Ce travail a pour objectif de générer des modèles vasculaires et de simuler des écoulements sanguins réalistes à l'intérieur de ces modèles. La première étape consiste à segmenter/reconstruire le volume 3D du réseau vasculaire. Une fois de tels volumes vasculaires segmentés et maillés, il est alors possible de simuler des écoulements sanguins à l'intérieur de ceux-ci. Pour la segmentation, nous utilisons une approche variationnelle. Nous proposons un premier modèle qui inclut un a priori de tubularité dans les modèles de débruitage ROF et TV-L1. Néanmoins, bien que ces modèles permettent de réhausser les vaisseaux, ils ne permettent pas de les segmenter. C'est pourquoi nous proposons un deuxième modèle amélioré qui inclut à la fois un a priori de tubularité et de direction dans le modèle de segmentation de Chan-Vese. Les résultats sont présentés sur des images synthétiques 2D, ainsi que sur des images rétiniennes. En ce qui concerne la simulation, nous nous intéressons d'abord au réseau veineux cérébral, encore peu étudié. Les équations de la dynamique des fluides qui régissent les écoulements sanguins dans notre géométrie sont alors les équations de Navier-Stokes. Pour résoudre ces équations, la méthode classique des caractéristiques est comparée avec un schéma d'ordre plus élevé. Ces deux schémas sont validés sur des solutions analytiques avant d'être appliqués aux cas réalistes du réseau veineux cérébral premièrement, puis du polygone artériel de Willis. / The aim of this work is to generate vascular models and simulate blood flows inside these models. A first step consists of segmenting/reconstructing the 3D volume of the vascular network. Once such volumes are segmented and meshed, it is then possible to simulate blood flows. For segmentation purposes, we use a variational approach. We first propose a model that embeds a vesselness prior in the denoising models ROF and TV-L1. Although these models can enhance vessels, they are not designed for segmentation. Then, we propose a second, improved model that includes both vesselness and direction priors in the Chan-Vese segmentation model. The results are presented on 2D synthetic images, as well as retinal images. In the second part, devoted to simulation, we first focus on the cerebral venous network, that has not been intensively studied. The equations governing blood flows inside our geometry are the Navier-Stokes equations. For their resolution, the classical method of characteristics is compared with a high-order scheme. Both schemes are validated on analytical solutions before their application on the realistic cases of the cerebral venous network, and the arterial polygon of Willis.

L'athérosclérose est une atteinte de la paroi des vaisseaux, qui détériore progressivement la circulation du sang à mesure qu'elle évolue. Les crises cardiaques et les attaques cérébrales qui sont les conséquences de cette maladie causent, dans les pays industrialisés, plus de décès que le cancer. L'angiographie est l'ensemble des techniques d'imagerie utilisées durant le diagnostic, le traitement, et le suivi de l'athérosclérose. Récemment, il a été montré que l'angiographie par Résonance Magnétique (ARM) avait un fort potentiel pour remplacer l'angiographie conventionnelle, invasive, par imagerie à rayons X. Cependant, pour exploiter toutes les informations apportées par cette modalité, il est nécessaire de mettre au point des méthodes plus objectives et plus reproductibles.<br />Cette thèse montre, à l'aide de deux applications, comment l'analyse d'images peut proposer une solution pour la définition et l'implémentation de ces méthodes. Premièrement, en utilisant la segmentation pour améliorer la visualisation de clichés d'ARM utilisant des produits de contraste du pool sanguin. Cette technique est aussi appliquée en angiographie scanner. Nous montrons que, en utilisant un algorithme issu de la théorie des graphes et de la logique floue, associé à une interaction limitée avec un utilisateur expert, nous pouvons simplifier la visualisation de structures 3D complexes comme les arbres vasculaires. Deuxièmement, nous proposons une méthodologie pour analyser la géométrie des artères en ARM corps entier. La ligne centrale des artères est extraite, et les propriétés géométriques de cette courbe 3D sont calculées, pour améliorer l'interprétation des angiogrammes. Ces techniques sont le point de départ d'une approche plus globale que la procédure conventionnelle d'évaluation de l'athérosclérose, dans l'espoir un jour d'utiliser ces méthodes pour un suivi systématique des maladies vasculaires.<br />Nous avons développé les méthodes que nous présentons dans le but qu'elles soient utilisées dans la pratique clinique. Cependant, elle peuvent potentiellement être utilisées pour d'autres applications de l'analyse d'images.