Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2008. / Submitted by Jaqueline Oliveira (jaqueoliveiram@gmail.com) on 2008-11-28T14:11:12Z No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / Approved for entry into archive by Georgia Fernandes(georgia@bce.unb.br) on 2009-02-12T15:59:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-02-12T15:59:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTACAO_2008_GracieleBellon.pdf: 544194 bytes, checksum: 1c2be5935a6e648eda2f9fc94c8d6c03 (MD5) / O maracujazeiro-doce (Passiflora alata Curtis), devido a preços diferenciados, vem ganhando importância dentro do mercado de frutas in natura. O melhoramento genético é fundamental para elevar a qualidade e produtividade da cultura, sendo a identificação de fontes de resistência a doenças uma etapa relevante de todo programa de melhoramento. Objetivou-se, neste trabalho analisar a variabilidade genética de acessos comerciais e silvestres de P. alata e avaliar a resistência de acessos de maracujazeiro-doce a bacteriose (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) e a virose do endurecimento dos frutos (Cowpea aphid-borne mosaic vírus - CABMV ou Passionfruit woodiness virus – PWV) em condições de campo e casa de vegetação. No presente trabalho, analisou-se a variabilidade genética de 17 acessos de maracujazeiro-doce, sendo nove obtidos de população cultivada e oito silvestres, por meio de marcadores moleculares RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) . O DNA (Ácido Desoxiribonucléico) genômico de cada acesso foi extraído e primers decâmeros foram utilizados para a obtenção de marcadores moleculares RAPD. Os marcadores foram convertidos em uma matriz de dados binários, a partir da qual foram estimadas as distâncias genéticas entre os acessos e realizadas análises de agrupamento. Entre os acessos analisados constatou-se que existe variabilidade genética entre os acessos obtidos de população cultivada e silvestres de P. alata, sendo que os acessos silvestres foram os que mais contribuem na amplitude da base genética dos materiais estudados. Ademais, avaliou-se a resistência de nove acessos de maracujazeiro-doce (sete acessos obtidos de população cultivada e dois acessos silvestres) à bacteriose em condições de campo e em casa de vegetação. Em condições de campo, foram analisadas cinco folhas por planta, selecionadas aleatoriamente, nas quais se avaliou o número médio de lesões por folha, o diâmetro médio das lesões, a média da área lesada por folha, a % de folhas sadias e a % de folhas sintomáticas. Em casa de vegetação, realizou-se a inoculação com o isolado 767 (UnB) de Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae e avaliou-se o diâmetro longitudinal médio da lesão, diâmetro transversal médio da lesão, diâmetro médio da lesão e área lesada média aos 5, 10 e 15 dias após inoculação. Os resultados foram significativos apenas para o experimento em casa de vegetação, em que o acesso com maior nível de resistência foi o acesso tipo J, seguido do acesso tipo D. Ainda, estudou-se a resistência de tais acessos à virose do endurecimento dos frutos também em condições de campo e casa de vegetação. Em condições de campo, foi avaliado incidência e severidade da doença. Para avaliação da severidade utilizou-se escala de notas para planta e para folha. Em condições controladas de casa de vegetação, a inoculação foi feita mecanicamente em cada acesso. Avaliou-se a porcentagem de plantas com sintomas da infecção viral (incidência). O maior nível de resistência foi verificado nos acessos silvestres N1 e N2. Em condições de campo, a incidência e a severidade de virose aumentaram ao longo do tempo, possivelmente devido à maior disseminação do vírus pelo afídio. Houve diferenças de nível de resistência entre plantas da mesma família ressaltando a importância da avaliação e da seleção de plantas individuais. Sendo assim a presença de alta variabilidade genética entre os acessos estudados refletida também na resistência a virose e bacteriose, geram perspectivas promissoras para o melhoramento desta espécie, possibilitando o lançamento futuro de variedades com caracteres desejáveis. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Sweet passion fruit (Passiflora alata Curtis) is gaining importance in the in natura fruit market due to differential pricing. Genetic breeding is crucial to improve crop quality and productivity, and identification of sources resistance a relevant stage for any breeding program. The objective the present work was to analyze the genetic variability of accesses of P. alata obtained from cultivated population and of wild accesses and to evaluate resistance sweet passion fruit accesses the to bacterial blight caused by (Xanthomonas axonopodis pv. passiflorae) and to passion fruit woodiness viruses. (caused by PWV or CABMV) under greenhouse and field conditions. Unthe present work, genetic variability of 17 sweet passion fruit accesses was analyzed, nine of them from a cultivated population and eight wildones, was analyzed by using RAPD (“Random Amplified Polymorphic DNA”) molecular markers. The genomic DNA of each access was extracted and decamers primers were used to obtain RAPD molecular markers. The markers have been converted into a matrix of binary data, used as base to estimate genetic distances between accesses and to produce grouping analysis. Among the studied accesses, genetic variability was observed between accesses from cultivated and wild population of P. alata, the wild accesses contribuing the most to the range of the genetic basis of the studied materials. Moreover, resistance to bacterial blight of nine sweet passion fruit accesses (seven obtained from cultivated population and two wild accesses) under greenhouse and field conditions was assessed. Under field conditions, five leaves randomly selected from each plant, were analyzed. The average number of lesions per leaf, the average diameter of lesions, the average lesioned area per leaf and the percentage of healthy and sick leaves were evalucted. Under greenhouse conditions, inoculation with the isolate 767 (UnB) of Xanthomonas axonopodis pv. Passiflorae was performed and the average longitudinal diameter, the average transverse diameter, the average diameter of the lesion and the average lesioned area were evaluated 5, 10 and 15 days after inoculation. Results were significant only for the greenhouse experiment, where the access with higher resistance level was the J-type, followed by the D-type. Furthermore, the resistance to passion fruit woodiness viruses. of such accesses was studied, under greenhouse and field conditions, likewise. Under field conditions, incidence and severity were evaluated. For evaluation of the severity it was used a scale for plant and leaf. Under controlled greenhouse conditions, the inoculation was produced mechanically in each access. The incidence of plants presenting viral infection symptoms (incidence) was measured. The highest resistance level to fruit was observed on wild accesses N1 and N2. Under field conditions, the incidence and severity of passion fruit woodiness viruses increased over time, possibly due to the dissemination of virus by the vector aphid. It was verified differences is possible to verify resistance levels in between plants of the same family, stressing the importance of evaluation and selection of individual plants. Thus, the presence of high genetic variability among the studied accesses, also reflected in the resistance to passion fruit woodiness viruses and bacterial blight, generate promising perspectives for the breeding of this species, enabling the future release of varieties with desirable characteristics.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-05-14T13:28:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-05-16T20:17:14Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T20:17:15Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-04-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O melhoramento genético tem desempenhado um importante papel na evolução da cultura do arroz. Assim, os melhoristas de plantas têm usado a análise de gerações para obter estimativas dos parâmetros genéticos, potencializando o entendimento das bases genéticas de caracteres de importância agronômica, consequentemente maior eficiência na condução do programa de melhoramento. Logo, esse trabalho teve o objetivo de determinar os parâmetros genéticos e o modo de ação gênica predominante para os caracteres: teor de compostos fenólicos totais (TCFT), variáveis da cor (luminosidade da cor (L), coordenada a* da cor (a*), coordenada b* da cor (b*), tonalidade da cor (°Hue) e da saturação da cor (Croma)) do pericarpo, número de panículas por planta (NPP), peso de panícula (PP), comprimento de panícula (CP) e altura de planta (AP) em populações segregantes de arroz. Dessa forma, foram realizados cruzamentos entre os genitores, obtendo assim as gerações P1, P2, F1, F2, RC1 (F1 x P1) e RC2 (F1 x P2) que foram avaliadas em um mesmo ambiente de cultivo. O cruzamento entre os genitores BRS Pampa e SCS 120 Ônix, assim como o cruzamento recíproco, foram executados a fim de estimar os parâmetros genéticos e modo de ação gênica para os caracteres TCFT, L, a*, b*, °Hue e Croma. Já o cruzamento entre os genitores BRS AG e Arbório, bem como o cruzamento recíproco, foram realizados para estimar os parâmetros genéticos e modo de ação gênica para os caracteres NPP, PP e CP. Já para AP, foram os cruzamentos BRS AG x Arbório, BRS Querência x BRS Pampa e BRS Pampa x SCS 120 Ônix. A partir da análise de variância das gerações, foram obtidos os seguintes componentes e parâmetros de variância fenotípica, variância de ambiente, variância genotípica, variância genética aditiva, variância genética de dominância, herdabilidade no sentido amplo e herdabilidade no sentido restrito. Sendo utilizados para a predição de ganhos por seleção e grau médio de dominância. A análise de ação gênica foi através do modelo completo e do modelo aditivo-dominante. As estimativas dos componentes e parâmetros genéticos de todos os caracteres analisados indicam que há variabilidade genética significativa, proporcionando ganhos genéticos em ciclos adicionais de seleção com base no fenótipo. Os caracteres analisados apresentam herança genética quantitativa e o efeito gênico mais importante na determinação dos caracteres é o efeito gênico aditivo. Ocorre ação gênica de dominância parcial para os caracteres TCFT, L, b*, °Hue, Croma, NPP, PP e CP. Já para o caráter a*, a ação gênica é de sobredominância. Para AP, o tipo de ação gênica é influenciado conforme os genitores analisados, sendo detectado ação gênica de dominância parcial e sobredominância. Não ocorre efeito materno para os caracteres analisados. Essas informações podem ser utilizadas a fim de possibilitar a definição de procedimentos técnicos e estratégias eficientes que proporcionaram o desenvolvimento e lançamento de novas cultivares de arroz. / The genetic improvement has played an important role in the evolution of rice crop. Thus, plant breeders have used the analysis of generations to obtain estimates of genetic parameters, potentializing the understanding of the genetic bases of characters of agronomic importance, consequently greater efficiency in the conduct of the breeding program. Therefore, this work had the objective of determining the genetic parameters and the mode of predominant genetic action for the characters: content of total phenolic compounds (CTPC), color variables (color luminosity (L), color coordinate a* (a*), color coordinate b* (b*), color tonality (°Hue) and color saturation (Chroma)) of pericarp, number of panicles per plant (NPP), panicle weight (PW),panicle length (PL) and plant height (PH) in rice-segregating populations. For this reason, were done cross breeding between the parents thus obtaining the generations P1, P2, F1, F2, BC1 (F1 x P1) e BC2 (F1 x P2) which were evaluated in the same culture environment. The cross between the parents BRS Pampa e SCS 120 Ônix, as reciprocal crossing, were performed in order to estimate the genetic parameters, and mode of genetic action for the characters CTPC, L, a*, b*, °Hue and Croma. Already the cross between the parents BRS AG and Arbório, as reciprocal crossing, were performed to estimate the genetic parameters and mode of genetic action for the characters NPP, PW and PL. Already for PH, were the crossings BRS AG x Arbório, BRS Querência x BRS Pampa and BRS Pampa x SCS 120 Ônix. As from analysis of variance of the generations, the following components and parameters of phenotypic variance, variance of environment, genotypic variance, additive genetic variance, genetic variance of dominance, heritability in the broad sense and heritability in the narrow sense were obtained. Being used for the prediction of earnings by selection and average degree of dominance. The analysis of genetic action was through the complete model and the additive-dominant model. The estimates of the components and genetic parameters of all traits analyzed indicate that there is significant genetic variability, providing genetic gains in additional cycles of selection based on the phenotype. The analyzed characters present quantitative genetic inheritance and the most important gene effect in determining the characters is the additive gene effect. Genetic action of partial dominance occurs for the characters CTPC, L, b*, °Hue, Chroma, NPP, PW and PL. Already for the character a*, the genetic action is over dominance. For PH, the type of genetic action is influenced according to the parents analyzed, being detected partial dominance and over dominance genetic action. There is no maternal effect for the characters analyzed. This information can be used to enable the definition of technical procedures and efficient strategies that provided the development and launch of new rice cultivars.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2018-11-22T14:30:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2018-11-23T18:49:42Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-23T18:49:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Gabriel Almeida Aguiar.pdf: 1098486 bytes, checksum: ba1c248551913ef68ad1a6ac02eb80bf (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-04-02 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / O melhoramento genético tem desempenhado um importante papel na evolução da cultura do arroz. Assim, os melhoristas de plantas têm usado a análise de gerações para obter estimativas dos parâmetros genéticos, potencializando o entendimento das bases genéticas de caracteres de importância agronômica, consequentemente maior eficiência na condução do programa de melhoramento. Logo, esse trabalho teve o objetivo de determinar os parâmetros genéticos e o modo de ação gênica predominante para os caracteres: teor de compostos fenólicos totais (TCFT), variáveis da cor (luminosidade da cor (L), coordenada a* da cor (a*), coordenada b* da cor (b*), tonalidade da cor (°Hue) e da saturação da cor (Croma)) do pericarpo, número de panículas por planta (NPP), peso de panícula (PP), comprimento de panícula (CP) e altura de planta (AP) em populações segregantes de arroz. Dessa forma, foram realizados cruzamentos entre os genitores, obtendo assim as gerações P1, P2, F1, F2, RC1 (F1 x P1) e RC2 (F1 x P2) que foram avaliadas em um mesmo ambiente de cultivo. O cruzamento entre os genitores BRS Pampa e SCS 120 Ônix, assim como o cruzamento recíproco, foram executados a fim de estimar os parâmetros genéticos e modo de ação gênica para os caracteres TCFT, L, a*, b*, °Hue e Croma. Já o cruzamento entre os genitores BRS AG e Arbório, bem como o cruzamento recíproco, foram realizados para estimar os parâmetros genéticos e modo de ação gênica para os caracteres NPP, PP e CP. Já para AP, foram os cruzamentos BRS AG x Arbório, BRS Querência x BRS Pampa e BRS Pampa x SCS 120 Ônix. A partir da análise de variância das gerações, foram obtidos os seguintes componentes e parâmetros de variância fenotípica, variância de ambiente, variância genotípica, variância genética aditiva, variância genética de dominância, herdabilidade no sentido amplo e herdabilidade no sentido restrito. Sendo utilizados para a predição de ganhos por seleção e grau médio de dominância. A análise de ação gênica foi através do modelo completo e do modelo aditivo-dominante. As estimativas dos componentes e parâmetros genéticos de todos os caracteres analisados indicam que há variabilidade genética significativa, proporcionando ganhos genéticos em ciclos adicionais de seleção com base no fenótipo. Os caracteres analisados apresentam herança genética quantitativa e o efeito gênico mais importante na determinação dos caracteres é o efeito gênico aditivo. Ocorre ação gênica de dominância parcial para os caracteres TCFT, L, b*, °Hue, Croma, NPP, PP e CP. Já para o caráter a*, a ação gênica é de sobredominância. Para AP, o tipo de ação gênica é influenciado conforme os genitores analisados, sendo detectado ação gênica de dominância parcial e sobredominância. Não ocorre efeito materno para os caracteres analisados. Essas informações podem ser utilizadas a fim de possibilitar a definição de procedimentos técnicos e estratégias eficientes que proporcionaram o desenvolvimento e lançamento de novas cultivares de arroz. / The genetic improvement has played an important role in the evolution of rice crop. Thus, plant breeders have used the analysis of generations to obtain estimates of genetic parameters, potentializing the understanding of the genetic bases of characters of agronomic importance, consequently greater efficiency in the conduct of the breeding program. Therefore, this work had the objective of determining the genetic parameters and the mode of predominant genetic action for the characters: content of total phenolic compounds (CTPC), color variables (color luminosity (L), color coordinate a* (a*), color coordinate b* (b*), color tonality (°Hue) and color saturation (Chroma)) of pericarp, number of panicles per plant (NPP), panicle weight (PW),panicle length (PL) and plant height (PH) in rice-segregating populations. For this reason, were done cross breeding between the parents thus obtaining the generations P1, P2, F1, F2, BC1 (F1 x P1) e BC2 (F1 x P2) which were evaluated in the same culture environment. The cross between the parents BRS Pampa e SCS 120 Ônix, as reciprocal crossing, were performed in order to estimate the genetic parameters, and mode of genetic action for the characters CTPC, L, a*, b*, °Hue and Croma. 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The estimates of the components and genetic parameters of all traits analyzed indicate that there is significant genetic variability, providing genetic gains in additional cycles of selection based on the phenotype. The analyzed characters present quantitative genetic inheritance and the most important gene effect in determining the characters is the additive gene effect. Genetic action of partial dominance occurs for the characters CTPC, L, b*, °Hue, Chroma, NPP, PW and PL. Already for the character a*, the genetic action is over dominance. For PH, the type of genetic action is influenced according to the parents analyzed, being detected partial dominance and over dominance genetic action. There is no maternal effect for the characters analyzed. This information can be used to enable the definition of technical procedures and efficient strategies that provided the development and launch of new rice cultivars.

O lúpus eritematoso sistêmico (LES) é uma doença autoimune com forte componente genético, caracterizada por inflamação crônica e produção de autoanticorpos. O objetivo deste trabalho foi determinar o perfil de variação no número de cópias (CNVs) e de regiões de perda de heterozigose (LOH) na patogênese do LES. A detecção de CNVs e LOH foi feita pela metodologia Cytoscan HD array em pacientes com LES (n = 23) e indivíduos saudáveis (n = 110). Devido à formação tri-híbrida da população brasileira, foi desenvolvido e validado um painel de 345 marcadores informativos de ancestralidade, a partir dados provenientes do próprio array, para estimar as proporções de ancestralidade individual e, em última instância, inseri-las nos modelos de regressão logística como variável de controle nas análises de distribuição de CNVs e LOH. O perfil de CNVs evidenciou que o número e o tamanho de duplicações são maiores nos indivíduos saudáveis do que nos pacientes com LES. Duplicações nos genes FCGR3B e ADAM3A foram descritas como fator de proteção ao LES, quando tais genes foram avaliados por PCR quantitativa em maior grupo amostral de pacientes (n = 135) e controles (n = 200). Além disso, mostrou-se o efeito sinérgico da presença da deleção em ambos os loci FCGR3B e ADAM3A no aumento do risco para desenvolver a doença. Deleções em pacientes com LES envolvendo os genes CFHR4, CFHR5 e HLA-DPB2, previamente descritos em associação com o LES na literatura, foram identificadas por array e confirmadas por PCR digital. O protocolo desenvolvido para identificação de variantes raras, resultou em um conjunto de 21 CNVs raras em pacientes com LES. Em relação às regiões de perda de heterozigose, não foram encontradas evidências de que o número médio e a extensão dos segmentos LOH seja diferente entre pacientes e indivíduos saudáveis. No entanto, os cromossomos 6 e 12 em pacientes exibem regiões de perda de heterozigose em maior quantidade e tamanho do que os de indivíduos saudáveis, além de apresentarem 17 segmentos LOH restritos ao grupo de pacientes com LES. Os resultados aqui descritos evidenciam que novos loci de susceptibilidade ao LES podem ser encontrados quando a distribuição de CNVs é analisada em todo o genoma, em que a investigação de sua relação com a patogênese pode contribuir para a compreensão da base genética da doença. / Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with a strong genetic background characterized by chronic inflammation and autoantibody production. The purpose of this study was to determine the copy number variation (CNV) and loss of heterozygosity (LOH) profiles in the susceptibility to SLE. The detection of CNVs and LOH was performed by the Cytoscan HD array methodology in SLE patients (n = 23) and healthy subjects (n = 110). Due to the tri-hybrid composition of the Brazilian population, a panel of 345 ancestral informative markers was developed and validated, based on data from the array itself, to estimate the proportions of individual ancestry and, ultimately, to insert them into the logistic regression models as a control variable in the analysis of CNV and LOH distribution. The CNVs profile showed that the burden and the size of duplications are higher in healthy individuals than in SLE patients. Duplications in FCGR3B and ADAM3A genes were described as a protective factor for SLE, when these genes were evaluated by quantitative PCR in a larger SLE (n = 135) and control (n = 200) groups. In addition, the synergistic effect of the presence of deletion in both FCGR3B and ADAM3A loci increase the risk of developing the disease. Deletions in SLE patients encompassing the CFHR4, CFHR5 and HLA-DPB2 genes, previously described in the literature in association to SLE, were identified by the array and confirmed by droplet digital PCR. The pipeline developed here for the identification of rare variants resulted in a set of 21 rare CNVs in SLE patients. Regarding the loss of heterozygosity regions, no evidence was found that the mean number and extent of LOH segments is different between patients and healthy individuals. However, the chromosomes 6 and 12 in SLE patients exhibit greater quantity and size of LOH than those of healthy individuals, besides showing 17 LOH segments restricted to the group of SLE. The results described here show that novel susceptibility loci to SLE can be found once the distribution of variants is analyzed throughout the genome, in which the investigation of its relation to the pathogenesis may contribute to the understanding of the genetic basis of the disease.

The event TC1507 maize with cry1F gene from the bacterium Bacillus thuringiensis Berliner (Bt) was approved for commercial release in Brazil in 2008. The evolution of pest resistance to Bt plants has been a great concern to preserve the lifetime of this technology. Therefore, in this study we assess the risk of evolution of resistance to Cry1F protein in Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) populations from major maize-growing regions in Brazil. The baseline susceptibility to Cry1F was detemined with diet overlay bioassay for susceptible reference population and four field populations of S. frugiperda. Then, we monitored 43 populations of S. frugiperda sampled in nine different States of Brazil during 2010/2011, 2011/2012 and 2012/2013 crop seasons. Only 4-fold variation in susceptibility to Cry1F was detected among S. frugiperda from field populations in the baseline susceptibility study. Diagnostic concentration of 2,000 ng cm-2 was defined for monitoring the susceptibility to Cry1F in S. frugiperda populations. Survival at 2,000 ng cm-2 of Cry1F protein increased significantly throughout crop seasons in populations from São Paulo, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Bahia, Mato Grosso, Goiás, Mato Grosso do Sul, and Paraná, but not in Minas Gerais. We also sampled a population of S. frugiperda in TC1507 field failures in Bahia in October, 2011. This population was selected in laboratory with Cry1F protein up to 20,000 ng cm-2 and the resistance ratio of the selected resistant population (BA25R) was > 5,000-fold. This resistant population was able to survive in Cry1F maize from neonate till pupa and produce normal adult. The inheritance of S. frugiperda resistance to Cry1F protein was autosomal. To test the functional dominance, neonate larvae obtained from the cross of resistant and susceptible populations were tested in leaf bioassay, and around 8% of heterozygotes were able to survive and complete the larval development and produce normal adults on TC1507 leaves while susceptible larvae could not survive for up to five days after infestation. Dominance was estimated to be 0.15 ± 0.09, suggesting that resistance to Cry1F in TC1507 maize was incompletely recessive. We also conducted resistance selection studies in other seven S. frugiperda populations from six different Brazilian states to test whether the resistance alleles were at same locus or not. The F1 larvae obtained from the cross between resistant population (BA25R) and each of the seven selected resistant populations were able to survive at 2,000 ng cm-2 of Cry1F protein in diet bioassay, and therefore they shared the same locus of resistance to Cry1F protein. We estimated the frequency of resistance allele to Cry1F protein in populations of S. frugiperda of main crop season 2011/2012 from five states. We stablished 517 isofemale lines using F2 screen method. The total frequency of Cry1F resistance allele in Brazil was 0.088 with 95% confidence interval between 0.077 and 0.100. Based on results obtained in this study, the risk of resistance evolution to Cry1F protein by S. frugiperda is high in Brazil. / O evento de milho TC1507 com gene cry1F da bactéria Bacillus thuringiensis Berliner foi aprovado comercialmente no Brasil em 2008. A evolução da resistência de pragas a plantas Bt tem sido uma grande preocupação na preservação desta tecnologia. Portanto, neste estudo foi avaliado o risco de evolução da resistência à proteína Cry1F em populações de Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) das principais regiões de cultivo de milho no Brasil. A linha-básica de suscetibilidade à proteina Cry1F foi determinada em bioensaio de aplicação superfícial na dieta para a população suscetível de referência e quatro populações de campo de S. frugiperda. Posteriormente, a suscetibilidade a Cry1F foi monitorada em 43 populações de S. frugiperda coletadas em nove Estados do Brasil nas safras agrícolas de 2010/2011, 2011/2012 e 2012/2013. A variação na suscetibilidade foi de apenas quatro vezes para Cry1F entre as populações de campo na linha-básica de suscetibilidade. A concentração diagnóstica de 2.000 ng cm-2 de proteína Cry1F foi definida para o monitoramento da suscetibilidade. A sobrevivência em 2.000 ng cm-2 de proteína Cry1F aumentou significativamente no decorrer das safras em populações de São Paulo, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Bahia, Mato Grosso, Goiás, Mato Grosso do Sul e Paraná, mas não em Minas Gerais. Além disso, uma população de S. frugiperda foi coletada em milho TC1507 com falha de controle na Bahia em outubro de 2011. Esta população foi selecionada no laboratório com a proteína Cry1F até 20.000 ng cm-2, obtendo-se uma população resistente (BA25R) com razão de resistência >5000 vezes. Esta população resistente foi capaz de sobreviver no milho TC1507 desde larva neonata até a fase de pupa e com emergência de adultos normais. O padrão de herança da resistência de S. frugiperda a Cry1F foi autossômica. Para testar a dominância funcional, as larvas neonatas do cruzamento entre a população resistente e suscetível foram testadas em folhas do evento TC1507 e cerca de 8% dos heterozigotos foram capazes de sobreviver, completar o desenvolvimento e produzir adultos normais, enquanto as larvas da linhagem suscetível não sobreviveram por mais de cinco dias após a infestação. A dominância foi estimada em 0,15 ± 0,09; portanto, a resistência à proteína Cry1F no milho TC1507 foi incompletamente recessiva. A resistência foi selecionada para outras sete populações de seis Estados brasileiros para testar se os alelos de resistência estavam no mesmo locus. As larvas F1 obtidas do cruzamento entre a população resistente (BA25R) e cada uma das sete populações selecionadas sobreviveram na concentração de 2,000 ng cm-2 de proteína Cry1F e, portanto, essas populações compartilharam o mesmo locus de resistência à proteína Cry1F. A freqüência do alelo resistente à proteína Cry1F foi estimada em populações de S. frugiperda coletadas em cinco Estados na safra 2011/2012. Foram estabelecidas 517 isolinhas utilizando o método de \"F2 screen\". A freqüência total do alelo de resistência à proteína Cry1F no Brasil foi de 0,088, com intervalo de confiança de 95% entre 0,077 e 0,100. Com base nos resultados, o risco de evolução da resistência à proteína Cry1F por S. frugiperda é elevada no Brasil.

The event TC1507 maize with cry1F gene from the bacterium Bacillus thuringiensis Berliner (Bt) was approved for commercial release in Brazil in 2008. The evolution of pest resistance to Bt plants has been a great concern to preserve the lifetime of this technology. Therefore, in this study we assess the risk of evolution of resistance to Cry1F protein in Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) populations from major maize-growing regions in Brazil. The baseline susceptibility to Cry1F was detemined with diet overlay bioassay for susceptible reference population and four field populations of S. frugiperda. Then, we monitored 43 populations of S. frugiperda sampled in nine different States of Brazil during 2010/2011, 2011/2012 and 2012/2013 crop seasons. Only 4-fold variation in susceptibility to Cry1F was detected among S. frugiperda from field populations in the baseline susceptibility study. Diagnostic concentration of 2,000 ng cm-2 was defined for monitoring the susceptibility to Cry1F in S. frugiperda populations. Survival at 2,000 ng cm-2 of Cry1F protein increased significantly throughout crop seasons in populations from São Paulo, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Bahia, Mato Grosso, Goiás, Mato Grosso do Sul, and Paraná, but not in Minas Gerais. We also sampled a population of S. frugiperda in TC1507 field failures in Bahia in October, 2011. This population was selected in laboratory with Cry1F protein up to 20,000 ng cm-2 and the resistance ratio of the selected resistant population (BA25R) was > 5,000-fold. This resistant population was able to survive in Cry1F maize from neonate till pupa and produce normal adult. The inheritance of S. frugiperda resistance to Cry1F protein was autosomal. To test the functional dominance, neonate larvae obtained from the cross of resistant and susceptible populations were tested in leaf bioassay, and around 8% of heterozygotes were able to survive and complete the larval development and produce normal adults on TC1507 leaves while susceptible larvae could not survive for up to five days after infestation. Dominance was estimated to be 0.15 ± 0.09, suggesting that resistance to Cry1F in TC1507 maize was incompletely recessive. We also conducted resistance selection studies in other seven S. frugiperda populations from six different Brazilian states to test whether the resistance alleles were at same locus or not. The F1 larvae obtained from the cross between resistant population (BA25R) and each of the seven selected resistant populations were able to survive at 2,000 ng cm-2 of Cry1F protein in diet bioassay, and therefore they shared the same locus of resistance to Cry1F protein. We estimated the frequency of resistance allele to Cry1F protein in populations of S. frugiperda of main crop season 2011/2012 from five states. We stablished 517 isofemale lines using F2 screen method. The total frequency of Cry1F resistance allele in Brazil was 0.088 with 95% confidence interval between 0.077 and 0.100. Based on results obtained in this study, the risk of resistance evolution to Cry1F protein by S. frugiperda is high in Brazil. / O evento de milho TC1507 com gene cry1F da bactéria Bacillus thuringiensis Berliner foi aprovado comercialmente no Brasil em 2008. A evolução da resistência de pragas a plantas Bt tem sido uma grande preocupação na preservação desta tecnologia. Portanto, neste estudo foi avaliado o risco de evolução da resistência à proteína Cry1F em populações de Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) das principais regiões de cultivo de milho no Brasil. A linha-básica de suscetibilidade à proteina Cry1F foi determinada em bioensaio de aplicação superfícial na dieta para a população suscetível de referência e quatro populações de campo de S. frugiperda. Posteriormente, a suscetibilidade a Cry1F foi monitorada em 43 populações de S. frugiperda coletadas em nove Estados do Brasil nas safras agrícolas de 2010/2011, 2011/2012 e 2012/2013. A variação na suscetibilidade foi de apenas quatro vezes para Cry1F entre as populações de campo na linha-básica de suscetibilidade. A concentração diagnóstica de 2.000 ng cm-2 de proteína Cry1F foi definida para o monitoramento da suscetibilidade. A sobrevivência em 2.000 ng cm-2 de proteína Cry1F aumentou significativamente no decorrer das safras em populações de São Paulo, Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Bahia, Mato Grosso, Goiás, Mato Grosso do Sul e Paraná, mas não em Minas Gerais. Além disso, uma população de S. frugiperda foi coletada em milho TC1507 com falha de controle na Bahia em outubro de 2011. Esta população foi selecionada no laboratório com a proteína Cry1F até 20.000 ng cm-2, obtendo-se uma população resistente (BA25R) com razão de resistência >5000 vezes. Esta população resistente foi capaz de sobreviver no milho TC1507 desde larva neonata até a fase de pupa e com emergência de adultos normais. O padrão de herança da resistência de S. frugiperda a Cry1F foi autossômica. Para testar a dominância funcional, as larvas neonatas do cruzamento entre a população resistente e suscetível foram testadas em folhas do evento TC1507 e cerca de 8% dos heterozigotos foram capazes de sobreviver, completar o desenvolvimento e produzir adultos normais, enquanto as larvas da linhagem suscetível não sobreviveram por mais de cinco dias após a infestação. A dominância foi estimada em 0,15 ± 0,09; portanto, a resistência à proteína Cry1F no milho TC1507 foi incompletamente recessiva. A resistência foi selecionada para outras sete populações de seis Estados brasileiros para testar se os alelos de resistência estavam no mesmo locus. As larvas F1 obtidas do cruzamento entre a população resistente (BA25R) e cada uma das sete populações selecionadas sobreviveram na concentração de 2,000 ng cm-2 de proteína Cry1F e, portanto, essas populações compartilharam o mesmo locus de resistência à proteína Cry1F. A freqüência do alelo resistente à proteína Cry1F foi estimada em populações de S. frugiperda coletadas em cinco Estados na safra 2011/2012. Foram estabelecidas 517 isolinhas utilizando o método de \"F2 screen\". A freqüência total do alelo de resistência à proteína Cry1F no Brasil foi de 0,088, com intervalo de confiança de 95% entre 0,077 e 0,100. Com base nos resultados, o risco de evolução da resistência à proteína Cry1F por S. frugiperda é elevada no Brasil.

O lúpus eritematoso sistêmico (LES) é uma doença autoimune com forte componente genético, caracterizada por inflamação crônica e produção de autoanticorpos. O objetivo deste trabalho foi determinar o perfil de variação no número de cópias (CNVs) e de regiões de perda de heterozigose (LOH) na patogênese do LES. A detecção de CNVs e LOH foi feita pela metodologia Cytoscan HD array em pacientes com LES (n = 23) e indivíduos saudáveis (n = 110). Devido à formação tri-híbrida da população brasileira, foi desenvolvido e validado um painel de 345 marcadores informativos de ancestralidade, a partir dados provenientes do próprio array, para estimar as proporções de ancestralidade individual e, em última instância, inseri-las nos modelos de regressão logística como variável de controle nas análises de distribuição de CNVs e LOH. O perfil de CNVs evidenciou que o número e o tamanho de duplicações são maiores nos indivíduos saudáveis do que nos pacientes com LES. Duplicações nos genes FCGR3B e ADAM3A foram descritas como fator de proteção ao LES, quando tais genes foram avaliados por PCR quantitativa em maior grupo amostral de pacientes (n = 135) e controles (n = 200). Além disso, mostrou-se o efeito sinérgico da presença da deleção em ambos os loci FCGR3B e ADAM3A no aumento do risco para desenvolver a doença. Deleções em pacientes com LES envolvendo os genes CFHR4, CFHR5 e HLA-DPB2, previamente descritos em associação com o LES na literatura, foram identificadas por array e confirmadas por PCR digital. O protocolo desenvolvido para identificação de variantes raras, resultou em um conjunto de 21 CNVs raras em pacientes com LES. Em relação às regiões de perda de heterozigose, não foram encontradas evidências de que o número médio e a extensão dos segmentos LOH seja diferente entre pacientes e indivíduos saudáveis. No entanto, os cromossomos 6 e 12 em pacientes exibem regiões de perda de heterozigose em maior quantidade e tamanho do que os de indivíduos saudáveis, além de apresentarem 17 segmentos LOH restritos ao grupo de pacientes com LES. Os resultados aqui descritos evidenciam que novos loci de susceptibilidade ao LES podem ser encontrados quando a distribuição de CNVs é analisada em todo o genoma, em que a investigação de sua relação com a patogênese pode contribuir para a compreensão da base genética da doença. / Systemic lupus erythematosus (SLE) is an autoimmune disease with a strong genetic background characterized by chronic inflammation and autoantibody production. The purpose of this study was to determine the copy number variation (CNV) and loss of heterozygosity (LOH) profiles in the susceptibility to SLE. The detection of CNVs and LOH was performed by the Cytoscan HD array methodology in SLE patients (n = 23) and healthy subjects (n = 110). Due to the tri-hybrid composition of the Brazilian population, a panel of 345 ancestral informative markers was developed and validated, based on data from the array itself, to estimate the proportions of individual ancestry and, ultimately, to insert them into the logistic regression models as a control variable in the analysis of CNV and LOH distribution. The CNVs profile showed that the burden and the size of duplications are higher in healthy individuals than in SLE patients. Duplications in FCGR3B and ADAM3A genes were described as a protective factor for SLE, when these genes were evaluated by quantitative PCR in a larger SLE (n = 135) and control (n = 200) groups. In addition, the synergistic effect of the presence of deletion in both FCGR3B and ADAM3A loci increase the risk of developing the disease. Deletions in SLE patients encompassing the CFHR4, CFHR5 and HLA-DPB2 genes, previously described in the literature in association to SLE, were identified by the array and confirmed by droplet digital PCR. The pipeline developed here for the identification of rare variants resulted in a set of 21 rare CNVs in SLE patients. Regarding the loss of heterozygosity regions, no evidence was found that the mean number and extent of LOH segments is different between patients and healthy individuals. However, the chromosomes 6 and 12 in SLE patients exhibit greater quantity and size of LOH than those of healthy individuals, besides showing 17 LOH segments restricted to the group of SLE. The results described here show that novel susceptibility loci to SLE can be found once the distribution of variants is analyzed throughout the genome, in which the investigation of its relation to the pathogenesis may contribute to the understanding of the genetic basis of the disease.