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Caracterização bromatológica da polpa desidratada de frutos de Euterpe edulis Mart. e seleção de genótipos

DIAS, N. C. S. 13 February 2017 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-01T22:57:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10674_Dissertação Final Natalia Caroliny da Silva Dias.pdf: 2889516 bytes, checksum: fe866e44b7ab3e33c10433bd291c9222 (MD5) Previous issue date: 2017-02-13 / A espécie Euterpe edulis Martius caracteriza-se por produzir uma elevada quantidade de frutos que servem de alimento para aves e mamíferos durante longos períodos de escassez de recursos. Entretanto, estima-se que esteja ocorrendo perdas na diversidade da espécie devido à fragmentação florestal e ao intenso extrativismo do palmito produzido desde a colonização do país até os dias atuais. Atualmente, a espécie encontra-se na lista de espécies ameaçadas de extinção. O objetivo deste trabalho foi caracterizar quimicamente a polpa desidratada dos frutos de 60 acessos E. edulis coletados na região Sul do Espírito Santo; avaliar a variabilidade genética e selecionar genótipos baseados em caracteres químicos relacionados à comercialização dos frutos a fim de aplicá-los ao programa de melhoramento da espécie. Foram coletados frutos de 60 acessos e realizadas análises das seguintes características: umidade, biomassa, rendimento, acidez total titulável (ATT), sólidos solúveis totais (SST), fibra bruta (FIB), lipídeos (LIP), pH, conteúdo mineral (CM), compostos fenólicos totais (FNT), antocianinas totais (ANT), flavonóis totais (FLV); proteína bruta (PROT); açucares solúveis totais (AT) e açucares solúveis redutores (AR). Realizou-se o teste de agrupamento Scott-Knott a 5% de probabilidade. Para análise da variabilidade genética entre e dentre os acessos utilizou-se o método de agrupamento de ligação média entre grupos (UPGMA) e a análise de variância molecular (AMOVA). Para a seleção dos indivíduos foram utilizados o índice de seleção com base em modelos mistos (REM/BLUP) e rank médio de Mulamba e Mock. Os materiais vegetais de E.edulis do sul do Espírito Santo apresentaram variação considerável nos teores químicos tendo-se acessos divergentes dentro de uma mesma localidade. O agrupamento UPGMA estruturou os 60 acessos em quatro grupos pela significância obtida pelo método de Mojena (1977). A distância genética entre os acessos dos grupos I e II foi baixa indicando alta similaridade entre eles. Os grupos III e IV apresentaram apenas um acesso, que divergiram de todos os outros. A AMOVA não foi significativa. Os acessos que obtiveram os melhores ganhos preditos de acordo com os índices de seleção foram IB3P4, IB3P9, IB3P5, IB3P6 e IB3P1, podendo ocupar posição de indivíduos base para cruzamento no programa de melhoramento da espécie.
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Variabilidade genética de acessos de maracujazeiro-doce caracterizada por marcadores RAPD e avaliação da resistência à bacteriose e à virose do endurecimento dos frutos / Genetic variability of sweet passion fruit accesses characterized by RAPD markers and evaluation of resistance to bacterial blight and passion fruit woodiness viruses

Bellon, Graciele 13 March 2008 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2008. / Submitted by Jaqueline Oliveira (jaqueoliveiram@gmail.com) on 2008-11-28T14:11:12Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / Approved for entry into archive by Georgia Fernandes(georgia@bce.unb.br) on 2009-02-12T15:59:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-02-12T15:59:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / O maracujazeiro-doce (Passiflora alata Curtis), devido a preços diferenciados, vem ganhando importância dentro do mercado de frutas in natura. O melhoramento genético é fundamental para elevar a qualidade e produtividade da cultura, sendo a identificação de fontes de resistência a doenças uma etapa relevante de todo programa de melhoramento. Objetivou-se, neste trabalho analisar a variabilidade genética de acessos comerciais e silvestres de P. alata e avaliar a resistência de acessos de maracujazeiro-doce a bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) e a virose do endurecimento dos frutos (Cowpea aphid-borne mosaic vírus - CABMV ou Passionfruit woodiness virus – PWV) em condições de campo e casa de vegetação. No presente trabalho, analisou-se a variabilidade genética de 17 acessos de maracujazeiro-doce, sendo nove obtidos de população cultivada e oito silvestres, por meio de marcadores moleculares RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) . O DNA (Ácido Desoxiribonucléico) genômico de cada acesso foi extraído e primers decâmeros foram utilizados para a obtenção de marcadores moleculares RAPD. Os marcadores foram convertidos em uma matriz de dados binários, a partir da qual foram estimadas as distâncias genéticas entre os acessos e realizadas análises de agrupamento. Entre os acessos analisados constatou-se que existe variabilidade genética entre os acessos obtidos de população cultivada e silvestres de P. alata, sendo que os acessos silvestres foram os que mais contribuem na amplitude da base genética dos materiais estudados. Ademais, avaliou-se a resistência de nove acessos de maracujazeiro-doce (sete acessos obtidos de população cultivada e dois acessos silvestres) à bacteriose em condições de campo e em casa de vegetação. Em condições de campo, foram analisadas cinco folhas por planta, selecionadas aleatoriamente, nas quais se avaliou o número médio de lesões por folha, o diâmetro médio das lesões, a média da área lesada por folha, a % de folhas sadias e a % de folhas sintomáticas. Em casa de vegetação, realizou-se a inoculação com o isolado 767 (UnB) de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae e avaliou-se o diâmetro longitudinal médio da lesão, diâmetro transversal médio da lesão, diâmetro médio da lesão e área lesada média aos 5, 10 e 15 dias após inoculação. Os resultados foram significativos apenas para o experimento em casa de vegetação, em que o acesso com maior nível de resistência foi o acesso tipo J, seguido do acesso tipo D. Ainda, estudou-se a resistência de tais acessos à virose do endurecimento dos frutos também em condições de campo e casa de vegetação. Em condições de campo, foi avaliado incidência e severidade da doença. Para avaliação da severidade utilizou-se escala de notas para planta e para folha. Em condições controladas de casa de vegetação, a inoculação foi feita mecanicamente em cada acesso. Avaliou-se a porcentagem de plantas com sintomas da infecção viral (incidência). O maior nível de resistência foi verificado nos acessos silvestres N1 e N2. Em condições de campo, a incidência e a severidade de virose aumentaram ao longo do tempo, possivelmente devido à maior disseminação do vírus pelo afídio. Houve diferenças de nível de resistência entre plantas da mesma família ressaltando a importância da avaliação e da seleção de plantas individuais. Sendo assim a presença de alta variabilidade genética entre os acessos estudados refletida também na resistência a virose e bacteriose, geram perspectivas promissoras para o melhoramento desta espécie, possibilitando o lançamento futuro de variedades com caracteres desejáveis. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Sweet passion fruit (Passiflora alata Curtis) is gaining importance in the in natura fruit market due to differential pricing. Genetic breeding is crucial to improve crop quality and productivity, and identification of sources resistance a relevant stage for any breeding program. The objective the present work was to analyze the genetic variability of accesses of P. alata obtained from cultivated population and of wild accesses and to evaluate resistance sweet passion fruit accesses the to bacterial blight caused by (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) and to passion fruit woodiness viruses. (caused by PWV or CABMV) under greenhouse and field conditions. Unthe present work, genetic variability of 17 sweet passion fruit accesses was analyzed, nine of them from a cultivated population and eight wildones, was analyzed by using RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) molecular markers. The genomic DNA of each access was extracted and decamers primers were used to obtain RAPD molecular markers. The markers have been converted into a matrix of binary data, used as base to estimate genetic distances between accesses and to produce grouping analysis. Among the studied accesses, genetic variability was observed between accesses from cultivated and wild population of P. alata, the wild accesses contribuing the most to the range of the genetic basis of the studied materials. Moreover, resistance to bacterial blight of nine sweet passion fruit accesses (seven obtained from cultivated population and two wild accesses) under greenhouse and field conditions was assessed. Under field conditions, five leaves randomly selected from each plant, were analyzed. The average number of lesions per leaf, the average diameter of lesions, the average lesioned area per leaf and the percentage of healthy and sick leaves were evalucted. Under greenhouse conditions, inoculation with the isolate 767 (UnB) of Xanthomonas axonopodis pv. Passiflorae was performed and the average longitudinal diameter, the average transverse diameter, the average diameter of the lesion and the average lesioned area were evaluated 5, 10 and 15 days after inoculation. Results were significant only for the greenhouse experiment, where the access with higher resistance level was the J-type, followed by the D-type. Furthermore, the resistance to passion fruit woodiness viruses. of such accesses was studied, under greenhouse and field conditions, likewise. Under field conditions, incidence and severity were evaluated. For evaluation of the severity it was used a scale for plant and leaf. Under controlled greenhouse conditions, the inoculation was produced mechanically in each access. The incidence of plants presenting viral infection symptoms (incidence) was measured. The highest resistance level to fruit was observed on wild accesses N1 and N2. Under field conditions, the incidence and severity of passion fruit woodiness viruses increased over time, possibly due to the dissemination of virus by the vector aphid. It was verified differences is possible to verify resistance levels in between plants of the same family, stressing the importance of evaluation and selection of individual plants. Thus, the presence of high genetic variability among the studied accesses, also reflected in the resistance to passion fruit woodiness viruses and bacterial blight, generate promising perspectives for the breeding of this species, enabling the future release of varieties with desirable characteristics.
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Análises biométricas de palmeiras juçara de fragmentos florestais no sul do Espírito Santo

Senra, João Felipe de Brites 19 February 2015 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-29T15:37:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8368_Tese Final João Felipe de Brites Senra20150914-93412.pdf: 793682 bytes, checksum: 4b0c0e4fa9a46d0ae2e7e1c4102106b4 (MD5) Previous issue date: 2015-02-19 / CAPES / A espécie Euterpe edulis Martius é nativa da Mata Atlântica e conhecida popularmente como palmeira juçara. Esta é uma espécie chave da Mata Atlântica, pois produz frutos que são consumidos por cerca de 30 espécies de aves e 13 espécies de mamíferos além de possuírem um grande potencial econômico para ser explorado na forma de polpa de fruta, doce e sovertes. Atualmente a palmeira juçara encontra-se na lista oficial das espécies ameaçadas de extinção no Brasil. Este trabalho teve por objetivos: estimar o coeficiente de repetibilidade e de determinação de características dos frutos e das sementes, analisar o número de medições para um nível de confiança de 95% e testar diferentes metodologias de estimação da repetibilidade; estudar a diversidade genética entre os acessos e avaliar o padrão de germinação das sementes via modelos não lineares Logístico, Gompertz, Von Bertalanffy e Will Bill; quantificar a diversidade genética interpopulacional da espécie baseada na correlação entre caracteres vegetativos e relacionados à produção de frutos. A coleta dos frutos da palmeira juçara foi realizada em 20 fragmentos florestais nos município da região Sul do estado do Espírito Santo: Alegre (oito fragmentos); Guaçuí (quatro fragmentos); Ibitirama (três fragmentos); Jerônimo Monteiro (um fragmento); Mimoso (três fragmentos); e Muqui (um fragmento). Para o estudo de repetibilidade foram utilizados 198 acessos, 25 frutos por planta, sendo avaliado: diâmetro longitudinal e equatorial do fruto e da semente (DLF, DLS, DEF e DES) em milímetros (mm); massa do fruto e da semente (MF e MS) em gramas (g). A deviance foi estimada pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML). Os coeficiente de repetibilidade e determinação e o número de medições necessárias foi realizado utilizando os métodos da REML, componentes principais via matriz de correlações e covariâncias e análise estrutural baseada nas matrizes de correlações e covariâncias. As estimativas dos coeficientes de repetibilidade e determinação de todas as variáveis analisadas são superiores a 0,78 e 98% respectivamente, para todas as metodologias testadas, realizando 25 medições. Para 95% de confiabilidade são necessárias 5 medições para as variáveis DLF, DEF, DLS, DES e MS e 4 medições para a variável MF. As metodologias utilizadas não diferem quanto à estimativa do coeficiente de repetibilidade para as variáveis DLF, DES, MF e MS, enquanto que para as demais variáveis as diferenças foram mínimas. Para a análise de identidade de modelos foram utilizados sementes de 45 acessos sendo avaliado: germinação; índice de velocidade de germinação; tempo médio de germinação; primeira contagem de germinação e a porcentagem de germinação. Com base nos dados quantitativos foi calculada a matriz de distância generalizada de Mahalanobis (D²) e posteriormente os acessos foram agrupados pelo método de otimização de Tocher formando quatro grupos. Em cada grupo a germinação foi analisada via regresão não linear utilizando os modelos de Logístico, Gompertz, Von Bertalanffy e Will Bill. O ajuste dos modelos foi avaliado pelo coeficiente de determinação (R²), quadrado médio do resíduo (QMR), desvio médio absoluto (DMA), critério de informação de Akaike (AIC) e critério de informação Bayesiano (BIC). O teste de identidade de modelos foi realizado pelo teste F. O modelo de Gompertz apresentou valores de β1, β2 e β3 intermediários aos demais modelos o que evita a sub ou super estimação destes parâmetros da regressão, além disso, este modelo apresenta os maiores valores de R2 e os menores valores do QMR, DMA, AIC e BIC sendo o mais indicado para descrever o padrão de germinação. O teste de identidade de modelos foi não significativo e desta forma uma única regressão não é eficiente para descrever o processo germinativo. Os grupos três e quatro possuem os maiores valores da TG indicando um maior vigor e para produção de mudas o tempo ideal para o transplantio seria de 30 dias para os grupos um, dois e quatro e 22 dias para o grupo três. Para o estudo de diversidade genética foram utilizados os dados dos frutos dos 198 acessos utilizados na análise de repetibilidade. Neste caso foram avaliados os caracteres: massa de cem frutos (MCF) e massa de cem sementes (MCS) em gramas; rendimento em polpa (RP) em porcentagem; diâmetro do caule a 1,5 m do solo (D1,5), diâmetro do caule a 1,0 m do solo (D1,0) e diâmetro do caule a 0,5 m do solo (D0,5) em milímetros; número de cachos (NC); comprimento do cacho (CC) em centímetros; número de ráquilas (NR); e altura até o cacho (AC) em metros. Com base nestes dados foi estimada a correlação genética, uma análise de componentes principais e análise de correspondência. A correlação genética entre os caracteres MCF x NR (0,44) é positiva. A característica NR é a principal determinante na variação da MCF e a seleção indireta poderá ser eficaz, dependendo de suas estimativas da herdabilidade. Os fragmentos GU3, AL4, JM1, MI1 e MQ1 oriundos de municípios diferentes são os que apresentam maior divergência genética interpopulacional entre os 20 fragmentos estudados. Os fragmentos GU2, GU3 e AL4 possuem indivíduos produtores de massa de cem frutos extragrandes (211,54 a 352,24 g) o que os tornam importantes fontes de seleção para utilização em programas de melhoramento genético da palmeira juçara visando a produção de polpa de fruta. / The species Euterpe edulis Martius is native to the Atlantic Forest and popularly known as jussara palm. It is a key species of the Atlantic Forest, producing fruits that are consumed by about 30 bird species and 13 mammal species, and also presenting great economic potential for exploitation of its fruit in the form of pulp, sweets and ice creams. Currently the jussara palm is on the official list of endangered species in Brazil. The objectives of this study were to: estimate the coefficient of repeatability and determination of the characteristics of fruits and seeds, analyze the number of measurements for a 95% confidence level and test different methods for estimation of repeatability, study the genetic diversity among accessions and evaluate the pattern of seed germination via the Logistic, Gompertz, von Bertalanffy and Will Bill nonlinear models, quantify the inter-population genetic diversity of the species based on the correlation between plant traits and related to fruit production. Collection of the jussara palm fruits was performed in 20 forest fragments in the following municipalities in the southern region of the state of Espírito Santo: Alegre (eight fragments), Guaçuí (four fragments), Ibitirama (three fragments), Jerônimo Monteiro (one fragment), Mimoso (three fragments) and Muqui (one fragment). For the study of repeatability 198 accessions were used, 25 fruits per plant, evaluating: longitudinal and equatorial diameter of the fruit and seed (DLF, DLS, DEF and DES) in millimeters (mm), and fruit and seed mass (MF and MS) in grams (g). Deviance was estimated by the restricted maximum likelihood (REML). The coefficient of repeatability and determination and the required number of measurements was determined using the REML methods, principal components via the correlation matrix, and covariances and structural analysis based on correlation and covariance matrices. Estimates of the repeatability coefficients and determination of all variables analyzed were greater than 0.78 and 98% respectively, for all tested methodologies, performing 25 measurements. For 95% reliability, 5 measurements are required for the variables DLF, DEF, DLS, DES and MS and 4 measurements for the variable MF. The methods used do not differ with respect to estimate of the repeatability coefficient for the variables DLF, DES, MF and MS, while for the other variables the differences were minimal. To analyze the identity of the models, seeds from 40 accessions were used to evaluate: germination, germination speed index, mean germination time, first germination count and the germination percentage. Based on the quantitative data the generalized Mahalanobis distance matrix (d²) was calculate and later accessions were clustered by the Tocher optimization method divided into four groups. In each group germination was analyzed via non-linear regression using the Logistic, Gompertz, von Bertalanffy and Will Bill models. Fit of the models was evaluated by the determination coefficient (R²), residual mean error (QMR), mean absolute deviation (MAD), Akaike information criterion (AIC) and Bayesian information criterion (BIC). The identity test of the models was performed by the F-test. The Gompertz model showed intermediary values of β1, β2 and β3 compared to other models which avoid under or over estimation of these regression parameters; in addition, this model presents the highest R 2 values and the lowest values of QMR, DMA, AIC and BIC, and is the most indicated to describe the pattern of germination. The identity test of the models was not significant and therefore a single regression is not efficient to describe the germination process. Groups three and four have the highest values of TG, indicating greater vigor, and for seedling production the ideal time for transplanting would be 30 days for groups one, two and 4, and 22 days for group three. For the study of genetic diversity, data from fruit of the 198 accessions utilized in the analysis of repeatability were used. In this case we evaluated the traits of: mass of one hundred fruits (MCF) and mass of one hundred seeds (MCS) in grams, pulp yield (RP) in percentage, stem diameter at 1.5 m above the ground (D1,5), stem diameter at 1.0 m above the ground (D1,0) and stem diameter at 0.5 m above the ground (D0,5) in millimeters, number of clusters (CN), cluster length (CC) in centimeters, number of rachilles (NR), and height of the cluster (AC) in meters. Based on these data the genetic correlation was estimated, and a principal components analysis and correspondence analysis were performed. Genetic correlation between the traits MCF x NR (0.44) is positive. The characteristic NR is the main determinant in variation of MCF and indirect selection can be effective, depending on estimates of heritability. The fragments GU3, AL4, JM1, MI1 and MQ1 from different municipalities are those that presented the greatest inter-population genetic divergence among the 20 fragments studied. The fragments GU2, GU3 and AL4 have exceptionally large individual producers regarding the mass of one hundred fruits (211.54 to 352.24 g) which make them important sources of selection for use in jussara palm breeding programs focused on the production of fruit pulp.
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Avaliação de genótipos de melancia quanto à resistência à mancha aquosa

CARVALHO, Francisco Conrado Queiroz Carvalho 29 February 2012 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-10T15:33:36Z No. of bitstreams: 1 Francisco Conrado Queiroz Carvalho.pdf: 693930 bytes, checksum: 0e5f734618ab807f4c62e74984f62954 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-10T15:33:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Francisco Conrado Queiroz Carvalho.pdf: 693930 bytes, checksum: 0e5f734618ab807f4c62e74984f62954 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Bacterial fruit blotch caused by Acidovorax citrulli occurs in different parts of watermelon plant, at different stages of development but symptoms are more conspicuous and easy to diagnose in fruit. BFB has caused significant economic losses to melon production in Brazil and is a major threat to the watermelon fields. This justifies the research for resistance sources to be used in breeding programs aiming to obtain varieties resistant to BFB, since they do not yet exist. To select genotypes with potential use in the management of fruit blotch, the resistance level of watermelon genotypes belonging to the Cucurbits Germplasm Active Bank for the Brazilian Northeast (Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas para o Nordeste Brasileiro - BAG) of Embrapa Semiárido was evaluated at different plant developmental stages: seeds (74 genotypes), seedlings and plants before flowering (29 genotypes) as well as plants during flowering and fruiting (7 genotypes). The genotypes were evaluated for the incidence or severity of the disease, which was estimated with the aid of descriptive scales. Additionally, A. citrulli transmission was determined in seeds derived from symptomatic and asymptomatic fruits. No watermelon genotype was immune to fruit blotch, and the majority showed variations in resistance responses. However, the genotypes BGCIA 979, BGCIA 34 and Sugar Baby showed high levels of resistance at most stages of plant development, thereby suggesting that these genotypes possess fruit blotch resistance genes that could be used in breeding programs. Seeds from symptomatic and asymptomatic fruits of the seven tested genotypes showed transmission rates of A. citrulli up to 35.3% and 8.7%, respectively. These results confirm that asymptomatic fruits can harbor contaminated seeds that are responsible for the transmission of the bacteria. / A mancha aquosa, causada pela bactéria Acidovorax citrulli, ocorre em distintos órgãos de melancia, em diferentes estádios de desenvolvimento, sendo os sintomas mais comuns e de fácil diagnose nos frutos. Essa doença é responsável por elevadas perdas econômicas na cultura do meloeiro no Brasil e uma grande ameaça para a melancia. Isto justifica a busca de fontes de resistência a serem utilizadas em programas de melhoramento visando à obtenção de variedades dessa olerícola com resistência a doença. Com o objetivo de selecionar genótipos com potencial de utilização no manejo da mancha aquosa, avaliou-se o nível de resistência de 74 genótipos de melancia pertencentes ao Banco Ativo de Germoplasma de Cucurbitáceas para o Nordeste Brasileiro (BAG) da Embrapa Semiárido, em diferentes estádios de desenvolvimento da planta: sementes (74 genótipos), plântulas e plantas antes da floração (29 genótipos), plantas durante a floração e frutificação (7 genótipos). Os genótipos foram avaliados quanto a incidência ou severidade da doença, esta estimada com auxílio de escalas descritivas. Adicionalmente, foi determinada a transmissão de A. citrulli em sementes oriundas de frutos sintomáticos e assintomáticos. Nenhum genótipo de melancia foi imune à mancha aquosa, e a maioria apresentou variação nas reações de resistência. Porém, os genótipos BGCIA 979, BGCIA 34 e ‘Sugar Baby’ mostraram altos níveis de resistência na maioria dos ensaios realizados, indicando possuírem genes para resistência à mancha aquosa que poderão ser utilizados em programas de melhoramento. Sementes de frutos sintomáticos e assintomáticos dos sete genótipos apresentaram transmissão de A. citrulli de até 35,3% e 8,7% respectivamente, confirmando que frutos assintomáticos podem abrigar sementes contaminadas responsáveis pela transmissão da bactéria.
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Caracterização genética, morfológica e agronômica de germoplasma de sacha inchi (plukenetia volubilis L.) no estado do Amazonas / Genetic, morphological and agronomic characterization of sacha inchi germoplasm (Plukenetia volubilis L.) in the state of amazonas

Rodrigues, Haroldo Silva 18 July 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 759469 bytes, checksum: 33ae9554924588966908ce701f540e81 (MD5) Previous issue date: 2013-07-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Although widely known and rich in biodiversity, the Amazon still has a range of species that are underexplored and neglected by science, these species may have great potential for man. Only a fraction of the Amazon biodiversity is known. It is estimated that the plant wealth comprises about 30,000 species, about 10% of plants from all over the planet. The sacha inchi is a native plant from the Amazon, with great potential for the pharmaceutical and cosmetic industry. This plant has high amounts of monounsaturated and polyunsaturated fatty acids in the oil that is extracted from its seeds. Studies on the oil characteristics are found in scientific journals. On the other hand, there is a lack of studies that measure the genetic diversity among genotypes of sacha inchi. Embrapa Western Amazon, located in Manaus, has a sacha inchi Germplasm Bank which is composed of 37 accessions. This work was aimed to measure the genetic diversity within and between accessions in this collection through molecular markers and phenotypic traits related to fruits and seeds. AFLP markers were used and the results obtained the genetic dissimilarity was calculating by the arithmetic complement of Jaccard coefficient and subsequent construction cluster by using the UPGMA method. The phenotypic data collected was subjected to variance analysis, classified with average grouping by the Skott-Knott method, Mahalanobis distance method and clustered by the UPGMA method. Also performed canonical correlation analysis and the study of diversity within and between accessions using the method of AMOVA. The results showed the following; the existence of genetic variability among genotypes, the molecular analysis revealed geographic structure among accessions, the phenotypic data affirmed that there is great variation between means of most of the variables considered in this work, it was not possible to detect statistically significant correlations between variables related to fruit and variables related to seed tough.For breeding purposes, the exploration of diversity within the accessions and crosses between divergent accessions should be adopted. / Apesar de amplamente conhecida e rica em biodiversidade, a região amazônica ainda possui uma gama de espécies subexploradas e negligenciadas pela comunidade científica, espécies essas que apresentam grande potencial de utilização para o homem. Apenas uma pequena fração dessa biodiversidade é conhecida, estima-se que a riqueza da flora amazônica compreende aproximadamente 30.000 espécies, cerca de 10% das plantas de todo o planeta. A sacha inchi é uma espécie nativa da amazônica com grande potencial de uso para a indústria farmacêutica e estética, pois possui alto teor de ácidos graxos mono e poliinsaturados no óleo extraído de sua semente. Apesar de estudos sobre características desse óleo serem encontrados na literatura, existe uma grande carência de trabalhos que mensurem a diversidade genética entre genótipos de sacha inchi. A Embrapa Amazônia Ocidental, situada no município de Manaus, possui um Banco de Germoplasma de sacha inchi composto por 37 acessos. O presente trabalho teve como objetivo estudar a diversidade genética entre e dentro dos acessos componentes dessa coleção por meio de marcadores moleculares e características fenotípicas relacionadas à produção de frutos e sementes. Foram utilizados marcadores AFLP e os resultados obtidos, submetidos à análise de dissimilaridade por meio do cálculo do complemento aritmético do coeficiente de Jaccard e subsequente construção dendograma pelo método UPGMA. Os dados fenotípicos coletados foram submetidos à analise de variância e subsequente analise de agrupamento de médias pelo método Skott-Knott, distância generalizada de Mahalanobis e dendograma construído pelo método UPGMA. Foi realizada ainda a análise de correlações canônicas e estudo da diversidade entre e dentro dos acessos utilizando o método da AMOVA. Os resultados obtidos mostram a existência de variabilidade genética entre os acessos estudados, o estudo à nível molecular mostrou estruturação geográfica entre os acessos estudados, os dados fenotípicos mostram que existe grande amplitude entre as médias de maioria das variáveis consideradas neste trabalho, por outro lado não foi possível detectar correlações estatisticamente significativas entre variáveis relacionadas ao fruto e variáveis relacionadas à semente. Para fins de melhoramento genético deve-se adotar a exploração da diversidade dentro dos acessos e optar por cruzamentos entre acessos divergentes.
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Diversidade genética e subcoleção representativa dos acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa / Genetic diversity and representative core collection of the tomato accesses of the Vegetable Germoplasm Bank at the Universidade Federal de Viçosa

Marim, Bruno Garcia 13 February 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:42:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 184500 bytes, checksum: da94e7e2492b99a28eb97e5893f21931 (MD5) Previous issue date: 2006-02-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The objectives of this work went to evaluate the genetic diversity and to elaborate a representative core col of the tomato accesses of the Vegetable Germoplasm Bank at the UFV. Were evaluated 70 accesses of tomato at the BGH-UFV divided in three experiments mounted in blocks and three repetitions. They were used you cultivate them Santa Clara and Débora Plus, as witness, in the three experiments. The data were analyzed considering groups of experiments. Before all the statistical analyses the averages of the accesses were corrected in agreement with the environmental effect of each experiment. To evaluate the genetic diversity among the accesses they took place analyses univariate and multivariate. The analyses univariate were: contrast between the averages of the accesses and witness and coincidence coefficient between the original data and the corrected data. The multivariate analyses were: grouping of Tocher and relative importance of the characteristics. Significant differences were verified among the averages of the accesses and of the witness for the characteristics length of the leaf, length of the stem, length of the fruit, width of the fruit, thickness of the endocarp, width of the central axis, lóculos number, number of good fruits, weight of good fruits, I weigh medium of the fruits, total number of fruits, total weight of fruits, precocity index, total soluble solids and quality of fruit. The characteristics with the smallest coincidence coefficients were: length of the stem, weight of good fruits and weigh of total of fruits, demonstrating that these characteristics are very influenced by the environment. For the analysis of grouping of Tocher, the accesses were separate in 10 groups, and, together with the witness, 28 accesses were allocated, what means similarity among these. On the other hand the accesses 981, 997, 989, 978 and 1214 were divergence the witness and they had superior averages for medium weight of the fruits, total weight of the fruits and total soluble solids. For definition of the representative core collection that best represented the tomato accesses of BGH-UFV they took place the calculations of the index of variability retention. Twelve representative core collection were developed, being derived of the combination among the sampling strategies, of sampling intensity and of definition of the number of accesses sampling for extract. The sampling strategies used they were aleatory and multivariate. The appraised intensities were 15, 20 and 30% and the strategies of definition of the number of accesses smapling for extract they were proportional and logarithmic. The chosen representative core collection was ML-30, in other words, sampling based on multivariate analyses, number of accesses defined for the logarithmic strategy and intensity of sampling of 30%. With this representative core collection it was possible the reduction of the number of tomato accesses they be maintained by BGH- UFV in 70%, in other words, with only 21 accesses, of the appraised 70, it was possible to represent approximately 90% of the existent variability. / Os objetivos deste trabalho foram avaliar a diversidade genética e elaborar uma subcoleção representativa dos acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da UFV. Avaliaram-se 70 acessos de tomateiro do BGH-UFV divididos em três experimentos montados em blocos ao acaso com três repetições. Utilizaram-se as cultivares Santa Clara e Débora Plus, como testemunhas, nos três experimentos. Os dados foram analisados em conjunto considerando grupos de experimentos. Antes de todas as análises estatísticas as médias dos acessos foram corrigidas de acordo com o efeito ambiental de cada experimento. Para avaliar a diversidade genética entre os acessos realizaram-se análises uni e multivariadas. As análises univariadas foram: contraste entre as médias dos acessos e testemunhas e coeficiente de coincidência entre os dados originais e os dados corrigidos. As análises multivariadas foram: agrupamento de Tocher e importância relativa das características. Verificaram-se diferenças significativas entre as médias dos acessos e das testemunhas para as características comprimento da folha, comprimento do entrenó, comprimento do fruto, largura do fruto, espessura do endocarpo, largura do eixo central, número de lóculos, número de frutos bons, peso de frutos bons, peso médio dos frutos, número total de frutos, peso total de frutos, índice de precocidade, sólidos solúveis totais e qualidade organoléptica. As características com os menores coeficientes de coincidência foram: comprimento do entrenó, peso de frutos bons e peso de total de frutos, demonstrando que estas características são muito influenciadas pelo ambiente. Pela análise de agrupamento de Tocher, os acessos foram separados em 10 grupos, sendo que, juntamente com as testemunhas ficaram alocados 28 acessos, o que significa similaridade entre estes. Por outro lado os acessos 981, 997, 989, 978 e 1214 foram divergentes as testemunhas e tiveram médias superiores para peso médio dos frutos, peso total dos frutos e sólidos solúveis totais. Para definição da subcoleção que melhor representou os acessos de tomateiro do BGH-UFV realizaram-se os cálculos do índice de retenção de variabilidade. Foram desenvolvidas 12 subcoleções, sendo derivadas da combinação entre as estratégias de amostragem, de intensidade de amostragem e de definição do número de acessos amostrados por extrato. As estratégias de amostragem utilizadas foram aleatória e multivariada. As intensidades avaliadas foram 15, 20 e 30% e as estratégias de definição do número de acessos amostrados por extrato foram proporcional e logarítmica. A subcoleção escolhida foi a ML-30, ou seja, amostragem baseada em análises multivariadas, número de acessos definido pela estratégia logarítmica e intensidade de amostragem de 30%. Com esta subcoleção foi possível a redução do número de acessos de tomateiro a serem mantidos pelo BGH-UFV em 70%, ou seja, com apenas 21 acessos, dos 70 avaliados, foi possível representar aproximadamente 90% da variabilidade existente.
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Pré-melhoramento visando resistência à requeima em tomateiro / Pre-breeding for resistance to late blight in tomato

Laurindo, Bruno Soares 17 July 2013 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 425667 bytes, checksum: 1f8c842faf40449adebf9de5ae50ad48 (MD5) Previous issue date: 2013-07-17 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The tomato production is considered a high risk economic activity, and of great agronomic complexity mainly because of the high number of pathogens that causes diseases in the culture. Among the pathogens of greatest importance, there is the oomycete Phytophthora infestans (Mont.) de Bary, causing late blight, which is considered the most destructive disease of tomato. There are no commercial tomato cultivars resistant and the control of this disease is highly dependent on the use of fungicides. Considering that the tomato is one of the most studied crop in genetic terms, the lack of resistant cultivars in the market reflects the difficulty in working this trait in breeding programs. The objectives with this present study was to select sources of resistance to late blight among accessions of Solanum lycopersicum, and estimate the overall and specific ability of combining six tomato accessions of Solanum lycopersicum selected for resistance to late blight, aiming at the selection of potential genitors for pre-breeding for resistance to this disease. Two experiments were carried out. In the first, twelve accessions of S. lycopersicum, from the Vegetable Germplasm Bank of the Federal University of Viçosa - BGH - UFV (BGH-973, BGH-1025, BGH- 2017, BGH-2093, BGH-2095, BGH-2102, BGH-2117, BGH-2127, BGH-2130, BGH- 2332, BGH-2333 and BGH-2343) were evaluated in a randomized block design with three replications. For the evaluation of the resistance, the plants were inoculated with a mixture of sporangia of P. infestans, in the concentration of 5x103 sporangia mL-1 , collected in different regions of the Zona da Mata Mineira. It was evaluated the percentage of plant tissue affected by the disease, or the percentage of severity, evaluated in the form of area under the disease progress curve (AUDPC). The accessions BGH-2102, BGH-2117, BGH-2127, BGH-2130, BGH-2332 and BGH-2343 obtained average values of AUDPC lower than the resistant controls, and were selected as a source of resistance to late blight. The selected accessions as resistant to late blight were used in a second experiment, where a balanced diallel of half table were realized, and fifteen F1 s hybrids were obtained. The six accessions of S. lycopersicum, BGH- 2102, BGH-2117, BGH-2127, BGH-2130, BGH-2332 and BGH-2343 together with the fifteen F1 s hybrid were evaluated in a randomized block design with three replications. For the evaluation of the resistance, the plants were inoculated with a mixture of sporangia of P. infestans, in the concentration of 5x103 sporangia mL-1 collected in different regions of the Zona da Mata Mineira. The percentage of plant tissue affected by the disease, or the percentage of severity, presented in the form of area under the disease progress curve (AUDPC) were evaluated. The diallelic analysis was carried out according to the model of GRIFFING (1956). Observed existence of additive genetic variability between the genitors and the predominance of additive gene effects involved in determining the AUDPC, besides the existence of bidirectional dominance deviations in the control of the character. The diallel analysis was efficient in selecting genitors aimed at a pre-breeding of resistance to late blight, highlighting the accessions BGH- 2117, BGH-2127 and BGH-2343 with the greatest frequency of favorable alleles and divergent, thus they can be included in crossings aiming the pre-breeding for resistance to late blight. / A tomaticultura é considerada uma atividade de elevado risco econômico e grande complexidade agronômica, principalmente pelo elevado número de patógenos que causam doenças na cultura. Entre os patógenos de maior importância, destaca-se o oomiceto Phytophthora infestans (Mont.) de Bary, causador da requeima ou mela, considerada a doença mais destrutiva do tomateiro. Não existem cultivares comerciais de tomate resistentes, e o controle da doença é altamente dependente do uso de fungicidas de caráter preventivo e/ou curativo. Considerando que o tomateiro é uma das plantas cultivadas mais bem estudadas em termos genéticos, a inexistência de cultivares resistentes no mercado reflete a dificuldade em se trabalhar essa característica nos programas de melhoramento. Os objetivos com o presente estudo foram selecionar fontes de resistência à requeima entre acessos de Solanum lycopersicum, e estimar as capacidades geral e específica de combinação dos acessos de S. lycopersicum selecionados quanto a resistência à requeima, visando selecionar potenciais genitores para o pré-melhoramento da resistência a esta doença. Foram realizados dois experimentos. No primeiro avaliou-se doze acessos de S. lycopersicum, do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa BGH UFV (BGH- 973, BGH-1025, BGH-2017, BGH-2093, BGH-2095, BGH-2102, BGH-2117, BGH- 2127, BGH-2130, BGH-2332, BGH-2333 e BGH-2343) no delineamento em blocos casualizados, com três repetições. Para a avaliação da resistência, as plantas foram inoculadas com uma mistura de esporângios de P. infestans, na concentração de 5x103 esporângios mL-1, coletados em diferentes regiões da Zona da Mata Mineira. Avaliou-se a porcentagem do tecido vegetal afetado pela doença, ou seja, a porcentagem de severidade, avaliada sob a forma de área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Os acessos BGH-2102, BGH-2117, BGH-2127, BGH-2130, BGH-2332 e BGH-2343 obtiveram valores médios de AACPD inferiores aos das testemunhas resistentes, sendo selecionados como fonte de resistência à requeima. Os acessos selecionados como resistentes à requeima foram utilizados em um segundo experimento, onde foi realizado um dialelo balanceado de meia tabela, e obtidos quinze híbridos F1 s. Os seis acessos de S. lycopersicum, BGH-2102, BGH-2117, BGH-2127, BGH-2130, BGH-2332 e BGH-2343 juntamente com os quinze híbridos F1 s foram avaliados em delineamento em blocos casualizados, com três repetições. Para a avaliação da resistência, as plantas foram inoculadas com uma mistura de esporângios de P. infestans, na concentração de 5x103 esporângios mL-1, coletados em diferentes regiões da Zona da Mata Mineira. Avaliou-se a porcentagem do tecido vegetal afetado pela doença, ou seja, a porcentagem de severidade, avaliada sob a forma de área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD). Procedeu-se a análise dialélica de acordo com o modelo de GRIFFING (1956). Observou-se existência de variabilidade genética aditiva entre os genitores e predominância de efeitos gênicos aditivos envolvidos na determinação da AACPD, além da existência de desvios de dominância bidirecional no controle do caráter em questão. A análise dialélica foi eficiente na seleção de genitores visando o pré-melhoramento da resistência à requeima, destacando os acessos BGH- 2117, BGH-2127 e BGH-2343 como os de maior frequência de alelos favoráveis e divergentes, por isso devem ser incluídos em cruzamentos visando o pré-melhoramento da resistência à requeima.

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