Zsfassung in engl. Sprache. - Würzburg, Univ., Diss., 2008

Thesis (PH.D.)--Michigan State University. Comparative Medicine and Integrative Biology, 2008. / Title from PDF t.p. (viewed on Aug. 11, 2009) Includes bibliographical references. Also issued in print.

Undergraduate honors paper--Mount Holyoke College, 2007. Dept. of Biological Sciences. / Includes bibliographical references (leaves 46-50).

Techn. Universiẗat, Diss., 2005--Darmstadt.

The aim of this master thesis was the investigation of the uncharacterized protein TbPH1, by in silico studies, determining effects of its knock-down, studying the effect of a knock-down on the cell cycle, examining its cellular localization, and finding out about possible complexes and interaction-partners.

This thesis highlights a divergent mitochondrial intermembrane assembly pathway in the parasitic protist Trypanosoma brucei. A comparative genomic study reveals the connection of Erv1 with the cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) pathway in trypanosomatids. Further, the CIA machinery of T. brucei has been described using RNAi interference and other biochemical and complementation assays. Finally, part of the divergent CIA machinery has been identified in the human intestinal pathogen Giardia intestinalis by means of complementation assays in T. brucei.

This thesis addresses several aspects of mitochondrial iron sulfur (Fe-S) cluster biogenesis and mitochondrial tRNA import and modifications in Trypanosoma brucei. Using RNA interference it uncovers essential role of Fe-S cluster assembly in tRNA(s) thiolation in both the cytosol and the mitochondrion of T. brucei. Further, this thesis describes the role of modifications in tRNA editing and in mitochondrial import of tRNAs. Finally, it provides evidence that in contrast to protein import, mitochondrial membrane potential is dispensable for import of tRNAs into the mitochondrion of T. brucei.

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:05:33Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo6280_1.pdf: 6554113 bytes, checksum: a5c056dd5ab8aaddb6aaf6d92bd9a8ae (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2006 / A síntese protéica é um processo básico e essencial para a sobrevivência dos seres vivos. Um dos pontos chave deste processo é a etapa de iniciação da tradução que é regulada pela ação de ao menos doze fatores protéicos chamados eIFs (eukaryotic Initiation Factor Fator de Iniciação de Eucariotos) perfazendo, aproximadamente, 30 polipeptídios em mamíferos. Os tripanossomatídeos, protozoários patogênicos de interesse médico e veterinário, apresentam características celulares próprias como a regulação da sua expressão gênica que ocorre em nível pós-transcricional. Nesse contexto a síntese de proteínas é um alvo em potencial para mecanismos de regulação, entretanto pouco se sabe sobre esse processo nos tripanossomatídeos. Em estudos prévios, foi iniciado nestes parasitas o estudo do fator eIF4F e observou-se a existência de múltiplos homólogos para cada uma de suas três subunidades. Neste trabalho utilizou-se ferramentas de bioinformática para identificar e caracterizar homólogos aos demais eIFs em Leishmania major, Trypanosoma brucei e T. cruzi. Foram identificados homólogos dos fatores eIF1, eIF1A, eIF5, eIF5A, eIF5B, eIF6 e sete subunidades do complexo eIF3 (b, c, d, e, f, i, k). Ao contrário do observado para as subunidades do eIF4F, e com a exceção da subunidade eIF3b, um único homólogo foi identificado para cada fator. A análise das seqüências protéicas mostrou que existe variabilidade no grau de conservação destes homólogos quando comparados com outros eucariotos (de 22% de identidade para o eIF3k até 58% para o eIF6). Em alguns casos foi possível mapear mutações exclusivas dos tripanossomatídeos. Também foram gerados modelos 3D de vários dos homólogos previamente identificados de subunidades do eIF4F facilitando sua caracterização funcional. Os resultados obtidos indicam que boa parte da iniciação da síntese protéica é conservada entre tripanossomatídeos e demais eucariotos. Todavia, diferenças significativas parecem ocorrer e merecem um estudo mais aprofundado

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In last decade, investigations of mitochondria including their various reduced forms such as hydrogenosomes and mitosomes revealed unexpected diversity of this indispensable organelle. Interestingly, the single mitochondrion of parasitic protist Trypanosoma brucei is able to undergo remarkable functional and structural changes reflecting available carbon sources. Moreover, it was proposed that trypanosomes belong among the most ancient eukaryotes and as such, their mitochondria raised high attention of biologists. To contribute to the knowledge of mitochondrial biogenesis and function, we focused on studies of two key mitochondrial processes, the processing of preproteins that are imported to the mitochondria, and mechanism of pyruvate transport to these organelles. Moreover, we also investigated uptake of iron by T. brucei. This metal is essential for function of numerous proteins, particularly for iron-sulfur proteins in mitochondria. Evolutionary history of trypanosomes and their mitochondrion is a question of debates. According to some reports, mitochondrion of trypanosomes represent an ancient form of this organelle, which is supported by identification of putative "archaic" translocase of the outer mitochondrial membrane (ATOM) and finding of only a single type of translocation pore in...