominado Brazilian penguinpox, causador de lesões cutâneas, esofágicas e respiratórias nos pinguins de Magalhães cutâneas, esofágicas e respiratórias nos pinguins de Magalhães em reabilitação em Santa Catarina e a identificação de dois Gammacoronavirus em três diferentes espécies assintomáticas que estavam em reabilitação em Santa Catarina e no Rio Grande do Sul. Os dados obtidos constituem uma base de informação útil para estudos futuros no campo da patologia, virologia, epidemiologia e dos impactos antrópicos na saúde das aves marinhas do cone sul. / Emerging infectious diseases are characterized as disease whose pathogens progressed to a new strain ar genotype capable of infecting the same host or a new species. The occurrence of emerging diseases has been correlated to the destruction of habitats and loss of biodiversity. Seabirds have been considered as good indicators and sentinels of aquatic ecosystem, and a wide variety of viral diseases have been investigated and described in birds worldwide. The characterization and understanding of viral diseases that affect seabirds that inhabit the Brazilian coast are of fundamental importance for the understanding of possible mortality outbreaks among other factors that influence the conservation of birds in general. The objective of this research was to investigate the occurrence of herpesvirus, coronavirus and avipoxvirus in seabird species that were rehabilitated in three centres located along the Brazilian coast and in breeding colonies of Sula sp. and Phaeton sp. located at the Abrolhos’s archipelago, Bahia, Brazil and four Spheniscus magellanicus's colonies located at Argentina's Patagonia. Viral analyzes were performed by PCR and RT-PCR and confirmed by sequencing the identified amplicon. In cases of death, the histopathological alterations were identified through optical microscopic analysis. The study revealed the occurrence of the three investigated viral agents in the Brazilian rehabilitation centres, besides the occurrence of herpesvirus in the freeliving and reproductive active seabird’s populations. Four new herpesvirus were identified and called: Magellanic penguin herpesvirus 1 (MagHV -I), causing a mortality outbreak associated with necrotic-hemorrhagic tracheitis in Magellanic penguins in rehabilitation process; Magellanic penguin herpesvirus 2 (MagHV-2), identified in apparently healthy breeding Magellanic penguins at the Argentinean Patagonia’s colonies; Sulid herpesvirus 1 (SuHV-l), identified in boobies (Sula sp.) and tropicalseabirds (Phaeton sp.) breeding colonies at Abrolhos Archipelago, and Thalassarchid herpesvirus 1 (ThHV -1), identified in a yellow nose albatross (Thalassarche chlororhynchos) that appeared on the beaches of Rio Grande, RS, Brazil. Were. also identified: a new avipox named Brazilian penguinpox causing cutaneous, esophagus and respiratory lesions in rehabilitation penguins at Santa Catarina and the identification of two Santa Catarina and the identification of two Gammacoronavirus in three different asymptomatic seabirds species that were undergoing rehabilitation in Santa Catarina and Rio Grande do Sul. The data provi de a useful information basis for further studies related to pathology, virology, epidemiology and human impacts on southern hemispheres seabirds’ health.
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Estudo do vírus Influenza em aves marinhas na região subantártica. / Study of Influenza vírus in seabirds of subantarctica region.

Seixas, Marina Maria Moraes de 07 October 2014 (has links)
Os vírus da influenza A (IA) provocam epidemias e pandemias em humanos. As aves selvagens são os reservatórios naturais desses vírus, dentre essas, as migratórias possuem um importante papel como transmissores da doença. A região subantártica abriga populações de aves marinhas, as quais reproduzem-se no verão austral formando colônias com milhares de aves, o que potencializa a importância do estudo do vírus IA em aves marinhas neste ambiente. Os objetivos deste trabalho foram analisar a presença do vírus IA em swabs orotraqueal e cloacal, e de anticorpos anti-IA em soro de aves marinhas da região subantártica, caracterizar molecularmente as amostras positivas, e conhecer mais a ecologia deste vírus. Foram coletadas amostras biológicas de pinguim-papua, pinguim-de-barbicha, pinguim-de-adelie, skua-subantártica, pomba-do-cabo, e petrel-gigante-do-sul, entre 2010-13, nas ilhas Elefante e Rei George. Das 615 amostras de swab, 13 foram positivas por One Step Real Time RT-PCR, e uma foi caracterizada como H6N8. Das 673 amostras de soro, 108 foram positivas por Ensaio Imonoenzimático competitivo (cELISA). O estudo contribuiu para o conhecimento do vírus IA na região e foram feitas recomendações para a prevenção a introdução de patógenos na Antártica. / Influenza A (IA) viruses cause epidemics and pandemics in humans. Wild birds are the natural reservoir of these viruses, among these, migratory ones have an important role as transmitters of disease. The subantarctic region is home to seabird populations, which breed in the austral summer forming colonies with thousands of birds, which enhances the importance of the study of AI viruses in waterfowl in this environment. The objectives of this study were to analyze the presence of IA virus in tracheal and cloacal swabs, and anti-IA antibodies in serum of seabirds from subantarctic region, molecular characterization of positive samples, and learn more about this virus ecology. Biological samples were collected of gentoo penguin, chinstrap penguin, adelie penguin, brown skua, cape petrel, and southern giant petrel, from Elephant and King George islands, between 2010-13.Of the 615 swab samples, 13 were positive by Real Time One Step RT-PCR, and one was characterized as H6N8. Of the 673 serum samples, 108 were positive by competitive enzyme-linked immunosorbent assay (cELISA). The study contributed to AI virus knowledge in the region and recommendations for preventing the introduction of pathogens in Antarctica were made.
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Flutuação temporal e a relação da amplitude de maré com as aves aquáticas da Laguna da Ilha Comprida, SP, Brasil / Temporal fluctuation and the relation of tidal amplitude with aquatic birds at laguna da Ilha Comprida, SP, Brazil

Delchiaro, Roberta Tonolli Chiavone 02 July 2012 (has links)
O objetivo deste trabalho foi estudar a composição da avifauna aquática, a diversidade, suas abundâncias, a variação mensal e sazonal das populações e entender a relação desses fatores com a variação de maré na Laguna da Ilha Comprida. Ocorreram 6193 indivíduos referentes a 54 espécies, a diversidade de acordo com o Índice de Shannon foi 2,7036. Não houve diferença estatística no número total de indivíduos entre os meses e estações. Já a riqueza variou, sendo o maior valor na primavera, explicada pela ocorrência de espécies visitantes do hemisfério norte durante a migração para o sul. Houve correlação negativa entre a riqueza de espécies, número de indivíduos e diversidade, com a oscilação da maré, pois conforme a maré diminuía, aumentava a área disponível para descanso e forrageio. A Família Ardeidae apresentou correlação negativa mais forte em relação à amplitude de maré ao ser comparada as Famílias Scolopacidae e Charadriidae. Este fato ocorreu pela presença de Egreta caerulea que depende da maré baixa para forragear. A Laguna é uma importante área para avifauna aquática utilizada para alimentação e descanso, principalmente na maré baixa, além de ponto de parada para aves costeiras na migração para o sul durante a primavera. / The objectives of this work was to study the composition of aquatic bird, its diversity, abundance, monthly and seasonal variation of the bird populations and understand the relation of these factors with tidal variation at Laguna da Ilha Comprida Island. We registered 6193 individuals of bird referring to 54 species, being that the Shannon diversity index was 2,7036. There were not statistics difference between total number of individuals, the months and seasons. However there was variation of the species richness, being the biggest valor in the spring, explained for the occurrence of visiting species of north hemisphere during the migration for the south. There were negative correlation enters the species richness, individual number and diversity with the tidal oscillation. Because when the tide was low, increase the area available for rest and foraging. The Ardeidae family presented stronger negative correlation in relation of tidal variation when comparative being the Families Scolopacidae and Charadriidae. This fact occurred for the presence of Egreta caerulea that depends on the low tide to foraging. The Laguna is an important aquatic area for bird, used for feeding and rest, during the low tide and stopover for coastal birds in the migration for the south during the spring
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Drivers of variation in the migration and foraging strategies of pelagic seabirds

Clay, Thomas Anthony January 2017 (has links)
The ability to move and forage efficiently plays a major role in determining the fate of individuals, and has important implications for population dynamics and ecosystem functioning. Migration is a particular type of movement strategy, whereby animals may travel remarkable distances in order to take advantage of seasonality in resource availability or to avoid arduous winter conditions; however, this can be at a cost in terms of increased mortality. Indeed, anthropogenic threats in non-breeding areas are a major cause of population declines and a better understanding of non-breeding spatial ecology is required in order to advance both ecological theory and conservation management. The recent development of animal tracking technologies, in particular light-based geolocation, has made it possible to track large-scale and long-term movements; however, there are still gaps in our knowledge, such as the links between migratory and reproductive performance, connectivity among populations and the ontogeny of migration strategies. In this thesis, I utilise multi-species and longitudinal datasets from albatrosses and petrels, some of the most mobile species on Earth, to explore the drivers of variation in movements, habitat use and foraging behaviour, and the implications for life history and conservation. In Chapter 1, I provide an overview of the key topics of this thesis. In Chapter 2, I provide quantitative recommendations of minimum sample sizes needed to track pelagic seabird migrations, using data from 10 species. In Chapter 3, I examine between- and within-population differences in the habitat preferences and distributions of albatrosses, including the relative roles of habitat specialization and intra-specific competition. In Chapter 4, I investigate the year-round movement and foraging strategies of petrels living in nutrient-poor environments. In Chapter 5, I examine potential links between foraging behaviour during the non-breeding season and reproductive senescence. In Chapter 6, I explore the ontogeny of foraging behaviour and foraging site fidelity in young albatrosses, shedding light on their “lost years” at sea. Finally, I conclude with a general discussion summarizing main findings and suggesting future work. Overall, my results highlight the complex relationships among individual traits, the environment, movements and foraging behaviour, and population dynamics across the lifespan of individuals, with implications for the conservation of this highly threatened group of species.
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Investigação de enfermidades virais selecionadas em aves marinhas na costa Atlântica da América do Sul / Selected viral diseases survey in seabirds along the South American Atlantic Coast

Claudia Niemeyer 18 December 2014 (has links)
Doenças infecciosas emergentes se caracterizam como enfermidades cujos patógenos evoluíram para uma nova cepa ou genótipo capaz de infectar tanto o mesmo hospedeiro quanto uma nova espécie. A ocorrência de doenças emergentes tem sido correlacionada à destruição de habitats e à perda de biodiversidade. As aves marinhas têm sido consideradas bons indicadores e sentinelas do ecossistema aquático, e uma ampla variedade de enfermidades virais têm sido investigadas e descritas em aves no mundo todo. A caracterização e o entendimento das enfermidades virais que acometem as aves marinhas que habitam a costa brasileira são de fundamental importância para a compreensão de possíveis surtos de mortalidade dentre outros fatores que interferem na conservação das aves em geral. O objetivo desta pesquisa foi investigar a ocorrência de herpesvírus, avipoxvírus e coronavírus nas espécies de aves marinhas que foram reabilitadas em três centros localizados ao longo da costa brasileira e nas colônias reprodutivas de Sula sp. e Phaeton sp. localizadas no arquipélago de Abrolhos, Bahia, Brasil, e em quatro colônias de Spheniscus magellanicus localizadas na Patagônia argentina. As análises virais foram realizadas pela técnica de PCR e RT-PCR e confirmadas pela reação de sequenciamento do amplicon identificado. Nos casos de óbito, as alterações histopatológicas foram identificadas por meio de análise microscópica. O estudo revelou a ocorrência dos três agentes virais identificados em centros de reabilitação no Brasil, além da ocorrência de herpesvírus nas populações de vida livre e ativas em seus sítios reprodutivos. Foram identificados quatro novos herpesvírus denominados: Magellanic penguin herpesvirus 1 (MagHV -1) causador de um surto de mortalidade associado a traqueíte necrótico-hemorrágica em pinguins de Magalhães em reabilitação; Magellanic penguin herpesvirus 2 (MagHV-2), identificado em pinguins de Magalhães aparentemente saudáveis nas colônias reprodutivas da Patagônia argentina; Sulid herpesvirus 1 (SuHV -1), identificado em atobás (Sula sp.) e grazinas (Phaeton sp.) nas colônias reprodutivas de Abrolhos e Thalassarchid herpesvirus 1 (ThHV -1), identificados em um albatroz de nariz amarelo (Thalassarche chlororhynchos) nas praias de Rio Grande, RS, Brasil. Também foram identificados: um novo avipox, denominado Brazilian penguinpox, causador de lesões cutâneas, esofágicas e respiratórias nos pinguins de Magalhães cutâneas, esofágicas e respiratórias nos pinguins de Magalhães em reabilitação em Santa Catarina e a identificação de dois Gammacoronavirus em três diferentes espécies assintomáticas que estavam em reabilitação em Santa Catarina e no Rio Grande do Sul. Os dados obtidos constituem uma base de informação útil para estudos futuros no campo da patologia, virologia, epidemiologia e dos impactos antrópicos na saúde das aves marinhas do cone sul. / Emerging infectious diseases are characterized as disease whose pathogens progressed to a new strain ar genotype capable of infecting the same host or a new species. The occurrence of emerging diseases has been correlated to the destruction of habitats and loss of biodiversity. Seabirds have been considered as good indicators and sentinels of aquatic ecosystem, and a wide variety of viral diseases have been investigated and described in birds worldwide. The characterization and understanding of viral diseases that affect seabirds that inhabit the Brazilian coast are of fundamental importance for the understanding of possible mortality outbreaks among other factors that influence the conservation of birds in general. The objective of this research was to investigate the occurrence of herpesvirus, coronavirus and avipoxvirus in seabird species that were rehabilitated in three centres located along the Brazilian coast and in breeding colonies of Sula sp. and Phaeton sp. located at the Abrolhos’s archipelago, Bahia, Brazil and four Spheniscus magellanicus's colonies located at Argentina's Patagonia. Viral analyzes were performed by PCR and RT-PCR and confirmed by sequencing the identified amplicon. In cases of death, the histopathological alterations were identified through optical microscopic analysis. The study revealed the occurrence of the three investigated viral agents in the Brazilian rehabilitation centres, besides the occurrence of herpesvirus in the freeliving and reproductive active seabird’s populations. Four new herpesvirus were identified and called: Magellanic penguin herpesvirus 1 (MagHV -I), causing a mortality outbreak associated with necrotic-hemorrhagic tracheitis in Magellanic penguins in rehabilitation process; Magellanic penguin herpesvirus 2 (MagHV-2), identified in apparently healthy breeding Magellanic penguins at the Argentinean Patagonia’s colonies; Sulid herpesvirus 1 (SuHV-l), identified in boobies (Sula sp.) and tropicalseabirds (Phaeton sp.) breeding colonies at Abrolhos Archipelago, and Thalassarchid herpesvirus 1 (ThHV -1), identified in a yellow nose albatross (Thalassarche chlororhynchos) that appeared on the beaches of Rio Grande, RS, Brazil. Were. also identified: a new avipox named Brazilian penguinpox causing cutaneous, esophagus and respiratory lesions in rehabilitation penguins at Santa Catarina and the identification of two Santa Catarina and the identification of two Gammacoronavirus in three different asymptomatic seabirds species that were undergoing rehabilitation in Santa Catarina and Rio Grande do Sul. The data provi de a useful information basis for further studies related to pathology, virology, epidemiology and human impacts on southern hemispheres seabirds’ health.
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Changing Oceanic Conditions on The Foraging Patterns of Cassin’s Auklets, Ptychoramphus aleuticusChanging Oceanic Conditions on The Foraging Patterns of Cassin’s Auklets, Ptychoramphus aleuticus

Flynn, Clare 01 January 2019 (has links)
Cassin’s auklet (Ptychoramphus aleuticus) reproductive success has been monitored on Southeast Farallon Island (SEFI) for the past 45 years. Their productivity has varied with oceanic conditions. The purpose of this study is to connect how oceanic conditions affect Cassin’s auklet foraging behaviors. The California Current System (CCS) can normally maintain high plankton productivity, and thus high seabird productivity, because of coastal upwelling. I hypothesized that lower upwelling and/or higher sea surface temperatures (SSTs) lead Cassin’s auklets to spend more time on intensive foraging behaviors such as flying and diving, and have less time to spend resting. I also hypothesized that they would dive more, dive deeper, and spend more time underwater in years of high SST and/or low upwelling. We deployed time depth recorders (TDRs) on 85 Cassin’s auklets on SEFI from 2008-2017 for a total of 268 foraging trips. We programmed the TDRs to record temperature and pressure every 5 seconds, and every 0.5 seconds when diving. I used the Pacific Fisheries Environmental Laboratory derived upwelling index (UI) from three months prior to the early chick-rearing season, and SST measured from SEFI during the days the TDRs were deployed. UI from three months prior and SST were not correlated. I found that in years with higher SSTs and in years with less upwelling, the Cassin’s auklets made deeper dives and stayed underwater longer. Neither higher SSTs nor lower UIs significantly affected the amount of time the auklets spent flying, diving, or resting. These results show that the physical conditions that drive the development of the California current food web influence they diving behavior of top predators.

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