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Expressão de microRNAs em indivíduos com infecção assintomática e com mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical (HAM/TSP) / MicroRNA expression in HTLV-1 asymptomatic carriers and in patients with HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP)

Emanuela Avelar Silva Costa 20 October 2016 (has links)
Embora o vírus linfotrópico de células T humanas do tipo 1 (HTLV-1) seja reconhecido como o agente etiológico da leucemia/linfoma de células T do adulto (ATL) e da paraparesia espástica tropical/mielopatia associada ao HTLV-1 (HAM/TSP), cerca de 90% dos indivíduos infectados permanecem assintomáticos por toda a vida. Até o presente momento, os fatores associados ao desenvolvimento de doença relacionada ao HTLV-1 não foram totalmente elucidados. Sabe-se que o aumento da carga proviral e a expressão de genes virais estão envolvidos no desenvolvimento/progressão de doenças associadas ao HTLV-1. Assim, por exemplo, a proteína Tax modula genes envolvidos na patogênese da HAM/TSP e genes regulados por HBZ estimulam a proliferação de linfócitos T, induzindo a ATL. Desde a última década, diversos estudos têm demonstrado que células transformadas pelo HTLV-1 apresentam microRNAs do hospedeiro desregulados, o que poderia promover alteração na expressão de genes virais (tax e HBZ), com possível contribuição para o desenvolvimento de HAM/TSP e ATL. Diante desses indícios, o presente estudo teve como objetivos: i) quantificar a expressão de miRNAs humanos conhecidos em células T CD4+ e T CD8+ do sangue periférico de indivíduos assintomáticos infectados por HTLV-1 e de pacientes com HAM/TSP; ii) identificar padrões diferenciais de expressão de miRNAs desregulados que pudessem caracterizar os grupos de pacientes de acordo com sua condição clínica; iii) investigar associações dos padrões diferenciais de expressão de miRNAs com a carga proviral e com a expressão dos genes tax e HBZ de HTLV-1. Analisou-se o perfil de expressão de 754 miRNAs em células T CD4+ e TCD8+ infectadas por HTLV-1 em 19 indivíduos assintomáticos, 17 pacientes com HAM/TSP e 14 controles não infectados. Foram detectados 10 miRNAs diferencialmente expressos no grupo HAM, quando comparados ao grupo ASS (super-expressos: hsa-miR-133a, -148a, -211, -330, -369-5p, -486 e -889 e sub-expressos: hsa-miR-520b, -520e e -566). A expressão alterada dos hsa-miR-133a, -148a, -211, e -889 (super-expressos) e do hsa-miR-520b (sub-expresso) foi correlacionada à carga proviral e a do hsa-miR-211 (super-expresso) à expressão de tax. Além disso, ao analisar as vias canônicas geradas no estudo, identificaram-se as moléculas IL6ST, PTPN11, MAP2K5, ELK4, AKT1, BAD, FOSL1, IRAK 3, CDC42, STAT3 e CREB A como potencialmente afetadas pela expressão alterada de miRNAs no grupo HAM, quando comparado com o grupo ASS. Tais achados mostram-se úteis para o delineamento futuro de estudos longitudinais com indivíduos infectados por HTLV-1, com vistas à identificação de biomarcadores prognósticos de risco para o desenvolvimento de HAM/TSP. / Even though human lymphotropic virus type 1 (HTLV-1) is etiologically linked to adult T-cell leukemia (ATL) and to HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP), about 90% of infected individuals remain asymptomatic lifelong. So far, factors that are associated with development of HTLV-1-related disease have not been totally clarified. Increase in proviral load and expression of viral genes are recognized as involved in disease development and progression. For instance, the Tax protein is known to modulate genes that are involved in HAM/TSP pathogenesis and HBZ-regulated genes account for T lymphocyte proliferation that leads to ATL. In the last decade, several studies have shown that HTLV-1-transformed cells exhibit dysregulated human microRNA expression, which could result in altered viral gene expression (tax and HBZ), contributing to the development of HAM/TSP and ATL. Based on this evidence, our study aimed at: i) quantifying known human miRNA expression in CD4+ and CD8+ peripheral blood T-cells from HTLV-1 asymptomatic carriers and patients with HAM/TSP; ii) identifying distinctive dysregulated miRNA expression profiles that could distinguish patients according to their clinical status; iii) investigating associations between differential miRNA expression profiles with proviral load and with HTLV-1 tax and HBZ gene expression. We analysed the expression profile of 754 miRNAs in CD4+ e CD8+ peripheral blood T cells from 19 HTLV-1 asymptomatic carriers (AC), 17 patients with HAM/TSP (HAM) and in 14 non-infected controls. Ten differentially expressed miRNAs were found in HAM, as compared with AC (overexpressed: hsa-miR-133a, -148a, -211, -330, -369-5p, -486 and -889; and underexpressed: hsa-miR-520b, -520e and -566). Altered expression of hsa-miR-133a, -148a, -211, and -889 (overexpressed) and of hsa-miR-520b (underexpressed) was shown to be correlated with proviral load and that of hsa-miR-211 (overexpressed) with tax expression. Moreover, analysing the miRNA canonical pathways generated in this study, we identified IL6ST, PTPN11, MAP2K5, ELK4, AKT1, BAD, FOSL1, IRAK 3, CDC42, STAT3 and CREB A as molecules that are potentially affected by altered miRNA expression in HAM, as compared to AC. Our findings are useful for the future design of longitudinal studies of HTLV-1 infected cohorts, aiming at the recognition of prognostic biomarkers of risk for the development of HAM/TSP
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Análise das notificações das infecções primárias de corrente sanguínea em unidades de terapia intensiva adulto de Goiânia-GO / Analysis of notifications of central-line associated bloodstream infections in adult ICUs in Goiânia, Brazil

Silva, Alexsandra Gomes Resende de Souza da 29 August 2018 (has links)
Submitted by Onia Arantes Albuquerque (onia.ufg@gmail.com) on 2018-10-11T15:04:28Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexsandra Gomes Resende de Souza da Silva - 2018.pdf: 3027265 bytes, checksum: 4c70a842bfa34b413b177bde613f5ba1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-10-15T11:04:15Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Alexsandra Gomes Resende de Souza da Silva - 2018.pdf: 3027265 bytes, checksum: 4c70a842bfa34b413b177bde613f5ba1 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-15T11:04:15Z (GMT). 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SPSS-17.0 and Stata software (version 14.0) were used. Data were expressed as temporal trend, descriptive statistics and percentiles. Data analysis considered a 95% confidence interval and significance level of p<0.05. Results: We analyzed 1988 healthcare-associated infection (HAI) notifications from 42 adult ICUs. The temporal trend of central-line associated bloodstream infections incidence density was stationary. The incidence density of laboratory central-line associated bloodstream infections varied from 3.32 to 4.34 infections per 1000 catheters/day. The rate of central venous catheter use in the period was 55.36%. In relation to percentile, increase was observed in the study period, particularly in 2016 in the 90th percentile. There was no statistical association between the variables analyzed. With respect to the microbiological and antimicrobial susceptibility profile, SCon and S. aureus showed 91.8% and 71.4% resistance to oxacillin, respectively, in 2016. K. pneumoniae and Acinectobacter spp. Were resistant to 3rd and 4th generation cephalosporins and carbapenems. Conclusion: It was concluded that the temporal trend of central-line associated bloodstream infections was stationary, and incidence density and percentiles increased over the years. The primary causative agents were SCon and K. pneumoniae, with broad spectrum antimicrobial resistance. Measures should be implemented to monitor health services and provide continuing education for health workers regarding the prevention and control of these infections. / Introdução: As infecções primárias de corrente sanguínea são frequentes, em Unidade de Terapia Intensiva (UTI) ocasionando prolongamento no tempo de internação, elevados custos hospitalares e óbitos. Mediante essa situação a vigilância, prevenção e controle são imprescindíveis. Objetivo: Analisar o perfil epidemiológico e microbiológico das infecções primárias de corrente sanguínea de UTI adulto do Município de Goiânia. Método: Estudo analítico ecológico, realizado a partir de dados secundários de notificações de infecções primárias de corrente sanguínea clínicas e laboratoriais das UTI adulto no Município de Goiânia-GO, no período de 2012-2016. Utilizou-se os Softwares SPSS-17.0 e Stata, versão 14.0. Os dados foram apresentados por meio da tendência temporal, estatística descritiva e percentis. Considerou-se IC: 95% e p<0,05.de significância de p<0,05. Resultados: Analisou-se 1988 fichas de notificações de IRAS dos referentes a 42 UTI adulto. A tendência temporal da densidade de incidência das infecções primárias de corrente sanguínea foi estacionária. A densidade de incidência das infecções primárias de corrente sanguínea laboratoriais variou de 3,32 a 4,34 infecções por 1000 cateteres-dia. A taxa de utilização de cateter venoso central no período foi de 55,36%. Em relação aos percentis houve elevação no período de estudo com destaque no ano de 2016 no percentil 90. Não houve associação estatística entre as variáveis analisadas. Quanto ao perfil microbiológico e de sensibilidade antimicrobiana identificou-se: SCon e S. aureus resistentes à oxacilina em 91,8% e 71,4% respectivamente em 2016. K. pneumoniae e Acinectobacter spp. resistentes às cefalosporinas de 3ª e 4ª gerações e aos carbapenêmicos. Conclusão: Conclui-se que a tendência temporal das infecções primárias de corrente sanguínea se manteve estacionária; a densidade de incidência e os percentis apresentaram elevação no decorrer dos anos. Os principais patógenos foram os SCon e K. pneumoniae com resistência a antimicrobianos de amplo espectro. Medidas de monitoramento dos serviços de saúde e de educação permanente dos trabalhadores da área da saúde, quanto a prevenção e controle dessas infecções, devem ser instituídas.
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Avaliação da carga viral plasmática do HTLV-1 em indivíduos assintomáticos e desenvolvendo a mielopatia associada ao HTLV-1/paraparesia espástica tropical (HAM/TSP). / Evaluation of HTLV-1 plasmatic viral load in asymptomatic and HTLV-1-associated myelopathy/Tropical spastic paraparesis (HAM/TSP) individuals.

Fábio Aparecido Barbosa Cabral 05 July 2010 (has links)
O vírus linfotrópico das células T humanas tipo 1 (HTLV-1), é responsável por patologias como a mielopatia associada ao HTLV-1 ou paraparesia espástica tropical (HAM/TSP) e a leucemia/linfoma das células T do adulto (ATL) dentre outras. As vias de replicação até hoje demonstradas, não suportam a hipótese de um estado virêmico. Neste estudo, a detecção de partículas virais plasmáticas foi executada, por PCR em Tempo Real e Nested PCR em 190 amostras de pacientes infectados pelo HTLV-1(assintomáticos ou com HAM/TSP), em acompanhamento, no Instituto de Infectologia Emílio Ribas. 12 indivíduos (8%) testados por PCR em tempo real (n=150) e 6 indivíduos (18%) testados por Nested PCR (n=33, dado que sete amostras foram excluídas da análise) apresentaram RNA do HTLV-1 detectável no plasma. Em conclusão, foi possível identificar RNA plasmático do HTLV-1, tanto em pessoas assintomáticas quanto com HAM/TSP. Esta detecção abre novas possibilidades de discussão sobre a replicação do HTLV-1 e das vias de transmissão, sugerindo maiores investigações para elucidar o assunto. / The human T-cell lymphotropic virus type1 (HTLV-1) is responsible for some pathologies such as HTLV-1-associated myelopathy/tropical spastic paraparesis (HAM/TSP) and Adult T-cell Leukemia/ Lymphoma (ATL) among others. Its ways of replication so far presented do not support the hypothesis of a viremic stage. In this study, the detection of the plasmatic viral load was performed by real time PCR and Nested PCR in 190 samples from HTLV-1 infected individuals (Either Asymptomatic or HAM/TSP cases) following up at Instituto de Infectologia Emílio Ribas. 12 individuals (8%) tested by Real time PCR (n= 150) and 6 individuals (18%) tested by Nested PCR (n= 33, given that 7 samples were excluded from the analysis) presented detectable HTLV-1 RNA in the plasma. In conclusion, it was possible to indentify HTLV-1 plasmatic RNA in asymptomatic carriers as well as in HAM/TSP cases. This detection opens new possibilities of discussion about HTLV-1 replication and transmission pathways, suggesting further investigation for clarifying this matter.
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Impacto da assistência fisioterapêutica em unidade de terapia intensiva no tempo de ventilação mecânica, tempo de internação e custos do paciente cirúrgico / Impact of physiotherapy assistance in intensive care unit in length of mechanical ventilation, length of intensive care unit stay and costs of surgical patients

Janete Maria da Silva 30 May 2012 (has links)
Estudos baseados em parâmetros fisiológicos tem mostrado que a fisioterapia tem papel imperativo na assistência de pacientes pré e pós-operatórios. Os efeitos da assistência fisioterapêutica na unidade de terapia intensiva (UTI) sobre o tempo de ventilação mecânica invasiva (VMI), tempo de internação e mortalidade do paciente crítico não foram elucidados. Tampouco, estudos sobre o impacto do turno diário da assistência fisioterapêutica nestes desfechos tem sido realizados. A despeito disto, e, possivelmente, baseadas na experiência clínica, as UTIs brasileiras adotarão turnos de 18 horas de assistência fisioterapêutica na UTI para atender a uma regulamentação governamental. O objetivo deste estudo foi comparar o efeito da assistência fisioterapêutica na UTI em turno diário de 24 horas (Fisio-24) ao turno diário de 12 horas (Fisio-12), sobre o tempo de VMI, tempo de internação na UTI, frequência de complicações respiratórias relacionadas a VMI e custos indiretos de pacientes pós-operatórios. Este estudo observacional, prospectivo, de coorte incluiu 114 pacientes de UTIs com Fisio-12 e 152 pacientes de UTIs com Fisio-24 em condição pós-operatória, idade 18 anos, submetidos a VMI por 24 horas e admitidos na UTI para rotina pós-operatória. Foram coletados dados demográficos e cirúrgicos. Os desfechos primários deste estudo foram tempo de VMI, tempo de internação na UTI, complicações respiratórias relacionadas a VMI e custos indiretos. O desfecho secundário foi o dia-livre de ventilação (VFD). Os custos foram avaliados através do Omega French Score que compreende três categorias (Omega 1, 2 e 3). Um modelo de regressão linear múltipla (MRL) foi construído para verificar a associação entre o turno diário de assistência fisioterapêutica na UTI e o tempo de VMI. A despeito dos pacientes Fisio-24 serem mais velhos (p=0,002), possuírem maior número de comorbidades (p=0,001), maior frequência de risco cirúrgico moderado a alto (p=0,003), maior frequência de complicações intra operatórias (p=0,012) e insuficiência renal aguda dialítica (p<0,001), comparados aos pacientes Fisio-12, apresentaram melhores desfechos clínicos, tais quais, menor mediana de tempo de VMI (4 dias versus 6 dias; p=0,002), maior mediana de VFD (24 dias versus 21 dias; p=0,004) e menor mediana de tempo de internação na UTI (10 dias versus 15 dias; p=0,015). Não foi encontrada diferença na frequência de complicações respiratórias relacionadas à VMI entre os dois grupos (p=0,704), embora pacientes Fisio-24 tenham recebido mais sessões de fisioterapia respiratória durante a internação na UTI (25 versus 20 sessões; p=0,014). Pacientes Fisio-24 apresentaram menor pontuação do Omega 2 (p=0,007). O MRL manteve como variáveis explicativas o número de sessões de fisioterapia respiratória, APACHE II, realização de Neurocirurgia e o turno diário de assistência fisioterapêutica na UTI. Mantidas constantes as outras variáveis explicativas, a presença de Fisio-24 na UTI reduziu o tempo de VMI em 2,80 unidades. Concluí-se que pacientes pós-operatórios admitidos em UTIs com Fisio-24 apresentaram menores tempo de VMI e tempo de internação na UTI, maior VFD, contudo, não foi encontrada diferença na frequência de complicações respiratórias relacionadas à VMI entre Fisio-12 e Fisio-24. A redução da pontuação de Omega 2 nos pacientes Fisio-24 não foi suficiente para promover diferenças no custo indireto entre os grupos / According to studies based on physiologic parameters, physiotherapy plays an imperative role on pre and postoperative patients. The effects of physiotherapy assistance (PTA) in the intensive care unit (ICU) on length of invasive mechanical ventilation (IMV), length of ICU stay, frequency of ventilator-associated pneumonia and mortality remain unclear. Moreover, studies about impact of PTA shifts have not been conducted. Despite this fact, and possibly based on clinical experiences, Brazilian ICUs are going to adopt 18 hours of PTA shifts in order to attend a governmental regulation. The objective of this study was to compare the effects of 24-hour PTA (Physio-24) to 12-hour PTA (Physio-12) daily shifts in the ICU on length of IMV, length of ICU stay, frequency of respiratory complications related to IMV and indirect costs of postoperative patients. This observational, prospective and cohort study included 114 patients from ICUs with Physio-12 and 152 patients from ICU with Physio-24. Patients presented postoperative conditions, were aged 18 years, who underwent IMV 24 hours and were admitted on ICU for postoperative routine. We collected demographical and surgical data. Our primaries end-points were duration of IMV, length of ICU stay, frequency of respiratory complications related to IMV and indirect costs. The secondary end-point was ventilator-free days (VFD). Indirect costs were assessed by Omega French Score which comprises three categories (Omega 1, 2 and 3). In addition, a multiple linear regression model (MLR) was constructed to verify the association between daily shifts of PTA in ICU and length of IMV. Despite of the fact that Physio-24 patients were older (p=0.002), with more severe conditions such as higher number of co morbidities (p<0.001), higher presence of moderate to severe surgical risk (p=0.003), higher frequency of intraoperative complications (p=0.012) and dialytic acute renal failure in ICU (p<0.001), compared to Physio-12 patients, they presented better clinical outcomes such as fewer median days spent in IMV (4 versus 6 days; p=0.002), higher median of VFD (24 versus 21 days; p=0.004) and shorter median of ICU stay (10 versus 15 days; p=0.015). No differences were found concerning respiratory complications related to IMV between groups (p=0.704), although Physio-24 patients had received more sessions of chest physiotherapy during ICU stay (25 versus 20 sessions; p=0.014). Physio-24 patients presented lower scores of Omega 2 (p=0.007). The number of chest physiotherapy sessions, APACHE II, Neurosurgery, and daily shifts of PTA in ICU remained as independent variables to length of IMV in the MLR model. According to this model, Physio-24 may reduce 2.80 units from length of IMV if the other independent variables are constant. We concluded that postoperative patients admitted in ICUs with daily shifts of 24-hour PTA showed shorter length of IMV and length of ICU stay and increased VFD; however, no reduction in frequency of respiratory complications related to IMV was found between groups. Despite the fact that Physio-24 patients had lower score of Omega 2, it was not enough to provoke a difference on indirect costs between Physio-12 and Physio-24 patients

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