Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-15T13:12:39Z No. of bitstreams: 1 Joao Carlos Gomes Borges.pdf: 1260294 bytes, checksum: 43236ab101e2f29881f9f2d010f259b3 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-15T13:12:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Joao Carlos Gomes Borges.pdf: 1260294 bytes, checksum: 43236ab101e2f29881f9f2d010f259b3 (MD5) Previous issue date: 2016-01-22 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / With five significant biomes and the largest river system in the World, Brazil has the richest continental biota on the planet, which has led to the country being classified as megadiverse. In Brazil, several species of aquatic mammals have been suffering almost constantly form the anthropogenic, and sometimes triggering, effects of different parasitic agents. However, our scientific knowledge of the parasitic fauna of aquatic mammals remains limited. Thus, the aim of the present study was to diagnose infections caused by Cryptosporidium spp., Giardia sp. and endoparasites among aquatic mammals in Brazil. To do this, 553 samples were collected from fecal content and the gastrointestinal tract of several species of cetaceans, sirenians (Antillean and Amazonian manatees) and mustelids (neotropical and giant otters) in the North (Amapá, Amazonas, Pará and Rondônia) and Northeast (Alagoas, Bahia, Ceará, Sergipe, Paraíba, Pernambuco, Rio Grande do Norte) of Brazil. Samples were obtained from animals that were kept in captivity and others in the wild, including specimens that lived in rivers, coastlines and oceans. For Cryptosporidium spp., the fecal samples were processed by Kinyoun technique. Concerning the identification of Giardia sp. cysts and helminth eggs, the material collected was submitted to flotation (Willis and Faust) and sedimentation (Hoffman) methods, followed by the Flotac technique. All samples were subjected to the direct immunofluorescence test. In the results obtained, a notable infection was caused by the digenetic trematode of the Opistothrematidae family (Pulmonicola cochleotrema), with an infection prevalence of approximately 7.95% (07/88) among Antillean manatees. The presence of Cryptosporidium spp. was confirmed in five species: Lontra longicaudis (15.28%); Pteronura brasiliensis (41.66%); Sotalia guianensis (9.67%); Trichechus inunguis (16.03%) and Trichechus manatus (13.79%). Giardia sp. was diagnosed in the following species: L. longicaudis (9.23%); P. brasiliensis (29.16%); Kogia breviceps (100%); Kogia sima (25%); S. guianensis (9.67%); T. inunguis (3.81%) and T. manatus (10.34%). The identification of Cryptosporidium spp. and Giardia sp. in aquatic mammals, allied to the capacity of their oocysts and cysts, respectively, to remain infective in the environment for a long period of time, increases the possibility of the transmission of these agents to other aquatic and land organisms, as well as the human population. / Abrigando cinco importantes biomas e o maior sistema fluvial do mundo, o Brasil tem a mais rica biota continental do planeta, o que rendeu o título de país megadiverso. Dentro deste contexto, encontram-se várias espécies de mamíferos aquáticos, as quais vem sofrendo constantemente com os efeitos antropogênicos e por vezes desencadeantes de diversos agentes parasitários. Entretanto, o conhecimento científico da fauna parasitária dos mamíferos aquáticos ainda é bastante limitado. Desta forma, este trabalho teve por objetivo diagnosticar infecções ocasionadas por Cryptosporidium spp., Giardia sp. e endoparasitos em mamíferos aquáticos no Brasil. Para isto foram realizadas coletas de 553 amostras de conteúdo fecal e do trato gastrointestinal de diversas espécies de cetáceos, sirênios (peixe-boi marinho e amazônico) e mustelídeos (lontra neotropical e ariranha), nas regiões Norte (Amapá, Amazonas, Pará e Rondônia) e Nordeste (Alagoas, Bahia, Ceará, Sergipe, Paraíba, Pernambuco, Rio Grande do Norte). Entre os animais envolvidos foi possível obter amostras de espécimes mantidos em cativeiro e de vida livre, bem como, de espécies que habitavam os recursos fluviais, costeiros e oceânicos. Para a pesquisa de Cryptosporidium spp. as amostras fecais foram processadas pela técnica de Kinyoun. Ao que concerne à identificação dos cistos de Giardia sp. e ovos de helmintos, o material coletado foi submetido aos métodos de flutuação (Willis e Faust) e sedimentação (Hoffman), assim como à técnica do Flotac. Todas as amostras foram submetidas ao Teste de Imunofluorescência Direta. Entre os resultados obtidos destaca-se a infecção ocasionada pelo trematódeo digenético da família Opistothrematidae, espécie Pulmonicola cochleotrema, sendo a frequência da infecção de aproximadamente 7,95% (07/88) em peixes-bois marinhos. A presença de Cryptosporidium spp. foi constatada em cinco espécies, sendo estas, a Lontra longicaudis (15,28%), Pteronura brasiliensis (41,66%), Sotalia guianensis (9,67%), Trichechus inunguis (16,03%) e Trichechus manatus (13,79%). No que concerne à ocorrência de Giardia sp., este coccídio foi diagnosticado em um maior número de espécies, conforme pode ser constatado em L. longicaudis (9,23%), P. brasiliensis (29,16%), Kogia breviceps (100%), Kogia sima (25%), S. guianensis (9,67%), T. inunguis (3,81%) e T. manatus (10,34%). A identificação de Cryptosporidium spp. e Giardia sp. acometendo os mamíferos aquáticos, aliado à capacidade dos oocistos e cistos respectivamente destes protozoários permanecerem infectantes em condições ambientais por um longo período de tempo, amplia a possibilidade de transmissão destes agentes para outros organismos aquáticos, terrestres e populações humanas.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:32:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6521.pdf: 3822006 bytes, checksum: 8dd5924ddfcce5bf41cf7ae19c8db5d8 (MD5) Previous issue date: 2014-11-18 / Financiadora de Estudos e Projetos / The neotropical otter (Lontra longicaudis) is one of the 13 species of otter and has one of the widest geographic distribution, occurring from the north of Mexico until northern Argentina. Along its distribution the species, inhabits a variety of habitats facing different environmental quality levels. The availability of food and places to build burrows are the key factors to its occurrence. The species is defined as top predator and because its generalist habits, it has been suggested as a community structure species. Although the species tend to be generalist it shows a preferences for fishes and crustaceans in its diet. Its IUCN classification (data deficient) is based mainly on studies related to its diet and habitat use. Nevertheless, information about the species still have too much gaps in relation to populations studies, current distribution and environment requirements. This paper aims to review the current status and species information with the purpose of propose future conservation actions for the species, and therefore propose further information to enable a most appropriate classification on the conservation status of the neotropical otter. / A Lontra longicaudis é uma das 13 espécies de lontra com maior distribuição geográfica, ocorrendo desde o norte do México até o norte da Argentina. Em todo seu território, está presente em diversos tipos de ambientes e com variados níveis de qualidade ambiental. A oferta de alimentos e disponibilidade de locais propícios para criação de tocas são os fatores chave para a sua ocorrência. Considerada topo de cadeia, é um animal generalista, mas que apresenta uma preferência em sua dieta por peixes e crustáceos. Classificada pela IUCN como Dados Deficientes, possuindo vários trabalhos relacionados à dieta e utilização de ambiente. Porém, ainda há grandes lacunas no que diz respeito a estudos populacionais, distribuição atual e suas exigências ambientais. Este trabalho teve como objetivo fazer uma revisão do atual status e informações a respeito da espécie e propor quais atitudes devem ser tomadas para conservação da lontra, tal como, trabalhos de educação ambiental, monitoramento das unidades de conservação, maior rigidez com o cumprimento das leis ambientais e quais áreas necessitam de maiores informações para possibilitar uma classificação sobre o status de conservação mais adequada da lontra.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-06-13T13:26:00Z No. of bitstreams: 1 Luciana Ghinato.pdf: 629302 bytes, checksum: 02a62afbcd511099f103c660d71ff183 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-13T13:26:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luciana Ghinato.pdf: 629302 bytes, checksum: 02a62afbcd511099f103c660d71ff183 (MD5) Previous issue date: 2015-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Brazil is a country which has five important biomes and the largest river system in the world. In addition, it has the richest continental biota of the planet which earned him the title of mega-diverse country. The various species of aquatic mammals, the manatee (Trichechus manatus) has constantly suffered the effects of anthropogenic factors. In this context, the sewage waste dumps and heavy metal waste, are related to the degradation of aquatic environments and animal species which live in this biome. The aims of this study was to evaluate the quality of surface water from the river Mamanguape, located in the state of Paraíba, Brazil. This place is featured by an Environmental Protection area, where manatees occur. From September 2013 to July 2014, water samples were collected in triplicate of five distinct points of the river. In order to determine the Most Probable Number of fecal coliform the technique of multiple tubes was used. The reading of the samples for the research of mercury metal was performed through the System of Flow Injection Analysis, whereas for the other metals was performed, by Optical Emission Spectrometry with Inductively Coupled Plasma. In the research of thermotolerant coliforms, the contamination of some points, but always, values below to that recommended by the legislation was observed. Mercury, cadmium and chromium metals, were not detected, conversely copper, nickel, manganese, zinc and iron were detected, in low concentrations. On the other hand, aluminum and lead were found in concentrations above that allowed by the legislation. In conclusion, the water of the Mamanguape River presenting levels of salinity and pH within the limits previously established and low levels of contamination by fecal coliforms. The water samples of the Mamanguape River herein evaluated presented contamination by heavy metals, demonstrating the need of implementation of programs to monitor the collection sites. This measure could identify the likely source of contamination, considering that they are bioconcentrated in marine biota and may cause alterations in the food chain and consequently on the manatee. / O Brasil é um país que tem cinco biomas importantes e o maior sistema fluvial do mundo. Além disso, ele tem a mais rica biota continental do planeta, que lhe valeu o título de país mega-diverso. Dentre as várias espécies de mamíferos aquáticos, o peixe-boi (Trichechus manatus) tem constantemente sofrendo os efeitos de fatores antropogênicos. Neste contexto, os depósitos de resíduos de esgoto e resíduos de metais pesados, estão relacionados com a degradação dos ambientes aquáticos e espécies animais que vivem nesse bioma. Os objetivos deste estudo foram avaliar a qualidade das águas superficiais do rio Mamanguape, localizada no estado da Paraíba, Brasil. Este lugar é caracterizado por uma Área de Proteção Ambiental, onde ocorrem peixes-bois marinhos. De setembro de 2013 a julho de 2014, amostras de água foram coletadas em triplicata de cinco pontos distintos do rio. A fim de determinar o Número Mais Provável de coliformes fecais foi utilizada a técnica de tubos múltiplos. A leitura das amostras para a pesquisa do metal mercúrio foi realizada por meio do Sistema de análise em fluxo, enquanto que para os outros metais foram realizadas, por Espectrometria de Emissão Óptica com plasma indutivamente acoplado. Na pesquisa de coliformes termotolerantes, houve contaminação de alguns pontos, mas sempre valores abaixo do recomendado pela legislação. Os metais mercúrio, cádmio e crómio, não foram detectados, pelo contrário foram detectados cobre, níquel, manganês, zinco e ferro, em concentrações baixas. Por outro lado, o alumínio e chumbo foram encontrados em concentrações superiores que permitidas pela legislação. Em conclusão, a água do rio Mamanguape apresenta níveis de salinidade e pH dentro dos limites previamente estabelecidos e baixos níveis de contaminação por coliformes termotolerantes. As amostras de água do rio Mamanguape aqui avaliados apresentaram contaminação por metais pesados, o que demonstra a necessidade de implementação de programas para monitorar os locais de coleta. Esta medida poderia identificar a provável fonte de contaminação, considerando que eles são bioacumulados na biota marinha e podem causar alterações na cadeia alimentar e, consequentemente, sobre o peixe-boimarinho.

<p>  </p> <p>Semi-aquatic mammals, such as American beavers (<em>Castor canadensis</em>), muskrats (<em>Ondatra zibethicus</em>), North American river otters (<em>Lontra canadensis</em>), and American mink (<em>Neogale</em> <em>vison</em>), often play important roles in their ecosystem. Beavers and muskrats can manipulate plant community structure through the use of woody debris and forbs. As mesocarnivores, North American river otters and American mink can also drive community structure through the predation. Traditionally, these species are monitored using sign surveys (i.e., walking transects and visually identifying scat, tracks, and latrines). Camera trapping has also been used to survey semi-aquatic species occupancy to a lesser extent. However, due to their almost exclusive use of edge habitat, they may be ideal species to camera trap. Another more recently employed survey method is environmental DNA (eDNA), which involves the extraction of DNA from environmental samples (such as soil, water, air, and snow) to determine species occupancy. In this study, I evaluate environmental DNA and camera trapping as survey methods for detecting semi-aquatic mammals around northeastern Indiana. In the first chapter, I used eDNA sampling and camera trapping to monitor seven sites for three weeks during March – May 2021 in order to determine the presence of American mink. I found that the naïve occupancy for each site was 0.86. Although the detection probability of eDNA was lower than that of camera trapping (0.25 and 0.36, respectively), the occupancy models created suggest that there was no difference in detection probability between the two methods. I also compared the cost and time spent per sample and found that both were 20% lower for eDNA than camera trapping. The results of my study suggest eDNA may be a cost- and time-effective method for surveying for American mink occupancy. The objective of my second chapter was to determine the number of camera traps required to obtain reliable data for detecting semi-aquatic mammals. A minimum requirement for number of camera traps would be useful knowledge for wildlife managers in terms of budgeting and resource management and could also help to refine current camera trapping methodologies. I camera trapped four ponds for four weeks during June – July 2021, varying the number of camera traps (1 – 5) used at each pond each week. I collected a total of 66,543 photos and detected one semi-aquatic mammal throughout the study period (<em>Neogale vison</em>). Due to the lack of semi-aquatic mammals detected, I could not perform any analyses.</p>