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Variabilidade genética e evolução do gene PRNP em veados cinzas (Mammalia; Cervidae; Mazama)

LIMA, Isabel Luiza de Melo Nunes Freire 10 August 2016 (has links)
Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-04-26T22:48:02Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇAO Isabel Luiza de Melo Nunes Freire Lima.pdf: 1037392 bytes, checksum: 56d64e9802047711f027f316cbc24e14 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-26T22:48:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇAO Isabel Luiza de Melo Nunes Freire Lima.pdf: 1037392 bytes, checksum: 56d64e9802047711f027f316cbc24e14 (MD5) Previous issue date: 2016-08-10 / FACEPE / CNPQ / O gênero Mazama é constituído por cervídeos sul-americanos e se divide, de acordo com a cor da pelagem, em veados vermelhos e veados marrons ou cinzas. Este segundo grupo é formado por M. gouazoubira e M. nemorivaga. O gene PRNP codifica a proteína Príon envolvida, quando em sua forma patogênica, na susceptibilidade a um conjunto de doenças neurológicas fatais e incuráveis. A Doença da Debilidade Crônica em Cervídeos (CWD) é um dos males neurológicos associados aos Príons, sendo epidêmica na América do Norte, porém nunca relatada em indivíduos Sul-americanos. A fim de entender qual curso evolutivo que esse gene percorreu nas espécies da família Cervidae, realizou-se uma análise de quais os mecanismos evolutivos que ele vem sendo submetido. Para tanto, foram analisadas as sequencias de nucleotídeos do éxon 3 do gene PRNP em amostras de 42 espécimes do gênero Mazama (M. gouazoubira - n: 36; M. nemorivaga - n: 06) de diversas regiões do Brasil, em comparação com outras espécies da família Cervidae. A inferência do mecanismo evolutivo do PRNP entre os cervídeos analisados neste estudo através do Teste de Neutralidade (dN-dS) sugere que nos Veados do Velho Mundo o gene vem passando por deriva genética. Já nos Veados do Novo Mundo a evolução ocorre em alternância de processos de deriva genética e seleção positiva. / The Mazama Genus consists of South American deer and is divided, according to the fur color in red deer and brocket deer. This second group is formed by M. gouazoubira and M. nemorivaga. The PRNP gene encoding the prion protein involved when the pathogenic form in susceptibility to a group of incurable and fatal neurological diseases. The Chronic Wasting Disease (CWD) is one of these neurological malady associated with prions and epidemic in North America, but never reported in South American individuals. In order to understand which evolutionary course that ran gene in the species of the Cervidae family was held an analysis of which of the possible evolutionary mechanisms that it are being submitted. Therefore, we analyzed the sequences of nucleotides of exon 3 of the PRNP gene in samples from 42 specimens of the genus Mazama (M. gouazoubira - n: 36; M. nemorivaga -n: 06) from different regions of Brazil. In comparison with other species of the Cervidae family, the conservation of the gene was observed in aligning sequences. The inference of the evolutionary mechanism of PRNP among cervids analyzed in this study through the Neutrality Test (dN-dS) suggests that Old World Deer in the gene has undergone genetic drift. Already in the evolution of New World deer occurs in alternation of positive selection and genetic drift processes.
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Partição de habitats entre os cervídeos do Parque Nacional do Iguaçu / Habitat partition among cervids in the Iguaçu National Park

Vogliotti, Alexandre 19 February 2009 (has links)
Este estudo avaliou os padrões que determinam a distribuição espacial entre as espécies simpátricas Mazama americana e Mazama nana ao longo do Parque Nacional do Iguaçu, sob os princípios da exclusão competitiva e da coexistência de espécies ecologicamente próximas. Foram formulados três potenciais modelos de partição de habitats para avaliar as relações entre a freqüência de ocorrências de cada uma das espécies com um conjunto de sete variáveis bióticas e abióticas mensuradas junto a cada unidade amostral. As ocorrências dos animais foram determinadas pela localização de amostras de fezes (unidades amostrais) encontradas ao longo do parque. As amostras foram identificadas geneticamente pela técnica do PCR/RFLP, com um marcador espécie-específico do gene do citocromo b do DNA mitocondrial extraído das amostras. No Modelo de Partição Parapátrica as freqüências de cada espécie (variável dependente) foram comparadas em função da altitude (m) acima do nível do mar, utilizada como indicativo dos tipos florestais considerados nesse modelo. No Modelo de Seleção Diferencial de Nichos, as espécies foram contrastadas com os valores de declividade (%), altura de dossel (m), densidade de cobertura vegetal vertical (%), densidade de cobertura horizontal (%) e o número de estratos vegetais (1-5). No Modelo de Partição Temporal, foram comparados os padrões de atividade de ambas as espécies, resultantes de um monitoramento com armadilhas fotográficas realizado nos extremos altitudinais do parque. Resultados significativamente discriminantes das freqüências de ocorrência das espécies foram observados em relação à altitude, densidade de cobertura vertical, horizontal e ao número de estratos vegetais, além de uma relação parcial com a declividade. A correlação observada entre a altitude e as variáveis de nicho (declividade, densidade vertical e horizontal) sugere um papel mais determinante do Modelo de Distribuição Parapátrica na modulação da distribuição de ambas as espécies na área em detrimento da Seleção Diferencial de Nichos. Na ausência de diferenças significativas entre os padrões circadianos de ambas as espécies, o Modelo de Partição Temporal também foi rejeitado. Uma análise adicional das dimensões (comprimento e largura) das síbalas fecais revelou uma grande sobreposição dos valores de ambas as espécies, rejeitando a validade de sua utilização como ferramenta para uma correta identificação dessas espécies na região. / This study evaluated the determinant patterns of spatial distribution among the sympatric species Mazama americana and Mazama nana in the Iguaçu National Park under the principles of competitive exclusion and coexistence of ecologically related species. Three potential models of habitat partition were proposed to evaluate the relations among the occurrence frequencies of the species and a set of seven biotic and abiotic variables measured near of each sample unit. Animal occurrences were determined by the location of fecal samples (sample units) found along the park. Samples were genetically identified by PCR/RFLP technique, using a species-specific cytochrome b gene marker of the mitochondrial DNA extracted from fecal samples. In the Parapatric Partition Model, frequencies of each species (dependant variable) were compared with respect to the altitude (m) above the sea level, used here as an index of the two forest types considered in this model. In the Niche Differential Selection Model, species were contrasted under its values of declivity (%), canopy height (m), canopy density (%), understory density (%) and the number of vegetal strata (1-5). In the Temporal Partition Model, the activity patterns obtained from a camera trap monitoring performed in both height extremes of the park were compared among the species. Significant results for differentiation of the species occurrence frequencies were observed for altitude, canopy and understory densities and number of vegetal strata, beyond a partial relation to declivity. An observed correlation between altitude and some of the niche variables (declivity, canopy and understory densities) suggests a more determinant role of the Parapatric Distribution Model to modulate the local distribution of both species, in detriment of the Niche Differential Selection one. The lack of significant differences between both daily activity patterns lead to the rejection of the Temporal Partition Model. An additional analysis of the fecal pellet dimensions (length and width) showed a high overlap of values from both species, refusing the validity of its use as secure identification tool for this species in the region.
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Partição de habitats entre os cervídeos do Parque Nacional do Iguaçu / Habitat partition among cervids in the Iguaçu National Park

Alexandre Vogliotti 19 February 2009 (has links)
Este estudo avaliou os padrões que determinam a distribuição espacial entre as espécies simpátricas Mazama americana e Mazama nana ao longo do Parque Nacional do Iguaçu, sob os princípios da exclusão competitiva e da coexistência de espécies ecologicamente próximas. Foram formulados três potenciais modelos de partição de habitats para avaliar as relações entre a freqüência de ocorrências de cada uma das espécies com um conjunto de sete variáveis bióticas e abióticas mensuradas junto a cada unidade amostral. As ocorrências dos animais foram determinadas pela localização de amostras de fezes (unidades amostrais) encontradas ao longo do parque. As amostras foram identificadas geneticamente pela técnica do PCR/RFLP, com um marcador espécie-específico do gene do citocromo b do DNA mitocondrial extraído das amostras. No Modelo de Partição Parapátrica as freqüências de cada espécie (variável dependente) foram comparadas em função da altitude (m) acima do nível do mar, utilizada como indicativo dos tipos florestais considerados nesse modelo. No Modelo de Seleção Diferencial de Nichos, as espécies foram contrastadas com os valores de declividade (%), altura de dossel (m), densidade de cobertura vegetal vertical (%), densidade de cobertura horizontal (%) e o número de estratos vegetais (1-5). No Modelo de Partição Temporal, foram comparados os padrões de atividade de ambas as espécies, resultantes de um monitoramento com armadilhas fotográficas realizado nos extremos altitudinais do parque. Resultados significativamente discriminantes das freqüências de ocorrência das espécies foram observados em relação à altitude, densidade de cobertura vertical, horizontal e ao número de estratos vegetais, além de uma relação parcial com a declividade. A correlação observada entre a altitude e as variáveis de nicho (declividade, densidade vertical e horizontal) sugere um papel mais determinante do Modelo de Distribuição Parapátrica na modulação da distribuição de ambas as espécies na área em detrimento da Seleção Diferencial de Nichos. Na ausência de diferenças significativas entre os padrões circadianos de ambas as espécies, o Modelo de Partição Temporal também foi rejeitado. Uma análise adicional das dimensões (comprimento e largura) das síbalas fecais revelou uma grande sobreposição dos valores de ambas as espécies, rejeitando a validade de sua utilização como ferramenta para uma correta identificação dessas espécies na região. / This study evaluated the determinant patterns of spatial distribution among the sympatric species Mazama americana and Mazama nana in the Iguaçu National Park under the principles of competitive exclusion and coexistence of ecologically related species. Three potential models of habitat partition were proposed to evaluate the relations among the occurrence frequencies of the species and a set of seven biotic and abiotic variables measured near of each sample unit. Animal occurrences were determined by the location of fecal samples (sample units) found along the park. Samples were genetically identified by PCR/RFLP technique, using a species-specific cytochrome b gene marker of the mitochondrial DNA extracted from fecal samples. In the Parapatric Partition Model, frequencies of each species (dependant variable) were compared with respect to the altitude (m) above the sea level, used here as an index of the two forest types considered in this model. In the Niche Differential Selection Model, species were contrasted under its values of declivity (%), canopy height (m), canopy density (%), understory density (%) and the number of vegetal strata (1-5). In the Temporal Partition Model, the activity patterns obtained from a camera trap monitoring performed in both height extremes of the park were compared among the species. Significant results for differentiation of the species occurrence frequencies were observed for altitude, canopy and understory densities and number of vegetal strata, beyond a partial relation to declivity. An observed correlation between altitude and some of the niche variables (declivity, canopy and understory densities) suggests a more determinant role of the Parapatric Distribution Model to modulate the local distribution of both species, in detriment of the Niche Differential Selection one. The lack of significant differences between both daily activity patterns lead to the rejection of the Temporal Partition Model. An additional analysis of the fecal pellet dimensions (length and width) showed a high overlap of values from both species, refusing the validity of its use as secure identification tool for this species in the region.
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Análise comparativa do período de atividade entre duas populações de Mazama americana (veado-mateiro) / Comparative analysis of the activity period between two populations of Mazama

Azevedo, Allyson Diaz Koester 19 February 2009 (has links)
O veado-mateiro (M. americana) é a maior espécie do gênero Mazama. A taxonomia da espécie suscita dúvidas quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em amplo estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas em uma relação geográfica coerente. Esse fato sugere a existência de diversas espécies dentro do grupo M. americana. Com base nesta hipótese, identificamos o período de atividade entre duas dessas variantes, na busca de diferenças ecológicas que pudessem afetar o isolamento reprodutivo dessas duas populações. Além de ser um relevante dado da história natural das espécies, o conhecimento do período de atividade pode ser utilizado como ferramenta para minimizar os esforços em trabalhos de campo. Para tanto este estudo empregou armadilhas fotográficas por dois meses na estação chuvosa e dois meses na estação seca no Parque Nacional do Iguaçu, no Estado do Paraná e na Floresta Nacional do Jamari, no Estado de Rondônia. As armadilhas fotográficas foram dispostas em pontos previamente identificados nas potenciais rotas de deslocamento dos animais (carreiros e riachos). Tanto a população de M. americana do Parna Iguaçu, quanto à da Flona do Jamari, não apresentaram diferenças significativas no período de atividade. Aparentemente as duas populações apresentam hábitos catemerais, estando ativas durante todo o ciclo circadiano (24h). Em relação à sazonalidade encontramos maior atividade para M. americana na Amazônia na estação chuvosa (73,33% dos registros fotográficos), enquanto o padrão de atividade da população da Mata Atlântica apresentou semelhanças nas duas estações. Apesar da diferença nos padrões de atividade em relação à sazonalidade das duas populações, este estudo não caracterizou nenhuma diferença ecológica relevante que pudesse levar ao desenvolvimento de fatores de isolamento reprodutivo entre essas duas populações potencialmente simpátricas. Outra informação relevante registrada neste estudo, apesar de não ter sido o foco desta dissertação, foi de que outra espécie de cervídeo simpátrica à M. americana na Amazônia, M. nemorivaga, apresentou-se ativo apenas durante o dia, com 61,35% das fotos registradas no período entre 12:00 e 18:00h. Este mesmo período do dia é justamente o período em que M. americana apresentou seu menor índice de registros fotográficos apenas 8,32%. Também foram caracterizadas diferenças nos padrões de atividade das duas espécies amazônicas em relação à sazonalidade. A freqüência de fotos de M. nemorivaga foi semelhante na chuva e na seca. Enquanto M. americana apresentou maior atividade no período chuvoso. / The red brocket deer (M. americana) is the largest species in the genus Mazama. The taxonomy of the species raises doubts as to the number of subspecies included or even as to the development of these into species. In an extensive cytotaxonomic study, chromossomal variations were found within a coherent geographical context. This fact suggests the existence of several species within the M. americana group. Based on this hypothesis, we identified the activity period for two of these variants, in the hope of discovering the ecological distinctions that could affect the reproductive isolation of these two populations. Besides being a relevant fact in the natural history of species, knowledge of the activity period can be used as a tool to minimize efforts in fieldwork. To this end, we employed camera trapping for two months in the rainy season and two months in the dry season in the Iguaçu National Park, in the state of Paraná, and in the Jamari National Forest, in the state of Rondônia. The camera phototraps were set up at sites previously identified in the potential movement routes of the animals (trails and streams). Neither the M. americana population of the Iguaçu National Park nor that of the Jamari National Forest showed any significant differences between each other in the activity period. Apparently both populations possess cathemeral habits, and are active during the entire circadian rhythm (24 hrs). As to seasonal aspects, we registered greater activity of the Amazon M. americana during the rainy season (73.33% of photographic records), while the activity pattern of the Atlantic forest population showed similar results for both seasons. In spite of the difference in seasonal activity patterns between the two populations, this study did not identify any relevant ecological distinction that could lead to the development of reproductive isolation factors between these two potentially sympatric populations. Another relevant data reported in the study, though not the main focus of this paper, was that another cervine species, sympatric to M. americana in the Amazon region, M. nemorivaga, was only active during the day period, with 61.35% of the pictures being recorded between 12 o’clock noon and 6 p.m. This time frame is precisely the same period in which the M. americana had the lowest rate of photographic shots registered, only 8.32%. Differences in activity patterns between the two Amazonian species were also recorded in relation to seasonal aspects. The frequency of photos taken of M. nemorivaga during the rainy season was similar to that of the dry period. In contrast, data for M. americana indicated they have a higher level of activity during the rainy time of year.
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Área de uso e seleção de habitats por veado-catingueiro (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814) no Pantanal de Nhecolândia-MS / Area of use and habitat selection by brown brocket deer (Mazama gouazoubira, Fisher, 1814) in the Nhecolândias Pantanal-MS

Antunes, Vinícius Soares 15 June 2012 (has links)
O espaço físico é uma das principais dimensões do nicho de uma espécie uma vez que a maneira como é utilizado determina uma série de interações ecológicas com o ambiente. No presente estudo estimou-se o tamanho da área de uso e a seleção de habitats considerando duas escalas de seleção (2a e 3a ordem) pelo veado-catingueiro (Mazama gouazoubira) na sub-região de Nhecolândia, Pantanal sul-matogrossense. Foram capturados e utilizados 3 indivíduos de veadocatingueiro nas análises. Rádio-colares VHF (telemetria convencional) e colares GPS (telemetria digital) foram utilizados para determinação das localizações dos animais. O período total de monitoramento foi de 6 meses e abrangeu o final da estação seca e início da estação chuvosa dos anos 2010-2011. A telemetria digital em um dos indivíduos monitorados (veado-controle) permitiu corrigir e simular projeções no tamanho da área dos indivíduos monitorados pela telemetria convencional. O veado-catingueiro apresentou uma área média de 73,2 ± 32,9 ha pelo método do mínimo polígono convexo considerando a correção das áreas obtidas pela telemetria VHF. Na escala de 2a ordem de seleção de habitat a categoria floresta (cordilheiras e capões de mata) foi a única selecionada positivamente pelos indivíduos analisados. A seleção foi testada através do teste do qui-quadrado de qualidade de ajustamento e utilizando o intervalo de confiança de Bonferroni. Na escala de 3a ordem, apesar de não haver diferença significativa do uso das categorias de vegetação em relação à disponibilidade, as áreas abertas como os campos e bordas de baía foram habitats importantes no que se refere à obtenção de recursos forrageiros. Concluiu-se que o veado-catingueiro é uma espécie de cervídeo que necessita de uma área relativamente pequena para suprir seus requerimentos e tem as cordilheiras e os capões de mata como habitat de suma importância no que se refere a alocação de sua área de uso. / The physique space is a major dimensions of the niche of a species as the way is used for determining a series of interactions with the ecological environment. In the present study we estimated the size of the home range and habitat selection considering two scales of selection (second and third order) by brown brocket deer (Mazama gouazoubira) in the sub-region Nhecolândia, Pantanal, Mato Grosso do Sul state. Were captured and used three individuals brown brocket deer in the analyzes. VHF radio-collars (conventional telemetry) and collars GPS (digital telemetry) were used to determine the locations of the animals. The total period of monitoring was 6 months and covered the late dry season and rainy season of the year 2010-2011. The digital telemetry from individuals monitored (control deer) allowed a simulated projections in the surface area of conventional subjects monitored by telemetry. The deer brown brocket showed an average area of 73.2 ± 32.9 ha by the minimum convex polygon method considering the correction of areas obtained by VHF telemetry. On the scale of the second order of selection forest habitat category (chains and capons of forest) was the only positively selected by the individuals analyzed. The selection was tested using the chi-square goodness of fit and using the Bonferroni confidence interval. On the scale of the third order, although no significant difference in the use of categories of vegetation in relation to the availability, open areas like fields and edges of the bay habitats were important with regard to obtaining forage resources. It was concluded that the deer brown brocket is a species of deer that requires a relatively small area to meet your requirements and has the chains and capons of forest as a habitat of great importance as regards the allocation of its area of use.
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Veados-campeiros (Ozotoceros bezoarticus (Linnaeus, 1758)) (Mammalia : Cervidae) no nordeste do Pantanal do Mato Grosso (RPPN SESC Pantanal), Barão de Melgaço, MT : densidade, tamanho populacional e uso dos hábitats

Manço, Aniela Moretti 07 1900 (has links)
Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2017-10-18T22:24:01Z No. of bitstreams: 1 640101.pdf: 4136989 bytes, checksum: 421abb2d2f8315a97633c880e4d100b9 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-18T22:24:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 640101.pdf: 4136989 bytes, checksum: 421abb2d2f8315a97633c880e4d100b9 (MD5) Previous issue date: 2004-07 / CAPES / SESC Pantanal / Ozotoceros bezoarticus (veado-campeiro) é um cervídeo sul-americano que tem preferência por habitats abertos e evita formações arbóreas. A redução de seus habitats tem levado a espécie à ameaça de extinção. O presente estudo teve como objetivos estimar a densidade, o tamanho populacional e a preferência de habitats em uma área do nordeste do Pantanal do Mato Grosso (Reserva Particular do Patrimônio Natural SESC Pantanal, Barão de Melgaço, MT). Foi aplicado o método de transecção linear sendo que seis rotas foram estabeleci das e amostradas a cavalo em dois períodos do ano (estação úmida e estação seca). As estações foram analisadas separadamente, sendo igualmente avaliado o efeito de uma estrada sobre a população. As análises foram realizadas via o software DISTANCE (estratificada e não-estratificada) e via Estimador de Hayne e Hayne modificado. Na estação úmida a densidade foi de 0,87 indivíduos/km² e o tamanho populacional de 31 indivíduos. Na estação seca a estimativa de densidade foi de 0,27 indivíduos/km² e o tamanho da população de 27 indivíduos. No estrato Estrada a densidade estimada foi de 1,19 indivíduos/km²; no estrato Não-estrada foi de 0,83 indivíduos/km². O número de indivíduos associado a cada estrato foi 5 e 26, respectivamente. Os habitats mais preferidos no período úmido foram os campos com murundus com capim Brachiaria humidicola; no período seco foram os campos baixos. Dentre os habitats utilizados, os campos com murundus foram os mais evitados nas duas estações. As classes mais abertas foram selecionadas com mais intensidade. As variações sazonais ou mudanças na vegetação, pelo decréscimo da atividade humana na área da Reserva, podem estar influenciando na distribuição e no tamanho da população, podendo colocá-la de maneira afastada das condições ótimas esperadas para a espécie. / Ozotoceros bezoarticus (pampas deer) is a South American deer associated to open habitats. The species avoids closed formations. The reduction of habitats has drive the speeies to near the extinction threat. The present study aims to estimate the population density, size and habitat preferences in an area located in northeastem of the Pantanal wetland (SESC Pantanal Reserve, Barão de Melgaço, MT). Through six transects sampled by horseback in dry and wet season, stratified and not stratified samples were analyzed using the software DISTANCE, and by Hayne's estimator and Modified Hyne estimatorto evaluate the population density. In the wet season the estimated density was of 0,87 deer/km², and a population size of 31 individuaIs. In the dry season the estimated density 0,27 deer/km², and a popuIation size of 27 individuaIs. In the road stratum the deer density was of 1,19 deer/km². In no-road stratum ihe deer densiiy was of 0,83 deer/km². The number of individuaIs associated to each stratum was 5 and 26, respectively. The most selected habitats in the wet season was “campos de murundus” (earthmound fields) with Brachiaria humidicola grass. In the dry period the most selected habitat was open grasslands. Among all the used habitats the earthmound fieIds were the most avoided in the two seasons. The seasonaI variations (floodings) and changes in the vegetation zones, as result of human activity reduction, may affeet the distribution of the species and the population size moving the species away from optimaI conditions.
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Área de uso e seleção de habitats por veado-catingueiro (Mazama gouazoubira; Fisher, 1814) no Pantanal de Nhecolândia-MS / Area of use and habitat selection by brown brocket deer (Mazama gouazoubira, Fisher, 1814) in the Nhecolândias Pantanal-MS

Vinícius Soares Antunes 15 June 2012 (has links)
O espaço físico é uma das principais dimensões do nicho de uma espécie uma vez que a maneira como é utilizado determina uma série de interações ecológicas com o ambiente. No presente estudo estimou-se o tamanho da área de uso e a seleção de habitats considerando duas escalas de seleção (2a e 3a ordem) pelo veado-catingueiro (Mazama gouazoubira) na sub-região de Nhecolândia, Pantanal sul-matogrossense. Foram capturados e utilizados 3 indivíduos de veadocatingueiro nas análises. Rádio-colares VHF (telemetria convencional) e colares GPS (telemetria digital) foram utilizados para determinação das localizações dos animais. O período total de monitoramento foi de 6 meses e abrangeu o final da estação seca e início da estação chuvosa dos anos 2010-2011. A telemetria digital em um dos indivíduos monitorados (veado-controle) permitiu corrigir e simular projeções no tamanho da área dos indivíduos monitorados pela telemetria convencional. O veado-catingueiro apresentou uma área média de 73,2 ± 32,9 ha pelo método do mínimo polígono convexo considerando a correção das áreas obtidas pela telemetria VHF. Na escala de 2a ordem de seleção de habitat a categoria floresta (cordilheiras e capões de mata) foi a única selecionada positivamente pelos indivíduos analisados. A seleção foi testada através do teste do qui-quadrado de qualidade de ajustamento e utilizando o intervalo de confiança de Bonferroni. Na escala de 3a ordem, apesar de não haver diferença significativa do uso das categorias de vegetação em relação à disponibilidade, as áreas abertas como os campos e bordas de baía foram habitats importantes no que se refere à obtenção de recursos forrageiros. Concluiu-se que o veado-catingueiro é uma espécie de cervídeo que necessita de uma área relativamente pequena para suprir seus requerimentos e tem as cordilheiras e os capões de mata como habitat de suma importância no que se refere a alocação de sua área de uso. / The physique space is a major dimensions of the niche of a species as the way is used for determining a series of interactions with the ecological environment. In the present study we estimated the size of the home range and habitat selection considering two scales of selection (second and third order) by brown brocket deer (Mazama gouazoubira) in the sub-region Nhecolândia, Pantanal, Mato Grosso do Sul state. Were captured and used three individuals brown brocket deer in the analyzes. VHF radio-collars (conventional telemetry) and collars GPS (digital telemetry) were used to determine the locations of the animals. The total period of monitoring was 6 months and covered the late dry season and rainy season of the year 2010-2011. The digital telemetry from individuals monitored (control deer) allowed a simulated projections in the surface area of conventional subjects monitored by telemetry. The deer brown brocket showed an average area of 73.2 ± 32.9 ha by the minimum convex polygon method considering the correction of areas obtained by VHF telemetry. On the scale of the second order of selection forest habitat category (chains and capons of forest) was the only positively selected by the individuals analyzed. The selection was tested using the chi-square goodness of fit and using the Bonferroni confidence interval. On the scale of the third order, although no significant difference in the use of categories of vegetation in relation to the availability, open areas like fields and edges of the bay habitats were important with regard to obtaining forage resources. It was concluded that the deer brown brocket is a species of deer that requires a relatively small area to meet your requirements and has the chains and capons of forest as a habitat of great importance as regards the allocation of its area of use.
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Análise comparativa do período de atividade entre duas populações de Mazama americana (veado-mateiro) / Comparative analysis of the activity period between two populations of Mazama

Allyson Diaz Koester Azevedo 19 February 2009 (has links)
O veado-mateiro (M. americana) é a maior espécie do gênero Mazama. A taxonomia da espécie suscita dúvidas quanto ao número de subespécies ou até quanto ao desdobramento destas em espécies. Em amplo estudo citotaxonômico foram encontradas variações cromossômicas em uma relação geográfica coerente. Esse fato sugere a existência de diversas espécies dentro do grupo M. americana. Com base nesta hipótese, identificamos o período de atividade entre duas dessas variantes, na busca de diferenças ecológicas que pudessem afetar o isolamento reprodutivo dessas duas populações. Além de ser um relevante dado da história natural das espécies, o conhecimento do período de atividade pode ser utilizado como ferramenta para minimizar os esforços em trabalhos de campo. Para tanto este estudo empregou armadilhas fotográficas por dois meses na estação chuvosa e dois meses na estação seca no Parque Nacional do Iguaçu, no Estado do Paraná e na Floresta Nacional do Jamari, no Estado de Rondônia. As armadilhas fotográficas foram dispostas em pontos previamente identificados nas potenciais rotas de deslocamento dos animais (carreiros e riachos). Tanto a população de M. americana do Parna Iguaçu, quanto à da Flona do Jamari, não apresentaram diferenças significativas no período de atividade. Aparentemente as duas populações apresentam hábitos catemerais, estando ativas durante todo o ciclo circadiano (24h). Em relação à sazonalidade encontramos maior atividade para M. americana na Amazônia na estação chuvosa (73,33% dos registros fotográficos), enquanto o padrão de atividade da população da Mata Atlântica apresentou semelhanças nas duas estações. Apesar da diferença nos padrões de atividade em relação à sazonalidade das duas populações, este estudo não caracterizou nenhuma diferença ecológica relevante que pudesse levar ao desenvolvimento de fatores de isolamento reprodutivo entre essas duas populações potencialmente simpátricas. Outra informação relevante registrada neste estudo, apesar de não ter sido o foco desta dissertação, foi de que outra espécie de cervídeo simpátrica à M. americana na Amazônia, M. nemorivaga, apresentou-se ativo apenas durante o dia, com 61,35% das fotos registradas no período entre 12:00 e 18:00h. Este mesmo período do dia é justamente o período em que M. americana apresentou seu menor índice de registros fotográficos apenas 8,32%. Também foram caracterizadas diferenças nos padrões de atividade das duas espécies amazônicas em relação à sazonalidade. A freqüência de fotos de M. nemorivaga foi semelhante na chuva e na seca. Enquanto M. americana apresentou maior atividade no período chuvoso. / The red brocket deer (M. americana) is the largest species in the genus Mazama. The taxonomy of the species raises doubts as to the number of subspecies included or even as to the development of these into species. In an extensive cytotaxonomic study, chromossomal variations were found within a coherent geographical context. This fact suggests the existence of several species within the M. americana group. Based on this hypothesis, we identified the activity period for two of these variants, in the hope of discovering the ecological distinctions that could affect the reproductive isolation of these two populations. Besides being a relevant fact in the natural history of species, knowledge of the activity period can be used as a tool to minimize efforts in fieldwork. To this end, we employed camera trapping for two months in the rainy season and two months in the dry season in the Iguaçu National Park, in the state of Paraná, and in the Jamari National Forest, in the state of Rondônia. The camera phototraps were set up at sites previously identified in the potential movement routes of the animals (trails and streams). Neither the M. americana population of the Iguaçu National Park nor that of the Jamari National Forest showed any significant differences between each other in the activity period. Apparently both populations possess cathemeral habits, and are active during the entire circadian rhythm (24 hrs). As to seasonal aspects, we registered greater activity of the Amazon M. americana during the rainy season (73.33% of photographic records), while the activity pattern of the Atlantic forest population showed similar results for both seasons. In spite of the difference in seasonal activity patterns between the two populations, this study did not identify any relevant ecological distinction that could lead to the development of reproductive isolation factors between these two potentially sympatric populations. Another relevant data reported in the study, though not the main focus of this paper, was that another cervine species, sympatric to M. americana in the Amazon region, M. nemorivaga, was only active during the day period, with 61.35% of the pictures being recorded between 12 o’clock noon and 6 p.m. This time frame is precisely the same period in which the M. americana had the lowest rate of photographic shots registered, only 8.32%. Differences in activity patterns between the two Amazonian species were also recorded in relation to seasonal aspects. The frequency of photos taken of M. nemorivaga during the rainy season was similar to that of the dry period. In contrast, data for M. americana indicated they have a higher level of activity during the rainy time of year.
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Área de vida e uso de habitat por fêmeas de veado-campeiro (Ozotoceros bezoarticus) nos diferentes períodos reprodutivos, no Pantanal Sul-Matogrossence / Home-range and habitat use by females of Pampas Deer (Ozotoceros bezoarticus) in different reproductive periods, in Pantanal Sul-Matogrossense

Versiani, Natalia Fraguas 20 May 2011 (has links)
As populações de veado-campeiro vêm sofrendo constantes ameaças, principalmente pela caça excessiva e destruição de seu habitat. A escassez de conhecimento sobre a biologia da espécie dificulta a elaboração de diferentes formas de manejo. Assim, há necessidade de estudos básicos para a instituição de programas para a conservação do veado-campeiro, principalmente no Brasil. O presente estudo teve como objetivos estimar o tamanho da área de vida de fêmeas de veado-campeiro, além de quantificar e comparar o uso de habitat pelas mesmas nos períodos reprodutivos e não-reprodutivos no Pantanal Sul-Matogrossense. Foram utilizadas quatro fêmeas de veado-campeiro em vida livre marcadas com colares de GPS modelo ATS® G2110, as quais tiveram suas localizações registradas a cada 13 horas por um período de aproximadamente 12 meses. Os cálculos para área de vida foram feitos através do programa ArcView® GIS versão 3 Extensão Animal Movement, usando os métodos do Mínimo Polígono Convexo (MPC) com 100% das localizações, e Kernel fixo com 95%, 70% e 50% de probabilidade de uso, sendo os dois últimos para estimativas dos centros de atividade. As fêmeas tiveram uma área de vida anual média de 549,88ha ± 124,76 quando estimado pelo MPC e 258,69ha ± 34,54 quando estimado por Kernel com 95% de probabilidade de uso. Quanto às áreas de uso mensais por status reprodutivo, não houve diferença significativa entre os meses (p > 0,05), evidenciando apenas uma pequena diminuição no tamanho das áreas de vida durante o período de aleitamento e um aumento nas épocas de acasalamento. Os habitats foram estabelecidos pelo tipo de vegetação predominante na área e foram caracterizados por imagem de satélite Landsat-5 e verificação in loco da região de estudo. Para verificar se houve uso desproporcional entre as categorias de habitats em relação à disponibilidade em suas respectivas áreas de vida foi usado o teste qui-quadrado de qualidade de ajustamento (chi-square goodness-of-fit test) e posterior estimativa do intervalo simultâneo de confiança de Bonferroni. Na análise anual, os habitats campo e baía foram selecionados, apesar deste último ser o menos abundante, enquanto floresta e caronal foram evitados pelas fêmeas de veado-campeiro. No entanto, ao analisarmos a seleção de habitat mensalmente para comparar o uso entre os diferentes status reprodutivos, o habitat campo tendeu a ser preferido, mas seu uso foi igual ao disponível em todos os períodos. Sendo assim, este estudo elucidou algumas informações sobre a ecologia do veado-campeiro, a fim de facilitar o desenvolvimento de programas de conservação para a espécie. / The pampas deer populations have been under constant threats, mainly by excessive hunting and habitat destruction. The lack of knowledge about the biology of the species hampers the development of different forms of management. Thus, there is a need for basic studies of establishment of conservation programs, mainly in Brazil. This study aimed to estimate the size of home-range, to quantify and compare the habitat use by females in reproductive and non-reproductive periods rights in Pantanal Sul-Matogrossense. Four females of pampas deer were marked with GPS collars, model ATS® G2110, which had recorded their locations every 13 hours for approximately 12 months. The calculations for home-range were made using the Arcview® GIS version 3 Extension Animal Movement, using the methods of the minimum convex polygon (MPC) with 100% of the locations, and fixed Kernel 95%, 70% and 50% of probability, being the last two for estimating the activity centers. The females had an annual home-range average of 549.88 ± 124.76 ha when estimated by MPC and 258.69 ± 34.54 ha when estimated by Kernel with 95% of probability. For the monthly home-ranges for reproductive status, no significant difference among months (p > 0.05), showing only a slight decrease in the size of home-range during the suckling period, increasing in the mating seasons. The habitats were established by the type of dominant vegetation and characterized by landsat-5 imaging satellite and in loco verification of the study area. To determine if there was disproportionate use of habitats between the categories regarding availability in their respective home-range, was used the chi-square goodness-of-fit test and subsequent estimation of Bonferroni simultaneous confidence intervals. In annual analysis, field and bay habitats were selected, despite the last being the less abundant, while forest and caronal were avoided by females of pampas deer. However, when analyzing the monthly habitat selection to compare the use between the different reproductive status, the habitat field tended to be preferred, but its use was equal to that available in all periods. Thus, this study clarified some informations about the ecology of pampas-deer, facilitating conservation programs development for the species.
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Análise molecular de amostras fecais de uma população de veado-mateiro (Mazama americana) para a obtenção de informações genéticas e ecológicas / Molecular analysis of faecal samples of a red brocket deer (Mazama americana) population for obtaining genetic and ecological information

Oliveira, Márcio Leite de 30 August 2010 (has links)
O gênero Mazama é composto por cinco espécies no Brasil. São animais de visualização dificultada por causa de comportamentos evasivos, o que torna as capturas e os estudos comportamentais quase impossíveis. Assim, o uso de metodologias não invasivas para estudos ecológicos e genéticos destas espécies se torna necessário. A análise do DNA fecal está dentro das técnicas mais promissoras para esse fim. Este estudo objetivou genotipar amostras fecais, de uma população de veado-mateiro (Mazama americana) para a obtenção de informações genéticas e ecológicas. Para tanto, foram coletadas, com auxílio de um cão farejador, georreferenciadas e estocadas em etanol absoluto, 52 amostras fecais de cervídeos. A coleta realizou-se em um fragmento (21o20S 47o17W) de 600 ha de floresta estacional semidecidual. Dessas amostras coletadas, 31% (n=16) foram classificadas como frescas e 69% (n=36) como não frescas. O DNA foi extraído em torno de 30 dias após a coleta, usando o kit comercial QIAamp® DNA Stool Mini Kit, seguindo o protocolo do fabricante. Das 52 amostras, 45 foram identificadas por PCR/RFLP como pertencentes a M. americana e as demais apresentaram problemas de amplificação e digestão, permanecendo sem identificação. Amplificaram-se por PCR cinco locos microssatélites, e o sucesso de amplificação, visualizado em gel de agarose, variou com o tamanho dos locos e com a classe das amostras. O sucesso de amplificação foi de 65% das amostras da categoria fresca e 35% das amostras da categoria não fresca. Encontrou-se uma correlação negativa (R= -0,82) entre o tamanho dos fragmentos dos locos de microssatélites e o sucesso de amplificação. Foi possível identificar o sexo do animal em 43,7% das amostras fecais, pela amplificação do gene da amelogenina. Os locos microssatélites amplificados foram analisados em sequenciador automático. Os eletroferogramas gerados pelo seqüenciador impossibilitaram a genotipagem da maioria dos locos e amostras, tornando inviável qualquer análise genética e ecológica com confiabilidade. Fica evidente a dificuldade de se trabalhar com a metodologia do DNA fecal para a identificação individual e sexagem de amostras obtidas de Cervídeos florestais em vida livre. Algumas melhorias metodológicas (coleta de amostras fecais frescas, seleção de iniciadores para locos menores e quantificação do DNA extraído por PCR em tempo real) são sugeridas para o aumento nos índices de sucesso na genotipgem em estudos futuros. / Mazama genus is composed by five species in Brazil. All of them are difficult to observe due to their evasive behaviors, what makes the captures and behavioral studies almost impossible. Thus, the use of non invasive methodologies is necessary to study the ecology and genetics of these species. The fecal DNA analysis is one of the most promising techniques for this purpose. This study aimed to genotype a Mazama americana population faecal samples for obtaining genetics and ecological information. For this, 52 deer faecal samples were collected in a 600ha seasonal semideciduos forest fragment (21o20S 47o17W), with the help of a detection dog, stored in ethanol and georeferenced. Of these samples 31% (n=16) was classified as fresh and 69% (n=36) as not fresh. About thirty days after the collection the DNA was extracted using the QIAamp® DNA Stool Mini Kit following the manufacturers instructions. From the 52 samples collected and extracted, 45 were identified by PCR/RFLP as M. americana and the others showed amplification and digestion problems, remaining without identification. Five microsatellite loci were amplified by PCR and the amplification success, visualized in agarose gel, varied with the loco size and age class. The amplifications success occurred in 65% of the fresh samples and in 35% of the non-fresh samples and a negative correlation (R= -0.82) was found between amplification success and loci sizes. It was possible to identify the animal sex in 43% of the samples by the amelogenin gene. The microsatellite loci amplifications were analyzed in an automatic sequencer. The majority of the samples and loci were impossible to genotype because of the quality of the elestroferograms, what made impossible any reliable genetic and ecological analysis. It is evident the difficulty to work with the faecal DNA methodology using field collected forests deer samples for individual and sexual identifications. Some methodological improvements (collect fresh samples, select primers for shorter loci and quantify the extracted DNA by real time PCR) are suggested to increase the genotyping success indexes in future studies

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