Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2016-04-04T19:57:21Z No. of bitstreams: 2 Tese- Robertha Augusta Vasconcelos Garcia - 2009.pdf: 2415126 bytes, checksum: 9b586c8248beb55e79f44e19660ab318 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-04-05T10:44:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese- Robertha Augusta Vasconcelos Garcia - 2009.pdf: 2415126 bytes, checksum: 9b586c8248beb55e79f44e19660ab318 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-05T10:44:51Z (GMT). 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Breeding programs have searched for ways to increase productivity and simultaneously enhance its nutritional value and decrease the cooking time. The demand on the use of molecular tools has increased in the past few years, aiming to generate information that can be used in genetic breeding programs. This work presents two studies that were conducted from the development of a set of microsatellite markers derived from expressed sequences and genomic libraries. In the first study EST-SSR markers developed with a set of genomic SSR were evaluated for their amplification quality, transferability, genic information content and polymorphism in the Bat 93 x Jalo EEP558 population study. A total of markers 377 EST-SRR were developed, from which 80% showed PCR amplification products. For the transferability analysis 65 EST-SSR and an additional set of 102 genomic SSR were selected, from which 82% were transferred to, at least, one of the 10 legume species evaluated, where the higher amplification rate was observed between species from the Phaseolus genera (63.67%) and the lower was observed for the Arachis (1.8%). In the characterization of 167 SSR, 72% were polymorphic and the mean estimated PIC varied from 0.53 for genomic SSR to 0.47 to EST-SSR. The analysis of polymorphism in the BJ population revealed that from the 315 markers (302 EST - SSR and 13 genomic), 24% were polymorphic and incorporated to the common bean reference map, totalizing 180 mapped loci with a total map distance of 1154.63cM. The second study presents the construction of a genetic map using a population derived from the cross CNFM 7875 x Laranja, where 132 families were obtained and evaluated in three generations, three locations and four experiments where the genotypic data were obtained. A set of 1,034 SSR loci were tested for polymorphism and 105 (10%) were polymorphic and 93 were mapped on 12 linkage groups with a total map length of 1,369.9cM. The analysis of the phenotypic data indicated that the families show great variability for cooking time. The coefficients of heritability between the means varied between 42.89% and 62.85%. QTL mapping was performed using composite interval mapping and eight regions were associated to the control of this trait, varying from 2 to 4 QTL in generations F2:3 e F2:5, respectively. Significant interactions were observed between QTL and locations, but one QTL was stable between generations conducted in the same environment. The proportion of the phenotypic variation explained by the QTL varied from 3.35% to 21.77%. / Das 50 espécies do gênero Phaseolus descritas, a espécie Phaseolus vulgaris (feijoeiro comum) é a mais cultivada no mundo, ocupando 85% da área total de produção. O Brasil ocupa posição de destaque, sendo o maior produtor mundial, contribuindo com 17,58% da produção total, com área de cultivo estimada em 4,01 milhões de ha. Dentre os legumes de grãos, o feijoeiro comum é o mais importante para o consumo direto humano em todos os continentes, representando uma importante fonte de proteínas, aminoácidos e minerais na dieta alimentar da população brasileira. Programas de melhoramento têm buscado meios de aumentar a produtividade de grãos, aliado a um incremento no valor nutricional e ao atendimento às exigências do consumidor, como a maior facilidade no preparo do alimento. A demanda pelo uso de ferramentas moleculares tem aumentado nos últimos anos visando gerar informações que possam ser agregadas aos programas de melhoramento genético. Esse trabalho apresenta o desenvolvimento de dois estudos que foram conduzidos a partir do desenvolvimento de uma bateria de marcadores microssatélites derivados de seqüências expressas e bibliotecas genômicas. No primeiro estudo, os marcadores EST-SSR desenvolvidos, juntamente com um conjunto de SSRs genômicos, foram avaliados quanto à capacidade de amplificação, transferibilidade, conteúdo de informação gênica e polimorfismo na população Bat 93 x Jalo EEP558 (BJ) para fins de mapeamento. Foram sintetizados 377 EST-SSR, dos quais 80% amplificaram produto de PCR. Para a análise de transferibilidade, foram selecionados 65 EST-SSR e um conjunto adicional de 102 SSR genômicos, dos quais 82% foram transferíveis para, pelo menos, uma das 10 espécies de leguminosas avaliadas, onde o maior índice de amplificação foi observado entre as espécies do gênero Phaseolus (63,67%) e o menor para Arachis (1,8%). Na análise de caracterização dos 167 SSR, 72% foram polimórficos e as estimativas de PIC médio variaram de 0,53 para os SSRs genômicos a 0,47 para os EST-SSR. Quanto ao polimorfismo na população BJ, dos 315 testados (302 EST-SSR e 13 genômicos), 24% foram polimórficos e integrados no mapa de referência da cultura do feijoeiro comum, totalizando 180 locos mapeados, compreendendo uma distância total de mapa de 1154,63 cM. O segundo trabalho apresenta a construção de um mapa genético utilizando uma população derivada do cruzamento CNFM7875 x Laranja, onde foram geradas 132 famílias que foram avaliadas em três gerações e em quatro ambientes dos quais foram obtidos os dados fenotípicos. Uma bateria de 1.034 locos SSR foram avaliados quanto ao polimorfismo, onde apenas 105 (10%) segregaram e 93 foram mapeados em 12 grupos de ligação, com uma extensão final de mapa de 1.369,9 cM. A análise dos dados fenotípicos indicou que as famílias são amplamente variáveis para o tempo de cocção, apresentando coeficientes de herdabilidade no sentido amplo, que variaram de 42,89% a 62,85%. O mapeamento de QTL, utilizando o método de intervalo composto, identificou oito regiões associadas ao controle dessa característica, variando de 2 a 4 QTL na gerações F2:3 e F2:5. Foram observadas interações significativas entre QTL por locais. Porém, foi identificado um (1) QTL estável entre gerações conduzidas em um mesmo ambientes. A proporção da variação fenotípica explicada pelos QTL detectados variou de 3,35% até 21,77%.