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Novel Insights in Structure and Mechanism of Escherichia coli TransketolaseRabe von Pappenheim, Fabian 23 May 2017 (has links)
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Développement de biocapteurs ampérométriques pour la détermination de l’activité de la transcétolase et pour la détection d’inhibiteurs de cette enzyme / Development of amperometric biosensors for the determination of the activity of transketolase and for the detection of inhibitors of this enzymeTouisni, Nadia 13 December 2013 (has links)
Depuis peu, des travaux ont montré que chez l’Homme, la transcétolase (TK, EC 2.2.1.1.) dont le cofacteur est la thiamine diphosphate (forme active de la vitamine B1), est une enzyme impliquée dans de nombreuses maladies telles que, le diabète, certains cancers, ou encore des maladies neurologiques, comme le syndrome de Wernicke-Korsakoff et la maladie d’Alzheimer. Pour des applications thérapeutiques, des inhibiteurs spécifiques de cette enzyme sont actuellement conçus et synthétisés dans les milieux académiques et industriels. Afin de déterminer l’activité de la TK (dans un but de diagnostic) d’une part, et de détecter des inhibiteurs potentiels de cette enzyme (dans un but thérapeutique) d’autre part, il est nécessaire de disposer de tests alliant rapidité, sensibilité et faible coût. Nous avons envisagé d’utiliser des biocapteurs ampérométriques qui combinent l’ensemble de ces avantages, et qui, de plus, n’ont jamais été mis en oeuvre avec la TK. Pour la détermination de l’activité des TK d’E. coli et humaine libres en solution, nous avons tout d’abord élaboré un premier biocapteur à galactose oxydase (GAOx, EC 1.1.3.9), dans lequel cette enzyme est immobilisée sur la laponite. Puis, dans le but de detecter des inhibiteurs de la TK, avec un système réutilisable, nous avons developpé un biocapteur à GAOx-TK d’E. coli, les deux enzymes étant co-immobilisées à la surface de l’électrode. Pour cela la TK a été immobilisée dans des Hydroxydes Doubles Lamellaires (HDL). Ce biocapteur bicouche et bi-enzymatique GAOx-TK, nous a permis d’évaluer l’effet d’inhibiteurs, tels que différents analogues du cofacteur et de substrats pris comme modèles. / Some recent studies have shown that human transketolase (TK, EC 2.2.1.1.), which thiamine diphosphate (active form of vitamin B1) is the cofactor, is involved in numerous disease such as diabete, some cancers and neurodegenerative diseases as Alzheimer’s disease and Wernicke-Korsakoff syndrome. For therapeutic purposes, TK inhibitors have been designed and synthesized in both academic and industrial fields. To determine TK activity (diagnostic) on the one hand, and to detect potential inhibitors of this enzyme (therapeutic) on the other hand, it is necessary to develop fast, sensitive and low cost assays. In this context, we designed some original amperometric biosensors that combine these advantages and were never studied with TK from now. We performed a first galactose oxidase (GAOx, EC 1.1.3.9) biosensor for E. coli and human TK activities detection. For that purpose, GAOx was immobilized on laponite matrix. Then, we designed a GAOx-TK biosensor by co-immobilization of GAOX and TK on the electrode surface that enabled the detection TK inhibitors with a reusable system. Thence, TK was immobilized in Layered Double Hydroxides (HDL). This bilayer and bi-enzymic biosensors, allowed us to determine the inhibitor potencies of several cofactors and substrates analogues as model compounds.
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Benzaldehyde Lyase From Pseudomonas Fluorescens Biovar I Mediated Biotransformation For The Synthesis Of Chiral Alpha Hydroxy KetonesHosrik, Birsu Semra 01 January 2010 (has links) (PDF)
Optically active & / #945 / -hydroxy ketones are important subunits of many biologically active compounds and indispensable synthons for asymmetric synthesis. Benzaldehyde Lyase from Pseudomonas fluorescens Biovar I is a novel ThDP-dependent enzyme that catalyzes the synthesis of benzoin type chiral & / #945 / -hydroxy ketones starting from both benzaldehyde and racemic benzoin derivatives. Benzaldehyde Lyase is the first example of enzymes in the literature which leads to a chemical resolution of enantiomers of benzoin derivatives through a C-C bond cleavage reaction.
Chiral 2-hydroxypropiophenone derivatives are formed by benzaldehyde lyase (BAL), catalyzing C-C bond formation after a selective C-C bond cleavage of a benzoin derivative accepted as a substrate. The enzyme uses only the (R)-benzoin derivatives as substrate for the formation of (R)-HPP derivatives and it is highly stereoselective. Thus, in the presence of the acetaldehyde as the acceptor aldehyde, the C-C bond cleavage of the benzoin molecule followed by the carboligation of the acetaldehyde to yield chiral 2-hydroxy propiophenone derivatives.
Given the racemic benzoin to the enzyme as the substrate in the presence of acetaldehyde, both the racemic resolution of the substrate, revealing the unreacted (S)-Benzoin and the formation of the corresponding R-HPP occur.
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Catalysis at the Interface- Elucidation of the Activation Process and Coupling of Catalysis and Compartmentalization of the Peripheral Membrane Protein Pyruvate Oxidase from Escherichia coliSitte, Astrid 24 April 2013 (has links)
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Structural and Funtional Studies on VitaminB1-Dependent Human and Bacterial Transketolases / Strukturelle und Funktionelle Untersuchungen an humaner und bakterieller, Vitamin B1-abhängiger TransketolaseLüdtke, Stefan 22 May 2012 (has links)
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