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Interação trófica entre Meloidogyne javanica e Tuta absoluta em tomateiro / Trophic interaction between Meloidogyne javanica and Tuta absoluta in tomatoArce, Carla Cristina Marques 23 July 2010 (has links)
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Previous issue date: 2010-07-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / To understand how the attack on the root herbivores can influence shoot is essential to understand the e ects that herbivory can cause the host. Plants respond when attacked by herbivores respond in an attempt to combat them. Among the varied responses, induction of defense is a mechanism frequently used by plants in these conditions. Therefore, the objective of this thesis was to determine whether an injury to the roots of a plant by a nematode triggers defensive responses and induction of defense as it varies in intensity and the injury suffered over time. Thus, as it is expected that the defensive response is systemic, what impact a specialist herbivore shoot suffer. For this, we checking: (i) if tomato plants Solanum lycopersicon infested by the root nematode Meloidogyne javanica respond to attack by the induction of defense and (ii) if tomato plants infested by nematodes in the root system affect the behavior of the herbivore oviposition shoot Tuta absoluta. For the response variation in the induction of defense and the intensity of damage and time was evaluated under different plants and days feeding on the roots. As an indication of induced defense was quantified protease inhibitor, nitrogen and photosynthesis. To check the oviposition behavior evaluated the percentage of eggs in oviposition test with multiple choice tests. Tomato plants infested root system responded to the attack by inducing systemic defense by increasing the amounts of protease inhibitors, nitrogen and the decrease of photosynthetic rate. Given these responses it was found that oviposition behavior of the specialist herbivore in the shoot was affected. The results increase the evidence that interactions between spatially separated herbivores may be mediated by the induction response of plant defense. Thus, strengthening the theory with subsidies optimal plant defense. / Para compreender como o ataque de herbívoros na raiz pode influenciar herbívoros na parte aérea e essencial entender os efeitos que esta herbivoria pode causar no hospedeiro. Plantas quando atacadas por herbívoros respondem na tentativa de combatê-los. Dentre as variadas respostas, a indução de defesa e um mecanismo bastante utilizado por plantas nestas condições. Sendo assim, o objetivo geral desta dissertação foi verificar se um dano causado no sistema radicular de uma planta por um nematóide desencadeia respostas defensivas e como esta indução de defesa varia quanto a intensidade da injúria sofrida e ao longo do tempo. Dessa forma, como espera-se que a resposta defensiva seja sistêmica, qual o impacto que um herbívoro especialista de parte aérea sofrerá. Para tal, verificamos:(i) se plantas de tomate Solanum lycopersicon infestadas no sistema radicular por nematóide Meloidogyne javanica respondem ao ataque pela indução de defesa e (ii) se plantas de tomate infestadas no sistema radicular por nematóide afetam o comportamento de oviposição do herbívoro de parte aérea Tuta absoluta. Para obter a variação da resposta na indução de defesa quanto a intensidade do dano e tempo, avaliou-se plantas sob diferentes níveis e dias de infestação no sistema radicular. Como indicativo de indução de defesa quantificou-se inibidor de protease, nitrogênio e fotossíntese. Para verificar o comportamento de oviposição avaliou-se a porcentagem de ovos em teste de oviposição com chance de escolha. Plantas de tomate infestadas no sistema radicular responderam ao ataque pela indução sistêmica de defesa, através do aumento nas quantidades de inibidor de protease, de nitrogênio e com a diminuição da taxa fotossintética. Diante destas respostas constatou-se que o comportamento de oviposição do herbívoro especialista na parte aérea foi afetado. Os resultados obtidos aumentam as evidências de que interações entre herbívoros separados espacialmente podem ser mediadas pela resposta de indução de defesa da planta. Assim, fortalecendo com subsídios a teoria ótima de defesa de plantas.
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Identificação de hospedeiros alternativos do Tomato chlorosis virus / Identification of alternative hosts of Tomato chlorosis virusFariña, Arnaldo Esquivel 05 February 2016 (has links)
O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é uma das hortaliças mais cultivadas no mundo. No Brasil, a cultura está entre as de maior importância econômica e social. Nos últimos anos, foi detectada a incidência de uma espécie de crinivirus, Tomato clorosis virus (ToCV), nos principais estados produtores dessa hortaliça no país. O ToCV é transmitido por Bemisia tabaci biótipo B de maneira semi-persistente. O objetivo deste trabalho foi identificar hospedeiros alternativos do isolado brasileiro do ToCV, que podem atuar como fonte primária de inóculo do patógeno. Um isolado brasileiro (A JQ952600) foi inoculado em plantas sadias de 73 espécies, pertencentes a 14 famílias, por meio de B. tabaci biótipo B, em testes com e sem chance de escolha do vetor. Também foi avaliada a preferência para oviposição do vetor em testes com chance de escolha. Por último, foi feita a recuperação do vírus das hospedeiras suscetíveis infectadas para plantas de tomate por meio do vetor, em teste sem chance de escolha. A detecção do ToCV foi feita por nested- PCR a partir de RNA total extraído das amostras foliares. Foram usados os pares de oligonucleotídeos iniciadores HS-11 / HS-12 e TOC-5 / TOC-6. O amplicon específico do ToCV de 463 pb esperado foi detectado no RNA total extraído de 19 espécies pertencentes às famílias Solanaceae e Amaranthaceae. A identidade do isolado viral foi confirmada por sequenciamento de nucleotídeos de alguns amplicons. Confirmou-se a suscetibilidade de Chenopodium album, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiana benthamiana, N. clevelandii, N. edwarsonii, N. glutinosa, N. tabacum, Solanum americanum, S. pimpinellifolium e Spinacea oleracea à infecção com o ToCV. As espécies Capsicum annuum, Physalis angulata, P. peruviana e S. tuberosum var. Asterix, relatadas como suscetíveis ao vírus no campo, foram infectadas experimentalmente. Beta vulgaris var. cicla, Chenopodium quinoa, S. aculeatissimum, S. melongena e S. sessiliflorum foram identificadas pela primeira vez como espécies suscetíveis ao ToCV. No teste de transmissão com chance de escolha do vetor, verificou-se alta suscetibilidade de quase todas as espécies à infecção com o ToCV. Também se encontrou que a grande maioria das espécies suscetíveis ao vírus exibiu boa preferência à oviposição de B. tabaci biótipo B. Porém, as espécies da família Amaranthaceae mostraram os menores valores para estas duas variáveis. No teste de recuperação do ToCV para plantas de tomate, todas as espécies identificadas como suscetíveis ao vírus mostraram ser boas fontes de inóculo do patógeno. A eliminação de hospedeiros alternativos do vírus presentes na vegetação espontânea, restos de culturas e plantas voluntarias infectadas deve ser parte das estratégias de manejo do amarelão do tomateiro. / The tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the most cultivated plants in the world. In Brazil, tomato crops are among the most economic and social crops. In recent years, the incidence of a crinivirus species, Tomato chlorosis virus (ToCV), in the main tomato producing states in the country has been constantly observed. The ToCV is transmitted by Bemisia tabaci biotype B in a semi-persistent manner. The aim of this study was to identify alternative hosts of the Brazilian isolate of ToCV, which can act as a primary source of inoculum of the pathogen in the field. A Brazilian isolate of the crinivirus (A JQ952600) was inoculated in healthy plants of 73 species, belonging to 14 families, through B. tabaci biotype B, in tests with and without chance of choice for the vector. It was also evaluated the preference for vector oviposition on plants used for the free choice transmission test. Finally, the recovery of the virus from susceptible species to tomato plants was carried out by B. tabaci biotype B in tests without chance of choice for the vector. The detection of ToCV was done by nested PCR from total RNA extracted from leaf samples. Primer pairs HS-11 / HS-12 and TOC-5 / TOC-6 were used. The specific amplicon of 463 bp of the ToCV was detected in total RNA extracted from 19 species of the Solanaceae and Amaranthaceae families. The identity of the virus isolate was confirmed by nucleotide sequencing of some amplicons. The results confirmed that Chenopodium album, Datura stramonium, Gomphrena globosa, Nicotiana benthamiana, N. clevelandii, N. edwarsonii, N. glutinosa, N. tabacum, Solanum americanum, S. pimpinellifolium, and Spinacea oleracea were susceptible to ToCV infection. Capsicum annuum, Physalis angulata, P. peruviana, and S. tuberosum var. Asterix, reported as susceptible to ToCV in the field, were experimentally infected. Beta vulgaris var. cicla, Chenopodium quinoa, S. aculeatissimum, S. melongena e S. sessiliflorum were for the first time identified as susceptible to infection with ToCV. The high susceptibility of the above-mentioned species was confirmed in the free choice transmission test with B. tabaci biotype B. It was also found that the vast majority of the susceptible species to the virus exhibited good preference for oviposition of B. tabaci biotype B. Except the species of the Amaranthaceae family, which showed the lowest values for both variables. For ToCV recovery test to tomato plants, all species identified as susceptible to the virus proved to be good sources of inoculum of the pathogen. The elimination of alternative hosts of the virus present in natural vegetation, abandoned crops and voluntary infected plant debris should be part of the management strategies of tomato yellowing.
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Tomato gynoecium patterning and fruit development are orchestrated by the interplay between microRNAs and gibberellin / O desenvolvimento do gineceu e fruto em tomateiro é coordenado pela interação entre giberelina e microRNAsCorrêa, João Paulo de Oliveira 19 August 2019 (has links)
Many characteristics of a fully developed fruit are controlled by processes that take place early in fruit development, even at floral meristem level. In fact, events that range from the transition of a vegetative into an inflorescence meristem to the last stages of fruit ripening determine characteristics of a mature fruit. Transcription factors post-transcriptionally regulated by microRNAs (miRNAs) play crucial roles in most of these stages. In such pathways, miRNAs may regulate its targets spatially, temporally, or dampen amount of targets transcript to provide optimal expression patterns for adequate organ development. Many miRNAs have been described to be essential in the regulation of flowering time, gynoecium patterning, post-pollination gynoecium growth and fruit ripening, among other stages of fruit development. Some aspects of early stages of gynoecium development, such as floral meristem maintenance, carpel fusion and gynoecium pattern, have been well studied in Arabidopsis. However, these stages are poorly understood in the development of fleshy fruit species, such as tomato. Many miRNA-related pathways were described to interact with phytohormone pathways. A good example is the interaction between miR156 and Gibberellins (GA) in the regulation of flowering time. Interestingly, this interaction is substantially different in Arabidopsis and tomato. MiR156 have been also shown to have distinct roles in controlling tomato and Arabidopsis gynoecium development. Considering this, here we: (1) review the available literature concerning control of fruit development, from gynoecium patterning to fruit ripening, by non-coding RNAs and (2) study the relationship between miR156 and GA pathways in the regulation of early stages of fruit development. We show that these pathways control floral meristem size and boundary establishment during gynoecium development and miR156 pathway modulates responses to GA. / Muitas características finais deu um fruto são controladas por processos que se dão muito cedo no desenvolvimento dos frutos, até mesmo a nível de meristema. De fato, processos que vão desde a transição de um meristema vegetativo para um meristema de inflorescência até os estágios finais do amadurecimento definem muitas características do fruto maduro. Fatores de transcrição regulados pós transcricionalmente por microRNAs (miRNAs) têm papel crucial na maior parte desses estágios. Nessas vias os miRNAs geralmente regulam a expressão de seus alvos espacialmente, temporalmente, ou diminuem o acúmulo de transcritos do alvo, proporcionando níveis adequados de expressão para o desenvolvimento do órgão. Muitos estudos mostram que determinados miRNAs são essenciais no controle do tempo de florescimento, desenvolvimento do gineceu, crescimento do fruto após a polinização e amadurecimento, dentre outros estágios do desenvolvimento do fruto. Muitos aspectos do controle do desenvolvimento inicial do gineceu foram relativamente bem estudados em Arabidopsis. Porém, essas etapas iniciais do desenvolvimento de carpelos/gineceu ainda não são bem estudadas em plantas que produzem fruto carnoso, como é o caso do tomateiro. Já foi demonstrado que muitas vias reguladas por miRNAs interagem com fitormônios na regulação de vários processos de desenvolvimento. Como exemplo podemos citar a relação entre a via do miR156 e a via das giberelinas (GA) no controle do tempo de florescimento. Essa relação é substancialmente em Arabidopsis e tomateiro. Além disso, foi demonstrado que o miR156 possui papéis distintos na regulação do desenvolvimento do gineceu nessas duas espécies. Dessa forma, nesse trabalho nós: (1) fazemos uma revisão de literatura sobre a regulação do desenvolvimento de frutos, do desenvolvimento inicial do gineceu ao amadurecimento, por vias reguladas por RNAs não codantes e; (2) estudamos a relação entre as vias do miR156 e GA na regulação de etapas iniciais do desenvolvimento de frutos. Nós demonstramos que essas vivas controlam o tamanho de meristemas florais, bem como o estabelecimento de zonas de divisão no desenvolvimento do gineceu. Além disso, mostramos que a via do miR156 modula a resposta a GA.
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Metodologias não-invasivas e bioquímicas usadas na detecção dos efeitos fisiológicos causados por salinidade, cádmio e flúor em tomateiro / Non invasive and biochemistries methodologies used the detect of the physiological effects due by salinity, cadmium and fluoride in tomato plantsSouza, Carlos Lúcio de Lacerda Vasconcelos 10 March 2003 (has links)
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Previous issue date: 2003-03-10 / Plantas de tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill) com sete dias de idade, cultivadas em solução nutritiva de Hoagland, foram expostas às concentrações de Na + Cl - de 0, 50, 100 e 150 mol m -3 ou de cádmio de 0, 10, 30 e 50, μmol L -1 de flúor de 0, 1, 3 e 5, μg L -1 , na forma de chuvas simuladas diárias, com a finalidade de avaliar os danos fisiológicos causados por estes agentes estressores, por meio de metodologias não- invasivas e pela atividade de certas enzimas ligadas a um possível estresse oxidativo. Após quatorze dias de exposição aos tratamentos com flúor ou cádmio e vinte um dias para o tratamento salino, foram avaliados, os teores de clorofila, a assimilação de carbono, a condutância estomática, a transpiração, a relação Ci/Ca, a fluorescência rápida e lenta, o teor dos agentes estressores na planta, as atividades das enzimas SODs e POXs e a peroxidação de lipídeos. As plantas submetidas aos tratamentos com Na + Cl - tiveram o potencial osmótico das folhas e raízes, bem como os teores de clorofilas a, b, total e carotenóides diminuídos, sendo que a relação clorofila a/b não foi alterada. A assimilação de carbono, a relação carbono interno/externo, a condutância estomática, a transpiração, a taxa relativa de transporte de elétrons e o q P diminuíram enquanto que a relação F v /F m e o q N não sofreram alterações significativas. As atividades das SODs e das POXs foram aumentadas significativamente pelo estresse, sendo também observado um aumento na peroxidação de lipídeos, pelo incremento da quantidade do malonaldeído formado. As plantas submetidas aos diversos tratamentos com cádmio tiveram os teores do metal presentes nas raízes e folhas aumentados, os teores de clorofilas a, b, total e carotenóides, diminuídos sensivelmente a relação clorofila a/b não foi alterada. A assimilação de carbono diminuiu, a relação carbono interno/externo aumentou, a condutância estomática e a transpiração não sofreram alterações significativas. Os parâmetros de fluorescência, F v /F m , q P e q N e a taxa relativa de transporte de elétrons foram alterados pelo cádmio. As atividades das SODs e POXs foram aumentadas pelo estresse, também foi observado um aumento significativo na peroxidação de lipídeos. As plantas expostas às chuvas simuladas com diversas concentrações de flúor tiveram elevados teores deste íon nas folhas. Os teores de clorofilas a, b, total, carotenóides, e a relação clorofila a/b não foram alterados. A assimilação de carbono, a relação carbono interno externo, a condutância estomática e a transpiração, não sofreram alterações significativas. Os parâmetros de F v /F m , q P , q N e a taxa relativa de transporte de elétrons não foram alterados. O flúor nas quantidades aplicadas, não foi capaz de produzir um estresse oxidativo, não ocorrendo um aumento significativo das atividades das SODs e POXs e da peroxidação de lipídeos. A associação do IRGA, fluorômetro e medidor SPAD, foram capazes de detectar alterações no metabolismo das plantas tratadas com cloreto de sódio e cádmio e de sugerir possíveis causas destas alterações. Os efeitos dos agentes causadores de estresse, nas plantas, foram evidenciados pela diminuição dos teores de clorofila, eficiência do fotossistema II e assimilação de carbono, pelo aumento das atividades das POXs e SODs e pelo aumento da peroxidação dos lipídeos. A quantidade de flúor usado foi insuficiente para causar injúrias as plantas, o que foi demonstrado pela associação do IRGA, do fluorômetro e do medidor SPAD. / Seven days old tomato seedlings (Lycopersicum esculentum Mill) were grown in Hoagland solution and exposed to different concentrations of Na + Cl - , cadmium and fluorine simulated rain. The main goal was to evaluate the physiological damages due to the stressors elements through non invasive methods and enzymatic activity related to oxidative stress. At the end of the exposure period parameters were measured, such as, chlorophylls content, carbon assimilation, stomatal conductance, transpiration, Ci/Ca ratio, fluorescence characteristics, ions content, SOXs and PODs activity and lipids peroxidation. Plants submitted to Na + Cl - treatment had their leaves and roots osmotic potential decreased. The concentrations of chlorophyll a, b, total and carotenoids decreased but the chlorophyll a/b ratio did not change. All gas exchange parameter, electron transport rate and q P decreased, while the F v /F m ratio and q N did not suffer any significant changes. POXs and SODs activity showed a significantly increase due to the saline stress. Similarly, the lipid peroxidation was observed by an increment on malaldeid formation. The plants on cadmium treatment showed a high content of the metal on leaves and roots concomitantly with the applied does. The content of chlorophylls a, b, total, and carotenoids decreased while the chloroiphyll a/b ratio did not change. The carbon assimilation rate decreased despite the fact that the no significant alterations were observed on Ci/Ca ratio, stomatal conductance and transpiration rate. The fluorescence traits, F v /F m , q P , q N , and the electron transport rate were altered by cadmium. POXs and SODs acticity, as well as lipids peroxidation increased significantly under the cadmium treatment. The plants exposed to simulated acid rain containing fluorine showed a high concentration of the element on the leaves. The gas exchange parameters, in this treatment, were not significantly affected. It had supposed that the applied doses of fluorine were not enough to induce an oxidative stress, since the SODs and POxs activity and lipid peroxidation were not affected. The combined use of IRGA, fluorometer and SPAD reader was able to detect the physiological alterations on plants treated with NaCl and cadmium, showing thus, a potential as a non invasive methodology. The metabolic effects of the elements were evident by a decrease on chlorophylls content, carbon assimilation rate, and PSII efficiency while the activity of SODXs and POXs and lipids peroxidation increased .The treatment with fluorine acid rain, was not effective to produce detectable physiological changes, as showed by the non invasive screening, probably due to the applied doses. / Dissertação importada do Alexandria
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Clonagem molecular do Tomato chlorotic mottle virus (TCMV) e estudos de pseudo- recombinação entre begomovírus de tomateiros e Sida sp. / Molecular cloning of Tomato chlorotic mottle virus (TCMV) and pseudorecombination studies among begomoviruses from tomato and Sida sp.Andrade, Eduardo Chumbinho de 03 April 2002 (has links)
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Previous issue date: 2002-04-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A família Geminiviridae, caracterizada pela morfologia de partículas icosaédricas geminadas e genoma composto por DNA de fita simples circular, é dividida em quatro gêneros, de acordo com o tipo de inseto vetor, gama de hospedeiros, organização do genoma e relacionamento filogenético. Os begomovírus possuem dois componentes genômicos, são transmitidos por mosca-branca e infectam dicotiledôneas. A partir de 1994 houve relatos sucessivos de begomovírus em tomateiro em diversos estados brasileiros. O sequenciamento parcial do genoma de alguns destes vírus revelou que há uma grande diversidade de espécies, provavelmente como resultado da disseminação de vírus nativos pelo biótipo B da mosca-branca Bemisia tabaci. O objetivo do presente trabalho foi a caracterização molecular de uma nova espécie de begomovírus detectada no município de Igarapé, MG, denominada Tomato chlorotic mottle virus, isolado MG-Ig1 (TCMV-[MG- Ig1]), e o estudo da ocorrência de eventos de pseudo-recombinação entre begomovírus que infetam tomateiro e Sida sp. Para a caracterização molecular, foram sintetizados dois pares de oligonucleotídeos sobrepostos com sítios de restrição que possibilitaram a amplificação do genoma completo (fragmentos de aproximadamente 2.600 nucleotídeos para os componentes A e B) do TCMV-[MG-Ig1]. Para o sequenciamento, o genoma completo foi divido em subclones sobrepostos e as seqüências foram montadas com o auxílio de programas apropriados. A análise comparativa das seqüências confirmou a identidade do TCMV-[MG- Ig1] como uma espécie do gênero Begomovirus. Para os estudos de pseudo-recombinação foram misturados componentes virais clonados em uma cópia e meia do TCMV (isolados BA-Se1 e MG-Be1), Tomato rugose mosaic virus (TRMV), Tomato yellow mottle virus (TYMoV) e Tomato golden mosaic virus (TGMV), provenientes de tomateiro, e Sida yellow mosaic virus (SYMV) e Sida mottle virus (SMoV), provenientes de Sida rhombifolia. A inoculação foi realizada via biobalística em plantas de Nicotiana benthamiana, e o diagnóstico da infecção foi confirmado via PCR, utilizando oligonucleotídeos universais para begomovírus. Foram observados sintomas sistêmicos nas plantas inoculadas com os pseudo- recombinantes recíprocos entre TRMV e TGMV, TCMV-[BA-Se1] e TGMV, além de TRMV-A + TYMoV-B, TRMV-B + TCMV-[MG-Be1]-A, TRMV-B + SYMV-A, TCMV- [BA-Se1]-A + TYMoV-B, TCMV-[BA-Se1]-B + SMoV e TCMV-[BA-Se1]-B + SYMV-A. As infecções foram confirmadas via PCR em todos os casos. Os sintomas observados variaram de acordo com a combinação, desde leve clorose entre as nervuras até mosaico amarelo e encarquilhamento severo das folhas. Não foram observados sintomas sistêmicos nas plantas inoculadas com os pseudo-recombinantes recíprocos entre TRMV e TCMV-[BA- Se1], além de TCMV-[BA-Se1]-B + TCMV-[MG-Be1]-A. Na combinação entre TRMV-B + SMoV-A foram observados sintomas sistêmicos, porém apenas o componente A de SMoV foi detectado via PCR. / The Geminiviridae family, characterized by a particle morphology of twinned, incomplete icosahedra and a single-stranded, circular DNA genome, is divided into four genera according to the type of insect vector, host range, genomic organization and phylogeny. The begomoviruses have two genomic components, are transmitted by whiteflies and infect dicot plants. Since 1994 there have been successive reports of begomovirus infection in tomato, in several states of Brazil. Partial sequencing of the genome of some of the isolates revealed a high degree of genetic diversity, probably due to the dissemination of indigenous viruses by the B biotype of the whitefly Bemisia tabaci. The objective of the present work was the molecular characterization of a new species of begomovirus detected at the city of Igarapé, MG, named Tomato chlorotic mottle virus, isolate MG-Ig1 (TCMV-[MG- Ig1]), and the study of pseudorecombination events among begomoviruses from tomato and Sida sp. for the molecular characterization, two sets of overlapping primers with a common restriction site were designed to amplify the full-length viral genome (approximately 2.600 nucleotide fragments for the DNA-A and DNA-B) of TCMV-[MG-Ig1]. The full-length clones were subcloned for sequencing, and the sequences were assembled using the appropriate computer programs. Comparative analysis confirmed the identity of TCMV-[MG- Ig1] as a species of the genus Begomovirus. For the pseudorecombination studies, cloned DNA components TCMV (isolates BA-Se1 and MG-Be1), Tomato rugose mosaic virus (TRMV), Tomato yellow mottle virus (TYMoV) and Tomato golden mosaic virus (TGMV), from tomato, and Sida yellow mosaic virus (SYMV) and Sida mottle virus (SMoV), from Sida rhombifolia were mixed and inoculated by particle bombardment into Nicotiana benthamiana plants. Viral infection was confirmed by PCR with general begomovirus primers. Sistemic symptoms were oberved in plants inoculated with the reciprocal pseudorcombinants between TRMV and TGMV, TCMV-[BA-Se1] and TGMV, and also with TRMV-A + TYMoV-B, TRMV-B + TCMV-[MG-Be1]-A, TRMV-B + SYMV-A, TCMV- [BA-Se1]-A + TYMoV-B, TCMV-[BA-Se1]-B + SMoV and TCMV-[BA-Se1]-B + SYMV- A. Infections were confirmed by PCR in all cases. The symptoms observed varied with each combination, from a mild internerval chlorosis to yellow mosaic and severe leak crumpling. Sistemic symptoms were not observed in plants inoculated with the reciprocal pseudorecombinants between TRMV and TCMV-[BA-Se1], and also with TCMV-[BA-Se1]- B + TCMV-[MG-Be1]-A. The combination of TRMV-B + SMoV-A yielded sistemic symptoms, but only the SMoV DNA-A was detected by PCR. / Dissertação importada do Alexandria
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Biocaracterização de um isolado de Bacillus cereus selecionado para o controle biológico de enfermidades do tomateiro (Lycopersicon esculentum Mill.) / Biological characterization of an isolate of Bacillus cereus selected for the biological control of diseases of the tomato plant (Lycopersicon esculentum Mill.)Neves, Dora Marchiori Silva 26 April 2005 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-04T11:52:18Z
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Previous issue date: 2005-04-26 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Experimentos realizados por Silva (2002) objetivando o isolamento e seleção de rizobactérias indutoras de resistência sistêmica e agentes de biocontrele a múltiplos patógenos resultaram na obtenção de um isolado promissor, selecionado de rizosfera de plantas de tomateiro em cultivo comercial e identificado por análise de ácidos graxos como Bacillus cereus. Ensaios em condições de laboratório, casa de vegetação e campo foram realizados neste trabalho visando uma caracterização mais completa do isolado para uma melhor compreensão dos mecanismos de biocontrele envolvidos na interação rizobactéria-fitopatógenos. Testes bioquímicos e morfológicos confirmaram a identificação de espécie para o isolado e demonstraram sua versatilidade fisiológica e nutricional. Ainda, em ensaios laboratoriais, verificou-se a capacidade de utilização de certos antibióticos em estudos de dinâmica populacional de B. cereus e sua compatibilidade a pesticidas utilizados na cultura do tomateiro e a adjuvantes utilizados em formulações comerciais. Porém, estudos visando a avaliação da sobrevivência de células de B. cereus em uma formulação proposta veiculando o isolado não se mostraram eficientes na manutenção da viabilidade celular. Ensaios de antibiose direta contra diversos fitopatógenos demonstraram que o isolado não inibiu o crescimento da maioria dos isolamentos patogênicos testados. Em condições controladas, o isolado não promoveu o crescimento de plantas de tomateiro, e também não foi capaz de controlar Meloidogyne incognita. Porém foi capaz de aumentar a produtividade na cultura do tomateiro sob cultivo protegido e comprovar a capacidade de indução de resistência em plantas de tomateiro, quando desafiadas com Pseudomonas syringae pv. tomato. Em condições de campo, B. cereus não conseguiu controlar a epidemia de Phythophtora infestans, mesmo quando diferentes formas de dispensa da rizobactéria foram testadas, e não foi capaz de promover o crescimento de plantas de tomateiro. Em experimento realizado em infectario observou- se uma menor suscetibilidade a murcha bacteriana (Ralstonia solanacearum), permitindo que plantas de tomateiro advindas de sementes microbiolizadas com B. cereus apresentassem uma menor incidência da doença por um período de 30 dias, quando a severidade da doença igualou- se nos dois tratamentos, demonstrando que o isolado não foi efetivo em controlar a epidemia. Estudos Visando a manipulação e otimização de fatores relacionados as habilidades fisiológicas e bioquímicas do isolado fazem-se necessários para o conhecimento e exploraoção máxima de suas potencialidades, como futuros trabalhos de formulação, possibilitando a obtenção de um produto passível de utilização na produção de culturas de alto valor comercial, minimizando o uso de agrotóxicos e favorecendo a prática de uma agricultura ecologicamente correta. / Experiments carried out by Silva (2002) to isolate and select rhizobacteria inducer of systemic resistance and biological control agents against multiple pathogens resulted in the obtention of a promising isolate. It was selected in the rhizosphere of tomato plants in commercial cultivation and identified by analysis of fatty acids as Bacillus cereus. In this work, to get to a more complete characterization of the isolate, essays in laboratory, greenhouse and field conditions were carried out, for a better understanding of the biological control mechanisms involved in the rhizobacteria- phytopathogen interaction. Biochemical and morphological tests confirmed the identification of the species in the isolate, as well as demonstrated its physiologic diversity and nutritional versatility. Moreover, in laboratorial essays, the viability of using determined antibiotics to carry out studies of populational dynamics of the isolate was verified, as well as the compatibility of B. cereus to pesticides used on the tomato cultivation and adjuvants used in commercial formulations. But studies to evaluate the survival of B. cereus in a formulation containing the isolate did not prove to be efficient to keep the viability of the cells. Essays of direct antibiosis against various phytopathogens showed that the isolate was not efficient to inhibit the growth of the majority of pathogenic isolates tested. Under controlled conditions, the isolate did not promote the growth of tomato plants, and also did not have the ability to control Meloidogyne incognita. But it showed the ability to increase the productivity of the crop in sheltered cultivation, and to prove the induction of resistance in tomato plants, when they were challenged with Pseudomonas syringae pv. tomato. Under field conditions, B. cereus was unable to control an epidemy of Phythophtora infestans, even when various application forms of the rhizobacteria were tested, and it also did not promote the growth of tomato plants. In an eXperiment carried out in an “infectario” (infested microplot), a less susceptibility to bacterial wilt (Ralstonia solanacearum) was observed, allowing the tomato plants to resist with less incidence of the disease for a period of 30 days in plants grown from microbiolized seeds, although B. cereus was not effective to control the epidemy. Studies aiming at handling and optimizing factors related to the physiological and biochemical abilities of the isolate are needed for the understanding and maXimum exploitation of its potentialities. For the biological control of diseases in the tomato cultivation, besides further formulation works, there is the probability of obtaining a product that could be used in the production of crops with high commercial value and quality, and that can keep the effectivity of action of this microorganism in the biological control as well as to minimize the use of pesticides encourage the practice of an agriculture ecologically correct. / Tese importada do Alexandria
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Diversidade genética da suscetibilidade e coleção nuclear de Tuta absoluta em Lycopersicon spp. / Susceptibility genetic diversity and core collection of Tuta absoluta in Lycopersicon spp.Moreira, Gisele Rodrigues 13 March 2002 (has links)
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Previous issue date: 2002-03-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com os objetivos de estudar a variabilidade genética da suscetibilidade de populações da traça do tomateiro (Tuta absoluta), oriundas de quatro localidades, e propor coleção nuclear representativa das populações em Lycopersicon spp., caracteres biológicos de T. absoluta foram avaliados. O experimento foi conduzido segundo esquema fatorial 4 x 5 (populações de T. absoluta e germoplasma de tomateiro), no delineamento inteiramente casualizado, com 3 repetições. Foram utilizadas populações da traça do tomateiro provenientes de Uberlândia (MG), Viçosa (MG), Camocim de São Félix (PE) e Santa Teresa (ES) e espécies de Lycopersicon contendo os aleloquímicos 2-tridecanona e 2-undecanona (L. hirsutum f. glabratum PI 134417, L. esculentum cvs. Moneymaker e TOM-601) e sesquiterpeno-zingibereno (L. hirsutum f. hirsutum PI 126445). A cultivar Santa Clara foi utilizada como padrão de suscetibilidade à traça do tomateiro. A variabilidade genética das populações de T. absoluta foi estudada por meio de análises uni e multivariada, sendo esta última realizada por meio da divergência genética entre as populações de T. absoluta no germoplasma de tomateiro e vice versa. Estudou-se a importância relativa das características de T. absoluta para a divergência genética por meio da metodologia de Singh (1981). Caracteres biológicos de T. absoluta foram submetidos a análise multivariada, por meio de análise de agrupamento (método de otimização de Tocher), com a finalidade de estratificar as populações de T. absoluta no germoplasma de tomateiro. As populações da traça do tomateiro de cada grupo foram combinadas, de maneira a obter o número de entradas de cada grupo e escolher quais entradas fariam parte da coleção nuclear. Para cada caráter, em cada combinação, foi realizado o teste t de Student para uma média, sendo o valor paramétrico de referência tomado como sendo a média obtida nas quatro populações (coleção total). Estudou-se a importância relativa das características de T. absoluta para a divergência genética entre as populações de T. absoluta no germoplasma de tomateiro por meio da metodologia de Singh (1981). O acesso silvestre PI 126445 foi o germoplasma mais resistente às populações da traça do tomateiro, seguido de PI 134417. ‘TOM-601’ e ‘Moneymaker’ foram consideradas fontes intermediárias de resistência, enquanto que, a cultivar Santa Clara foi o germoplasma mais suscetível. A população Camocim de São Félix foi a mais suscetível à ‘Moneymaker’. Em ‘TOM-601’e PI 126445 a população Santa Teresa foi a mais suscetível. As populações de Uberlândia e Viçosa foram as mais suscetíveis ao PI 134417. Apenas na ‘Moneymaker’ as populações Viçosa e Uberlândia ficaram em grupos distintos, sendo que em PI 126445 e PI 134417 a formação dos grupos foi similar, reunindo em um grupo as populações de Uberlândia e Viçosa e em outro grupo as populações Camocim de São Félix e Santa Teresa. A mortalidade larval foi a que mais contribuiu com a divergência entre as populações da traça do tomateiro, com exceção de PI 134417, cujo caráter de maior contribuição foi número de pupas fêmea. O agrupamento que melhor distinguiu as fontes de resistência em relação ao germoplasma mais suscetível (‘Santa Clara’) foi obtido quando o germoplasma foi infestado pela população de Viçosa, visto que ‘Moneymaker’ e ‘TOM-601’ ficaram em grupo distinto das espécies silvestres PI 126445 e PI 134417; em grupo isolado permaneceu apenas a cultivar Santa Clara. Nos demais, as cultivares ‘Moneymaker’ e ‘TOM-601’ se agruparam ora com PI 126445 ora com PI 134417, mas em nenhum caso agrupou-se com a cultivar Santa Clara. Os caracteres que mais contribuíram com a divergência entre germoplasma de tomateiro foram mortalidade larval, número de pupas fêmea e número de pupas macho. A coleção nuclear proposta foi formada pelas populações da traça oriundas de Uberlândia e Santa Teresa. Apesar de ter sido proposta a coleção nuclear, em geral todas as combinações entre populações foram representativas das quatro populações estudadas. Isto provavelmente ocorreu devido ao fato de ter sido utilizado pequeno número de populações de T. absoluta. Portanto, seria interessante que em futuros trabalhos mais populações pudessem ser utilizadas, de modo a representar com maior confiabilidade a variabilidade da espécie. Os caracteres que mais contribuíram com a divergência genética entre as populações de T. absoluta, no germoplasma de tomateiro, foram período larval e número de pupas fêmea. / Aiming to study the susceptibility of Pinworm populations (Tuta absoluta) genetic variability, collected from four regions, and to propose a representative T. absoluta population core collection in Lycopersicon spp., several biological characteristics of T. absoluta were evaluated. A 4x5 (T. absoluta populations and tomato germplasm, respectively) factorial experiment was evaluated, in a completely randomized design with three replications. Were used T. absoluta populations originally from Uberlândia (MG), Viçosa (MG), Camocim de São Félix (PE) and Santa Teresa (ES) and Lycopersicon species containing the alelochimicals 2- tridecanone and 2-undecanone (L. hirsutum f. glabratum PI 134417 and L. esculentum cv. Moneymaker and L. esculentum cv.TOM-601) and sesquiterpene- zingiberene (L. hirsutum f. hirsutum PI 126445). The Santa Clara cultivar was used as a susceptibility pattern to the pinworm. The genetic variability evaluation was performed by uni and multivariated analysis, the latter done by means of the genetic divergence among T. absoluta populations in tomato germplasm and vice versa. The relative importance of T. absoluta characteristics to the genetic divergence was evaluated as proposed by Singh (1981). Biological characteristics were submitted to cluster analysis (Tocher optimization method), intending to split the populations in genetically distinct groups. The pinworm populations in each group were combined to obtain the number of entries of that group, and the entries that would be part of the core collection. For each variable in each combination, Student t test for one mean was performed, where the reference parametric value for each variable was considered as the four populations mean for that variable(total collection). The relative importance of T. absoluta characteristics to the genetic divergence in tomato germplasm was evaluated as proposed by Singh (1981). The wild access PI 126445 was the most resistant germplasm to the pinworm populations, followed by PI 134417. ‘TOM-601’ and ‘Moneymaker’, were identified as intermediate sources of resistance, while the Santa Clara cultivar was evaluated as the most susceptible germplasm. The Camocim de São Félix population was the most susceptible to ‘Moneymaker’. In ‘TOM-601’e PI 126445 Santa Teresa population was the most susceptible. Uberlândia and Viçosa populations were the most susceptible to PI 134417. It was observed that only in ‘Moneymaker’, Viçosa and Uberlândia populations were placed in distinct groups, thought that in PI 126445 and PI 134417 the groups formation were similar. The larval mortality was what most contributed to divergence among pinworm populations, except for PI 134417, which had the number of female pupae as the characteristic with the highest contribution. The best grouping representing the differentiation of the resistance sources regarding the susceptible germplasm was the one where the four genotypes were infested by Viçosa population, since that Moneymaker and TOM-601 cultivars were placed in a isolated group from wild species PI 126445 and PI 134417. In an isolated group stayed only the Santa Clara cultivar. In others groups Moneymaker and TOM-601 cultivars were sometimes grouped with PI 126445 and sometimes with PI 134417, but never with Santa Clara cultivar. The characteristics that most contributed to divergence among tomato germplasm were larval mortality, female pupae number and male pupae number. The core collection proposed in this work was formed by the pinworm population from Uberlândia and Santa Teresa. Nevertheless, despite a core collection being proposed, in general all combinations among pinworm populations were representative from the four populations studied. This might have happened because of the small number of T. absoluta populations evaluated. Therefore it would be interesting that in future works more populations could be used, in order to have a better representation of the specie variability. The characteristics that most contributed to the genetic divergence among T. absoluta populations in the tomato germplasm were larval period and female pupae number. / Dissertação importada do Alexandria
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Capacidade combinatória e diversidade genética das fontes de resistência de lycopersicon spp. e das populações de Tuta absoluta / Combining ability and genetic diversity of Lycopersicon spp. resistance sources and populations of Tuta absolutaSuinaga, Fábio Akiyoshi 04 October 2002 (has links)
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Previous issue date: 2002-10-04 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Esta pesquisa foi realizada com os objetivos de avaliar a diversidade de genótipos de Lycopersicon spp. quanto a resistência ao ataque de Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae), estudar as capacidades geral e específica de combinação do germoplasma em relação aos caracteres de resistência, e avaliar a variabilidade genética de oito populações de T. absoluta. Os genótipos foram quatro variedades de Lycopersicon esculentum: Ângela, IPA-5, Santa Clara, e TX 401-08 e seis acessos silvestres de Lycopersicon spp.: L. pennellii LA 716; L. hirsutum f. typicum LA 1777, LA 2329 e PI 126445; L. hirsutum f. hirsutum PI 127826; e L. hirsutum f. glabratum PI 134417. As características de resistência do tomateiro a T. absoluta avaliadas neste estudo foram: número de minas pequenas (comprimento < 0,5 cm), número de minas grandes (comprimento > 0,5 cm), mortalidade larval em percentagem, período larval em dias, peso de pupas em mg, mortalidade pupal em percentagem, e período pupal em dias. As populações de T. absoluta utilizadas no estudo de variabilidade foram provenientes dos Estados de Espírito Santo (Santa Tereza), Goiás (Goianápolis), Minas Gerais (Uberlândia e Viçosa), Pernambuco (Camocim de São Félix), Rio de Janeiro (São João da Barra), e São Paulo (Paulínea e Sumaré). No estudo de divergência genética de Lycopersicon spp. foram estimadas a distância generalizada de Mahalanobis (D 2 ), realizadas as análises de agrupamento de Tocher, bem como a análise por variáveis canônicas. Com base em D 2 , observou-se que os genitores mais similares foram Ângela e IPA-5, enquanto que Ângela e PI 126445 foram os mais divergentes. Os genitores foram divididos em três grupos, pelas técnicas de variáveis canônicas e Tocher. Na análise combinatória empregou-se o dialelo parcial detectando-se a predominância de efeitos gênicos aditivos na maior parte dos caracteres avaliados. Utilizando-se as estimativas de capacidade geral de combinação notou-se que os genitores mais indicados ao melhoramento genético do tomateiro visando resistência a T. absoluta foram: Ângela, Santa Clara, LA 716, e LA 1777. Analisando o desempenho das combinações Ângela x LA 716, Ângela x LA 2329, Santa Clara x PI 126445, Santa Clara x PI 127826 e TX 401-08 x LA 1777 concluiu- se, com base nos valores de capacidade específica de combinação, que estes híbridos têm alto potencial de gerar populações superiores. Na realização do estudo da variabilidade entre populações de T. absoluta empregou-se a técnica de marcadores moleculares AFLP (Amplified Fragment Lenght Polymorphism). A partir destes dados, realizaram-se as análises de UPGMA e coordenadas principais a fim de determinar as diferenças entre as populações advindas de diversas localidades brasileiras. Estas populações foram divididas em dois grupos (A: Camocin do São Félix, Paulínea, São João da Barra, Sumaré, e Uberlândia; B: Goianápolis, Santa Tereza, e Viçosa) sendo estes, parcialmente concordantes com estudos previamente realizados de resistência deste inseto a inseticidas. / This research was carried out in order to: evaluate the genetic divergence among genotypes of Lycopersicon spp. regarding their resistance to Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera: Gelechiidae) attack, study general and specific combining ability of these genotypes, and to estimate the genetic variability among eight populations of T. absoluta. The treatments (genotypes) used in this study were composed by 4 Lycopersicon esculentum cultivars: Ângela, IPA-5, Santa Clara, and TX 401-08; and 6 wild accessions of Lycopersicon spp.: L. pennellii LA 716; L. hirsutum f. typicum LA 1777, LA 2329 e PI 126445; L. hirsutum f. hirsutum PI 127826; e L. hirsutum f. glabratum PI 134417. The characteristics assessed in this study were: quantity of small mines (length < 0.5 cm); quantity of large mines (length > 0.5 cm); percentage of larval mortality; length of the larval phase; pupal weight; percentage of pupal mortality; and length of the pupal phase. Populations of T. absoluta from the states of Espírito Santo (Santa Tereza), Goiás (Goianápolis), Minas Gerais (Uberlândia and Viçosa), Pernambuco (Camocim de São Félix), Rio de Janeiro (São João da Barra), and São Paulo (Paulínea and Sumaré) were used in the study of the genetic variability of this insect. To evaluate the genetic divergence among Lycopersicon spp, the Mahalanobis distance (D 2 ) was estimated, as well as the group of genotypes based on Tocher technique and on canonical variable. Regarding D 2 , the most similar genotypes were Ângela and IPA-5, while Ângela and PI 126445 were the most divergent. Three groups of genotypes, based on Tocher technique and on canonical variables, were detected in this study. The combining ability was studied using partial diallel cross, where the main gene action was the additive effect, which was involved in the majority of characters. Considering GCA, the genotypes Ângela, Santa Clara, LA 716, e LA 1777 are the most indicated to be used in a breeding program for improving tomato resistance to T. absoluta. The best hybrids, based on SCA and heterosis, were Ângela x LA 716, Ângela x LA 2329, Santa Clara x PI 126445, Santa Clara x PI 127826 and TX 401-08 x LA 1777. It was concluded that those hybrids could have a great potential in tomato breeding programs. The AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) technique was used to assess the variability among populations of T. absoluta. Using this data, statistical analysis (UPGMA - Unweighted Pair-Group Method, based on arithmetic averages and principal coordinate analysis) were performed to estimate the differences among Brazilian populations of T. absoluta. As a result, these populations were divided in two groups which partially corroborate with previous toxicological studies. / Tese importada do Alexandria
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Antixenose em acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da UFV a Tuta absoluta e suas possíveis causas químicas / Antixenosis to Tuta absoluta in tomatoes accesses of UFV Vegetable Germoplasma Bank and possible chemical causesOliveira, Fabrício Alves de 10 February 2004 (has links)
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Previous issue date: 2004-02-10 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo deste trabalho foi avaliar cinqüenta e sete acessos de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade federal de Viçosa e os cultivares ‘Moneymaker’ e ‘TOM-601’ e ‘Santa Clara’ quanto a resistência por antixenose a traça do tomateiro Tuta absoluta (Meyrick) (Lepidoptera:Gelechiidae) e identificar suas possíveis causas químicas. A primeira parte do experimento foi conduzida em casa de vegetação no período de abril a julho de 2003 na Horta de Pesquisa do departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. O delineamento utilizado foi o de blocos ao acaso com 3 repetições. Foram realizadas infestações semanais com adultos de T. absoluta. As avaliações foram realizadas 30, 45 e 60 dias após transplantio. As características avaliadas foram número de minas grandes (diâmetro ≥ 0,5 cm), pequenas e totais/folha e porcentagem de folhas minadas. Folíolos de tomateiro com 90 dias de idade foram coletados e levados ao laboratório onde realizou-se extração hexânica e análise cromatográfica dos extratos obtidos. Foi observada baixa infestação por T. absoluta nos primeiros 45 dias de experimento. Já aos 60 dias após transplantio verificou-se alta infestação possibilitando a discriminação dos acessos avaliados para todas as características. Nos acessos BGH-55, BGH-83, BGH-225, BGH-227, BGH-320, BGH-406, BGH- 603, BGH-674, BGH-1282, BGH-1497, BGH-1708, BGH-1532, BGH-1989, BGH- 1990, BGH-7235, BGH-7238 ocorreram os menores números de minas grandes/folha e menores porcentagens de folhas minadas, indicando que estes podem ser os acessos candidatos a resistência por antixenose a T. absoluta . Nos acessos BGH-674 e BGH-1497, não foram observados qualquer dano causado pela traça do tomateiro em nenhuma das avaliações. Foram encontrados oito picos nos extratos hexânicos dos folíolos de tomateiro, os quais foram identificados como hexadecano, heptadecano, eicosano, 2-metil-tricosano, tetracosano, hexacosano, octacosano e dotriacontano. Em dois destes identificados com índice de viisimilaridade de 94% como tetracosano e hexacosano foram observadas correlações significativas com características de suscetibilidade a T. absoluta. Em nenhum dos picos identificados foram observadas correlações significativas com resistência do tomateiro à T.absoluta. / The aims of this study were to evaluate fifty-seven tomato accesses UFV Vegetable Germoplasma Bank (BGH-UFV), and the cultivars ‘Moneymaker’ and ‘TOM-601’ and ‘Santa Clara’ to resistance to Tuta absoluta by antixenosis mechanism besides identifying possible chemical causes. The first part of this experiment was carried out in a greenhouse between April and July 2003 at Horta de Pesquisa of UFV. A completely randomized block design with three replications was used. Infestations with T. absoluta adults were made weekly and evaluations were conducted thirty, forty-five and sixty days after transplanting. The characteristics evaluated were: number of mines (large mines with diameter ≥ 0.5 cm and small mines) and total mines per leaf and percentage of mined leaves. At ninety days, tomato leaflets were collected, transported to the laboratory, extracted with hexane and analyzed by gas chromatography/mass spectrometry (GC/MS.) A lower infestation was observed in the first forty-five days after transplanting. Sixty days after transplanting, a higher infestation was observed allowing the discrimination of the accesses evaluated. Accesses, BGH-55, BGH-83, BGH-225, BGH-227, BGH-320, BGH-406, BGH-603, BGH-674, BGH-1282, BGH-1497, BGH- 1708, BGH-1532, BGH-1989, BGH-1990, BGH-7235, BGH-7238 showed a lower number of large mines and lower percentage of mined leaves, indicating possible existence of antixenosis mechanism to T. absoluta. In BGH-674 and BGH-1497 accesses, no damage was by tomato pinworm. Eight peaks were observed in all the hexane extracts of tomatoes leaflets on GC/MS analysis, which were identified by the database as hexadecane, heptadecane, eicosane, tetracosane, hexacosane, octacosane and dotriacontane. 2-methyl-tricosane, Two of the peaks, identified with a similarity index of 94%, as tetracosane and hexacosane showed ixsignificant correlations with susceptibility characteristics of T. absoluta. None of peaks showed significant correlation with resistance characteristics.
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Interação do vírus do anel do pimentão (Pepper ringspot virus - PepRSV) com plantas hospedeiras / Interaction of 'vírus do anel do pimentão' (Pepper ringspot virus - PepRSV) with plant hostsTavares, Moana Lima 17 February 2017 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2017. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2017-04-13T14:02:07Z
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2017_MoanaLimaTavares.pdf: 3476137 bytes, checksum: 86b634a5033a3276f2eeb85ebea21d18 (MD5) / O tomateiro (Solanum lycopersicum L.) é uma das principais hortaliças cultivadas no mundo. O cultivo de tomateiro representa uma importante atividade econômica e social no Brasil. As viroses representam um grande desafio fitossanitário para as principais regiões produtoras desta hortaliça, sendo que os begomovírus, tospovírus e crinivírus destacam-se pela importância e alta incidência. Recentemente, houve relatos de ocorrência de um tobravírus em tomateiro no Brasil e a carência de informações sobre essa virose justifica uma alta demanda para a realização de estudos sobre esse importante grupo de vírus de plantas. Representantes do gênero Tobravirus apresentam o genoma constituído por RNA senso positivo e bipartido (RNA1 e RNA2). Os tobravírus são transmitidos planta a planta por nematoides de solo e raízes dos gêneros Paratrichodorus e Trichodorus (Família Trichodoridae), considerados seus vetores naturais. Este gênero é representado por apenas três espécies, Tobacco rattle virus (TRV), Pea early-browning virus (PEBV) e Pepper ringspot virus (PepRSV). Conhecido como vírus da mancha anelar do pimentão ou vírus da faixa amarela do tomateiro, o PepRSV foi descrito somente no Brasil, causando doenças nas culturas de pimenta, alcachofra, patchuli e tomate. O primeiro isolado a ser caracterizado foi proveniente de pimenta e é conhecido como isolado CAM (Campinas-SP). Em 2012, a ocorrência de dois isolados de PepRSV foi relatada em tomateiro rasteiro em Luziânia, GO, denominados LAV e Pivo4. O objetivo geral deste trabalho foi estudar a interação de PepRSV com plantas hospedeiras e construir clones infecciosos de PepRSV (isolado CAM e LAV). Dois isolados foram utilizados, CAM de pimentão e LAV, isolado de tomateiro. Inicialmente, estes isolados foram caracterizados biologicamente e um antissoro foi produzido (cap. 2). Adicionalmente, clones infecciosos foram construídos (cap. 3). No capítulo 2, o círculo de hospedeiro foi analisado a partir inoculação mecânica em plantas indicadoras e cultivares de tomateiro. Partículas virais foram purificadas visando a produção de anticorpos em coelhos. A presença das partículas purificadas foi confirmada em microscópio eletrônico de transmissão e o antissoro anti-CP foi produzido. No capítulo 3, descreve-se a construção de clones infeciosos de PepRSV isolado CAM e LAV através da extração de RNA total, seguido por uma RT-PCR do RNA1 e RNA2 que foram inseridos no vetor de clonagem pJL-89 por Gibson Assembly. Os clones de PepRSV (isolado CAM e LAV) gerados foram agroinfiltrados em plantas de N. benthamiana. Conclui-se com esse trabalho que foi possível a produção do antissoro policlonal anti-CP que foi utilizado como técnica de detecção sorológica para determinar o círculo de hospedeiros do isolado CAM de PepRSV (infectou sistemicamente 16 plantas distintas); PepRSV isolado CAM se transloca para o sistema radícular quando inoculado na parte aérea das hospedeiras Nicotiana tabacum ‘Samsun’, N. tabacum ‘TNN’, N. rustica, Capsicum chinense PI159236, C. annuum ‘Ikeda’, S. lycopersicum cv. Santa Clara, Chenopodium quinoa e Gomphrena globosa; as cultivares de tomateiro Santa Clara, AP533, N901, U2006, Money Maker e Gaucho são suceptíveis à infecção por PepRSV isolado CAM; foi detectado um novo isolado de PepRSV denominado Ag1. Finalmente, os clones infeciosos de dois isolados construídos se mostraram infectivos em plantas de N. benthamiana, viabilizando a realização de estudos aprofundados de replicação, transmissão e translocação. / The tomato (Solanum lycopersicum L.) is one of the main vegetables grown in the world. The cultivation of tomato represents an important economic and social activity in Brazil. Viruses represent a major phytosanitary problem for the major growing regions of this vegetable, being the begomovirus, tospovirus and crinivirus the ones with great importance and high incidence. Recently, there were reports of the occurrence of a tobravirus in Brazil and the lack of information about this virus disease justifies a high demand on starting a research on this important virus group. Members of the genus Tobravirus have the genome constituted by positive sense RNA in a bipartite genome (RNA1 and RNA2). Tobraviruses are transmitted plant-by-plant by soil nematodes of the genus Paratrichodorus and Trichodorus (family Trichodoridae), considered as their natural vectors. This genus is represented by only three species, Tobacco rattle virus (TRV), Pea early-browning virus (PEBV) and Pepper ringspot virus (PepRSV). Known as ‘vírus da mancha anelar do pimentão’ or ‘vírus da faixa amarela’, PepRSV is only described in Brazil, causing diseases in pepper, artichoke, patchuli and tomato plants. The first isolate characterized was from pepper and is known as isolate CAM (Campinas-SP). In 2012, the occurrence two isolates of PepRSV was reported in processing tomatoes in Luziânia, GO, denominated LAV and Pivo4 . The general objective of this work was to study the interaction of PepRSV with the host. Two isolates were used, CAM from pepper and LAV, collected in tomato in 2012. Initially, these isolates were characterized biologically and an antibody was produced (Chapter 2). Furthermore, infectious clones were constructed (Chapter 3). In the chapter 2, the host range was analyzed afer mechanical inoculation in indicator plants, and tomato cultivars. Viral particles were purified for the production of antibodies in rabbits. The presence of the purified particles was confirmed by transmission electron microscopy, and an atibody with good specificity was produced. In the chapter 3, PepRSV infectious clones were constructed by extracting total RNA, followed by an RNA-1 and RNA2 RT-PCR that were inserted into the pJL-89 cloning vector by Gibson Assembly and later were agro-infiltrated into susceptible plants. It was concluded that it was possible to produce anti-CP polyclonal antibody; the PepRSV CAM isolate infects 16 different plants systemically; PepRSV isolate CAM translocates to the root system when inoculated on the aerial part of the hosts Nicotiana tabacum 'Samsun', N. tabacum 'TNN', N. rustica, Capsicum chinense PI159236, C. annuum 'Ikeda', S. lycopersicum cv. Santa Clara, Chenopodium quinoa and Gomphrena globosa; the tomato cultivars AP533, N901, U2006, Money Maker and Gaucho were susceptible to infection by PepRSV isolated CAM; a new PepRSV isolate named Ag1 was detected; and finally the clones of PepRSV were infectious to N. benthamiana plants.
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