La conservación de la biodiversidad y el control de la desertificación en la Patagonia tienen necesariamente que estar unidos a la identificación de las especies que potencialmente puedan ser utilizadas. El objetivo general fue el de evaluar el efecto de distintos niveles de disponibilidad de agua en la germinación, establecimiento y supervivencia de las especies estudiadas, y sobre su eventual potencialidad para fijar N. Asimismo se estudiaron la posible existencia de caracteres xeromórficos y/o especializaciones en sus tejidos que les permiten persistir y que posibilitan la fijación de N en distintas condiciones de déficit hídrico. Las poblaciones naturales de Astragalus cruckshanksii (Hook. et Arn.) Griseb., Glycyrrhiza astragalina Gillies ex Hooker et Arnott y Adesmia lotoides Hook.f., vegetan en distintas localidades de la Provincia Fitogeográfica Patagónica donde se colectó semillas y suelo rizosférico de las tres especies en distintas oportunidades para realizar los estudios. Además porciones de plantas de A. lotoides. Se estudió la germinación y la emergencia. Se realizó un ensayo de respuesta a un gradiente de humedad de plantas de las especies en estudio que se llevo a cabo en el exterior y solo cubiertas de la lluvia. Mientras duró el ensayo se estudió la supervivencia. A la finalización del ensayo en las plantas de todos los tratamientos, se determinó longitud de tallo, número de hojas y folíolos por hoja, superficie foliar, ramificaciones, número de nódulos, longitud de raíz principal, número y longitud de raíces laterales, materia seca de vástago y raíz. Se extrajeron muestras tisulares para futuros estudios. Se registró la nodulación, la fijación biológica del nitrógeno y el contenido de nitrógeno total. G. astragalina y A. lotoides son plantas rizomatosas que en la primera etapa de su desarrollo poseen la base del tallo o corona que sería similar a lo descrito para A. cruckshanksii. Todas las especies mostraron zonas subterráneas con yemas para la permanencia y el crecimiento. Con menor contenido de humedad edáfica se produjo menos masa de tejido meristemático, lo que determinó un menor desarrollo del banco de yemas y menor diferenciación de tejido secundario. A su vez generó células de menor tamaño y produjo folíolos más delgados. A. cruckshanksii y A. lotoides vieron dificultado el proceso de germinación a partir de -0,8 MPa, G. astragalina disminuyó su potencial germinativo a partir de -0,4 MPa. A. cruckshanksii fue la especie que evidenció mejor comportamiento en la emergencia. Las especies son afectadas, por la disponbilidad de agua, en los parámetros estudiados pero es probable que posean caracteres genéticos adaptativos al déficit hídrico. El estudio realizado demostró la supervivencia, infectividad y efectividad de las cepas de Rhizobium nativo, y por otro lado la capacidad de nodular por parte de las leguminosas estudiadas en las condiciones de déficit hídrico en que se desarrollaron durante el estudio. A. lotoides fue la que mayor porcentaje de N total asimiló en la biomasa subterránea de plantas de 15 % de humedad edáfica. / Biodiversity conservation and desertification control in Patagonia must necessarily be related to the identification of plant species that could be used for this purpose. The general objective of this work was to evaluate different levels of water disponibility effects on germination, establishment and survival of the studied species and their eventual potentiality for N fixation. It was also studied the possible existence of xeromorphic characters and/or tissue specializations that could allow them to persist and fix N at different conditions of water stress. Natural populations of Astragalus cruckshanksii (Hook. et Arn.) Griseb., Glycyrrniza astragalina Gillies ex Hooker et Arnott and Adesmia lotoides Hook.f., can be found at different locations of the Phytogeographic Province of Patagonia, where seeds and rhizospheric soil of the three species were colected at different times, as well as portions of A. lotoides individuals, in order to develop this study. Germination and emergency were determined. Trials for moisture gradient response was conducted for all the plant species. For all the treatments stem long, leaves and leaflets numbers, leaf surface, ramifications, nodes number, main and laterals root long. were registered. There were taken tissue samples for further analysis and dry matter from shoot and root, nodulation was registered, as well as N biological fixation and N total content. G. astragalina and A. lotoides are rhizomatic plants that during the first stage of their development have a stem base or crown that could be similar to the one described for A. cruckshanksii. All species shown underground areas with buds for persistence and growing. At lower levels of soil moisture, less mass of meristematic tissue was formed. This conducted to a lower development of buds bank and least differentiation of secondary tissue which in turn generated smaller cells and thinner leaflets. Germination was hampered in A. cruckshanksii and A lotoides from -0,8 MPa, and G. astragalina decreased its germination potential from -0,4 MPa. A.cruckshanksii was the species that shown the best emergency behavior. Plants are affected by water disponibility at the analyzed parameters, but it is possible that they could present genetic adaptatives characters to water deficit. The study also demonstrated survival, infectivity and efectivity of native Rhizobium strains, and, on the other hand, nodulation capacity of Legumes analyzed at the water deficit conditions of the treatments. A. lotoides got the highest total N percentage in the underground biomass at the 15% soil moisture treatment.

Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2017-07-17T19:02:52Z No. of bitstreams: 2 Dissertação Pedro Chaves PPG ATU Definitiva Pedro Chaves ATU.pdf: 2840827 bytes, checksum: 10ddf6bca5fe5cbaf202777b9aa62728 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-17T19:02:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação Pedro Chaves PPG ATU Definitiva Pedro Chaves ATU.pdf: 2840827 bytes, checksum: 10ddf6bca5fe5cbaf202777b9aa62728 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-12-16 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / The pumpkins belong to the genus Cucurbita and are vegetables that present wide genetic variability and versatility of use in human food due to its medicinal properties and nutritional composition, being highlighted the carotenoids (precursors of vitamins A), the presence of vitamin C and mineral salts. They are cultivated by family farmers in lowland and dry land areas in riparian communities in the State of Amazonas. They are among the main species of economic interest in the Amazon region. However, in the selection of fruits for commercialization, many are left in the rural properties, fairs and marketing centers for not meeting the characteristics demanded by the consumers that aim at greater practicality and quality of the fruits. The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of populations of pumpkins cultivated in the metropolitan region of Manaus using phenological and agronomic descriptors. Thirteen populations of pumpkins cultivated in the metropolitan region of Manaus were evaluated and maintained in the germplasm collection of the National Research Institute of the Amazon (INPA). The experiments were carried out simultaneously at Experimental Vegetable Stations (EEH INPA), located at Km 14 of the state highway AM 010, in the Red-Yellow Argisol soil and in the Experimental Farm of the Federal University of Amazonas - UFAM (Fazenda UFAM) , Located at Km 38 of federal highway BR 174, in Latossolo Amarelo, municipality of Manaus-AM. Of the 13 populations evaluated, nine were identified as milk squash (Cucurbita moschata) and four populations such as cabocla squash (C. maxima). In the phenological evaluations of the POPs it was observed that the germination of the seeds occurred between three and four days, with greater percentage (95%) in three days. The flowering, fruiting and maturation phases of the fruits in the EEH INPA occurred at 32, 43 and 82 days after transplanting between the earliest and 43, 54 and 93 days among the later ones, respectively. In the area of the Fazenda UFAM, the flowering, fruiting and maturation phases of the fruit occurred at 23, 34 and 71 days after transplanting between the earliest and 31, 45 and 84 days among the later ones. The quantitative data were submitted to analysis of variance and tests of means. Significant contrasts were detected at a 5% probability level by the Tukey test. In the area of EEH INPA, the POPs of Iranduba (13.17 t ha-1) and Silves (11.69 t ha-1) were the ones that had higher productivity. At the Fazenda UFAM, the POPs of Iranduba (21.72 t ha-1) and Presidente Figueiredo (19.22 t ha-1) were the ones that had the highest productivity. As for fruit mass and pulp thickness, POPs from Iranduba, Presidente Figueiredo, Rio Preto da Eva, Silves and Manaus obtained the highest results among the 13 POPs evaluated. At EEH INPA and Fazenda UFAM, heritability was higher than 80% for fruit mass (89.62% and 83.80%), fruit length (88.74% and 86.43%), diameter of the fruit (90.72% and 90.12%) and internal fruit cavity width (87.50% and 87.45%), respectively. By means of the grouping using the generalized distances of Mahalanobis (D2), through the Medium Link Between Groups method (UPGMA) it can be inferred that there is genetic divergence among the 13 populations evaluated in the two experimental areas. This finding can be observed by the formation of four (EEH INPA) and five (Fazenda da UFAM) distinct groups. The phenotypic variability detected in the populations (POPs) allows the selection of several genetic materials, which can be immediately used in breeding programs for pumpkins in the state of Amazonas. / As abóboras pertencem a gênero Cucurbita e são hortaliças que apresentam ampla variabilidade genética e versatilidade de uso na alimentação humana, devido suas propriedades medicinais e composição nutricional, com destaque aos carotenóides (precursores de vitaminas A), a vitamina C e sais minerais. São cultivadas por agricultores familiares nas áreas de várzea e terra firme em comunidades ribeirinhas do Estado do Amazonas. Estão entre as principais espécies de interesse econômico na região Amazônica. No entanto, na seleção dos frutos para comercialização, muitos são deixados nas propriedades rurais, feiras e centros de comercialização por não atender às características exigidas pelos consumidores que visam maior praticidade e qualidade dos frutos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética de populações de abóboras cultivadas na região metropolitana de Manaus, utilizando descritores fenológicos e agronômicos. Foram avaliadas treze populações de abóboras, mantidas na coleção de germoplasma do Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia - INPA. Os experimentos foram conduzidos, simultaneamente, nas Estações Experimentais de Hortaliças do INPA (EEH INPA), localizada no km 14 da rodovia estadual AM 010, em solo Argissolo Vermelho-Amarelo e na Fazenda Experimental da Universidade Federal do Amazonas – UFAM (Fazenda UFAM), localizada no km 38 da rodovia federal BR 174, em Latossolo Amarelo, município de Manaus-AM. Das 13 populações avaliadas, nove foram identificadas como abóbora de leite (Cucurbita moschata) e quatro populações como abóbora cabocla (C. maxima). Nas avaliações fenológicas das POPs observou-se que a germinação das sementes ocorreu entre três e quatro dias, com maior percentual (95%) em três dias. A fase de floração, frutificação e maturação dos frutos na EEH INPA aconteceu aos 32, 43 e 82 dias após o transplantio entre as mais precoces e 43, 54 e 93 dias entre as mais tardias, respectivamente. Na área da Fazenda da UFAM, a fase de floração, frutificação e maturação dos frutos, aconteceu aos 23, 34 e 71 dias após o transplantio entre as mais precoces e 31, 45 e 84 dias entre as mais tardias. Os dados quantitativos foram submetidos a análises de variância e testes de médias. Foram detectados contrastes significativos em nível de 5% de probabilidade pelo teste de Tukey. Na área da EEH INPA, as POPs de Iranduba (13,17 t ha-1) e Silves (11,69 t ha-1), foram as que tiveram maior produtividade. Na Fazenda da UFAM, as POPs de Iranduba (21,72 t ha-1) e Presidente Figueiredo (19,22 t ha-1) foram as mais produtivas. Quanto ao caráter massa dos frutos e espessura da polpa, as POPs oriundas de Iranduba, Presidente Figueiredo, Rio Preto da Eva, Silves e Manaus apresentaram os melhores resultados entre as 13 POPs avaliadas. Na EEH INPA e Fazenda UFAM, os valores de herdabilidade estiveram acima de 80% para os caracteres massa do fruto (89,62% e 83,80%), comprimento do fruto (88,74% e 86,43%), diâmetro do fruto (90,72% e 90,12%) e largura da cavidade interna do fruto (87,50% e 87,45%), respectivamente. Por meio do agrupamento utilizando as distâncias generalizadas de Mahalanobis (D2), através do método de Ligação Média entre Grupos (UPGMA) pode-se inferir que existe divergência genética entre as treze populações avaliadas nas duas áreas experimentais. Essa constatação pode ser observada pela formação de quatro (EEH INPA) e cinco (Fazenda da UFAM) grupos distintos. A variabilidade fenotípica detectada nas populações (POPs) permite a seleção de vários materiais genéticos, que podem ser imediatamente utilizados em programas de melhoramento genético de abóboras no Estado do Amazonas.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-23T01:29:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 241442.pdf: 398933 bytes, checksum: 6be192fee8ab73ef2bc1970bfc2ce3ff (MD5) / Estudou-se a ecologia da polinização da amoreira-preta (Rubus sp.), da família Rosaceae, por meio de testes de polinização, análise da produção de néctar e da amostragem de visitantes florais em área de cultivo comercial. Objetivou-se, especificamente, confirmar a síndrome de polinização de Rubus sp, através da análise de sua biologia floral e alocação de recursos florais para os insetos. Objetivou-se, também, avaliar a importância das abelhas como vetores de pólen e se esta associação influencia positivamente no sucesso reprodutivo de Rubus sp. Os experimentos foram realizados em uma área de cultivo de amoreira-preta, durante a florada no município de Timbó, SC (Latitude 26°46'38,5'' S e Longitude 49°15'42,0'' W). Para a avaliação do potencial polinizador de Rubus sp., foram introduzidos, próximo ao cultivo das amoreiras, oito ninhos de abelhas "sem-ferrão" (Apidae, Meliponineae), sendo dois de cada espécie: Melipona marginata, Melipona quadrifasciata, Plebeia droryana e Plebeia remota. Constatou-se que a maior taxa de frutificação (48,3 % ± 3,2) ocorreu via polinização livre (natural). Foi verificada a ocorrência de autopolinização, porém com uma taxa de frutificação inferior (12,2% ± 4,9). Não foi verificada, nas plantas (N=40), a formação de frutos agamospérmicos e partenocárpicos. A anemofilia também não foi constatada na espécie. A avaliação de néctar potencial e néctar instantaneamente disponível em Rubus sp., por meio da análise do volume e da concentração de sacarose resultou em valores compatíveis com a síndrome de melitofilia (polinização por abelhas). Os valores médios de produção diária por flor foram de 6,41 ± 0,15 µL, com concentração de sacarose que variou de 11,6 a 29,5 °Brix. A comparação entre o néctar potencial e o néctar instantaneamente disponível se mostrou diferente nos horários de maior visitação por abelhas, corroborando com a síndrome de polinização entomófila, especialmente por abelhas. Os visitantes florais coletados e observados sobre as flores de Rubus sp. foram predominantemente abelhas (Hymenoptera) (97%), que iniciam a atividade de forrageamento às 7h, com pico de atividade às 11h e declinando até as 17h. As 48 coletas resultaram numa amostragem de 1.360 abelhas, divididas em quatro famílias e 13 espécies. A família com maior riqueza de espécies (N = 7) foi Halictidae e a mais abundante foi Apidae, com 1.288 indivíduos. Em Apidae houve o predomino da espécie exótica Apis mellifera, cuja representação foi de 1.246 indivíduos. Apidae também foi representada por indivíduos das espécies Melipona marginata (N= 21), Plebeia droryana (N= 13) e Plebeia remota (8). Os dados da abundância e as observações naturalísticas apontaram A. mellifera como o principal polinizador de Rubus sp, na área amostrada, mas confirma que as demais espécies de abelhas também podem exercer um papel no processo de polinização de Rubus sp. Das espécies da subfamília Meliponineae introduzidas na área de estudo, recomenda-se Melipona marginata, que, além da sua maior representatividade na amostragem, apresenta comportamento forrageiro mais adequado à polinização de Rubus sp., e pode contribuir para a produção de frutos em pomares de amoreira-preta. In this study we verified the pollination ecology of the blackberry (Rubus sp.) (Rosaceae), by means of pollination tests, analysis of the nectar production and sampling of the floral visitors in a commercial orchard. The specific objective was to confirm the pollination syndrome of Rubus sp, through analysis of its floral biology and allocation of floral resources for the flower visiting insects. We intended, also, to evaluate the importance of bees as vectors of pollen and if this association influenced positively the reproductive success of Rubus sp. The experiments were carried out in a flowering orchard of blackberry, in Timbó, SC, (latitud 26°46' 38,5'' S and longitud 49°15'42,0'' W). For the evaluation of the potential pollinators of Rubus sp., we introduced, next to the blackberry orchard, ten nests of stingless bees (Apidae, Meliponinae), belonging to the species: Melipona marginata, Melipona quadrifasciata, Plebeia droryana and Plebeia remota. The highest fruit set (48.3% ± 3,2) occurred in the free pollination test (natural). Self-pollination was verified, however with a lower fruit set (12.2% ± 4.9) as compared to the natural pollination test. It was not observed in the plants (N=40), the formation of agamospermic or parthenocarpic fruits. Wind pollination was also not observed in the species. The nectar potential and the nectar standing crop evaluation in Rubus sp., by means of the analysis of its volume and its concentration of sucrose, presented values, compatible with the melittophily syndrome (pollination by bees). The average volumes of nectar daily produced by each flower was 6.41 ± 0.15 µL with a sucrose concentration that varied between 11.6 and 29.5°Brix. The comparison between the volumes of nectar potential and nectar standing crop, showed high differences in the hours of higher visitation rates by bees, corroborating the pollination by insects' syndrome, especially by bees. The floral visitors collected and observed on the flowers of Rubus sp. were predominantly bees (Hymenoptera) (97%), which initiate their foraging activity around 7 am, with a peak of activity around 11 am, and the activity declining until 17 pm. In the 48 hours of collection we sampled 1.360 bees, included in four families and 13 species. The family represented in the survey with the highest number of species (N = 7) was Halictidae and the most abundant family was Apidae, with 1.288 individuals. In Apidae there was observed a predominance of the exotic species Apis mellifera, represented in the survey by 1.246 individuals. Apidae was also represented by individuals of the species Melipona marginata (N= 21), Plebeia droryana (N= 13) and Plebeia remota (8). The data of the abundance and the behavior of the visiting insects pointed A. mellifera as the main pollinator of Rubus sp, in the studied area, but also suggest that many species of wild bees also might be important in pollinating Rubus sp. Of the species of Meliponinae, introduced in the study area, we suggest that Melipona marginata, due to its higher abundance in the orchard, and by presenting a more adequate foraging behavior while visiting Rubus sp. flowers, can contribute effectively to increase the production of fruits in blackberry orchards.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-24T00:20:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 263046.pdf: 5159222 bytes, checksum: cb415f68a42e21eb3558a03c271f9032 (MD5)

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2017. / Made available in DSpace on 2017-10-03T04:17:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348732.pdf: 1781969 bytes, checksum: 0f07f5bdc6d9c073d363acb1e97aa593 (MD5) Previous issue date: 2017 / A mesorregião serrana de Santa Catarina tem se destacado na produção de vinhos finos e espumantes. No entanto, a região apresenta elevada precipitação pluviométrica, o que favorece o aparecimento de doenças, como o míldio, que constituem um risco para a viticultura e podem reduzir substancialmente a produtividade. A região do Trentino Alto Adige na Itália é famosa pela produção de vinhos finos, entretanto a utilização de variedades europeias por todo o território torna-se um foco de ataque por míldio também. Nas últimas décadas diferentes genótipos e variedades de videiras resistentes ao míldio foram desenvolvidos, entretanto existe a preocupação de que o patógeno possa ter evoluído com o passar dos anos e com a criação de novas variedades. Neste sentido, o objetivo principal do presente estudo foi avaliar no Brasil os efeitos dos loci de resistência Rpv1 e Rpv3 (individual e piramidados) sobre o progresso da doença de Plasmopara viticola durante todo o ciclo vegetativo e reprodutivo dos genótipos do programa de melhoramento genético da UFSC Curitibano; e na Itália o principal objetivo foi avaliar as diferenças moleculares entre isolados de míldio coletados na região do Trentino Alto Adige e determinar se existem diferentes níveis de agressividade nos genótipos e variedades estudados. As plantas da população UFSC-2012-1 foram selecionadas e divididas em quatro grupos de resistência: 1) Nenhum loci de resistência; 2) Apenas Rpv1; 3) Apenas Rpv3 e 4) Rpv1 + Rpv3. A gravidade da doença foi monitorada durante as estações 2014/2015 e 2015/2016. Foram construídas curvas de progresso da doença do míldio e foram comparadas as epidemias de cada grupo de resistência utilizando quatro medidas epidemiológicas: início da aparência dos sintomas (BSA), tempo para atingir a gravidade máxima da doença (TRMDS), gravidade máxima da doença (Smax) e área sob a doença Curva de progresso (AUDPC). 41 marcadores SSR foram utilizados na análise genética de sete isolados de Plasmopora viticola. Doze variedades / genótipos hospedeiros foram utilizados para as inoculações cruzadas com quatro isolados de P. viticola. Os hospedeiros foram divididos em dois grupos: susceptível (SUS) e resistente ou parcialmente resistente (R ou PAR) a P. viticola, contendo diferentes QTLs conferindo resistência a P. viticola (Rpv). A escala OIV-452-1 foi utilizada em discos foliares para avaliar a resistência dos genótipos ao patógeno. Nos genótipos do programa de melhoramento da UFSC Curitibanos, os grupos contendo apenas um dos loci de resistência revelaram apenas resistência parcial a P. viticola; contudo, quando os loci foram piramidados, o controle do progresso da doença foi completo. Na Itália, a comparação molecular e fenológica de isolados de míldio coletados em diferentes vinhedos da região mostrou que existem diferenças genéticas entre eles e sua agressividade em diferentes genótipos de Vitis também foram demonstrados.<br> / Abstract : The mountainous region of Santa Catarina has been excelling at the production of fine and sparkling wines. However, the region presents high rainfall, which favors the emergence of diseases that are a risk to viticulture and can substantially reduce productivity. The region of Trentino, Alto Adige in Italy, is famous for the production of fine wines. Conversely, the use of grape varieties throughout the territory has become a focus of attack by mildew. In the last decades, different mildew resistant genotypes and varieties of vines have been developed; notwithstanding, there is concern that the pathogen may have evolved over the years with the creation of new varieties. In this sense, the main objective of the present study was to evaluate, in Brazil, the effects of resistance loci Rpv1 and Rpv3 ? individual and pyramidal ? on the progress of Plasmopara viticola disease throughout the vegetative and reproductive cycles of the genotypes in the breeding program UFSC Curitibanos. In Italy, the main objective was to evaluate the molecular differences between isolates collected in the Trentino Alto Adige region, and to determine if there are different levels of aggression in the genotypes and varieties studied. The plants of the UFSC-2012-1 population were selected and divided into four resistance groups: 1) No resistance loci; 2) Rpv1 only; 3) Only Rpv3 and 4) Rpv1 + Rpv3. The severity of the disease was monitored during the 2014/2015 and 2015/2016 seasons. Progress curves for mildew disease were constructed and the epidemics of each resistance group were compared using four epidemiological measures: symptom onset (BSA), time to maximum disease severity (TRMDS), maximum disease severity ( Smax) and area under the Disease Progress Curve (AUDPC). The use of 41 SSR markers was implemented in the genetic analysis of seven isolates of Plasmopora viticola. In total, 12 host varieties / genotypes were used for cross inoculation with four isolates of P. viticola. The hosts were divided into two groups: susceptible (SUS) and resistant or partially resistant (R or PAR) to P. viticola, containing different QTLs, which confer resistance to P. viticola (Rpv). The OIV-452-1 scale was used in leaf discs to evaluate the resistance of the genotypes to the pathogen. In the breeding program genotypes of UFSC Curitibanos, groups containing only one of the resistance loci revealed only partial resistance to P. viticola; however, when the loci were pyramided, full control of the disease progress was attained. In Italy, the molecular and phenological comparison of mildew isolates collected from different vineyards in the region, revealed the existence genetic differences between them ? and their aggressiveness in different genotypes of Vitis were also demonstrated.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2014 / Submitted by GLENDA RANY MÁXIMO DE SOUZA (rany.maximo@gmail.com) on 2014-09-12T15:32:46Z No. of bitstreams: 1 2014_RicardoMenesesSayd.pdf: 1397603 bytes, checksum: f81dad44bbde5161fab98d6dec50fff9 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2014-09-12T15:52:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_RicardoMenesesSayd.pdf: 1397603 bytes, checksum: f81dad44bbde5161fab98d6dec50fff9 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-12T15:52:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_RicardoMenesesSayd.pdf: 1397603 bytes, checksum: f81dad44bbde5161fab98d6dec50fff9 (MD5) / A cultura da cevada (Hordeum vulgare L.) tem se mostrado com alto potencial para integrar sistemas de produção do Cerrado irrigado em razão da sua capacidade agronômica de adaptação e pela crescente demanda por essa commodity. Todavia, apenas a cevada tradicional ou com casca, com viés cervejeiro, vem sendo explorada pelos melhoristas brasileiros. Nos últimos anos, a cevada nua ou ‘’Hulless barley’’, tem despertado um grande interesse devido as suas propriedades físico-químicas relacionadas à saúde. Essas características podem ser aproveitadas tanto para malteação como na alimentação animal e humana, dando oportunidade e oferta ao negócio agrícola, de forma a incluir novas oportunidades comerciais. Nesse sentido, ações de pesquisa e desenvolvimento são necessárias para gerar informações moleculares e agronômicas de diferentes acessos de cevada nua e, posteriormente, utilizar a variabilidade genética para o desenvolvimento de cultivares adaptadas. Neste trabalho, objetivou-se quantificar e caracterizar a variabilidade genética de 18 acessos de cevada nua com base em marcadores moleculares e caracteres agronômicos, além de selecionar acessos com características agronômicas desejáveis para cultivo no sistema de produção irrigado no Cerrado. Foram avaliados 18 acessos de cevada nua, além de três acessos de cevada com grãos cobertos que serviram como referência. Os experimentos foram realizados em dois locais no Distrito Federal: na Embrapa Cerrados, Planaltina-DF, situada a 15º35’30’’ de latitude Sul e 47º42’30’’ de longitude Oeste, numa altitude de 1.007 m; e na Embrapa Produtos e Mercado (SPM), localizada em Recanto das Emas-DF a 15°54’53’’ de latitude Sul e 48°02’14’’ de longitude Oeste, em uma altitude de 1.254 m, ambos irrigados via pivô central, de maio a Setembro de 2012. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos ao acaso com três repetições. As características avaliadas foram: rendimento de grãos, classificação comercial de primeira, segunda e terceira classe, peso de mil sementes, altura de plantas, grau de acamamento, ciclo de espigamento, peso hectolítrico e teor de proteína no grão. A caracterização molecular foi realizada com base em 157 marcadores moleculares RAPD e nos dez caracteres agronômicos. Foram obtidas as matrizes de distância genética entre os genótipos com base em marcadores moleculares e características quantitativas. Foram realizadas análises de agrupamento e dispersão gráfica dos acessos. Foi constatada alta variabilidade genética molecular e agronômica entre os acessos, possibilitando a utilização das mesmas pelo programa de melhoramento genético. Observou-se tendência de agrupamento dos genótipos etíopes e uma significativa dispersão dos genótipos brasileiros, os quais apresentaram maior variabilidade genética molecular. Com base nas características agronômicas, foram verificados dois agrupamentos mais consistentes, um com os materiais dísticos e outro com os hexásticos. Os genótipos mais divergentes foram os dísticos CI 13453, CN Cerrado 5, CN Cerrado 1 e CN Cerrado 2. Os genótipos PI 356466, CN Cerrado 1, PI 370799 e CI 13453 apresentaram características 8 agronômicas de interesse e foram distintos geneticamente, sendo indicado para a base de cruzamentos visando à seleção de genótipos promissores, maximizando os efeitos heteróticos e a complementaridade gênica dentro do programa de melhoramento genético da cevada nua irrigada no Cerrado. Os dados obtidos na caracterização agronômica foram submetidos à análise de variância e as médias agrupadas entre si pelo teste de Tukey. Foram detectadas diferenças significativas a 1% entre os acessos para todas as características avaliadas. Há possibilidade de se obter ganhos genéticos devido aos elevados valores do coeficiente de variação genotípico. Foi observada alta herdabilidade para todas as características, exceto para teor de proteína, possibilitando a transferência de características de interesse dos genitores para seus descendentes. Os acessos CI 13453, CN Cerrado 1, CN Cerrado 2, CN Cerrado 5 e PI356466 destacaram-se dos demais em relação as características agronômicas, rendimento de grãos, classificação comercial de primeira, acamamento e proteína. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The barley (Hordeum vulgare L.) has shown a high potential for integrating irrigated production systems in the Brazilian Savanna due to its agronomic adaptability and to the increasing demand for this commodity. However, only the traditional or covered barley, with brewing characteristics, has been explored by Brazilian breeders. In recent years, the naked barley, or hulless barley, has aroused great interest due to its physical and chemical properties related to health. These characteristics can be availed for both malting and human or animal feeding, providing opportunity and supply to the agriculture business, in a way to include new commercial opportunities. In this sense, actions in research and development are needed to generate molecular and agronomic information from different barley accessions and, posteriorly, use the genetic variability for the development of adapted cultivars. In this study, it was aimed to quantify and characterize the genetic variability of 18 accessions of hulless barley based on molecular markers and agronomic traits, and select accessions with desired agronomic traits for cultivation in irrigated production system in the Brazilian Savanna. Eighteen accessions of hulless barley were evaluated, and three accessions of covered barley served as reference. The experiments were performed in two sites in Distrito Federal: Embrapa Cerrados, Planaltina-DF, 15º35’30’’ latitude south and 47º42’30’’ longitude West, 1.007 meters high; and Embrapa Produtos e Mercado (SPM), Recanto das Emas-DF, 15°54’53’’ latitude South and 48°02’14’’ longitude West, 1.254 meters high, both irrigated via central pivot, from May to September of 2012. It was used the randomized blocks experimental design with three replicates. The evaluated characteristics were: grain yield; commercial classification of first, second, and third class; thousand seeds weight; plant height; lodging level; earing cycle; hectoliter weight; and grain protein content. The molecular characterization was performed based on 157 RAPD molecular markers and on the ten agronomic traits. Matrices of genetic distance among the genotypes were obtained based on molecular markers and quantitative traits. Graphic grouping and dispersion analysis of the accessions were made. High molecular and agronomic genetic variability were found among the accessions, enabling their use by the breeding program. It was observed a tendency to grouping among the Ethiopian genotypes and a significant dispersion among the Brazilian genotypes, which presented higher molecular genetic variability. Based on the agronomic characteristics, two more consistent groupings were identified, one with the two-rowed materials and another with the six-rowed materials. The more divergent genotypes were the two-rowed CI 13453, CN Cerrado 5, CN Cerrado 1, and CN Cerrado 2. The PI 356466, CN Cerrado 1, PI 370799, and CI 13453 genotypes presented agronomic traits of interest and were genetically different, being indicated for the crossing base aiming promising genotypes selection, maximizing the heterotic effects and the genic complementarity inside the breeding program of the hulless irrigated barley in the Cerrado. 10 The data obtained in the agronomic characterization were subjected to the statistical analysis of variance and the grouped means where analyzed by the Tukey test. Significant differences were observed at 1% among the accessions for all the evaluated traits. There’s the possibility of obtaining genetic gains due to the high values of the genotypic variation coefficient. High heritability was found for all the characteristics, except protein content, enabling the trait of interest transfer from the parents to the descendants. The accessions CI 13453, CN Cerrado 1, CN Cerrado 2, CN Cerrado 5, and PI356466 stood out among the others in relation to the agronomic traits, grain yield, commercial classification of first class, lodging, and protein content.

Made available in DSpace on 2018-03-22T15:59:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8343_Tese Final Alessandra de Abreu Rodrigues Vieira.pdf: 2138393 bytes, checksum: fa716e87b05ac28bf19a1741c1bb67e6 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / A fragmentação de habitats decorrente da perturbação antrópica, modifica a paisagem dos ambientes florestais, entre eles, a Floresta Atlântica que hoje se encontra como um conjunto de fragmentos florestais isolados. A situação atual desse bioma vem causando a extinção local de várias populações e outras vêm sofrendo perdas inestimáveis de variabilidade genética. Astronium concinnum Schott (Gonçalo-Alves) e Senefeldera verticillata (Vell.) Croizat (Sucanga), são espécies arbóreas que têm característica adequadas para serem aproveitadas nos projetos de parques e jardins, além do uso farmacológico. A compreensão sobre os padrões de diversidade genética de uma espécie é um fator determinante na tomada de decisões para preservação, manejo e recuperação de áreas degradadas. Nesse sentido, amostras foliares de A. concinnum e S. verticillata foram coletadas em duas unidades de conservação, na Floresta Nacional (FLONA) de Pacotuba e na Reserva Particular do Patrimônio Natural (RPPN) Cafundó, localizadas em Cachoeiro de Itapemirim, ES. O objetivo principal desse estudo foi avaliar a diversidade genética, utilizando marcadores moleculares Inter Simple Sequence Repeats (ISSR) e, a partir dos resultados, inferir sobre o manejo mais adequado de preservação dessas espécies, além de selecionar árvores mais divergentes geneticamente para produção de mudas destinadas a recuperação de áreas degradadas da região. Também, foi realizada uma comparação entre quatro diferentes protocolos, tendo por objetivo, o isolamento de DNA genômico puro da espécie S. verticillata. Para a espécie A. concinnum, oito primers forneceram 121 fragmentos de DNA, com 73,55% de polimorfismo. A diversidade genética de Nei (H) e índice de diversidade de Shannon (I) foram 0,312 e 0,473, respectivamente. O fluxo gênico (Nm) foi de 10,629. A análise de variância molecular (AMOVA) identificou que, 92,54% da diversidade genética ocorrem dentro da população. Foi identificada a formação de três grupos, por meio da análise Bayesiana. Pelo método de agrupamento de médias aritméticas não ponderadas (UPGMA), foi observada a formação de sete grupos. Objetivando o isolamento de DNA genômico puro de S. verticillata quatro protocolos foram comparados. O protocolo 1, Doyle e Doyle (1990) modificado pelo Instituto Agronômico de Campinas (IAC), forneceu DNA com pureza de 1,96 e a maior concentração média de DNA (224,22 ng/&#956;L). O protocolo 2, Doyle e Doyle (1990) modificado pelo IAC, com alterações nas concentrações de Polivinilpirrolidona (PVP) e &#946;-mercaptoetanol, forneceu pureza semelhante ao do protocolo 1 e concentração média de 201,02 ng/&#956;L. Com o protocolo 3, Doyle e Doyle (1990) modificado pelo IAC, com alterações nas concentrações de PVP, &#946;-mercaptoetanol e adição de Albumina de Soro Bovino (BSA), foram obtidos valores de 65,75 ng/&#956;L e 1,5 de concentração e pureza de DNA, respectivamente. Por fim, no protocolo 4, Doyle e Doyle (1990) com adição de Proteinase K, obteve-se valores de 67,6 ng/&#956;L de concentração e pureza de 1,66. Os resultados de pureza de DNA, nos protocolos 3 e 4, indicaram que houve contaminação por proteínas durante o processo de extração. Sugere-se, a utilização do protocolo 1 para obtenção de DNA de boa qualidade de S. verticillata. Para as análises de diversidade genética de S. verticillata foram utilizados doze primers ISSR, resultando em um total de 179 produtos de amplificação, com 75,97% de bandas polimórficas. Os resultados de H e I foram 0,329 e 0,503, respectivamente. O Nm estimado foi de 13,542. Maior diversidade genética foi constatada dentro das populações (94,98%), por meio dos resultados da AMOVA e, entre populações, o resultado foi de 5,02%. A análise Bayesiana de agrupamento forneceu a formação de três grupos. O dendrograma obtido pelo método UPGMA forneceu a formação de seis grupos. Por meio dessa pesquisa, foi constatada que, a maior diversidade genética ocorre dentro das populações, para ambas as espécies. Foram identificados indivíduos de A. concinnum e S. verticillata mais divergentes geneticamente e que, podem ser selecionadas como árvores matrizes para o fornecimento de sementes com variabilidade genética. Também, foi possível obter um protocolo que resultou em amostras de DNA de S. verticillata com maior qualidade.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Curso de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-18T00:40:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Muitas evidências sugerem que animais frugívoros sejam críticos para a reprodução de várias árvores tropicais, e que plantas com frutos sejam importantes para muitas espécies de aves e mamíferos nas florestas tropicais. O presente estudo procurou conhecer aspectos da dispersão de sementes de Virola bicuhyba (Schott) Warb. no parque Botânico do Morro Baú (26° 47'10" e 26° 50'15" S; 48° 55'33" e 48°57'35" W), um fragmento florestal com 700 hectares de área, localizado na Bacia Hidrográfica do Itajaí, em uma parcela de 3 hectares de Floresta Ombrófila Densa Primária pouco alterada. Caracterizaram-se aspectos relacionadas a estrutura populacional da espécie, chuva de sementes, fenologia reprodutiva e biometria das sementes em relação a dispersão de sementes. Os agentes de dispersão primários e secundários foram também caracterizados. Com diâmetro acima do peito superior a 5 cm registrados, 82 indivíduos de Virola bicuhyba foram mapeados. A distância média entre os indivíduos ficou em 19,13 metros. Considerando-se apenas os indivíduos femininos, a distância encontrada foi de 32,16 metros. A floração iniciou-se em dezembro, indo até março, com pico de floração em dezembro e início de janeiro. Pela avaliação da morfologia dos sementes, observou-se que estas apresentam uma considerável variação no tamanho. Em média, 31% do peso fresco total da semente corresponde ao arilo (n= 55 diásporos, Dp: 0,06). Onze espécies de aves foram identificadas explorando 101 sementes ariladas, que consumiram partes do arilo ou ingeriam totalmente os diásporos. Quatro espécies de aves, Ramphastos dicolorus, Selenidera maculirostris, Turdus albicollis e Platycichla flavipes, apresentaram a capacidade de engolir as sementes ariladas. Entre os derrubadores de sentes destacou-se Turdus albicollis. Algumas aves apresentaram o comportamento de transportar sementes para fora da área de influência da copa do bico, como: Turdus albicollis, Platycichla flavipes e Melanerpes flavifrons. Após a visita, as espécies de aves partiam para copas vizinhas com deslocamentos que atingiram uma média de 24,66 metros (Dp = 13,66). Nas amplitudes de deslocamento o máximo observa-se foi uma distância de 80 metros, realizado por Ramphastos dicolorus (Ramphastidae). O "índice potencial de fluxo gênico via semente" calculado foi de 4,18 vezes maior do que a distância média entre as plantas de bicuíba estudadas. Quatro roedores (Muridae) foram capturados, sendo dois gêneros Akodon e dois do gênero Oryzomis, um marsupial, Monodelphis sp. e uma ave, Turdus albicollis. Formigas também procuraram as sementes para consumir o arilo. Todos estes elementos, associados ao fato de uma estimativa de fluxo gênico via semente relativamente alto, proporcionado pelo comportamento exercido pelo conjunto de animais, levam a acreditar que V. bicuhyba, dentro deste fragmento florestal, ainda encontre as condições necessárias para seu estabelecimento e posterior recrutamento.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-24T13:56:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 265369.pdf: 1439894 bytes, checksum: ae817d58e8578515df8266190b001945 (MD5) / Em coletas realizadas no sul do Brasil, acessos de Paspalum foram caracterizados e comparados entre si, a partir da análise de grupos distintos, que sugerem a ocorrência de diferentes hibridações na origem dos materiais com distintos níveis de ploidia. Para pentaplóides supostamente oriundos de hibridações naturais interespecíficas, foram levantadas características que aproximam os acessos V14285, V14289 e V14860 de Paspalum dilatatum biótipo #Torres# (V14401) ou de P. urvillei (V14392), com valores intermediários para o número de afilhos e a altura do primeiro entrenó visível. Verificou-se também, a presença de grãos de pólen não corados ou dimórficos em todos os pentaplóides deste primeiro grupo. Já nos pentaplóides supostamente oriundos de hibridações intraespecíficas, foram encontrados valores intermediários para as características morfológicas. Quanto aos aspectos citogenéticos, verificou-se desbalanço na divisão celular nos pentaplóides, com dimorfismo e baixa viabilidade de pólen. Um acesso heptaplóide, reportado pela primeira vez do Brasil, apresentou vários arranjos celulares, formando díades, políades e tétrades normais, configurando irregularidades na meiose. No entanto, houve formação de sementes, com germinação superior a 50%. / In germplasm collections undertaken in Southern Brazil, accessions of Paspalum have been characterized and compared, according to distinct groups, that suggest the occurrence of distinct hybridizations in the origin of materials with distinct ploidy levels. Morphological features were surveyed for pentaploids supposed originated from interspecific natural crosses, which locate the accessions V14285, V14289 e V14860 closer to the Paspalum dilatatum #Torres# biotype (V14401) or to P. urvillei (V14392), with some features presenting intermediate values, such as the number of shoots, and the height of the first visible node. Unstained and dimorphic pollen grains were observed in all pentaploids of this group. As concerns pentaploid accessions supposedly originated from intraspecific natural hybridizations, intermediate values were found for morphological features. Concerning cytogenetic aspects, unbalanced cell division, dimorphic pollen, and low pollen viability estimates were observed in pentaploids. A heptaploid accession, for the first time reported from Brazil, has shown variable and abnormal meiotic behavior, forming diads, polyads, and normal tetrads. However, normal seed was developed, with germination above 50%.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T06:44:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 287627.pdf: 1226059 bytes, checksum: 2337976f95da6827275c91baaf2701fc (MD5) / Cedrela lilloi (Meliaceae) é uma das quatro espécies de cedro nativas da Argentina e encontra-se estritamente distribuída na Selva de Yungas na região noroeste do país. Como tantas outras espécies florestais de importância econômica, as populações de C. lilloi encontram-se vulneráveis a exploração e fragmentação. No país são escassos os estudos referentes à diversidade e estrutura genética destas populações. Assim, os objetivos principais deste estudo foram a) desenvolver marcadores microssatélites específicos para a espécie e, b) estimar a variabilidade genética de três populações naturais. O DNA genômico de C. lilloi foi digerido com enzima, purificado, enriquecido através de sondas de oligos CT(8), GT(8) e TTC(8), clonado em bactérias e finalmente isolado e sequenciado. Dos 258 clones sequenciados, a porcentagem total de sequências microssatélites observadas foi muito baixa (14%). Foram desenhados iniciadores para essas 37 regiões microssatélites encontradas e somente quatro locos amplificaram produtos polimórficos. Devido a que os poucos locos desenvolvidos não foram suficientes para analisar as populações, foi considerado a alternativa da transferibilidade. Foram transferidos cinco iniciadores provenientes de outras espécies da família Meliaceae. No total, foram utilizados oito locos, três próprios de C. lilloi e cinco transferidos (média de 5,25 alelos), para analisar três populações com um total de 140 indivíduos. Nenhum loco apresentou desequilíbrio de ligação e não foi observada a presença de alelos nulos. A heterozigosidade observada (Ho) total foi de 0,406 e a esperada (He) de 0,416. O índice de fixação dentro das populações (FIS=0,035) não foi estatisticamente diferente de zero, indicando que a probabilidade de acasalamento entre indivíduos aparentados não é diferente do esperado no equilíbrio de Hardy-Weinberg. A endogamia a nível grupal (FIT=0,140) e a diferenciação genética entre as populações foram iguais e moderadas (FST=0,108), indicando que as populações estão estruturadas por causa da perda de alelos devido à deriva genética. As duas populações da região norte das Yungas (Baritú e San Andrés) foram geneticamente mais similares entre si e apresentaram maior diversidade gênica em comparação a população amostrada na região sul (El Siambón).