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Etude de déterminants moléculaires de Xanthomonas fuscans subsp. fuscans impliqués dans la colonisation de son hôte Phaseolus vulgaris

Darsonval, Arnaud 08 April 2008 (has links) (PDF)
Xanthomonas fuscans subsp. fuscans (Xff) est l'un des agents responsables de la graisse commune de haricot, bactériose transmise par les semences. A partir d'une semence contaminée, cet agent pathogène colonise les parties aériennes de son hôte sur la totalité d'un cycle cultural sans enclencher de processus infectieux ; cela aboutit finalement à sa transmission à la graine. Les objectifs de cette thèse ont été d'identifier des déterminants moléculaires de Xff et de caractériser leur rôle dans trois étapes clés de la colonisation asymptomatique du haricot. Deux types de gènes candidats ont été identifiés chez Xff : des gènes induits in planta codant le système de sécrétion de type trois (SST3) et ses effecteurs, des gènes impliqués dans les processus d'adhésion aux surfaces et de formation des biofilms.Contrairement à la phyllosphère, la graine de haricot en germination et les jeunes plantules ne constituent pas des environnements limitant pour la multiplication bactérienne. L'absence d'induction de réactions de défense à cette étape laisse penser que les bactéries se comportent en saprophytes sans dialogue moléculaire avec la plante. La survie de Xff dans la phyllosphère du haricot dépend partiellement des régulateurs HrpG et HrpX du SST3 ; la colonisation active et la transmission aux graines par la voie vasculaire nécessitent quant à elle un SST3 fonctionnel. En situation incompatible non-hôte, X. campestris pv. campestris et ses mutants du SST3 survivent et se transmettent à la graine de haricot, mais peu fréquemment et avec de faibles tailles de populations. Les six adhésines identifiées chez Xff interviennent toutes lors de la colonisation de la phyllosphère ou pour la transmission à la graine de haricot par la voie vasculaire. La transmission à la graine par la voie florale est une voie plus générale, régulée seulement partiellement par HrpG et HrpX.
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Desempenho de famílias de feijoeiro-comum de uma população de seleção recorrente para resistência ao crestamento bacteriano comum / Performance of families of common bean from a population of recurrent selection for resistance to common bacterial blight

Silva, Helton Salles da 30 August 2017 (has links)
Submitted by Franciele Moreira (francielemoreyra@gmail.com) on 2018-10-15T13:46:38Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helton Salles da Silva - 2017.pdf: 3105351 bytes, checksum: 0468af71a8e8a4810e5e7793d972203c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-10-15T14:48:27Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helton Salles da Silva - 2017.pdf: 3105351 bytes, checksum: 0468af71a8e8a4810e5e7793d972203c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T14:48:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Helton Salles da Silva - 2017.pdf: 3105351 bytes, checksum: 0468af71a8e8a4810e5e7793d972203c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-08-30 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The common bean culture (Phaseolus vulgaris L.) plays an important role in human feeding and its use occurs in a wide range of planting’s systems. Therefore, it is indeed necessary to develop cultivars adapted to these different systems and which serves both the needs of producers and consumers. Different factors have contributed to decrease the crop yield, among these, we highlight the common bacterial blight (CBB) caused by Xanthomonas axonopodis pv. Phaseoli and Xanthomonas fuscans subsp. Fuscans. In this sense, the main objectives of the present study was to: (i) evaluate the genetic potential and to select superior progenies from a population of recurrent selection for resistance to CBB in common bean of the black commercial group; (ii) study the adaptability and stability of families S0:4, S0:5 and S0:6 in different environments; (iii) estimate the genetic gains obtained with the selection of the ten best families; and (iv) select families that are resistant to CBB while associated to other variables of agronomic importance such as grain yield, plant bedding and resistance to anthracnose. Sixty families of a C0 population were evaluated in the years 2015 and 2016 in different environments, in randomized blocks design with three replicates. After the evaluations, analyzes of individual and joint variance were performed, as well as the application of the ranks sum index using “Genes” software. Subsequently, analyzes of adaptability and phenotypic stability were performed in the selected families, using the methodology of Nunes et al. From the simultaneous selection for grain yield and resistance to CBB, ten families considered more promising were selected. Then, a new selection was made, including the plant bedding criteria and, lastly, the variable anthracnose resistance was included. Selection gains were obtained for all the variables. Most of the selected families presented better individual results in relation to the resistance to CBB variable. And the great majority of the selected families presented themselves adapted and stable, mainly in comparison with other bean treatments. Among the families with the best performance, the families SRCP.55 and SRCP.318 were highlighted for grain yield, resistance to CBB and anthracnose. By selecting these families, it is expected that they may be used in hybridization stages carried out in new studies, either as parents in other programs as sources of resistance to CBB, or in their use as new cultivars. / A cultura do feijoeiro-comum (Phaseolus vulgaris L.) tem grande importância na alimentação humana e seu emprego se dá nos mais variados sistemas de plantio. Logo, há a necessidade de desenvolvimento de cultivares adaptadas a esses diferentes sistemas e que atendam concomitantemente às necessidades de produtores e consumidores. Diferentes fatores têm contribuído para diminuir a produtividade da cultura, dentre estes, destaca-se o crestamento bacteriano comum (CBC) causado por Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli e Xanthomonas fuscans subsp. fuscans. Neste sentido, o presente trabalho teve como objetivos: (i) avaliar o potencial genético e selecionar progênies superiores oriundas de uma população de seleção recorrente para resistência ao CBC em feijoeiro-comum do grupo comercial preto. (ii) estudar a adaptabilidade e estabilidade das famílias S0:4, S0:5 e S0:6 em diferentes ambientes; (iii) estimar ganhos genéticos obtidos com a seleção das dez melhores famílias; (iv) selecionar famílias resistentes ao CBC associadas a outras variáveis de importância agronômica como produtividade de grãos, acamamento de planta e resistência à antracnose. Foram avaliadas 60 famílias de uma população C0 nos anos de 2015 e 2016 em diferentes ambientes, no delineamento em blocos ao acaso com três repetições. Após as avaliações, foram feitas análises de variância individual e conjunta, bem como a aplicação do índice da soma de “ranks” utilizando-se o programa “Genes”. Posteriormente, as famílias selecionadas foram submetidas às análises de adaptabilidade e estabilidade fenotípica, de acordo com a metodologia de Nunes et al. Foram selecionadas, partindo-se da seleção simultânea para produtividade de grãos e resistência ao CBC, dez famílias consideradas mais promissoras. Em seguida, foi feita nova seleção, incluindo-se o acamamento de planta e sendo incluída, por fim, a variável resistência à antracnose. Obteve-se ganhos de seleção para todas as variáveis. A maior parte das famílias selecionadas apresentou melhores resultados individuais em relação à variável de resistência ao CBC. E a grande maioria das famílias selecionadas mostraram-se adaptadas e estáveis, principalmente, quando comparadas às testemunhas. Dentre as famílias de melhor desempenho, se destacaram as famílias SRCP.55 e SRCP.318 para produtividade de grãos, resistência ao CBC e antracnose. Com a seleção dessas famílias, espera-se que as mesmas possam vir a ser utilizadas em etapas de hibridizações realizadas em novos estudos, seja como genitores em outros programas como fontes de resistência ao CBC, seja também em sua utilização como novas cultivares.

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