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Estudo da cisteína com espectroscopia de massa por tempo de vooAraújo, Oscar Cardoso 19 March 2015 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Física, Programa de Pós-Graduação em Física, 2015. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-05-27T14:07:12Z
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2015_OscarCardosoAraujo.pdf: 3121042 bytes, checksum: d0774dd0454b0b4d223fda8e6181765e (MD5) / A cisteína (C3H7NO2S) é um dos aminoácidos que compõem as proteínas dos seres vivos e junto com a metionina são os únicos que tem enxofre em sua composição. Devido a grande importância dos aminoácidos, as suas propriedades físico-químicas se tornaram objetos de estudos, e são de interesse da bioquímica, da astroquímica, da astrofísica, biotecnologia, entre outras áreas. Neste trabalho fizemos o estudo da fragmentação da cisteína na região de valência. Utilizamos a técnica de Espectroscopia de Massa por Tempo-de-Voo (TOF) com Coincidência entre Fotoelétron-Fotoíon (PEPICO). As medidas foram realizadas na faixa de energia entre 11,2 eV a 21eV, na linha de luz TGM (Monocromador de Grades Toroidais), do Laboratório Nacional de Luz Síncrotron (LNLS), Campinas-Brasil, a qual possui um filtro de gás que absorve os harmônicos de ordem superior dos fótons. Na análise dos dados determinamos quantitativamente os fragmentos formados, identificamos e caracterizamos a dinâmica do processo de fragmentação em cada energia do fóton utilizada. Observamos que para energias menores que 15 eV são formados principalmente os íons: íon pai, HS-CH2-CH(NH2)-COOH, menos o radical CH2SH neutro e carregado, e o COOH, resultando nos íons C2H7-xNO2+ e C2H7-xNS+ e o íon H2S+. Para energias maiores observamos o surgimento de outras famílias de íons como: C2HxS+, CHxS+, CO+, HxO+. Determinamos a partir dos íons formados o padrão de fragmentação da cisteína. Os nossos resultados concordam com cálculos teóricos que preveem que os seguintes fragmentos são quebrados da molécula em ordem crescente de energia: [COOH]0, [CH2SH2]0, [H]0, [CH2SH2]+, [NH2]0, [COOH]+, [NH2]+, [H]+. A molécula se quebra preferencialmente fragmentando o radical com o enxofre neutro ou carregado. Outra parte do trabalho foi o desenvolvimento de instrumentação científica que consistiu na montagem de um espectrômetro TOF dedicado a experimentos em amostras líquidas. Como líquidos são incompatíveis com vácuo e com equipamentos eletrônicos, uma série de cuidados foram tomados na confecção desse espectrômetro. O TOF foi projetado como uma sub-câmara dentro da câmara principal para que o alto vácuo pudesse ser mantido nos detectores do espectrômetro. O trabalho consistiu na confecção de diversas peças em aço-inox e teflon e a montagem do espectrômetro. / Cysteine (C3H7NO2S) is one of the amino acids that make up proteins of living beings and with methionine are the ones that have sulfur in their composition. Due to the great importance of the amino acids, their physicochemical properties have become subject of study, and are main the interest of biochemistry, physical chemistry, astrophysics, and biotechnology, among other areas. In this work we study the fragmentation of cysteine in the valence region. We use Time-of-Flight Mass Spectroscopy (TOF) with photoelectron-photoion coincidence technique (PEPICO). The measurements were performed in the range of energy between 11.2 eV to 21eV, in TGM beam line (Toroidal Grating Monochromator), in the Brazilian Synchrotron Light Laboratory (LNLS), Campinas, Brazil, which has a gas filter that absorbs the harmonics of a higher order of photons. In analyzing these data, we can quantitatively determine the fragments formed, we identified and characterized the dynamics of the fragmentation in which photon energy. We note that for energies less than 15 eV are mainly formed ions: father ion, HS-CH2-CH(NH2)-COOH, less CH2SH neutral and charged radical, and the COOH, resulting in C2H7-xNO2+ and C2H7-xNS+ ions and H2S+ ion. For more energy, we observe yielding other families of ions such as: C2HxS+, CHxS+, CO+ HxO+. We determined from the ions formed the fragmentation pattern of cysteine. Our results agree with theoretical calculations predict that the following fragments are broken from the molecule in order of increasing energy: [COOH]0, [CH2SH2]0, [H]0, [CH2SH2]+ , [NH2]0, [COOH]+, [NH2]+, [H]+. The molecule breaks preferably fragmenting the radical with neutral or charged sulfur. Another part of the work was the development of scientific instrumentation that was the assembly of a TOF spectrometer dedicated to experiments in liquid samples. As liquids are incompatible with vacuum and electronic equipment, a lot of care has been taken in the preparation of this spectrometer. The TOF was designed as a sub-chamber within the main chamber to high vacuum could be maintained in the spectrometer detectors. The work consisted of making various parts in stainless steel and Teflon and the assembly of the spectrometer.
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Oxidação diferenciada da dupla ligação enaminica de enecarbamatos endociclicos : sintese de alfa-aminoacidos conformacionalmente restritosSugisaki, Claudia Harumi 21 July 2018 (has links)
Orientador: Carlos Roque Duarte Correia / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-21T10:13:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1996 / Mestrado
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Estudo da seletividade facial das reações de oxidação da dupla ligação de enecarbamatos endociclicos e aplicações sinteticasSugisaki, Claudia Harumi 27 July 2018 (has links)
Orientador: Carlos Roque Duarte Correia / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-07-27T12:28:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2000 / Doutorado
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Sintese de aminoesteres a partir de adutos de Baylis-Hillman : precursores de aminoacidos não proteinogenicosPorto, Ricardo Silva 03 August 2018 (has links)
Orientador: Fernando Antonio Santos Coelho / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-08-03T17:35:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2003 / Mestrado
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Catabolismo da lisina em sorgo : isolamento, purificação parcial e caracterização das enzimas LOR e SDH e sua relação com o acumulo da lisina em sementesFornazier, Ricardo Francisco 08 April 2004 (has links)
Orientador: Ricardo Antunes de Azevedo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T00:22:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2004 / Resumo: A lisina é um aminoácido essencial, sintetizada em plantas através da via metabólica do ácido aspártico. O catabolismo da lisina é desempenhado pela ação de duas
enzimas consecutivas, lisina 2-oxoglutarato redutase (LOR) e sacaropina desidrogenase (SDH). A concentração final de lisina solúvel em sementes de cereais é controlada tanto pela taxa de biossíntese quanto de catabolismo, porém, o catabolismo desempenha um papel central neste controle. O entendimento dos aspectos regulatórios das vias metabólicas de biossíntese e degradação da lisina, bem como a manipulação das enzimas relacionadas são importantes para a produção e caracterização de plantas com alta concentração de lisina, principalmente que acumulem lisina nas sementes. Neste trabalho foi isolada, purificada parcialmente e caracterizada a LOR e SDH de sorgo. Estes procedimentos foram particularmente trabalhosos devido a instabilidade e atividades muito baixas das enzimas, embora diversos métodos de purificação e modificações nos tampões tenham sido testados.
Um pico principal de atividade para LOR e SDH foi observado e co-purificado após precipitação com sulfato de amônio e cromatografia de troca iônica, sugerindo a existência de um polipeptídeo bifuncional contendo dois domínios, conforme previamente observado para LOR e SDH em outras espécies de plantas estudadas. As análises da concentração de lisina em sementes sugerem que o sorgo naturalmente contém concentrações de lisina elevadas, quando comparado a outros cereais, o que pode ser explicado pelas baixas atividades de LOR e SDH observadas, de maneira similar a outras plantas que acumulam lisina já estudadas. Devido a estas altas concentrações de lisina, estudos futuros podem ser desenvolvidos para melhor caracterizar o sorgo como uma fonte alimentar rica no conteúdo do aminoácido essencial lisina, entre outros / Abstract: Lysine is an essential amino acid, synthesized in plants in the aspartic acid metabolic pathway. Lysine catabolism is performed by the action of two consecutive enzymes,
lysine 2-oxoglutarate reductase (LOR) and saccharopine dehydrogenase (SDH). The final soluble lysine concentration in cereal seeds is controlled by both, the synthesis and
catabolism rates, with an apparent central role played by the catabolism. The understanding of the regulatory aspects of lysine biosynthesis and catabolism and the manipulation of the enzymes involved in both processes is important for the production and characterization of high-lysine plants. In this work we have isolated, partially purified and characterized LOR and SDH from sorghum. The isolation, purification and even characterization were particularly difficult due to instability and very low activities of the enzymes during purification, although several methods of purification and modifications to the buffer system had been tested. One main peak of LOR and SDH activity was observed and co-purified after ammonium sulphate and anion exchange chromatography, suggesting the existence of a bifunctional polypeptide containing two domains as previously observed for LOR and SDH of all plant species studied so far. Analysis of lysine concentration in the seeds suggests that sorghum naturally contains much higher lysine concentration than other cereal crops, which may explain the low LOR and SDH activities observed, in a similar manner to other high-lysine plants studied. Due to this high lysine concentration further studies should be carried out in
order to better characterize sorghum as a food source of the essential amino acid lysine / Doutorado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Controle do catabolismo da lisina na semente de milho : isolamento, sequenciado e caracterização do clone genomico da enzima lisina cetoglutarato redutase/sacaropina desidrogenaseMoraes, Karen Cristiane Martinez de 25 July 2018 (has links)
Orientador: Paulo Arruda / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-25T11:51:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1999 / Mestrado / Genetica / Mestre em Ciências Biológicas
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Mecanismo de intercambio de aminoácidos del transportador y+L de eritrocitos de pollo: especificidad del sitio que se expone al comportamiento internoForlivesi Córdova, Daniella January 2004 (has links)
Memoria para optar al Titulo Profesional de Médico Veterinario / El transportador y+L es un intercambiador de aminoácidos que pertenece a la familia de transportadores heterodiméricos. El sitio que se expone al medio extracelular, reconoce aminoácidos catiónicos y neutros con alta afinidad en presencia de Na+ (o Li+), mientras que en K+ es específico para aminoácidos catiónicos. En este trabajo se investigó la especificidad del sitio interno, utilizando como modelo experimental membranas reselladas de eritrocitos de pollo.
Se estudió la dependencia de los flujos de entrada de L-[14C]lisina de la concentración de distintos aminoácidos localizados en el compartimento intracelular en presencia de Na+, K+ o Li+. Los resultados muestran que el sitio interno presenta una marcada preferencia por L-lisina y que la unión de los aminoácidos neutros estudiados (L-glutamina, L-leucina, L-metionina) es débil. L-lisina, a concentraciones saturantes, aceleró el flujo unidireccional de entrada aproximadamente 8 veces y la constante de saturación media (K0,5) para el efecto activador en presencia de Na+ fue 0,010 0,001 mM. L-glutamina, el aminoácido neutro que se unió más fuertemente, causó el mismo efecto a una concentración 80 veces superior (K0,5: 0,8 0,27 mM). En K+, la selectividad por aminoácidos catiónicos es aún mayor. Los resultados indican que el transportador y+L muestra una marcada asimetría en los sitios de unión externo e interno y que esta cualidad no depende de la presencia o ausencia de Na+, además demuestran que el proceso favorecido es el intercambio de aminoácidos neutros (más Na+), desde el exterior por aminoácidos catiónicos en el interior
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Obtenção de hidrolisados enzimáticos de minhoca e estudo das suas propriedades funcionaisRodrigues, Mariano 11 March 2014 (has links)
Submitted by FERNANDA DA SILVA VON PORSTER (fdsvporster@univates.br) on 2014-09-23T18:58:48Z
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2014MarianoRodrigues.pdf: 2094556 bytes, checksum: d1d85616463f5a3f36cac185c321a683 (MD5) / Hidrolisados são proteínas que por ação química ou enzimática produzem peptídeos de vários tamanhos, sendo que pelo método enzimático o valor nutricional da proteína é mantido, sem a degradação dos aminoácidos. Vários pesquisadores demonstraram a possibilidade de se obter hidrolisados proteicos de origem animal a partir de enzimas, utilizando como matéria prima peixes e frango, podendo estes serem utilizados em alimentos, visto que promovem a modificação das propriedades funcionais das proteínas. As minhocas apresentam cerca de 70% de proteínas (base seca) e vêm sendo utilizadas no Brasil na alimentação de pequenos animais, sob a forma de farinha e também na transformação de resíduos orgânicos em húmus. Sendo assim este trabalho teve como objetivo obter hidrolisados proteicos utilizando como matéria - prima a minhoca e avaliar as suas propriedades funcionais, visto que a mesma apresenta elevado valor nutricional e até hoje tem sido pouco utilizada na obtenção destes produtos. Para isto, os hidrolisados foram obtidos após hidrólise enzimática, variando-se a concentração enzima/substrato, pH, temperatura, tempo de hidrólise e agitação do meio, e utilizando como enzimas as proteases Alcalase e Flavourzyme (Novozymes), a partir de um planejamento experimental. Os produtos obtidos foram avaliados com relação ao grau de hidrólise, a fim de se obter a condição mais adequada para a formação da maior quantidade de proteína solúvel, sendo então realizado um estudo de suas propriedades funcionais e teor de aminoácidos por cromatografia a líquido de alta eficiência. Os resultados demonstraram que a condição mais adequada para a obtenção da maior fração solúvel foi em meio alcalino e utilizando a enzima Alcalase, sendo que o produto apresentou algumas propriedades funcionais e praticamente todos os aminoácidos essenciais. Dessa forma a minhoca surge como uma nova e importante fonte na obtenção de hidrolisados, sendo que no futuro pode ser fornecido ao mercado um bioproduto que possa ser usado na alimentação de pequenos animais.
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Adição diastereosseletiva de nucleofilos de carbono a ions N-aciliminios ciclicosAlves, Conceição de Fatima 26 October 2018 (has links)
Orientador: Ronaldo Aloise Pilli / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Quimica / Made available in DSpace on 2018-10-26T16:47:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 1998 / Doutorado
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Isótopos estáveis e composição química de cacharasOtani, Fabrizia Sayuri [UNESP] 28 May 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:29Z (GMT). No. of bitstreams: 0
Previous issue date: 2012-05-28Bitstream added on 2014-06-13T20:00:45Z : No. of bitstreams: 1
otani_fs_dr_jabo.pdf: 299725 bytes, checksum: c249c1632c6bae2a4a3a00e8c512c5b7 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho objetivou determinar a origem de produção de cacharas Pseudoplatystoma reticulatum, pela técnica de isótopos estáveis de 13C e 15N, e análise de composição química. Este estudo está dividido em três capítulos. O capítulo I apresenta uma introdução, abordando os principais assuntos que justificam este trabalho. Os capítulos II e III apresentam os resultados. Cacharas foram capturados e cultivados em Ladário, no rio Paraguai, região da cidade de Corumbá, MS, sacrificados em gelo e transportados para a UNESP, Univ. Estadual Paulista, câmpus de Botucatu. O pescado foi avaliado em relação à origem de produção - de aquicultura ou captura. A origem de produção influenciou os resultados da análise de isótopos estáveis de 13C e 15N (p<0,01), pela análise de componentes principais. Os peixes cultivados apresentaram menor enriquecimento isotópico que os peixes capturados (p<0,01). Além disso, ao comparar tecidos com metabolismo distinto - pele, músculo e ossos - foi possível diferenciar os pares isotópicos entre músculo e ossos para cacharas capturados e pele, músculo e ossos para os peixes de aquicultura (p<0,01). Na determinação da composição química, origem do pescado influenciou os componentes centesimais e a composição mineral (p<0,05). O perfil de aminoácidos não foi alterado pela origem (p>0,05), mas a composição de ácidos graxos foi influenciada (p<0,05). Os resultados permitem concluir que é possível diferenciar a origem de produção pela técnica de isótopos estáveis e composição química / This study aimed to determine the differences between cultured and wild Brazilian catfishes Pseudoplatystoma reticulatum, by stable carbon δ13C and nitrogen δ15N isotopes technique, and to determine the chemical composition. This study is divided into three chapters. The Chapter I contains an introduction, justifying this work. Chapters II and III present the results. The fish were captured and farmed in the area of Corumbá city, Mato Grosso do Sul state, than the fish were slaughtered and sent to São Paulo State University, in Botucatu city. The Brazilian catfish was evaluated in relation to the source - aquaculture or wild. The production source affected the results of 13C and 15N (p<0,01) by principal component analysis. The farmed fish had lower isotopic enrichment of the wild fish (p<0,01). Furthermore, when comparing tissues with different metabolic activity - skin, muscle and bones - the isotopic pairs differed between muscle and bone, to wild fish, and skin, muscle and bones for cultured fish (p<0,01). The production source induced the chemical and mineral composition (p<0,05). The amino acid profile was not affect by the source (p>0,05), but the fatty acid profile was affected (p<0,05). Thus, cultured and wild Brazilian catfishes may be differentiated using stable isotopes technique, and the chemical composition is affected by the production source
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