Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T10:15:55Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-19T10:17:31Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-19T10:17:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Amanda Rafaela Rodrigues - 2014.pdf: 1648839 bytes, checksum: 9a00f301e577d05e94214afe813688c5 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-10-23 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The genus Trichoderma is represented by non-pathogenic soil fungi that have been studied by act as biological control agents against fungal pathogens, such as Sclerotinia sclerotiorum, the fungus that causes white mold, besides that, reduce environment and human health risks by being able to replace agrochemicals. Proteomic strategies with MS techniques have been important tools in studies of patterns identification for protein expression in different growth conditions. This work aims to development new strategies that enable the detection and identification of proteins secreted by Trichoderma asperellum (TR356) and Sclerotinia sclerotiorum when inoculated together and separated. The results obtained by MALDI / TOF analysis allowed the identification of a β-1.3--glucanosiltransferase and α-1.2-Dmannosidase, demonstrating the possibility of proteins identification for better comprehension about interaction between these organisms. It was therefore possible to identify the proteins through strategies used, but further analysis are required in order to elucidate the function and interaction of proteins secreted by the fungus Trichoderma asperellum TR356 against S. sclerotiorum. / OgêneroTrichodermaérepresentadoporfungosdesolonãopatogênicosquesãoestudad osporsuaaçãocomoagentesdecontrolebiológicocontrafungosfitopatógenos,comoScler otiniasclerotiorum,ofungocausadordomofobranco.Osfungos Trichoderma spp.atuamcomoimportantesagentesdecontrolebiológico,diminuindoosriscosàsaúdehu manaeaomeioambienteporseremcapazesdesubstituirosagroquímicos.Estratégiasprot eômicas juntamente com técnicas de MSsãoimportantesferramentasemestudosdepadrão, identificação e expressãodeproteínasemdiferentescondiçõesdecrescimento.Levando em consideração a importância de tais estudos, o presente trabalho tem por objetivo o desenvolvimento de novas estratégias que possibilitem a detecção e identificação de proteínas secretadas por Trichoderma asperellum (TR356) e Sclerotinia sclerotiorum quando inoculados juntos e/ou separados os dois organismos vivos. Os resultados obtidos através das análises por MALDI/TOF permitiram a identificação dasproteínas, β-1,3-glucanosiltransferase e α-1,2-D-mannosidase,demonstrando a possibilidade de identificaçãopara o entendimento futuro acerca da interação destes organismos. Foi possível, portanto, a identificação das proteínas através das estratégias utilizadas, porém serão necessárias futuras análises afim de elucidar a interação e função das proteínas secretadas através do fungo T. asperellum TR356sobre S. sclerotiorum.

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:16:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 parte I regiane.pdf: 912177 bytes, checksum: 0b47e257840020aec3acb3cb01014dba (MD5) Previous issue date: 2008-05-29 / The β-1.3-glucanases have several functions in the cell as fungal metabolic in hydrolysis of polysaccharides for possible cellular assimilation; morphogenetic function in the hydrolysis or modifications of the cell wall, which includes growth and extension of the wall, altering the structure and composition of the wall and autolysis. In addition to presenting ecological importance, since these enzymes are involved in biological control, through the process of mycoparasitism. The gender Trichoderma comprises a group of filamentous fungi, saprophytic soil, found on decomposing organic matter in the rhizosphere, and some plants. Considering the importance of β-1.3 glucanases proposing in this study to evaluate the production of β-1.3 - glucanases by T. asperellum using different sources of carbon and nitrogen. The enzyme was produced using cell wall of Rizoctonia solani (PCRS), chitin, chitosan, starch, cellulose, sucrose, maltose, lactose, celobiose and glucose. The best production of enzymes was obtained in the middle containing PCRS, with two bands of activity of polyacrylamide gel were found. Furthermore, the effect of varying concentrations of ammonium sulfate (2, 4, 6, 8, 20, 40 and 60 mM) in the production of β-1.3-glucanase was evaluated during the growth of the fungus in PCRS. A great increase in activity of the enzyme was detected in the presence of nitrogen source. We can see that there was a considerable increase in the expression of the enzyme of low molecular weight at this culture conditions. / As b-1,3-glucanases apresentam diversas funções na célula fúngica como metabólica, na hidrólise de polissacarídeos para eventual assimilação celular; função morfogenética, na hidrólise ou modificações da parede das células, que inclui o crescimento e extensão da parede, alterando sua estrutura e sua composição e autólise. Além de apresentar importância ecológica estas enzimas estão envolvidas no controle biológico, através do processo de micoparasitismo. O gênero Trichoderma compreende um grupo de fungos filamentosos saprófitas de solo, encontrados sobre matéria orgânica em decomposição e na rizosfera de algumas plantas. Considerando a importância das b-1,3-glucanases propõe-se neste trabalho a avaliação da produção de b-1,3-glucanases por T. asperellum utilizando diferentes fontes de carbono e nitrogênio. A enzima foi produzida utilizando parede celular de Rizoctonia solani (PCRS), quitina, quitosana, amido, celulose, sacarose, maltose, lactose, celobiose e glicose. A melhor produção de enzimas foi obtida n o meio contendo PCRS, sendo detectadas duas bandas de atividade em gel de poliacrilamida. Além disto, o efeito de concentrações variadas de (NH4) 2SO4 (2, 4, 6, 8, 20, 40 e 60 mM) na produção de b-1,3-glucanases foi avaliado durante o crescimento do fungo em PCRS. Um aumento considerável na atividade da enzima foi detectado na presença desta fonte de nitrogênio. Pode - se observar que houve um aumento considerável na expressão da enzima de menor massa molecular nestas condições de cultivo.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-27T14:53:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - João Paulo Cabral de Brito - 2014.pdf: 977293 bytes, checksum: f8d05d4259ea9bbd904419bbd7674cf9 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-01-28T13:20:49Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - João Paulo Cabral de Brito - 2014.pdf: 977293 bytes, checksum: f8d05d4259ea9bbd904419bbd7674cf9 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-28T13:20:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Dissertação - João Paulo Cabral de Brito - 2014.pdf: 977293 bytes, checksum: f8d05d4259ea9bbd904419bbd7674cf9 (MD5) Previous issue date: 2014-08-08 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Trichoderma genus corresponds to free-living filamentous fungi, including species able to act as biological control agents against pathogenic fungi. It is believed that this ability is due to the synergy of several mechanisms, including a wide variety of secondary metabolites produced by these organisms. Among them, there is the production of peptaibols, an antibiotic peptide group characterized by the presence of non-proteinogenic amino acids such as α-aminoisobutyrate (Aib), presence of N-terminal modifications and amino alcohols in the C-terminal region. These peptaibols have amphipathic nature, allowing the formation of ion channels in lipid membranes, which are believed to be related to its antimicrobial activity. This study aimed to draw a profile of production and identify of secreted peptaibols from Trichoderma asperellum TR356 strain. The fungi was grown in TLE with 0.3% glucose medium for 5 days, 120 rpm in the dark. Liquid medium filtrate was used as metabolites source. These extracts were subjected to high performance liquid chromatography (HPLC) and subsequent analysis by matrix-assisted laser desorption ionization mass spectrometry (MALDI-TOF). The results indicate the production of two classes of peptaibols for this T. asperellum strain. Primary structure of two Asperelines (A and E) and five Trichotoxins (T5D2, T5E, T5F, and T5G 1717A) has been elucidated. Most of these peptaibols had been previously described in T. viride and T. asperellum marine strains. This is the first report of some of these compounds being produced by a T. asperellumstrain from soil. Future analysis will be necessary to elucidate the three-dimensional structures and their activity against pathogens. / O gênero Trichoderma corresponde a fungos filamentosos, de vida livre, que inclui espécies capazes de agir como agentes de controle biológicoeficazes contra fungos fitopatogênicos. Acredita-se que esta capacidade é devida a sinergia de vários mecanismos, incluindo a ampla variedade de metabólitos secundários produzidos por estes organismos. Dentre eles, há a produção de peptídeos antibióticos conhecidos como “peptaibols”, compostos caracterizados pela presença de aminoácidos não proteinogênicos como α-aminoisobutirato (Aib), e por possuírem modificações N-terminais e presença de amino álcoois na região C-terminal. Estes peptaibols apresentam natureza anfipática, permitindo a formação de canais iônicos nas membranas lipídicas, o que se acredita estar relacionado com sua atividade antimicrobiana. Este trabalhoteve como objetivo traçar um perfil de produção e identificar peptaibols secretados pela linhagem de Trichoderma asperellum TR356. O isolado foi crescido em meio TLE contendo 0,3% de glicose, por 5 dias, 120 rpm no escuro. O sobrenadante filtrado foi utilizado como fonte para extração de metabólitos. Estes extratos foram submetidos a cromatografia líquida de alta eficiência (CLAE) e posterior análise pela técnica de espectrometria de massas por ionização e dessorção a laser assistida por matriz (MALDI-TOF). Os resultados indicam a produção de duas classes de peptaibols por esta linhagem de T. asperellum. Foram elucidadas as estruturas primárias de duas Asperelinas (A e E), e de cinco Trichotoxinas (T5D2, T5E, T5F, T5G e 1717A). A maior parte destes peptaibols havia sido descrito anteriormente em linhagens de T. viride e linhagens de T. asperellum marinhas. Este é o primeiro relato de alguns destes compostos sendo produzidos por uma linhagem de T. asperellum proveniente do solo. Futuras análises serão necessárias para a elucidação de suas estruturas tridimensionais e atividade destes compostos contra fitopatógenos.

Made available in DSpace on 2017-07-25T19:31:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Kamila Santana.pdf: 1363071 bytes, checksum: 4f5da813f22ced41d3b26851a927779f (MD5) Previous issue date: 2016-06-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The blueberry is an agricultural crops recently introduced in Brazil and lots of researches are turning to develop and adapt it to the country. Due to its low amount of root hair, it forms associations with microorganisms to expand its zone of nutrient uptake, being the nitrogen the most required element. At this work it was observed the interaction of this cultivation with the inoculum Azospirilum brasilense and Trichodema asperellum into different substrates or doses of nitrogen fertilization. The experiment was performed with cv. Climax and the plants conditioned in pots in greenhouse, under trial design of randomized blocks, factorial 3x3. The considered factors were inoculation (A. brasilense, T. asperellum or without inoculation) and formulation of the substrates (5; 20 e 35% of organic matter – hardened cattle manure) or, at the second experiment, inoculation (A. brasilense, T. asperellum or without inoculation) and doses of nitrogen (0, 10 and 15 g f N plant-1 – provided as urea). The larger quantity of organic matter provided the highest averages relating to physiological (transpiration, water use efficiency and carboxylation efficiency) and growth variables (foliar limb area, total foliar area and rate of relative growth), although, for some of them, it has not differed from plants grown with 20% of organic matter. With 30% of O.M., the inoculation with T. asperellum showed superior averages in CO2 assimilation (A), carboxylation efficiency (A/Ci) and rate of relative growth (RRG). The nitrogen doses positively affected A/Ci, clorophyll amounts, foliar area (limb and total) and foliar nitrogen concentration, although it not differing between 10 or 15g of N plant-1. For the accumulation of the nutrients Ca, Mg, S, Fe and Zn, the nitrogen fertilization did not represent higher foliar levels, even though this might be related to a dilution effect. / O mirtileiro é uma cultura recentemente introduzida no Brasil, sendo que várias pesquisas tem-se voltado para seu melhor desenvolvimento e adaptação no país. Por possuir poucos pelos radiculares, forma associações com microrganismos afim de aumentar sua zona de absorção de nutrientes, sendo o nitrogênio o elemento absorvido em maior quantidade. Neste trabalho, observou-se a interação dessa cultura com os inóculos Azospirillum brasilense e Trichoderma asperellum em diferentes substratos ou doses de adubação nitrogenada. O experimento foi realizado com a cv. Clímax e as plantas acondicionadas em vasos, em casa de vegetação, sob delineamento experimental de blocos casualizados em esquema fatorial 3x3. Os fatores analisados foram inoculação (A. brasilense, T. asperellum ou sem inoculação) e formulação dos substratos (5; 20 e 35% de matéria orgânica – esterco bovino curtido) ou, no segundo experimento, inoculação (A. brasilense, T. asperellum ou sem inoculação) e doses de nitrogênio (0, 10 e 15 g de N planta-1 – fornecido como ureia). A maior proporção de matéria orgânica propiciou as maiores médias em relação a variáveis fisiológicas (transpiração, eficiência no uso da água e eficiência de carboxilação) e de crescimento (área de limbo foliar, área foliar total e taxa de crescimento relativo), embora, para outras, não tenha diferido das plantas cultivadas com 20% de matéria orgânica. Com 35% de M.O., a inoculação com T. asperellum apresentou médias superiores em assimilação de CO2 (A), eficiência de carboxilação (A/Ci) e taxa de crescimento relativo (TCR). As doses de nitrogênio influenciaram positivamente A/Ci, teores de clorofila, área foliar (de limbo e total) e concentração foliar de nitrogênio, embora não diferindo entre 10 ou 15g de N planta-1. Para o acúmulo dos nutrientes Ca, Mg, S, Fe e Zn, a adubação nitrogenada não representou maiores teores foliares, embora isto possa estar relacionado a um efeito de diluição.