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ESTRUTURA GENÉTICA DE Tibouchina papyrus (Pau-papel) EM ÁREAS NATURAIS DE CAMPO RUPESTRE NO CERRADO.Silva, Sandra Pereira da 28 March 2008 (has links)
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Previous issue date: 2008-03-28 / (Genetic structure of Tibouchina papyrus (Pohl) Toledo (“pau-papel”) in natural
areas of Cerrado rupestrian fields). This paper has the aim describe the genetic
of variability of Tibouchina papyrus (Pohl) Toledo local populations, from the
regions of “Serra Dourada” and “Serra de Pirineus”, in Goiás State, Central
Brazil. The six RAPD primers generated a total of 147 loci, varying from 23 to
26 per primer. The hierarchical evaluation of genetic variability, performed using
an Analysis of Molecular Variance (AMOVA) considering the local populations
within the two regions (i.e., “Serra dos Pirineus” and “Serra Dourada”), showed
an estimate of overall diversity among populations equal to ST=0,3439. The
value of divergence between regions ( CT) was equal to 18,96%, so that the
variation among local populations within regions was equal to 15,43%.
Estimates of gene flow indicates a small number of migrants among local
populations per generation. Multivariate analyses (UPGMA and NMDS)
indicated that a relationship between genetic and geographical distances exists,
which was confirmed by a spatial pattern analysis using Mantel test (r = 0.71; P
< 0.015 with 1000 random permutations). Thus, this structure was originated
from a stochastic neutral model of population differentiation, in which drift within
populations is counteracted by short distance gene flow. Despite strong levels
of population structure (i.e., high divergence among populations within regions),
the diversity observed support the hypothesis that Tibouchina papyrus is a
facultative xenogamous species. For conservation ends of germplasm with
base in the preliminary results, it can be suggested the collection of seeds of
the most possible number of populations, and in the two appraised areas,
because each one contains a singular component of the total genetic variation. / (Estrutura genética de Tibouchina papyrus (Pohl) Toledo (pau-papel) em áreas
naturais de campo rupestre no Cerrado). O presente trabalho teve como
objetivo conhecer a variabilidade genética de populações de Tibouchina
papyrus (Pohl) Toledo, provenientes da região de Serra Dourada e Serra dos
Pirineus, no Estado de Goiás. Os seis iniciadores RAPD produziram um total
de 147 locos, variando entre 23 e 26 por iniciador. A avaliação hierárquica da
estruturação da variabilidade genética, realizada pela a AMOVA, considerando
a existência de duas regiões (Serra dos Pirineus e Serra Dourada) apresentou
uma estimativa de ST=0,3439. O valor do componente entre regiões ( CT) foi
igual a 18,96% e a variação entre populações dentro de regiões igual a
15,43%. As estimativas de fluxo gênico indicam a existência de uma baixa
proporção de migrantes entre populações. As análises multivariadas (UPGMA
e NMDS) indicam que existe uma relação entre distância genética e espaço
geográfico, hipótese esta que foi confirmada por uma análise de padrão
espacial utilizando o teste de Mantel (r = 0,71; P = 0,015 com 1000
permutações aleatórias). Os resultados indicam assim que esta estrutura tenha
se originado seguindo um modelo de diferenciação estocástica (neutro) entre
regiões e por um balanço entre fluxo gênico a curtas distâncias e deriva
genética nas populações dentro das regiões. Os valores de diversidade
genética obtidos apóiam a hipótese de que a espécie Tibouchina papyrus é
uma espécie xenógama facultativa. Para fins de conservação de germoplasma,
com base nestes resultados preliminares, pode-se sugerir a coleta de
sementes do maior número possível de populações, e nas duas regiões
avaliadas, pois cada uma contém um componente singular da variação
genética total.
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DIVERSIDADE E ESTRUTURA GENÉTICA DE Tibouchina papyrus (MELASTOMATACEAE) BASEADO EM REGIÕES NÃO CODIFICANTES DO DNA CLOROPLASTIDIALCastro, Thaís Guimarães de 09 July 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-07-09 / Tibouchina papyrus (Melastomataceae) is an endemic tree of cerrado rupestre,
restricted to Serra Dourada (SD) and Pirineus (SP), in Goiás, and Natividade (NT) in
Tocantins. This work s objective was to study the variability and genetic structure of T.
papyrus, based on the polymorphism of non-coding regions of chloroplast DNA. We
sampled 16 individuals in six subpopulations of T. papyrus in three localities of
occurrence. The individuals were sequenced for the intergenic regions psbA/trnH,
trnC/ycf6 and trnS/trnG, whose fragments were 268pb, 294pb and 580pb, respectively. For
the 96 individuals studied, we found 11 different haplotypes for the three sequenced
regions combined. Serra Dourada showed a higher genetic diversity (h = 0.837; = 0.0012
± 0.0008), followed by Pirineus (h = 0.762, = 0.0012 ± 0.0009) and Natividade (h =
0.591, = 0,0013 ± 0.0009). Network program analysis showed groups geographically
distinct, no sharing of haplotypes between localities, and the analysis of variance showed a
high differentiation between subpopulations (!ST = 0.684; p <0.001), with the largest
variation occurring between populations (68.39% AMOVA). There is no sign of recent
retraction in populations size followed by expansion (Tajima D and Mismatch
Distribution). Despite the high genetic diversity shown in this study, the populations of T.
papyrus probably are historically isolated and its expansion is restricted by the distribution
of favorable habitat, which represents a risk to long-term persistence of populations. / Tibouchina papyrus (Melastomataceae) é uma árvore endêmica de cerrado rupestre,
restrita às Serras Dourada (SD) e dos Pirineus (SP), em Goiás, e Natividade (NT) em
Tocantins. O presente trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade e estrutura
genética de T. papyrus, baseada no polimorfismo de regiões não codificantes do DNA de
cloroplasto. Foram amostrados 16 indivíduos em seis subpopulações de T. papyrus nas três
localidades de ocorrência da espécie. Os indivíduos foram sequenciados para as regiões
intergênicas psbA/trnH, trnC/ycf6 e trnS/trnG, cujos fragmentos apresentaram 268pb,
294pb e 580pb, respectivamente. Para os 96 indivíduos estudados, foram encontrados 11
diferentes haplótipos para as três regiões sequenciadas combinadas. Serra dourada
apresentou maior diversidade genética (h = 0,837; π = 0,0012 ± 0,0008), seguida de
Pirineus (h = 0,762, π = 0,0012 ± 0,0009) e Natividade (h = 0,591, π = 0,0013 ± 0,0009).
A análise no programa Network mostrou agrupamentos geograficamente distintos, sem
compartilhamento de haplótipos entre localidades, e a análise de variância mostrou uma
alta diferenciação entre as subpopulações (!ST = 0,684; p < 0,001), sendo que a maior
variação ocorre entre subpopulações (68.39%, AMOVA). Não há sinal de retração recente
no tamanho das subpopulações seguido por expansão (Tajima D e Mismatch Distribution).
Apesar da alta diversidade genética indicada neste trabalho, as subpopulações de T.
papyrus provavelmente estão isoladas historicamente e sua expansão é restrita pela
distribuição do habitat favorável o que representa um risco a persistência em longo prazo
das subpopulações.
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