Ambientes dulcícolas ocupam uma pequena parcela da superfície do planeta comparada aos ambientes marinhos e terrestres, porém são de suma importância para diversas atividades humanas e essenciais à manutenção da vida. Por estarem localizadas próximas a áreas urbanizadas passam a servir como corpos receptores de efluentes domésticos e até industriais. A cidade de Cubatão, SP, abriga um importante pólo industrial do país, sendo o rio Cubatão o corpo receptor principal de efluentes domésticos e industriais. O rio Cubatão é o principal da região e abastece quase toda a Baixada Santista juntamente com o rio Pilões. A intenção deste presente trabalho é evidenciar as fontes de contaminação do Rio Cubatão, por meio da literatura e de resultados de efeitos ecotoxicológicos (crônico e agudo) determinados em águas superficiais, utilizando os organismos Ceriodaphnia dubia e Vibro fischeri, respectivamente. Forte esforço foi aplicado a fim de quantificar os surfactantes (princípio ativo de detergentes) e outros contaminantes de interesse que permitam estabelecer a relação causa-efeito da toxicidade. Para as análises químicas e biológicas foram coletadas águas superficiais em cinco pontos do rio Cubatão, 2 pontos nos canais de Fuga da Usina Henry Borden e um ponto nos rios Pilões e Perequê. Os ensaios realizados com V. fischeri possibilitaram identificar toxicidade em todos os pontos amostrais, entre as cinco campanhas, cujos valores variaram entre CE(I)50 25,98% e 61%. Os resultados obtidos com C. dubia, tratados pelo Teste t por bioequivalência, mostraram toxicidade nos pontos P0; P1; P3; P4; P5 e P6 na terceira campanha. Na segunda e terceira campanha, os valores médios para a reprodução de C.dubia variaram entre 2,9 a 12,6 neonatas, possível efeito observado para a espécie, já que estes valores estiveram abaixo de 15 organismos, número mínimo recomendado pela ABNT NBR 13373:2004 para C.dubia. Com relação à condutividade das águas, o valor médio de 774,18 μS/cm-1 foi determinado para o P5, sendo esta média significativamente maior em relação aos demais pontos, possivelmente associado a proximidade das salinas da Carbocloro S.A. Indústrias Químicas. O P5 apresentou valor médio de 74,68 mg/L para cloretos.Os valores de compostos fenólicos, na segunda e terceira campanha, variaram entre 0,05 e 3,62 mg/L, concentrações essas acima do estabelecido pelo CONAMA 357:2005, para rios de classe 1 e 2 (0,003 mg/L). Os valores médios de surfactantes aniônicos estiveram entre 0,01 e 0,04 mg/L. Embora duas substâncias tenham sido empregadas na calibração do método (LAS) e (DSS), os resultados mostraram que não há diferença significativa na quantificação de surfactantes, pelo método (MBAS methylene blue active substance - APHA, 2005) (p ≤ 0,01). Em análise qualitativa foram identificados compostos aromáticos como tolueno, xileno, benzeno, etilbenzeno e diclorobenzeno, nos pontos amostrados em fevereiro de 2011. / Freshwater environments occupy a small portion of the surface compared to marine and terrestrial environments, but are critical for many activities essential to maintaining human life. By being located close to urban areas they serve as receptors bodies and even industrial effluents. The city of Cubatão, SP, houses an important industrial center in the country. Cubatão river is an important receptor of sewage and industrial effluents. It is the principal river of the region and supplies almost all of Baixada Santista with the Pilões river. The intention of this paper is to highlight the sources of contamination for Cubatão, through literature and results of ecotoxicological effects (chronic and acute) to be determined in surface water bodies using Ceriodaphnia dubia and Vibro fischeri, respectively. Strong effort was applied to quantify surfactant (active ingredient of detergents) and other contaminants of interest for determining the cause-effect relationship of toxicity. For chemical and biological analysis surface waters of the Cubatão river were collected in five points, two points in the channels of Henry Borden Plant, one on the Pilões and Perequê river. Through tests using V. fischeri toxicity was identified in all nine sampling sites, whose values ranged from EC(I)50 25.98% up to 60%. The results obtained from C. dubia , using \"t for bioequivalence\" showed toxic effects at P0, P1, P3, P4, P5 and P6 , third campaign. Dring the second and third campaign, it was obtained 2.9 to 12.6 neonates of C.dubia , numbers interpreted as chronic effects once they were quite below 15 neonates, number recommended by Brazilian environmental agencies (ABNT NBR 13373:2004). Water conductivity was much higher at P5, 774.18 μS/cm-1, mean value, probably related to the salt source from Carbocloro SA Chemical Industries. Chlorides at P5 was 74.68 mg/L, confirming the last statemente. Phenolic compounds varied from 0.05 to 3.62 mg/L, which is above the recommended by CONAMA 357:2005 (0,003 mg/L). Anionic surfactants varied from 0,01 to 0,04 mg/L. Although using two substances for internal method calibration (LAS) e (DSS), no statistically diference was obtained (p ≤ 0,01) (MBAS methylene blue active substance - APHA, 2005). Quantitative analysis reveled the following aromatic substances: toluene, xilene, benzene, ethylbenzene and dichlorobenzene, during February 2011 samplings.

Dissertation (Ph.D.)--University of South Florida, 2008. / Includes vita. Includes bibliographical references. Also available online.

published_or_final_version / abstract / toc / Ecology and Biodiversity / Master / Master of Philosophy

Includes bibliographical references. / 1 v. (various foliations) : ill. ; 30 cm. / Title page, contents and abstract only. The complete thesis in print form is available from the University Library. / Investigates the mechanism of serotype conversion between the Inaba and Ogawa serotypes of Vibrio cholerae 01. / Thesis (Ph.D.)--University of Adelaide, Dept. of Microbiology and Immunology, 1993?

Thesis (Dr. P.H.)--University of Texas Health Science Center at Houston, School of Public Health, 1988. / Includes bibliographical references (leaves 158-179).

Thesis (Ph. D.)--University of Hong Kong, 1991.

Thesis (M.S.)--University of Delaware, 2007. / Principal faculty advisor: Haiqiang Chen, Animal & Food Sciences. Includes bibliographical references.

Thesis (M.S.)--Oregon State University, 2008. / Printout. Includes bibliographical references (leaves 78-97). Also available on the World Wide Web.

AMARANTE, Deborah Oliveira. Viabilidade de agentes bacterianos como probiótico no cultivo do camarão marinho Litopenaeus vannamei. 2016. 54 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia de Pesca, Fortaleza-CE 2016 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-25T12:59:38Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_doamarante.pdf: 1020688 bytes, checksum: 0e9a0df944198bacc3311bb495290af9 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-25T12:59:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_doamarante.pdf: 1020688 bytes, checksum: 0e9a0df944198bacc3311bb495290af9 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-25T12:59:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_doamarante.pdf: 1020688 bytes, checksum: 0e9a0df944198bacc3311bb495290af9 (MD5) Previous issue date: 2016 / Probiotics have emerged as an alternative to antibiotics in the control of pathogenic bacteria. Seeking alternatives to reduce Vibrio infections comes the use of bacteria of the genus Bacillus as prevention for the onset of diseases. The main objective of the research was to test the feasibility and efficiency of bacteria isolated from the intestinal tract of healthy shellfish such as probiotic agents in the cultivation of Litopenaeus vannamei. Were tested 17 strains of the genus Bacillus and a strain of genus Paenibacillus, of the following species: B. circulans (n = 1), B. megaterium (n = 1), B. subtilis (n = 2), B. cereus ( n = 2), Bacillus thuringiensis (n = 2), Bacillus sp. (n = 9) and P. agaridevorans (n = 1). The temperature tolerance activity tests were conducted under different concentrations viability pH and tolerance to NaCl. The susceptibility testing to antibiotics and analysis of the presence or absence of some virulence factors was performed. The inhibition test was done to pathogens in two ways: using agar plugs and through cross-striations (cross streak). The aggregation ability was observed through the glass adhesion test. In vivo experiment was performed using Litopenaeus vannamei shrimp with average weight of 10 g. The experimental design was completely at random and were supplemented as follows: Treatment A: control (no supplementation); Treatment B: a strain sprinkler; Treatment C: Bacterial mix spray; Treatment D: A Strain bioencapsulated sodium alginate; Treatment E: Bacterial mix bioencapsulated sodium alginate. The feed was offered ad libitum three times a day for 30 days. Biometrics animal was taken every 10 days. After 30 days of feeding, the shrimp were challenged against the pathogen Vibrio harveyi. Standard plate count (SPC) was performed to Vibrio and Bacillus from gut and intestinal contents before and after the infection of the system. Most of the strains showed potential for use as probiotics in shrimp farming. The final weight was statistically superior to the initial weight for treatments A, B, D and E (p <0.05). The treatments of bacteria of the genus Bacillus reduced growth of bacteria of the genus Vibrio after infection. Thus, it suggested to carry out further studies of potential probiotic strains of Bacillus sp. in the control of Vibrio, minimizing the effects of this pathogen in shrimp farming. / Os probióticos surgiram como alternativa ao uso de antibióticos no controle de bactérias patogênicas. Buscando alternativas para reduzir as vibrioses surgiu a utilização das bactérias do gênero Bacillus como prevenção para o aparecimento de enfermidades. O objetivo principal desta pesquisa foi testar a viabilidade e eficiência de bactérias isoladas do trato intestinal de crustáceos saudáveis como agentes probióticos no cultivo do camarão Litopenaeus vannamei. Foram testadas 17 cepas do gênero Bacillus e uma cepa do gênero Paenibacillus, pertencentes às seguintes espécies: B. circulans (n=1), B. megaterium (n=1), B. subtilis (n=2), B. cereus (n=2), B. thuringiensis (n=2), Bacillus sp. (n=9) e P. agaridevorans (n=1). Foram realizados testes de atividade da tolerância à temperatura, viabilidade sob diferentes concentrações de pH e tolerância ao NaCl. Foi realizado o teste de susceptibilidade a antimicrobianos e da análise da presença ou ausência de alguns fatores de virulência. O teste de inibição de patógenos foi feito de duas formas: através de plugs de ágar e por intermédio de estrias cruzadas (cross streak). A capacidade de agregação foi verificada por meio do teste de aderência ao vidro. O experimento in vivo foi realizado utilizando camarões Litopenaeus vannamei com peso médio de 10 g. O delineamento experimental foi totalmente ao acaso e foram suplementados da seguinte forma: Tratamento A: controle (sem suplementação); Tratamento B: uma cepa por aspersão; Tratamento C: mix bacteriano por aspersão; Tratamento D: uma cepa bioencapsulada em alginato de sódio; Tratamento E: mix bacteriano bioencapsulado em alginato de sódio. A alimentação foi ofertada ad libitum três vezes ao dia por 30 dias. A biometria dos animais foi feita a cada 10 dias. Passados os 30 dias de alimentação, os camarões foram desafiados frente ao patógeno Vibrio harveyi. Foi realizada a Contagem Padrão em Placas (CPP) de Vibrio e Bacillus do intestino e do conteúdo intestinal, antes e após a infecção do sistema. A maioria das cepas testadas apresentaram potencial para uso como probióticos em carcinicultura. O peso final foi estatisticamente superior ao peso inicial para os tratamentos A, B, D e E (p<0,05). Os tratamentos que utilizaram as bactérias do gênero Bacillus apresentaram crescimento reduzido das bactérias do gênero Vibrio após a infecção. Com os resultados encontrados neste trabalho é sugerida a realização de estudos complementares da potencialidade probiótica das cepas de Bacillus no controle de Vibrio, minimizando os efeitos deste patógeno na carcinicultura.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Ciências dos Alimentos / Made available in DSpace on 2013-03-04T19:09:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 309352.pdf: 1330978 bytes, checksum: 53f32bc5f3243f33f297d2c1954775e2 (MD5) / Esta pesquisa teve por objetivo identificar e quantificar vibrios marinhos potencialmente patogênicos em ostras (Crassostrea gigas) e águas provenientes da Baía Sul de Santa Catarina, Brasil. Assim como avaliar a patogenicidade e susceptibilidade destas cepas frente a diferentes antibióticos e verificar a eficácia da depuração de ostras (Crassostrea gigas) contaminadas com Vibrio parahaemolyticus ou Vibrio vulnificus usando luz ultravioleta (UV) isoladamente e efeito sinérgico com cloro. Das 60 amostras de ostras 48,3% estavam contaminadas por uma ou mais espécies de vibrio. As espécies mais frequentes foram V. parahaemolyticus e V. vulnificus. As contagens de V. parahaemolyticus e V. vulnificus nas amostras variaram entre < 0,5 log10 NMP g-1 a 2,3 log10 NMP g-1 de ostra, e < 0,5 log10 NMP g-1 a 2,1 log10 NMP g-1 de ostra, respectivamente. Das 60 amostras de água 73,3% estavam contaminadas por uma ou mais espécies de vibrios. As contagens de V. parahaemolyticus e V. vulnificus nas amostras variaram entre < 0,3 log10 NMP 100 mL-1 a 1,7 log10 NMP 100 mL-1 de água marinha, e < 0,3 log10 NMP 100 mL-1 a 2,0 log10 NMP 100 mL-1 de água marinha, respectivamente. Das 120 cepas enviadas para tipificação, foram avaliadas as características de 106 cepas reativadas. Destas 83 (78,3%) foram previamente identificadas como V. parahaemolyticus, 20 (18,9%) como V. vulnificus, três (2,8%) como V. cholerae. Foram caracterizados 20 diferentes sorotipos de V. parahaemolyticus, e identificados genes de patogenicidade tanto de V. parahaemolyticus quanto de V. cholerae. A resistência à gentamicina e cefuroxima foi observada em 84,3% das cepas testadas para ambos antibióticos, e a resistência a ampicilina foi observada em 80,0% das cepas de Vibrio spp. O cloranfenicol foi o antibiótico ao qual as cepas de Vibrio spp. foram mais sensíveis, seguido da tetraciclina, diferente do observado para V. cholerae que apresentou maior sensibilidade a Amoxicilina + clavulanato. Para o experimento de depuração as ostras foram contaminadas com um coquetel de cinco cepas de V. parahaemolyticus ou V. vulnificus ao nível de 104 a 105 UFC mL-1. A depuração foi realizada num sistema fechado de recirculação. As contagens de V. parahaemolyticus ou V. vulnificus foram realizadas no tempo zero, 6, 18, 24 e 48 h. Três tratamentos foram realizados: T1 (controle), T2 (luz UV) e T3 (luz UV mais cloro). Após 48 h de depuração de V. parahaemolyticus, T3 reduziu 3,1 log NMP g-1 e T2 reduziu 2,4 log NMP g-1, enquanto T1 reduziu apenas 2,0 log NMP g-1. Após 48 h de depuração de V. vulnificus, tanto T2, como T3 foram eficientes na redução das contagens, reduzindo a população em 2,5 e 2,4 log NMP g-1, respectivamente, enquanto que T1 reduziu apenas 1,4 log NMP g-1. O tratamento utilizando Luz UV mais cloro foi mais eficiente para controlar V. parahaemolyticus em ostras. Tanto o tratamento utilizando luz UV, como o tratamento utilizando luz UV mais cloro foram eficientes para reduzir as contagens de V. vulnificus. Os resultados desta pesquisa servem de subsídio para analise de risco de vibrios potencialmente patogênicos em ostras. / The purpose of this study was to assess the incidence and level of contamination for Vibrio spp. in seawater and oysters (Crassostrea gigas) harvested in Southern Brazil, as to evaluate the pathogenicity of strains and test the susceptibility of these strains to different antibiotics, and to evaluate efficacy of depuration using UV light and UV light plus chlorinated seawater for decontaminating Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus in oysters. Of the 60 oysters# samples analyzed, 29 (48.3%) contained one or more vibrio species. The most frequently isolated species were Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus. The counts of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus in the samples ranged between < 0.5 log10 MPN g-1 to 2.3 log10 MPN g-1 of oyster, and < 0.5 log10 MPN g-1 to 2.1 log10 MPN g-1of oyster, respectively. Of the 60 seawater samples analyzed, 44 (73.3%) contained one or more species vibrios. The counts of Vibrio parahaemolyticus and Vibrio vulnificus in the samples ranged between < 0.3 log10 MPN 100 mL-1 to 1.7 log10 MPN 100 mL-1 of seawater, and < 0.3 log10 MPN 100 mL-1 to 2.0 log10 MPN 100 mL-1 of seawater, respectively. Of the 120 strains sent for typing were evaluated the characteristics of the strains 106 reactivated, 83 (78.3%) were previously identified as V parahaemolyticus, 20 (18.9%) as V vulnificus, three (2.8%) and V. cholerae. Were characterized 20 different serotypes of V. parahaemolyticus, and isolated genes of patogenicity for V. parahaemolyticus and V. cholerae. The gentamycin and cefuroxime resistance was observed in 84.3% of the strains to both antibiotics, and the ampicillin resistance was observed in 80.0% of the strains of Vibrio spp. Chloramphenicol is the antibiotic to which the strains of Vibrio spp. were more susceptible. The tetracycline antibiotic was the second to which the strains of V. parahaemolyticus and V. vulnificus were more susceptible than the observed for V. cholerae that showed greater susceptibility to amoxicillin + clavulanate. For depuration the oysters were contaminated with five-strain cocktail of V. parahaemolyticus or V. vulnificus to level of 104 to 105 CFU mL-1. The depuration was conducted in a recirulated closed system. Counts of V. parahaemolyticus or V. vulnificus were determined at zero, 6, 18, 24 and 48 h. Three treatments were conducted: T1 (control treatment); T2 (UV treatment); and T3 (UV plus chlorine treatment). After 48 h of depuration of Vibrio parahaemolyticus, T3 reduced 3.1 log MPN g-1 and T2 reduced 2.4 log MPN g-1, while T1 reduced only 2.0 log MPN g-1. After 48 h of depuration of Vibrio vulnificus, T2 as well as T3 were efficient reducing counts in 2.5 and 2.4 log MPN g-1, respectively; while T1 reduced only 1.4 log MPN g-1. UV light plus chlorine treatment was more efficient for controlling V. parahaemolyticus in oysters. Both UV light and UV light plus chlorine were efficient for V. vulnificus. These results serve as input for risk analysis studies of potentially pathogenic vibrios in oysters in southern Brazil.