Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012. / Submitted by Jaqueline Ferreira de Souza (jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-14T11:03:51Z No. of bitstreams: 1 2012_EdieneGaldinodeGouvea.pdf: 1348445 bytes, checksum: eef908d13b7d1ad7bb9fd1bcfbf8ca24 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Ferreira de Souza(jaquefs.braz@gmail.com) on 2012-06-14T11:04:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_EdieneGaldinodeGouvea.pdf: 1348445 bytes, checksum: eef908d13b7d1ad7bb9fd1bcfbf8ca24 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-06-14T11:04:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_EdieneGaldinodeGouvea.pdf: 1348445 bytes, checksum: eef908d13b7d1ad7bb9fd1bcfbf8ca24 (MD5) / O amendoim cultivado (Arachis hypogaea L.) é um grão de grande importância econômica e nutricional, e um dos alimentos humanos mais nutritivos e de fácil digestão, por ter o grão rico em óleo e proteínas. Espécies silvestres de Arachis são importantes fontes de genes que controlam características de interesse para o amendoim. O mapeamento genético é de grande utilidade no auxílio a programas de melhoramento de plantas, possibilitando o mapeamento de locos que controlam características quantitativas, ou QTL‟s (Quantitative Trait Loci); também são usados em estudos de sintenia ou mapeamento comparativo e clonagem de genes. Nesse trabalho foram desenvolvidos três mapas genéticos baseados em populações RIL: um referente ao genoma A, um referente ao genoma B e por último um para o genoma tetraploide do amendoim. Para o mapa A foram utilizados diversos tipos de marcadores, como microssatélites, marcadores âncoras, SNPs e RGAs; já nos mapas B e tetraploide foram utilizados somente marcadores microssatélites. Em geral, os mapas obtidos apresentaram tamanhos e número de grupos de ligação semelhantes aos mapas já publicados. O mapa de genoma A apresentou comprimento total de 1036 cM com 870 marcadores distribuídos em 10 grupos de ligação. O mapa de genoma B teve comprimento total de 560,3 cM, 10 grupos de ligação e 147 marcadores mapeados e o mapa tetraploide 1066 cM, com 210 marcadores mapeados em 21 grupos de ligação. Muitos dos marcadores utilizados são gênicos e de cópias únicas e são de grande importância para estudos de genômica comparativa, e apresentam grande chance de estarem ligados a genes de interesse. Além disso, foi realizado um estudo de sintenia entre esses mapas, que evidenciou bastante semelhança entre eles. Os mapas genéticos moderadamente saturados representam um considerável aumento na capacidade de mapear genes úteis e utilizar a seleção assistida por marcadores nos programas de melhoramento do amendoim. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cultivated peanut (Arachis hypogaea L.) is a grain of great nutritional and economic importance, and it is one of the most nutritious and digestible human food available, as it is rich in oil and protein. Wild species of Arachis are important sources of genes that control interesting traits for the cultivated peanut. Genetic mapping is a useful tool in plant breeding programs, enabling the mapping of loci controlling quantitative, polygenic or traits with complex inheritance, called QTL's (Quantitative Trait Loci); it is also used in studies of synteny or comparative mapping and gene cloning. In this work three genetic maps were developed based on RIL populations: one for the A genome, one for the B genome and one for the tetraploid peanut genome. For the A map we used different types of markers such as microsatellite, anchor, SNPs and RGA markers, whereas in the B and tetraploid maps only microsatellite markers were used. In general, the maps had size and number of linkage groups similar to already published maps. The A genome map showed a total size of 1036 cM, with 870 markers distributed into 10 linkage groups. The B genome map had a total size of 560,3 cM, 10 linkage groups and 147 markers mapped, while the map for tetraploid genome showed 1066 cM, with 210 markers mapped into 21 linkage groups. Many of the markers are single copy genes and of great importance to comparative genomics studies, and with a great chance of being linked to genes of interest. Furthermore, a synteny study between these maps showed a great similarity between them. The moderately saturated genetic maps represent a considerable increase in the ability to map useful genes and to use marker-assisted selection in peanut breeding programs.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2007. / Submitted by Fernanda Weschenfelder (nandaweschenfelder@gmail.com) on 2009-12-01T14:38:10Z No. of bitstreams: 1 2007_FernandoCamposdeAssisFonseca.pdf: 4862700 bytes, checksum: 7ae03fd7dbfe469b16e76185d1c0a7f0 (MD5) / Approved for entry into archive by Lucila Saraiva(lucilasaraiva1@gmail.com) on 2010-01-12T23:14:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2007_FernandoCamposdeAssisFonseca.pdf: 4862700 bytes, checksum: 7ae03fd7dbfe469b16e76185d1c0a7f0 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-01-12T23:14:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2007_FernandoCamposdeAssisFonseca.pdf: 4862700 bytes, checksum: 7ae03fd7dbfe469b16e76185d1c0a7f0 (MD5) Previous issue date: 2007 / O amendoim cultivado (Arachis hypogaea) é uma cultura de grande importância econômica, sendo cultivado em vários países do mundo. As safras na agricultura são reduzidas por estresses bióticos e abióticos aos quais as espécies silvestres são resistentes. Visando a obtenção de plantas mais resistentes, foi desenvolvida uma estratégia onde as espécies silvestres seriam as doadoras de genes de resistência que seriam transferidos através de cruzamentos interespecíficos. O primeiro passo seria a construção de mapas genéticos que identifiquem as distâncias e as posições dos genes de interesse no genoma de cada espécie. O segundo passo seria a correção da diferença de ploidia entre as espécies, já que a cultivada é uma alotetraplóide (2n=4x=40) com genoma AABB e as silvestres diplóides (2n=2x=20) com genomas AA ou BB. Porém, problemas de incompatibilidade entre os cruzamentos são comuns. Isso se deve muitas vezes por causa de diferenças nas composições das regiões não-codantes e de repetições, o que faz necessário um estudo detalhado dessas regiões. Dentre as seqüências repetitivas de maior importância estão os retrotransposons, elementos que se multiplicam no genoma e inserem uma nova fita de DNA em diferentes sítios. Neste trabalho, foram isoladas e caracterizadas seqüências de um retrotransposon LTR do amendoim cultivado e de seus parentais silvestres (A. duranensis e A. ipaënsis). A seqüência codificadora da enzima transcriptase reversa foi amplificada através de PCR utilizando combinações de iniciadores específicos. O Southern blot não mostrou nenhum sinal de metilação na seqüência desse elemento, mas através de sondagem de 20 mil seqüências de ESTs nenhuma similaridade foi encontrada, sugerindo que esse elemento não é expresso. Análises filogenéticas e estatísticas foram realizadas utilizando-se 87 contigs, onde seqüências nucleotídicas e de aminoácidos formaram grupos específicos nas árvores de similaridade, indicando que o retrotransposon evoluiu diferentemente nos genomas das espécies parentais. De acordo com o cálculo do número de substituições sinônimas na seqüência desse elemento, observou-se que ele é mais variável no genoma BB. Já no genoma AA de A. duranensis ele parece ter sofrido modificações recentes, provavelmente decorridas da transposição desse elemento há cerca de 2-6 milhões de anos, fato que não pode ser observado no genoma de A. ipaënsis. O número de cópias calculado por genoma diplóide nas três espécies foi, em média, 800 em A. ipaënsis, 3 mil em A. duranensis e 5 mil em A. hypogaea. Esses resultados mostram que o retrotransposon é muito antigo e provavelmente fazia parte do genoma do ancestral comum à diferentes grupos vegetais. Após a diferenciação nas espécies parentais o retrotransposon provavelmente multiplicou seu número de cópias no genoma AA e permaneceu praticamente inalterado no genoma BB. Apesar de ser encontrado em regiões eucromáticas e de não estar metilado ele se mantém inativo. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The cultivated peanut (Arachis hypogaea) is a crop of economic importance and it is cultivated in several countries around the world. Yields in agriculture are reduced by biotic and abiotic stresses to which most the wild species are resistant. With the aim of developing more resistant plants, a strategy of crossing where wild species are the donors of resistance genes to the cultivated peanut is used. The first step is to develop a linkage map to identify the distances and positions of genes of interest for each species. The second step is the correction of the number of chromosomes since the cultivated peanut is an allotetraploid (2n=4x=40) with an AABB genome and the wild species are diploid (2n=2x=20) with AA or BB genomes. However, problems of incompatibility during crosses are common. One possible cause for incompatibility is the difference in the intergenic noncoding regions of different species. For this and other reasons, the study of repetitive DNA is interesting. Among the repetitive sequences, retrotransposable elements are found to be of major importance because they can copy of themselves into new chromosome sites. In this work we reported the isolation and characterization of an LTR retrotransposon from the cultivated peanut and its wild parental genomes (A. duranensis and A. ipaënsis). The coding region of the reverse trancriptase gene was amplified by PCR using specific primer combinations derived from genomic sequences of the Arachis data base. No methylation was found using Southern blot but also no significant homology to 20.000 ESTs sequences on the GenBank, suggesting that this element is not expressed. Phylogenetic and statistical analyses were done with 87 contigs. Both the nucleotide and aminoacid sequences formed specific groups indicating that the retroelement evolved differently in the wild species genomes. According to the synonymous substitutions content it was observed that the retrotransposon has accumulated more mutations in BB genome than in the A. duranensis genome, probably because of a recent amplification that occurred about 2-6 myr ago. The copy number calculated per diploid genome for the three species was aproximately: 800 for A. ipaënsis, 3.000 for A. duranensis and 5.000 for A. hypogaea. These results show that the element is ancient and it was a part of the genome of a species ancestral to many different groups of plants. After the differentiation between the two parental species, this element probably multiplied its copy number in the AA genome and remained almost silent in the BB genome. Although the element is dispersed in euchromatic regions and does not present any methylation no sign of activity was found.

Dissertação (Mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Ciências da Saúde, 2011. / Submitted by Gabriela Ribeiro (gaby_ribeiro87@hotmail.com) on 2011-09-15T18:20:37Z No. of bitstreams: 1 2011_RenataMirandaLopes.pdf: 2328025 bytes, checksum: 7b9349d8eb5a289c06abc2c5f0f920a4 (MD5) / Approved for entry into archive by Camila Mendes(camila@bce.unb.br) on 2011-10-07T16:15:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_RenataMirandaLopes.pdf: 2328025 bytes, checksum: 7b9349d8eb5a289c06abc2c5f0f920a4 (MD5) / Made available in DSpace on 2011-10-07T16:15:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_RenataMirandaLopes.pdf: 2328025 bytes, checksum: 7b9349d8eb5a289c06abc2c5f0f920a4 (MD5) / O resveratrol é um dos principais compostos bioativos do amendoim (Arachis hypogaea L, Fabaceae), presente também na uva e no vinho, e é associado à redução do risco de desenvolvimento de doenças cardiovasculares e câncer destes alimentos. Neste trabalho foi realizada a determinação de trans-resveratrol em folhas de espécies silvestres desse gênero por CLAE. O estudo para definição e validação da metodologia envolveu a avaliação do solvente de extração, a técnica de preparação da amostra para análise e o método analítico. Após a padronização da metodologia, foi realizada a determinação de resveratrol em folhas de dez espécies silvestres de Arachis, estressadas por radiação UV. As espécies estudadas foram A. kuhlmannii, A. cardenasii, A. duranensis, A. cruziana, A. gregoryii, A. batizocoi, A. simpsonii, A. ipäensis e A. kempff-mercado,utilizando A. hypogaea, como referência. Os extratos foram obtidos utilizando EtOH 80% como solvente e posteriormente foram submetidos a extração liquido-líquido para eliminação de pigmentos e outros interferentes. A análise por CLAE foi realizada com coluna Zorbax XDB Agilent (250 mm x 4,6 mm, 5 μm), com gradiente de eluição, acetonitrila:ácido fosfórico 0,02%. O método apresentou linearidade entre 5,75 e 217,6 μg/mL, coeficiente de correlação (r² 0,9998) e repetibilidade de 1,18% (a 23 μg/mL). Todas as espécies do estudo expressaram resveratrol após a indução com UV e nenhuma apresentou teor de resveratrol significativamente mais elevado do que a espécie cultivada A. hypogaea. Contudo na análise de cluster as espécies A. kuhlmannii, A. cardenasii, A. duranensis, foram agrupadas no grupo de maior teor de resveratrol juntamente com a espécie cultivada. Os teores médios de resveratrol observados foram 808,75 ± 177,6 μg/g para A. kuhlmannii, 752,24 ± 305,4 μg/g para A. cardenasii, 639,93 ± 224,7 μg/g para A. duranensis, 564,67 ± 205,1 μg/g para A. cruziana, 524,54 ± 131,1 μg/g para A. batizocoi, 484,77 ± 167,8 μg/g para A. magna, 370,14 ± 103,7 μg/g para A. gregoryii, 318,37 ± 146,9 μg/g para A. simpsonii, 314,07 ± 76,8 μg/g para A. ipäensis e 299,49 ± 89,1 μg/g para A. kempff-mercadoi. Os resultados obtidos nesse trabalho sugerem que é possível agregar valor às folhas de amendoim, utilizando-as para a extração de resveratrol, após o processo de indução por radiação ultravioleta. Considerando as várias atividades biológicas do resveratrol e sua ampla utilização nas indústrias farmacêutica, cosmética e de suplementos alimentares, a utilização de folhas de amendoim pode constituir-se em um novo nicho nesse mercado. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Resveratrol, main active component of peanut (Arachis hypogaea L, Fabaceae), is present also in grape and wine. Resveratrol present in these foods is associated to risk reduction of cardiovascular diseases and cancer. In this work, it was developed the HPLC determination of trans-resveratrol in leaves of wild species of Arachis. The study for method selection and method validate was based on the solvent extraction valuate, on the sample preparation for analysis and on the analytical method. After methodology standardization, it was carried out the determination of resveratrol in leaves of 10 Arachis wild species, stressed by UV light. The species studied were A. kuhlmannii, A. cardenasii, A. duranensis, A. cruziana, A. gregoryii, A. batizocoi, A. simpsonii, A. ipäensis e A. kempff-mercadoi, A. hypogaea, using A. hypogaea as a reference Resveratrol was extracted with 80 % EtOH and cleaning of extract was done by liquid-liquid extraction to remove pigments and others interfering. HPLC analysis was done using a Zorbax XDB Agilent (250 mm x 4.6 mm, 5 μm) and a gradient of acetonitrile : 0.02 % phosphoric acid. The method was linear between 5.75 and 217.6 μg/mL, the correlation coefficient (r² 0.9998) and injection repeatability was 1.18% (at 23 μg/mL). All species of the resveratrol study expressed after induction with UV and none specie showed levels of resveratrol significantly more high than the cultivated species A. hypogaea. . However in cluster analysis, the species A. kuhlmannii, A. cardenasii, A. duranensis were statistically grouped in the highest group content of resveratrol, along with the cultivated species. . The concentration of resveratrol observed were 808.75 ± 177.6 μg/g to A. kuhlmannii, 752.24 ± 305.4 μg/g to A. cardenasii, 639.93 ± 224.7 μg/g to A. duranensis, 564.67 ± 205.1 μg/g to A. cruziana, 524,54 ± 131.1 μg/g to A. batizocoi, 484.77 ± 167.8 μg/g to A. magna, 370.14 ± 103.7 μg/g tol A. gregoryii, 318.37 ± 146.9 μg/g to A. simpsonii, 314.07 ± 76.8 μg/g to A. ipäensis and 299.49 ± 89.1 μg/g to A. kempff-mercadoi. The present results suggest that it is possible to add value to the peanut leaves, using them to extract resveratrol, after the process of induction by ultraviolet radiation. Considering the various biological activities of resveratrol and its wide use in the pharmaceutical, cosmetic and food supplements, the use of peanut leaves can form themselves into a new niche in this market.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Departamento de Botânica, Programa de Pós-Graduação em Botânica, 2012. / Submitted by Alaíde Gonçalves dos Santos (alaide@unb.br) on 2013-12-09T10:28:37Z No. of bitstreams: 1 2012_CarolinaCatiaSchaffer.pdf: 11255908 bytes, checksum: b289c0346364ad40da6b3b781aee08b2 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-12-13T12:13:57Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2012_CarolinaCatiaSchaffer.pdf: 11255908 bytes, checksum: b289c0346364ad40da6b3b781aee08b2 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-12-13T12:13:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012_CarolinaCatiaSchaffer.pdf: 11255908 bytes, checksum: b289c0346364ad40da6b3b781aee08b2 (MD5) / Capítulo 1, O gênero Arachis tem atualmente 80 espécies descritas, sendo 47 delas consideradas endêmicas da flora brasileira. Diante da velocidade de modificação dos ecossistemas, associada à baixa capacidade de dispersão natural das sementes, é relevante mapear a ocorrência das espécies para ampliar o conhecimento do espaço ecológico adequado para estabelecimento e permanência das populações, e aprimorar os estudos de conservação in situ dessas espécies. Os Sistemas de Informação Geográfica e os modelos de distribuição potencial ao associar dados de ocorrência em campo com variáveis ambientais indicam os locais de ocorrência de espécies e auxiliam no mapeamento de áreas potenciais. Foram utilizados 1.541 pontos de ocorrência extraídos do Catalog oi Arachis Germplasm Collection e de coletas recentes da Embrapa. A distribuição das espécies abrange todo o território brasileiro, a exceção dos estados do Amapá, Amazonas, e Roraima, com pontos distribuídos ao longo das rodovias e estradas o que caracteriza a presença do homem na dispersão dessas espécies. Cerca de 56% das espécies estão localizadas no Planalto Central Brasileiro, área de predomínio do bioma Cerrado e de influência das bacias hidrográficas do Paraguai, Paraná, Tocantins-Araguaia e São Francisco. Os mapas com as projeções das áreas com potencial de ocorrência gerados a partir da modelagem com os algoritmos GARP e SVM, foram avaliados conforme os valores de curva ROC e apresentaram valores AUC > 0.85 indicando modelos fiéis com adequabilidade de ocorrência das espécies de Arachis. Independente das incertezas dos modelos, trabalhos com modelagem auxiliam na aproximação da extensão das áreas potenciais de ocorrência. O uso de sistemas de informação geográfica se mostrou útil para delimitação da amplitude de ocorrência biogeográfica do gênero e para o estabelecimento de novas áreas de coletas. / Capítulo 2, O Brasil, um dos países mais biodiversos do mundo, apresenta representantes das 9 secções taxonómicas formais do gênero Arachis. As 65 espécies encontradas no território brasileiro são utilizadas sobretudo para melhoramento genético do amendoim comum, cobertura do solo, agricultura familiar e paisagismo urbano. Distribuídas em sua maioria no Brasil central, as áreas de ocorrência de Arachis estão sob forte influência antrópica, sujeitas a ameaças de depauperamento de suas populações. Diante da velocidade de modificação dos ecossistemas brasileiros, associada à baixa capacidade de dispersão natural das sementes, é relevante analisar a presença e o potencial de ocorrência de espécies dentro das Unidades de Conservação de Proteção Integral para ampliar o conhecimento do espaço ecológico adequado para estabelecimento e permanência das populações, e aprimorar a possibilidade de conservação in situ de espécies. A conservação in situ é influenciada pela criação e gestão de áreas protegidas e entorno e pela conservação dos recursos naturais, principalmente através dos sistemas de Unidades de Conservação e pelas leis que os estabelecem. Foram utilizados 1.539 pontos de ocorrência, extraídos do "Catalog of Arachis Germplasm Collection" e de coletas recentes da Embrapa, para gerar mapas de distribuição e proximidade com Unidades de Conservação de Proteção Integral e mapas de modelos com potencial de ocorrência nessas unidades. A proximidade dos pontos presenciais com as unidades foi avaliada em quatro categorias, a partir das Zonas de Amortecimento instituídas em lei: 1-Dentro da UC; 2-Muito próxima (até 500m de raio); 3- Próximo (de 500 a 3.000m); 4-Pouco próximo (de 3.000 a lO.OOOm). Da avaliação dos mapas de distribuição foram localizados 5 pontos Dentro das Unidades de Conservação, 10 pontos Muito Próximos, 58 pontos Próximos, e 130 pontos Pouco Próximos, indicando que somente 13% do total da amostra está localizada dentro e/ou no entorno das áreas de Unidades de Conservação de Proteção Integral. Quando estipulado um limite de corte superior a 80% de probabilidade de ocorrência para o modelo, e quando este é sobreposto aos mapas das unidades, estima-se que 21,6 milhões de hectares das áreas de Unidades de Conservação são áreas potenciais para ocorrência de espécies do gênero. Quando este limite é reduzido a 100km de raio em volta dos pontos de ocorrência, o tamanho da área potencial cai para 14,2 milhões. Independente das incertezas dos modelos, trabalhos com modelagem e com sistemas de informação geográfica auxiliam na estipulação de presença e ocorrência potencial de espécies em Unidades de Conservação de Proteção Integral. Além disso, essas ferramentas aliadas à criação de novas áreas protegidas e ao conhecimento sobre sua flora e fauna se mostram úteis no processo de desenvolvimento de estratégias de conservação in situ das espécies de Arachis e para a manutenção de seus recursos genéticos. _______________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The genus Arachis has currently 80 described species, 47 of them endemic to the Brazilian flora. Given the speed of change of ecosystems, associated with low natural dispersal ability of seeds, it is important to map the occurring areas of species to understand the ecological space suitable for establishment and persistence of populations, and enhance the studies of in situ conservation of these species. Geographic Information Systems and models of potential distribution by associating occurrence data with environmental variables indicate the locations of species occurrence and assist in the mapping of potential areas. We used 1.541 occurrence points extracted from the "Catalog of Arachis Germplasm Collection" and recent collections from Embrapa. The species distribution covers the entire Brazilian territory, except the states of Amapá, Amazonas and Roraima, with points distributed along the highways which characterizes the presence of man in the dispersion of these species. About 56% of the species are located in the Brazilian central plateau, an area of the predominantly savannah and influence of Paraguay, Paraná, Tocantins-Araguaia and São Francisco rivers basins. The maps with projections of potential areas of occurrence generated from the model with GARP and SVM algorithms were evaluated according to the values of ROC curve, showed AUC > 0.85 indicating faithful models of Arachis species occurrence. Regardless model uncertainties, studies with modeling help approximation the extent of potential occurrence areas. The use of geographic information systems proved useful for defining the genus range of biogeo graphical occurrence and to establishment of new collection areas. / Brazil, one of the most biodiverse country in the world, has representatives of nine formal taxonomic sections of the genus Arachis. The 65 species found in Brazil are mainly used in research for genetic improvement of peanut, in the processes of soil cover, as a component of agricultre and urban landscaping. Distributed mostly in central Brazil, the areas of Arachis occurrence are under strong anthropogenic influence, under the threat of depletion of their populations. Given the speed of change in the Brazilian ecosystems associated with a low capacity for seeds dispersal, it is important to analyze the presence and potential occurrence of species within the Integral Protection Conservation Units to expand the knowledge on the ecological space suitable for the establishment and permanence of populations and enhance the possibility of in situ conservation of species. In situ conservation is influenced by the creation and management of protected areas and conservation of environment and natural resources, mainly through the systems of conservation laws and by establishing them. We used 1.539 occurrence points drawn from the "Catalog of Arachis Germplasm Collection" and recent collections of Embrapa, to generate distribution maps and proximity to the Conservation Units and maps of models with the potential to occur in these units. The proximity of the face points to the units was evaluated in four categories, from the Buffer Zone established by law: 1- Inside Protected Areas, 2-Very close (up to 500m radius), 3-Nearby (500 to 3.000m) 4-Remotely Close (3.000 to 10.000m). Evaluating the distribution maps located 5 points inside Protected Areas, 10 points Very close, 58 points Nearby, and 130 points Remotely Close, indicating that only 13% of the total sample is located within and / or around the areas of Integral Protection Conservation Units. When we set a cut-off limit higher than 80% probability of occurrence for the model, and when this is superimposed on maps of the Protected Areas, it is estimated that 21.6 million hectares of areas of conservation are potential areas for the occurrence of Arachis species. When this limit is reduced to 100km radius around the points of occurrence, the size of the potential drops to 14.2 million hectares. Regardless of the uncertainties of the models, studies with modeling and geographic information systems assist in the provision of presence and potential occurrence of species in Integral Protection Conservation Units. Moreover, these tools together with the creation of new protected areas and the knowledge on its flora and fauna prove helpful in the process of developing strategies for in situ conservation of Arachis species and the maintenance of their genetic resources.

Orientador : Maria de Fatima D. A. Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T00:51:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ArmandoJunior_Jose_M.pdf: 5717232 bytes, checksum: e905ffa01f04ec0e134e98afe2efb7d5 (MD5) Previous issue date: 1990 / Resumo: O amendoim (Arachis hypogaea L.) é uma planta herbácea, anual, com caules eretos e prostrados, flores amarelas localizadas nas regiões axiliares, pertencente à família Leguminosae. Neste trabalho, foi estudada a influência de alguns fatores do ambiente, como o fotoperíodo, temperatura e disponibilidade de água, na variedade Tatuí, desta espécie. Constatou-se que esta planta apresenta uma resposta quantitativa a dias longos. Foi verificado o efeito residual do fotoperíodo em plantas da segunda geração. Os resultados sugerem que a sensibilidade fotoperiódica das plantas parentais foi transmitida às plantas da segunda geração. A temperatura é um fator que interfere no processo da floração. Plantas mantidas na estação outono-inverno, produzem mais flores do que as da estação primavera-verão. A temperatura noturna influencia o processo da floração nesta variedade. A temperatura noturna baixa é uma condição que favorece este processo fisiológico. Já a temperatura noturna alta, mostrou ser um fator limitante, prejudicando a floração nesta variedade de amendoim. A disponibilidade de água tem forte influência no processo da floração nesta variedade de amendoim. As plantas mantidas sob deficiência hídrica apresentaram uma redução de cresci- mento, além de baixo número de flores. O elevado nível de prolina encontrado, indica que estas plantas "perceberam" a deficiência hídrica desde o início do tratamento. O excesso de água mostrou ser uma condição favorável ao processo da floração. Além do número de flores, constatou-se que todos os parâmetros avaliados foram favorecidos ... Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The groundnut (Arachis hypogaea L. ), Leguminosae is a herb plant, annual, with prostrate and erected branches, yellow flowers located in axillary positions. In the present work, studies on the influence of some environmental factor, such as photoperiod, temperature and water leveI, in the variety "Tatuí" of this species, are described. It was determined that this plant shows a quantitative response to long days. A residual effect of the photoperiod on the second generation plants was observed. The results suggest that the photoperiodic sensibility of parent plants are transmited to the plants of second generation. The temperature is a factor that strongly influences the flowering process. Plants kept in the period autumn-winter produced more flowers than those kept in the period spring-summer. The night temperature influences the flowering process in this variety of groundnut. The low temperature during dark period is a condition that promotes this phisioIogical Process. On the other hand, high temperature during the dark period, showed to be a negative factor. for the flowering process in this species. The water leveI strongly infIuences the flowering process in this variety of groundnut. Plants kept under water deficiency showed a decrease in vegetative growth, as well as in flower production / Mestrado / Biologia Vegetal / Mestre em Ciências Biológicas

Orientador: João Domingos Biagi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-20T10:39:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dalbello_Osvaldir_M.pdf: 4151672 bytes, checksum: 8b7a648068b9adec2c0478df6a387075 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: A secagem artificial é parte fundamental na modernização da agricultura, é pré condição para que se possa armazenar o produto com segurança por longos períodos, sendo um processo altamente dispendioso em energia calorífica ou mecânica para o aquecimento e movimentação do ar. Os secadores de grãos, normalmente são selecionados, observando-se apenas a sua capacidade nominal, raros são os casos em que a eficiência energética é relacionada. Na eficiência do processo de secagem do amendoim e milho-pipoca, foram considerados os aspectos energéticos, econômicos e qualitativos. A cultura do amendoim se constitui numa excelente fonte de alimentos, fornecendo matéria prima para a obtenção de uma infinidade de produtos industrializados, tem como um dos principais problemas, a ausência de equipamentos e instalações adequadas para secagem e armazenagem do produto. O milho-pipoca é utilizado exclusivamente para o consumo humano, sendo uma ótima alternativa de renda para produtores e processadores do produto. Há contudo, escassez e muitas dificuldades em se obter informações sobre a cultura. O presente trabalho teve como objetivo, avaliar a influência dos parâmetros de secagem (temperatura e fluxo de ar), teor de umidade inicial e altura da camada do produto na eficiência do processo de secagem e na qualidade do amendoim e milho-pipoca. O experimento foi desenvolvido no Laboratório de Secagem da FEAGRIJUNICAMP, em um secador de camada fixa. Foi utilizadotrêstemperaturas(40,45 e 60 o C),três fluxosde ar (12,5, 18,0e 25 m3jmin.m2), altura de camada de 0,5 e 1,0 m e umidade inicial variando de 18,5 a 12,0 % para o amendoim, e 0,5 m e umidade inicial de 16 e 22 % para o milho-pipoca, totalizando 41 testes de secagem. Os resultados indicaram que os tratamentos com temperatura de 40 o C e fluxos de 18e 25 m3/min.m2e maior umidade inicial, 18%para o amendoim e 22 % para o milho-pipoca, obtiveram os melhores resultados, tanto para a eficiência do processo de secagem,como na qualidade dos produtos utilizados. A temperatura de 60 o C, foi prejudicial para a qualidade do amendoim e milho-pipoca. Os dados mostraram que foi possível trabalhar com temperaturas de até 45 o C, sem afetar significativamentea qualidade dos produtos. Os experimentos realizados, tendo os produtos com menor teor de umidade inicial foram economicamente mais eficientes. O conjunto otor-ventilador, foi um dos principais fatores de utilização de energia quando se usou temperaturas do ar de secagemde 40 e 45 o C. A capacidadede expansãodo milho-pipocaobteveos melhores resultados com os teores de umidade finais na faixa de 10a 11% / Abstract: The artificial drying process is fundamental for agriculture modernization, and is a precondition to store products for long periods of time. Grain drying is an energy intensive and expensive operation. The performance of grain dryers has been measured generally in terms of drying capacity only. In a few cases the energy efficiency are indicated. In the drying process efficiency analysis the energetic, economic and qualitative aspects were considered. The peanut is an exce1ent food source, supplying raw material for industrialization.The peanut main problem, has been the lack of suitable drying equipment and storage facilities.The popcom is used excIusively for human consumption. However, there are few inforrnation about popcom.The objectives of this work were: to evaluate the influence of the drying parameters; drying air temperature, air flow, product initial moisture content and bed depth, on the drying process efficiency and the peanut and popcom qualities. The experiments were conducted at the UNICAMP/FEAGRI Drying Laboratory, with a stationary bed dryer. The experimental conditions were: drying air temperatures (40; 45 and 60 o C); air flows (12,5 ; 18,0 and 25,0 m3/min.m2);bed depths ( 0,5 and 1,0m for peanut, and 0,5 m for popcom), and initial moisture content (from 18,5 to 12,0% for peanut, and 16 and 22 % for popcom). The results showed that the treatments with temperature of 40 o C, air fiow of 18,0 and 25,0 m3/min.m2and initial moisture content of 18 % for peanut and 22 % for popcom, gave better drying process efficiency, andproductsquality.The dryingair temperatureof 60 o C, reducedthe peanutand popcom qualities. The data showed that it was possible to work with temperature of 45 o C, without reduction ofthe products quality. The best results in terms ofthe economic efficiency, was obtained, when the products initial moisture content, was 12 % for peanut and 16 % for 107 popcOm. During the drying process, the fan was the major factor of energy utilization, when the drying air temperatures ranged from 40 to 45 o C. The results showed that popping expansion volume was atfected by the final moisture content. The maximum expansion volume was obtained when the final moiture content ranged from 10to 11 % / Mestrado / Pre-Processamento de Produtos Agropecuarios / Mestre em Engenharia Agrícola

Orientador : Jaime Amaya-Farfan / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agricola / Made available in DSpace on 2018-07-15T17:03:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grosso_CarlosRaimundoFerreira_M.pdf: 4768032 bytes, checksum: 334f9c1b62c14782d9b1d73534af69f2 (MD5) Previous issue date: 1982 / Resumo: A espécie selvagem brasileira de amendoim Arachis villosulicarpa foi objeto de um estudo de caracterização química e biológica, através do qual o cultivar Tatu foi usado como testemunha, representando a espécie comercial Ararachis hypogaea L. Os aminoácidos totais e livres, assim como o valor nutritivo da fração nitrogenada na farinha desengordurada foram determinados. A composição em ácidos graxos e o perfil de açúcares livres foram também determinados na fração lipídica e glicídica respectivamente.O óleo e a farinha desengordurada foram obtidos mediante prensagem e extração com solvente de lotes de 4 Kg de sementes.A composição atípica em ácidos graxos do óleo da espécie selvagem foi confirmada mediante cromatografia gasosa de derivados metil éster dos ácidos em coluna DEGS à 10%. Os ácidos linoléico (51%) e oléico (15%) se encontram nesta espécie em proporções que lembram mais o óleo de milho do que o de amendoim. Também ácidos graxos de cadeias muito longas estão presentes em quantidades relativamente altas. Após extração dos sacarídeos solúveis com uma mistura de metanol: clorofórmio: água (1:1: 1), seguida de reação para converter os açúcares nas correspondentes oximas e determinação dos derivados trimetilsililados, encontrou - se quantidades menores de sacarose e maltose na espécie A. villosulicarpa. O teor de sacarose nesta espécie foi apenas de 60% do total encontrado para Tatu, o que não deixa de surpreender uma vez que o sabor da espécie selvagem é mais adocicado. Inositol, melibiose e rafinose foram sacarídeos encontrados em maior concentração na espécie A. villosulicarpa.A partir dos resultados da hidrólise total da proteína por cinco tempos diferentes, pode-se concluir que treonina, cistina, metionina e triptofano estão presentes em maior concentração na espécie A. villosulicarpa do que no controle Tatu. No levantamento do perfil de aminoácidos livres, foram testados três sistemas de extração: ácido tricloroacético (TCA), ácido sulfossalisílico (SSA) e a mistura metanol: clorofórmio: água (MCW, 60: 25:15). O sistema TCA foi mais eficiente que o MCW, mas equivalente ao SSA. Este último, porém, propiciou maior resolução nos cromatogramas durante a análise. Ácido glutâmico, asparagina e arginina foram os aminoácidos livres mais abundantes. A espécie selvagem, de modo geral, apresentou maiores concentrações na maioria dos aminoácidos livres com excessão de fosfoserina, taurina, ácido aminoadípico, prolina, ácido ?-aminobutírico e isoleucina. Avaliação biológica da proteína com ratos, sugeriu que a qualidade protéica da espécie A. villosulicarpa foi igual ou ligeiramente superior ã proteína da variedade Tatu. Os valores de "NPU" e "NPR" foram 44,23 e 3,71 para a espécie selvagem, e 42,38 e 3,43 para a variedade Tatu respectivamente. / Abstract: The Brazilian wild species of peanuts Arachis villosulicarpa was the subject of a chemical and biological study in which the cultivar Tatu, a representative of the commercial species Arachis hypogaea L., was used as a control. Total and free amino acids and nutritive quality were assessed in the nitrogenous fraction of the defatted flour, while the fatty acid pattern and the free sugar distribution were determined in the oil and the carbohydrate fractions, respectively. Oil and defatted flour were obtained by pressing 4-Kg samples of seeds and extracting the resulting cake with solvent. Gas-liquid chromatographic determination of the fatty acid methyl esters on a 10% DEGS column confirmed the unique composition of the A", villosulicarpa oil. Linoleic (51%) and oleic (15%) acids in the wild species were found to resemble the pattern of corn rather than peanut oil. In addition, very long chain acids were present in relatively high concentrations. Extraction of soluble saccharides with a mixture of methanol-cloroform-water (1:1:1) followed by conversion to the corresponding oximes and determination of the trimethylsilyl volatiles, revealed lower amounts of sucrose and maltose in A. villosulicarpa. Sucrose content of this species was only 60% of that found in Tatu; contrary to expectations, considering the rather sweet taste of A. villosuliaarpa. Inositol, melibiose and raffinose were also found in greater concentrations in the wild species.From the total amino acid determination of five different times of hydrolysis, it was concluded that the villosulicarpa species contains higher concentrations of threonine, cystine, methionine and tryptophan while having a slightly lower concentration of lysine than the control Tatu. In order to establish the free amino acid profile, three extraction systems were tested: trichloroacetic acid (TCA), sulfosalicylic acid (SSA) and the mixture metanol-chloroform-water (MCW, 60:25:15). The TCA system was considered more efficient than MCW and as efficient as SSA in regard to the extraction. Use of SSA however, provided the highest chromatographic resolution during analysis. The most prominent free amino acids found in either species were glutamic acid, asparagine and arginine. The wild species, in general, exhibited greater amounts of all amino acids except for phosphoserine, taurine, aminoadipic acid, proline, ?-aminobutyric acid and isoleucine.Biological evaluation with rats, suggested that the nutritive quality of the A. villosulicarpa protein was equal to or slightly better than the Tatu protein. NPU and NPR values were 44.23 and 3.71 for the wild species and 42.38 and 3.43 for the Tatu cultivar, respectively. / Mestrado / Mestre em Engenharia Agrícola

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:28:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-06-22Bitstream added on 2014-06-13T19:57:57Z : No. of bitstreams: 1 simoes_rr_me_jabo.pdf: 1025114 bytes, checksum: 222989ab6bb60c0b93aaa44e8a5fbba2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O amendoim é uma cultura que possui o seu fruto sob a superfície do solo, exigindo que sua colheita seja realizada em duas etapas denominadas arranquio e recolhimento. Neste processo ocorrem perdas de grau variado, as quais variam espacialmente e temporalmente, com influência direta sobre a qualidade da semente produzida. Pressupondo que as perdas na colheita mecanizada de amendoim apresentem variabilidade temporal e que, portanto, o local de amostragem possa interferir na determinação dos valores obtidos, este trabalho teve como objetivo avaliar, por meio do controle estatístico de processo, as perdas quantitativas no arranquio e recolhimento do amendoim, bem como, avaliar estatisticamente a qualidade das sementes após a colheita. Para a coleta dos dados foi montada uma malha de 42 pontos amostrais, nos quais foram avaliadas as perdas visíveis, invisíveis e totais no arranquio, as perdas na plataforma, as perdas visíveis totais e perdas totais na colheita. Também foram determinados parâmetros de caracterização da colheita do amendoim, tais como teor de água do solo e das vagens, matéria seca, dimensões da leira, cobertura vegetal, fluxo de material colhido, bem como foram realizadas avaliações da qualidade fisiológica das sementes. O teor de água das vagens e do solo foi adequado à operação de arranquio. As perdas visíveis, invisíveis e totais no arranquio apresentaram distribuição assimétrica e instabilidade segundo o controle estatístico. Somente as perdas totais na colheita de amendoim tiveram distribuição normal no recolhimento. Todas as variáveis de caracterização do material recolhido (exceto impurezas minerais) e o índice da velocidade de germinação para a qualidade fisiológica das sementes apresentaram distribuição normal. / The peanut culture has its fruits under the soil surface, demanding a two-steps harvest named digging and collecting. In this process different losses degree can occur, varying spatially and timely influencing directly on the produced seed quality. Estimating that the peanut mechanized harvest losses present temporal variability and, therefore, the sampling place can intervene the gotten values determination, this work aimed evaluate, by the process statistical control means, the quantitative losses in the plowing and picking up the peanut, as well evaluate statistically the seeds quality after harvest. To data collecting a 42-sample-poitns mesh was built in which the visible, invisible, and total losses in the plowing, the platform losses, the visible, invisible, and total losses in the harvest were evaluated. Peanut harvest characterization parameters as soil and pods water content, dry matter, line dimensions, vegetal munching, harvested material flow were determined as well seed physiologic quality evaluations. The water content in the pods and soil was adequate to plowing. The visible, invisible and total losses during plowing presented asymmetric distribution and instability according the statistical control. The total losses in the peanut harvest was the only parameter with normal distribution in the collecting. All material collected characterization variables (except mineral impurities) and the germination index to the seed physiologic quality presented normal distribution.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2007. / Submitted by Luanna Maia (luanna@bce.unb.br) on 2009-03-04T15:40:38Z No. of bitstreams: 1 TESE MONTADA.pdf: 9759866 bytes, checksum: 7f990755db869064b1fabc423ab57975 (MD5) / Approved for entry into archive by Luanna Maia(luanna@bce.unb.br) on 2009-03-04T15:41:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE MONTADA.pdf: 9759866 bytes, checksum: 7f990755db869064b1fabc423ab57975 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-03-04T15:41:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE MONTADA.pdf: 9759866 bytes, checksum: 7f990755db869064b1fabc423ab57975 (MD5) / O amendoim cultivado (Arachis hypogaea) é uma espécie importante, amplamente cultivada nas regiões tropicais e subtropicais do mundo. É bastante suscetível a diversos estresses bióticos e abióticos, para os quais muitas das espécies silvestres são resistentes. Neste trabalho foram avaliadas as duas espécies silvestres A. duranensis e A. stenosperma e selecionadas quanto à resistência ao nematóide Meloidogyne arenaria raça 1. O estudo histopatológico mostrou que A. stenosperma é uma espécie resistente sendo esta caracterizada por uma reação de hipersensibilidade (HR). A. duranensis é uma espécie suscetível, mas possui ciclo de infecção diferenciado da espécie hospedeira típica, A. hypogaea. Bibliotecas de cDNA de raízes de A. stenosperma foram construídas para a formação de um banco de ESTs. Os ESTs de bibliotecas de raízes de A. stenosperma inoculadas e não inoculadas com o nematóide foram analisados in silico para a expressão diferencial de genes durante a infecção. A estratégia do estudo dos ESTs evidenciou oito genes diferencialmente expressos e foi uma primeira tentativa de procura dos fatores responsáveis pela resistência ao nematóide em A. stenosperma. A análise da expressão de seis ESTs foi testada por Northern blot para a confirmação da análise in silico e identificação do possível envolvimento destes genes com a resistência. Neste trabalho ainda, foram construídas e validadas duas bibliotecas BAC (Bacterial Artificial Chromosome) das espécies silvestres diplóides, A. duranensis e A. ipaënsis que são as possíveis espécies parentais do alotetraplóide A. hypogaea. Estas bibliotecas servirão como importantes ferramentas genéticas que possibilitarão o isolamento de genes de interesse do amendoim silvestre e sua comparação com o genoma de outras leguminosas. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Arachis hypogaea, the cultivated peanut, is an important crop, widely grown in tropical and subtropical regions of the world. It is highly susceptible to several biotic and abiotic stresses to which wild species are resistant. In this work, two wild species, A. duranensis and A. stenosperma were evaluated and selected based upon resistance to the root-knot nematode Meloidogyne arenaria race 1. Histopathological studies showed that A. stenosperma is a resistant species. Its resistance is characterized by a hypersensitive response (HR). A. duranensis is susceptible but the evolution of the nematode cycle is different to the host species, A. hypogaea. cDNA libraries of roots were constructed for the development of an EST databank for wild Arachis species. ESTs generated from non inoculated and M. arenaria race 1 inoculated roots of A. stenosperma were analyzed in silico for differential gene expression during infection. This strategy revealed eight clones differentially expressed and represented a first attempt to search for factors that are responsible for resistance in A. stenosperma. Expression analysis of six of these ESTs was conducted by Northern blot to confirm and validate the in silico analysis for the possible involvement of these genes in resistance. In this study two BAC (Bacterial Artificial Chromosome) libraries of the wild progenitors of A. hypogaea, A. duranensis and A. ipaënsis were also constructed and validated. These libraries will function as genetic tools and may help with the isolation of genes of interest in wild Arachis and in comparison with others legume genomes.

Orientador: Rouverson Pereira da Silva / Banca: Carlos Eduardo Angeli Furlani / Banca: João Paulo Arantes Rodrigues da Cunha / Resumo: O amendoim é uma cultura que possui o seu fruto sob a superfície do solo, exigindo que sua colheita seja realizada em duas etapas denominadas arranquio e recolhimento. Neste processo ocorrem perdas de grau variado, as quais variam espacialmente e temporalmente, com influência direta sobre a qualidade da semente produzida. Pressupondo que as perdas na colheita mecanizada de amendoim apresentem variabilidade temporal e que, portanto, o local de amostragem possa interferir na determinação dos valores obtidos, este trabalho teve como objetivo avaliar, por meio do controle estatístico de processo, as perdas quantitativas no arranquio e recolhimento do amendoim, bem como, avaliar estatisticamente a qualidade das sementes após a colheita. Para a coleta dos dados foi montada uma malha de 42 pontos amostrais, nos quais foram avaliadas as perdas visíveis, invisíveis e totais no arranquio, as perdas na plataforma, as perdas visíveis totais e perdas totais na colheita. Também foram determinados parâmetros de caracterização da colheita do amendoim, tais como teor de água do solo e das vagens, matéria seca, dimensões da leira, cobertura vegetal, fluxo de material colhido, bem como foram realizadas avaliações da qualidade fisiológica das sementes. O teor de água das vagens e do solo foi adequado à operação de arranquio. As perdas visíveis, invisíveis e totais no arranquio apresentaram distribuição assimétrica e instabilidade segundo o controle estatístico. Somente as perdas totais na colheita de amendoim tiveram distribuição normal no recolhimento. Todas as variáveis de caracterização do material recolhido (exceto impurezas minerais) e o índice da velocidade de germinação para a qualidade fisiológica das sementes apresentaram distribuição normal. / Abstract: The peanut culture has its fruits under the soil surface, demanding a two-steps harvest named digging and collecting. In this process different losses degree can occur, varying spatially and timely influencing directly on the produced seed quality. Estimating that the peanut mechanized harvest losses present temporal variability and, therefore, the sampling place can intervene the gotten values determination, this work aimed evaluate, by the process statistical control means, the quantitative losses in the plowing and picking up the peanut, as well evaluate statistically the seeds quality after harvest. To data collecting a 42-sample-poitns mesh was built in which the visible, invisible, and total losses in the plowing, the platform losses, the visible, invisible, and total losses in the harvest were evaluated. Peanut harvest characterization parameters as soil and pods water content, dry matter, line dimensions, vegetal munching, harvested material flow were determined as well seed physiologic quality evaluations. The water content in the pods and soil was adequate to plowing. The visible, invisible and total losses during plowing presented asymmetric distribution and instability according the statistical control. The total losses in the peanut harvest was the only parameter with normal distribution in the collecting. All material collected characterization variables (except mineral impurities) and the germination index to the seed physiologic quality presented normal distribution. / Mestre