Made available in DSpace on 2016-08-10T10:38:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 THAIS GUIMARAES DE CASTRO.pdf: 13614820 bytes, checksum: 32a8409344e14615a4b71779806ea4b9 (MD5) Previous issue date: 2010-07-09 / Tibouchina papyrus (Melastomataceae) is an endemic tree of cerrado rupestre, restricted to Serra Dourada (SD) and Pirineus (SP), in Goiás, and Natividade (NT) in Tocantins. This work s objective was to study the variability and genetic structure of T. papyrus, based on the polymorphism of non-coding regions of chloroplast DNA. We sampled 16 individuals in six subpopulations of T. papyrus in three localities of occurrence. The individuals were sequenced for the intergenic regions psbA/trnH, trnC/ycf6 and trnS/trnG, whose fragments were 268pb, 294pb and 580pb, respectively. For the 96 individuals studied, we found 11 different haplotypes for the three sequenced regions combined. Serra Dourada showed a higher genetic diversity (h = 0.837; = 0.0012 ± 0.0008), followed by Pirineus (h = 0.762, = 0.0012 ± 0.0009) and Natividade (h = 0.591, = 0,0013 ± 0.0009). Network program analysis showed groups geographically distinct, no sharing of haplotypes between localities, and the analysis of variance showed a high differentiation between subpopulations (!ST = 0.684; p <0.001), with the largest variation occurring between populations (68.39% AMOVA). There is no sign of recent retraction in populations size followed by expansion (Tajima D and Mismatch Distribution). Despite the high genetic diversity shown in this study, the populations of T. papyrus probably are historically isolated and its expansion is restricted by the distribution of favorable habitat, which represents a risk to long-term persistence of populations. / Tibouchina papyrus (Melastomataceae) é uma árvore endêmica de cerrado rupestre, restrita às Serras Dourada (SD) e dos Pirineus (SP), em Goiás, e Natividade (NT) em Tocantins. O presente trabalho teve como objetivo estudar a variabilidade e estrutura genética de T. papyrus, baseada no polimorfismo de regiões não codificantes do DNA de cloroplasto. Foram amostrados 16 indivíduos em seis subpopulações de T. papyrus nas três localidades de ocorrência da espécie. Os indivíduos foram sequenciados para as regiões intergênicas psbA/trnH, trnC/ycf6 e trnS/trnG, cujos fragmentos apresentaram 268pb, 294pb e 580pb, respectivamente. Para os 96 indivíduos estudados, foram encontrados 11 diferentes haplótipos para as três regiões sequenciadas combinadas. Serra dourada apresentou maior diversidade genética (h = 0,837; &#960; = 0,0012 ± 0,0008), seguida de Pirineus (h = 0,762, &#960; = 0,0012 ± 0,0009) e Natividade (h = 0,591, &#960; = 0,0013 ± 0,0009). A análise no programa Network mostrou agrupamentos geograficamente distintos, sem compartilhamento de haplótipos entre localidades, e a análise de variância mostrou uma alta diferenciação entre as subpopulações (!ST = 0,684; p < 0,001), sendo que a maior variação ocorre entre subpopulações (68.39%, AMOVA). Não há sinal de retração recente no tamanho das subpopulações seguido por expansão (Tajima D e Mismatch Distribution). Apesar da alta diversidade genética indicada neste trabalho, as subpopulações de T. papyrus provavelmente estão isoladas historicamente e sua expansão é restrita pela distribuição do habitat favorável o que representa um risco a persistência em longo prazo das subpopulações.

Made available in DSpace on 2014-07-29T16:21:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Jacqueline (final).pdf: 503234 bytes, checksum: cbbe7d056e9c71e1218bf7062ca9a262 (MD5) Previous issue date: 2011-02-25 / Tibouchina papyrus is a Melastomataceae endemic to the Cerrado. It has a disjunct distribution, restricted to campos rupestres . Therefore, it can be considered a model species, helping guide Cerrado endemic plant studies. Thus, this study aimed to characterize genetic variability in microsatellite regions of T. papyrus genome and use spatial statistical analysis methods to assess genetic diversity and structure in disjunct populations. Individuals were georeferenced and leaf samples were taken from the localities of Serra dos Pirineus (216), Serra Dourada (66) and Serra de Natividade (192). In order to obtain the genotypes, we used ten microsatellite loci that were developed for T. papyrus. The locus showed a mean of 3,4 alleles and a large number of private alleles was detected (19 in total) at the populations studied. Values (f) significant were observed for two populations, indicating that populations not are following the proportions expected by Hardy-Weinberg. The global &#61553; value is significant and equal to 0.712, showing a high differentiation among the three populations studied. Thus, the three populations of T. papyrus can be treated as three different ESUs. Spatial genetic structure was weak for two populations, with low levels of SP. The low SGS corroborates the hypothesis that wind-dispersed species present no SGS due to long distance gene flow because of seed dispersal. This is plausible for T. papyrus, which is a wind-dispersed species. Despite the low intra-population SGS found in two populations, based on the relationship between kinship and distance, significant positive values were observed for the some distance class, indicating higher values for the relationship between these individuals. The intercept of the correlogram for each population may indicate the minimum distance where it is more likely that sampled individuals are less similar, which is an information applicable for the management of T. papyrus populations. Based on genetic data, it was evident that the three T. papyrus populations must be preserved, because each one contains a number of unique genetic variability that is not shared between them. Thus, theoretically it is possible to maintain the evolutionary potential of this species and to avoid local extinction in only three regions where it occurs. / Tibouchina papyrus é uma Melastomataceae endêmica do Cerrado que possui distribuição disjunta e restrita aos campos rupestres, com essas características peculiares ela pode ser considerada modelo de espécie, auxiliando em estudos de outras plantas do Cerrado que exibem o mesmo conjunto de características. Neste sentido, o objetivo desse trabalho foi caracterizar a variabilidade genética existente em regiões microssatélites do genoma de T. papyrus e utilizar metodologias de análise estatística espacial para avaliar a diversidade e a estrutura genética nas três subpopulações disjuntas da espécie. Foram amostradas folhas e georreferenciados indivíduos nas Serras dos Pirineus (216) Serra Dourada (66) e Serra de Natividade (192). Para a obtenção dos genótipos foram utilizados dez locos microssatélites desenvolvidos para a espécie. Os dez locos produziram uma média de 3,4 alelos e foi detectado um grande número de alelos privados (19 no total) nas três subpopulações avaliadas. Foi observados valores de (f) significativos em duas subpopulações, indicando que estas subpopulações não estão seguindo as proporções esperadas para o equilíbrio de Hardy-Weinberg. O valor global de &#952; foi significativo e igual a 0,712, apresentando uma altíssima divergência genética entre as subpopulações. Sendo assim, as três subpopulações de T. papyrus podem ser tratadas como três diferentes ESUs. A estrutura genética espacial intrapopulacional apresentou-se fraca em duas subpopulações, com baixos níveis de SP. A existência de autocorrelação espacial pouco intensa corrobora com a hipótese de que espécies com dispersão pelo vento não exiba esta estrutura, em função do fluxo gênico causado pela dispersão de sementes em longas distâncias. Isso é plausível para T. papyrus, que apresenta dispersão por anemocoria. Apesar da fraca EGE intrapopulacional encontrada em duas subpopulações, baseado nos correlogramas de parentesco, foram observados valores positivos e significativos nas primeiras classes de distância, indicando um maior grau de parentesco entre esses indivíduos. O intercepto do correlograma para cada uma das subpopulações pode indicar o distanciamento mínimo onde é mais provável amostrar indivíduos menos semelhantes, que é uma informação relevante para o manejo das subpopulações da espécie T. papyrus. Com base nos dados genéticos obtidos ficou evidente que as três subpopulações da espécie T. papyrus devem ser conservadas, pois cada uma contém uma quantidade de variabilidade genética única que não é compartilhada entre elas. Sendo assim, teoricamente torna-se possível a manutenção do potencial evolutivo da espécie e evita a extinção local nas três únicas regiões de ocorrência natural da espécie.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:39:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Juliana Rosa Ramos.pdf: 17613343 bytes, checksum: 68ed1271f638431652b7a38e62ad7129 (MD5) Previous issue date: 2008-08-12 / O cerrado é um dos ecossistemas mais ricos do mundo em diversidade, possuindo um grande número de espécies endêmicas, como é o caso de Tibouchina papyrus. Entretanto, os estudos sobre essa grande riqueza ainda deixam a desejar. Por isso, tornase necessário a realização de estudos em todas as áreas da biologia das espécies, possibilitando planejamentos mais efetivos de conservação. Nesse contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar a repetibilidade de marcadores RAPD e caracterizar a variabilidade genética intrapopulacional de T. papyrus (pau-papel), com endemismo nos campos rupestres do cerrado. Para tanto, foram utilizados seis iniciadores RAPD e 207 plantas, distribuídas em três subpopulações. A análise de repetibilidade foi realizada utilizando-se a matriz contendo o total de locos produzidos, com base em um algoritmo de otimização (simulated annealing), para definir soluções que contemplassem o número mínimo de indivíduos que apresentassem todos os locos. Os indivíduos de uma das soluções foram escolhidos para a realização de uma nova PCR, para cada um dos iniciadores RAPD, produzindo uma nova matriz de dados binários, contendo somente os locos que repetiram. Os resultados mostraram que as subpopulações de T. papyrus (pau-papel) exibiram consideráveis níveis de variabilidade genética, tanto com base na matriz contendo o total de locos (176), quanto aquela com os locos RAPD com repetibilidade (147). De uma maneira geral, todos os parâmetros genéticos estimados, com base nas duas matrizes e com diferentes metodologias de análise se apresentaram muito semelhantes, exibindo uma média de 95% dos locos polimórficos, valores de diversidade média igual a 0,351e coeficiente de endogamia igual a 0,962. Além disso, foi possível verificar que existe uma elevada estruturação da variabilidade genética nessas subpopulações de T. papyrus (18%), uma vez que duas dessas subpopulações estão muito próximas geograficamente. A análise de repetibilidade indica que a técnica de RAPD, quando bem padronizada, permite a obtenção de resultados robustos, uma vez que a taxa de repetibilidade dos locos é relativamente alta, com 84% de reprodutibilidade. O índice de agregação (R), nas três subpopulações, menores que 1, indica que há uma distribuição em agregados das plantas de T. papyrus. O padrão espacial intrapopulacional da variabilidade genética, nas subpopulações, revelou a formação de patches de indivíduos geneticamente mais similares, gerado por um padrão de diferenciação de isolamento-por-distância ou stepping-stone. As diferenças nos tamanhos dos patches sugere que os processos de polinização e dispersão atuam ligeiramente diferente entre as subpopulações, produzindo padrões espaciaos similares, com escalas geográficas variáveis. Considerando as informações sobre a biologia reprodutiva da espécie, os valores elevados de endogamia podem ser explicados por um balanço entre autofecundação e fecundação cruzada entre indivíduos aparentados. Outro argumento que corrobora com essa argumentação é o fato dos frutos serem rompidos com facilidades (autocoria), seguido de uma dispersão secundária pelos ventos fortes (anemocoria) que ocorrem nessas regiões, gerando agrupados de indivíduos aparentados.