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Flow fabric determination of two Mesoproterozoic midcontinent rift dike swarms, northeastern MinnesotaFein, Elizabeth May 16 January 2009 (has links)
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Implicações do polimorfismo genético de cyp1a1, gstm1 e gstt1 na suscetibilidade do carcinoma espinocelular da laringe / Implications of genetic polymorphism of CYP1A1, GSTM1 and GSTT1 in susceptibility of squamous cell carcinoma laryngealSilva Junior, Raimundo Lima da 30 May 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-05-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The larynx is a tubular organ of the aerodigestive tract whose main function is the production of
voice, in addition to tasks related to the protection of the lower airways and swallowing food. The
squamous cell carcinoma presents itself as a multifactorial disease and epigenetic being influenced by
environmental factors, behavioural and relate to the individual. Several polymorphic genes that
encode enzymes involved in the biotransformation of the carcinogens have been associated to the
development of cancer, especially in squamous cell carcinoma of head and neck. The CYP1A1m,
GSTM1 and GSTT1 genes which catalyzes the oxidation of PAHs in phenolic and epoxides products.
The purpose of this study was to evaluate the epidemiological data of patients diagnosed with
squamous cell carcinoma of the larynx from the Cancer Registry of Population basis of Goiânia and
from Association of Cancer Combat in Goiânia, analyzing data from 63 medical records followed in a
period of 6 year; establish the allelic profiles of the gene CYP1A1m, GSTM1 and GSTT1 in casecontrol
groups investigating the degrees of suscetibility of patients diagnosed with squamous cell
carcinoma (SCC) of the larynx, according to smoking and alcoholism habits. In total 112 samples
were evaluated, 63 from patients with SCC of the larynx and 49 patients in the control group. The
CEC of the larynx was about 3,5 times more frequent in men than in women. The rate of survival on
general was approximately 66% to 6 years. The smoking and ethilic habits associated have a
significantly lower survival. No significant differences were found in the staging analysis and
treatment of patients. Were found allelic frequencies of CYP1A1m1 of 52,4% (34/62) and 63,3%
(31/49) for the wild allele T and 44,4% (28/62) and 34,7% (18/49) for the mutant allele C. There were
no statistically significant associations between allelic variants and genotypic CYP1A1m1 with
squamous cell carcinoma of the larynx. Positive genotypic frequencies were observed for the genes
GSTM1 and GSTT1 of 41.3% (26/63) and 54.0% (34/63) to the patients with laryngeal cancer, and
49,0% (24/49) and 51,0% (25/49) for the control group, respectively. For the assessment of genotype
GSTM1 (null) and GSTT1 (null), the patients if the case group had 58,7% (37/63) and 46,0% (29/63)
of genotypes for GSTM1 null and GSTT1, while the patients in the control group showed 51,0%
(25/49) and 40,8% (20/49). There was no statistically significance in associations of genotypic
variants GSTM1 (null) and GSTT1 (null) with the larynx squamous cell carcinoma. In this context, an
experimental study was accomplished in the intention of evaluating the function of the genes Cyp and
Gst in the metabolism of the Cyclophosphamide. This study addressed the Cyclophosphamide
toxicological evaluation and analysis of the polymorphism of Cyp2a29 and Gstp1 BALB/c genes in
mice, correlating them with the toxicity of drugs through the assessment of organs commonly affected.
It was determinated the DL50 of the 474mg/kg. Subsequently, another 40 mice were used on the
assessment of the genetic polymorphism of genes Cyp2a29 and Gstp1. As for toxicity,
cyclophosphamide caused reduction in body weight at different doses and kidneys, spleen, liver, heart
and lungs. The animals that received a dose of 500mg/Kg died in 24 hours, three animals with a dose
of 250mg/Kg died the end of one week. The evaluation of toxicity showed changes of varying degrees
of congestion observed in the spleen, liver and heart. There were not found statistically significant
differences between the frequencies of allelic and genotypic to Cyp2a29 and Gstp1 in groups of
animals studied. This observation should be probably the characteristic line BALB/c are isogenic.
Studies that make the use se of tests of genetic suscetibility, epidemic evaluation, combined to the
evaluation anatomopathological they allow the study of the interaction genetic atmosphere and a
possible standardization of various chemotherapy protocols for treatment. / A laringe é um órgão tubular do trato aerodigestivo cuja principal função é a produção da voz, além de
funções relacionadas com a proteção das vias aéreas inferiores e deglutição alimentar. O carcinoma de
células escamosas (CEC) de laringe apresenta-se como uma doença multifatorial e epigenética sendo
influenciada por fatores ambientais, comportamentais e inerentes ao indivíduo. Vários genes
polimórficos que codificam enzimas envolvidas na biotransformação de carcinógenos têm sido
associados ao desenvolvimento de câncer, sobretudo no carcinoma espinocelular de cabeça e pescoço.
Os genes CYP1A1m1, GSTM1 e GSTT1 são fundamentais no processo de detoxificação de Poli -
Hidrocarbonetos Aromáticos (PHA) e de diversas moléculas endógenas, facilitando o seu metabolismo
e excreção. Os objetivos do presente estudo foram de avaliar os dados epidemiológicos de pacientes
diagnosticados com CEC da laringe do Registro de Câncer de Base Populacional de Goiânia (RCBP)
da Associação de Combate ao Câncer em Goiás (ACCG), analisando os dados de 63 prontuários
acompanhados num período de 6 anos; estabelecer os perfis alélicos dos genes CYP1A1m1, GSTM1
e GSTT1 em grupos caso-controle investigando os graus de suscetibilidade dos pacientes
diagnosticados com CEC de laringe, segundo hábitos tabagistas e etilistas. Ao total foram avaliadas
112 amostras, sendo 63 provenientes de pacientes com CEC da laringe e 49 de pacientes do grupo
controle. O CEC da laringe se mostrou cerca de 3,5 vezes mais freqüente em homens que em
mulheres. A taxa de sobrevida relativa geral foi de aproximadamente 66% para 6 anos. Os hábitos
tabagista e etilista concomitantes apresentam uma sobrevida consideravelmente menor. Foram
encontradas freqüências alélicas para CYP1A1m1 de 52,4% (34/62) e 63,3% (31/49) para o alelo
selvagem T e 44,4% (28/62) e 34,7% (18/49) para o alelo mutante C. Não foram encontradas
associações estatisticamente significativas das variantes alélicas e genotípicas CYP1A1m1 para o CEC
da laringe. Quanto aos genes GSTM1 e GSTT1 foram observadas freqüências genotípicas positivas
para os genes GSTM1 e GSTT1 de 41,3% (26/63) e 54,0% (34/63) para os pacientes com carcinomas
laríngeos, e de 49,0% (24/49) e 51,0% (25/49) para o grupo controle, respectivamente. Para a
avaliação do genótipo GSTM1 (nulo) e GSTT1 (nulo), os pacientes do grupo caso apresentaram 58,7%
(37/63) e 46,0% (29/63) de genótipos nulos para GSTM1 e GSTT1, enquanto que os pacientes do
grupo controle apresentaram 51,0% (25/49) e 40,8% (20/49). Não foram encontradas associações
estatisticamente significativas das variantes genotípicas GSTM1 (nulo) e GSTT1 (nulo) para o CEC da
laringe. Neste contexto, foi realizado um estudo experimental no intuito de avaliar o papel dos genes
Cyp e Gst no metabolismo da ciclofosfamida. Tal estudo abordou avaliações toxicológicas da
Ciclofosfamida e a análise do polimorfismo dos genes Cyp2a29 e Gstp1 em camundongos BALB/c e
correlacionando-os com a toxicidade da droga através da avaliação dos órgãos comumente afetados. A
DL50 da droga observada em 40 camundongos foi de 474mg/Kg. Posteriormente, outros 40
camundongos foram utilizados na avaliação do polimorfismo genético dos genes Cyp2a29 e Gstp1.
Quanto à toxicidade, a ciclofosfamida ocasionou redução da massa corporal nos rins, baço, fígado,
coração e pulmões. A avaliação da toxicidade demonstrou alterações de diferentes graus de congestão
observados no baço, fígado e coração. Não foram encontradas diferenças estatisticamente
significativas entre as freqüências alélicas e genotípicas de Cyp2a29 e Gstp1 nos grupos dos animais
estudados. Estudos que preconizem a utilização de testes toxicológicos combinados à avaliação
anatomopatológica e investigação da variabilidade genética permitem a padronização de protocolos de
tratamento de diversos quimioterápicos.
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Candida albicans versus Candida dubliniensis : identificação, virulência, perfil de suscetibilidade antifúngica e epidemiologia dos casos clínicos de candidose sistêmica diagnosticados em um hospital de Porto Alegre - RSMattei, Antonella Souza January 2013 (has links)
Essa tese teve como objetivo avaliar todos os casos de candidose sistêmica por Candida albicans identificadas através de kit comercial ID 32C® (bioMérieux), diagnosticados no Laboratório de Micologia da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre/RS, durante o período de 1999 a 2009, buscando identificar a prevalência de C. dubliniensis, bem como avaliar os fatores de virulência e diferença de perfil de suscetibilidade antifúngica entre os isolados clínicos. Foi realizado um levantamento clínico-epidemiológico dos casos incluídos no estudo, avaliando sexo, idade, manifestações clínicas, evolução, região proveniente do paciente, doença de base, condições predisponentes, utilização de corticóides e antibióticos e resposta ao tratamento recebido. Para a diferenciação das duas espécies utilizou-se testes fenotípicos (arranjo dos clamidosporos, teste de termotolerância, formação do tubo germinativo, crescimento em meio hipertônico e niger), molecular (espectrometria de massa) e genotípico (reação em cadeia da polimerase - PCR). Em adição, foi avaliada a eficácia do método de conservação das leveduras estocadas a -20ºC e comparamos quatro substratos (soro fresco, soro congelado, ágar e caldo Mueller-Hinton) para a prova do tubo germinativo. Determinou-se a produção da fosfolipase e proteinase em isolados incluídos no estudo. A atividade in vitro dos antifúngicos fluconazol, anfotericina B e anidulafungina frente aos isolados estudados foi determinada através da concentração inibitória mínima (CIM), a concentração fungicida mínima (CFM) e ponto de corte epidemiológico (ECV). Os casos de candidemia por C. albicans diagnosticados durante 10 anos ocorreram com maior frequência em pacientes adultos com presença de cateteres. Observamos que houve maior chance de ocorrência desta em pacientes oncológicos. O percentual de alta nos pacientes foi baixo. O método utilizado para a conservação de leveduras nesse estudo apresentou taxa de 70% de viabilidade. O ágar e o caldo Mueller-Hinton demonstraram sensibilidade de 90% e especificidade de 100%. Os isolados de C. albicans provenientes de hemocultivos apresentaram produção de fosfolipase em 78% e proteinase em 97% dos isolados. A espécie C. dubliniensis não foi identificada em isolados de hemocultivos, sendo todos os casos de candidemia por C. albicans. Os testes microcultivo em ágar fubá, espectrometria de massa, caldo niger e caldo hipertônico concordaram com o teste genotípico. Os isolados de C. albicans apresentaram maior suscetibilidade a anidulafungina, entretanto, os menores valores obtidos em 90% dos isolados (CIM90) foi pela anfotericina B. E através do ECV, os isolados poderiam ser resistentes ao fluconazol, demonstrando a importância da associação desses dois parâmetros. / The aim this tesis was to evaluate systemic candidiasis cases by Candida albicans through ID 32C® (bioMérieux), at Mycology Laboratory of the Santa Casa de Porto Alegre/RS, during 1999 to 2009, seeking to identify the C. dubliniensis prevalence, as well as evaluating the virulence factors and antifungal susceptibility profile difference of among isolates. The clinical and epidemiological survey was made through gender, age, clinical manifestations, evolution, patient's region, underlying disease, predisposing conditions, steroids and antibiotics use, and response to treatment. The phenotypic tests (tthermotolerance, germ tube, hypertonic and Niger medium), molecular (mass spectrometry) and genotypic (polymerase chain reaction – PCR) was used for two species identification. We also assessed if the mantainance of C. albicans stored at - 20ºC in a freezer with sterile distilled water was usefull.The four substrate (fresh and frozen serum, agar and broth Mueller-Hinton®) were used for germ tube formation and the phospholipase and proteinase activity were evaluated. The in vitro activity of fluconazole, amphotericin B and anidulafungin were compared through the minimum inhibitory concentration (MIC), the minimum fungicidal concentration (MFC) and epidemiological cutoff value (ECV). The candidemia cases by C. albicans for ten years occurred more frequently in adult and catheters use. We observed the more chance this occurrence in cancer patients. The survival percentage was low. The used method in the study for yeast stored had 70% of viability. The agar and broth Mueller-Hinton were 90% sensitivity and 100% specificity. The boodstream isolates of C. albicans produce virulence factors, such the germ tube production and hydrolytic enzymes (78% of phospholipase and 97% of protease) production. The C. dubliniensis was not identified in bloodstream isolates, thus all candidemia cases were by C. albicans. The mass spectrometry, cornmeal agar, Niger and hypertonic broth agreed with genotypic test. The isolates exhibited more susceptibility to anidulafungin, and 90% of them (MIC90) exhibited the lowest values against amphotericin B. Based on ECV and Pfaller classification, isolates could be resistant to fluconazole, demonstrating the importance of the combination of these parameters.
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Candida albicans versus Candida dubliniensis : identificação, virulência, perfil de suscetibilidade antifúngica e epidemiologia dos casos clínicos de candidose sistêmica diagnosticados em um hospital de Porto Alegre - RSMattei, Antonella Souza January 2013 (has links)
Essa tese teve como objetivo avaliar todos os casos de candidose sistêmica por Candida albicans identificadas através de kit comercial ID 32C® (bioMérieux), diagnosticados no Laboratório de Micologia da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre/RS, durante o período de 1999 a 2009, buscando identificar a prevalência de C. dubliniensis, bem como avaliar os fatores de virulência e diferença de perfil de suscetibilidade antifúngica entre os isolados clínicos. Foi realizado um levantamento clínico-epidemiológico dos casos incluídos no estudo, avaliando sexo, idade, manifestações clínicas, evolução, região proveniente do paciente, doença de base, condições predisponentes, utilização de corticóides e antibióticos e resposta ao tratamento recebido. Para a diferenciação das duas espécies utilizou-se testes fenotípicos (arranjo dos clamidosporos, teste de termotolerância, formação do tubo germinativo, crescimento em meio hipertônico e niger), molecular (espectrometria de massa) e genotípico (reação em cadeia da polimerase - PCR). Em adição, foi avaliada a eficácia do método de conservação das leveduras estocadas a -20ºC e comparamos quatro substratos (soro fresco, soro congelado, ágar e caldo Mueller-Hinton) para a prova do tubo germinativo. Determinou-se a produção da fosfolipase e proteinase em isolados incluídos no estudo. A atividade in vitro dos antifúngicos fluconazol, anfotericina B e anidulafungina frente aos isolados estudados foi determinada através da concentração inibitória mínima (CIM), a concentração fungicida mínima (CFM) e ponto de corte epidemiológico (ECV). Os casos de candidemia por C. albicans diagnosticados durante 10 anos ocorreram com maior frequência em pacientes adultos com presença de cateteres. Observamos que houve maior chance de ocorrência desta em pacientes oncológicos. O percentual de alta nos pacientes foi baixo. O método utilizado para a conservação de leveduras nesse estudo apresentou taxa de 70% de viabilidade. O ágar e o caldo Mueller-Hinton demonstraram sensibilidade de 90% e especificidade de 100%. Os isolados de C. albicans provenientes de hemocultivos apresentaram produção de fosfolipase em 78% e proteinase em 97% dos isolados. A espécie C. dubliniensis não foi identificada em isolados de hemocultivos, sendo todos os casos de candidemia por C. albicans. Os testes microcultivo em ágar fubá, espectrometria de massa, caldo niger e caldo hipertônico concordaram com o teste genotípico. Os isolados de C. albicans apresentaram maior suscetibilidade a anidulafungina, entretanto, os menores valores obtidos em 90% dos isolados (CIM90) foi pela anfotericina B. E através do ECV, os isolados poderiam ser resistentes ao fluconazol, demonstrando a importância da associação desses dois parâmetros. / The aim this tesis was to evaluate systemic candidiasis cases by Candida albicans through ID 32C® (bioMérieux), at Mycology Laboratory of the Santa Casa de Porto Alegre/RS, during 1999 to 2009, seeking to identify the C. dubliniensis prevalence, as well as evaluating the virulence factors and antifungal susceptibility profile difference of among isolates. The clinical and epidemiological survey was made through gender, age, clinical manifestations, evolution, patient's region, underlying disease, predisposing conditions, steroids and antibiotics use, and response to treatment. The phenotypic tests (tthermotolerance, germ tube, hypertonic and Niger medium), molecular (mass spectrometry) and genotypic (polymerase chain reaction – PCR) was used for two species identification. We also assessed if the mantainance of C. albicans stored at - 20ºC in a freezer with sterile distilled water was usefull.The four substrate (fresh and frozen serum, agar and broth Mueller-Hinton®) were used for germ tube formation and the phospholipase and proteinase activity were evaluated. The in vitro activity of fluconazole, amphotericin B and anidulafungin were compared through the minimum inhibitory concentration (MIC), the minimum fungicidal concentration (MFC) and epidemiological cutoff value (ECV). The candidemia cases by C. albicans for ten years occurred more frequently in adult and catheters use. We observed the more chance this occurrence in cancer patients. The survival percentage was low. The used method in the study for yeast stored had 70% of viability. The agar and broth Mueller-Hinton were 90% sensitivity and 100% specificity. The boodstream isolates of C. albicans produce virulence factors, such the germ tube production and hydrolytic enzymes (78% of phospholipase and 97% of protease) production. The C. dubliniensis was not identified in bloodstream isolates, thus all candidemia cases were by C. albicans. The mass spectrometry, cornmeal agar, Niger and hypertonic broth agreed with genotypic test. The isolates exhibited more susceptibility to anidulafungin, and 90% of them (MIC90) exhibited the lowest values against amphotericin B. Based on ECV and Pfaller classification, isolates could be resistant to fluconazole, demonstrating the importance of the combination of these parameters.
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Candida albicans versus Candida dubliniensis : identificação, virulência, perfil de suscetibilidade antifúngica e epidemiologia dos casos clínicos de candidose sistêmica diagnosticados em um hospital de Porto Alegre - RSMattei, Antonella Souza January 2013 (has links)
Essa tese teve como objetivo avaliar todos os casos de candidose sistêmica por Candida albicans identificadas através de kit comercial ID 32C® (bioMérieux), diagnosticados no Laboratório de Micologia da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre/RS, durante o período de 1999 a 2009, buscando identificar a prevalência de C. dubliniensis, bem como avaliar os fatores de virulência e diferença de perfil de suscetibilidade antifúngica entre os isolados clínicos. Foi realizado um levantamento clínico-epidemiológico dos casos incluídos no estudo, avaliando sexo, idade, manifestações clínicas, evolução, região proveniente do paciente, doença de base, condições predisponentes, utilização de corticóides e antibióticos e resposta ao tratamento recebido. Para a diferenciação das duas espécies utilizou-se testes fenotípicos (arranjo dos clamidosporos, teste de termotolerância, formação do tubo germinativo, crescimento em meio hipertônico e niger), molecular (espectrometria de massa) e genotípico (reação em cadeia da polimerase - PCR). Em adição, foi avaliada a eficácia do método de conservação das leveduras estocadas a -20ºC e comparamos quatro substratos (soro fresco, soro congelado, ágar e caldo Mueller-Hinton) para a prova do tubo germinativo. Determinou-se a produção da fosfolipase e proteinase em isolados incluídos no estudo. A atividade in vitro dos antifúngicos fluconazol, anfotericina B e anidulafungina frente aos isolados estudados foi determinada através da concentração inibitória mínima (CIM), a concentração fungicida mínima (CFM) e ponto de corte epidemiológico (ECV). Os casos de candidemia por C. albicans diagnosticados durante 10 anos ocorreram com maior frequência em pacientes adultos com presença de cateteres. Observamos que houve maior chance de ocorrência desta em pacientes oncológicos. O percentual de alta nos pacientes foi baixo. O método utilizado para a conservação de leveduras nesse estudo apresentou taxa de 70% de viabilidade. O ágar e o caldo Mueller-Hinton demonstraram sensibilidade de 90% e especificidade de 100%. Os isolados de C. albicans provenientes de hemocultivos apresentaram produção de fosfolipase em 78% e proteinase em 97% dos isolados. A espécie C. dubliniensis não foi identificada em isolados de hemocultivos, sendo todos os casos de candidemia por C. albicans. Os testes microcultivo em ágar fubá, espectrometria de massa, caldo niger e caldo hipertônico concordaram com o teste genotípico. Os isolados de C. albicans apresentaram maior suscetibilidade a anidulafungina, entretanto, os menores valores obtidos em 90% dos isolados (CIM90) foi pela anfotericina B. E através do ECV, os isolados poderiam ser resistentes ao fluconazol, demonstrando a importância da associação desses dois parâmetros. / The aim this tesis was to evaluate systemic candidiasis cases by Candida albicans through ID 32C® (bioMérieux), at Mycology Laboratory of the Santa Casa de Porto Alegre/RS, during 1999 to 2009, seeking to identify the C. dubliniensis prevalence, as well as evaluating the virulence factors and antifungal susceptibility profile difference of among isolates. The clinical and epidemiological survey was made through gender, age, clinical manifestations, evolution, patient's region, underlying disease, predisposing conditions, steroids and antibiotics use, and response to treatment. The phenotypic tests (tthermotolerance, germ tube, hypertonic and Niger medium), molecular (mass spectrometry) and genotypic (polymerase chain reaction – PCR) was used for two species identification. We also assessed if the mantainance of C. albicans stored at - 20ºC in a freezer with sterile distilled water was usefull.The four substrate (fresh and frozen serum, agar and broth Mueller-Hinton®) were used for germ tube formation and the phospholipase and proteinase activity were evaluated. The in vitro activity of fluconazole, amphotericin B and anidulafungin were compared through the minimum inhibitory concentration (MIC), the minimum fungicidal concentration (MFC) and epidemiological cutoff value (ECV). The candidemia cases by C. albicans for ten years occurred more frequently in adult and catheters use. We observed the more chance this occurrence in cancer patients. The survival percentage was low. The used method in the study for yeast stored had 70% of viability. The agar and broth Mueller-Hinton were 90% sensitivity and 100% specificity. The boodstream isolates of C. albicans produce virulence factors, such the germ tube production and hydrolytic enzymes (78% of phospholipase and 97% of protease) production. The C. dubliniensis was not identified in bloodstream isolates, thus all candidemia cases were by C. albicans. The mass spectrometry, cornmeal agar, Niger and hypertonic broth agreed with genotypic test. The isolates exhibited more susceptibility to anidulafungin, and 90% of them (MIC90) exhibited the lowest values against amphotericin B. Based on ECV and Pfaller classification, isolates could be resistant to fluconazole, demonstrating the importance of the combination of these parameters.
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