Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2014-12-22T12:42:57Z No. of bitstreams: 2 blenda_calazans_soares.pdf: 3676934 bytes, checksum: e52fe2d2fae270bbccbb7f61353a234c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2014-12-22T13:14:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 blenda_calazans_soares.pdf: 3676934 bytes, checksum: e52fe2d2fae270bbccbb7f61353a234c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2014-12-22T13:15:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 blenda_calazans_soares.pdf: 3676934 bytes, checksum: e52fe2d2fae270bbccbb7f61353a234c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-12-22T13:15:08Z (GMT). No. of bitstreams: 2 blenda_calazans_soares.pdf: 3676934 bytes, checksum: e52fe2d2fae270bbccbb7f61353a234c (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2014 / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / O objetivo do presente trabalho foi estimar os efeitos de popula??es, matrizes e do coeficiente de repetibilidade de vari?veis f?sicas e qu?micas em frutos de pequizeiro (Caryocar brasiliense Camb.) oriundos de duas popula??es. Coletaram-se frutos procedentes de 30 matrizes, de diferentes idades, em Curvelo e em S?o Gon?alo do Rio Preto, Minas Gerais, 15 matrizes de cada local, por tr?s anos. Foram avaliadas vari?veis f?sicas, massa total do fruto; massa do mesocarpo externo; n?mero de put?mens por fruto; massa total de put?mens; massa m?dia de put?mens; massa total de polpa e massa m?dia da polpa, e vari?veis qu?micas, lip?deos e prote?nas. Foi realizada a an?lise de vari?ncia conjunta com as matrizes comuns aos tr?s anos, 20 matrizes para as vari?veis f?sicas, nove de Curvelo e 11 de S?o Gon?alo do Rio Preto, e oito matrizes para as vari?veis qu?micas, quatro de cada local. Os efeitos de matrizes dentro das respectivas popula??es foram altamente significativos para todas as vari?veis estudadas, ao passo que os efeitos destas popula??es n?o o foram para nenhuma vari?vel. O coeficiente de repetibilidade variou muito entre as vari?veis estudadas e, em geral, o n?mero de medi??es necess?rias para se atingir uma determina??o (R2) de pelo menos 80% foi acima de dois. Infere-se, portanto, que a sele??o de matrizes superiores para as vari?veis em apre?o pode ser conduzida em uma ?nica popula??o, mas as avalia??es devem ser conduzidas mais de uma vez em cada matriz. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Produ??o Vegetal, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2014. / ABSTRACT The goal of this present paper is to estimate the effects of populations, mother trees and the repeatability coefficient of physical and chemical variables in pequi fruits (Caryocar brasiliense Camb.), originated from two populations. It was collected fruitage from 30 mother trees, of different ages, in Curvelo and S?o Gon?alo do Rio Preto, Minas Gerais, bein 15 mother trees from each place, during 3 years. It was evaluated the physical variables, total mass of the product, exterior mesocarp mass, number of putamens per fruit, total mass of the putamens, total and average mass of the pulp, and chemical variables, lipids and proteins. An joint variance analysis with the common mother trees in the 3 years was made, bein 20 mother trees for physical variables, 11 from S?o Gon?alo do Rio Preto and 9 from Curvelo; and 8 mother trees for chemical variables, 4 from each place. The effects of the mother trees inside the respective populations were highly significatives for all the variables checked, but the effects of those populations were not for any variable. The repeatability coefficient fluctuated a lot among the variables checked and, in general, the number of measurements necessary to reach a determination (R?) of at least 80% was higher than 2. It is implied, then, that the selection of superior mother trees considering the used variables in this work could be conducted in a single population, but the evaluations must be conducted more than once in each mother tree.

Orientador: Humberto Tonhati / Resumo: A espécie bubalina (Bubalus bubalis) é originária do continente Asiático e hoje encontra-se difundida mundialmente. Os criadores têm optado pela atividade leiteira nessa espécie, destinando a produção leiteira à elaboração de produtos lácteos. A espécie tem como atrativo econômico a alta produção de proteína e gorgura, que aliada a boa capacidade de produção leiteira, resulta em alto rendimento queijeiro. A crescente demanda pelos derivados do leite bubalino nos últimos anos incentivou os produtores a incrementarem a produção iniciando à seleção de animais superiores. O termo repetibilidade é uma estimativa que sugere que as produções anteriores podem ser utilizadas como indicadoras de produções futuras, auxiliando no descarte de fêmeas do rebanho. As estimativas de herdabilidade determina a resposta a seleção e a correlação genética nos informa como as características estão associadas em um nível genético, ambas as estimativas tendo impacto nas estimativas de tendência genética apresentados pelas características. Objetivou-se nesse estudo a avaliação dos parâmetros genéticos e dos progressos fenotípico e genético para produção total de leite truncada aos 305 dias (PL), de gordura (PTG) e de proteína (PTP), em 13 rebanhos que fazem parte do programa de controle leiteiro mantido pelo Departamento de Zootecnia da FCAV/UNESP. As análises foram realizadas considerando um modelo multicaracterística, cujos efeitos fixos considerados foram os grupos de contemporâneos (GC), formados ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Mestre

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-28T10:32:16Z No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 529153 bytes, checksum: 753576372a0b737add5fd421351a897a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-28T10:32:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 529153 bytes, checksum: 753576372a0b737add5fd421351a897a (MD5) Previous issue date: 2002-04-08 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Visando definir a melhor alternativa para avaliar o valor genético de indivíduos e progênies derivadas de cruzamentos de cafeeiros, assim como avaliar repetibilidade e performance genotípica do caráter produção de grãos, foram realizadas as seguintes análises biométricas: estimação de parâmetros genéticos, de ambiente e correlações; repetibilidade e performance genotípica do caráter produção de grãos; e avaliação de diferentes critérios de seleção. Foram estudadas progênies na geração F 3 , descendentes de cruzamentos entre o Híbrido de Timor com a variedade Catuaí, pertencentes ao programa de melhoramento genético da EPAMIG e UFV. Foram avaliadas em seis blocos casualizados, 28 progênies F 3 e a variedade Catuaí. Os dados de produção de grãos em anos individuais e combinação de anos, além de alguns caracteres vegetativos obtidos nas quatro colheitas iniciais, de 1997 a 2000, foram inicialmente analisados tomando as médias de parcelas. Considerando os tratamentos de efeito fixo, foi possível comparar as progênies entre si e em relação às testemunhas. Nas análises, cujo objetivo foi selecionar indivíduos superiores, os tratamentos foram admitidos de efeito aleatório. O conjunto de progênies avaliadas apresentou média de produção superior à das testemunhas, associada a grande variabilidade genética, sugerindo assim a possibilidade de se obter linhagens produtivas. Detectou-se variabilidade genética para caracteres vegetativos, indicando que, a partir do conjunto de progênies avaliadas, é possível obter linhagens que atendam a diferentes objetivos do melhoramento do cafeeiro. A seleção de indivíduos baseada na combinação da 2 a , 3 a e 4 a colheitas apresentou os maiores valores de repetibilidade de 0,48 e coeficiente de determinação de 73,55%, estimados pela técnica dos componentes principais baseada na matriz de correlações. Concluiu-se excluir das análises a primeira colheita, onde os genótipos não expressam integralmente seus potenciais. A performance genotípica mostrou resultados satisfatórios, quando avaliada pela estatística não paramétrica proposta por Linn e Binns (P i ) ponderada pelo coeficiente de variação residual, pois esta apresenta apenas um valor para análise e mostrou-se correlacionada com a produção. Considerando o desbalanceamento dos dados, os componentes de variância foram adequadamente estimados pelos processos da ANOVA, REML e ML. Além disso, um processo de estimação por meio da ANOVA aproximada também se mostrou adequado. A seleção combinada contemplou indivíduos de poucas progênies, o que pode causar estreitamento da base genética da população selecionada. A seleção entre e dentro, embora não tenha possibilitado selecionar alguns genótipos de alta produção, pertencentes a progênies intermediárias, mostrou-se mais balanceada que a seleção combinada. Porém, considera para seleção dentro de progênies apenas o valor fenotípico do indivíduo. A seleção baseada na estatística P i permitiu selecionar indivíduos pertencentes a diversas progênies, considerando apenas o valor fenotípico do indivíduo e a sua performance genotípica. / Aiming at the definition of a better alternative to evaluate the genetic value of the individuals and progenies derived from coffee plant crossings, as well as to evaluate the repeatability and genotypic performance of the coffee berry yield, the following biometrics analyses were performed: estimate of the genetic parameter, environmental parameter, and correlation; repeatability and genotypic performance of the trait coffee berry yield; and evaluation of different selection criteria. Studies were conducted concerning to F 3 generation progenies descending from crossings between the Timor hybrid with the 'Catuaí' variety and developed by the genetic improvement program of EPAMIG and UFV. Twenty-eight F 3 progenies and the 'Catuaí' variety were evaluated on a six randomized block experimental design. The data of the coffee berry yield in each year and the combination among the years, besides some vegetative traits obtained in four initial harvests (from 1997 to 2000) were initially analyzed by using the plot averages. Considering the fixed effect treatments, it was possible to compare the progenies to each other as well as in relation to the control. In those analyses aiming at the selection of superior individuals, the randomized effects were admitted for treatments. The appraised progenie group presented an average yield superior to that of the control, associated to high genetic variability, so suggesting the possibility to obtain productive lines. The genetic variability was detected for vegetative traits, thus indicating that from the group of the evaluated progenies it is possible to obtain lines satisfying to different objectives of coffee plant improvement. The selection of the individuals was based on combination of the 2 a , 3 a and 4 a harvests that presented the highest values for repeatability (0.48), estimated by the main component technique based on correlation matrix, while the determination coefficient was 73.55%. Considering that the genotypes do not integrally express their potentials, the first harvest was excluded. The genotypic performance showed satisfactory results, when evaluated by the non-parametric statistics proposed by Linn and Binns (P i ) weighed by xthe residual variation coefficient, since this statistics presents only a value for interpretation and was shown to be correlated with yield. Considering the unbalance of the data, the variance components were appropriately estimated by the processes ANOVA, REML and ML. In addition, a process for estimation through the approached ANOVA was also shown to be appropriate. The combined selection just contemplated the individuals of a few progenies, which might cause the narrowing of the genetic base in the selected population. Although the selection made among and inside progenies has not made possible to select some high production genotypes pertaining to the intermediate progenies, it was shown to be more balanced than the combined selection. However, it considers only the phenotypic value of the individual for selection inside progenies. The selection based on statistics P i allowed for selecting the individuals belonging to several progenies, by just considering the individual's phenotypic value and genotypic performance.

ALVES, Anderson Antônio Carvalho. Estudo genético – quantitativo do desempenho de ovinos da raça Santa Inês em exposições agropecuárias. 2015. 58 f. Dissertação (mestrado em zootecnia)- Universidade Federal do Ceará, Fortaleza-CE, 2015. / Submitted by Elineudson Ribeiro (elineudsonr@gmail.com) on 2016-04-05T20:26:51Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_aacalves.pdf: 1711854 bytes, checksum: 4ef192235f48cac5ffeabd28edbbe1f3 (MD5) / Approved for entry into archive by José Jairo Viana de Sousa (jairo@ufc.br) on 2016-05-24T23:05:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_aacalves.pdf: 1711854 bytes, checksum: 4ef192235f48cac5ffeabd28edbbe1f3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-24T23:05:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_aacalves.pdf: 1711854 bytes, checksum: 4ef192235f48cac5ffeabd28edbbe1f3 (MD5) Previous issue date: 2015 / The aim in this study was to evaluate the genetic nature of the ability of an animal to rank among the top three on age categories (HAB3) and its total score (PTO) on trial championships held in different agricultural fairs. Records belonging to the Brazilian Association of Santa Inês (ABSI) and related to fairs that occurred between the years 2012 and 2014 were used. We evaluated the HAB3 for animals between 4 and 36 months, divided into 16 categories according to their age, and the PTO, considering all individual championships performed during the agricultural fair, where the animals belonging until the 4th age category (4-8 months) competed in categories and in subsequent championships to define the Future Sheep Champion, and confirmed animals (over 8 months) competed for the top award of the Great Breed Champion. The final data files contained 3,180 placing records (HAB3) for 1,896 animals and 4,383 information on the obtained scores (PTO) for 2,170 animals. The pedigree file included 4,069 animals. Variance components were estimated fitting threshold and linear animal models for ABI3 and TS, respectively, by Bayesian analysis using the Gibbs sampler. The posterior means of heritability and repeatability were, respectively, 0.10 ± 0.07 and 0.57 ± 0.11 for HAB3 and 0.12 ± 0.04 and 0.31 ± 0.02 for PTO. Low heritability values reported for these traits reveal a strong influence of environment factors, such as the treatment offered to the animals. The repeatability values suggest high correlation between the animal classifications, implying that animals ranked in the top three in the categories of age, tend to have similar performance in subsequent competitions. However, for the total score, the observed performance has moderate confidence be repeated over time. We conclude that the selection and use of rams who achieved good performances in trial competitions feature no major guarantees that their offspring have the same capacity. / O objetivo no presente estudo foi avaliar a natureza genética da habilidade de um animal se classificar entre os três primeiros colocados em categorias de idade (HAB3) e de sua pontuação total obtida (PTO) em campeonatos de julgamento realizados em diferentes exposições agropecuárias. Foram utilizados dados pertencentes à Associação Brasileira de Santa Inês (ABSI), referentes a eventos ocorridos entre os anos de 2012 e 2014. Avaliou-se a HAB3 para animais entre 4 e 36 meses, distribuídos em 16 categorias, de acordo com sua idade, e a PTO, considerando-se todos os campeonatos individuais disputados durante a exposição, onde os animais pertencentes até a 4ª categoria de idade (4 a 8 meses) competiram dentro de categorias e em campeonatos subsequentes para definição do Campeão Ovino do Futuro, e animais confirmados (acima de 8 meses) disputaram a premiação máxima de Grande Campeão da Raça. Os arquivos finais continham 3.180 registros de classificação (HAB3) referentes a 1.896 animais e 4.383 informações referentes às pontuações obtidas (PTO) por 2.170 animais. O arquivo de genealogia incluiu 4069 animais. Os componentes de variância foram estimados em modelo animal de limiar para a característica HAB3 e linear para PTO, mediante análise bayesiana, utilizando-se o Amostrador de Gibbs. As médias a posteriori para a herdabilidade e repetibilidade foram, respectivamente, 0,10 ± 0,07 e 0,57 ± 0,11 para HAB3 e 0,12 ± 0,04 e 0,31 ± 0,02 para PTO. Os baixos valores de herdabilidade relatados para estas características revelam uma forte influência de fatores ambientais, tais como o tratamento oferecido a estes animais. Os valores estimados para repetibilidade sugerem correlação alta entre as classificações dos animais, o que implica que animais classificados entre os três primeiros colocados nas categorias de idade, tendem a ter desempenho semelhante em competições subsequentes. No entanto, para a pontuação total obtida, o desempenho observado apresenta moderada confiança de se repetir ao longo do tempo. Conclui-se que a seleção e o uso de reprodutores que obtiveram bons desempenhos em competições de julgamento não apresentam grandes garantias que seus filhos tenham a mesma capacidade.

Made available in DSpace on 2016-08-10T10:39:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Juliana Rosa Ramos.pdf: 17613343 bytes, checksum: 68ed1271f638431652b7a38e62ad7129 (MD5) Previous issue date: 2008-08-12 / O cerrado é um dos ecossistemas mais ricos do mundo em diversidade, possuindo um grande número de espécies endêmicas, como é o caso de Tibouchina papyrus. Entretanto, os estudos sobre essa grande riqueza ainda deixam a desejar. Por isso, tornase necessário a realização de estudos em todas as áreas da biologia das espécies, possibilitando planejamentos mais efetivos de conservação. Nesse contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar a repetibilidade de marcadores RAPD e caracterizar a variabilidade genética intrapopulacional de T. papyrus (pau-papel), com endemismo nos campos rupestres do cerrado. Para tanto, foram utilizados seis iniciadores RAPD e 207 plantas, distribuídas em três subpopulações. A análise de repetibilidade foi realizada utilizando-se a matriz contendo o total de locos produzidos, com base em um algoritmo de otimização (simulated annealing), para definir soluções que contemplassem o número mínimo de indivíduos que apresentassem todos os locos. Os indivíduos de uma das soluções foram escolhidos para a realização de uma nova PCR, para cada um dos iniciadores RAPD, produzindo uma nova matriz de dados binários, contendo somente os locos que repetiram. Os resultados mostraram que as subpopulações de T. papyrus (pau-papel) exibiram consideráveis níveis de variabilidade genética, tanto com base na matriz contendo o total de locos (176), quanto aquela com os locos RAPD com repetibilidade (147). De uma maneira geral, todos os parâmetros genéticos estimados, com base nas duas matrizes e com diferentes metodologias de análise se apresentaram muito semelhantes, exibindo uma média de 95% dos locos polimórficos, valores de diversidade média igual a 0,351e coeficiente de endogamia igual a 0,962. Além disso, foi possível verificar que existe uma elevada estruturação da variabilidade genética nessas subpopulações de T. papyrus (18%), uma vez que duas dessas subpopulações estão muito próximas geograficamente. A análise de repetibilidade indica que a técnica de RAPD, quando bem padronizada, permite a obtenção de resultados robustos, uma vez que a taxa de repetibilidade dos locos é relativamente alta, com 84% de reprodutibilidade. O índice de agregação (R), nas três subpopulações, menores que 1, indica que há uma distribuição em agregados das plantas de T. papyrus. O padrão espacial intrapopulacional da variabilidade genética, nas subpopulações, revelou a formação de patches de indivíduos geneticamente mais similares, gerado por um padrão de diferenciação de isolamento-por-distância ou stepping-stone. As diferenças nos tamanhos dos patches sugere que os processos de polinização e dispersão atuam ligeiramente diferente entre as subpopulações, produzindo padrões espaciaos similares, com escalas geográficas variáveis. Considerando as informações sobre a biologia reprodutiva da espécie, os valores elevados de endogamia podem ser explicados por um balanço entre autofecundação e fecundação cruzada entre indivíduos aparentados. Outro argumento que corrobora com essa argumentação é o fato dos frutos serem rompidos com facilidades (autocoria), seguido de uma dispersão secundária pelos ventos fortes (anemocoria) que ocorrem nessas regiões, gerando agrupados de indivíduos aparentados.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-16T16:47:59Z No. of bitstreams: 1 Hudsonkleio da Costa Silva.pdf: 1360315 bytes, checksum: 496e932ecdd318656c26fc4681553375 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-16T16:48:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hudsonkleio da Costa Silva.pdf: 1360315 bytes, checksum: 496e932ecdd318656c26fc4681553375 (MD5) Previous issue date: 2012-06-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The sugarcane (Saccharum spp.) presents itself as a culture of great social and economic importance for Brazil. The breeding programs have contributed to increasing productivity in sugarcane areas of the country, due to the replacement and renewal of sugarcane, this increase amounted to thirty percent increases in the last three decades. However, the efficiency of the breeding programs of sugarcane depends on the spatial and temporal repeatability of traits under selection. Thus, assessment surveys genotype x environment interaction and repeatability of characters is crucial to the selection result in success. The objective of this study was to evaluate the behavior of agroindustrial genotypes sugarcane in all three cutting times and reliably determine the number of evaluations needed to select new genotypes based on their production components. The experiments were conducted: in Santa Teresa Mill (Goiana) in the years 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, evaluating 25 genotypes; in São José Mill (Igarassú) in the years 2005/2006, 2006/2007, 2007 / 2008 and 2008/2009, to evaluate the repeatability of characters in 16 genotypes, located on the northern coast of Pernambuco, both in a randomized block design, with plots consisting of five eight-meter grooves and spaced one meter. In each section were measured variables: ton of pol per hectare (TPH), ton of cane per hectare (TCH) pol in cane corrected (PCC), fiber (FIB), purity (PZA), soluble solids (° BRIX ) and total recoverable sugar (TRS). Data were subjected to analysis of variance, the group averages by testing Skott & Knott and repeatability of the experiment than those we used: ANAVA, principal component analysis (variance and covariance) and structural analysis. Based on the results of gross income, the best genotypes for beginning and middle of harvest were RB86 7515, RB92 579 and SP81 3250, to end of season highlight for genotypes RB86 7515, SP78 4764 and SP81 3250. To select new genotypes based on the coefficient of repeatability, methods of structural analysis and principal components were equivalent, and depending on the variable in the analysis and reliability stipulated, the number of assessments varied: for TPH and TCH were needed for reliability of 2 reviews 90% for FIB, PCC, PZA, BRIX and ATR were 3-4 consecutive assessments. / A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) apresenta-se como uma cultura de grande importância social e econômica para o Brasil. Os programas de melhoramento genético vêm contribuindo para o aumento da produtividade nas áreas canavieiras do país, graças à substituição e renovação dos canaviais, esse incremento atingiu aumentos de trinta por cento nas três últimas décadas. No entanto, a eficácia dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar depende da repetibilidade espacial e temporal dos caracteres sob seleção. Com isso, pesquisas de avaliação de interação genótipo x ambiente e repetibilidade de caracteres é de fundamental importância para a seleção resultar em sucesso. Objetivou-se com esse trabalho avaliar o comportamento agroindustrial de genótipos de cana-de-açúcar nas três épocas de corte e determinar com confiabilidade o número de avaliações necessárias para selecionar novos genótipos baseado em seus componentes de produção. Os experimentos foram instalados: na Usina Santa Teresa (Goiana) nos anos agrícolas 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, avaliando 25 genótipos; na Usina São José (Igarassú) nos anos agrícolas 2005/2006, 2006/2007, 2007/2008 e 2008/2009, avaliando-se a repetibilidade de caracteres em 16 genótipos, localizados no Litoral Norte de Pernambuco, ambos em delineamento experimental de blocos casualizados, com parcelas composta de cinco sulcos de oito metros e espaçadas de um metro. Em cada corte foram mensuradas as variáveis: tonelada de pol por hectare (TPH), tonelada de cana por hectare (TCH), pol na cana corrigido (PCC), fibra (FIB), pureza (PZA), teor de sólidos solúveis (ºBRIX) e açúcar total recuperável (ATR). Os dados foram submetidos à análise de variância conjunta, o agrupamento de médias através do teste de Skott & Knott e para o experimento de repetibilidade além desses utilizou-se: ANAVA, análise de componentes principais (variância e covariância) e análise estrutural. Com base nos resultados obtidos de renda bruta, os melhores genótipos para início e meio de safra foram RB867515, RB92579 e SP813250; para final de safra destaque para os genótipos RB867515, SP784764 e SP813250. Para selecionar novos genótipos baseado no coeficiente de repetibilidade, os métodos de componentes principais e análise estrutural se equivaleram, sendo que dependendo da variável em análise e da confiabilidade estipulada, o número de avaliações variou: para TPH e TCH foram necessárias 2 avaliações para confiabilidade de 90%, para FIB, PCC, PZA, BRIX e ATR foram de 3 a 4 avaliações consecutivas.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-04-24T17:27:26Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 344195 bytes, checksum: f00083004d6f88a28a8884775e1f79ba (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T17:27:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 344195 bytes, checksum: f00083004d6f88a28a8884775e1f79ba (MD5) Previous issue date: 1999-05-20 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Este trabalho teve como propósito a obtenção de um conjunto de informações genéticas, capazes de oferecer subsídios importantes para o adequado planejamento e execução de programas de melhoramento genético do café Conillon (Coffea canephora Pierre). Para isso, as seguintes análises biométricas foram realizadas: estimação de parâmetros genéticos e ambientais; correlações fenotípicas, genotípicas e de ambiente; repetibilidade do caráter produção de grãos; análise discriminante para classificação de genótipos; e análise da divergência genética, na qual foram utilizados diversos métodos multivariados. Utilizaram-se dados relativos a um conjunto de características, algumas das quais avaliadas em apenas uma repetição, obtidas a partir de um experimento conduzido em blocos ao acaso, com 80 tratamentos e quatro repetições, a partir do qual foi possível a obtenção das variedades EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 e EMCAPA 8131, as primeiras variedades clonais da espécie, obtidas e recomendadas no Brasil. As elevadas estimativas dos coeficientes de determinação genotípicos (H2) para todos os caracteres considerados nesta etapa, bem como a tendência dos valores obtidos nas estimativas das correlações genotípicas em superar, em magnitude, aqueles verificados nas correlações fenotípicas, indicam a predominância dos componentes de variação genéticos em relação aos ambientais. A seleção de indivíduos para o caráter produção de grãos, com base em quatro colheitas, ofereceu uma acurácia, estimada pelo coeficiente de determinação (R2), variando entre 65,32 e 81,59%, dependendo do método de estimação utilizado. A classificação original dos genótipos apresenta grande concordância com aquela obtida através da análise discriminante, com taxa de erro aparente de apenas 6,25%. Os genótipos ES 22, ES 25 e ES 92, pertencentes, respectivamente, às variedades EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 e EMCAPA 8131, mostraram-se como os mais divergentes do grupo, sendo os dois primeiros os mais indicados para programas de cruzamentos visando a obtenção de híbridos heteróticos, considerando-se conjuntamente a divergência genética e o desempenho individual destes. Verificou-se a existência de expressiva dissimilaridade genética entre os genótipos componentes de cada variedade clonal estudada, indicando a adequada composição destas, com clones distribuídos em vários grupos dissimilares. Foram discutidas as implicações destas e outras informações no estabelecimento de programas eficazes de melhoramento genético para a espécie. / Biometric analysis in conillon coffee (Coffea canephora Pierre). Adviser : Tocio Sediyama. Committee members: Cosme Damião Cruz and Ney Sussumu Sakiyama. The purpose of this paper is to obtain a set of genetic information, capable of offering important support to adequate planning and carrying out of conillon coffee (Coffea canephora Pierre) breeding programs. Thus , the following biometric analyses were accomplished: genetic and environmental parameter estimations; phenotypic, genotypical and environmental correlations; repeatability of the character grain production; discriminating analysis for genotype classification; and analysis of genetic divergence, in which different multivariated methods were used. Information was used related to a set of traits, some of which submitted to only one repetition, obtained from an experiment arranged in randomized block design, with 80 treatments and 4 repetitions, which made possible to obtain the varieties EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 and EMCAPA 8131.These were the first clonal varieties of the species, obtained and recommended in Brazil.The high estimates of the genotypical discriminating coefficient (H2) to all characters considered in this stage, as well as, the tendency of the values obtained in the genotypical correlation estimates, to overcome in magnitude, those verified in the phenotypical correlation, point out the predominance of the components of genetic variation in relation to those of enviromental variation. The selections of individual for the character grain production, based on 4 crops, presented an accuracy, estimated by the determination coefficient (R2), varying from 65.32 to 81.59%, depending on the estimation method used. The original classification of genotypes presents great agreement with that obtained through the discriminating analysis, with an apparent error ratio of only 6.25%. The genotypes ES 22, ES 35 and ES 92, belonging, respectively, to the varieties EMCAPA 8111, EMCAPA 8121 and EMCAPA 8131, showed to be the most divergent in the group,the first two being the most adequate for breeding programs to obtain hetereotic hybrids, also considering, the genetic divergence and their individual performance. Expressive genetic dissimilarity among the genotypic components of each clonal variety studied was observed, indicating their adequate composition, with clones distributed in various dissimilar groups. The implications of this and other information are dicussed related to the establishment of efficient breeding programs for the species.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8368_Tese Final João Felipe de Brites Senra20150914-93412.pdf: 793682 bytes, checksum: 4b0c0e4fa9a46d0ae2e7e1c4102106b4 (MD5) Previous issue date: 2015-02-19 / CAPES / A espécie Euterpe edulis Martius é nativa da Mata Atlântica e conhecida popularmente como palmeira juçara. Esta é uma espécie chave da Mata Atlântica, pois produz frutos que são consumidos por cerca de 30 espécies de aves e 13 espécies de mamíferos além de possuírem um grande potencial econômico para ser explorado na forma de polpa de fruta, doce e sovertes. Atualmente a palmeira juçara encontra-se na lista oficial das espécies ameaçadas de extinção no Brasil. Este trabalho teve por objetivos: estimar o coeficiente de repetibilidade e de determinação de características dos frutos e das sementes, analisar o número de medições para um nível de confiança de 95% e testar diferentes metodologias de estimação da repetibilidade; estudar a diversidade genética entre os acessos e avaliar o padrão de germinação das sementes via modelos não lineares Logístico, Gompertz, Von Bertalanffy e Will Bill; quantificar a diversidade genética interpopulacional da espécie baseada na correlação entre caracteres vegetativos e relacionados à produção de frutos. A coleta dos frutos da palmeira juçara foi realizada em 20 fragmentos florestais nos município da região Sul do estado do Espírito Santo: Alegre (oito fragmentos); Guaçuí (quatro fragmentos); Ibitirama (três fragmentos); Jerônimo Monteiro (um fragmento); Mimoso (três fragmentos); e Muqui (um fragmento). Para o estudo de repetibilidade foram utilizados 198 acessos, 25 frutos por planta, sendo avaliado: diâmetro longitudinal e equatorial do fruto e da semente (DLF, DLS, DEF e DES) em milímetros (mm); massa do fruto e da semente (MF e MS) em gramas (g). A deviance foi estimada pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML). Os coeficiente de repetibilidade e determinação e o número de medições necessárias foi realizado utilizando os métodos da REML, componentes principais via matriz de correlações e covariâncias e análise estrutural baseada nas matrizes de correlações e covariâncias. As estimativas dos coeficientes de repetibilidade e determinação de todas as variáveis analisadas são superiores a 0,78 e 98% respectivamente, para todas as metodologias testadas, realizando 25 medições. Para 95% de confiabilidade são necessárias 5 medições para as variáveis DLF, DEF, DLS, DES e MS e 4 medições para a variável MF. As metodologias utilizadas não diferem quanto à estimativa do coeficiente de repetibilidade para as variáveis DLF, DES, MF e MS, enquanto que para as demais variáveis as diferenças foram mínimas. Para a análise de identidade de modelos foram utilizados sementes de 45 acessos sendo avaliado: germinação; índice de velocidade de germinação; tempo médio de germinação; primeira contagem de germinação e a porcentagem de germinação. Com base nos dados quantitativos foi calculada a matriz de distância generalizada de Mahalanobis (D²) e posteriormente os acessos foram agrupados pelo método de otimização de Tocher formando quatro grupos. Em cada grupo a germinação foi analisada via regresão não linear utilizando os modelos de Logístico, Gompertz, Von Bertalanffy e Will Bill. O ajuste dos modelos foi avaliado pelo coeficiente de determinação (R²), quadrado médio do resíduo (QMR), desvio médio absoluto (DMA), critério de informação de Akaike (AIC) e critério de informação Bayesiano (BIC). O teste de identidade de modelos foi realizado pelo teste F. O modelo de Gompertz apresentou valores de β1, β2 e β3 intermediários aos demais modelos o que evita a sub ou super estimação destes parâmetros da regressão, além disso, este modelo apresenta os maiores valores de R2 e os menores valores do QMR, DMA, AIC e BIC sendo o mais indicado para descrever o padrão de germinação. O teste de identidade de modelos foi não significativo e desta forma uma única regressão não é eficiente para descrever o processo germinativo. Os grupos três e quatro possuem os maiores valores da TG indicando um maior vigor e para produção de mudas o tempo ideal para o transplantio seria de 30 dias para os grupos um, dois e quatro e 22 dias para o grupo três. Para o estudo de diversidade genética foram utilizados os dados dos frutos dos 198 acessos utilizados na análise de repetibilidade. Neste caso foram avaliados os caracteres: massa de cem frutos (MCF) e massa de cem sementes (MCS) em gramas; rendimento em polpa (RP) em porcentagem; diâmetro do caule a 1,5 m do solo (D1,5), diâmetro do caule a 1,0 m do solo (D1,0) e diâmetro do caule a 0,5 m do solo (D0,5) em milímetros; número de cachos (NC); comprimento do cacho (CC) em centímetros; número de ráquilas (NR); e altura até o cacho (AC) em metros. Com base nestes dados foi estimada a correlação genética, uma análise de componentes principais e análise de correspondência. A correlação genética entre os caracteres MCF x NR (0,44) é positiva. A característica NR é a principal determinante na variação da MCF e a seleção indireta poderá ser eficaz, dependendo de suas estimativas da herdabilidade. Os fragmentos GU3, AL4, JM1, MI1 e MQ1 oriundos de municípios diferentes são os que apresentam maior divergência genética interpopulacional entre os 20 fragmentos estudados. Os fragmentos GU2, GU3 e AL4 possuem indivíduos produtores de massa de cem frutos extragrandes (211,54 a 352,24 g) o que os tornam importantes fontes de seleção para utilização em programas de melhoramento genético da palmeira juçara visando a produção de polpa de fruta. / The species Euterpe edulis Martius is native to the Atlantic Forest and popularly known as jussara palm. It is a key species of the Atlantic Forest, producing fruits that are consumed by about 30 bird species and 13 mammal species, and also presenting great economic potential for exploitation of its fruit in the form of pulp, sweets and ice creams. Currently the jussara palm is on the official list of endangered species in Brazil. The objectives of this study were to: estimate the coefficient of repeatability and determination of the characteristics of fruits and seeds, analyze the number of measurements for a 95% confidence level and test different methods for estimation of repeatability, study the genetic diversity among accessions and evaluate the pattern of seed germination via the Logistic, Gompertz, von Bertalanffy and Will Bill nonlinear models, quantify the inter-population genetic diversity of the species based on the correlation between plant traits and related to fruit production. Collection of the jussara palm fruits was performed in 20 forest fragments in the following municipalities in the southern region of the state of Espírito Santo: Alegre (eight fragments), Guaçuí (four fragments), Ibitirama (three fragments), Jerônimo Monteiro (one fragment), Mimoso (three fragments) and Muqui (one fragment). For the study of repeatability 198 accessions were used, 25 fruits per plant, evaluating: longitudinal and equatorial diameter of the fruit and seed (DLF, DLS, DEF and DES) in millimeters (mm), and fruit and seed mass (MF and MS) in grams (g). Deviance was estimated by the restricted maximum likelihood (REML). The coefficient of repeatability and determination and the required number of measurements was determined using the REML methods, principal components via the correlation matrix, and covariances and structural analysis based on correlation and covariance matrices. Estimates of the repeatability coefficients and determination of all variables analyzed were greater than 0.78 and 98% respectively, for all tested methodologies, performing 25 measurements. For 95% reliability, 5 measurements are required for the variables DLF, DEF, DLS, DES and MS and 4 measurements for the variable MF. The methods used do not differ with respect to estimate of the repeatability coefficient for the variables DLF, DES, MF and MS, while for the other variables the differences were minimal. To analyze the identity of the models, seeds from 40 accessions were used to evaluate: germination, germination speed index, mean germination time, first germination count and the germination percentage. Based on the quantitative data the generalized Mahalanobis distance matrix (d²) was calculate and later accessions were clustered by the Tocher optimization method divided into four groups. In each group germination was analyzed via non-linear regression using the Logistic, Gompertz, von Bertalanffy and Will Bill models. Fit of the models was evaluated by the determination coefficient (R²), residual mean error (QMR), mean absolute deviation (MAD), Akaike information criterion (AIC) and Bayesian information criterion (BIC). The identity test of the models was performed by the F-test. The Gompertz model showed intermediary values of β1, β2 and β3 compared to other models which avoid under or over estimation of these regression parameters; in addition, this model presents the highest R 2 values and the lowest values of QMR, DMA, AIC and BIC, and is the most indicated to describe the pattern of germination. The identity test of the models was not significant and therefore a single regression is not efficient to describe the germination process. Groups three and four have the highest values of TG, indicating greater vigor, and for seedling production the ideal time for transplanting would be 30 days for groups one, two and 4, and 22 days for group three. For the study of genetic diversity, data from fruit of the 198 accessions utilized in the analysis of repeatability were used. In this case we evaluated the traits of: mass of one hundred fruits (MCF) and mass of one hundred seeds (MCS) in grams, pulp yield (RP) in percentage, stem diameter at 1.5 m above the ground (D1,5), stem diameter at 1.0 m above the ground (D1,0) and stem diameter at 0.5 m above the ground (D0,5) in millimeters, number of clusters (CN), cluster length (CC) in centimeters, number of rachilles (NR), and height of the cluster (AC) in meters. Based on these data the genetic correlation was estimated, and a principal components analysis and correspondence analysis were performed. Genetic correlation between the traits MCF x NR (0.44) is positive. The characteristic NR is the main determinant in variation of MCF and indirect selection can be effective, depending on estimates of heritability. The fragments GU3, AL4, JM1, MI1 and MQ1 from different municipalities are those that presented the greatest inter-population genetic divergence among the 20 fragments studied. The fragments GU2, GU3 and AL4 have exceptionally large individual producers regarding the mass of one hundred fruits (211.54 to 352.24 g) which make them important sources of selection for use in jussara palm breeding programs focused on the production of fruit pulp.

Submitted by Ricardo Faria (fariasky@gmail.com) on 2016-03-19T01:28:20Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_RICARDO_ANTONIO_DA_SILVA_FARIA.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Paula Grisoto (grisotoana@reitoria.unesp.br) on 2016-03-22T13:37:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 faria_ras_me_jabo.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-03-22T13:37:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 faria_ras_me_jabo.pdf: 1017582 bytes, checksum: 84a709da815cc0db9987696624f4e936 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A raça Quarto de Milha (QM) teve seus primeiros exemplares criados no Brasil em 1956, cujos pais foram importados dos Estados Unidos, com fundação da associação dos criadores em 1969, totalizando mais de 415 mil animais registrados e destes 45% são puros. A raça apresenta-se como versátil para trabalho, conformação e corrida, atributos que a tornam como de escolha entre os criadores e de maior população equina nacional. Apesar disto, poucos estudos foram realizados na raça, particularmente acerca da variabilidade genética. Os objetivos do estudo foram obter informações da estrutura populacional da raça QM no Brasil e estimar os parâmetros genéticos da característica Classe de Tempo (CT), relacionada com a performance em corridas de equinos em diferentes distâncias. O escore aplicado a CT, classifica os animais baseado na comparação percentual de tempo do vencedor de cada páreo. Os dados avaliados foram provenientes da Associação Brasileira de Criadores do Cavalo Quarto de Milha e do hipódromo do Jockey Clube de Sorocaba em São Paulo. A preparação da base de dados e estatística inicial foi realizada no programa SAS, os parâmetros populacionais com o programa ENDOG e os componentes de (co) variâncias e parâmetros genéticos com o programa THRGIBBS1F90. A característica CT foi estabelecida nas corridas com distância de 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) e 402 (CT420) metros e analisada por meio de modelo animal limiar. Os parâmetros populacionais obtidos foram 0,49% de endogamia, 0,29% de parentesco, 9,3 anos de intervalo gerações, a probabilidade de origem dos genes com valor igual a 333 de número efetivo de fundadores, a variabilidade genética total apresentou-se explicada por 7.254 ancestrais, com 161 ancestrais explicando 50%. As estimativas a posteriores da herdabilidade e da repetibilidade, obtidas em análise multicaracterística, foram de 0,52±0,04 e 0,85±0,04 (CT301), 0,48±0,06 e 0,97±0,01 (CT320), 0,56±0,04 e 0,88±0,06 (CT365) e 0,45±0,06 e 0,78±0,04 (CT420), respectivamente. Os valores obtidos indicam que a característica CT pode ser utilizada como critério de seleção e obter rápido ganho genético. A baixa variabilidade genética na raça Quarto de Milha foi evidenciada, sugerindo aos criadores inserção de reprodutores no rebanho. / The Quarter Horse (QH) had its first specimens bred in Brazil in 1956, whose parents were imported from the United States, with its breeder association founded in 1969, totaling more than 415,000 registered animals and of these 45% are purebred. The breed is versatile in what concerns performance, conformation and racing, attributes that make the QH the breed of choice among breeders and makes it the largest national equine population. In spite of that, few studies have been conducted about the breed, particularly on the genetic variability of strains. The aim of this study was to gather information about the population structure and estimate the genetic parameters of the trait class time (CT) related to performance in different QH racing distances, contributing with results that enable their use in the design of animal breeding programs aimed at maintaining the variability of the breed and decreasing race times. The score applied to CT, ranks animals based on comparing percentage winning time of each match. The analyzed data originates from the Brazilian Association of Breeders of Quarter Horse and Jockey Clube de Sorocaba’s hippodrome, in Sao Paulo. The preparation of the initial data and statistical base was done using SAS software, the population parameters with the ENDOG software and the (co) variances and genetic parameters components with the THRGIBBS1F90 software. The CT characteristic was established in racing with 301 (CT301), 320 (CT320), 365 (CT365) and 402 (CT420) meters distances and analyzed by threshold animal model. The obtained population parameters were 0.49% of inbreeding, 0.29% of kinship, 9.3-year generation interval, The probability of origin of genes with value 333 related to effective number of founders, the total genetic variability is explained by 7,254 ancestors, with 161 ancestors responsible for 50%. The estimates later heritability and repeatability obtained in multi-trait analysis were 0.52 ± 0.04 and 0.85 ± 0.04 (CT301), 0.48 ± 0.06 and 0.97 ± 0, 01 (CT320), 0.56 ± 0.04 and 0.88 ± 0.06 (CT365) and 0.45 ± 0.06 and 0.78 ± 0.04 (CT420), respectively. The values obtained indicate that CT feature can be used as selection criteria and obtain rapid genetic gain. The low genetic variability in the Quarter Horse breed was evidenced, suggesting to breeding insertion breeders in the herd.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 670022 bytes, checksum: 545da53bb28a3a29eb0f499873a94613 (MD5) Previous issue date: 2011-02-18 / The bean breeding aiming to produce more upright architecture plants comes growing in importance based on four main objectives: to attend the demand of the producer of irrigated areas in relation to the possibility of mechanical harvesting; to attenuate the problems of diseases caused by soil fungi, especially the white mold; to facilitate the cultural practices and reduce the risks of cultivation in the rainy season. Currently, a grading scale is being used to evaluate the architecture of plant bean, however, this scale is subjective, demands hard work and relies an extensive experience of the evaluator. Therefore, it is important for bean breeding programs to identify characters with the potential to support or even replace, the assessment of plant architecture by notes, seeking greater efficiency in the selection of upright plants. Aiming to identify effective indicators of plant architecture, thirty-six bean lines were evaluated for key traits related to plant architecture and agronomic traits in two seasons, winter of 2007 and winter of 2009. The experiments were conducted in a randomized block design with three repetition at Coimbra’s Experimental Station, belonging to the Department of Plant Science, Universidade Federal de Viçosa. It was observed that more erect plants had a higher cycle, higher at harvest time, smaller insertion angle of branches, epicotyl and hypocotyls with larger diameter, higher height of first pod, pods concentrated on the main stem and a greater number of internodes on the main stem. By path analysis, it was observed that the insertion angle of branches, plant height at harvest and the diameter of the hypocotyl were the main determinants of character architecture of bean plants. Hypocotyl diameter showed a strong association of cause and effect with note plant architecture, high accuracy and precision in its evaluation and ease of evaluation. Moreover, its evaluation is not subjective, can be taken for individual plants within plots, the evaluation can be done after harvest and requires only six measures to access the genotypic value of lineages. Thus, the diameter of the hypocotyl stood out as an effective indicator of the bean plant architecture. / O melhoramento do feijoeiro visando à obtenção de plantas de arquitetura mais ereta vem crescendo em importância com base em quatro objetivos principais: atender à demanda do produtor de áreas irrigadas com relação à possibilidade de colheita mecânica; atenuar os problemas de doenças causadas por fungos de solo, especialmente o mofo-branco; facilitar os tratos culturais e reduzir os riscos do cultivo na safra das águas. Atualmente vem-se utilizando o emprego de uma escala de notas para avaliar a arquitetura de plantas de feijão, porém, essa escala é subjetiva, trabalhosa e depende de grande experiência do avaliador. Assim, é de importância para os programas de melhoramento do feijoeiro a identificação de caracteres com potencial para subsidiar, ou até mesmo substituir, a avaliação da arquitetura de plantas por notas, visando maior eficiência na seleção de plantas de porte ereto. Com o objetivo de identificar indicadores efetivos da arquitetura de plantas, trinta e seis linhagens de feijoeiro foram avaliadas quanto aos principais caracteres relacionados à arquitetura de plantas e caracteres agronômicos em duas safras, inverno de 2007 e inverno de 2009. Os experimentos foram conduzidos em blocos casualizados, com três repetições, na Estação Experimental de Coimbra, pertencente ao departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. Observou-se que plantas mais eretas apresentaram maior ciclo, maior altura na colheita, menor ângulo de inserção dos ramos, epicótilo e hipocótilo com maior diâmetro, maior altura de inserção da primeira vagem, vagens concentradas na haste principal e maior número de entrenós na haste principal. Pela análise de trilha, observou-se que o ângulo de inserção dos ramos, a altura das plantas na colheita e o diâmetro do hipocótilo foram os principais caracteres determinantes da arquitetura de plantas do feijoeiro. O diâmetro do hipocótilo apresentou elevada associação de causa e efeito com nota de arquitetura de planta, elevada acurácia e precisão em sua avaliação e maior facilidade de avaliação. Ademais, sua avaliação não é subjetiva e podem ser tomadas medidas de plantas individuais dentro da parcela, bem como a avaliação pode ser realizada após a colheita e são necessárias apenas seis medidas para acessar o valor genotípico de linhagens. Assim, o diâmetro do hipocótilo se destacou como indicador efetivo da arquitetura de plantas do feijoeiro.